期刊文献+
共找到3篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
多数据库分析ARHGAP44在结直肠癌中的表达及临床意义 被引量:1
1
作者 姜小叶 姜钟翔 +3 位作者 向丽莼 吴焦 陈雪诺 姜政 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期97-104,共8页
目的:探讨多个数据集中结直肠组织的Rho GTP酶活化蛋白44(Rho GTPase activating protein 44,ARHGAP44)表达情况及其与结直肠癌临床病理特征和预后的关系。方法:利用基因表达汇编(the gene expression omnibus,GEO)及癌症和肿瘤基因表... 目的:探讨多个数据集中结直肠组织的Rho GTP酶活化蛋白44(Rho GTPase activating protein 44,ARHGAP44)表达情况及其与结直肠癌临床病理特征和预后的关系。方法:利用基因表达汇编(the gene expression omnibus,GEO)及癌症和肿瘤基因表达图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据集汇总结直肠癌相关数据,分析ARHGAP44表达及其与结直肠癌临床病理学的关系,用Kaplan-Meier分析和Cox回归模型评价其预后价值。采用RT-qPCR方法检测临床样本中ARHGAP44基因表达情况,之后使用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)预测通路,并使用单样本基因集富集分析(single-sample gene-set enrichment analysis,ssGSEA)算法,计算ARHGAP44与免疫细胞浸润之间的关联。结果:在TCGA、GEO数据集及临床样本中,ARHGAP44表达在肿瘤中降低(P<0.001),且与T分期及TNM分期有关(P<0.05)。ARHGAP44的低表达是结直肠癌患者总体生存(overall survival,OS)的独立危险因素(HR=0.44,P=0.02)。GSEA结果显示,ARHGAP44高表达样本中富集了结直肠癌通路、Notch通路、T细胞受体、B细胞受体等基因集。ARHGAP44的表达与macrophages、T helper cells、肿瘤浸润淋巴细胞(tumorinfiltrating lymphocytes,TIL)和typeⅠIFNresponse等免疫信号成负相关(cor=-0.35、-0.37、-0.33、-0.35、-0.23、-0.32,P=0.008、0.006、0.027、0.021、0.041、0.021)。结论:ARHGAP44的表达在结直肠癌中被下调,可作为独立的预后生物标记物,且在肿瘤免疫学中具有潜在作用。 展开更多
关键词 结直肠癌 arhgap44 预后 免疫
原文传递
Mutant p53 promotes cell spreading and migration via ARHGAP44 被引量:4
2
作者 Jinjin Xu Jian Jiao +8 位作者 Wei Xu Lei Ji Dongjie Jiang Shaofang Xie Syeda Kubra Xiaotao Li Junjiang Fu Jianru Xiao Bianhong Zhang 《Science China(Life Sciences)》 SCIE CAS CSCD 2017年第9期1019-1029,共11页
The tumor suppressor p53 protein is either lost or mutated in about half of all human cancers.Loss of p53 function is well known to influence cell spreading,migration and invasion.While expression of mutant p53 is not... The tumor suppressor p53 protein is either lost or mutated in about half of all human cancers.Loss of p53 function is well known to influence cell spreading,migration and invasion.While expression of mutant p53 is not equivalent to p53 loss,mutant p53 can acquire new functions to drive cell spreading and migration via different mechanisms.In our study,we found that mutant p53 significantly increased cell spreading and migration when comparing with p53-null cells.RNA-Seq analysis suggested that Rho GTPase activating protein 44(ARHGAP44) is a new target of mutant p53,which suppressed AKHGAP44 transcription.ARHGAP44 has GAP activity and catalyze GTP hydrolysis on Cdc42.Higher level of GTP-Cdc42 was correlated with increase expression of mutant p53 and reduced ARHGAP44.Importantly,wt-ARHGAP44 but not mutant ARHGAP44(R291A) suppressed mutant p53 mediated cell spreading and migration.Bioinformatics analysis indicated lower expression of ARHGAP44 in lung carcinoma compared with normal tissues,which was verified by RT-qPCR using specimens from patients.More interestingly,ARHGAP44 mRNA level was lower in tumors with mutant p53 than those with normal p53.Collectively,our results disclose a new mechanism by which mutant p53 stimulates cell spreading and migration. 展开更多
关键词 mutant p53 novel function of arhgap44 cell spreading cell migration CANCER new mechanism
暂未订购
红鳍东方鲀低温胁迫应答主效QTL候选基因的表达特征分析 被引量:1
3
作者 朱理光 刘志峰 +6 位作者 马爱军 王新安 孙志宾 常浩文 刘圣聪 包玉龙 马得友 《渔业科学进展》 CSCD 北大核心 2023年第6期74-82,共9页
红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)为暖温性、广温性鱼类,低温的冬季海水会对其生存造成很大影响,因此,选育具有抗寒性状的品系对其产业发展具有重要意义。本研究在利用QTL(quantitative trait locus)定位分析筛选出6个与红鳍东方鲀耐低温... 红鳍东方鲀(Takifugu rubripes)为暖温性、广温性鱼类,低温的冬季海水会对其生存造成很大影响,因此,选育具有抗寒性状的品系对其产业发展具有重要意义。本研究在利用QTL(quantitative trait locus)定位分析筛选出6个与红鳍东方鲀耐低温相关的候选基因(tacc2、fsip1、exoc4、arhgap44a、pde10a和unc5b)的基础上,通过Real-time PCR检测这6个基因在低温胁迫下在肝脏、心脏和肾脏中表达量的变化。实验用鱼为课题组建立的同一家系的8月龄鱼,共设置3个温度梯度(8℃、13℃和18℃),8℃和13℃为低温组,18℃为对照组。结果显示,6个基因在不同温度下的3个组织中均有不同程度的表达。其中,pde10a基因在3个组织中的表达均呈先升高后下降的趋势;tacc2和exoc4基因在8℃组肝脏、肾脏以及心脏中的表达分别呈先下降再趋于稳定、先升高再趋于稳定和先上升后下降的趋势;unc5b基因在肝脏和心脏中的表达量较低,在低温组实验前期的肾脏中呈现高表达;arhgap44a基因在肝脏中的表达呈上升趋势,在心脏和肾脏中整体表达无明显变化;fsip1基因在肝脏中的表达呈下降趋势,在心脏和肾脏中的表达呈先上升后下降的趋势。这6个基因在红鳍东方鲀组织中均随着时间和温度变化具有差异性表达,在低温胁迫下呈现积极响应,表明这6个QTL候选基因在红鳍东方鲀低温适应中具有潜在的重要作用。本研究可为红鳍东方鲀耐低温相关信号通路研究以及耐低温品种选育提供理论依据。 展开更多
关键词 红鳍东方鲀 pde10a基因 tacc2基因 unc5b基因 exoc4基因 arhgap44a基因 fsip1基因 低温胁迫
在线阅读 下载PDF
上一页 1 下一页 到第
使用帮助 返回顶部