为探索胃癌中BICC1基因表达水平的临床预后意义及其在胃癌进展中的功能,通过分析肿瘤基因组图谱计划(the cancer genome atlas program,TCGA)中BICC1在胃癌及癌旁组织中转录水平表达的差异,回顾性研究了BICC1转录表达水平与临床病理特...为探索胃癌中BICC1基因表达水平的临床预后意义及其在胃癌进展中的功能,通过分析肿瘤基因组图谱计划(the cancer genome atlas program,TCGA)中BICC1在胃癌及癌旁组织中转录水平表达的差异,回顾性研究了BICC1转录表达水平与临床病理特征及预后之间的关系。利用单样本基因集富集分析(single sample gene set enrichment analysis,ss GSEA)研究BICC1高表达与肿瘤免疫细胞浸润的相关性,用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)研究胃癌中BICC1高表达相关的信号通路。TCGA泛癌的数据集分析结果表明,多种肿瘤组织中BICC1的mRNA相对表达量显著高于癌旁组织(P<0.01)。进行Wilcoxon秩和检验和logistic回归分析,认为胃癌BICC1转录水平的高表达与肿瘤原发灶大小、Lauren分型、肿瘤分化期、人种等特征均显著相关(P<0.05)。通过Kaplan-Meier生存分析和多因素Cox回归,认为胃癌BICC1的高表达与患者更差的总生存期(overall survival,OS)显著相关(P<0.05),是影响总生存期的独立风险因素之一。通过ssGSEA分析,认为BICC1的表达与自然杀伤细胞、巨噬细胞、未成熟树突状细胞(immature dendritic cells,iDCs)、效应型记忆T细胞(effector memory T cells,Tem)浸润水平具有显著相关性(P<0.001)。通过GSEA分析,认为BICC1的高表达与肿瘤细胞TGF-β1、MAPK、Wnt、JAK-STAT和mTOR等信号通路显著富集有关(FDR<0.25,P<0.05)。综上所述,BICC1转录水平高表达与影响胃癌进展的恶性表型密切相关,其可能是一个可预测胃癌预后的独立风险因素。展开更多
文摘为探索胃癌中BICC1基因表达水平的临床预后意义及其在胃癌进展中的功能,通过分析肿瘤基因组图谱计划(the cancer genome atlas program,TCGA)中BICC1在胃癌及癌旁组织中转录水平表达的差异,回顾性研究了BICC1转录表达水平与临床病理特征及预后之间的关系。利用单样本基因集富集分析(single sample gene set enrichment analysis,ss GSEA)研究BICC1高表达与肿瘤免疫细胞浸润的相关性,用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)研究胃癌中BICC1高表达相关的信号通路。TCGA泛癌的数据集分析结果表明,多种肿瘤组织中BICC1的mRNA相对表达量显著高于癌旁组织(P<0.01)。进行Wilcoxon秩和检验和logistic回归分析,认为胃癌BICC1转录水平的高表达与肿瘤原发灶大小、Lauren分型、肿瘤分化期、人种等特征均显著相关(P<0.05)。通过Kaplan-Meier生存分析和多因素Cox回归,认为胃癌BICC1的高表达与患者更差的总生存期(overall survival,OS)显著相关(P<0.05),是影响总生存期的独立风险因素之一。通过ssGSEA分析,认为BICC1的表达与自然杀伤细胞、巨噬细胞、未成熟树突状细胞(immature dendritic cells,iDCs)、效应型记忆T细胞(effector memory T cells,Tem)浸润水平具有显著相关性(P<0.001)。通过GSEA分析,认为BICC1的高表达与肿瘤细胞TGF-β1、MAPK、Wnt、JAK-STAT和mTOR等信号通路显著富集有关(FDR<0.25,P<0.05)。综上所述,BICC1转录水平高表达与影响胃癌进展的恶性表型密切相关,其可能是一个可预测胃癌预后的独立风险因素。
