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BDA1型短趾症中的IHH信号通路
1
作者
沈陆
吴茜
+2 位作者
韦雨琦
贺林
秦胜营
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2017年第4期403-408,共6页
Hedgehog(HH)信号通路是动物发育的关键调控之一,在所有的两侧对称动物中都有表达[2].HH信号通路有3种同源蛋白:SHH,IHH和DHH.Indian Hedgehog(IHH)信号通路是一条重要的发育相关通路,在多种生理过程中起非常关键的调控作用[3].在...
Hedgehog(HH)信号通路是动物发育的关键调控之一,在所有的两侧对称动物中都有表达[2].HH信号通路有3种同源蛋白:SHH,IHH和DHH.Indian Hedgehog(IHH)信号通路是一条重要的发育相关通路,在多种生理过程中起非常关键的调控作用[3].在IHH基因敲除的小鼠(Mus musculus)模型中,
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关键词
IHH信号通路
短趾症
bda1
软骨内骨化
基因敲除
肢干
musculus
信号传导
核转录因子
下游靶
暂未订购
短指症(Brachydactyly)一家系调查及遗传分析
被引量:
1
2
作者
赵秀丽
邢立强
+1 位作者
单祥年
侯惠敏
《中国优生与遗传杂志》
2002年第4期99-101,共3页
本文对中国河北一短指家系 94名成员调查 ,该家系 7代共有患者 2 6人 ,男性患者 10人 ,女性患者 16人 ;通过对 16名现存患者体查以及对先证者等 6名患者手足骨骼X线片分析 ,发现患者指 (趾 )短小主要源于中指 (趾 )骨、掌 (跖 )骨短小...
本文对中国河北一短指家系 94名成员调查 ,该家系 7代共有患者 2 6人 ,男性患者 10人 ,女性患者 16人 ;通过对 16名现存患者体查以及对先证者等 6名患者手足骨骼X线片分析 ,发现患者指 (趾 )短小主要源于中指 (趾 )骨、掌 (跖 )骨短小畸形或中指 (趾 )骨与末端指 (趾 )骨愈合 ,基本与Bell[1] 短指症A1型 (BrachydactylytypeA1或BDA1)有关BDA1主要临床特征相符 ,但该家系多数患者伴其他手足畸形 ,与Bell[1] ,Fitch[2 ] ,Xinping .Yang[3 ] 等对BDA1描述有所不同 ,所以 ,我们认为这是一种未曾报道的短指症。
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关键词
短指症
bda1
PAX3
HOXD13
HOXA13
遗传异质性
暂未订购
ChIP-seq技术分析突变IHH-GLI1信号传导通路对下游转录调控的影响
被引量:
1
3
作者
王挺
沈陆
+4 位作者
魏慕筠
周伟
李沫
贺林
秦胜营
《晓庄学院自然科学学报》
CAS
北大核心
2020年第6期27-35,共9页
为发现IHH/GLI1突变导致的下游转录调控的变化,在小鼠间充质干细胞C3H10T1/2中加入人野生型重组IHH-N蛋白(WT)和突变型蛋白(MT,p.E95K)以激活IHH信号通路,利用染色体免疫沉淀高通量测序(ChIP-seq)技术挖掘GLI1转录因子结合靶点,并对其...
