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子宫内膜癌组织KIF18B、ASF1B表达与患者临床病理特征和生存预后的关系
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作者 叶小琳 梁新丽 张超 《中国临床新医学》 2025年第9期1021-1026,共6页
目的探讨驱动蛋白家族成员18B(KIF18B)、抗沉默功能蛋白1B(ASF1B)在子宫内膜癌(EC)组织中的表达情况,分析二者与临床病理特征和生存预后的关系。方法通过生物信息学方法分析正常组织和子宫体子宫内膜癌(UCEC)组织中KIF18B、ASF1B mRNA... 目的探讨驱动蛋白家族成员18B(KIF18B)、抗沉默功能蛋白1B(ASF1B)在子宫内膜癌(EC)组织中的表达情况,分析二者与临床病理特征和生存预后的关系。方法通过生物信息学方法分析正常组织和子宫体子宫内膜癌(UCEC)组织中KIF18B、ASF1B mRNA和蛋白的表达水平。收集2016年7月至2021年7月西安市人民医院(西安市第四医院)收治的226例EC患者的临床资料。术中留取EC组织和癌旁组织(距癌组织边缘3~5 cm)。采用实时荧光定量聚合酶链反应(FQ-PCR)法检测EC组织和癌旁组织KIF18B mRNA、ASF1B mRNA的表达水平。采用SP法免疫组化染色检测EC组织和癌旁组织中KIF18B、ASF1B蛋白的表达情况。术后对患者进行3年随访,记录患者生存预后情况。结果TCGA数据库显示,UCEC组织中KIF18B mRNA、ASF1B mRNA水平显著高于正常组织(P<0.05)。CPTAC数据库显示,UCEC组织中ASF1B蛋白表达水平显著高于正常组织(P<0.05)。EC组织中KIF18B mRNA、ASF1B mRNA水平显著高于癌旁组织(P<0.05)。EC组织中KIF18B蛋白阳性表达率、ASF1B蛋白阳性表达率显著高于癌旁组织(P<0.05)。KIF18B、ASF1B蛋白表达情况与肌层浸润深度、国际妇产科联盟(FIGO)分期、淋巴结转移情况有关(P<0.05)。多因素Cox回归分析结果显示,FIGO分期Ⅲ期、KIF18B蛋白阳性表达、ASF1B蛋白阳性表达是EC患者发生死亡的独立危险因素(P<0.05)。KIF18B、ASF1B蛋白阴性表达患者的生存预后显著优于其阳性表达患者(log-rank检验:χ^(2)=8.518,P=0.004;log-rank检验:χ^(2)=9.993,P=0.002)。结论EC组织中KIF18B、ASF1B均呈高表达,且二者与肌层浸润深度、FIGO分期、淋巴结转移情况和生存预后密切相关。 展开更多
关键词 子宫内膜癌 驱动蛋白家族成员18B 抗沉默功能蛋白1B 临床病理特征 生存预后
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癌组织miR-218联合ASF1B预测前列腺癌根治术后复发的价值
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作者 韩广业 马阔 +3 位作者 宋伟航 刘沛 张少华 余沁楠 《海南医学》 CAS 2024年第20期2969-2973,共5页
目的探讨癌组织微小RNA-218(miR-218)联合组蛋白伴侣抗沉默功能蛋白1B(ASF1B)预测前列腺癌根治术后患者复发的价值。方法前瞻性选取2021年1月至2023年5月新乡医学院第一附属医院收治的252例前列腺癌患者作为研究对象,所有患者均实施前... 目的探讨癌组织微小RNA-218(miR-218)联合组蛋白伴侣抗沉默功能蛋白1B(ASF1B)预测前列腺癌根治术后患者复发的价值。方法前瞻性选取2021年1月至2023年5月新乡医学院第一附属医院收治的252例前列腺癌患者作为研究对象,所有患者均实施前列腺癌根治术,术后接受为期1年的随访,根据术后1年复发情况分为复发组50例和未复发组202例。比较癌组织、癌旁组织及两组患者癌组织miR-218、ASF1B m RNA表达水平。采用多因素Logistic回归分析癌组织miR-218、ASF1B m RNA对术后复发风险的影响;采用受试者工作特征(ROC)曲线分析癌组织miR-218、ASF1B m RNA表达水平联合预测术后复发风险的价值。