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鸭ARHGDIB基因克隆、生物信息学及组织表达研究
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作者 郑好 刘梦云 +6 位作者 王明玉 董霞 史良玉 余博 杨宇 周傲 陈星 《中国畜牧兽医》 北大核心 2025年第7期3004-3015,共12页
【目的】旨在研究鸭Rho GDP解离抑制因子β(ARHGDIB)基因功能,进一步解析鸭皮下脂肪沉积的机理。【方法】以28日龄武禽10肉鸭肝脏组织cDNA为模板克隆ARHGDIB基因,经琼脂糖凝胶电泳及测序验证正确后,利用在线软件对所获序列进行比对及生... 【目的】旨在研究鸭Rho GDP解离抑制因子β(ARHGDIB)基因功能,进一步解析鸭皮下脂肪沉积的机理。【方法】以28日龄武禽10肉鸭肝脏组织cDNA为模板克隆ARHGDIB基因,经琼脂糖凝胶电泳及测序验证正确后,利用在线软件对所获序列进行比对及生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR检测ARHGDIB基因在鸭胸腺、肺脏、脾脏、心脏、十二指肠、肝脏、肾脏、腹脂、胸肌、腿肌、皮脂中的相对表达量。【结果】鸭ARHGDIB基因全长1409 bp,预测其编码区长693 bp,包含7个外显子,可编码230个氨基酸,其中亮氨酸含量最高,占比为10%。鸭ARHGDIB基因核苷酸序列与鹅、牛、犬、山羊、斑马鱼、马、家猫、鸡、人、猕猴、家鼠、绵羊、黑猩猩、狒狒、野猪、野鸽的相似性分别为82.56%、50.53%、58.75%、54.08%、24.94%、56.30%、35.31%、81.79%、54.10%、54.90%、49.44%、47.25%、56.22%、55.99%、55.17%和82.64%。系统进化树分析表明,鸭与鹅的亲缘关系最近,其次为野鸽。鸭ARHGDIB蛋白属于稳定的亲水性蛋白,无跨膜结构,有24个磷酸化位点、2个N-糖基化位点,亚细胞定位预测蛋白主要定位在线粒体。鸭ARHGDIB蛋白二级结构由α-螺旋、延长链、β-转角和无规则卷曲4种类型组成,占比分别为25.22%、23.91%、4.35%和46.52%。三级结构与二级结构预测结果一致。实时荧光定量PCR结果显示,ARHGDIB基因在鸭各组织中均有表达,其中在胸腺中的表达量最高,且显著高于其他组织(P<0.05);其次是脾脏、心脏、肺脏;在皮脂中的表达量最低,且显著低于其他组织(P<0.05)。【结论】鸭ARHGDIB基因编码区长693 bp,编码230个氨基酸,为亲水性蛋白,主要定位于线粒体。ARHGDIB基因在鸭各组织中均有表达,且在胸腺中表达量最高,皮脂中表达量最低。该研究为进一步探索鸭ARHGDIB基因的功能提供了理论依据,为解析其在脂肪代谢中的调节作用和鸭定向育种奠定基础。 展开更多
关键词 鸭 arhgdib基因 克隆 生物信息学分析 组织表达
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