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达格列净通过调节miR-199a-5p和ARHGAP21表达及抑制RhoA/ROCK通路减轻肺纤维化的机制
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作者 张炳丽 许文亚 +2 位作者 刘运婵 郑亚妹 谢甜 《热带医学杂志》 2025年第9期1157-1163,1194,F0004,共9页
目的研究达格列净通过调节miR-199a-5p和Rho GTP酶激活蛋白21(ARHGAP21)的表达及抑制RhoA/Rho相关卷曲螺旋蛋白激酶(ROCK)信号通路对肺纤维化(PF)的潜在治疗作用。方法将C57BL/6小鼠随机分为正常组(未处理)、模型组、5 mg/kg达格列净组... 目的研究达格列净通过调节miR-199a-5p和Rho GTP酶激活蛋白21(ARHGAP21)的表达及抑制RhoA/Rho相关卷曲螺旋蛋白激酶(ROCK)信号通路对肺纤维化(PF)的潜在治疗作用。方法将C57BL/6小鼠随机分为正常组(未处理)、模型组、5 mg/kg达格列净组、20 mg/kg达格列净组,每组6只,模型组、5 mg/kg达格列净组、20 mg/kg达格列净组通过气管内注射博莱霉素建立PF模型,5、20 mg/kg达格列净组分别给予5、20 mg/kg达格列净;苏木素-伊红(HE)和马松(Masson)染色评估小鼠肺组织病理变化。将肺癌细胞A549分为miR-199a-5p模拟物(miR-199a-5p mimic)组和阴性对照(NC-mimic)组,分别转染miR-199a-5p mimic、NC-mimic慢病毒载体,RT-PCR和Western blot检测各组miR-199a-5p和ARHGAP21表达,双荧光素酶报告基因实验验证miR-199a-5p对ARHGAP21的靶向抑制作用,最后通过GLISA分析评估RhoA和ROCK的活性。结果HE染色显示,正常组小鼠肺组织肺泡结构完整,气道和肺泡壁清晰且无增厚;模型组肺泡结构破坏,肺泡壁增厚,并有明显的炎性细胞浸润;与模型组比较,5、20 mg/kg达格列净组小鼠肺组织肺泡结构较为完整,炎性细胞浸润减少,其中20 mg/kg达格列净组肺泡结构接近正常。Masson染色显示,正常组小鼠肺组织仅见少量胶原纤维沉积,模型组中蓝色胶原纤维沉积明显增多,差异有统计学意义(q=14.62,P<0.001),提示肺组织纤维化较重;与模型组比较,5、20 mg/kg达格列净组小鼠胶原纤维沉积明显减少,差异均有统计学意义(q=7.92、10.26,P均<0.001),其中20 mg/kg达格列净组纤维化改善更为显著。RT-PCR检测结果显示,与正常组比较,模型组肺组织中ARHGAP21表达水平显著降低,miR-199a-5p mRNA表达水平显著升高,差异均有统计学意义(q=8.59、33.44,P均<0.001);与模型组比较,5、20 mg/kg达格列净组ARHGAP21表达水平显著升高,miR-199a-5p mRNA表达水平显著降低,差异均有统计学意义(q=11.69、42.97,35.82、51.85,P均<0.001)。肺组织免疫组化检测结果进一步证实,正常组小鼠肺组织中ARHGAP21表达较高,呈现为广泛的棕色染色;模型组ARHGAP21表达显著减少,仅见少量染色;5、20 mg/kg达格列净组小鼠肺组织中ARHGAP21表达较模型组有所增加,其中20 mg/kg达格列净组表达接近正常组水平。细胞实验结果显示,miR-199a-5p mimic组中ARHGAP21 mRNA、蛋白相对表达表达水平显著低于NC-mimic组,差异均有统计学意义(t=11.76、10.50,P均<0.001)。Targetscan数据库分析结果显示,miR-199a-5p与ARHGAP21的3′UTR存在结合位点,并设计对应突变位点;双荧光素酶实验结果显示,ARHGAP21-WT-miR-199a-5p组相对荧光素酶活性显著低于ARHGAP21-WT-NC组,差异有统计学意义(q=26.16,P<0.001)。GLISA分析结果显示,模型组相对RhoA、ROCK活性显著高于正常组,差异均有统计学意义(q=52.50、40.30,P均<0.001);与模型组比较,5、20 mg/kg达格列净组相对RhoA、ROCK活性显著降低,差异均有统计学意义(q=17.44、15.41,38.51、35.75,P均<0.001)。结论达格列净可能通过下调miR-199a-5p、上调ARHGAP21以及抑制RhoA/ROCK信号通路,减轻PF的病理变化,具有潜在的治疗作用。 展开更多
关键词 肺纤维化 达格列净 miR-199a-5p arhgap21 RhoA/ROCK信号通路
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长链非编码RNA FTX促进子宫内膜癌细胞ARHGAP35的表达并抑制其侵袭、迁移和上皮-间质转化
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作者 车艳美 谢薇薇 王丹华 《中国组织化学与细胞化学杂志》 2025年第4期382-388,共7页
目的探讨长链非编码RNA 5’端到Xist(fiveprime to Xist,FTX)通过调节ARHGAP35表达在子宫内膜病变过程及癌细胞行为中的作用机制。方法数据库分析ARHGAP35基因及其编码的p190A蛋白在正常子宫内膜组织、子宫内膜良性病变组织和子宫内膜... 目的探讨长链非编码RNA 5’端到Xist(fiveprime to Xist,FTX)通过调节ARHGAP35表达在子宫内膜病变过程及癌细胞行为中的作用机制。方法数据库分析ARHGAP35基因及其编码的p190A蛋白在正常子宫内膜组织、子宫内膜良性病变组织和子宫内膜恶性病变组织中的表达水平;qRT-PCR和Western blot检测子宫内膜癌细胞系中ARHGAP35 mRNA和p190A蛋白的表达;利用Transwell检测细胞侵袭数目,细胞划痕实验检测细胞迁移面积比;免疫荧光染色和Western blot检测p190A、N-cadherin、E-cadherin和vimentin蛋白水平。结果子宫内膜良性病变组织、子宫内膜恶性病变组织和子宫内膜癌细胞系中ARHGAP35 mRNA和p190A蛋白水平降低;子宫内膜癌细胞系中FTX表达量明显降低;在子宫内膜癌细胞HEC1A细胞中过表达FTX显著上调ARHGAP35 mRNA、p190A和E-cadherin蛋白水平明显增加,而细胞侵袭数目、细胞迁移面积比、N-cadherin和vimentin蛋白淑平明显减少。结论LncRNA FTX可能通过促进ARHGAP35表达,抑制子宫内膜癌细胞的侵袭、迁移以及上皮间质转化。 展开更多
