题名 序列比对程序Blat在转录组数据分析中的应用
被引量:3
1
作者
杭兴宜
赵东升
张成岗
机构
军事医学科学院放射医学研究所
军事医学科学院卫生勤务与医学情报研究所
出处
《生物信息学》
2005年第2期85-88,共4页
基金
国家重点基础研究发展计划(973计划)(2003CB715900)
国家高技术研究发展专项经费(2002AA234021)
+2 种基金
国家海外青年学者合作研究基金(30128010)
国家自然科学重大研究计划(90208017)
国家并行与分布处理国防重点实验室基金(51484050304JB4401)
文摘
随着功能基因组学研究领域的快速发展,人们已经开始系统地研究全基因组的转录以及全部基因发挥功能的动态机制。为实现此目标,需要从海量的转录组数据中提炼出能够揭示基因功能以及表达调控的重要信息。采用高性能的序列比对程序以满足规模化的比对需求是其中的瓶颈环节。通过综合比较目前流行的各种序列比对软件的性能,并针对不同的转录组数据分析任务对Blat进行详细的应用分析,结果发现,Blat能够解决转录组数据分析过程中的序列比对这一瓶颈,可广泛应用于功能基因组相关的数据分析任务。
关键词
序列比对
数据分析
转录
程序
功能基因组学
研究领域
动态机制
全基因组
表达调控
基因功能
综合比较
应用分析
分析过程
规模化
性能
Keywords
transcriptome
sequence alignment
blat
Blast
Sim4
分类号
Q75
[生物学—分子生物学]
TP301.6
[自动化与计算机技术—计算机系统结构]
题名 经济简洁的新型BLATS钢水炉外精炼
2
作者
施飒英
机构
宝钢工程技术集团有限公司
出处
《冶金设备》
2018年第1期39-42,47,共5页
文摘
在转炉内初炼的钢液倒入钢包内进行脱氧、脱碳、脱硫、脱磷、脱气、去除非金属夹杂物和调整钢液成分及温度以达到进一步冶炼目的。BLATS法增设了底吹氩等对IR-UT法设备布置进行优化的钢包二次精炼。
关键词
钢包二次精炼
CAS-OB法
LATS法
IR-UT法
blat S法
Keywords
Secondary refining of ladle CAS-OB LATS IR-UT blat S
分类号
TF769
[冶金工程—钢铁冶金]
题名 传统PLC远程通信的改进方法
3
作者
陈曦
郭江飞
韩亚杰
机构
河北工业大学控制科学与工程学院
出处
《自动化与仪表》
北大核心
2014年第10期27-28,36,共3页
文摘
传统PLC远程通信是基于相应PLC远程通信硬件模块或者构建VPN通道形式进行通信,在成本上需要支付相应的硬件费用与通信费用,相应硬件模块占用额外空间,并且某些单位出于安全角度并不对外开放VPN通道。该文主要设计思路为,在WinCC7.0软件中运用VB语言编程访问SQL Server 2005实现报表输出,通过编写Windows脚本定时自助发送文档报表的形式来解决远程通信问题。省去了部分通信硬件,方法简单实用,不需要现场人员具有较高的计算机水平,跳过VPN通道,克服传统方式存在的不足。
关键词
WINCC
数据报表
SQL
SERVER
blat
Keywords
WinCC
data report
SQL Server
blat
分类号
TP391.8
[自动化与计算机技术—计算机应用技术]
题名 DNA序列的甲基化特征提取软件
被引量:2
4
作者
戴胜冬
杨昆
顾靓
王路路
机构
杭州电子科技大学计算机学院
出处
《生物信息学》
2012年第1期5-7,共3页
基金
国家自然科学基金(No.60903086)
文摘
提取(量化)特征是DNA甲基化状态预测中的一个关键步骤,然而不同的方法所使用的特征并不相同,特征量化的具体过程计算繁琐。本文集成文献中的重要特征,设计并实现了DNA序列的特征提取软件工具。该软件封装了特征的计算过程,可以方便地批量计算目标序列的相关特征,为后续的数据分析和挖掘提供便利。
关键词
DNA甲基化
特征提取
CPG岛
blat
软件
Keywords
DNA methylation
feature extraction
CpG island
blat
Software
分类号
Q518.2
[生物学—生物化学]
题名 R-301驱避剂化学合成及生物活性的研究
被引量:8
5
作者
贾家祥
金长发
施恒华
蔡国英
倪齐珍
王乃健
机构
中国预防医学科学院寄生虫病研究所
上海杜梆技术有限公司
出处
《中华卫生杀虫药械》
CAS
2002年第2期9-12,共4页
文摘
