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植物ARF家族成员研究进展 被引量:1
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作者 孟思达 聂晓雨 +6 位作者 叶云珠 朱美玉 韩磊磊 申琦 谭昌华 齐明芳 李天来 《沈阳农业大学学报》 北大核心 2025年第2期160-168,共9页
ARF(Auxin Response Factor)作为生长素信号传导路径中的关键转录因子,调控下游靶基因的表达,参与对多种植物发育进程的调控,如花器官发育、胚发育、叶片极性发育以及根系发育等。ARF家族成员不但对植物形态建成产生影响,还在植物对环... ARF(Auxin Response Factor)作为生长素信号传导路径中的关键转录因子,调控下游靶基因的表达,参与对多种植物发育进程的调控,如花器官发育、胚发育、叶片极性发育以及根系发育等。ARF家族成员不但对植物形态建成产生影响,还在植物对环境胁迫的响应中发挥着重要作用。全面总结ARF家族成员在植物生长发育中的研究进展,包括ARF家族成员的发现与鉴定、结构特点、表达模式,探讨其在激素信号传导、细胞分化和形态建成等方面的具体作用;分析ARF基因在植物应对逆境条件下的响应机制,如干旱胁迫、盐胁迫等因素对其表达的影响。通过系统地梳理现存研究成果,为利用分子生物学手段对植物生长的调控提供参考。 展开更多
关键词 arf 生长素 转录因子 分子机制
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TRIM24、c-myc及ARF在食管鳞癌组织中的表达及意义
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作者 吴建龙 姜海斌 +5 位作者 王学文 宋晶晶 初晓燕 王爱民 李建辉 苏彬 《现代肿瘤医学》 2025年第3期417-422,共6页
目的:探讨三结构域蛋白家族24(tripartite motif-containing protein 24,TRIM24)、c-myc及ARF蛋白在食管鳞状细胞癌组织中的表达及其意义。方法:选取2018年01月至2022年12月期间承德市中心医院接受手术治疗的102例食管鳞癌患者临床病理... 目的:探讨三结构域蛋白家族24(tripartite motif-containing protein 24,TRIM24)、c-myc及ARF蛋白在食管鳞状细胞癌组织中的表达及其意义。方法:选取2018年01月至2022年12月期间承德市中心医院接受手术治疗的102例食管鳞癌患者临床病理资料作为研究对象(实验组),同时选取癌旁正常食管黏膜组织54例(对照组),采用免疫组化(Envision法)对TRIM24、c-myc及ARF蛋白进行检测,观察三者在鳞癌组织及癌旁正常食管黏膜组织中的表达情况,并分析三者的表达与临床病理特征的关系,同时研究三者于食管鳞癌组织内表达的相关性。结果:TRIM24、c-myc及ARF在鳞癌组织及癌旁正常食管黏膜组织中阳性表达率分别为72.62%vs 7.45%、74.36%vs 13.85%、26.56%vs 83.18%,三种蛋白在鳞癌组织及正常食管黏膜组织中的表达差异具有统计学意义(P均<0.05);经分析,食管鳞癌组织中的TRIM24、c-myc及ARF蛋白表达与癌的分化程度、淋巴结转移、临床分期具有显著相关性(P均<0.05);经Spearman相关性分析,食管鳞癌组织中TRIM24与c-myc蛋白表达呈正相关(r=0.587,P<0.05),TRIM24与ARF蛋白表达呈负相关(r=-0.601,P<0.05),c-myc与ARF蛋白表达呈负相关(r=-0.465,P<0.05)。结论:TRIM24、c-myc、ARF的异常表达可能对食管鳞状细胞癌的发生及发展有一定关系。因此,c-myc、TRIM24和ARF可能作为新的潜在治疗靶点,为食管鳞癌患者的个体化治疗提供新的方向。 展开更多
关键词 TRIM24 C-MYC arf 食管鳞状细胞癌 病理学特征
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彩色马铃薯ARF基因家族的鉴定与表达分析 被引量:1
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作者 马杰茹 武小娟 +5 位作者 王沛捷 李楠 马宇 杨恩泽 马艳红 聂虎帅 《中国农业大学学报》 北大核心 2025年第7期105-118,共14页