关键词 长链非编码RNA FTX arhgap35 子宫内膜癌细胞 侵袭 迁移 上皮间质转化
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Loss of Arhgap39 facilitates cell migration and invasion in murine hepatocellular cancer cells
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作者 HUNG-WEI LIN PEI YU LEE +1 位作者 YU-SHIUAN CHANG MAU-SUN CHANG 《Oncology Research》 2025年第2期493-503,共11页
Background:Rho GTPases are essential regulators for cellular movement and intracellular membrane trafficking.Their enzymatic activities fluctuate between active GTP-bound and inactive GDP-bound states regulated by GTP... Background:Rho GTPases are essential regulators for cellular movement and intracellular membrane trafficking.Their enzymatic activities fluctuate between active GTP-bound and inactive GDP-bound states regulated by GTPase activating proteins(GAPs)and guanine nucleotide exchange factors(GEFs).Arhgap39/Vilse/Porf-2 is a newly identified GAP.The role of Arhgap39 in migration and invasion has not been addressed thoroughly.Methods:The Arhgap39 gene was knocked out by Crispr-Cas9 gene editing in mouse Hepa1-6 and Hepa-1c1c7 cells to analyze the impact of Arhgap39 depletion on migration and invasion.Results:Loss of Arhgap39 noticeably increased the migration and invasive potential.Purified Arhgap39 recombinant protein facilitated the hydrolysis of GTP in RhoA and Rac1 in vitro.RNA-seq analysis revealed that matrix metalloproteinase 13(MMP13)and Laminin subunit beta 1(LAMB1)were increased in Arhgap39^(^(-/-))cells.We further crossed Arhgap39fl/fl with KrasLSL-G12D and p53fl/fl mice under the control of albumin-Cre recombinase to induce the spontaneous development of hepatocellular carcinomas.Intriguingly,the expression levels of MMP13 and the overall survival in Alb-Cre_KrasLSL-G12D_p53fl/fl_Arhgap39fl/fl(KPA)mice were comparable to control Alb-Cre_KrasLSL-G12D_p53fl/fl(KP)mice.The cell migration and invasion of KPA mice were also similar to those of control KP mice.Conclusion:Arhgap39 loss could modulate the migration and invasion in some hepatocellular cancer cells,but not in those isolated from KPA mice. 展开更多
关键词 arhgap39 Hepa1-6 Hepa-1c1c7 Invasion
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ARHGAP8在中低位局部进展期直肠癌新辅助化疗疗效预测中的应用 被引量:1
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作者 郗宇宁 薛军 +7 位作者 武雪亮 屈明 孙光源 韩磊 郭飞 张春泽 王一飞 梁卫政 《中国医学科学院学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期528-538,共11页