为发现IHH/GLI1突变导致的下游转录调控的变化,在小鼠间充质干细胞C3H10T1/2中加入人野生型重组IHH-N蛋白(WT)和突变型蛋白(MT,p.E95K)以激活IHH信号通路,利用染色体免疫沉淀高通量测序(ChIP-seq)技术挖掘GLI1转录因子结合靶点,并对其进行基因功能注释和KEGG通路分析,再结合前期基因芯片数据进行联合分析。利用ChIP-seq生物信息学分析发现两组间465个不同的GLI1结合靶点,基因注释和KEGG通路分析的结果主要富集于Wnt、刺猬因子(HH)、胰岛素等参与调控长板软骨发育的关键信号通路。联合分析发现了两个数据集中19个共同的候选基因。本研究精确定位了IHH信号蛋白突变导致的GLI1结合靶点差异,为进一步探索由IHH信号介导的BDA1的发病机制和治疗靶点提供理论基础。
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关键词
A1型短指症
印度刺猬因子(IHH)
GLI1
CHIP-SEQ
靶基因
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职称材料
题名
BDA1型短趾症中的IHH信号通路
1
作者
沈陆
吴茜
韦雨琦
贺林
秦胜营
机构
上海交通大学Bio-X研究院
出处
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2017年第4期403-408,共6页
文摘
Hedgehog(HH)信号通路是动物发育的关键调控之一,在所有的两侧对称动物中都有表达[2].HH信号通路有3种同源蛋白:SHH,IHH和DHH.Indian Hedgehog(IHH)信号通路是一条重要的发育相关通路,在多种生理过程中起非常关键的调控作用[3].在IHH基因敲除的小鼠(Mus musculus)模型中,
关键词
IHH信号通路
短趾症
bda1
软骨内骨化
基因敲除
肢干
musculus
信号传导
核转录因子
下游靶
分类号
R596 [医药卫生—内科学]
暂未订购
题名
短指症(Brachydactyly)一家系调查及遗传分析
被引量:
1
2
作者
赵秀丽
邢立强
单祥年
侯惠敏
机构
东南大学医学院医学遗传中心
张家口医学院
出处
《中国优生与遗传杂志》
2002年第4期99-101,共3页
文摘
本文对中国河北一短指家系 94名成员调查 ,该家系 7代共有患者 2 6人 ,男性患者 10人 ,女性患者 16人 ;通过对 16名现存患者体查以及对先证者等 6名患者手足骨骼X线片分析 ,发现患者指 (趾 )短小主要源于中指 (趾 )骨、掌 (跖 )骨短小畸形或中指 (趾 )骨与末端指 (趾 )骨愈合 ,基本与Bell[1] 短指症A1型 (BrachydactylytypeA1或BDA1)有关BDA1主要临床特征相符 ,但该家系多数患者伴其他手足畸形 ,与Bell[1] ,Fitch[2 ] ,Xinping .Yang[3 ] 等对BDA1描述有所不同 ,所以 ,我们认为这是一种未曾报道的短指症。
关键词
短指症
bda1
PAX3
HOXD13
HOXA13
遗传异质性
分类号
R596.1 [医药卫生—内科学]
暂未订购
题名
ChIP-seq技术分析突变IHH-GLI1信号传导通路对下游转录调控的影响
被引量:
1
3
作者
王挺
沈陆
魏慕筠
周伟
李沫
贺林
秦胜营
机构
上海交通大学生命科学技术学院Bio-X研究院
出处
《晓庄学院自然科学学报》
CAS
北大核心
2020年第6期27-35,共9页
基金
上海市2011年度“科技创新行动计划”重大科技项目子课题(11dz1950300)。
文摘
为发现IHH/GLI1突变导致的下游转录调控的变化,在小鼠间充质干细胞C3H10T1/2中加入人野生型重组IHH-N蛋白(WT)和突变型蛋白(MT,p.E95K)以激活IHH信号通路,利用染色体免疫沉淀高通量测序(ChIP-seq)技术挖掘GLI1转录因子结合靶点,并对其进行基因功能注释和KEGG通路分析,再结合前期基因芯片数据进行联合分析。利用ChIP-seq生物信息学分析发现两组间465个不同的GLI1结合靶点,基因注释和KEGG通路分析的结果主要富集于Wnt、刺猬因子(HH)、胰岛素等参与调控长板软骨发育的关键信号通路。联合分析发现了两个数据集中19个共同的候选基因。本研究精确定位了IHH信号蛋白突变导致的GLI1结合靶点差异,为进一步探索由IHH信号介导的BDA1的发病机制和治疗靶点提供理论基础。
关键词
A1型短指症
印度刺猬因子(IHH)
GLI1
CHIP-SEQ
靶基因
Keywords
Brachydactyly type A1(
bda1
)
Indian hedgehog(IHH)
GLI1
ChIP-seq
target genes
分类号
Q78 [生物学—分子生物学]
R285.5 [医药卫生—中药学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
BDA1型短趾症中的IHH信号通路
沈陆
吴茜
韦雨琦
贺林
秦胜营
《中国科学:生命科学》
CSCD
北大核心
2017
0
暂未订购
2
短指症(Brachydactyly)一家系调查及遗传分析
赵秀丽
邢立强
单祥年
侯惠敏
《中国优生与遗传杂志》
2002
1
暂未订购
3
ChIP-seq技术分析突变IHH-GLI1信号传导通路对下游转录调控的影响
王挺
沈陆
魏慕筠
周伟
李沫
贺林
秦胜营
《晓庄学院自然科学学报》
CAS
北大核心
2020
1
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