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基于APOCS的点云去噪算法
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作者 李刚森 程远志 《智能计算机与应用》 2018年第4期96-102,共7页
使用3D扫描工具获取点云数据时常常会伴随着加性噪声。本文提出了一个基于凸集平均映射(APOCS)的原创点云去噪算法。首先,使用基于相关性筛选改良过的均值滤波算法对噪声点云的法向量进行滤波。每个滤波后的法向量都能决定其相对应的局... 使用3D扫描工具获取点云数据时常常会伴随着加性噪声。本文提出了一个基于凸集平均映射(APOCS)的原创点云去噪算法。首先,使用基于相关性筛选改良过的均值滤波算法对噪声点云的法向量进行滤波。每个滤波后的法向量都能决定其相对应的局部平面,将这些平面视为凸集,可通过APOCS算法更新点云中各点的位置。在本文的最后将给出该算法在不同强度噪声点云上与双边滤波对比的实验结果。 展开更多
关键词 点云 去噪 apocs Graph-cut
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鸡APOC3蛋白生物信息学分析及其对鸡肌内前体脂肪细胞分化的影响
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作者 邢雨欣 管宏波 +8 位作者 马乘霖 申颖 申家宁 卢镕镕 田亚东 李转见 田卫华 刘小军 李红 《中国家禽》 北大核心 2025年第6期19-28,共10页
研究旨在对鸡APOC3蛋白进行生物信息学分析及构建APOC3基因组织表达谱,并探究其对肌内前体脂肪细胞分化的影响。试验从NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)数据库下载APOC3蛋白氨基酸序列并进行生物信息学分析;利用PCR技术扩增APOC3基... 研究旨在对鸡APOC3蛋白进行生物信息学分析及构建APOC3基因组织表达谱,并探究其对肌内前体脂肪细胞分化的影响。试验从NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)数据库下载APOC3蛋白氨基酸序列并进行生物信息学分析;利用PCR技术扩增APOC3基因CDS序列,采用同源重组方法构建APOC3基因过表达载体;利用qPCR检测APOC3基因在鸡不同组织中的表达量,分析APOC3基因表达规律;利用差速贴壁法分离14日龄AA肉鸡胸肌原代肌内前脂肪细胞;在肌内前脂肪细胞中过表达APOC3基因,利用qPCR、检测甘油三酯(Triglyceride,TG)含量、油红O染色评估APOC3基因对肌内前体脂肪细胞分化成脂的影响。生物信息学分析结果显示,同源基因APOC3在鸡与火鸡之间序列保守度较高,与小鼠保守度最低;APOC3蛋白是定位于细胞外、无跨膜结构域的分泌型蛋白。组织表达分析结果显示,APOC3基因在肝脏中特异性表达。体外试验结果分析显示,与对照组相比,试验组APOC3 mRNA表达水平升高了60倍,甘油三酯含量显著增加(P<0.05),细胞内脂滴含量极显著增多(P<0.01),脂肪细胞分化相关标志基因过氧化物增殖物激活受体γ(Peroxisome proliferator-activated receptor gamma,PPARγ)、脂肪酸结合蛋白4(Fatty acid binding protein 4,FABP4)、脂肪酸结合蛋白5(Fatty acid binding protein 5,FABP5)、CCAAT/增强子结合蛋白α(CCAAT/enhancer binding protein alpha,C/EBPα)、脂蛋白脂肪酶(Lipoprotein lipase,LPL)mRNA的表达水平显著上升(P<0.05);APOC3蛋白与载脂蛋白A1(APOA1)、异质核核糖核蛋白A/B(HNRNPAB)、高温需求因子A3(HTRA3)、肿瘤坏死因子受体超家族成员6B(TNFRSF6B)、载脂蛋白D(APOD)存在相互作用。研究表明,鸡APOC3蛋白属于分泌型蛋白,其编码基因在肝脏中特异性表达且与火鸡之间保守序列相似度较高;鸡APOC3基因过表达能够促进鸡肌内前体脂肪细胞分化与脂质积累。 展开更多
关键词 APOC3基因 肌内脂肪 生物信息学分析
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嘉积鸭APOC3基因多态性与生长性状关联分析
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作者 谢攀攀 徐铁山 +1 位作者 顾丽红 张丽 《西南农业学报》 北大核心 2025年第4期855-864,共10页
