期刊文献+
任意字段
题名或关键词
题名
关键词
文摘
作者
第一作者
机构
刊名
分类号
参考文献
作者简介
基金资助
栏目信息
共找到9篇文章
< 1 >
每页显示 20 50 100
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
显示方式：
人APEX1基因的生物信息学分析 被引量：6
1
作者 郭润民 黄金智 +1 位作者 卫月 马天仲 《基因组学与应用生物学》 CAS CSCD 北大核心 2016年第8期1852-1857,共6页
APEXl是影响基因表达和氧化还原活性相关碱基修复和多功能蛋白的关键基因，对APEXl基因及编码蛋白进行生物信息学方面的深入分析，更有利于对APEXl基因相关癌症及其他遗传流行病学的阐述。本研究利用生物信息学分析方法以11个物种APEXl... APEXl是影响基因表达和氧化还原活性相关碱基修复和多功能蛋白的关键基因，对APEXl基因及编码蛋白进行生物信息学方面的深入分析，更有利于对APEXl基因相关癌症及其他遗传流行病学的阐述。本研究利用生物信息学分析方法以11个物种APEXl基因序列及编码蛋白序列为研究对象，对人APEXl基因进行了系统进化分析及预测启动子及CpG岛，并对其蛋白质理化性质及结构功能等进行了预测分析。核酸分析结果表明，人APEXl基因包含5个外显子，预测核心启动子区域为158～208bp。进化分析结果显示，人与黑猩猩的遗传距离为0．003，亲缘关系最近。蛋白预测软件结果显示，人APEXl蛋白主要由自由卷曲及仪一螺旋结构组成，无合适信号肽及明显跨膜区，表明该基因不参与跨膜物质运输及信号转导。 展开更多
关键词 人 apex1基因 生物信息学分析
原文传递
散发性大肠癌APEX基因两个单核苷酸多态性的检测及分析 被引量：1
2
作者 侯君 汤显斌 +1 位作者 谭云山 刘佳 《临床检验杂志》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期120-122,共3页
目的　检测分析中国人散发性大肠癌APEX基因 12 4 7位点、2 197位点的单核苷酸多态性 (singlenucleotidepolymorphism ,SNP)状况 ,探讨其与散发性大肠癌发生的关系。 方法　变性梯度凝胶电泳 (denaturinggradientgelelectrophoresis,DG... 目的　检测分析中国人散发性大肠癌APEX基因 12 4 7位点、2 197位点的单核苷酸多态性 (singlenucleotidepolymorphism ,SNP)状况 ,探讨其与散发性大肠癌发生的关系。 方法　变性梯度凝胶电泳 (denaturinggradientgelelectrophoresis,DGGE)、单链构像多态性 (singlestrandconformationpolymorphism ,SSCP)分别检测 15 0例大肠癌及其周围正常粘膜DNA的APEX基因 12 4 7位点、2 197位点SNP ,并直接测序验证结果。结果　 12 4 7位点经DGGE检测及测序证实有 17例存在A→G的SNP ,导致I 6 4V改变 ;经SSCP检测和测序证实 2 197位点有 38例T→G的SNP ,并导致D14 8E改变。结论　APEX基因SNP分布可能具有明显的种族差异 ,12 4 展开更多
关键词 散发性大肠癌 apex基因 单核苷酸 多态性 检测
暂未订购
天祝白牦牛APEX-1基因的克隆及生物信息学分析 被引量：1
3
作者 李亚兰 张全伟 +3 位作者 王雪莹 马友记 张勇 赵兴绪 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2014年第2期51-55,共5页