目的分析ARHGAP8对中低位局部进展期直肠癌新辅助化疗疗效预测的敏感性,为进展期直肠癌的治疗提供精准依据。方法通过生物信息学分析筛选,获得差异基因ARHGAP8。选取68例原发性直肠癌患者的直肠癌组织及直肠组织标本,应用实时荧光定量PC... 目的分析ARHGAP8对中低位局部进展期直肠癌新辅助化疗疗效预测的敏感性,为进展期直肠癌的治疗提供精准依据。方法通过生物信息学分析筛选,获得差异基因ARHGAP8。选取68例原发性直肠癌患者的直肠癌组织及直肠组织标本,应用实时荧光定量PCR、Western blot和免疫组织化学方法分别对ARHGAP8的表达强度进行验证,并收集患者性别、年龄、分期、肿瘤大小、分化程度、病理类型等临床病理特征进行功能验证;选取44例行新辅助化疗的中低位局部进展期直肠癌患者,采用免疫组织化学方法检测新辅助化疗前后ARHGAP8的表达情况,分析ARHGAP8在新辅助化疗前后、不同疗效组之间的表达情况。结果生物信息学结果显示,ARHGAP8在癌组织及直肠组织中的表达差异有统计学意义(P<0.001),且ARHGAP8的表达水平与肿瘤分期(P=0.024)、淋巴结转移(P=0.007)、年龄(P=0.005)等临床特征相关。实时荧光定量PCR结果显示,ARHGAP8 mRNA在癌组织中的表达显著高于直肠组织(P<0.001);Western blot和免疫组织化学结果显示,ARHGAP8蛋白在癌组织中的表达显著高于直肠组织(P=0.011);ARHGAP8的表达与肿瘤大小(P=0.010)、病理分期(P=0.005)密切相关,而与肿瘤分化程度、淋巴结转移、肝转移、Ki-67、微卫星不稳定性的表达程度无相关性。44例接受新辅助化疗的患者中TRG 0级13例、1级8例、2级8例、3级15例,其中65.91%(29/44)的患者新辅助化疗有效,新辅助化疗有效患者治疗后ARHGAP8的表达显著下降(P<0.001),ARHGAP8蛋白低表达患者的有效率为92.86%,显著高于ARHGAP8蛋白高表达者(53.33%)(P=0.033)。结论ARHGAP8在直肠癌组织中高表达,ARHGAP8低表达的中低位局部进展期直肠癌患者对XELOX方案新辅助化疗更为敏感,ARHGAP8可作为直肠癌发生发展的潜在生物学指标,同时可作为中低位局部进展期直肠癌XELOX方案新辅助化疗疗效评估的重要参考指标。 展开更多
关键词 中低位局部进展期直肠癌 arhgap8 新辅助化疗 疗效评估 肿瘤退缩分级
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敲减ARHGAP30基因对宫颈癌Siha细胞增殖及凋亡的影响 被引量:1
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作者 彭雅婷 刘端 +5 位作者 孟洁 李文超 李慧琦 郭华 牛美兰 秦巧红 《中国药理学通报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期847-853,共7页
目的探究敲减Rho鸟苷三磷酸酶激活蛋白30(Rho GTPase-activating protein 30,ARHGAP30)后,宫颈癌Siha细胞增殖及凋亡的变化。方法设计特异性shARHGAP30引物并连接pLKO.1载体,转化到大肠杆菌感受态细胞中,再与慢病毒辅助质粒转入HEK-293... 目的探究敲减Rho鸟苷三磷酸酶激活蛋白30(Rho GTPase-activating protein 30,ARHGAP30)后,宫颈癌Siha细胞增殖及凋亡的变化。方法设计特异性shARHGAP30引物并连接pLKO.1载体,转化到大肠杆菌感受态细胞中,再与慢病毒辅助质粒转入HEK-293T细胞,收集细胞上清获得的病毒过滤后感染Siha细胞,RT-qPCR和Western blot检测敲减效率,以及转染后Bax及Bcl-2的表达变化;CCK-8法检测敲减后细胞的增殖水平。结果成功构建敲减ARHGAP30基因的慢病毒质粒,并建立Siha稳转细胞,ARHGAP30在Siha细胞中的转录和翻译减少(P<0.01),Bax/Bcl-2明显降低(P<0.01),凋亡减少,细胞增殖水平升高(P<0.01)。结论ARHGAP30参与Siha细胞的增殖与凋亡,调控ARHGAP30基因或将干扰宫颈癌的发生和发展。 展开更多
关键词 SIHA细胞 arhgap30 宫颈癌 基因敲减 细胞增殖 细胞凋亡
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宫腔粘连子宫内膜组织中ArhGAP29、E-cadherin的表达及意义 被引量:14
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作者 徐倩 段华 +3 位作者 汪沙 甘露 付凤仙 汤一群 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2017年第1期4-7,共4页
目的探讨ArhGAP29和E-cadherin在宫腔粘连(intrauterine adhesions,IUAs)子宫内膜组织中的表达及其临床意义,分析ArhGAP29、E-cadherin在IUAs发病中的作用机制。方法采用免疫组化PV 9000两步法检测IUAs中ArhGAP29、E-cadherin的表达,分... 目的探讨ArhGAP29和E-cadherin在宫腔粘连(intrauterine adhesions,IUAs)子宫内膜组织中的表达及其临床意义,分析ArhGAP29、E-cadherin在IUAs发病中的作用机制。方法采用免疫组化PV 9000两步法检测IUAs中ArhGAP29、E-cadherin的表达,分析其与IUAs的临床病理特征关系以及ArhGAP29、E-cadherin的相关性。结果(1)ArhGAP29、E-cadherin在正常子宫内膜中表达的免疫组化反应评分(immunoreactive score,IRS)高于IUAs患者,差异有统计学意义(P=0.017,P=0.004);(2)中度IUAs患者子宫内膜中ArhGAP29、E-cadherin表达的IRS高于重度IUAs患者,差异有统计学意义(P=0.020,P=0.026);非闭经IUAs患者子宫内膜ArhGAP29、E-cadherin表达的IRS高于闭经IUAs患者,差异有统计学意义(P=0.019,P=0.031);(3)ArhGAP29表达降低与E-cadherin低表达之间呈显著正相关(r=0.725,P<0.001)。结论 ArhGAP29、E-cadherin在IUAs子宫内膜中表达降低,其下降程度与IUAs严重程度有关,ArhGAP29、E-cadherin降低可能参与IUAs的形成。 展开更多
