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陕北细毛羊BMPR1B基因多态性与产羔数的关联分析
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作者 宋晓越 刘伟 +10 位作者 谢宇杰 姬凯 李慧敏 朱海鲸 郝嘉旭 杜晓敏 张鑫 张磊 王振有 冯继英 屈雷 《中国畜牧杂志》 北大核心 2025年第9期144-148,共5页
绵羊产羔性状的遗传力较低,利用分子遗传标记,筛选绵羊产羔性状相关的基因突变,是提高繁殖性能的重要方法之一。陕北细毛羊是陕西省特色品种,毛细度优势突出,但产羔性能较低,严重制约了陕北细毛羊大规模发展。国内外研究表明,骨形态发... 绵羊产羔性状的遗传力较低,利用分子遗传标记,筛选绵羊产羔性状相关的基因突变,是提高繁殖性能的重要方法之一。陕北细毛羊是陕西省特色品种,毛细度优势突出,但产羔性能较低,严重制约了陕北细毛羊大规模发展。国内外研究表明,骨形态发生蛋白受体1B(Bone Morphogenetic Protein Receptor 1B,BMPR1B)基因能提升多个绵羊品种的产羔性能,本研究通过筛选BMPR1B基因在陕北细毛羊中的FecB突变和InDel突变,并分析其与产羔数之间的相关性,旨在探寻该基因对产羔性能的影响。结果显示,陕北细毛羊BMPR1B基因存在FecB突变和InDel突变,其中,InDel P3-23bp位点DD基因型个体的产羔率大于其他基因型个体。本研究首次研究了陕北细毛羊BMPR1B基因的多态性,为培育多羔型陕北细毛羊提供了参考。 展开更多
关键词 陕北细毛羊 bmpr1b基因 产羔数 FECB INDEL
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GDF9、BMPR1B、FSHR基因多态性及其与兴羔肉羊产羔数的关联分析
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作者 乌日古木拉 文兰 +6 位作者 田进东 塔拉 何小龙 王标 达赖 付绍印 丽春 《中国畜牧杂志》 北大核心 2025年第4期196-205,共10页
本文通过对繁殖性状相关基因进行Sanger测序和KASP分型检测,挖掘与兴羔肉羊产羔数显著相关的单核苷酸多态位点(Single Nucleotide Polymorphism,SNP),为高繁殖力绵羊分子育种提供新的遗传标记。选取250只兴羔肉羊进行血液样品的采集并... 本文通过对繁殖性状相关基因进行Sanger测序和KASP分型检测,挖掘与兴羔肉羊产羔数显著相关的单核苷酸多态位点(Single Nucleotide Polymorphism,SNP),为高繁殖力绵羊分子育种提供新的遗传标记。选取250只兴羔肉羊进行血液样品的采集并提取基因组DNA,利用混合PCR结合Sanger测序技术检测绵羊生长分化因子9(Growth Differentiation Factor,GDF9)、骨形态发生蛋白受体1B(Bone Morphogenetic Protein Receptor 1B,BMPR1B)、卵泡雌激素受体(Follicle Stimulating Hormone Receptor,FSHR)基因启动子以及第1外显子区DNA序列的多态性,采用KASP技术对多态性位点进行分型检测并利用SPSS 26.0软件的一般线性模型(One-way ANOVA)进行关联分析,研究其与产羔数之间的相关性。结果显示,在GDF9基因启动子区存在g.41771007A>C、g.41770949G>A、g.41770718A>C,BMPR1B基因启动子区存在g.29461868G>A、g.29461739T>G、g.29315643A>G,FSHR基因启动子区存在g.75132264C>T、g.75132365T>C及第1外显子区存在g.75132817G>A共9个多态性位点。卡方检验表明,GDF9基因的g.41771007A>C、g.41770949G>A,BMPR1B基因的g.29315643A>G以及FSHR基因的g.75132365T>C、g.75132264C>T位点均处于哈代-温伯格(Hardy-Weinberg)平衡状态(P>0.05);将处于哈代-温伯格平衡的位点与产羔数关联分析显示,BMPR1B基因的g.29315643A>G,FSHR基因的g.75132264C>T、g.75132365T>C位点与兴羔肉羊产羔数有显著关联;连锁不平衡分析结果表明,兴羔肉羊群体中,GDF9基因和BMPR1B基因的6个位点之间处于较弱的连锁平衡状态,而FSHR基因的3个位点之间处于较强的连锁不平衡状态。以上结果表明,在兴羔肉羊GDF9、BMPR1B及FSHR基因上鉴定到9个多态性位点,其中BMPR1B基因的g.29315643A>G和FSHR基因的g.75132264C>T、g.75132365T>C位点可作为兴羔肉羊的潜在候选遗传标记。本研究结果为兴羔肉羊繁殖性能的研究提供了参考数据。 展开更多
关键词 绵羊 GDF9基因 bmpr1b基因 FSHR基因 产羔数
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BMPR1B基因在细毛羊皮肤毛囊中的表达及与羊毛性状关系的研究 被引量:14