结果癌组织miR-218表达水平为0.47±0.13,明显低于癌旁组织的0.86±0.21,而癌组织ASF1B mRNA表达水平为1.54±0.49,明显高于癌旁组织的1.05±0.18,差异均有统计学意义(P<0.05);复发组患者癌组织的miR-218表达水平为0.25±0.08,明显低于未复发组的0.52±0.17,而ASF1B m RNA表达水平为2.03±0.66,明显高于未复发组的1.42±0.46,差异均有统计学意义(P<0.05);经多因素Logistic回归分析结果显示,校正了术后病理分期、术前PSA、术后切缘阳性后,癌组织miR-218、ASF1B mRNA仍是术后复发的独立相关影响因素(P<0.05);经ROC分析结果显示,癌组织miR-218、ASF1B m RNA及联合检测预测术后复发的ROC曲线下面积(AUC)为0.803、0.824、0.936,联合检测的AUC大于miR-218、ASF1B mRNA,差异均有统计学意义(P<0.05)。结论癌组织miR-218、ASF1B m RNA表达与前列腺癌根治术后复发风险独立相关,联合检测抑癌因子miR-218和促癌因子ASF1B m RNA能提高对患者术后复发的预测价值,为前列腺癌根治术后分层管理、治疗决策等提供重要的参考依据。 展开更多
关键词 前列腺癌 复发 微小RNA-218 组蛋白伴侣抗沉默功能1B 预测效能
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基于数据库分析ASF1B在胃癌中的表达与预后的关系 被引量:2
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作者 李蒙蒙 黄露 +3 位作者 李全营 密奥宁 纪知语 秦长江 《河南大学学报(医学版)》 CAS 2021年第5期329-334,共6页
[目的]研究ASF1B基因在胃癌中的表达水平,进而分析ASF1B基因表达水平与预后的关系。[方法]从TCGA(the cancer genome atlas)数据库和GEO(Gene ExPession Omnibus)数据库中下载胃癌的RNA-seq和临床数据;分析TCGA数据库中ASF1B在胃癌组织... [目的]研究ASF1B基因在胃癌中的表达水平,进而分析ASF1B基因表达水平与预后的关系。[方法]从TCGA(the cancer genome atlas)数据库和GEO(Gene ExPession Omnibus)数据库中下载胃癌的RNA-seq和临床数据;分析TCGA数据库中ASF1B在胃癌组织与癌旁组织的差异表达;采用KaPlan-Meier方法分析GEO数据库和TCGA数据库中ASF1B表达量与患者总生存期的关系,并采用COX回归分析基因表达和其他临床相关因素与预后的关系;应用GSEA软件分析ASF1B在胃癌中的作用通路;绘制预后相关列线图并计算C-指数。[结果]胃癌组织中ASF1B的表达量显著高于癌旁组织;K-M生存分析显示ASF1B低表达的总生存率较差,多因素COX分析表明ASF1B为患者总体生存率的独立预后因素,验证集显示相似的结果,绘制列线图预测胃癌患者1 a、2 a、3 a的生存率并验证C指数表明模型准确度良好;ASF1B高表达主要在细胞周期、同源重组、错配修复、碱基切除修复等通路存在富集,ASF1B低表达主要在ECM受体相互作用和Hedgehog信号通路上富集。[结论]ASF1B低表达水平可作为胃癌患者预后不佳的独立因素,评估ASF1B的表达可能有助于预测患者预后。 展开更多
关键词 胃癌 asf1b基因 预后关系 TCGA
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ASF1B通过PI3K/Akt通路调节人胶质瘤细胞的增殖和侵袭 被引量:2
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作者 程创 陈元武 +3 位作者 熊伟 侯良绢 夏菁 邓雪松 《神经解剖学杂志》 CAS CSCD 2022年第3期314-320,共7页
目的:探讨抗沉默功能1B组蛋白伴侣(ASF1B)对人胶质瘤细胞的增殖与侵袭的影响及机制。方法:首先比较GENT2数据库中正常人脑组织与人脑肿瘤组织中ASF1B的表达,分析ASF1B表达与预后的关系;WesternBlot法检测A172、U87、U251和HS683细胞系中... 目的:探讨抗沉默功能1B组蛋白伴侣(ASF1B)对人胶质瘤细胞的增殖与侵袭的影响及机制。方法:首先比较GENT2数据库中正常人脑组织与人脑肿瘤组织中ASF1B的表达,分析ASF1B表达与预后的关系;WesternBlot法检测A172、U87、U251和HS683细胞系中ASF1B的表达;采用siRNA技术抑制人脑胶质瘤细胞系U251和U87细胞ASF1B基因表达;分别通过CCK-8法和Transwell小室法检测U251和U87细胞增殖和侵袭情况,Western Blot法检测PI3K/Akt通路中p-Akt和p-mTOR蛋白的表达水平。结果:与正常脑组织相比,ASF1B在人脑肿瘤组织中的表达明显增加,ASF1B高表达的人脑肿瘤患者总生存期更短(P=0.036);ASF1B下调不仅明显抑制U251和U87细胞的增殖和侵袭;也明显抑制p-Akt和p-mTOR蛋白表达。结论:ASF1B通过PI3K/Akt通路促进U251和U87细胞增殖和侵袭。 展开更多