关键词 宫腔粘连 arhgap29 E-CADHERIN 上皮一间质转化 免疫组织化学
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ARHGAP4在结直肠癌中的表达及临床意义 被引量:3
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作者 徐学虎 徐远东 +3 位作者 祝梓原 黎淑玲 吴小兵 刘学娟 《实用医学杂志》 CAS 北大核心 2017年第5期705-708,共4页
目的:研究ARHGAP4基因在结直肠癌中的表达及临床意义。方法:采用RT-PCR、Western blot及免疫组化分析ARHGAP4基因在结直肠癌组织及细胞系中的表达水平,分析其表达与临床病理特征的相关性。结果:ARHGAP基因在结直肠癌组织及结直肠癌细胞... 目的:研究ARHGAP4基因在结直肠癌中的表达及临床意义。方法:采用RT-PCR、Western blot及免疫组化分析ARHGAP4基因在结直肠癌组织及细胞系中的表达水平,分析其表达与临床病理特征的相关性。结果:ARHGAP基因在结直肠癌组织及结直肠癌细胞系中的表达较癌旁正常组织及正常结肠上皮细胞明显升高。其蛋白表达水平与肿瘤的T分类,N分类,远处转移及生存时间密切相关(P<0.05)。结论:ARHGAP4过表达可能促进结直肠癌的发生、发展,具有作为结直肠癌预后判断标记物的潜能。 展开更多
关键词 结直肠肿瘤 arhgap4 临床意义
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ARHGAPs分子与结直肠癌侵袭及转移关系的研究进展 被引量:3
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作者 陶丽 朱莹杰 +1 位作者 顾缨 郑坚 《现代肿瘤医学》 CAS 2018年第9期1450-1454,共5页
Rho家族参与细胞形态、细胞骨架重组、细胞与基质黏附、细胞周期、细胞凋亡等过程。ARHGAPs作为Rho家族的分子开关,可以极大地提高Rho蛋白内在的Rho GTPase活性,负性调控Rho蛋白,在多种恶性肿瘤的侵袭和转移中发挥重要作用。在结直肠癌... Rho家族参与细胞形态、细胞骨架重组、细胞与基质黏附、细胞周期、细胞凋亡等过程。ARHGAPs作为Rho家族的分子开关,可以极大地提高Rho蛋白内在的Rho GTPase活性,负性调控Rho蛋白,在多种恶性肿瘤的侵袭和转移中发挥重要作用。在结直肠癌组织中,一些ARHGAPs表现出抑制肿瘤侵袭和转移的作用,值得进一步深入研究。 展开更多
关键词 arhgaps 结直肠癌 侵袭 转移
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双荧光素酶报告基因系统验证hsa-miR-1291对ARHGAP29基因的调控作用 被引量:2
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作者 徐倩 汪沙 +3 位作者 刘麒薇 吕承晓 甘露 柳鑫 《首都医科大学学报》 CAS 北大核心 2021年第1期53-57,共5页
目的验证hsa-miR-1291对ARHGAP29基因的靶向调控作用。方法利用PCR方法,根据目的基因ARHGAP29的3′非编码区(3′untranslated region,3′UTR)序列信息设计扩增引物,以293T细胞基因组DNA为模板,扩增ARHGAP29基因的野生型3′UTR片段(ARHGA... 目的验证hsa-miR-1291对ARHGAP29基因的靶向调控作用。方法利用PCR方法,根据目的基因ARHGAP29的3′非编码区(3′untranslated region,3′UTR)序列信息设计扩增引物,以293T细胞基因组DNA为模板,扩增ARHGAP29基因的野生型3′UTR片段(ARHGAP 29-WT 3′UTR)及突变型3′UTR片段(ARHGAP29-MUT 3′UTR),并将其分别克隆到双荧光素酶报告pmiR-RB-Report载体中,构建双荧光素酶基因报告载体,即野生型载体ARHGAP29-WT 3′UTR pmiR-RB-Report和突变型载体ARHGAP29-MUT 3′UTR pmiR-RB-Report。将hsa-miR-1291 mimic、阴性对照(non-target control,NC组)同野生型载体、突变型载体载体分别共转染于293T细胞中,进一步检测相对荧光值。结果成功构建ARHGAP29-WT 3′UTR pmiR-RB-Report载体(野生型载体)、ARHGAP29-MUT 3′UTR pmiR-RB-Report载体(突变型载体)。荧光检测结果显示,野生型载体转染hsa-miR-1291 mimic后,其荧光表达较NC组明显下降(0.67±0.04 vs 1.00±0.08,P=0.014);转染hsa-miR-1291 mimic后,突变型载体的荧光表达相对于野生型载体的荧光表达有所上升(1.20±0.05 vs 0.67±0.04,P<0.001)。结论初步证实hsa-miR-1291很可能对ARHGAP 293′UTR上的该位点有靶向调控作用。 展开更多
关键词 双荧光素酶报告基因系统 hsa-miR-1291 arhgap29 宫腔粘连
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绵羊ARHGAP36全长cDNA的克隆及其蛋白在睾丸精细管中的分布检测