【目的】筛查嘉积鸭载脂蛋白C3(APOC3)基因潜在的单核苷酸多态性(SNPs)位点,并分析其与生长性状的关联性,为嘉积鸭分子选育提供理论支撑。【方法】以嘉积鸭为研究对象,利用PCR扩增和直接测序法检测APOC3基因SNPs,并进行遗传多样性分析;... 【目的】筛查嘉积鸭载脂蛋白C3(APOC3)基因潜在的单核苷酸多态性(SNPs)位点,并分析其与生长性状的关联性,为嘉积鸭分子选育提供理论支撑。【方法】以嘉积鸭为研究对象,利用PCR扩增和直接测序法检测APOC3基因SNPs,并进行遗传多样性分析;采用SPSS对不同多态位点所对应的基因型与体尺指标进行相关性分析;利用HaploView软件分析APOC3基因SNPs的连锁不平衡和单倍型;通过NAfold WebServer软件预测不同基因型的mRNA二级结构。【结果】在嘉积鸭的APOC3基因中共发现11个SNPs,其中4个位于5′UTR,1个位于2号外显子中且为同义突变,其他6个为内含子突变,均存在3种基因型。其中,仅有3个SNPs即g.6555762G>A、g.6555842G>A、g.6555964C>T符合Hardy-Weinberg平衡(P>0.05)。SNPs多态位点与体重体尺关联分析结果表明,具有显著关联(P<0.05)的是2个SNPs位点(g.6555465G>A、g.6555516G>A)与龙骨长,1个SNP位点(g.6555516G>A)与胫长,2个SNPs位点(g.6555632C>T、g.6555640C>A)与体重,2个SNPs位点(g.6555762G>A、g.6555842G>A)与胸深,1个SNPs位点(g.6555842G>A)与体斜长,1个SNPs位点(g.6555964C>T)与胫围。g.6555513C>T和g.6555516G>A存在强连锁关系,形成3种单倍型,即H1(CA)、H2(CG)、H3(TG)。g.6555465G>A和g.6555494G>A位点的突变导致mRNA最小自由能升高,降低了mRNA二级结构稳定性,其余3个位点的突变降低了最小自由能,增加了二级结构稳定性。【结论】嘉积鸭APOC3基因的7个SNPs(g.6555465G>A、g.6555516G>A、g.6555632C>T、g.6555640C>A、g.6555762G>A、g.6555964C>T、g.6555842G>A)对体重、体斜长等生长指标具有显著影响,可作为嘉积鸭选育的候选标记。 展开更多
关键词 嘉积鸭 APOC3基因 生长性状 单核苷酸多态性 关联分析
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血清chemerin、瘦素及apoC Ⅲ水平对妊娠期糖尿病患者不良妊娠结局的预测价值 被引量:2
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作者 付翠芳 国晓 +2 位作者 孙宇婷 宁超 白晓蔚 《分子诊断与治疗杂志》 2024年第2期387-390,394,共5页
目的 分析血清chemerin、瘦素及apoC Ⅲ水平对妊娠期糖尿病患者不良妊娠结局的预测价值。方法 收集2020年5月至2022年8月邢台市第三医院收治的131例GDM患者(GDM组),另选取同期于本院体检行口服75g葡萄糖耐量试验且结果正常的孕妇126名(... 目的 分析血清chemerin、瘦素及apoC Ⅲ水平对妊娠期糖尿病患者不良妊娠结局的预测价值。方法 收集2020年5月至2022年8月邢台市第三医院收治的131例GDM患者(GDM组),另选取同期于本院体检行口服75g葡萄糖耐量试验且结果正常的孕妇126名(对照组)。比较GDM组、对照组chemerin、瘦素及apoC Ⅲ水平,分析两组不良妊娠结局,比较GDM组不同妊娠结局chemerin、瘦素及apoC Ⅲ水平,采用多因素Logistic回归分析影响GDM不良妊娠结局的危险因素,绘制ROC曲线分析chemerin、瘦素及apoC Ⅲ联合检测GDM不良妊娠结局的预测价值。结果 GDM组血清chemerin、瘦素、apoC Ⅲ水平均显著高于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05)。GDM组不良妊娠结局发生率高于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05)。GDM组中不良妊娠结局患者血清chemerin、瘦素、apoC Ⅲ水平均高于正常妊娠结局患者,差异具有统计学意义(P<0.05)。多因素Logistic回归结果显示,chemerin、瘦素、apoC Ⅲ水平上升为影响GDM不良妊娠结局的危险因素(P<0.05)。chemerin、瘦素及apoC Ⅲ联合检测GDM不良妊娠结局灵敏度、特异度分别为91.29%、89.22%,高于上述指标单一检测(P<0.05)。结论 血清chemerin、瘦素及apoC Ⅲ有助于预测GDM患者不良妊娠结局的发生风险,且联合监测上述因子可提高对GDM患者不良妊娠结局的预测价值,可为尽早干预、治疗提供依据。 展开更多
