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淇河鲫bmp6基因的克隆及表达特性分析
1
作者 马峻 连凯琪 +5 位作者 闪金研 刘玉玲 李晓龙 赵黎明 李学军 彭仁海 《华北农学报》 北大核心 2025年第2期218-229,共12页
骨形态发生蛋白6(bmp6)基因对鱼类肌间刺的形成发育具有重要的调控作用。为探究淇河鲫bmp6基因的序列特征和表达特性,通过克隆获得淇河鲫bmp6基因的编码序列(CDS),并进行生物信息学分析;通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测,分析bmp6基因... 骨形态发生蛋白6(bmp6)基因对鱼类肌间刺的形成发育具有重要的调控作用。为探究淇河鲫bmp6基因的序列特征和表达特性,通过克隆获得淇河鲫bmp6基因的编码序列(CDS),并进行生物信息学分析;通过实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测,分析bmp6基因在淇河鲫不同组织和发育时期的表达差异。结果显示,淇河鲫bmp6基因由两部分同源基因各3个等位基因组成,分别是bmp6a-1、bmp6a-2、bmp6a-3和bmp6b-1、bmp6b-2、bmp6b-3,其CDS序列全长分别为1245,1257 bp,编码414,418个氨基酸。bmp6a和bmp6b均是含有一个信号肽序列且无跨膜结构的不稳定疏水性分泌蛋白,bmp6a主要分布在线粒体、细胞核和细胞质中,而bmp6b主要分布在细胞核与线粒体上。bmp6a和bmp6b二级结构都以无规则卷曲为主,与三级结构预测的结果一致,且都具有1个TGF-β-rel家族保守结构域。氨基酸序列同源性分析表明,淇河鲫bmp6a氨基酸序列与团头鲂bmp6具有较高的相似性,与哺乳动物的相似性较低,而淇河鲫bmp6b氨基酸序列与鲫鱼和银鲫的bmp6b具有较高的相似性。系统发育树分析显示,淇河鲫bmp6a与鲤鱼bmp6a聚于同一进化支,而淇河鲫bmp6b与鲫鱼和银鲫bmp6b聚于同一进化支。qRT-PCR检测结果表明,bmp6a和bmp6b基因在淇河鲫的脑、肌肉、鳃、脾脏、肠、性腺、肝脏和肾脏组织中均有表达,但在肝脏、鳃组织和肾脏中表达量较高;二者在淇河鲫幼鱼不同发育时期具有相似的表达模式,在肌间刺骨化前,bmp6a和bmp6b的表达量最高,之后随着肌间刺的发育形成,bmp6a和bmp6b的表达量降低。综上,通过克隆获得淇河鲫bmp6基因CDS序列,并进行生物信息学分析和qRT-PCR检测,为进一步创制淇河鲫无肌间刺新品系提供了参考依据。 展开更多
关键词 淇河鲫 骨形态发生蛋白6(bmp6) 基因克隆 序列分析 基因表达
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粤西卷羽鸡BMP6基因多态性与生长性状及屠宰性状的关联分析 被引量：1
2
作者 李国 张丽 +7 位作者 王府建 李磊 宾乘峰 郭东雪 王晓彤 林君媛 林树带 谢婷婷 《华南农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期477-486,共10页
[目的]探讨BMP6基因多态性对粤西卷羽鸡生长性状及屠宰性状的影响。[方法]以120只粤西卷羽鸡为试验材料,对BMP6基因外显子设计特异性扩增引物,采取PCR产物直接测序法分析SNP位点,利用单因素方差分析对SNP位点基因型与生长性状及屠宰性... [目的]探讨BMP6基因多态性对粤西卷羽鸡生长性状及屠宰性状的影响。[方法]以120只粤西卷羽鸡为试验材料,对BMP6基因外显子设计特异性扩增引物,采取PCR产物直接测序法分析SNP位点,利用单因素方差分析对SNP位点基因型与生长性状及屠宰性状进行关联分析。[结果]在BMP6基因外显子区域共检测到7个SNP位点,其中,g.64185950 T>C、g.64195411 G>A和g.64195613 C>T处于编码区,均为同义突变。HardyWeinberg平衡检验结果显示,g.64195833 T>A在粤西卷羽鸡群体中显著偏离Hardy-Weinberg平衡(P<0.05)。基因型与生长性状关联分析结果表明:在公鸡中,g.64195613 C>T位点CC基因型胫长显著高于TT基因型(P<0.05);在母鸡中,g.64195411 G>A位点AA基因型龙骨长显著高于AG基因型(P<0.05),g.64196373 T>C位点CC基因型胫长极显著高于CT基因型(P<0.01),g.64196735 T>C位点CT基因型胫长显著高于TT基因型(P<0.05)。基因型与屠宰性状关联分析结果表明:在公鸡中,g.64196735 T>C位点CC基因型活体质量显著高于CT基因型(P<0.05);在母鸡中,g.64195613 C>T位点CC基因型腹脂率显著高于CT基因型(P<0.05),g.64196373 T>C位点CC基因型半净膛率显著高于CT基因型(P<0.05)。[结论]BMP6基因多态性与粤西卷羽鸡的部分生长性状及屠宰性状相关,可作为粤西卷羽鸡标记辅助选择的候选基因。 展开更多
关键词 粤西卷羽鸡 bmp6基因 生长性状 屠宰性状 单核苷酸多态性 关联分析
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BMP6基因在单、双羔蒙古羊不同生理时期卵巢组织中的差异表达及分析 被引量：3
3
作者 杨燕燕 杜文 +7 位作者 刘永斌 达来 王标 青格勒 周璇 何亭漪 乌达巴拉 田瑛 《畜牧与饲料科学》 2017年第3期25-27,31,共4页
为了进一步探讨经SSH筛选的蒙古羊繁殖差异基因BMP6对蒙古羊双羔性状的影响及作用机制,利用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)检测了单、双羔蒙古羊发情第0、5、10、15天时卵巢组织中BMP6基因的表达水平,比较了BMP6基因在蒙古羊单、双羔群... 为了进一步探讨经SSH筛选的蒙古羊繁殖差异基因BMP6对蒙古羊双羔性状的影响及作用机制,利用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)检测了单、双羔蒙古羊发情第0、5、10、15天时卵巢组织中BMP6基因的表达水平,比较了BMP6基因在蒙古羊单、双羔群体中的差异表达情况。结果表明,在一个发情周期中,单羔组和双羔组蒙古羊卵巢组织中BMP6基因的mRNA表达水平变化趋势相似:发情第0天表达量最低,发情第10天时表达量最高,且显著高于其他时期(P<0.05);双羔组发情第0天和第10天的BMP6基因mRNA表达量分别显著(P<0.05)和极显著(P<0.01)高于相应时期的单羔组。综上提示,BMP6基因是影响蒙古羊双羔性状的候选基因。 展开更多
关键词 bmp6基因 蒙古羊 卵巢 双羔 RT-QPCR
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