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作者 王小佳 贺建宁 +3 位作者 程明 刘开东 刘积凤 柳楠 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2017年第1期33-38,共6页
本研究旨在探讨BMPR1B基因在皮肤毛囊的表达及与羊毛性状的关系,为解析其对羊毛相关性状的调控机理奠定理论基础。以敖汉细毛羊为研究材料,分别采集肩部(多毛区)和腹股沟部(少毛区)皮肤组织样。通过基因芯片技术,分析BMPR1B基因在皮肤... 本研究旨在探讨BMPR1B基因在皮肤毛囊的表达及与羊毛性状的关系,为解析其对羊毛相关性状的调控机理奠定理论基础。以敖汉细毛羊为研究材料,分别采集肩部(多毛区)和腹股沟部(少毛区)皮肤组织样。通过基因芯片技术,分析BMPR1B基因在皮肤不同部位表达量的差异;应用实时荧光定量PCR技术,检测BMPR1B基因在细毛羊肩部的表达量,并与羊毛性状和毛囊密度进行关联性分析;应用免疫组化方法,定位BMPR1B基因在细毛羊毛囊中表达的位置。结果表明:BMPR1B基因在肩部和腹股沟部均有表达,且在肩部表达量较高,差异倍数在2倍以上(P<0.05);关联分析显示,BMPR1B基因的m RNA表达量与羊毛细度呈显著正相关,相关系数为0.382(P<0.05);免疫组化结果显示,BMPR1B基因在细毛羊皮肤中,主要表达于表皮上皮细胞和内根鞘细胞中。综上,可推测在内根鞘中表达的BMPR1B基因,可能对羊毛细度具有调控作用,这可对细毛羊的育种实践提供理论参考。 展开更多
关键词 细毛羊 皮肤 bmpr1b 表达 羊毛性状
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绵羊多羔主效基因BMPR1B的研究进展 被引量:28
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作者 潘章源 狄冉 +1 位作者 刘秋月 储明星 《家畜生态学报》 北大核心 2015年第5期1-6,共6页
骨形态发生蛋白受体1B(Bone morphogenetic protein receptor 1B,BMPR1B)是一种重要的跨膜受体蛋白,主要参与转化生长因子β(TGF-β)通路,其在调控成骨分化、细胞扩散以及卵巢卵泡发育等过程中起重要作用,并直接影响如绵羊等动物的繁殖... 骨形态发生蛋白受体1B(Bone morphogenetic protein receptor 1B,BMPR1B)是一种重要的跨膜受体蛋白,主要参与转化生长因子β(TGF-β)通路,其在调控成骨分化、细胞扩散以及卵巢卵泡发育等过程中起重要作用,并直接影响如绵羊等动物的繁殖性状。绵羊BMPR1B基因发生A746G突变(命名为FecB突变),导致第249位氨基酸由谷氨酰胺(Q)转变为精氨酸(R),进而使得绵羊排卵数和产羔数显著增加,因此BMPR1B成为目前最受关注的绵羊多羔主效基因。论文就绵羊BMPR1B基因定位、功能机制研究进展及其对高繁殖力绵羊的影响进行了综述,同时也对BMPR1B功能研究中一些亟待解决的问题展开了讨论。 展开更多
关键词 bmpr1b基因 FECB 绵羊 多羔
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BMPR1B基因在寒泊肉羊世代选育中的遗传变异及其与产羔性状的关联分析 被引量:6
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作者 陈晓勇 孙洪新 +1 位作者 田树军 敦伟涛 《河北农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期99-102,共4页
为了探讨BMPR1B(A746G)基因在寒泊肉羊世代选育中的遗传变异及其与产羔数的关系,本试验分析了不同选育世代寒泊肉羊BMPR1B基因型和基因频率,基因型对不同世代母羊产羔数的影响。结果表明BMPR1B基因突变纯合型BB个体从第一世代就开始出现... 为了探讨BMPR1B(A746G)基因在寒泊肉羊世代选育中的遗传变异及其与产羔数的关系,本试验分析了不同选育世代寒泊肉羊BMPR1B基因型和基因频率,基因型对不同世代母羊产羔数的影响。结果表明BMPR1B基因突变纯合型BB个体从第一世代就开始出现,BB基因型频率随选育世代增加呈现增加趋势,从G1到G2世代,BB基因型频率显著增加。G1世代B+基因型母羊产羔数高于++基因型,但差异不显著。G2世代BB基因型母羊产羔数达到3.0,显著大于B+(1.89)和++(1.24)基因型个体(P<0.01)。G1和G2世代BMPR1B基因型母羊对初产日龄和产羔间隔均无显著影响(P>0.05)。结果提示BMPR1B基因作为分子标记可显著提高寒泊肉羊新种群母羊产羔数。 展开更多
关键词 寒泊肉羊 bmpr1b基因 产羔数 产羔间隔 初产日龄 基因型频率 基因频率
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家兔BMPR1B基因多态性及其与生长速度的相关性分析 被引量:6
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作者 贾伟 张龚炜 +2 位作者 陈仕毅 贾先波 赖松家 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2014年第4期1781-1785,共5页