关键词 妊娠期糖尿病 CHEMERIN 瘦素 apoCⅢ 不良妊娠结局
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APOA-Ⅰ、APOC1与胃癌术前临床分期、肿瘤因子表达水平关系研究
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作者 代春雨 《辽宁医学杂志》 2024年第3期34-38,共5页
目的探究APOA-Ⅰ、APOC1与胃癌术前临床分期、肿瘤因子表达水平关系研究。方法采用回顾性分析选取我院2020年1月~2022年1月收治的93例胃癌组织和93例癌旁正常胃黏膜组织标本。分析观察APOA-Ⅰ、APOC1与临床病理基本因素及肿瘤表达因子CA... 目的探究APOA-Ⅰ、APOC1与胃癌术前临床分期、肿瘤因子表达水平关系研究。方法采用回顾性分析选取我院2020年1月~2022年1月收治的93例胃癌组织和93例癌旁正常胃黏膜组织标本。分析观察APOA-Ⅰ、APOC1与临床病理基本因素及肿瘤表达因子CA125、CEA的水平相关性研究。结果低APOA-Ⅰ表达与高APOA-Ⅰ表达在年龄、性别、肿瘤直径、浸润深度、分化程度、淋巴结转移方面比较无显著差异(P>0.05)。高APOA-Ⅰ表达CA125、CEA水平显著高于低APOA-Ⅰ表达(χ^(2)=10.628、7.769,P=0.001、0.005)。高APOA-Ⅰ表达TNM分期显著高于低APOA-Ⅰ表达(χ^(2)=5.036,P=0.024)。低APOC1表达与高APOC1表达在年龄、性别、肿瘤直径、浸润深度、分化程度、淋巴结转移方面比较无显著差异(P>0.05)。高APOC1表达CA125、CEA水平显著高于低APOC1表达(χ^(2)=6.196、11.448,P=0.012、0.001)。高APOC1表达TNM分期显著高于低APOC1表达(χ^(2)=2.514,P=0.112)。结论APOA-Ⅰ、APOC1与胃癌术前临床分期和肿瘤因子CEA、CA125呈现正相关。 展开更多
关键词 APOA-Ⅰ APOC1 胃癌术前临床分期 肿瘤因子 关系研究
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猪APOA5和APOC3基因mRNA的表达差异及与肌内脂肪沉积的相关性分析 被引量:13
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作者 惠嫣婷 杨永强 刘若余 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2014年第1期94-99,共6页
为了探究载脂蛋白A5(apolipoprotein A5,APOA5)基因和载脂蛋白C3(apolipoprotein C3,APOC3)基因组织表达差异及其与肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)沉积的相关性,本研究利用荧光定量PCR方法分析APOA5和APOC3基因mRNA在可乐猪和江口萝卜... 为了探究载脂蛋白A5(apolipoprotein A5,APOA5)基因和载脂蛋白C3(apolipoprotein C3,APOC3)基因组织表达差异及其与肌内脂肪(intramuscular fat,IMF)沉积的相关性,本研究利用荧光定量PCR方法分析APOA5和APOC3基因mRNA在可乐猪和江口萝卜猪7个组织中的相对表达量及其与IMF沉积的相关性。研究结果表明:APOA5和APOC3基因在可乐猪和江口萝卜猪的7个组织中均有不同程度表达,在肝脏中表达量最高,在皮下脂肪和背最长肌中表达量次之;APOA5基因在可乐猪多数组织中的表达量显著低于江口萝卜猪(p<0.05),而APOC3基因未呈现类似规律性;可乐猪中,除心脏外,其它组织均表现为APOC3基因mRNA表达量高于APOA5,江口萝卜猪心脏、肝脏、脾脏、小肠和背最长肌中同样呈现上述表达差异。相关及回归分析表明,IMF沉积量与可乐猪APOC3 mRNA表达丰度呈线性正相关(p<0.05)。根据研究结果,可以推测APOA5和APOC3基因与IMF沉积有一定关联性。 展开更多
关键词 APOA5基因 APOC3基因 肌内脂肪
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广西巴马人群外周血载脂蛋白C-Ⅲ基因mRNA的表达水平 被引量:1
