目的建立快速检测CYP3A5基因型的新方法及其临床应用。方法针对CYP3A5不同基因型特异性位点设计引物,采用等位基因特异性PCR方法(Allele specific PCR,AS-PCR)进行扩增,通过琼脂糖凝胶电泳分辨不同基因型,并检测临床标本100例,与一代测...目的建立快速检测CYP3A5基因型的新方法及其临床应用。方法针对CYP3A5不同基因型特异性位点设计引物,采用等位基因特异性PCR方法(Allele specific PCR,AS-PCR)进行扩增,通过琼脂糖凝胶电泳分辨不同基因型,并检测临床标本100例,与一代测序法比对两个方法的一致率。结果新方法检测100例临床标本中,CYP3A5基因型*1/*1型15例;*1/*3型26例;*3/*3型59例,结果与一代测序法一致,一致率100%。结论通过AS-PCR检测CYP3A5基因型,操作简便,结果易于判断,可应用于临床。展开更多
目的根据allele-specific PCR(AS-PCR)原理,建立具有良好敏感性与特异性的百日咳鲍特菌23S r RNA位点变异检测方法。方法基于百日咳鲍特菌23S r RNA A2047G位点突变与其对红霉素耐药的相关性,设计包含特异变异位点的引物进行两阶段PCR反...目的根据allele-specific PCR(AS-PCR)原理,建立具有良好敏感性与特异性的百日咳鲍特菌23S r RNA位点变异检测方法。方法基于百日咳鲍特菌23S r RNA A2047G位点突变与其对红霉素耐药的相关性,设计包含特异变异位点的引物进行两阶段PCR反应,根据电泳有无特异大小目的片段的出现,确定百日咳鲍特菌23S r RNA A2047G位点是否有变异。结果以基因序列测定法为金标准的评价结果显示,AS-PCR法检测突变型菌株的灵敏度为96%(144/150),特异度为100%(100/100),kappa=0.95(P<0.01);检测野生型菌株的灵敏度为100%(18/18),特异度为100%(100/100),kappa=1(P<0.01)。结论 AS-PCR方法检测百日咳鲍特菌23S r RNA A2047G位点变异具有较高灵敏度和特异度,适用于普通微生物实验室开展百日咳鲍特菌对红霉素耐药性的快速检测。展开更多
文摘目的建立快速检测CYP3A5基因型的新方法及其临床应用。方法针对CYP3A5不同基因型特异性位点设计引物,采用等位基因特异性PCR方法(Allele specific PCR,AS-PCR)进行扩增,通过琼脂糖凝胶电泳分辨不同基因型,并检测临床标本100例,与一代测序法比对两个方法的一致率。结果新方法检测100例临床标本中,CYP3A5基因型*1/*1型15例;*1/*3型26例;*3/*3型59例,结果与一代测序法一致,一致率100%。结论通过AS-PCR检测CYP3A5基因型,操作简便,结果易于判断,可应用于临床。
文摘目的根据allele-specific PCR(AS-PCR)原理,建立具有良好敏感性与特异性的百日咳鲍特菌23S r RNA位点变异检测方法。方法基于百日咳鲍特菌23S r RNA A2047G位点突变与其对红霉素耐药的相关性,设计包含特异变异位点的引物进行两阶段PCR反应,根据电泳有无特异大小目的片段的出现,确定百日咳鲍特菌23S r RNA A2047G位点是否有变异。结果以基因序列测定法为金标准的评价结果显示,AS-PCR法检测突变型菌株的灵敏度为96%(144/150),特异度为100%(100/100),kappa=0.95(P<0.01);检测野生型菌株的灵敏度为100%(18/18),特异度为100%(100/100),kappa=1(P<0.01)。结论 AS-PCR方法检测百日咳鲍特菌23S r RNA A2047G位点变异具有较高灵敏度和特异度,适用于普通微生物实验室开展百日咳鲍特菌对红霉素耐药性的快速检测。