本文旨在研究家兔BMPR1B基因的多态性及其与生长速度的相关性。采用PCR产物测序方法检测BMPR1B基因编码区的多态性,利用PCR-RFLP技术对候选SNPs位点(c.117G>A)进行基因分型,研究其与家兔生长速度的关联性(N=262)。结果表明,在BMPR1B... 本文旨在研究家兔BMPR1B基因的多态性及其与生长速度的相关性。采用PCR产物测序方法检测BMPR1B基因编码区的多态性,利用PCR-RFLP技术对候选SNPs位点(c.117G>A)进行基因分型,研究其与家兔生长速度的关联性(N=262)。结果表明,在BMPR1B基因编码区共存在14个SNPs位点,它们分别是c.9C>T、c.54C>T、c.75T>A、c.88C>T、c.96T>C、c.117G>A、c.384A>G、c.392C>T、c.540C>T、c.603T>C、c.1254T>A、c.1332A>G、c.1356A>G及c.1436A>G,除c.392C>T突变致使该基因编码的第131个氨基酸亮氨酸(leu)被丝氨酸(ser)替换外,其他13个位点均为同义突变。c.117G>A位点处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),为中度多态(0.25<PIC<0.50)。关联分析表明BMPR1B基因c.117G>A位点AA基因型35日龄断奶重显著高于GG基因型和AG基因型(669.556±43.733VS 612.571±10.588VS 612.478±13.73)。 展开更多
关键词 家兔 bmpr1b基因 PCR-RFLP SNP 关联分析
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绵羊BMPR1B基因生物信息学分析 被引量:7
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作者 潘章源 狄冉 +4 位作者 刘秋月 胡文萍 王翔宇 郭晓飞 储明星 《中国草食动物科学》 CAS 2015年第6期1-5,共5页
该研究从生物信息学角度分析BMPR1B基因结构、蛋白结构、理化性质、同源进化和信号通路。结果显示:绵羊BMPR1B DNA全长20 k,包含12个外显子,其中Fec B突变位于第8外显子;BMPR1B具有3个保守motif和3个功能结构域,FecB突变位于蛋白激酶功... 该研究从生物信息学角度分析BMPR1B基因结构、蛋白结构、理化性质、同源进化和信号通路。结果显示:绵羊BMPR1B DNA全长20 k,包含12个外显子,其中Fec B突变位于第8外显子;BMPR1B具有3个保守motif和3个功能结构域,FecB突变位于蛋白激酶功能结构域,该突变改变了蛋白空间结构;绵羊BMPR1B蛋白与山羊的同源性最高,首先相聚,其次为牛、狼、人、猕猴、小鼠、猪、原鸡、斑马鱼;BMPR1B主要在TGFB通路中起信号转导作用,是一个重要的膜受体。 展开更多
关键词 绵羊 bmpr1b基因 生物信息学 FecB突变 蛋白互作
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GDF9、BMPR1B与BMP15基因在和田羊群体的遗传特征分析 被引量:7
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作者 王琼 马海玉 +2 位作者 刘玲玲 黄开飞 刘武军 《草食家畜》 2020年第4期1-8,共8页
试验旨在探究高繁殖力候选基因在和田羊群体的遗传特征,为和田羊多羔类群的选育奠定基础。以不同产羔数的和田羊为研究对象,借助特异性内切酶,对TGFβ/BMP信号通路中GDF9(G1位点)、BMPR1B(FecB位点)与BMP15基因(FecXG位点)进行酶切位点... 试验旨在探究高繁殖力候选基因在和田羊群体的遗传特征,为和田羊多羔类群的选育奠定基础。以不同产羔数的和田羊为研究对象,借助特异性内切酶,对TGFβ/BMP信号通路中GDF9(G1位点)、BMPR1B(FecB位点)与BMP15基因(FecXG位点)进行酶切位点分析。经检测,在和田羊中首次发现GDF9、BMPR1B基因具有多态性,GDF9存在2种基因型(GG、GA),BMPR1B存在3种基因型(++、+B、BB),而BMP15基因无多态性;GDF9、BMPR1B基因的PIC分别为低度多态、中度多态,均处于Hardy-Weinberg平衡状态(P>0.05),可世代稳定遗传;GDF9、BMPR1B基因在和田羊母羊群体中存在4种组合基因型,在公羊群体中存在2种组合基因型,公羊、母羊群体的遗传结构特征可能存在差异。以上结果揭示,BMP15基因不是影响和田羊繁殖性状的候选基因;GDF9、BMPR1B基因有待与和田羊繁殖性状进行关联分析以进一步确认。 展开更多
关键词 和田羊 GDF9 bmpr1b BMP15 群体遗传结构
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绵羊BMPR1B基因真核表达及产物互作蛋白的鉴定 被引量:6
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作者 贾建磊 陈倩 +2 位作者 靳继鹏 袁赞 张利平 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期94-104,共11页