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作者 黄永全 张志勇 +5 位作者 黄倩倩 罗兰英 施礼威 梁桂云 农清清 覃健 《中国老年学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期2233-2235,共3页
目的比较广西巴马地区不同人群载脂蛋白(Apo)CⅢmRNA基因的表达水平是否有差异,探讨广西巴马长寿人群与ApoCⅢ基因可能存在的关系。方法采用实时荧光定量RT-PCR方法检测43人长寿老人与78人对照人群的ApoCⅢmRNA基因的表达水平。结果长... 目的比较广西巴马地区不同人群载脂蛋白(Apo)CⅢmRNA基因的表达水平是否有差异,探讨广西巴马长寿人群与ApoCⅢ基因可能存在的关系。方法采用实时荧光定量RT-PCR方法检测43人长寿老人与78人对照人群的ApoCⅢmRNA基因的表达水平。结果长寿组与对照1组、对照2组ApoCⅢmRNA表达水平有统计学意义(P<0.05),对照1组与对照2组间ApoCⅢmRNA表达水平无显著性差异(P>0.05),长寿组与对照2组ApoCⅢmRNA表达水平无明显差异(P>0.05)。结论广西巴马长寿地区人群ApoCⅢmRNA表达水平明显高于非长寿地区人群,提示广西巴马长寿现象可能与ApoCⅢmRNA表达水平较高有一定的关系。 展开更多
关键词 ApoCⅢ MRNA 巴马 长寿 RT—PCR
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理脾调脂胶囊对血脂失调症大鼠ApoE、ApoCⅢ基因表达的影响 被引量:3
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作者 闫石 刘桂荣 刘非 《上海中医药杂志》 2011年第2期60-62,共3页
目的研究理脾调脂胶囊对血脂失调症大鼠ApoE、ApoCⅢ基因表达的影响,探讨其调节血脂代谢的作用机制。方法 Wistar大鼠随机分为正常组、模型组、理脾调脂胶囊治疗组(简称治疗组)、血脂康对照组(简称对照组),造模4周后,治疗组大鼠每日灌... 目的研究理脾调脂胶囊对血脂失调症大鼠ApoE、ApoCⅢ基因表达的影响,探讨其调节血脂代谢的作用机制。方法 Wistar大鼠随机分为正常组、模型组、理脾调脂胶囊治疗组(简称治疗组)、血脂康对照组(简称对照组),造模4周后,治疗组大鼠每日灌胃理脾调脂胶囊,对照组每日灌胃血脂康,用药8周。实验结束时,酶法测定大鼠血清TC、TG浓度,沉淀法测定大鼠血清HDL-c、LDL-c;实时定量PCR法(Real-time PCR)检测大鼠肝脏ApoE、血浆中ApoCⅢmRNA的表达。结果与正常组比较,模型组大鼠血清中的TC、TG、LDL-c均显著升高(P<0.01),HDL-c降低(P<0.01),ApoEmRNA的表达量降低(P<0.05),血浆ApoCⅢ基因表达显著升高(P<0.01);与模型组比较,治疗组和对照组大鼠血清中TC、TG、LDL-c均降低(P<0.01),治疗组大鼠血清HDL-c升高较为明显(P<0.01),ApoEmRNA的表达量升高较为显著(P<0.01),血浆ApoCⅢ基因表达显著降低(P<0.01);与对照组比较,治疗组大鼠血清中TC、TG、LDL-c均降低(P<0.05),HDL-c升高(P<0.01),血浆ApoCⅢ基因表达显著降低(P<0.01)。结论理脾调脂胶囊能显著提高实验性血脂失调症大鼠肝脏ApoEmRNA的表达,并降低血中ApoCⅢmRNA的表达,具有调控血脂代谢的作用。 展开更多
关键词 理脾调脂胶囊 血脂康 血脂失调症 APOE ApocⅢmRNA 大鼠
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猪apoC3基因的遗传变异分析 被引量:2
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作者 惠嫣婷 刘若余 张依裕 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2012年第2期36-39,共4页
目的:探究猪apoC3基因多态性,为进一步探讨其对脂肪沉积的影响和表达调控等研究提供依据。方法:选取具有不同脂肪沉积特点的3个猪种(可乐猪、贵州白香猪和大约克猪)构建品种DNA池并进行测序,结合各SNP位点测序峰高比值估算等位基因频率... 目的:探究猪apoC3基因多态性,为进一步探讨其对脂肪沉积的影响和表达调控等研究提供依据。方法:选取具有不同脂肪沉积特点的3个猪种(可乐猪、贵州白香猪和大约克猪)构建品种DNA池并进行测序,结合各SNP位点测序峰高比值估算等位基因频率,并利用在线软件对不同基因型的转录结合位点及mRNA二级结构进行预测。结果:在3个猪种的apoC3基因中共发现17个SNPs(2个位于5’侧翼区;1个位于外显子3中,为同义突变;1个位于3’非翻译区,其它13个分别位于3个不同内含子中),其中C813G变异增加了一个转录因子GATA-2结合位点,G2280A变异导致mRNA二级结构最小自由能增加0.4kkal/mol。结论:不同猪种间apoC3基因SNPs位点等位基因频率差异较大,而apoC3基因编码区相对保守。 展开更多
