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基于遗传算法的DNA序列聚类可靠性评估 被引量：1
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作者 孙杰 李重 《浙江理工大学学报（自然科学版）》 2017年第3期461-466,共6页
聚类分析是分子生物学家推断同源序列进化关系的常用技术,评估聚类的可靠性是聚类分析的重要内容。Bootstrap是评估聚类可靠性的一种统计方法,它替换DNA序列的所有核苷酸碱基以进行采样分析。在Bootstrap方法的基础上,提出了一种评估DN... 聚类分析是分子生物学家推断同源序列进化关系的常用技术,评估聚类的可靠性是聚类分析的重要内容。Bootstrap是评估聚类可靠性的一种统计方法,它替换DNA序列的所有核苷酸碱基以进行采样分析。在Bootstrap方法的基础上,提出了一种评估DNA序列聚类可靠性的改进方法。该方法首先按照一定比例随机抽取原始DNA序列的部分碱基,然后对抽取的每个碱基利用遗传算法进行替换。提出的方法考虑了碱基之间的相关性,得到的样本更接近于原始序列,且更符合生物渐进进化的结果。使用该方法对DNA序列聚类构建的进化树进行可靠性评估。实验结果发现可靠性评估的准确率得到了提高,表明该方法可行、有效。 展开更多
关键词 DNA序列 聚类分析 进化树 b00tstrap 可靠性
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