旨为研究BMPR1B蛋白及其相互作用蛋白在绵羊卵巢卵母细胞发育及排卵的作用通路。通过构建BMPR1B基因真核表达体系并表征BMPR1B蛋白质,利用CoIP-MS技术鉴定母羊卵巢提取物中与BMPR1B特异性相互作用的蛋白质,构建目的蛋白质互作网络,通过... 旨为研究BMPR1B蛋白及其相互作用蛋白在绵羊卵巢卵母细胞发育及排卵的作用通路。通过构建BMPR1B基因真核表达体系并表征BMPR1B蛋白质,利用CoIP-MS技术鉴定母羊卵巢提取物中与BMPR1B特异性相互作用的蛋白质,构建目的蛋白质互作网络,通过生物信息学分析并预测BMPR1B蛋白及其相互作用蛋白在绵羊卵巢卵母细胞发育及排卵的作用通路。母羊卵巢提取物中23种蛋白质与BMPR1B蛋白具有关联性,其中6种目的蛋白(BMP2、BMP4、GDF5、GDF9、RhoD和HSP10)与BMPR1B具有特异性相互作用,通过生物信息学分析表明目的蛋白在TGF-β信号转导通路、卵巢类固醇生成通路和MAPK信号转导通路构成复杂且紧密的交互网络,基于互作结果设计BMPR1B蛋白调节绵羊卵母细胞的发育和排卵的代谢途径。BMPR1B蛋白与绵羊产羔性状途径中Smads家族蛋白具有交互作用,在绵羊卵母细胞发育和排卵中具有重要作用。 展开更多
关键词 绵羊 bmpr1b 互作蛋白 CoIP-MS 生物信息学
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绵羊FecB突变对BMPR1B活性及BMP/SMAD通路的影响研究进展 被引量:6
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作者 龚一鸣 王翔宇 +4 位作者 贺小云 刘玉芳 余平 储明星 狄冉 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2023年第4期295-305,共11页
BMPR1B是绵羊中被鉴定的第一个多羔主效基因,但该基因中FecB突变增加绵羊排卵数的分子机制尚未解析。近年来发现BMPR1B活性受小分子抑制蛋白FKBP1A调控,该蛋白充当了BMPR1B及BMP/SMAD通路活性控制开关的关键作用且FecB突变恰好位于FKBP1... BMPR1B是绵羊中被鉴定的第一个多羔主效基因,但该基因中FecB突变增加绵羊排卵数的分子机制尚未解析。近年来发现BMPR1B活性受小分子抑制蛋白FKBP1A调控,该蛋白充当了BMPR1B及BMP/SMAD通路活性控制开关的关键作用且FecB突变恰好位于FKBP1A与BMPR1B结合位点附近。本文首先总结了BMPR1B和FKBP1A的蛋白结构,阐明二者空间结合区域及FecB突变的位置,进而预测了FecB突变与二者结合强弱的关系,最终提出了FecB突变通过影响BMPR1B与FKBP1A结合强度改变BMP/SMAD通路活性的科学假设,为后续探明FecB突变影响绵羊排卵数的分子机制提供了新思路。 展开更多
关键词 绵羊 FecB突变 bmpr1b FKBP1A BMP/SMAD通路
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鲁中肉羊BMPR1B、BMP15和GDF9基因多态性与产羔数关联分析 被引量:11
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作者 孙庆 田志龙 +3 位作者 刘秋月 潘林香 王金文 储明星 《中国草食动物科学》 CAS 2019年第4期1-5,10,共6页
为分析绵羊已知多羔主效基因BMPR1B、BMP15和GDF9的多态性与鲁中肉羊产羔数之间的关系,采用Sequenom MassARRAY■SNP技术检测鲁中肉羊BMPR1B、BMP15和GDF9基因中已知主效位点多态性,并与产羔数进行关联分析。结果表明:BMPR1B基因在鲁中... 为分析绵羊已知多羔主效基因BMPR1B、BMP15和GDF9的多态性与鲁中肉羊产羔数之间的关系,采用Sequenom MassARRAY■SNP技术检测鲁中肉羊BMPR1B、BMP15和GDF9基因中已知主效位点多态性,并与产羔数进行关联分析。结果表明:BMPR1B基因在鲁中肉羊中存在FecB突变,GDF9基因6个分型位点仅4个位点(G1、G3、G4、G5)在鲁中肉羊中存在多态,BMP15基因中5个分型位点在鲁中肉羊中均不存在多态性。FecB基因3种基因型(CC、CT、TT)突变频率分别为0.16、0.58和0.26,此位点多态性较高(0.25<PIC<0.5),并在鲁中肉羊中处于哈代温伯格不平衡状态(P<0.05);GDF9基因中G3位点在鲁中肉羊群体中多态性较高(0.25<PIC<0.5),且G3和G4位点在鲁中肉羊中处于哈代温伯格不平衡状态(P<0.05)。FecB位点不同基因型与鲁中肉羊不同胎次产羔数之间均显著关联(P<0.05),GDF9基因中仅G5位点的不同基因型与鲁中肉羊第一胎产羔数之间显著关联。综上,BMPR1B基因FecB位点可以作为鲁中肉羊产羔数分子标记继续进行选育;GDF9基因G5位点对鲁中肉羊产羔数性状选育具有一定的指导意义,值得扩大样本进一步研究。 展开更多
关键词 鲁中肉羊 bmpr1b BMP15 GDF9 分型 产羔数
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敖汉细毛羊Hoxa5、BMPR1B基因互作研究 被引量:2