关键词 DNA池 apoC3基因 脂肪沉积
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急性冠脉综合征患者血清ApoCⅢ的检测及临床意义 被引量:2
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作者 李亚伟 韩静 +3 位作者 江平 王立君 杜超 张军惠 《中外医学研究》 2017年第10期59-61,共3页
目的:分析探讨急性冠脉综合征(ACS)患者血清载脂蛋白CⅢ(ApoCⅢ)的检测和临床意义。方法:选取笔者所在医院收治的120例ACS患者,选取其中49例单支病变患者分为单支病变组,71例多支病变患者分为多支病变组。再选取同时期的健康人员120例... 目的:分析探讨急性冠脉综合征(ACS)患者血清载脂蛋白CⅢ(ApoCⅢ)的检测和临床意义。方法:选取笔者所在医院收治的120例ACS患者,选取其中49例单支病变患者分为单支病变组,71例多支病变患者分为多支病变组。再选取同时期的健康人员120例作为对照组。比较三组患者血清ApoCⅢ和血脂。再将120例ACS患者根据其治疗后预后效果分为预后良好组(n=57)和预后不良组(n=63)。分析比较预后效果与患者血清ApoCⅢ之间的关系。结果:多支病变组甘油三酯(TG)、低密度脂蛋白胆固醇(LDL-C)、ApoCⅢ大于单质病变组及对照组,且单质病变组大于对照组;多支病变组高密度脂蛋白胆固醇(HDL-C)小于单支病变组及对照组,且单质病变组小于对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。多支病变组患者TC水平高于单支病变组和对照组,差异有统计学意义(P<0.05)。单支病变组和对照组受检人员总胆固醇(TC)水平比较无统计学意义(P>0.05)。预后不良组患者血清Apo CIII水平高于预后良好组,差异有统计学意义(P<0.05);血清Apo CIII水平与TG、TC、LDL-C呈正相关性,与HDL-C呈负相关性。结论:ACS患者血清Apo CIII水平与冠状动脉病变程度有关,可作为临床诊疗及评估患者预后的参考指标。 展开更多
关键词 急性冠脉综合征 血清ApoCⅢ 冠状动脉病变程度 相关性
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人载脂蛋白C3基因转基因小鼠的建立及血脂变化分析 被引量:2
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作者 全雄志 高翔 +4 位作者 张旭 葛文萍 关菲菲 董伟 张连峰 《中国比较医学杂志》 CAS 2012年第10期1-5,共5页
目的制备系统性表达人载脂蛋白C3(APOC3)基因的转基因小鼠,建立高血脂小鼠模型。方法将人APOC3基因插入系统性表达启动子下游,构建转基因表达载体,通过显微注射法建立人APOC3转基因C57BL/6J小鼠。并利用特异引物PCR法鉴定转基因小鼠的... 目的制备系统性表达人载脂蛋白C3(APOC3)基因的转基因小鼠,建立高血脂小鼠模型。方法将人APOC3基因插入系统性表达启动子下游,构建转基因表达载体,通过显微注射法建立人APOC3转基因C57BL/6J小鼠。并利用特异引物PCR法鉴定转基因小鼠的基因型,Western blot检测基因表达水平,血生化分析检测不同月龄转基因小鼠与同龄野生型小鼠的血脂指标,脂肪染色观察肝脏脂肪水平。结果建立了高表达人APOC3基因的转基因小鼠品系;转入的人APOC3基因在血液、肝脏、小肠、肌肉、心脏、肾脏、脾脏中均有明显表达;不同月龄转基因小鼠的血浆甘油三酯水平明显高于同龄野生型小鼠;转基因小鼠的肝脏脂肪含量高于野生型小鼠。结论系统性表达人APOC3基因的转基因小鼠表现高脂血症表型,可以作为高血脂以及高血脂相关的心血管病的工具动物。 展开更多
关键词 载脂蛋白C3 转基因小鼠 甘油三酯 高脂血症 人APOC3基因
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载脂蛋白CⅡ微卫星DNA检测的方法学建立 被引量:1
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作者 高纯 周新 +1 位作者 吴昀 顾国浩 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2001年第4期197-199,共3页
