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铁皮石斛AP3-3基因及启动子的克隆与分析
1
作者
王义琴
孙博
+6 位作者
何玲
师凯辉
黄鑫
王冬梅
陈宇
臧睿
和凤美
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期585-591,共7页
【目的】AP3-3属于MADS-box基因家族B类基因,参与兰科植物花被和唇瓣的形成,克隆该基因并进行启动子分析可以进一步研究该基因的生物学功能及其启动子调控作用机制。【方法】使用RT-PCR和常规PCR技术克隆铁皮石斛DoAP3-3基因及其启动子...
【目的】AP3-3属于MADS-box基因家族B类基因,参与兰科植物花被和唇瓣的形成,克隆该基因并进行启动子分析可以进一步研究该基因的生物学功能及其启动子调控作用机制。【方法】使用RT-PCR和常规PCR技术克隆铁皮石斛DoAP3-3基因及其启动子序列,进行生物信息学分析,构建启动子缺失片段与GUS基因融合表达载体,农杆菌介导转化铁皮石斛原球茎,进行瞬时表达。【结果】DoAP3-3基因cDNA长度为675 bp,编码蛋白质的分子式为C_(1129)H_(1803)N_(333)O_(347)S_(12),分子量25.98 kDa,pI为8.71,不稳定性指数40.14,GRAVY为-0.823,不存在跨膜区域,亚细胞定位预测得分为细胞核87.0%、线粒体8.7%、细胞质4.3%。启动子片段长度1885 bp,顺式作用元件含有大量的光响应元件等;3个启动子片段均可驱动GUS基因表达,表达强度为-1885~0 bp>-1604~0 bp>-750~0 bp。【结论】DoAP3-3蛋白具有碱性、亲水性和不稳定性,无跨膜结构域,亚细胞定位于细胞核中。DoAP3-3启动子可能受光照、植物激素、MYB转录蛋白等多个因素调控,具备启动活性,且随启动子缺失长度减少呈现增加趋势。
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关键词
铁皮石斛
ap3-3
CDNA
启动子
克隆
序列分析
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职称材料
小花草玉梅花器官变异多样性机制初步研究
被引量:
1
2
作者
王超
戎利勤
+1 位作者
冯璐杰
刘虎岐
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期89-96,共8页
以野外条件下花器官发生了多样性变异的小花草玉梅(Anemone rivularis var.flore-minore)为材料,根据其花器官变异部位及程度将变异分为5类:全白、绿白相间、五瓣、全绿和极端变异。通过分子鉴定、花器官形态学观察、AP3-3基因分析,对...
以野外条件下花器官发生了多样性变异的小花草玉梅(Anemone rivularis var.flore-minore)为材料,根据其花器官变异部位及程度将变异分为5类:全白、绿白相间、五瓣、全绿和极端变异。通过分子鉴定、花器官形态学观察、AP3-3基因分析,对其变异多样性机制进行了初步研究。结果表明,正常植株和变异植株的ITS2和rbc L序列无差异位点,表明正常植株和变异植株为同一物种;形态观察发现变异花形态差异很大,由外向内存在连续变异梯度,除正常和五瓣花的花被片数相对稳定外,其余各类型花器官数和占比均不稳定,且花被片数占比的增减与雄蕊、雌蕊的占比呈负相关,说明变异花中内层增加的花被片可能是由雄蕊和雌蕊转化而来;在正常和绿白相间变异AP3-3序列基础上,扩增其余4种变异植株的AP3-3,比对正常株和变异株AP3-3序列,发现变异株AP3-3在上游调控区有一段插入,在编码区有1个碱基缺失,其可能与小花草玉梅花器官变异有关。
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关键词
小花草玉梅
花器官
变异
分子鉴定
ap3-3
基因
原文传递
题名
铁皮石斛AP3-3基因及启动子的克隆与分析
1
作者
王义琴
孙博
何玲
师凯辉
黄鑫
王冬梅
陈宇
臧睿
和凤美
机构
云南农业大学园林园艺学院
出处
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022年第5期585-591,共7页
