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完全性肺静脉异位引流患儿的ARHGEF16基因突变筛查及突变功能分析
被引量：
1
1
作者
王静
金理辉
+2 位作者
张琪
孙锟
于昱
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期70-75,共6页
目的·探究完全性肺静脉异位引流(total anomalous pulmonary venous connection,TAPVC)的发病机制,通过全外显子测序筛查出致病基因ARHGEF16,并对其进行功能验证。方法·收集78例TAPVC患儿及100例正常对照儿童的血液、临床资...
目的·探究完全性肺静脉异位引流(total anomalous pulmonary venous connection,TAPVC)的发病机制,通过全外显子测序筛查出致病基因ARHGEF16,并对其进行功能验证。方法·收集78例TAPVC患儿及100例正常对照儿童的血液、临床资料及辅助检查结果,抽提全血DNA进行ARHGEF16突变筛查。构建ARHGEF16野生型及突变型表达质粒,转染293T细胞,通过实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,RT-qPCR)和蛋白质印迹法(Western blotting)分别检测mRNA和蛋白的表达水平;通过软件Cytoscape进行蛋白与蛋白之间的相互作用分析。结果·在TAPVC患儿中发现ARHGEF16基因2个未报道的突变位点c.C236>T(A79V)和c.G619>C(G207R),在对照组中未发现。与野生型相比,突变型ARHGEF16 mRNA和蛋白表达量均上调。蛋白相互作用分析显示,ARHGEF16与RAC1可以直接相关联;通过RT-qPCR检测,发现在过表达ARHGEF16时,RAC1表达上调。结论·ARHGEF16的错义突变影响了ARHGEF16 mRNA及蛋白表达水平,过表达ARHGEF16可上调RAC1的表达,提示其可能通过对RAC1的调控参与TAPVC的形成及发展。
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关键词
完全性肺静脉异位引流
arhgef16
错义突变
RAC1
发育
暂未订购
基于数据挖掘分析肺腺癌中ARHGEF16的表达及其临床意义
被引量：
3
2
作者
赵森
唐俊明
《临床与实验病理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期695-697,共3页
目的探讨Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子16(Rho guanine nucleotide exchange factor 16,ARHGEF16)在肺腺癌中的表达及临床意义。方法使用Oncomine数据库挖掘ARHGEF16的信息,并对ARHGEF16在肺腺癌中的表达及临床意义进行分析,采用SPSS 22.0软...
目的探讨Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子16(Rho guanine nucleotide exchange factor 16,ARHGEF16)在肺腺癌中的表达及临床意义。方法使用Oncomine数据库挖掘ARHGEF16的信息,并对ARHGEF16在肺腺癌中的表达及临床意义进行分析,采用SPSS 22.0软件进行统计学分析,Graphpad Prism 7.0绘制患者生存曲线。结果与正常肺组织相比,肺腺癌组织中的ARHGEF16基因呈高表达(P<0.001)。在肺腺癌组织中,EPHB3基因与ARHGEF16表达有相关性(r=0.933)。肺腺癌患者的总生存期与ARHGEF16基因高表达呈负相关(P=0.032)。结论肺腺癌组织中ARHGEF16的表达高于对应正常肺组织,且与患者预后呈负相关,提示ARHGEF16可能参与肺腺癌的发生、发展。
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关键词
肺肿瘤
腺癌
arhgef16
EPHB3
预后
暂未订购
题名
完全性肺静脉异位引流患儿的ARHGEF16基因突变筛查及突变功能分析
被引量：
1
1
作者
王静
金理辉
张琪
孙锟
于昱
机构
上海交通大学医学院附属新华医院小儿心血管科心血管发育与再生医学研究所
出处
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第1期70-75,共6页
基金
国家自然科学基金（81974021）~~
文摘
目的·探究完全性肺静脉异位引流(total anomalous pulmonary venous connection,TAPVC)的发病机制,通过全外显子测序筛查出致病基因ARHGEF16,并对其进行功能验证。方法·收集78例TAPVC患儿及100例正常对照儿童的血液、临床资料及辅助检查结果,抽提全血DNA进行ARHGEF16突变筛查。构建ARHGEF16野生型及突变型表达质粒,转染293T细胞,通过实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,RT-qPCR)和蛋白质印迹法(Western blotting)分别检测mRNA和蛋白的表达水平;通过软件Cytoscape进行蛋白与蛋白之间的相互作用分析。结果·在TAPVC患儿中发现ARHGEF16基因2个未报道的突变位点c.C236>T(A79V)和c.G619>C(G207R),在对照组中未发现。与野生型相比,突变型ARHGEF16 mRNA和蛋白表达量均上调。蛋白相互作用分析显示,ARHGEF16与RAC1可以直接相关联;通过RT-qPCR检测,发现在过表达ARHGEF16时,RAC1表达上调。结论·ARHGEF16的错义突变影响了ARHGEF16 mRNA及蛋白表达水平,过表达ARHGEF16可上调RAC1的表达,提示其可能通过对RAC1的调控参与TAPVC的形成及发展。
关键词
完全性肺静脉异位引流
arhgef16
错义突变
RAC1
发育
Keywords
total anomalous pulmonary venous connection
arhgef16
missense mutations
RAC1
development
分类号
R725.4 [医药卫生—儿科]
暂未订购
题名
基于数据挖掘分析肺腺癌中ARHGEF16的表达及其临床意义
被引量：
3
2
作者
赵森
唐俊明
机构
湖北医药学院基础医学院/胚胎干细胞研究湖北省重点实验室
出处
《临床与实验病理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020年第6期695-697,共3页
基金
国家自然科学基金(81670272)
湖北省重大技术创新专项(2018ACA162)。
文摘
目的探讨Rho鸟嘌呤核苷酸交换因子16(Rho guanine nucleotide exchange factor 16,ARHGEF16)在肺腺癌中的表达及临床意义。方法使用Oncomine数据库挖掘ARHGEF16的信息,并对ARHGEF16在肺腺癌中的表达及临床意义进行分析,采用SPSS 22.0软件进行统计学分析,Graphpad Prism 7.0绘制患者生存曲线。结果与正常肺组织相比,肺腺癌组织中的ARHGEF16基因呈高表达(P<0.001)。在肺腺癌组织中,EPHB3基因与ARHGEF16表达有相关性(r=0.933)。肺腺癌患者的总生存期与ARHGEF16基因高表达呈负相关(P=0.032)。结论肺腺癌组织中ARHGEF16的表达高于对应正常肺组织,且与患者预后呈负相关,提示ARHGEF16可能参与肺腺癌的发生、发展。
关键词
肺肿瘤
腺癌
arhgef16
EPHB3
预后
分类号
R734.2 [医药卫生—肿瘤]
暂未订购
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
完全性肺静脉异位引流患儿的ARHGEF16基因突变筛查及突变功能分析
王静
金理辉
张琪
孙锟
于昱
《上海交通大学学报（医学版）》
CAS
CSCD
北大核心
2020
1
暂未订购
2
基于数据挖掘分析肺腺癌中ARHGEF16的表达及其临床意义
赵森
唐俊明
《临床与实验病理学杂志》
CAS
CSCD
北大核心
2020
3
暂未订购
已选择
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