10
作者 白雪 王连庆 邢万金 《生物学杂志》 CAS CSCD 2015年第2期1-7,32,共8页
ARHGAP36是Rho GAPs家族的一员,在成神经管细胞瘤中超表达,可能参与调节细胞增殖。为了研究ARHGAP36在羊精子发生过程中的作用,采用RACE(rapid amplification of c DNA ends)技术从绵羊睾丸组织中克隆了SARHGAP36的c DNA全长序列。内部... ARHGAP36是Rho GAPs家族的一员,在成神经管细胞瘤中超表达,可能参与调节细胞增殖。为了研究ARHGAP36在羊精子发生过程中的作用,采用RACE(rapid amplification of c DNA ends)技术从绵羊睾丸组织中克隆了SARHGAP36的c DNA全长序列。内部区域c DNA序列与5'RACE和3'RACE扩增的两端序列测序后拼接,得到了2698 bp的绵羊ARHGAP36 c DNA全长,其中包含一个长1593 bp的开放阅读框(ORF),编码530 aa,与Uni Prot中预测的牛ARHGAP36氨基酸序列(A7MB27)同源性为98%,说明我们克隆的c DNA是Rho GAP家族的成员ARHGAP36。对所克隆的绵羊ARHGAP36的氨基酸序列和Uni Prot数据库中所收集的所有其它ARHGAP成员的氨基酸序列比对分析显示,ARHGAP36没有其它ARHGAP成员都有的标志性"精氨酸指"基序,而它的对应基序中的保守精氨酸残基被苏氨酸替代了,暗示ARHGAP36很可能并不依靠酶催化活性发挥其功能。当把所克隆的c DNA与Gen Bank中发布的绵羊arhgap36序列比对时发现绵羊arhgap36基因组测序结果的第一个外显子中缺少一小段DNA,导致如果用该基因组序列预测绵羊ARHGAP36的c DNA,无法得到能编码正确氨基酸的c DNA,因此,实验为进一步研究ARHGAP36这个特殊ARHGAP成员的功能提供了正确的c DNA序列。绵羊睾丸总蛋白Western blot检测发现绵羊睾丸内的ARHGAP36有3种长度,免疫组织化学检测发现ARHGAP36蛋白在绵羊睾丸精细管中的精子发生过程中各类细胞中都有分布。 展开更多
关键词 绵羊 arhgap36 CDNA克隆 RACE 免疫组织化学
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ARHGAP29调控小鼠腭突间充质细胞增殖能力的研究 被引量:1
11
作者 阮文彦 侯宇转 +3 位作者 迟丹丹 于丽丽 段小红 黄永清 《口腔医学研究》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期275-279,共5页
目的:探讨ARHGAP29对小鼠腭突间充质细胞增殖能力的影响。方法:免疫组织化学染色确定ARHGAP29在腭突组织中的表达;体外培养GD13.5小鼠腭突间充质细胞,免疫荧光染色鉴定细胞来源;合成3条Arhgap29基因特异性小干扰RNA进行体外沉默实验,利... 目的:探讨ARHGAP29对小鼠腭突间充质细胞增殖能力的影响。方法:免疫组织化学染色确定ARHGAP29在腭突组织中的表达;体外培养GD13.5小鼠腭突间充质细胞,免疫荧光染色鉴定细胞来源;合成3条Arhgap29基因特异性小干扰RNA进行体外沉默实验,利用Real-time PCR和Western blot检测沉默效率;CCK-8法检测Arhgap29基因沉默后腭突间充质细胞增殖能力的改变;实验结果采用GraphPad Prism 8.0.2软件进行统计学分析。结果:免疫组织化学结果示ARHGAP29在GD13.5小鼠腭突组织中显著表达;免疫荧光染色结果显示Vimentin染色的腭突间充质细胞包浆着色,绿色荧光表达强,Cytokeratin染色的细胞未见有阳性表达;Real-time PCR和Western blot结果显示,相较于阴性对照组和空白对照组,实验组ARHGAP29 mRNA和蛋白表达水平明显降低,其中Arhgap29-siRNA3的沉默效果最好(P<0.001);CCK-8结果显示体外沉默Arhgap29基因48 h后腭突间充质细胞的增殖能力开始上升,转染72 h细胞的增殖能力显著增强(P<0.05)。结论:ARHGAP29可能通过促进腭突间充质细胞的增殖,在腭突发育阶段造成腭突与口腔上皮的黏连,从而影响腭部的正常发育。 展开更多
关键词 arhgap29 腭突间充质细胞 RNA干扰 细胞增殖
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南江黄羊ARHGAP11A基因SNPs筛选及其与生长性状的关联分析 被引量:1
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作者 王嘉欣 张德鹏 +5 位作者 谭永乾 冯静 宋天增 陈愉 张红平 李利 《四川农业大学学报》 CSCD 北大核心 2018年第1期91-99,共9页
【目的】探讨ARHGAP11A基因与南江黄羊生长性状的关联。【方法】以南江黄羊(母羊,n=243)为试验材料,采用PCR产物直接测序筛选ARHGAP11A基因的SNP位点并分析其与性状之间的关联。【结果】在南江黄羊群体中共发现ARHGAP11A基因16个SNPs位... 【目的】探讨ARHGAP11A基因与南江黄羊生长性状的关联。【方法】以南江黄羊(母羊,n=243)为试验材料,采用PCR产物直接测序筛选ARHGAP11A基因的SNP位点并分析其与性状之间的关联。【结果】在南江黄羊群体中共发现ARHGAP11A基因16个SNPs位点。g.3483A>G和g.3621G>A的纯合突变具有增加南江黄羊体重(2月龄、6月龄和12月龄)以及胸围(6月龄)指标的趋势(P>0.05),而在g.3525A>G位点AG型羊初生重、12月龄体重和12月龄胸围显著高于GG型个体(P<0.05)。AAGT单倍型山羊体重体尺均高于AGGT和GGAT个体(P>0.05)。【结论】南江黄羊母羊群体中ARHGAP11A基因突变与生长发育密切相关,进一步验证其功能后在选育中可考虑其作为辅助选择标记。 展开更多
