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芹菜AgDREBA6b基因的克隆及非生物胁迫响应分析
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作者 谢芳杰 胡锦凤 +4 位作者 张文佳 王欣茹 周守航 杨桂臻 吕瑞恒 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第4期233-241,共9页
为研究DREBA6b基因在芹菜非生物胁迫中的作用机制,从转录组数据中筛选出芹菜DREBA6b基因参考序列并设计引物从津南实芹中克隆到该基因全长cDNA,并命名为AgDREBA6b,对该基因结构、序列特征及系统进化等进行生物信息分析,并利用qPCR检测... 为研究DREBA6b基因在芹菜非生物胁迫中的作用机制,从转录组数据中筛选出芹菜DREBA6b基因参考序列并设计引物从津南实芹中克隆到该基因全长cDNA,并命名为AgDREBA6b,对该基因结构、序列特征及系统进化等进行生物信息分析,并利用qPCR检测该基因在非生物胁迫下的表达模式。结果表明:(1)理化性质表明,AgDREBA6b含1个长度为1023 bp的开放阅读框,编码340个氨基酸,含有典型的AP2转录因子保守结构域;AgDREBA6b蛋白是亲水性蛋白,不具有信号肽和跨膜结构。(2)同源序列比对显示,AgDREBA6b蛋白与其他植物DREB蛋白具有高度保守性,与天竺葵和胡萝卜亲缘关系最近。启动子分析发现含13种顺式元件,其中2种植物生长发育元件、6种激素响应元件和5种胁迫响应元件。(3)qPCR分析显示,AgDREBA6b基因在低温、高温、干旱、高盐等逆境胁迫诱导下具有不同的表达模式,在低温、干旱和盐胁迫诱导后先上调再下调,然而高温下随着时间的增加呈现持续上升趋势,说明AgDREBA6b基因受非生物胁迫诱导表达,尤其高温响应更为显著。 展开更多
关键词 芹菜 agdreba6b 克隆 基因表达模式 表达分析
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