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魔芋苯丙氨酸解氨酶基因家族鉴定及表达分析
1
作者
杨希睿
黄禾芮
+4 位作者
胡馨月
王俊杰
黄梦蕾
俞振明
李效贤
《核农学报》
北大核心
2026年第3期445-454,共10页
苯丙氨酸解氨酶(PAL)是苯丙烷代谢的关键限速酶,在植物生长发育和次生代谢等方面具有重要作用。为明确PALs家族在魔芋生长发育中的作用,本研究利用生物信息学方法对AkPALs家族成员的理化特性、系统发育树、基序及保守结构域、顺式元件...
苯丙氨酸解氨酶(PAL)是苯丙烷代谢的关键限速酶,在植物生长发育和次生代谢等方面具有重要作用。为明确PALs家族在魔芋生长发育中的作用,本研究利用生物信息学方法对AkPALs家族成员的理化特性、系统发育树、基序及保守结构域、顺式元件等进行分析,同时比较了AkPALs在魔芋不同器官、球茎的不同生长阶段及镧诱导下的表达模式。结果显示,7个魔芋AkPALs家族基因分布在5条染色体上,编码212~759个氨基酸,分布在3个分枝中,与单子叶植物亲缘关系较近。AkPALs家族启动子区域富集光响应、激素响应及逆境响应元件。结合转录组数据与镧诱导后的实时荧光定量PCR(qRTPCR)分析,筛选出与魔芋球茎生长发育及其生物碱合成代谢密切相关的AkPAL4/5。本研究结果为魔芋AkPALs基因及其生物学功能的深入研究提供了理论参考。
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关键词
魔芋
akpals
生物信息学
表达分析
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题名
魔芋苯丙氨酸解氨酶基因家族鉴定及表达分析
1
作者
杨希睿
黄禾芮
胡馨月
王俊杰
黄梦蕾
俞振明
李效贤
机构
浙江中医药大学药学院
出处
《核农学报》
北大核心
2026年第3期445-454,共10页
基金
2025年浙江省自然科学基金项目(ZCLQN25H2803)
2023年浙江省自然科学基金项目(LY23H280003)
+1 种基金
国家自然科学基金项目(32000257)
国家级大学生创新创业训练计划项目(202410344068X)。
文摘
苯丙氨酸解氨酶(PAL)是苯丙烷代谢的关键限速酶,在植物生长发育和次生代谢等方面具有重要作用。为明确PALs家族在魔芋生长发育中的作用,本研究利用生物信息学方法对AkPALs家族成员的理化特性、系统发育树、基序及保守结构域、顺式元件等进行分析,同时比较了AkPALs在魔芋不同器官、球茎的不同生长阶段及镧诱导下的表达模式。结果显示,7个魔芋AkPALs家族基因分布在5条染色体上,编码212~759个氨基酸,分布在3个分枝中,与单子叶植物亲缘关系较近。AkPALs家族启动子区域富集光响应、激素响应及逆境响应元件。结合转录组数据与镧诱导后的实时荧光定量PCR(qRTPCR)分析,筛选出与魔芋球茎生长发育及其生物碱合成代谢密切相关的AkPAL4/5。本研究结果为魔芋AkPALs基因及其生物学功能的深入研究提供了理论参考。
关键词
魔芋
akpals
生物信息学
表达分析
Keywords
Amorphophallus konjac
akpals
bioinformatics
expression analysis
分类号
S632.3 [农业科学—蔬菜学]
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题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
魔芋苯丙氨酸解氨酶基因家族鉴定及表达分析
杨希睿
黄禾芮
胡馨月
王俊杰
黄梦蕾
俞振明
李效贤
《核农学报》
北大核心
2026
0
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