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作者 张梦瑶 杨峰 +3 位作者 刘积凤 刘开东 贺建宁 柳楠 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2019年第2期229-238,共10页
旨在构建敖汉细毛羊Hoxa5、BMPR1B基因的质粒及共转染成纤维细胞后,通过基因表达量变化研究两基因的互作。以敖汉细毛羊为研究对象,采集40日龄的胎羊。首先,通过RNA的提取反转录成cDNA,参照GenBank中Hoxa5、BMPR1B基因序列信息分别设计... 旨在构建敖汉细毛羊Hoxa5、BMPR1B基因的质粒及共转染成纤维细胞后,通过基因表达量变化研究两基因的互作。以敖汉细毛羊为研究对象,采集40日龄的胎羊。首先,通过RNA的提取反转录成cDNA,参照GenBank中Hoxa5、BMPR1B基因序列信息分别设计1对引物,通过PCR反应扩增获得Hoxa5、BMPR1B基因片段,将得到的Hoxa5、BMPR1B基因分别连接到pEASYTM-T1载体,构建pEASYTM-T1-Hoxa5、pEASYTM-T1-BMPR1B重组质粒并转化大肠杆菌(E.coli)DH5α感受态细胞,提取质粒进行酶切鉴定。鉴定正确后构建pcDNA3.1-Hoxa5、pcDNA3.1-BMPR1B重组质粒,转化大肠杆菌(E.coli)DH5α感受态细胞。其次,对敖汉细毛羊的成纤维细胞进行分离培养,并将构建的质粒pcDNA3.1-Hoxa5、pcDNA3.1-BMPR1B共转染成纤维细胞,利用荧光定量PCR技术和Western Blot技术检测Hoxa5、BMPR1B基因单转染和共转染在成纤维细胞中表达量的变化。结果显示,经酶切、测序鉴定质粒pcDNA3.1-Hoxa5、pcDNA3.1-BMPR1B构建成功,并且共转染成纤维细胞BMPR1B基因的表达量明显下降,Hoxa5基因的表达量明显升高且共转染组的表达量极显著地高于单转染组(P<0.01)。成功构建了敖汉细毛羊Hoxa5、BMPR1B基因的质粒,并且成功共转染成纤维细胞,Hoxa5基因的表达量明显升高,BMPR1B基因的表达量明显下降,因而Hoxa5基因抑制了BMPR1B基因的表达,BMPR1B基因促进了Hoxa5基因的表达,结果可为进一步研究其功能奠定基础。 展开更多
关键词 敖汉细毛羊 成纤维细胞 Hoxa5 bmpr1b 基因互作 质粒构建 RT-PCR WESTERN BLOT
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利用同源重组构建敖汉细毛羊BMPR1B真核表达载体及在成纤维细胞中表达量的研究 被引量:2
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作者 张梦瑶 杨峰 +3 位作者 刘开东 刘积凤 柳楠 贺建宁 《中国畜牧杂志》 CAS 北大核心 2018年第9期109-114,共6页
本研究旨在利用同源重组技术构建敖汉细毛羊BMPR1B基因的表达载体及转染成纤维细胞后基因的表达量变化。以敖汉细毛羊为研究对象,采集40日龄的胎羊。首先,提取RNA并反转录成cDNA,参照GenBank中BMPR1B基因序列信息以及pcDNA3.1序列设计1... 本研究旨在利用同源重组技术构建敖汉细毛羊BMPR1B基因的表达载体及转染成纤维细胞后基因的表达量变化。以敖汉细毛羊为研究对象,采集40日龄的胎羊。首先,提取RNA并反转录成cDNA,参照GenBank中BMPR1B基因序列信息以及pcDNA3.1序列设计1对含有同源臂的引物,通过PCR反应扩增获得BMPR1B基因片段、利用SoSo试剂盒将目的片段连接到pcDNA3.1真核表达载体上。鉴定pcDNA3.1-BMPR1B表达载体构建成功后,转化大肠杆菌(E.coli)DH5α感受态细胞;其次对敖汉细毛羊的成纤维细胞进行分离培养,并将构建的表达载体pcDNA3.1-BMPR1B转染成纤维细胞,利用实时荧光定量PCR技术和Western blot技术检测BMPR1B基因在成纤维细胞中表达量的变化。结果表明:经酶切、测序鉴定pcDNA3.1-BMPR1B表达载体构建成功,并且转染成纤维细胞后BMPR1B基因的mRNA、蛋白表达量均明显升高,且转染组的表达量极显著高于对照组(P<0.01)。本研究利用同源重组技术成功构建了敖汉细毛羊BMPR1B基因表达载体,并且成功转染成纤维细胞,基因在细胞中过表达,结果可为进一步研究其功能奠定基础。 展开更多
关键词 同源重组 成纤维细胞 bmpr1b基因转染 RT-PCR WESTERNBLOT
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鸡BMPR1B基因克隆、生物信息学及组织表达分析 被引量:7
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作者 张晨曦 赖云强 +4 位作者 杨岚 樊学伟 王阳光 李文婷 康相涛 《河南农业大学学报》 CAS CSCD 2022年第1期115-123,共9页