关键词 南江黄羊 arhgap11A基因 单核苷酸多态性位点(SNP) 生长性能 关联分析
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ARHGAP29内含子区域SNP位点的生物信息学分析 被引量:4
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作者 侯宇转 阮文彦 +1 位作者 段小红 黄永清 《口腔生物医学》 2020年第3期147-150,共4页
目的:通过生物信息学方法对全基因组关联分析(GWAS)得到的ARHGAP29内含子区域的单核苷酸多态性(SNP)进行深度分析,对目标SNP进行信息注释及功能预测。方法:根据病例对照实验筛选出4个有统计学意义的SNP位点,运用美国国家生物技术信息中... 目的:通过生物信息学方法对全基因组关联分析(GWAS)得到的ARHGAP29内含子区域的单核苷酸多态性(SNP)进行深度分析,对目标SNP进行信息注释及功能预测。方法:根据病例对照实验筛选出4个有统计学意义的SNP位点,运用美国国家生物技术信息中心(NCBI)中的SNP数据库、3D SNP数据库,RegulomeDB数据库、LncSNP2.0数据库等多种信息分析方法对SNP的生物学信息及相关长链非编码RNA(LncRNA)的功能进行预测。结果:4个SNP(rs3814019、rs72964308、rs17396055、rs7540684)均位于1号染色体,rs72964308的次要等位基因频率(MAF)值小于0.05,在后续分析中将其排除。目标SNP可通过三维的染色质环与ABCA4、ARHGAP29相互作用,线性距离95~200 kb。SNP在多种组织中位于增强子区,在个别组织中属于转录起始位点。rs17396055的转录因子信息中DNA可接近性较高,表明其转录活性较强。rs17396055和rs7540684相关的LncRNA预测显示相关性最高的疾病为唇腭裂。结论:上述生物信息学方法表明rs3814019、rs17396055、rs7540684在多种细胞类型中发挥调控作用,与rs17396055、rs7540684相关的LncRNA可能与颅颌面发育有关。 展开更多
关键词 唇腭裂 arhgap29 单核苷酸多态性 长链非编码RNA 生物信息学
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Arhgap29基因多态性与宁夏地区人群非综合征型唇腭裂的相关性 被引量:2
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作者 周子铃 马坚 +4 位作者 侯宇转 于丽丽 丁小艳 韩龙 黄永清 《宁夏医科大学学报》 2020年第6期559-564,共6页
目的探讨编码Rho-GTP酶激活蛋白29基因(Arhgap29)多态性变异与宁夏地区人群非综合征型唇腭裂(NSCL/P)的相关性。方法收集宁夏医科大学总医院口腔颌面外科NSCL/P患儿504例及该地区同期出生的正常新生儿455例。对Arhgap29基因上23个常见SN... 目的探讨编码Rho-GTP酶激活蛋白29基因(Arhgap29)多态性变异与宁夏地区人群非综合征型唇腭裂(NSCL/P)的相关性。方法收集宁夏医科大学总医院口腔颌面外科NSCL/P患儿504例及该地区同期出生的正常新生儿455例。对Arhgap29基因上23个常见SNP位点进行基因分型、H-W平衡检验、病例对照分析、连锁分析和单倍型分析。结果对照组样本中23个SNP位点的基因型分布符合H-W平衡(P>0.05),即对照组样本具有代表性。病例对照研究显示,23个SNP位点中有4个基因位点[rs3814019(等位基因P=0.0053;基因型P=0.019),rs72964308(等位基因P=0.0295;基因型P=0.019),rs7540684(等位基因P=0.0125;基因型P=0.041)和rs17396055(等位基因P=0.0393;基因型P=0.022)]基因型和等位基因型频率在病例组与对照组比较差异有统计学意义(P均<0.05)。连锁分析表明23个SNP共形成2个连锁block,每个block分别有2个单倍型组合在病例组和对照组差异有统计学意义(P均<0.05)。结论 Arhgap29基因多态性变异与宁夏地区非综合征型唇腭裂的发病存在相关性。 展开更多
关键词 arhgap29基因 非综合征型唇腭裂伴或不伴腭裂 单核苷酸多态性
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多数据库分析ARHGAP44在结直肠癌中的表达及临床意义 被引量:1
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作者 姜小叶 姜钟翔 +3 位作者 向丽莼 吴焦 陈雪诺 姜政 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第1期97-104,共8页
目的:探讨多个数据集中结直肠组织的Rho GTP酶活化蛋白44(Rho GTPase activating protein 44,ARHGAP44)表达情况及其与结直肠癌临床病理特征和预后的关系。方法:利用基因表达汇编(the gene expression omnibus,GEO)及癌症和肿瘤基因表... 目的:探讨多个数据集中结直肠组织的Rho GTP酶活化蛋白44(Rho GTPase activating protein 44,ARHGAP44)表达情况及其与结直肠癌临床病理特征和预后的关系。方法:利用基因表达汇编(the gene expression omnibus,GEO)及癌症和肿瘤基因表达图谱(the cancer genome atlas,TCGA)数据集汇总结直肠癌相关数据,分析ARHGAP44表达及其与结直肠癌临床病理学的关系,用Kaplan-Meier分析和Cox回归模型评价其预后价值。采用RT-qPCR方法检测临床样本中ARHGAP44基因表达情况,之后使用基因集富集分析(gene set enrichment analysis,GSEA)预测通路,并使用单样本基因集富集分析(single-sample gene-set enrichment analysis,ssGSEA)算法,计算ARHGAP44与免疫细胞浸润之间的关联。