为鉴定参与彩色马铃薯花青素合成相关的ARF基因,基于马铃薯转录组测序数据,利用生物信息学方法对其基因家族成员进行理化性质、系统进化、保守基序、启动子顺式作用元件等进行分析,并通过qRT-PCR验证9个与花青素合成相关的StARFs基因在... 为鉴定参与彩色马铃薯花青素合成相关的ARF基因,基于马铃薯转录组测序数据,利用生物信息学方法对其基因家族成员进行理化性质、系统进化、保守基序、启动子顺式作用元件等进行分析,并通过qRT-PCR验证9个与花青素合成相关的StARFs基因在不同生长时期的紫肉和白肉马铃薯中的表达模式。结果表明:筛选得到55个StARFs基因,可分为4个亚族;同一亚族成员呈现出相似的保守基序和保守结构域,表明其具有相似的功能。启动子顺式元件预测结果显示,其中9个StARFs均含有激素响应作用元件,5个StARFs含有MYB结合位点响应元件。此外,7个StARFs在黄皮白肉马铃薯‘大西洋’中高表达,在‘华颂66’中低表达;2个StARFs在紫皮紫肉马铃薯‘华颂66’中高表达,在‘大西洋’中低表达。这9个StARFs基因极有可能参与马铃薯块茎花青素的生物合成过程。 展开更多
关键词 彩色马铃薯 花青素 arf转录因子 生物信息学 表达模式
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圆齿野鸦椿ARF基因家族鉴定和功能分析 被引量:1
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作者 陈丝雨 张培兰 +4 位作者 朱渊铭 林宇清 陈德星 冯翯 邹双全 《西南农业学报》 北大核心 2025年第1期31-40,共10页
【目的】为进一步探究ARF基因在圆齿野鸦椿生长与发育过程中的作用机制提供科学依据。【方法】通过圆齿野鸦椿全基因组,利用生物信息学,鉴定其ARF基因家族成员,分析EkARF基因的理化性质、染色体定位、进化关系、基因结构、所包含的结构... 【目的】为进一步探究ARF基因在圆齿野鸦椿生长与发育过程中的作用机制提供科学依据。【方法】通过圆齿野鸦椿全基因组,利用生物信息学,鉴定其ARF基因家族成员,分析EkARF基因的理化性质、染色体定位、进化关系、基因结构、所包含的结构域以及顺式作用元件。探究EkARF基因在不同组织中的表达模式并进行功能预测。【结果】共鉴定出29个EkARF基因(EkARF1~EkARF29),分为4个亚族;除LG02染色体外,其余染色体上均有分布。29个ARF基因的氨基酸数量介于432~1110个,相对分子质量在48159.66~122724.62 u,均为亲水性蛋白,其亚细胞定位预测均在细胞核内。29个EkARF蛋白均含有DBD、Auxin_resp结构域,其中21个含有CTD结构域,其基因启动子顺式作用元件与植物光响应、激素的调节、防御机制和生长发育密切相关。EkARF基因在不同组织中表达存在差异,EkARF10在种子中高表达,可能参与种子发育调控;EkARF5随着果实的成熟表达量逐渐降低,可能在果实发育过程中起重要调控作用;EkARF16、EkARF20随着果实发育表达量上调,尤其是EkARF20在果实脱落期呈高表达,与果实成熟变红后仍挂果超130 d不脱落的现象一致,可能是果实发育的关键调控基因。【结论】本研究揭示了EkARF基因在圆齿野鸦椿不同组织部位中的表达模式,为阐明EkARF基因在圆齿野鸦椿生长发育过程中的功能提供理论基础。 展开更多
关键词 圆齿野鸦椿 arf基因家族 生物信息学 表达分析
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烟草NtARF11基因克隆及功能初步分析
5
作者 朱紫童 喻奇伟 +6 位作者 李长 武博寒 解自健 孟岩 杨永霞 张松涛 贾宏昉 《中国烟草学报》 北大核心 2025年第2期104-113,共10页
【目的】为探究生长素响应因子NtARF11调控氮吸收利用的分子机制。【方法】克隆烟草NtARF11,比对该基因编码氨基酸序列并构建系统发育树。研究NtARF11在低氮胁迫条件下的表达模式,采用基因编辑技术创制响应低氮诱导的NtARF11基因突变体... 【目的】为探究生长素响应因子NtARF11调控氮吸收利用的分子机制。【方法】克隆烟草NtARF11,比对该基因编码氨基酸序列并构建系统发育树。研究NtARF11在低氮胁迫条件下的表达模式,采用基因编辑技术创制响应低氮诱导的NtARF11基因突变体材料,测定该突变体材料在田间表现出的光合能力、生物量、农艺性状和氮含量。通过实时定量聚合酶链反应(qRT-PCR)技术,分析NtARF11突变体中的氮吸收转运和同化相关基因的表达。【结果】(1)NtARF11基因CDS序列全长2016 bp,编码671个氨基酸,其编码氨基酸序列与枸杞LfARF11、番茄SlARF18和辣椒Ca ARF9均存在着较高的同源性,同源性分别为85.69%、85.84%和82.81%;(2)NtARF11的表达受到低氮条件的诱导,在低氮胁迫情况下,NtARF11的表达水平呈现出负相关,氮浓度越低时其表达量越高;(3)NtARF11突变后植株光合能力、生物量、氮积累能力均较野生型升高;(4)NtARF11突变后,与氮吸收转运和同化相关的基因表达显著高于野生型K326的水平。【结论】NtARF11是受低氮诱导表达增强基因,NtARF11突变体材料具有良好的氮吸收以及氮利用能力,推测NtARF11可能具有调控氮吸收和利用的功能。 展开更多
关键词 烟草 arf家族 基因功能 氮高效 基因编辑 生长素响应因子
