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一株石油降解菌 Aquabacterium oleiNBRC 110486的基因组完成图及分析 被引量：1
1
作者 唐标 常江 +3 位作者 肖兴宁 吴静 钱鸣蓉 杨华 《浙江农业科学》 2021年第6期1213-1217,共5页
Aquabacterium olei RBRC 110486是一种新发现的具有降解石油能力的革兰氏阴性菌。为进一步探究该菌株降解石油的分子机制,挖掘菌株可能存在的生物功能,本研究使用PacBio高通量测序技术对其进行全基因组测序,基于完成图进行基因预测、... Aquabacterium olei RBRC 110486是一种新发现的具有降解石油能力的革兰氏阴性菌。为进一步探究该菌株降解石油的分子机制,挖掘菌株可能存在的生物功能,本研究使用PacBio高通量测序技术对其进行全基因组测序,基于完成图进行基因预测、功能注释以及次级代谢产物合成基因簇预测。该菌株基因组大小为3890087 bp,GC含量为67.33%,共3402个蛋白;另外发现大小为366221 bp的环形质粒pTB101,GC含量为66.91%,325个蛋白。共预测到2个可能的次级代谢产物合成基因簇。定位了该菌株的石油降解关键酶链烷1-单加氧酶AlkB,与假单胞菌属聚类在同一个分支。该基因组是Aquabacterium属的首个报道的序列完成图,已提交至美国国立生物技术信息中心(NCBI)的GenBank数据库,登录号分别为CP029210和CP029211。以上研究将为菌株NBRC 110486的功能基因组学及石油降解特性研究提供基础数据。 展开更多
关键词 aquabacterium olei NBRC 110486 全基因组完成图 石油降解
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制药用水环境分离菌用于荧光染色快检技术的专属性研究
2
作者 任凤姣 王杠杠 马仕洪 《中国药业》 2025年第4期88-91,共4页
目的 研究制药用水环境分离菌用于荧光染色快检技术的专属性。方法 根据国内外相关法规对微生物检验替代方法验证的要求,取伯克霍尔德菌、慢生根瘤菌和水杆状菌菌悬液(浓度≤1 000 cfu/mL),参考传统染色时间(3,7,5 d),分别在不同培养节... 目的 研究制药用水环境分离菌用于荧光染色快检技术的专属性。方法 根据国内外相关法规对微生物检验替代方法验证的要求,取伯克霍尔德菌、慢生根瘤菌和水杆状菌菌悬液(浓度≤1 000 cfu/mL),参考传统染色时间(3,7,5 d),分别在不同培养节点染色以确定微生物最佳染色时间。实验设快检方法组(培养至最佳染色时间)、复培养组(最佳染色时间染色后培养至传统染色时间)、传统培养组(培养至传统染色时间)、阴性对照组(快检方法及传统培养),各组染色、培养后统计菌落数,试验平行3次,计算快检方法与传统培养、快检方法与染色后复培养及染色后复培养与快检方法计数结果平均值的比值(分别记为平均回收率1,2,3),验证荧光染色快检技术的专属性。结果 3种菌的最佳染色时间分别为26,72,40 h。与药典方法相比,3种菌平均回收率均大于0.7(水杆状菌除外,其因菌落形态特殊,无计数结果,故无回收率3),符合替代方法验证要求。结论 荧光染色快检技术适用于检测制药用水中引入的伯克霍尔德菌、慢生根瘤菌和水杆状菌。 展开更多
关键词 伯克霍尔德菌 慢生根瘤菌 水杆状菌 荧光染色法 快检技术 制药用水 专属性 回收率
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