关键词 抗沉默功能1B组蛋白伴侣 PI3K AKT 增殖 侵袭 人脑胶质瘤细胞
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ASF1B在肾透明细胞癌中的表达及临床意义 被引量:1
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作者 郑天云 孙井涛 +1 位作者 崔浩辰 阎磊 《泌尿外科杂志(电子版)》 2023年第2期28-36,共9页
目的探讨ASF1B基因在肾透明细胞癌患者中的表达水平及对临床预后的意义。方法通过在肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)及UCSC Xena数据库下载并分析肾透明细胞癌基因表达数据共607例,其中正常肾组织及癌旁组织数据72例,肾透... 目的探讨ASF1B基因在肾透明细胞癌患者中的表达水平及对临床预后的意义。方法通过在肿瘤基因图谱(the cancer genome atlas,TCGA)及UCSC Xena数据库下载并分析肾透明细胞癌基因表达数据共607例,其中正常肾组织及癌旁组织数据72例,肾透明细胞癌数据535例。明确ASF1B基因在肾透明细胞癌组织与正常组织间的表达差异,分析ASF1B表达与患者生存时间的相关性。使用生信线上工具(GEPIA、cBioPortal、STRING以及TIMER)探究肾透明细胞癌患者ASF1B表达与基因突变及甲基化水平相关性,研讨其与肿瘤免疫微环境的相互作用,探讨ASF1B对肾透明细胞癌的预测能力。结果ASF1B基因在肾透明细胞癌细胞中表达水平明显高于正常肾组织中的表达水平(P=2.22e^(-16));ASF1B基因高表达组的患者生存周期明显低于ASF1B基因低表达组(P=0.024)。ASF1B基因在经过多因素回归分析(P<0.001)后可确定为肾透明细胞癌的高风险独立预后因子。ASF1B基因突变水平无法作为患者预后的诊断指标;cg06969527甲基化位点的甲基化程度与基因表达呈负相关(P=0.0048,HR=-0.16)。ASF1B基因表达水平与CD4^(+)T细胞表达水平呈负相关(P=5.89e^(-1),Rho=-0.025),与CD8^(+)T细胞表达水平呈正相关(P=2.04e^(-10),Rho=0.29),与CD2基因表达水平呈正相关(P=2.47e^(-21),Rho=0.395),与CD3D基因表达水平呈正相关(P=9.54e^(-22),Rho=0.399),与CD3E基因表达水平呈正相关(P=1.58e^(-20),Rho=0.387)。结论ASF1B基因与肾透明细胞癌患者的不良预后有关,可以作为肾透明细胞癌的独立危险因素。 展开更多
关键词 生物信息学 肾透明细胞癌 asf1b 基因突变 甲基化 生物标志物
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ASF1B对子宫内膜癌细胞恶性行为的影响及相关机制 被引量:5
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作者 白驹 斗泽加 《分子诊断与治疗杂志》 2020年第10期1357-1362,共6页
目的探究ASF1B在子宫内膜癌中的表达情况及其与细胞恶性行为的关系。方法收集68例子宫内膜癌患者的肿瘤组织及癌旁组织,qPCR检测组织中ASF1B的表达水平。培养人子宫内膜癌细胞HEC-151及KLE,通过细胞转染技术将HEC-151细胞分为对照组、... 目的探究ASF1B在子宫内膜癌中的表达情况及其与细胞恶性行为的关系。方法收集68例子宫内膜癌患者的肿瘤组织及癌旁组织,qPCR检测组织中ASF1B的表达水平。培养人子宫内膜癌细胞HEC-151及KLE,通过细胞转染技术将HEC-151细胞分为对照组、过表达组及回复组;KLE细胞分为无意义组及干扰组;Transwell实验检测各组细胞侵袭迁移能力;CCK-8法检测各组细胞增殖能力;Western Blotting及qPCR检测各组细胞中ASF1B、FOXM1、CDK6及VEGFB的表达含量。结果qPCR结果提示ASF1B在子宫内膜癌组织中表达水平显著升高,并与患者高临床分期、淋巴结转移及预后不良相关,相关性分析发现ASF1B与FOXM1表达正相关(P<0.05);相比对照组,过表达组细胞体外增殖及转移能力显著增强,FOXM1、CDK6及VEGFB的蛋白表达水平显著上升,差异有统计学意义(P<0.05);而相比过表达组,回复组细胞体外增殖及转移能力显著减弱,FOXM1、CDK6及VEGFB的蛋白表达水平显著降低,差异有统计学意义(P<0.05)。相比无意义组,干扰组细胞体外增殖及转移能力显著减弱,差异有统计学意义(P<0.05)。FOXM1、CDK6及VEGFB的表达水平显著降低,差异有统计学意义(P<0.05)。结论ASF1B可促进FOXM1的表达,并促进子宫内膜癌细胞的增殖及转移能力,增强其恶性表型。 展开更多
