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2020年黑河市某规模化牛场BAstV检测及ORF1a基因遗传变异分析 被引量：1
1
作者 杨硕 朱庆贺 +1 位作者 王笑冉 孙东波 《黑龙江八一农垦大学学报》 2022年第2期52-58,共7页
为调查2020年黑河市某规模化奶牛养殖场中牛星状病毒(bovine astrovirus,BAstV)的感染及遗传进化情况,应用RT-PCR方法对该牛场的腹泻样品进行检测,并对BAstV ORF1a基因进行扩增、测序以及遗传进化分析。结果表明,15份腹泻粪便样品中,BA... 为调查2020年黑河市某规模化奶牛养殖场中牛星状病毒(bovine astrovirus,BAstV)的感染及遗传进化情况,应用RT-PCR方法对该牛场的腹泻样品进行检测,并对BAstV ORF1a基因进行扩增、测序以及遗传进化分析。结果表明,15份腹泻粪便样品中,BAstV的检测阳性率为20%(3/15),对测序成功的2株BAstV毒株进行序列分析显示,鉴定的2株BAstV毒株的核苷酸与氨基酸同源性分别为99.3%和99.4%。2株毒株都与我国BAstV四川流行毒株,登录号NC_037655.1核苷酸同源性较高,分别为96.6%和97.3%,而其与嗜神经型BAstV欧洲毒株,KX266908.1差异较大,核苷酸同源性分别为36.7%和37.4%。系统发育进化树结果显示,试验鉴定的2株BAstV与已报道的其他中国BAstV流行参考毒株关系密切。 展开更多
关键词 bastv ORF1a基因 遗传进化分析
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重庆肉牛腹泻相关病毒的检测及遗传进化分析 被引量：7
2
作者 王牧川 岳华 +1 位作者 汤承 杨泽林 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2017年第9期2731-2738,共8页
为了解重庆市肉牛病毒性腹泻的病原流行情况,本研究对重庆市8个肉牛养殖场的81份腹泻粪便样本中牛病毒性腹泻—黏膜病病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)、牛冠状病毒(bovine coronavirus,BCV)、牛轮状病毒(bovine rotavirus,BRV)... 为了解重庆市肉牛病毒性腹泻的病原流行情况,本研究对重庆市8个肉牛养殖场的81份腹泻粪便样本中牛病毒性腹泻—黏膜病病毒(bovine viral diarrhea virus,BVDV)、牛冠状病毒(bovine coronavirus,BCV)、牛轮状病毒(bovine rotavirus,BRV)和牛星状病毒(bovine astrovirus,BAstV)4种致腹泻病毒进行了RT-PCR检测,对PCR产物进行测序,用Mega 6.0软件进行系统发育分析。结果显示,BRV、BAstV和BVDV检出率分别为66.7%、8.6%和7.4%,BCV未检出。遗传进化分析结果表明,测序的5个BRV单独聚为一小支,与GenBank中其他VP6序列有明显的遗传距离;BVDV与中国株和丹麦株聚为一支,遗传关系最近;5个BAstV单独聚为一支,与中国香港株遗传关系最近,但仍有明显的遗传距离。本试验结果表明,重庆地区肉牛腹泻主要发生在6月龄以下犊牛,BRV是该地区肉牛腹泻的重要原因,BRV、BAstV和BVDV 3种病毒的遗传多样性值得进一步关注。 展开更多
关键词 肉牛 牛病毒性腹泻—黏膜病病毒 牛星状病毒 牛冠状病毒 牛轮状病毒
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