【目的】探究鸡骨形态发生蛋白受体1B(bone morphogenetic protein receptor type 1B,BMPR1B)基因在家禽卵巢发育中的功能。【方法】利用cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)扩增BMPR1B基因cDNA的序列,通过生... 【目的】探究鸡骨形态发生蛋白受体1B(bone morphogenetic protein receptor type 1B,BMPR1B)基因在家禽卵巢发育中的功能。【方法】利用cDNA末端快速扩增技术(rapid amplification of cDNA ends,RACE)扩增BMPR1B基因cDNA的序列,通过生物信息学软件对其所编码的蛋白理化性质及结构功能进行分析,利用实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)技术探究BMPR1B基因在鸡各个组织中的表达情况。【结果】鸡BMPR1B基因存在2种转录本,转录本T1长1925 bp,包含5’UTR 248 bp,编码序列1509 bp,3’UTR 168 bp;转录本T2长度为1754 bp,包含5’UTR 77 bp,编码序列1509 bp,3’UTR 168 bp,编码的蛋白包含502个氨基酸。进化分析表明,鸡BMPR1B基因在进化过程中与火鸡亲缘关系最近,保守性较高。理化性质分析显示,鸡BMPR1B基因编码蛋白属于不稳定、亲水性蛋白。结构域预测发现,该蛋白存在有1段跨膜结构和1个GS保守结构域,整个二级结构主要由无规卷曲组成,预测含有4个磷酸化位点和2个糖基化位点。组织表达分析显示,BMPR1B基因在鸡的心、肝、脾、肺、肾、胸肌、腿肌和卵巢8个组织中均有表达,且在卵巢组织中表达量最高。【结论】该研究结果为后续深入研究BMPR1B基因在鸡卵巢卵泡发育中的作用奠定基础。 展开更多
关键词 bmpr1b基因 CDNA末端快速扩增技术 生物信息学分析 组织表达
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BMPR1B基因多态性对大白母猪生长和繁殖性能的影响 被引量:4
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作者 李清春 和军飞 +9 位作者 卢世豪 何凡 陈鑫 祁梦凡 黎明国 符彬彬 张庆泽 任玉军 张化鹏 黄涛 《中国畜牧杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第9期184-190,共7页
为研究骨形态发生蛋白受体1B(BMPR1B)遗传变异对大白母猪生长和繁殖性能的影响,本研究利用DNA混池测序,确定BMPR1B基因的SNPs,采用GenoPlexs?基因分型技术对316头大白母猪群进行基因分型,并与其体重达100 kg时的生长性能(日增重、背膘... 为研究骨形态发生蛋白受体1B(BMPR1B)遗传变异对大白母猪生长和繁殖性能的影响,本研究利用DNA混池测序,确定BMPR1B基因的SNPs,采用GenoPlexs?基因分型技术对316头大白母猪群进行基因分型,并与其体重达100 kg时的生长性能(日增重、背膘厚、体重日龄、眼肌面积和眼肌厚)、母系指数、父系指数、出生乳头数和妊娠期进行关联分析。结果表明:本研究共筛查到5个SNPs,分别为g.124593852G>A、g.124561254G>C、g.124561098C>T、g.124546851A>G和g.124542062T>C,其中g.124561254G>C与g.124561098C>T发生同义突变后改变了BMPR1B基因mRNA二级结构;g.124561254G>C与g.124561098C>T为强连锁遗传;BMPR1B基因g.124593852G>A与大白母猪父系指数和出生乳头数显著相关;g.124561254G>C与出生乳头数和校正100 kg背膘厚显著相关,与校正100 kg体重日龄、校正100 kg日增重和父系指数极显著相关;g.124561098C>T与父系指数和出生乳头数极显著相关,与妊娠期显著相关;g.124546851A>G与父系指数、校正100 kg体重日龄和校正100 kg日增重显著相关;g.124542062T>C与校正100 kg背膘厚显著相关;联合基因型g.124561254G>C—g.124561098C>T与妊娠期显著相关,GGCT为优势基因型。总之,本研究筛查到的5个SNPs对大白母猪生长或繁殖性能相关,可为大白猪的分子标记辅助选育提供参考。 展开更多
关键词 大白母猪 bmpr1b 多态位点 生长性能 繁殖性能
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绵羊BMPR1B基因的生物信息学分析 被引量:9
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作者 焦丹 刘秀 +4 位作者 李少斌 王继卿 闫伟 李文浩 罗玉柱 《甘肃农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第4期1-6,共6页