关键词 子宫内膜癌 asf1b FOXM1 恶性表型
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ASF1B在胶质母细胞瘤中的表达及其与患者预后的关系
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作者 李思博 关梅村 +2 位作者 曹艳菲 姜旭东 张丽娜 《科学技术创新》 2022年第5期29-32,共4页
目的:应用生物信息学技术分析组蛋白伴侣抗沉默功能蛋白1B(anti-silencing function 1B,ASF1B)在胶质母细胞瘤中的表达水平以及与患者预后的相关性。方法:通过下载TCGA数据和GEPIA数据库分析了ASF1B在胶质母细胞瘤以及低级别胶质瘤中的... 目的:应用生物信息学技术分析组蛋白伴侣抗沉默功能蛋白1B(anti-silencing function 1B,ASF1B)在胶质母细胞瘤中的表达水平以及与患者预后的相关性。方法:通过下载TCGA数据和GEPIA数据库分析了ASF1B在胶质母细胞瘤以及低级别胶质瘤中的表达水平,通过CCLE数据库和HPA数据库在线分析了ASF1B在胶质瘤细胞株以及组织中的表达状态,通过PrognoScan数据库分析了ASF1B与胶质瘤患者预后的相关性。结果显示:ASF1B在胶质瘤中表达上调,并且与低级别胶质瘤相比,ASF1B在胶质母细胞瘤中具有更高的表达水平。ASF1B在胶质瘤中的表达高于多数肿瘤,并且ASF1B在高级别胶质瘤组织中蛋白表达增强。PrognoScan数据表明ASF1B与胶质瘤患者不良预后相关。 展开更多
关键词 胶质母细胞瘤 生物信息学 asf1b MRNA
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组蛋白去乙酰化酶3通过调节miR-625/ASF1B轴抑制乳腺癌细胞焦亡 被引量:2
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作者 商平平 张颜明 +1 位作者 王向臣 徐立成 《中华内分泌外科杂志》 CAS 2022年第5期541-547,共7页
目的探讨组蛋白去乙酰化酶3(histone deacetylase 3,HDAC3)调节miR-625/组蛋白伴侣抗沉默功能蛋白1B(anti-silencing function 1B,ASF1B)轴对乳腺癌(breast cancer,BC)细胞焦亡的影响及其作用机制。方法采用qRT-PCR法检测HDAC3、miR-625... 目的探讨组蛋白去乙酰化酶3(histone deacetylase 3,HDAC3)调节miR-625/组蛋白伴侣抗沉默功能蛋白1B(anti-silencing function 1B,ASF1B)轴对乳腺癌(breast cancer,BC)细胞焦亡的影响及其作用机制。方法采用qRT-PCR法检测HDAC3、miR-625和ASF1B在乳腺癌(breast cancer,BC)组织和癌旁正常组织、BC细胞系(T47D、MCF7和MDA-MB-231)和人正常乳腺上皮细胞MCF-10A中的表达水平。采用Western blot实验检测细胞焦亡相关蛋白NLRP3、Caspase-1和GSDMD的表达水平。ELISA法检测焦亡相关炎性因子IL-18和IL-1β的表达水平。ChIP实验用于测定HDAC3与miR-625的互作用关系。双荧光素酶报告实验验证miR-625和ASF1B的靶向关系。结果与癌旁正常组织和MCF-10A细胞比较,BC组织和细胞中的HDAC3和ASF1B表达升高,miR-625表达降低(均P<0.05)。与si-NC组比较,si-HDAC3组细胞NLRP3、Caspase-1和GSDMD的蛋白表达水平升高,细胞培养上清液中IL-18和IL-1β的浓度升高(均P<0.05)。HDAC3通过结合miR-625的启动子区域抑制其表达(P<0.05)。与si-HDAC3+miR-NC组比较,si-HDAC3+miR-625 inhibitor组细胞中NLRP3、Caspase-1、GSDMD、IL-18和IL-1β的表达减少(均P<0.05)。ASF1B被证实为miR-625的靶基因,si-HDAC3+pcDNA3.1-ASF1B组细胞中的焦亡相关因子水平显著低于si-HDAC3+pcDNA3.1-NC组。结论HDAC3通过抑制miR-625上调ASF1B的表达,进而抑制BC细胞焦亡。 展开更多