目的 建立准确检测载脂蛋白CⅡ (apoCⅡ )微卫星DNA(TG)n(AG)m的方法。方法 采用套式聚合酶链反应扩增样品DNA ,将扩增产物上样于变性聚丙烯酰胺凝胶 ,高压电泳 ,凝胶银染后按等位基因梯阶标准判定样品基因型 ;对等位基因(TG) 2 0 (AG... 目的 建立准确检测载脂蛋白CⅡ (apoCⅡ )微卫星DNA(TG)n(AG)m的方法。方法 采用套式聚合酶链反应扩增样品DNA ,将扩增产物上样于变性聚丙烯酰胺凝胶 ,高压电泳 ,凝胶银染后按等位基因梯阶标准判定样品基因型 ;对等位基因(TG) 2 0 (AG) 8进行测序。结果  (TG)n(AG)m位点 ,共检出 12个等位基因 ( 17、18、2 6~ 3 5 ) ,3 6个基因型。 (AG)m位点 ,共检出4个等位基因 ( 6~ 9) ,7个基因型。DNA测序确证该等位基因为 (TG) 2 0 (AG) 8。结论 该法准确、快速、简便 ,适用于科研及大规模人群检查。 展开更多
关键词 apoCⅡ 微卫星DNA 变性聚丙烯酰胺凝胶电泳 等位基因梯阶标准 载脂蛋白CⅡ 冠心病
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恶性高脂血症载脂蛋白CⅡ的基因分析 被引量:2
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作者 田翠环 胡维诚 +1 位作者 陈融 克丙申 《实用医药杂志》 2000年第3期153-155,共3页
为了从分子水平上揭示婴儿恶性高脂血症的发病机制 ,从一例婴儿恶性高脂血症 (患儿已死亡 )患儿父母外周血白细胞中提取DNA ,在特异引物引导下 ,采用聚合酶链反应技术扩增载脂蛋白CⅡ调控区及第一、二、三、四外显子基因。扩增产物纯化... 为了从分子水平上揭示婴儿恶性高脂血症的发病机制 ,从一例婴儿恶性高脂血症 (患儿已死亡 )患儿父母外周血白细胞中提取DNA ,在特异引物引导下 ,采用聚合酶链反应技术扩增载脂蛋白CⅡ调控区及第一、二、三、四外显子基因。扩增产物纯化后 ,应用DNA自动分析法测定了扩增产物全部DNA序列。结果 ,患儿父母载脂蛋白CⅡ第一、二、三、四外显子基因均没有出现突变点 ,但其载脂蛋白CⅡ的调控区第一外显子上游 -1 90位点各自有一条链由正常的T突变为A ,患儿父母均为此突变的杂合子。据此推测 ,这种突变可能影响了载脂蛋白CⅡ的基因表达 ,患儿可能为此载蛋白CⅡ基因突变的纯合子 ,此突变使载脂蛋白CⅡ合成减少 ,浓度降低 ,不能有效地激活脂蛋白脂酶进行脂解 。 展开更多
关键词 婴儿 恶性高脂血症 载脂蛋白CⅡ(apoCⅡ) 聚合酶链反应(PCR) DNA序列分析 基因突变
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低剂量CT联合APOC1、YKL-40在儿童难治性支原体肺炎诊断中的应用 被引量:1
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作者 黄光举 张慧玉 +1 位作者 李娟 李佳 《甘肃科技纵横》 2022年第8期84-87,90,共5页
目的:探讨低剂量CT联合血清载脂蛋白C1(Apolipoprotein C1,APOC1)、甲壳质酶40(YKL-40)在儿童难治性支原体肺炎诊断中的意义。方法:收集我院2017年3月至2020年5月MPP患儿105例,根据病情严重程度分为普通MP(general MP,GMP)60例和RMCP 45... 目的:探讨低剂量CT联合血清载脂蛋白C1(Apolipoprotein C1,APOC1)、甲壳质酶40(YKL-40)在儿童难治性支原体肺炎诊断中的意义。方法:收集我院2017年3月至2020年5月MPP患儿105例,根据病情严重程度分为普通MP(general MP,GMP)60例和RMCP 45例;所有患儿行CT胸部低剂量扫描和血清APOC1、YKL-40表达检测;比较两组间APOC1、YKL-40、低剂量胸部CT影像的差异;应用二元Logistic回归建立低剂量CT成像指标、APOC1和YKL-40水平对RMCP的预测模型,采用ROC曲线计算APOC1、YKL-40和预测模型的ROC曲线下面积,以截断值为诊断阈值,计算预测模型的准确度、特异度、敏感度、阳性预测值、阴性预测值。结果RMCP组APOC1、YKL-40值高于GMP组,且有显著统计学差异(P<0.01)。APOC1截断值为14.12 mg/L,ROC曲线下面积(AUC)为0.831(95%CI:0.755~0.907;P<0.01),YKL-40截断值为34.780mmol/L,AUC=0.759(95%CI:0.665~0.853;P<0.01),预测模型:AUC=0.996(95%CI:0.989~0.100;P<0.01),其敏感度、特异度、阳性预测值、阴性预测值、正确率、约登指数分别为95.56%,100%,40.95%,59.08%,98.10%,0.96。结论:RMCP患儿APOC1、YKL-40表达异常升高,低剂量CT联合APOC1和YKL-40方式对RMCP具有很好的诊断价值。 展开更多