【目的】利用生物信息学软件对绵羊BMPR1B基因进行分析,并了解其功能和结构,为进一步探讨BMPR1B基因在绵羊生长繁殖以及绵羊卵泡生长和分泌和产羔率等研究奠定遗传信息基础.【方法】利用生物信息学对绵羊骨形态发生蛋白1β(bone morphog... 【目的】利用生物信息学软件对绵羊BMPR1B基因进行分析,并了解其功能和结构,为进一步探讨BMPR1B基因在绵羊生长繁殖以及绵羊卵泡生长和分泌和产羔率等研究奠定遗传信息基础.【方法】利用生物信息学对绵羊骨形态发生蛋白1β(bone morphogenetic protein 1beta,BMPR1B)基因的蛋白理化性质、亚细胞定位、潜在信号肽剪切位点、蛋白跨膜螺旋结构、糖基化和磷酸化位点、蛋白保守结构域、亲疏水性和编码产物进行功能预测分析,及其编码蛋白的二级结构和三级结构等进行分析预测.【结果】绵羊BMPR1B基因CDs编码蛋白质的502个氨基酸残基中,带电荷氨基酸、疏水氨基酸和极性氨基酸含量较高.相对分子量为56 907.4U,理论等电点pI为7.78;亚细胞主要定位于细胞核,不属于分泌蛋白;无信号肽序列;预测含有32个磷酸化位点和2个糖基化位点;存在一段跨膜结构且分别有一个GS和S-TKc的结构域,二级结构以无规卷曲为主.预测该蛋白在翻译和脂肪代谢过程中有着重要意义.【结论】绵羊BMPR1B蛋白包含502个氨基酸,为细胞核合成蛋白,该蛋白翻译后修饰的主要方式是磷酸化,在细胞内主要行翻译和脂肪代谢作用.蛋白二级结以无规卷曲为主,三级结构主要由α螺旋和无规卷曲缠绕折叠形成. 展开更多
关键词 绵羊 骨形态发生蛋白1β基因 生物信息学
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猪BMPR1B基因的生物信息学分析 被引量:1
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作者 王君岩 张涵 +3 位作者 刘哲熹 白珂瑞 王德鹏 吴克亮 《江苏农业科学》 北大核心 2023年第1期32-44,共13页
为了分析猪骨形态发生蛋白1B型受体BMPR1B蛋白的理化性质、高级结构、结构域、亚细胞定位、N-糖基化、同源进化关系、选择压力以及分子内共进化等,利用生物信息学软件及平台,对BMPR1B基因的结构与功能进行鉴定,为进一步探讨BMPR1B基因... 为了分析猪骨形态发生蛋白1B型受体BMPR1B蛋白的理化性质、高级结构、结构域、亚细胞定位、N-糖基化、同源进化关系、选择压力以及分子内共进化等,利用生物信息学软件及平台,对BMPR1B基因的结构与功能进行鉴定,为进一步探讨BMPR1B基因在母猪繁殖性状中发挥的作用奠定遗传信息基础。结果表明,猪BMPR1B基因编码502个氨基酸;相对分子量为56960.47,理论等电点为7.78,带正电,呈碱性,不稳定,是一种跨膜的亲水蛋白;二级结构以α-螺旋和无规卷曲为主,三级结构由1条主链和1条侧链构成,模型稳定,构象合理;具有3个保守的功能结构域,为激活素受体结构域、GS结构域和丝氨酸/苏氨酸激酶结构域;定位于细胞膜上,无信号肽序列,为非GPI锚定蛋白;另含有13个潜在的N-糖基化位点。系统进化分析表明:物种间,猪BMPR1B基因与马的同源性最高;物种内,猪BMPR1B基因类型上可以分为3个组,值得注意的是梅山猪作为独立的一支被分为一组,与猪的高繁殖力性状有一定联系。选择压力分析显示:猪BMPR1B基因经历了强烈的净化选择,十分保守,但在M7vs.M8模型中发现了44个强烈的正选择位点。分子共进化显示,在猪BMPR1B基因中检测到4组协同进化,涉及10个氨基酸。 展开更多
关键词 bmpr1b基因 生物信息学 选择压力 分子共进化
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ACVR2B、BMPR1A和BMPR1B基因多态性与母猪繁殖性能的相关分析 被引量:3
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作者 李清春 和军飞 +7 位作者 陈鑫 孙义姗 高若男 卢世豪 祁梦凡 何凡 黎明国 黄涛 《畜牧与兽医》 北大核心 2022年第6期1-10,共10页
为研究转化生长因子-β(TGF-β)通路中激活素A受体2B(ACVR2B)、骨形态发生蛋白受体1A(BMPR1A)和骨形态发生蛋白受体1B(BMPR1B)基因多态性对母猪繁殖性能的影响,选用大白和长白母猪为试验对象,采用DNA混池测序对猪ACVR2B、BMPR1A和BMPR1... 为研究转化生长因子-β(TGF-β)通路中激活素A受体2B(ACVR2B)、骨形态发生蛋白受体1A(BMPR1A)和骨形态发生蛋白受体1B(BMPR1B)基因多态性对母猪繁殖性能的影响,选用大白和长白母猪为试验对象,采用DNA混池测序对猪ACVR2B、BMPR1A和BMPR1B基因多态位点进行筛选,利用GenoPlexs;基于多重PCR的靶向测序基因型分型技术对候选SNPs进行分型,并与经产母猪繁殖性能进行关联性分析。结果显示:ACVR2B基因筛到2个单碱基突变和1个缺失多态,分别为g.23259668T>C、g.23260159(delG)和g.23260324C>T,命名为P1、P2和P3;BMPR1A基因g.87887024-87887026(delTGG)筛到1个缺失多态,命名为P4;BMPR1B基因筛到5个单碱基突变,g.124593852G>A、g.124561254G>C、g.124561098C>T、g.124546851A>G和g.124542062T>C,分别命名为P5、P6、P7、P8和P9。