克隆天祝白牦牛脱嘌呤嘧啶核酸内切酶基因(APEX-1)全长cDNA序列,为研究天祝牦牛高原抗逆性机制提供理论基础。根据已知哺乳动物APEX-1基因cDNA序列同源性,设计引物以及5'和3'特异性引物,运用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得天... 克隆天祝白牦牛脱嘌呤嘧啶核酸内切酶基因(APEX-1)全长cDNA序列,为研究天祝牦牛高原抗逆性机制提供理论基础。根据已知哺乳动物APEX-1基因cDNA序列同源性,设计引物以及5'和3'特异性引物,运用cDNA末端快速扩增(RACE)技术获得天祝白牦牛APEX-1基因全长cDNA序列。扩增获得天祝白牦牛APEX-1基因全长cDNA序列为1 391 bp(GenBank登录号:KF611690),ORF长957 bp,编码318个氨基酸。氨基酸序列分析显示天祝白牦牛APEX-1基因编码氨基酸序列与大多数哺乳动物相似,但有7个氨基酸突变。同源建模预测,显示天祝白牦牛APEX-1蛋白由8个α-螺旋和11个β-折叠片形成一个呈三明治的α/β球蛋白。天祝白牦牛APEX-1基因的成功克隆为进一步研究该基因的功能奠定了基础。 展开更多
关键词 天祝白牦牛 脱嘌呤嘧啶核酸内切酶 CDNA末端快速扩增 序列分析
在线阅读 下载PDF
水稻叶尖早衰突变体lad的形态、生理分析与基因定位 被引量：24
4
作者 杜青 方立魁 +5 位作者 桑贤春 凌英华 李云峰 杨正林 何光华 赵芳明 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第1期168-173,共6页
叶片作为植物的主要光合作用场所,研究其早衰机制对提高作物的经济产量具有非常重要的意义。本研究报道了一个来自EMS诱变优良恢复系缙恢10号的新水稻叶尖早衰突变体lad(leafapexdead),其叶尖在第5片叶抽出前呈正常状态,当第5叶完全抽... 叶片作为植物的主要光合作用场所,研究其早衰机制对提高作物的经济产量具有非常重要的意义。本研究报道了一个来自EMS诱变优良恢复系缙恢10号的新水稻叶尖早衰突变体lad(leafapexdead),其叶尖在第5片叶抽出前呈正常状态,当第5叶完全抽出之后前5叶的叶尖变黄并最终枯死;随后的叶子在完全抽出后,叶尖也逐渐变黄并枯死。对该突变体的生理生化分析发现,其叶绿素含量、可溶性蛋白含量明显下降,SOD酶活性异常。其株高、叶长、粒数等也都显著降低。经遗传分析,该突变性状受1对隐性单基因控制,利用分子标记将该基因定位于第11染色体SSR标记SWU11-19和SWU11-5之间,遗传距离为13cM,并且与SSR标记SWU11-25和SWU11-27共分离。本研究结果为该基因的进一步克隆和功能研究奠定了良好基础。 展开更多
关键词 水稻 叶尖早衰死亡 基因定位 表型分析 生理分析
在线阅读 下载PDF
农杆菌介导的海岛棉茎尖再生体系及其遗传转化影响因子的研究 被引量：11
5
作者 翁琴 陈全家 +3 位作者 孔庆平 张国政 武金玲 曲延英 《新疆农业大学学报》 CAS 2007年第4期63-67,共5页
采用根癌农杆菌LBA4404和EHA105介导,对海岛棉的茎尖再生体系及其转化影响因子进行了研究。茎尖培养与棉花体细胞胚胎发生相比,不同基因型的茎尖再生频率差异不明显;在9种不同的激素组合中,以6-BA0.5 mg/L＋NAA0.1 mg/L与1/2MSB5＋IBA 0... 采用根癌农杆菌LBA4404和EHA105介导,对海岛棉的茎尖再生体系及其转化影响因子进行了研究。茎尖培养与棉花体细胞胚胎发生相比,不同基因型的茎尖再生频率差异不明显;在9种不同的激素组合中,以6-BA0.5 mg/L＋NAA0.1 mg/L与1/2MSB5＋IBA 0.1 mg/L对茎尖的再生效果较好;获得较高转化频率的海岛棉培养条件为：海岛苗茎尖在OD600值为0.6-0.8农杆菌菌液中感染20-30 min,共培养3 d后进行转接,在含有不同激素和抗生素的各类培养基中进行抑菌和筛选继代培养,选择压以50-150 mg/L梯度进行;农杆菌以EHA105菌株的转化效果较好;抗性苗用SDS-CTAB法提取其总DNA,进行PCR扩增检测,有7株PCR检测呈阳性反应。由此,初步证明外源抗虫基因已经进入到再生植株的细胞核中。 展开更多