结果:在TCGA、GEO数据集及临床样本中,ARHGAP44表达在肿瘤中降低(P<0.001),且与T分期及TNM分期有关(P<0.05)。ARHGAP44的低表达是结直肠癌患者总体生存(overall survival,OS)的独立危险因素(HR=0.44,P=0.02)。GSEA结果显示,ARHGAP44高表达样本中富集了结直肠癌通路、Notch通路、T细胞受体、B细胞受体等基因集。ARHGAP44的表达与macrophages、T helper cells、肿瘤浸润淋巴细胞(tumorinfiltrating lymphocytes,TIL)和typeⅠIFNresponse等免疫信号成负相关(cor=-0.35、-0.37、-0.33、-0.35、-0.23、-0.32,P=0.008、0.006、0.027、0.021、0.041、0.021)。结论:ARHGAP44的表达在结直肠癌中被下调,可作为独立的预后生物标记物,且在肿瘤免疫学中具有潜在作用。 展开更多
关键词 结直肠癌 arhgap44 预后 免疫
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MiR-4719通过靶向调控ARHGAP36抑制人乳腺癌细胞的迁移和和侵袭
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作者 李侨 邱宇翔 +2 位作者 金婷 柳满然 侯懿烜 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第6期854-861,共8页
目的检测miR-4719在乳腺癌组织和细胞中的表达,研究其对乳腺癌细胞侵袭迁移的影响及其分子机制。方法采用实时荧光定量PCR检测30对人乳腺癌组织和癌旁组织,乳腺癌细胞株(BT549和MDA-MB-231)以及正常乳腺上皮细胞(MCF-10A)中miR-4719和AR... 目的检测miR-4719在乳腺癌组织和细胞中的表达,研究其对乳腺癌细胞侵袭迁移的影响及其分子机制。方法采用实时荧光定量PCR检测30对人乳腺癌组织和癌旁组织,乳腺癌细胞株(BT549和MDA-MB-231)以及正常乳腺上皮细胞(MCF-10A)中miR-4719和ARHGAP36的表达水平。生物信息手段分析miR-4719对乳腺癌患者生存率的影响,并预测miR-4719的潜在靶基因。将miR-4719模拟物,靶向ARHGAP36的shRNA、ARHGAP36过表达质粒分别转染乳腺癌细胞。Western blot和免疫组化实验检测ARHGAP36的蛋白水平;细胞划痕实验和Transwell实验检测癌细胞的迁移和侵袭能力;双荧光素酶报告实验验证miR-4719与ARHGAP36的mRNA 3'-非翻译区(3'-UTR)直接结合。结果与癌旁组织、正常乳腺上皮细胞相比,miR-4719和ARHGAP36分别在乳腺癌组织(P<0.001)和乳腺癌细胞(P<0.01)中显著降低和增高。miR-4719低表达与乳腺癌患者不良预后密切相关(P<0.01)。过表达miR-4719或敲低ARHGAP36可明显抑制乳腺癌细胞的侵袭和迁移(P<0.01)。乳腺癌组织中miR-4719和ARHGAP36表达水平呈负相关(P<0.01),双荧光素酶报告实验显示miR-4719可靶向调控ARHGAP36的表达(P<0.01),向癌细胞外源性导入miR-4719可明显抑制ARHGAP36的表达(P<0.01)。此外,过表达ARHGAP36可逆转miR-4719模拟物对癌细胞迁移和侵袭能力的抑制作用(P<0.01)。结论乳腺癌组织和癌细胞中miR-4719的丧失,导致靶基因ARHGAP36的异常高表达,促进了人乳腺癌细胞的迁移和侵袭。 展开更多
关键词 乳腺肿瘤 miR-4719 arhgap36 迁移 侵袭
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ARHGAP21通过失活WNT信号通路抑制非小细胞肺癌中的上皮间质转化 被引量:5
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作者 谢紫平 刘立威 +3 位作者 房锦存 钟星怡 林俊豪 陈逢生 《南方医科大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第8期1322-1332,共11页
目的探究Rho GTPase激活蛋白21(ARHGAP21)对非小细胞肺癌(NSCLC)细胞迁移、转移的影响并探讨其作用机制。方法通过TCGA、CPTAC数据库和临床资料确定ARHGAP21在NSCLC中的表达与患者预后的关系;通过免疫印迹(Western blot)和免疫组化验证A... 目的探究Rho GTPase激活蛋白21(ARHGAP21)对非小细胞肺癌(NSCLC)细胞迁移、转移的影响并探讨其作用机制。方法通过TCGA、CPTAC数据库和临床资料确定ARHGAP21在NSCLC中的表达与患者预后的关系;通过免疫印迹(Western blot)和免疫组化验证ARHGAP21在NSCLC的基础表达;通过慢病毒稳转构建敲低ARHGAP21的NSCLC细胞系;通过Transwell实验和划痕愈合实验检测敲低ARHGAP21对肺癌细胞体外迁移能力的影响;通过裸鼠肺转移肿瘤模型的构建检测敲低ARHGAP21对肿瘤细胞体内转移能力的影响;通过生物信息学分析预测ARHGAP21的可能作用机制;通过Western blot实验验证其相关机制。结果ARHGAP21的低表达与不良预后相关(P<0.05);与正常组织相比,ARHGAP21在肺癌组织中表达下调(P<0.001);Transwell和划痕愈合实验结果显示敲低ARHGAP21促进了肺癌细胞迁移能力(P<0.001)。裸鼠尾静脉肺转移模型结果显示与阴性对照组相比,敲低ARHGAP21组肺部肿瘤转移结节数量更多(P<0.05)且具有更高表达水平的N-钙粘蛋白和波形蛋白。生物信息学分析表明,APC、GSK3β、Axin和ARHGAP21之间存在高度相关性(P<0.001)。Western blot结果显示敲低ARHGAP21能够降低β-catenin的泛素化,上调N-钙黏蛋白并激活WNT信号通路。结论ARHGAP21的下调能够显著促进NSCLC的迁移、转移能力,这可能与ARHGAP21基因下调后激活WNT信号通路,影响APC、GSK3β、Axin的表达从而降低β-catenin的泛素化有关。 展开更多