关键词 儿童 计算机体层摄影 低剂量 APOC1 YKL-40 难治性支原体肺炎
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人ApoC-Ⅰ基因的克隆、原核表达与纯化
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作者 谢伟群 邝枣园 +4 位作者 孙砚辉 张晓圆 陈健 刘思颖 张韧 《广州中医药大学学报》 CAS 2015年第2期317-324,共8页
【目的】进行含信号肽ApoC-Ⅰ(signal-ApoC-Ⅰ)和ApoC-Ⅰ成熟肽(mature-ApoC-Ⅰ)的基因克隆、原核表达和纯化。【方法】取肝癌切除手术患者的癌旁组织,提取总RNA后,逆转录成c DNA,并设计带酶切位点的特异引物分别扩增出signal-Apo C-Ⅰ... 【目的】进行含信号肽ApoC-Ⅰ(signal-ApoC-Ⅰ)和ApoC-Ⅰ成熟肽(mature-ApoC-Ⅰ)的基因克隆、原核表达和纯化。【方法】取肝癌切除手术患者的癌旁组织,提取总RNA后,逆转录成c DNA,并设计带酶切位点的特异引物分别扩增出signal-Apo C-Ⅰ、mature-Apo C-Ⅰ基因;将扩增出的基因通过T克隆入PMDTM19-T载体;T克隆经测序验证后,双酶切出目的基因,连入同样双酶切后的PET28a载体,构建原核表达质粒;再次测序验证后,将质粒转入BL21Star(DE3)中,表达条件优化后进行融合表达;将表达后产物用Ni-NTA树脂亲和层析进行重组蛋白纯化;纯化产物采用Western blot进行验证。【结果】构建了PET28a-signal-ApoC-Ⅰ、PET28a-mature-Apo C-Ⅰ表达质粒,重组质粒都经过测序鉴定正确;PET28a-signalApoC-Ⅰ诱导表达后能抑制宿主菌生长,但经过条件优化2个表达质粒都在BL21Star(DE3)菌中经异丙基-β-D-硫代半乳糖苷(IPTG)诱导大量表达和纯化,Western blot证实了表达的结果。【结论】含信号肽ApoC-Ⅰ、ApoC-Ⅰ成熟肽的基因克隆、原核表达和纯化成功,为进一步研究重组人Apo C-Ⅰ的作用奠定了基础。 展开更多
关键词 ApoC 基因克隆 基因表达 蛋白纯化
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ApoCⅢ与脂质代谢相关性研究进展 被引量:1
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作者 马志国 白云燕 《医学检验与临床》 2011年第1期78-79,共2页
载脂蛋白C(apolipoprotein C,apoC)是血浆中一组水溶性的低分子量蛋白质,包括载脂蛋白CI、CII、CⅢ和新近发现的civ四个亚类,它们主要分布在乳糜微粒(chylomicron,CM)、极低密度脂蛋白(very low density lipoprotein,VLDL)... 载脂蛋白C(apolipoprotein C,apoC)是血浆中一组水溶性的低分子量蛋白质,包括载脂蛋白CI、CII、CⅢ和新近发现的civ四个亚类,它们主要分布在乳糜微粒(chylomicron,CM)、极低密度脂蛋白(very low density lipoprotein,VLDL)和高密度脂蛋白(high density lipoprotein,HDL)中。 展开更多
关键词 ApoCⅢ 脂质代谢 相关性 载脂蛋白CI 极低密度脂蛋白 高密度脂蛋白 低分子量 乳糜微粒
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肝细胞膜apoCIII受体的研究进展
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作者 刘皓 刘秉文 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2003年第11期1532-1532,共1页
关键词 肝细胞膜 apoCⅢ受体 激素 内源性高甘油三酯血症 脂蛋白
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猪APOC3蛋白的生物信息学分析 被引量:1
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作者 曹威荣 《畜牧兽医科技信息》 2014年第11期26-29,共4页