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半夏ARF转录因子家族的全基因组鉴定及生物信息学分析
6
作者 朱志炎 张德清 +2 位作者 周厚英 何勇 田志宏 《江苏农业学报》 北大核心 2025年第6期1095-1106,共12页
半夏(Pinellia ternate)是一种重要的药用植物,其在生长过程中对光照和温度极为敏感,易发生倒苗现象,导致产量降低。本研究基于国家生物信息中心发布的半夏基因组数据,鉴定出25个PtARF家族成员,并通过系统进化分析将其划分为4个亚族。... 半夏(Pinellia ternate)是一种重要的药用植物,其在生长过程中对光照和温度极为敏感,易发生倒苗现象,导致产量降低。本研究基于国家生物信息中心发布的半夏基因组数据,鉴定出25个PtARF家族成员,并通过系统进化分析将其划分为4个亚族。蛋白质理化性质分析结果表明,半夏PtARF均为亲水性不稳定蛋白,大部分PtARF定位于细胞核中。蛋白质三级结构预测结果显示,亲缘关系较近的PtARF家族成员的三级结构高度相似,表明部分PtARF可能存在功能冗余。系统进化分析和共线性分析结果表明,半夏和水稻的ARF基因亲缘关系较近。半夏ARF家族基因启动子区域中,数量最多的顺式作用元件为生物及非生物胁迫响应元件,其次是植物激素响应元件,植物生长与发育响应元件数量最少。这一结果表明,PtARF可能广泛参与半夏对逆境胁迫的响应。进一步的研究结果表明,PtARF能够响应弱光胁迫和高温胁迫,可能参与半夏倒苗和块茎发育的调控。本研究为半夏抗逆育种及栽培技术优化提供了重要的理论依据。 展开更多
关键词 半夏 arf转录因子家族 倒苗 生物信息学
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甘蓝ARF基因家族的鉴定及其在非生物胁迫下的表达分析
7
作者 秦文俊 熊言杰 +3 位作者 赵冉 马萧然 叶霄萌 宋江华 《生物技术通报》 北大核心 2025年第10期253-263,共11页
【目的】鉴定甘蓝生长素响应因子ARF基因家族成员,分析BoARF基因在甘蓝多种非生物胁迫中的表达模式,为明确甘蓝ARF基因家族功能奠定基础。【方法】通过生物信息学方法,在甘蓝基因组中鉴定出36个ARF基因家族成员,并对其进行系统发育树构... 【目的】鉴定甘蓝生长素响应因子ARF基因家族成员,分析BoARF基因在甘蓝多种非生物胁迫中的表达模式,为明确甘蓝ARF基因家族功能奠定基础。【方法】通过生物信息学方法,在甘蓝基因组中鉴定出36个ARF基因家族成员,并对其进行系统发育树构建、保守基序鉴定、染色体定位、顺式作用元件预测以及共线性分析。采用实时荧光定量PCR技术,检测甘蓝BoARF基因在不同非生物胁迫(低温、高温、干旱和盐胁迫)下的表达模式。【结果】系统发育分析表明,36个BoARF基因可被划分为4组,这些基因分布于甘蓝的9条染色体上。36个BoARF基因都包含ARF家族的保守结构域Auxin_resp。除BoARF31外,其余35个成员均含有B3型DNA结合结构域。在基因结构方面,大多数成员含有12‒15个外显子。种内共线性分析检测到17对具有共线性关系的基因对,种间共线性分析发现甘蓝ARF基因家族与拟南芥中有27个共线性关系,与白菜含有30对共线性基因。启动子分析发现多种与光响应、激素响应及逆境响应相关的顺式作用元件。BoARF基因在非生物胁迫下的表达模式分析发现,BoARF基因对低温、高温、盐和干旱胁迫处理具有不同程度的响应,表明ARF基因家族可能参与甘蓝对非生物胁迫的适应性调控。【结论】甘蓝中共鉴定出36个BoARF基因,定位于9条染色体。ARF基因启动子含有与非生物胁迫相关的顺式作用元件。BoARF基因在非生物胁迫下表现出不同的表达模式。 展开更多
关键词 甘蓝 arf 基因家族 非生物胁迫 染色体定位 系统发育分析 顺式作用元件 表达分析
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野生二粒小麦ARF家族基因的鉴定和盐胁迫下的表达分析
8
作者 马博 杜旭冉 +3 位作者 武郅忠 郭荣娣 罗爽 聂小军 《麦类作物学报》 北大核心 2025年第11期1441-1450,共10页
生长素响应因子(auxin response factor,ARF)是调控植物生长发育的关键转录因子之一,通过与生长素响应元件结合,参与生长素相关信号通路,在植物的器官建成、信号传导以及逆境响应等方面发挥着重要作用。为探究野生二粒小麦盐胁迫响应AR... 生长素响应因子(auxin response factor,ARF)是调控植物生长发育的关键转录因子之一,通过与生长素响应元件结合,参与生长素相关信号通路,在植物的器官建成、信号传导以及逆境响应等方面发挥着重要作用。为探究野生二粒小麦盐胁迫响应ARF基因及其与盐胁迫的关系,利用Blast和HMM-search相结合的方法在全基因组水平鉴定了野生二粒小麦的ARF家族基因,并对其启动子及耐盐性进行分析。结果表明,在野生二粒小麦中鉴定出22个ARF基因,其分布于2A、2B、3A、3B、5A、5B、6A、6B、7A和7B染色体上;利用系统进化树可将22个ARF家族成员分成3个亚家族。通过启动子顺式元件预测,野生二粒小麦ARF基因启动子主要包含与生长发育、激素响应、光响应及逆境响应相关4类顺式作用元件。经过遗传变异分析,在四倍体小麦的驯化过程中,ARF家族成员的遗传多样性降低,发生了明显的遗传瓶颈效益。在转录组数据中检测到17个成员响应盐胁迫,在盐胁迫下TdARF主要呈现下调表达。TdARF可为小麦耐盐育种的候选基因。 展开更多