目的:阐述新型R-301驱避剂的合成及其驱避效果;方法:驱蚊活性按GB/T 17322.10-1998规定进行试验,驱蠊活性用选室法进行试验,驱螨活性采用计算驱避率法进行试验;结果:7%浓度R-301对白纹伊蚊有效保护时间平均为3.80±0.86 h,100%保护率的时间为3 h,0.1%和0.3%浓度对德国小蠊1~10 d具有杀灭作用,11-46 d有驱避作用,驱避率均为100%。对尘螨的驱避率,其浓度为0.1%、0.3%和0.5%均为100%,R-301对大肠杆菌、金黄色葡萄球菌和糠秕孢子菌的最小抑菌浓度(MTC)分别为0.125、0.25和0.01;结论:R-301驱避剂合成线路简便合理,对蚊、蠊、螨和菌具有生物活性,为一新型广谱的驱避剂,有开发推广应用前景。
关键词
R-301
驱避剂
化学合成
生物活性
Keywords
R - 301 repellent, chemical synthesis, biological activity, Culex pipiens pallen, Dermatophagoides farinae, blat -tella germanica
分类号
R979.8
[医药卫生—药品]
题名 矿用牙轮钻机动态参数测取
6
作者
杜蜀
刘立松
机构
太原重型机械学院工程机械系
北京钢铁设计总院
出处
《太原重型机械学院学报》
1992年第4期65-72,共8页
文摘
本文讨论了矿用牙轮钻机动态轴压、扭矩、应力响应及振动参数的测取。在实测中,采用了先进的遥测技术。结合理论计算结果,对实验信号进行了测量误差分析,说明所采用的测试手段是可行的,所得到的测试结果是令人满意的。
关键词
牙轮钻机
钻机
动态参量
Keywords
blat s-hole drill, dynamic measurement, remote measuring technique
分类号
TD422.1
[矿业工程—矿山机电]
题名 衢州市主要病媒生物对常用卫生杀虫剂的抗药性调查
被引量:3
7
作者
朱霖
胡晓龙
陆献耀
机构
浙江省衢州市爱国卫生运动委员会办公室
浙江省衢州市疾病预防控制中心传防科
出处
《中国医药导报》
CAS
2017年第2期62-65,共4页
基金
浙江省衢州市科技课题研究计划项目(2013J065)
文摘
目的了解衢州市淡色库蚊、家蝇、德国小蠊对常用卫生杀虫剂的抗性现状,为科学使用化学杀虫剂防制病媒生物提供可靠依据。方法溴氰菊酯、高效氯氰菊酯、残杀威、敌敌畏、氯菊酯、仲丁威、乙酰甲胺磷7种杀虫剂来源于中国疾病预防控制中心。现场试虫来源于衢州市区农贸市场、餐饮场所、宾馆饭店、垃圾中转站、垃圾箱桶等,对照试虫来源于浙江省疾病预防控制中心实验室。浸渍法测定淡色库蚊4龄期幼虫的半数致死浓度,点滴法分别测定家蝇和德国小蠊的半数致死量。结果淡色库蚊自然品系对敌敌畏、溴氰菊酯、高效氯氰菊酯、仲丁威、残杀威抗性倍数分别为16.87、13.08、9.52、7.66、2.63倍;家蝇自然品系对高效氯氰菊酯、溴氰菊酯、敌敌畏、残杀威、氯菊酯抗性倍数分别为13.14、6.22、5.59、5.21、4.87倍;德国小蠊自然品系对高效氯氰菊酯、乙酰甲胺磷、溴氰菊酯、氯菊酯、残杀威抗性倍数分别为23.69、14.51、11.58、8.99、8.20倍。结论根据抗性判定标准,淡色库蚊、家蝇、德国小蠊自然品系对7种常用杀虫剂存在不同程度的抗性,其中德国小蠊对高效氯氰菊酯为高抗。
关键词
病媒生物
卫生杀虫剂
抗性倍数
淡色库蚊
家蝇
德国小蠊
Keywords
Vector
Hygienic insecticide
Resistance ra-tio
Culex pipiens pallens
Musca domestica vicina
blat -tella germanica
分类号
R184.3
[医药卫生—流行病学]
题名 Mg-Al/PTFE混合物的爆炸性质
被引量:4
8
作者
李玲琴
武静博
机构
中北大学化工与环境学院
出处
《化工中间体》
2014年第5期30-33,39,共5页
文摘
此研究的主题是关于包含微小颗粒的镁铝合金(PAM)与高度分散的聚四氟乙烯的混合物烟火药的爆炸性质。该混合物显示出时机械冲击和热作用的很明显的钝感,但对明火和火花的极度的敏感。此混合物的燃烧速率随着密度的减少而增加,最小为1cm/s、最大为100m/s。当装药密度小于1 g/cm3时,混合物发生非常激烈的燃烧,现象甚至与爆轰类似。,当装药密度在1.1g/cm3以上时,混合物能够稳定燃烧。本论文主要就松装密度下的混合物以高速率燃烧时空气中产生的压力冲击进行了研究。该压力冲击不同于典型的冲击波,波阵面压力从爆炸中心点刘最大距离可持续50~100ms,而典型的冲击波在等量装药时一般小于1ms。合成物的起爆方式会影响压力冲击的形状和参数。已经有人提出了对于该合成物燃烧速率的巨大变化的合理解释,在该文献中所述的效果,均使用来自具有耐爆炸性的工业门和窗户的评价。
关键词
PTFE氧化剂
高速燃烧
冲击波:耐爆炸压力
Keywords
PTFE as oxidizer
high-rate combusion
blat wave
explosive pressure resistance
分类号
TQ560.1
[化学工程—炸药化工]