基金
国家自然科学基金项目(31760591)
晋宁区花卉产业科技特派团专项(202204BI090022)。
文摘
【目的】AP3-3属于MADS-box基因家族B类基因,参与兰科植物花被和唇瓣的形成,克隆该基因并进行启动子分析可以进一步研究该基因的生物学功能及其启动子调控作用机制。【方法】使用RT-PCR和常规PCR技术克隆铁皮石斛DoAP3-3基因及其启动子序列,进行生物信息学分析,构建启动子缺失片段与GUS基因融合表达载体,农杆菌介导转化铁皮石斛原球茎,进行瞬时表达。【结果】DoAP3-3基因cDNA长度为675 bp,编码蛋白质的分子式为C_(1129)H_(1803)N_(333)O_(347)S_(12),分子量25.98 kDa,pI为8.71,不稳定性指数40.14,GRAVY为-0.823,不存在跨膜区域,亚细胞定位预测得分为细胞核87.0%、线粒体8.7%、细胞质4.3%。启动子片段长度1885 bp,顺式作用元件含有大量的光响应元件等;3个启动子片段均可驱动GUS基因表达,表达强度为-1885~0 bp>-1604~0 bp>-750~0 bp。【结论】DoAP3-3蛋白具有碱性、亲水性和不稳定性,无跨膜结构域,亚细胞定位于细胞核中。DoAP3-3启动子可能受光照、植物激素、MYB转录蛋白等多个因素调控,具备启动活性,且随启动子缺失长度减少呈现增加趋势。
关键词
铁皮石斛
ap3-3
CDNA
启动子
克隆
序列分析
Keywords
Dendrobium officinale
ap3-3
cDNA
promoter
cloning
sequence analysis
分类号
S682.31 [农业科学—观赏园艺]
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职称材料
题名
小花草玉梅花器官变异多样性机制初步研究
被引量:
1
2
作者
王超
戎利勤
冯璐杰
刘虎岐
机构
西北农林科技大学生命科学学院
出处
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017年第1期89-96,共8页
基金
中医药行业科研专项(201207002)
中医药公共卫生专项(财社[2011]76号)
文摘
以野外条件下花器官发生了多样性变异的小花草玉梅(Anemone rivularis var.flore-minore)为材料,根据其花器官变异部位及程度将变异分为5类:全白、绿白相间、五瓣、全绿和极端变异。通过分子鉴定、花器官形态学观察、AP3-3基因分析,对其变异多样性机制进行了初步研究。结果表明,正常植株和变异植株的ITS2和rbc L序列无差异位点,表明正常植株和变异植株为同一物种;形态观察发现变异花形态差异很大,由外向内存在连续变异梯度,除正常和五瓣花的花被片数相对稳定外,其余各类型花器官数和占比均不稳定,且花被片数占比的增减与雄蕊、雌蕊的占比呈负相关,说明变异花中内层增加的花被片可能是由雄蕊和雌蕊转化而来;在正常和绿白相间变异AP3-3序列基础上,扩增其余4种变异植株的AP3-3,比对正常株和变异株AP3-3序列,发现变异株AP3-3在上游调控区有一段插入,在编码区有1个碱基缺失,其可能与小花草玉梅花器官变异有关。
关键词
小花草玉梅
花器官
变异
分子鉴定
ap3-3
基因
Keywords
Anemone rivularis var.flore
-
minore
floral organ
variant
molecular identification
ap3-3
gene
分类号
S682.19 [农业科学—观赏园艺]
原文传递
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
铁皮石斛AP3-3基因及启动子的克隆与分析
王义琴
孙博
何玲
师凯辉
黄鑫
王冬梅
陈宇
臧睿
和凤美
《福建农业学报》
CAS
CSCD
北大核心
2022
0
在线阅读
下载PDF
职称材料
2
小花草玉梅花器官变异多样性机制初步研究
王超
戎利勤
冯璐杰
刘虎岐
《园艺学报》
CAS
CSCD
北大核心
2017
1
原文传递
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