关键词 海岛棉茎尖 遗传转化 根癌农杆菌 BT基因
在线阅读 下载PDF
利用根癌农杆菌和基因枪法转化获得转抗虫融合蛋白基因(Bt-CpTI)甘蓝植株 被引量：6
6
作者 杨广东 朱祯 +1 位作者 李燕娥 朱祝军 《实验生物学报》 CSCD 北大核心 2002年第2期117-122,共6页
以下胚轴、带柄子叶和茎尖为外植体,利用根癌农杆菌和基因枪法将抗虫融合蛋白基因(Bt-CpTI)导人甘蓝品种“中甘8号”,得到了13株卡那霉素抗性植株。经PCR扩增反应和Southern blot分子验证表明:农杆菌介导转化下胚轴和带柄子叶来源的Ⅰ... 以下胚轴、带柄子叶和茎尖为外植体,利用根癌农杆菌和基因枪法将抗虫融合蛋白基因(Bt-CpTI)导人甘蓝品种“中甘8号”,得到了13株卡那霉素抗性植株。经PCR扩增反应和Southern blot分子验证表明:农杆菌介导转化下胚轴和带柄子叶来源的Ⅰ型抗性植株均为转基因植株,而农杆菌介导转化茎尖外植体得到的Ⅱ型抗性植株属“假阳性”植株,基因枪介导转化茎尖的2株Ⅲ型植株中,有1株是非转基因植株。经胰蛋白酶抑制剂活性分析和抗虫测试证明,部分转基因植株有较高的胰蛋白酶抑制剂活性和抗菜青虫能力。 展开更多
关键词 根癌农杆菌 基因枪法 转化 Bt-CpTI融合基因 转基因甘蓝 抗性植株
在线阅读 下载PDF
基于转录组测序的菜心茎尖组织开花相关基因差异表达分析 被引量：2
7
作者 王帷千 龚泽平 +6 位作者 陈妍娜 李荣华 黄红弟 郭少龙 李光光 郭培国 夏岩石 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第3期721-732,共12页
【目的】基于转录组测序数据分析鉴定调控菜心抽薹开花相关的候选基因及信号通路,为今后阐明菜心抽薹开花调控分子机制及选育不同熟性菜心品种提供理论参考。【方法】对四九-19号(早熟型)和80天油绿(晚熟型)菜心的七叶期和现蕾期茎尖组... 【目的】基于转录组测序数据分析鉴定调控菜心抽薹开花相关的候选基因及信号通路,为今后阐明菜心抽薹开花调控分子机制及选育不同熟性菜心品种提供理论参考。【方法】对四九-19号(早熟型)和80天油绿(晚熟型)菜心的七叶期和现蕾期茎尖组织进行转录组测序,比较不同熟性菜心品种间及不同生长时期间的差异表达基因(DEGs),并对其进行GO功能注释及KEGG信号通路富集分析,结合FLOR-ID和UniProt数据库筛选出不同熟性菜心参与调控抽薹开花时间的候选基因及信号通路,通过实时荧光定量PCR验证转录组数据的可靠性。【结果】菜心茎尖组织转录组测序数据为81.93 Gb,经质控过滤后得到536679570条Clean reads,GC含量为47.24%~47.63%,Q20为97.11%~98.00%,Q30为91.97%~94.11%,平均87.98%的Clean reads比对上参考基因组。四九-19号菜心的七叶期和现蕾期间有1965个DEGs,80天油绿菜心的七叶期和现蕾期有6007个DEGs。GO功能注释结果显示,涉及分子功能的DEGs最多,主要注释为蛋白质二聚化活性、血红素结合和四吡咯结合等;其次是生物学过程,主要注释为小分子代谢过程、脂质代谢过程和离子运输等过程;细胞成分类别中,DEGs主要注释为核糖体、细胞器部分、染色体、核小体、蛋白质-DNA复合物和DNA包装复合体。