关联结果显示:ACVR2A基因的P1、P2和P3这3个位点完全连锁遗传,与长白母猪出生活仔数和校正21日龄窝重显著相关(P<0.05),与大白母猪校正21日龄窝重显著相关(P<0.05);BMPR1A基因P4位点与长白母猪出生窝重显著相关(P<0.05);BMPR1B基因P5位点与长白母猪总产仔数极显著相关(P<0.01),与出生活仔数显著相关(P<0.05),与大白母猪出生窝重显著相关(P<0.05);P6位点与长白母猪总产仔数显著相关(P<0.05),与大白母猪出生活仔数显著相关(P<0.05);P9位点与大白母猪出生窝重极显著相关(P<0.01),与校正21日龄窝重显著相关(P<0.05)。联合基因型显示:P6-P7的联合基因型与大白母猪出生活仔数和出生窝重显著相关(P<0.05),CGCT组合基因型为优势基因型;P8-P9的联合基因型与大白母猪出生活仔数、出生窝重和校正21日龄窝重显著相关(P<0.05),GGTC组合基因型为出生活仔数和出生窝重的优势基因型,GGCC组合基因型为校正21日龄窝重的优势基因。结论:本研究筛选的9个位点对母猪的繁殖性能存在影响,可作为潜在的遗传标记,为猪分子育种提供参考,并推测BMPR1B基因可作为母猪产仔性能的主效基因。 展开更多
关键词 母猪 骨形态发生蛋白受体1A 骨形态发生蛋白受体1B 激活素A受体2B 多态位点 繁殖性能
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长链非编码RNA BMPR1B-AS1在卵巢癌中的表达及对预后的影响
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作者 李昀徽 陈晓静 +3 位作者 蒋慧云 成娟 蒋森伟 何善阳 《中国医师杂志》 2025年第7期971-976,982,共7页
目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)BMPR1B-AS1在卵巢癌中的表达及其对预后的影响,以评估其作为潜在生物标志物的价值。方法利用TCGA、GEPIA和UALCAN数据库回顾性分析BMPR1B-AS1在妇科肿瘤中的表达差异,并结合临床数据进行预后分析。通过实... 目的探讨长链非编码RNA(lncRNA)BMPR1B-AS1在卵巢癌中的表达及其对预后的影响,以评估其作为潜在生物标志物的价值。方法利用TCGA、GEPIA和UALCAN数据库回顾性分析BMPR1B-AS1在妇科肿瘤中的表达差异,并结合临床数据进行预后分析。通过实时荧光定量反转录聚合酶链反应(RT-qPCR)在卵巢癌组织和细胞系中验证BMPR1B-AS1的表达水平,并运用单因素和多因素Cox回归模型分析其与卵巢癌预后的关系。结果数据库分析显示BMPR1B-AS1在卵巢癌及子宫内膜癌中表达高于非肿瘤组(均P<0.05),且卵巢癌中BMPR1B-AS1高表达与较好的预后相关(P<0.05)。实验验证显示,卵巢癌组织中BMPR1B-AS1表达量显著高于良性卵巢组织,且卵巢癌细胞系中BMPR1B-AS1表达高于正常人卵巢上皮细胞(P<0.05)。Cox回归分析表明高表达BMPR1B-AS1是卵巢癌预后的独立保护性因素(P<0.05)。结论BMPR1B-AS1在卵巢癌及子宫内膜癌中的表达比非肿瘤组高,是卵巢癌患者预后良好的独立保护因素,可能作为一种新的生物标志物,为卵巢癌的诊断和治疗提供新的思路。 展开更多
关键词 RNA 长链非编码 bmpr1b-AS1 卵巢肿瘤
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MTHFR、BMPR1B和TYMS多态性与先天性小耳畸形相关性研究 被引量:2
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作者 刘宁 刘育凤 +5 位作者 隋静 张艳秋 马书梅 吴文娟 梁戈玉 谭谦 《临床耳鼻咽喉头颈外科杂志》 CAS 北大核心 2017年第6期409-414,共6页
目的:探讨MTHFR、BMPR1B和TYMS基因多态性与先天性小耳畸形的相关性。方法:收集180例小耳畸形患者和141例健康对照,采用多重PCR分析方法对MTHFR rs4846049、BMPR1Brs1434536和TYMS rs2790位点进行基因型检测,采用χ~2检验分析各基因型... 目的:探讨MTHFR、BMPR1B和TYMS基因多态性与先天性小耳畸形的相关性。方法:收集180例小耳畸形患者和141例健康对照,采用多重PCR分析方法对MTHFR rs4846049、BMPR1Brs1434536和TYMS rs2790位点进行基因型检测,采用χ~2检验分析各基因型频率和等位基因频率的在病例组和对照组中的分布,采用分层分析探讨3种基因多态性对不同性别先天性小耳畸形发病风险的影响。结果:TYMS基因rs2790位点基因型频率和等位基因频率分布在病例组与对照组中差异有统计学意义(P<0.05),进一步分层分析发现,TYMS rs2790基因多态性主要增加男性先天性小耳畸形发病风险(P<0.05),与携带AA基因型的个体相比,携带基因型AG、GG、AG+GG的个体发病风险分别为对照组的1.93、3.23和2.10倍,95%CI分别为1.07~3.48、1.12~9.33和1.20~3.68。未发现MTHFR rs4846049、BMPR1Brs1434536多态性和先天性小耳畸形有关(P>0.05)。结论:TYMS rs2790基因多态性和男性先天性小耳畸形发生有关。 展开更多
关键词 先天性小耳畸形 MTHFR bmpr1b TYMS 基因多态性
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