APOC3在动物机体脂蛋白的代谢中发挥着关键的作用,本研究利用生物信息学相关软件对猪APOC3蛋白的理化性质、信号肽、跨膜结构、亚细胞定位、翻译后修饰位点、二级和三级结构进行初步的分析。结果表明:猪APOC3蛋白由96个氨基酸组成,分子... APOC3在动物机体脂蛋白的代谢中发挥着关键的作用,本研究利用生物信息学相关软件对猪APOC3蛋白的理化性质、信号肽、跨膜结构、亚细胞定位、翻译后修饰位点、二级和三级结构进行初步的分析。结果表明:猪APOC3蛋白由96个氨基酸组成,分子量为10.7 k Da,等电点为4.76,为一种分子量较小的亲水性稳定蛋白;该蛋白的N末端存在信号肽,剪切位点位于第23与24位氨基酸之间,但不存在跨膜结构域;APOC3蛋白含有4个O-糖基化和10个磷酸化修饰位点;α螺旋和无规则卷曲是构成其二级结构和三级结构主要的元件;系统进化分析显示,猪与牛和山羊的亲缘关系最近。该研究结果为进一步研究该蛋白的生物学功能奠定了基础。 展开更多
关键词 APOC3 生物信息学分析 系统进化
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APOC1基因rs11568822多态性与阿尔茨海默病的关联研究
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作者 何香花 庞国防 +7 位作者 张为 谢海群 吕泽平 吕渊 梁庆华 何本进 杨泽 胡才友 《中国老年保健医学》 2018年第5期39-41,共3页
目的探讨APOC1基因多态性在阿尔茨海默病(LOAD)发病风险中的作用。方法以300例中国南方的AD患者和300例对照组为研究对象,通过聚合酶链反应(PCR)和sanger测序分析其APOC1基因rs11568822多态和APOE基因的基因型和等位基因频率。结果 APOC... 目的探讨APOC1基因多态性在阿尔茨海默病(LOAD)发病风险中的作用。方法以300例中国南方的AD患者和300例对照组为研究对象,通过聚合酶链反应(PCR)和sanger测序分析其APOC1基因rs11568822多态和APOE基因的基因型和等位基因频率。结果 APOC1基因rs11568822多态在AD组与对照组的基因型分布及等位基因分布差异均无统计学意义(P> 0. 05);经APOEε4分层后,APOC1基因rs11568822多态在AD组与对照组的基因型和等位基因频率分布差异仍然无统计学意义(P> 0. 05)。结论在我们的研究中未发现APOC1基因rs11568822多态与AD有关。 展开更多
关键词 APOC1基因 rs11568822 阿尔茨海默病 多态性 载脂蛋白E
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过表达山羊APOC3基因促进肌内脂肪细胞分化 被引量:4
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作者 冉黎 吕锦诗 +5 位作者 张浩 王永 朱江江 李艳艳 孟庆勇 林亚秋 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2022年第3期223-230,共8页
为了明确APOC3基因在山羊肌内脂肪细胞分化中的作用,采用RT-PCR技术克隆山羊APOC3基因序列,并通过在线软件进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR(qPCR)技术检测山羊APOC3基因在各组织和不同分化阶段的肌内脂肪细胞中的表达规律;在利... 为了明确APOC3基因在山羊肌内脂肪细胞分化中的作用,采用RT-PCR技术克隆山羊APOC3基因序列,并通过在线软件进行生物信息学分析;利用实时荧光定量PCR(qPCR)技术检测山羊APOC3基因在各组织和不同分化阶段的肌内脂肪细胞中的表达规律;在利用双酶切法构建山羊APOC3过表达载体的基础上,利用油红O染色确定山羊APOC3基因过表达对肌内脂肪细胞脂滴聚集的影响,同时利用qPCR方法检测成脂分化标志基因mRNA的相对表达水平,进而明确其可能发挥作用的途径。结果表明,获得山羊APOC3的ORF区长294 bp,编码97个氨基酸,功能结构域区在第23—88个氨基酸处。山羊APOC3在心脏、肝脏、脾脏等14个组织中均有表达,且在肝脏中的表达量最高;山羊APOC3在诱导分化48 h表达量最高,极显著高于分化前;过表达山羊APOC3后肌内脂肪细胞中脂滴积聚增多,成脂分化标志基因SREBP1和CEBPβ的相对表达水平极显著上调,PPARγ的相对表达水平显著上调,而Pref-1相对表达水平显著下调。结果表明,山羊APOC3可能通过上调SREBP1、CEBPβ、PPARγ及下调Pref-1来发挥作用促进肌内脂肪细胞的分化。 展开更多
关键词 山羊 APOC3基因 肌内脂肪细胞 过表达 细胞分化
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