关键词 arhgap21基因 上皮间质转化 WNT信号通路 非小细胞肺癌
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乙型肝炎病毒相关肝细胞癌癌组织ARHGAP18水平及其基因调控网络分析
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作者 秦浩 方春华 +5 位作者 张磊 冉斌 汪丽萍 罗凌 李应 黄育红 《实用肝脏病杂志》 CAS 2023年第5期694-697,共4页
目的 探讨Rho GTP酶激活蛋白18(ARHGAP18)基因在乙型肝炎病毒相关肝细胞癌(HBV-HCC)组织水平变化及其功能。方法 在基因表达数据库(GEO)中下载数据集以评估ARHGAP18水平。应用UALCAN网站研究不同临床和病理特征的HCC组织ARHGAP18水平差... 目的 探讨Rho GTP酶激活蛋白18(ARHGAP18)基因在乙型肝炎病毒相关肝细胞癌(HBV-HCC)组织水平变化及其功能。方法 在基因表达数据库(GEO)中下载数据集以评估ARHGAP18水平。应用UALCAN网站研究不同临床和病理特征的HCC组织ARHGAP18水平差异及其对预后的影响。在GEO数据集对HBV-HCC多组学队列转录组数据和甲基化阵列数据分析与ARHGAP18水平相关的表观遗传模式。结果 HBV感染患者肝组织ARHGAP18水平为(5.62±0.66),显著高于正常肝组织【(5.04±0.21),P<0.05】;HBV-HCC肿瘤组织ARHGAP18水平为(3988.63±1701.17),显著高于HBV-HCC癌旁肝组织【(1976.34±531.32),P<0.05】;在肝脏边缘组织、距肿瘤2~3 cm癌旁肝组织、肿瘤边缘癌旁肝组织、肿瘤外围组织和肿瘤中心组织ARHGAP18水平分别为(7.06±0.61)、(6.83±0.47)、(6.82±0.42)、(7.75±0.56)和(8.38±0.79),提示越向肿瘤中心组织,ARHGAP18水平呈异常升高趋势(P<0.05);ARHGAP18高水平的HCC患者生存期显著缩短(P<0.05);转录组数据提示ARHGAP18高水平组存在炎症反应、先天性免疫反应、适应性免疫反应和免疫调节等免疫炎症相关通路的激活。结论 ARHGAP18与HBV-HCC发生发展密切相关,其机制值得进一步研究。 展开更多
关键词 肝细胞癌 Rho GTP酶激活蛋白18(arhgap18)基因 细胞衰老 转录组 基因表达数据库
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免疫调节分子Rho GTP酶活化蛋白11A(ARHGAP11A)在肺腺癌高表达且与预后差正相关 被引量:2
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作者 闫柄文 韩明伟 刘蓉蓉 《细胞与分子免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期596-601,共6页
目的研究Rho GTP酶活化蛋白11A(ARHGAP11A)在肺腺癌中的表达及临床意义。方法通过检索Oncomine等多个在线数据库,获取和分析ARHGAP11A在肺腺癌和正常组织中的表达,并对肺癌患者相关的临床病理参数和生存数据进行生物信息学分析,采用Prog... 目的研究Rho GTP酶活化蛋白11A(ARHGAP11A)在肺腺癌中的表达及临床意义。方法通过检索Oncomine等多个在线数据库,获取和分析ARHGAP11A在肺腺癌和正常组织中的表达,并对肺癌患者相关的临床病理参数和生存数据进行生物信息学分析,采用PrognoScan预后分析数据库分析ARHGAP11A基因表达和肺腺癌预后的关系,利用检索相互作用基因/蛋白质的搜索工具(STRING)数据库构建ARHGAP11A及其功能相关基因网络。结果与正常组织相比,ARHGAP11A在肺腺癌的癌组织高表达,且临床分期越晚癌组织分化越差,ARHGAP11A表达越高,临床预后也越差。结论ARHGAP11A在肺腺癌组织高表达且与肺腺癌预后差相关。 展开更多
关键词 Rho GTP酶活化蛋白11A(arhgap11A) 肺腺癌 预后
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ARHGAP17与肿瘤相关性研究进展 被引量:1
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作者 邢鹏 刘百良 +3 位作者 孙中琦 陈丁华 邓可歆 张巍 《现代肿瘤医学》 CAS 2020年第11期1981-1984,共4页
ARHGAP17(Rho GTPase activating protein 17)作为小G蛋白家族成员调控蛋白参与众多生理过程,如细胞骨架重组、细胞极性的维持、细胞的黏附与迁徙、基因的转录、肿瘤血管生成、上皮-间质转化、细胞的增殖分化和凋亡等。近年来,ARHGAP17... ARHGAP17(Rho GTPase activating protein 17)作为小G蛋白家族成员调控蛋白参与众多生理过程,如细胞骨架重组、细胞极性的维持、细胞的黏附与迁徙、基因的转录、肿瘤血管生成、上皮-间质转化、细胞的增殖分化和凋亡等。近年来,ARHGAP17在各种恶性肿瘤组织中表达及其传导通路的研究已取得了初步进展,包括结肠癌、宫颈癌、乳腺癌等相关恶性肿瘤。本文分别从ARHGAP17对各种相关肿瘤的发生、发展的调控作用及预后影响进行综述。 展开更多
关键词 肿瘤 研究进展 arhgap17 RICH1
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