KEGG信号通路富集结果显示,四九-19号菜心七叶期和现蕾期间的DEGs显著(Padj<0.05,下同)富集在光合生物中的碳固定及角质、木栓质和蜡生物合成等通路;80天油绿菜心七叶期和现蕾期间的DEGs显著富集在苯丙素生物合成、DNA复制和植物激素信号转导等通路。四九-19号和80天油绿菜心品种间有750个DEGs,其中16个为开花相关基因,涉及光周期途径、自主途径、赤霉素途径、春化途径、温度途径和年龄途径等,部分开花基因在2个菜心品种中表达量存在明显差异。实时荧光定量PCR检测结果与转录组测序结果相关性较强。【结论】菜心抽薹开花过程受到光周期途径、自主途径和赤霉素途径等关键途径调控,同时受到春化途径、温度途径和年龄途径的影响。虽然2个不同熟性菜心品种开花调控所涉及的途径基本相同,但开花调控途径中的基因响应不一致,导致二者开花时间存在差异。 展开更多
关键词 菜心 茎尖组织 转录组 差异表达基因(DEGs) 开花调控
在线阅读 下载PDF
AtWUS过表达诱导分蘖洋葱体细胞胚高频发生 被引量：1
8
作者 徐启江 黄俊慧 +3 位作者 何涛 邢志勇 杨安妮 黄云彤 《北方园艺》 CAS 北大核心 2024年第1期24-30,共7页
以分蘖洋葱茎尖外植体诱导的愈伤组织为试材,采用农杆菌介导法,将外源基因AtWUS导入分蘖洋葱愈伤组织中,研究AtWUS对分蘖洋葱愈伤组织诱导体细胞胚发生的影响,以期建立分蘖洋葱体细胞胚高频发生体系。结果表明:过表达AtWUS可以显著促进... 以分蘖洋葱茎尖外植体诱导的愈伤组织为试材,采用农杆菌介导法,将外源基因AtWUS导入分蘖洋葱愈伤组织中,研究AtWUS对分蘖洋葱愈伤组织诱导体细胞胚发生的影响,以期建立分蘖洋葱体细胞胚高频发生体系。结果表明:过表达AtWUS可以显著促进分蘖洋葱愈伤组织的体细胞胚发生率(大约6倍),91%的双极性体细胞胚具有发育形成完整植株能力。RT-PCR分析结果表明,AtWUS在体细胞胚和转基因植株中高丰度表达。 展开更多
关键词 分蘖洋葱 茎尖外植体 愈伤组织 体细胞胚发生 AtWUS基因
原文传递
茄子果顶形状数据采集方法比较和遗传分析 被引量：5
9
作者 耿树文 张映 +2 位作者 刘富中 陈钰辉 连勇 《中国蔬菜》 北大核心 2018年第7期48-55,共8页
以圆顶茄子和尖顶茄子为亲本构建6世代群体(P_1、P_2、F_1、BC_1P_1、BC_1P_2、F_2),在春露地和秋大棚两个茬口分别种植6世代群体,利用目测法和Tomato Analyzer软件分析法采集茄子果顶形状数据,应用植物数量性状主基因+多基因混合遗传... 以圆顶茄子和尖顶茄子为亲本构建6世代群体(P_1、P_2、F_1、BC_1P_1、BC_1P_2、F_2),在春露地和秋大棚两个茬口分别种植6世代群体,利用目测法和Tomato Analyzer软件分析法采集茄子果顶形状数据,应用植物数量性状主基因+多基因混合遗传模型多世代联合分析方法,对茄子果顶形状进行遗传分析。结果表明:目测法和软件法都可以用来描述茄子果顶形状,Tomato Analyzer软件分析法获取的果顶数据计算出的AIC值完整性好、适应性检测中的统计量差异显著个数少,对茄子果顶形状的数据测量更为准确,更加适用于茄子果顶形状的采集。茄子果顶形状表现为数量性状,受2对加性-显性-上位性主基因控制,同时也受环境条件的影响。在分离群体中F_2群体主基因遗传率高、稳定性好,主基因遗传率达到72%以上,育种过程中适合在F_2群体进行果顶形状的选择。 展开更多
关键词 茄子果顶 目测法 TOMATO ANALYZER 软件分析法 主基因+多基因 遗传分析
在线阅读 下载PDF
已选择0条
导出题录 引用分析
参考文献
引证文献
 统计分析
检索结果
已选文献
上一页 1 下一页 到第 页
使用帮助 返回顶部