关键词 野生二粒小麦 arf基因家族 遗传变异 盐胁迫 表达特性
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向日葵ARF基因家族全基因组鉴定及其耐盐抗旱功能分析
9
作者 张抗萍 周亚茜 +5 位作者 薛征 蒋媛媛 宋晋汇 郭建忠 李林 张晶晶 《江苏农业科学》 北大核心 2025年第14期43-54,共12页
生长素响应因子是生长素信号转导通路中的重要调控因子,在植物应对非生物胁迫过程中发挥重要作用。为揭示向日葵ARF基因在干旱和盐胁迫中的关键作用,对向日葵ARF基因家族进行全基因组鉴定,分析了基因结构、系统发育关系、保守基序、共... 生长素响应因子是生长素信号转导通路中的重要调控因子,在植物应对非生物胁迫过程中发挥重要作用。为揭示向日葵ARF基因在干旱和盐胁迫中的关键作用,对向日葵ARF基因家族进行全基因组鉴定,分析了基因结构、系统发育关系、保守基序、共线性、顺式调控元件和蛋白互作网络,并结合转录组数据和实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR),分析向日葵ARF基因在干旱和盐胁迫下的表达模式。结果表明,向日葵ARF基因家族(HaARF)包含49个成员,不均匀分布于16条染色体上,可分成4个亚家族,同一亚家族成员的基因结构相似。HaARF启动子序列中含有较多与激素响应、非生物胁迫和光响应相关的顺式作用元件。转录组结果显示,多数HaARF在干旱和盐胁迫下呈现诱导性表达。RT-qPCR分析进一步证实,在干旱胁迫条件下,HaARF17和HaARF19相对表达量显著上调(P<0.05);HaARF38受盐胁迫明显抑制,HaARF17在盐胁迫12h时,相对表达量达到峰值。研究结果可为进一步研究向日葵ARF基因在抗旱耐盐过程中的潜在功能提供科学依据。 展开更多
关键词 向日葵 arf基因 全基因组鉴定 非生物胁迫 表达分析
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CLIC4/ARF6通路对宫颈癌细胞增殖、侵袭及凋亡的影响
10
作者 苏根娣 张林艳 +1 位作者 姜文静 郑荣荣 《生物技术》 2025年第2期223-227,205,共6页
[目的]探索CLIC4/ARF6信号通路对SiHa细胞增殖、侵袭能力的影响。[方法]用蛋白免疫印迹实验检测HUCEC细胞、SiHa细胞、C33A细胞以及HeLa细胞中CLIC4与ARF6的蛋白表达水平;将人宫颈癌SiHa细胞分为3组:si NC组、si CLIC4组与si ARF6组。通... [目的]探索CLIC4/ARF6信号通路对SiHa细胞增殖、侵袭能力的影响。[方法]用蛋白免疫印迹实验检测HUCEC细胞、SiHa细胞、C33A细胞以及HeLa细胞中CLIC4与ARF6的蛋白表达水平;将人宫颈癌SiHa细胞分为3组:si NC组、si CLIC4组与si ARF6组。通过CCK-8实验检测SiHa细胞的增殖活性;Transwell实验检测SiHa细胞的侵袭数量;通过TUNEL实验检测SiHa细胞的凋亡率。[结果]与HUCEC细胞相比,SiHa细胞、C33A细胞及HeLa细胞的CLIC4与ARF6的蛋白表达增加(0.13±0.02 vs 0.92±0.11 vs 0.89±0.08 vs 0.87±0.05;0.21±0.05 vs 0.72±0.06 vs 0.81±0.03 vs 0.77±0.03)。与si NC组比较,si CLIC4组及si ARF6组的SiHa细胞的增殖活性降低(P<0.05);si CLIC4组、si ARF6组的SiHa细胞侵袭数量减少(85.23±9.22 vs 36.62±7.75 vs 39.83±11.58);si CLIC4组、si ARF6组的SiHa细胞的凋亡率增加(5.73%±0.76%vs 26.58%±0.29%vs 29.03%±0.58%)。[结论]CLIC4与ARF6在宫颈癌细胞中表达上调,下调CLIC4或ARF6的表达后,宫颈癌SiHa细胞的增殖活性与侵袭数量降低。此外,下调CLIC4或ARF6的表达后,宫颈癌SiHa细胞凋亡率增加。 展开更多
关键词 CLIC4 arf6 增殖 侵袭 宫颈癌 凋亡 SIHA SIRNA
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ARF4 acting upstream of LBD16 promotes adventitious root formation in peach 被引量:1
11