关键词 组蛋白去乙酰化酶3 miR-625 抗沉默功能蛋白1B 乳腺癌 焦亡
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组蛋白分子伴侣ASF1在胃癌中的诊断和预后价值
9
作者 刘慧 唐启明 +2 位作者 焦艳 卿松 谢光琴 《医学理论与实践》 2024年第22期3798-3802,共5页
目的:探讨组蛋白分子伴侣ASF1在胃癌中的诊断和预后价值。方法:应用GEPIA数据库和Kaplan-Meier数据库评估ASF1的两个亚型ASF1A和ASF1B在胃癌中的表达情况以及在胃癌中的预后价值。选取本院于2021年6月—2022年6月收治的38例胃癌患者为... 目的:探讨组蛋白分子伴侣ASF1在胃癌中的诊断和预后价值。方法:应用GEPIA数据库和Kaplan-Meier数据库评估ASF1的两个亚型ASF1A和ASF1B在胃癌中的表达情况以及在胃癌中的预后价值。选取本院于2021年6月—2022年6月收治的38例胃癌患者为研究对象,验证信息分析学结果。通过收集胃癌组织和癌旁组织,并采用qRT-PCR、免疫组化、Western Blot分析ASF1A和ASF1B的表达量。对患者进行平均18个月的随访,研究ASF1A和ASF1B与患者预后的关系。结果:信息分析学和入组患者的样本分析结果一致表明,ASF1B的表达量在胃癌组织中显著升高。ASF1B与生存时间存在负相关,即其高表达预示着不良预后。此外,ASF1B的表达与肿瘤大小、淋巴结转移和TNM分期显著相关(P<0.05)。然而,ASF1A在胃癌组织和正常胃组织中的表达未发现明显差异。结论:ASF1B在胃癌组织中高表达,并且与胃癌患者的生存时间和临床病理特征密切相关,表明ASF1B在胃癌的诊断和预后预测方面具有重要价值。 展开更多
关键词 胃癌 ASF1A asf1b 生物标志物 癌症 诊断 预后
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基于生物信息学分析宫颈癌关键基因及预后相关生物标志物 被引量:2
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作者 鲁伟 姚轶敏 +1 位作者 陈平 陈婷婷 《浙江中西医结合杂志》 2021年第12期1105-1110,共6页
目的从公共数据库筛选并探讨宫颈鳞状细胞癌的关键致病基因。方法从GEO数据库GSE122697、GSE89657里下载宫颈组织表达谱芯片数据。利用R软件和韦恩图查找数据集的差异表达基因(DEGs)交集,进行GO和KEGG通路富集分析。利用STRING数据库构... 目的从公共数据库筛选并探讨宫颈鳞状细胞癌的关键致病基因。方法从GEO数据库GSE122697、GSE89657里下载宫颈组织表达谱芯片数据。利用R软件和韦恩图查找数据集的差异表达基因(DEGs)交集,进行GO和KEGG通路富集分析。利用STRING数据库构建了DEGs的蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPIs)并导入Cytoscape软件进一步分析,通过CytoHubba插件和MCC算法筛选出DEGs。利用癌症基因组图谱(TCGA)数据库对已初步筛选的DEGs进行验证及生存曲线分析,并进一步筛选与宫颈癌总生存率相关的DEGs进行ROC分析,获得关键基因。结果宫颈鳞状细胞癌差异基因56个,其中15个上调和41个下调。GO及KEGG分析结果显示,这些mRNA主要参与细胞核分裂、细胞外基质代谢调控等生物学进程;主要富集于细胞周期、减数分裂、PI3K-Akt信号通路、ECM受体相互作用通路等。通过PPI网络中筛选出18个核心基因,并在TCGA数据集中得以验证,生存曲线分析的结果表明18个差异基因中的ASF1B基因对宫颈癌患者生存预后具有显著影响[HR=0.437(0.272~0.704),P<0.01],ROC分析的结果表明其对宫颈癌患者具有很好的诊断价值(AUC=0.998)。结论本研究通过综合生物信息学分析,有望为宫颈癌诊断和预后提供可靠的分子生物标志物和治疗靶点。 展开更多
关键词 宫颈鳞状细胞癌 生物信息学 抗沉默功能蛋白1B
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