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乙型肝炎病毒相关肝细胞癌癌组织ARHGAP18水平及其基因调控网络分析
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作者 秦浩 方春华 +5 位作者 张磊 冉斌 汪丽萍 罗凌 李应 黄育红 《实用肝脏病杂志》 CAS 2023年第5期694-697,共4页
目的 探讨Rho GTP酶激活蛋白18(ARHGAP18)基因在乙型肝炎病毒相关肝细胞癌(HBV-HCC)组织水平变化及其功能。方法 在基因表达数据库(GEO)中下载数据集以评估ARHGAP18水平。应用UALCAN网站研究不同临床和病理特征的HCC组织ARHGAP18水平差... 目的 探讨Rho GTP酶激活蛋白18(ARHGAP18)基因在乙型肝炎病毒相关肝细胞癌(HBV-HCC)组织水平变化及其功能。方法 在基因表达数据库(GEO)中下载数据集以评估ARHGAP18水平。应用UALCAN网站研究不同临床和病理特征的HCC组织ARHGAP18水平差异及其对预后的影响。在GEO数据集对HBV-HCC多组学队列转录组数据和甲基化阵列数据分析与ARHGAP18水平相关的表观遗传模式。结果 HBV感染患者肝组织ARHGAP18水平为(5.62±0.66),显著高于正常肝组织【(5.04±0.21),P<0.05】;HBV-HCC肿瘤组织ARHGAP18水平为(3988.63±1701.17),显著高于HBV-HCC癌旁肝组织【(1976.34±531.32),P<0.05】;在肝脏边缘组织、距肿瘤2~3 cm癌旁肝组织、肿瘤边缘癌旁肝组织、肿瘤外围组织和肿瘤中心组织ARHGAP18水平分别为(7.06±0.61)、(6.83±0.47)、(6.82±0.42)、(7.75±0.56)和(8.38±0.79),提示越向肿瘤中心组织,ARHGAP18水平呈异常升高趋势(P<0.05);ARHGAP18高水平的HCC患者生存期显著缩短(P<0.05);转录组数据提示ARHGAP18高水平组存在炎症反应、先天性免疫反应、适应性免疫反应和免疫调节等免疫炎症相关通路的激活。结论 ARHGAP18与HBV-HCC发生发展密切相关,其机制值得进一步研究。 展开更多
关键词 肝细胞癌 Rho GTP酶激活蛋白18(arhgap18)基因 细胞衰老 转录组 基因表达数据库
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Human brain arteriovenous malformation:an analysis of differential expressed genes
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作者 Xing Liu Guolu Meng +8 位作者 Tengfei Yu Xiangjiang Lin Liwei Zhang Xiaobin Fei Junting Zhang Zhen Wu Shengze Deng Shuo Wang Jizong Zhao 《Chinese Neurosurgical Journal》 CSCD 2017年第1期21-26,共6页
Background:Much still remains unknown about the pathogenesis of brain arteriovenous malformations(AVMs).Previous studies have revealed the abnormal expression of various angiogenesis-related genes in AVMs.To further u... Background:Much still remains unknown about the pathogenesis of brain arteriovenous malformations(AVMs).Previous studies have revealed the abnormal expression of various angiogenesis-related genes in AVMs.To further understand this disease,we sought to identify genes differently expressed in AVMs by means of the gene microarray technique.Methods:Nine AVMs specimen and nine samples of normal vessels are collected.Total RNA isolated from these specimen is hybridized with Oligonucleotide array and gene analysis was conducted.Analyzing data with the help of significance analysis of microarrays(SAM)and a free web-based molecular annotation system 3.0(MAS 3.0).Results:The SAM method identify 37 gene significantly up-regulated and 10 genes down-regulated in AVMs.Conclusions:Among those genes,VACN,SPARK and ARHGAP18 seem to play a facilitating role during the genesis of AVMs.Multiple pathways,as MAPK pathway,may also be involved. 展开更多
关键词 Brain arteriovenous malformations Gene microarray technique VCAN SPARK arhgap18 MAPK pathway
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