作者 Jingjing Liu Lingling Gao +4 位作者 Ruoxi Zhang Anqi Gao Zamith Kerubo Oginga Beibei Zheng Yuepeng Han 《Horticultural Plant Journal》 2025年第1期145-161,共17页
Although class A auxin response factors(ARFs)are known to regulate adventitious root(AR)development through the canonical SCFTIR1-Aux/IAA-ARF signaling pathway,the regulatory role of class B ARFs in AR development rem... Although class A auxin response factors(ARFs)are known to regulate adventitious root(AR)development through the canonical SCFTIR1-Aux/IAA-ARF signaling pathway,the regulatory role of class B ARFs in AR development remains largely unclear.Therefore,this research focused on the role of class B ARF transcription factors in peach(Prunus persica‘Shengli')adventitious root formation.Here,we report the role of a class B ARF gene Pp ARF4 in adventitious root formation in peach.Comparative transcriptome and q RT-PCR analyses showed that the transcription of Pp ARF4 was significantly up-regulated in auxin-treated stem explants.Y2H assay showed that Pp ARF4 had no interaction with Pp IAAs(AUXIN/INDOLE ACETIC ACIDs).Pp ARF4 could bind the promoters of lateral root development gene Pp LBD16 and auxin transport gene Pp PIN1 to activate their transcription.Ectopic overexpression of Pp ARF4 and Pp LBD16 in Arabidopsis promoted AR development.Additionally,Pp ARF4 could act as a negative regulator of flavone synthesis and thus prevent the explants from browning.The results not only provide novel insights into the functions of ARFs in regulating plant growth and development,but will also be useful for fulfilling asexual propagation by stem cuttings in peach. 展开更多
关键词 Prunus persica Adventitious root AUXIN Pp arf4 Pp LBD16
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Discovery of toad-derived peptide analogue targeting ARF6 to induce immunogenic cell death for immunotherapy of hepatocellular carcinoma
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作者 Dihui Xu Xiang Lv +8 位作者 Meng Yu Ao Tan Jiaojiao Wang Xinyi Tang Mengyuan Li Wenyuan Wu Yuyu Zhu Jing Zhou Hongyue Ma 《Journal of Pharmaceutical Analysis》 2025年第3期657-660,共4页
Chemotherapeutic drugs such as doxorubicin(DOx)and oxaliplatin can induce immunogenic cell death(ICD)in tumor cells.Current studies have demonstrated that peptide-based drugs can also induce ICD in tumor cells.Unlike ... Chemotherapeutic drugs such as doxorubicin(DOx)and oxaliplatin can induce immunogenic cell death(ICD)in tumor cells.Current studies have demonstrated that peptide-based drugs can also induce ICD in tumor cells.Unlike small molecule drugs,peptide drugs not only enhance the effectiveness of immunotherapy but also offer the advantage of low biotoxicity[1]. 展开更多
关键词 arf DOXORUBICIN hepatocellular carcinoma immunogenic cell death IMMUNOTHERAPY small molecule drugspeptide drugs OXALIPLATIN chemotherapeutic drugs
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p14^(ARF)、ARF-BP1及c-myc mRNA在肝细胞癌中的表达及临床意义 被引量:1
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作者 覃新干 罗殿中 +2 位作者 吕自力 林静 苏传丽 《世界华人消化杂志》 CAS 北大核心 2008年第23期2656-2660,共5页
目的:探讨肝细胞癌组织中p14ARF、ARF-BP1及c-myc的mRNA表达及其与临床参数关系.方法:采用半定量逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,对52例HCC组织及其中45例相应癌旁组织p14ARF、ARF-BP1及c-myc的mRNA表达丰度进行检测并分析他们之间... 目的:探讨肝细胞癌组织中p14ARF、ARF-BP1及c-myc的mRNA表达及其与临床参数关系.方法:采用半定量逆转录-聚合酶链式反应(RT-PCR)技术,对52例HCC组织及其中45例相应癌旁组织p14ARF、ARF-BP1及c-myc的mRNA表达丰度进行检测并分析他们之间的关系及其与临床参数的关系.结果:在52例HCC组织中p14ARF、ARF-BP1及c-myc的mRNA各表达77.0%、77.0%和75.0%,与45例相应癌旁组织(11.1%、20.0%、53.3%)比较,呈高表达.p14ARF、ARF-BP1mRNA的表达与肿瘤大小有关(t=2.169,2.087,均P<0.05);而c-mycmRNA表达与肿瘤大小无关.p14ARF、ARF-BP1及c-myc的mRNA表达在性别、年龄、AFP、临床病理分级、浸润转移、HBV、包膜等无统计学差异.p14ARF与ARF-BP1、p14ARF与c-myc及ARF-BP1与c-myc的mRNA表达两两成正相关(r=0.565,0.436,0.584,均P<0.01).结论:p14ARF、ARF-BP1、c-myc过度表达可能是HCC发生的早期指标;ARF-BP1过度表达可能是影响HCC发生、发展的关键,干预ARF-BP1可能是治疗HCC的新途径. 展开更多
关键词 p14^arf^ arf-BP1 C-MYC 肝细胞癌 逆转录-聚合酶链式反应
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P14ARF及其与口腔癌的关系 被引量:1
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作者 龚飞飞 叶茂昌 《口腔医学研究》 CAS CSCD 2007年第1期103-105,共3页
关键词 口腔癌 P14arf P14arf基因 分子生物学技术 口腔卫生习惯 癌基因激活 不良嗜好 基因失活
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p14^(ARF)、ARF-BP1、c-myc在肝细胞癌中的表达及意义
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作者 覃新干 吕自力 +2 位作者 林静 苏传丽 罗殿中 《广西医科大学学报》 CAS 北大核心 2007年第4期528-531,共4页
目的:探讨肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)组织及其癌旁肝组织中p14ARF、ARF-BP1、c-myc的表达及意义。方法:采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术、免疫组化技术对45例HCC组织及其癌旁肝组织中p14ARF、ARF-BP1、c-myc的mRNA表... 目的:探讨肝细胞癌(Hepatocellular Carcinoma,HCC)组织及其癌旁肝组织中p14ARF、ARF-BP1、c-myc的表达及意义。方法:采用逆转录-聚合酶链反应(RT-PCR)技术、免疫组化技术对45例HCC组织及其癌旁肝组织中p14ARF、ARF-BP1、c-myc的mRNA表达和p14ARF、c-myc蛋白表达情况进行检测。结果:p14ARF、ARF-BP1、c-myc的mRNA在HCC组织中阳性表达分别为80.00%、86.67%、84.44%,在癌旁肝组织中分别为11.11%、20.00%、53.33%,三者的mRNA在癌组织中呈过表达,明显高于癌旁肝组织(P<0.01)。p14ARF、c-myc蛋白在HCC组织中表达分别为78.38%、75.68%,明显高于癌旁肝组织的13.51%(P<0.01)和51.35%(P<0.05)。结论:p14ARF、ARF-BP1、c-myc在HCC组织中高表达,这种高表达可能与HCC的发生有相关性。 展开更多
关键词 P14^arf arf-BP1 C-MYC 肝细胞癌 逆转录-聚合酶链反应 免疫组织化学
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ARF蛋白——p53蛋白的重要调控因子 被引量:1
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作者 陈芳 陈杰 《国外医学(生理病理科学与临床分册)》 2003年第6期555-557,共3页
ARF蛋白是INK4a基因位点编码产物之一。ARF能抑制MDM2介导的p5 3降解和p5 3转录下调 ,某些癌基因和调节因子能通过ARF蛋白调节p5 3蛋白的功能 ,从而对细胞周期进程产生影响。在黑色素瘤、血液系统肿瘤、肺癌、肠道肿瘤中均发现有ARF的... ARF蛋白是INK4a基因位点编码产物之一。ARF能抑制MDM2介导的p5 3降解和p5 3转录下调 ,某些癌基因和调节因子能通过ARF蛋白调节p5 3蛋白的功能 ,从而对细胞周期进程产生影响。在黑色素瘤、血液系统肿瘤、肺癌、肠道肿瘤中均发现有ARF的突变或缺失 ,ARF蛋白在肿瘤发生发展中可能有重要作用。 展开更多
关键词 INK4a/arf基因 arf蛋白 P53蛋白 细胞周期 凋亡
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拟南芥突变体arf8和nph4/arf7的长下胚轴表型的初步研究
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作者 田长恩 周玉萍 +1 位作者 Hideki Muto Kotaro T Yamamoto 《广州大学学报(自然科学版)》 CAS 2011年第4期32-35,共4页
通过对拟南芥(Arabidopsis thaliana)ARF8和NPH4/ARF7基因的突变体以及有关双突变体的下胚轴长度的表型和遗传分析,探讨了arf8-1、nph4-102和nph4-107长下胚轴表型的起源.结果表明,ARF8基因的其他突变体arf8-2、arf8-3和arf8-4都没有表... 通过对拟南芥(Arabidopsis thaliana)ARF8和NPH4/ARF7基因的突变体以及有关双突变体的下胚轴长度的表型和遗传分析,探讨了arf8-1、nph4-102和nph4-107长下胚轴表型的起源.结果表明,ARF8基因的其他突变体arf8-2、arf8-3和arf8-4都没有表现出类似于arf8-1的长下胚轴表型;在与ARF8同源性较高的NPH4/ARF7的突变体中,突变位点与arf8-1相似的nph4-102和nph4-107表现出与arf8-1相似的长下胚轴表型和不完全显性的遗传方式;双突变体arf8-1 nph4-102的下胚轴长度比两个单突变体的长,说明arf8-1与nph4-102在长下胚轴表型上存在加性效应.因此,arf8-1、nph4-102和nph4-107的长下胚轴表型极可能源于相应突变体蛋白的产生,而非相关基因功能的缺失. 展开更多
关键词 生长素反应因子7 生长素反应因子8 arf8 nph4/arf7 长下胚轴表型
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INK4a/ARF基因与乳腺癌的关系
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作者 张智 陈小东 《广东医学院学报》 2009年第6期675-677,共3页
INK4a/ARF是直接调控细胞周期并抑制细胞增殖的抑癌基因,本文就INK4a/ARF基因以及p53与乳腺癌的关系作一综述。
关键词 INK4A/arf P53 P16INK4A P14arf 乳腺癌 综述文献
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黄瓜生长素反应因子(ARF)家族鉴定及表达特异性分析 被引量:15
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作者 盛慧 秦智伟 +3 位作者 李文滨 周秀艳 武涛 辛明 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第10期1985-1994,共10页
【目的】鉴定黄瓜生长素反应因子(ARF),预测small RNAs并验证ARF与small RNAs和生长素的关系;分析ARF在种子萌发过程中的表达模式,推断ARF在黄瓜单性结实和种子萌发过程中是否起到关键作用。【方法】利用拟南芥和水稻ARF蛋白质序列检索... 【目的】鉴定黄瓜生长素反应因子(ARF),预测small RNAs并验证ARF与small RNAs和生长素的关系;分析ARF在种子萌发过程中的表达模式,推断ARF在黄瓜单性结实和种子萌发过程中是否起到关键作用。【方法】利用拟南芥和水稻ARF蛋白质序列检索黄瓜基因组数据库,对检索到的黄瓜ARF家族进行结构分析和small RNAs预测;将预测到的gma-MIR160o precursur构建到pCAMBIA2301植物表达载体上,利用农杆菌介导法将其导入到单性结实黄瓜品种中,并对PCR检测为阳性的转基因植株进行RT-PCR验证;利用real-time RT-PCR方法分析ARF家族成员在生长素诱导后、开花时期及种子萌发阶段的表达模式。【结果】通过与拟南芥和水稻ARF蛋白序列的比对,共得到18个黄瓜ARF蛋白质序列。将其连同拟南芥和水稻的ARF蛋白质序列共分为4大类。从结构上看,外显子数目2-18不等,但同一类之间基因结构较为相似。进化树分析显示,18个基因之间的相似性不高;18个黄瓜ARF基因均有相对应的small RNA。其中,Csa010564、Csa011935、Csa015176、Csa020560和Csa022361可能都是miR160的靶基因。转基因试验进一步说明Csa010564、Csa011935和Csa015176在表达量上出现下降趋势,而Csa020560和Csa022361的表达量与对照相比略有上升,说明Csa010564、Csa011935和Csa015176是miR160的靶基因;在生长素诱导表达的试验中,Csa007296、Csa011935和Csa015176在根、茎和叶中的表达量均高于对照,说明ARF的表达受IAA的正调控;同时,以上3个基因在叶片和雌花花冠中的表达量均是开花第2 d低于开花当天,而在子房中的表达量确是第2天高于开花当天,尤其是Csa011935和Csa015176上调显著,说明ARF在子房发育过程中起到至关重要的作用;ARF在种子萌发过程中的表达分析显示:大部分基因在吸涨后12 h和48 h处于表达最高峰。【结论】ARF受生长素和相应的small RNAs调控。在黄瓜单性结实和种子萌发过程中,ARF可能起到了关键性作用。 展开更多
关键词 黄瓜 arf SMALL RNAS 生长素 表达模式
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谷子ARF基因家族的鉴定与生物信息学分析 被引量:27
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作者 赵艳 瓮巧云 +5 位作者 马海莲 宋晋辉 袁进成 王凌云 董志平 刘颖慧 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第3期547-554,共8页
生长素应答因子(ARF,auxin response factors)是一类可以结合在生长素应答基因启动子部位的转录因子,在植物的生长发育中起至关重要的作用。本研究以谷子为材料,共鉴定出24个ARF基因,命名为Si ARFs。利用生物信息学对谷子Si ARFs基因的... 生长素应答因子(ARF,auxin response factors)是一类可以结合在生长素应答基因启动子部位的转录因子,在植物的生长发育中起至关重要的作用。本研究以谷子为材料,共鉴定出24个ARF基因,命名为Si ARFs。利用生物信息学对谷子Si ARFs基因的结构、染色体分布、基因倍增模式、系统进化以及基因的表达模式进行分析。结果表明,Si ARF基因家族在染色体上呈不均匀分布,除2号染色体外,其他染色体上都有该家族基因,基因的扩增模式为分散复制与片段复制。Si ARFs基因家族具有相对保守的结构,即包含1个保守的B3 DNA结构域、ARF结构域和Aux/IAA结构域,ARF蛋白的3D结构含有3个α螺旋和7个β折叠结构。进化树分析表明谷子ARF蛋白和物种相近的高粱、玉米聚在一起。大多数ARF基因在谷子根、茎、叶和穗中都有表达,且不同基因表达量有较大差异。 展开更多
关键词 谷子 arf 生物信息学分析 蛋白结构
原文传递
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