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A-FABP和AMPD1基因SNP位点对北京油鸡部分肉质性状的组合效应分析
被引量：
16
1
作者
刘琛
文杰
+2 位作者
赵桂苹
郑麦青
陈继兰
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第10期1555-1559,共5页
本研究旨在分析鸡脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)和腺苷一磷酸脱氨酶(AMPD1)基因的SNP位点对鸡肉肌内脂肪(IMF)和肌苷酸(IMP)含量的组合效应。试验以北京油鸡为材料,采用PCR-SSCP技术对A-FABP基因外显子1第51位碱基(P4位点)的C→T突变和A...
本研究旨在分析鸡脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)和腺苷一磷酸脱氨酶(AMPD1)基因的SNP位点对鸡肉肌内脂肪(IMF)和肌苷酸(IMP)含量的组合效应。试验以北京油鸡为材料,采用PCR-SSCP技术对A-FABP基因外显子1第51位碱基(P4位点)的C→T突变和AMPD1基因序列第129位(PB位点)的A→G突变进行单基因和多基因组合效应分析。结果表明,P4位点的突变纯合BB基因型和PB位点的突变纯合NN基因型分别是多态位点上IMF和IMP含量的优势基因型;组合效应分析结果表明,在9种组合中,BBNN和BBMN组合基因型个体的组合效应显著,其中BBMN基因型个体的IMF含量、腹脂率(AFP)和平均脂带宽(WFS)比组合前P4位点BB基因型和PB位点MN基因型个体的均值分别增加了7.80%、50.74%和4.92%,组合效应显著(P<0.05),IMP含量比组合前增加了2.53%;2个基因位点间不存在显著的互作效应(P>0.05)。因此,可将BB与NN或MN基因型聚合,进行分子标记聚合育种,以辅助选择提高鸡肉IMP和IMF含量。
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关键词
北京油鸡
脂肪酸结合蛋白基因
腺苷一磷酸脱氨酶基因
单核苷酸多态性
基因型组合效应
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职称材料
山羊腺苷单磷酸脱氨酶1基因启动子区单核苷酸多态性研究
被引量：
1
2
作者
王德凤
杨永强
韩勇
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2013年第7期127-132,共6页
为筛选腺苷单磷酸脱氨酶1(adenosine monophosphate deaminase 1,AMPD1)基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)及研究其对启动子功能元件的影响,试验选择小香羊、黔北麻羊、努比山羊构建不同DNA池,直接测序结合BLAST筛选SNP位点。结果表明,AM...
为筛选腺苷单磷酸脱氨酶1(adenosine monophosphate deaminase 1,AMPD1)基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)及研究其对启动子功能元件的影响,试验选择小香羊、黔北麻羊、努比山羊构建不同DNA池,直接测序结合BLAST筛选SNP位点。结果表明,AMPD1基因启动子区存在5个SNPs位点,分别为:T-614A、G-326A、G-309A、T-287C和T-165C。生物信息学软件预测得到AMPD1基因核心启动子区和转录因子结合位点,SNPs位点导致9个转录因子结合位点消失,而产生7个新的转录因子结合位点。AMPD1基因RNA二级结构在突变后显著改变,但未检测到CpG岛区域。
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关键词
腺苷单磷酸脱氨酶1
单核苷酸多态性
启动子
小香羊
黔北麻羊
努比山羊
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职称材料
题名
A-FABP和AMPD1基因SNP位点对北京油鸡部分肉质性状的组合效应分析
被引量：
16
1
作者
刘琛
文杰
赵桂苹
郑麦青
陈继兰
机构
中国农业科学院北京畜牧兽医研究所
出处
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009年第10期1555-1559,共5页
基金
国家高技术研究发展计划(863)项目(2008AA101009
2006AA10Z1D8)
文摘
本研究旨在分析鸡脂肪型脂肪酸结合蛋白(A-FABP)和腺苷一磷酸脱氨酶(AMPD1)基因的SNP位点对鸡肉肌内脂肪(IMF)和肌苷酸(IMP)含量的组合效应。试验以北京油鸡为材料,采用PCR-SSCP技术对A-FABP基因外显子1第51位碱基(P4位点)的C→T突变和AMPD1基因序列第129位(PB位点)的A→G突变进行单基因和多基因组合效应分析。结果表明,P4位点的突变纯合BB基因型和PB位点的突变纯合NN基因型分别是多态位点上IMF和IMP含量的优势基因型;组合效应分析结果表明,在9种组合中,BBNN和BBMN组合基因型个体的组合效应显著,其中BBMN基因型个体的IMF含量、腹脂率(AFP)和平均脂带宽(WFS)比组合前P4位点BB基因型和PB位点MN基因型个体的均值分别增加了7.80%、50.74%和4.92%,组合效应显著(P<0.05),IMP含量比组合前增加了2.53%;2个基因位点间不存在显著的互作效应(P>0.05)。因此,可将BB与NN或MN基因型聚合,进行分子标记聚合育种,以辅助选择提高鸡肉IMP和IMF含量。
关键词
北京油鸡
脂肪酸结合蛋白基因
腺苷一磷酸脱氨酶基因
单核苷酸多态性
基因型组合效应
Keywords
Beijing-You chicken
A-FABP gene
ampd1
gene
snp
s
genotype combinations effect
分类号
S831 [农业科学—畜牧学]
Q343.1 [生物学—遗传学]
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职称材料
题名
山羊腺苷单磷酸脱氨酶1基因启动子区单核苷酸多态性研究
被引量：
1
2
作者
王德凤
杨永强
韩勇
机构
贵州省畜牧兽医研究所
贵州大学动物科学学院高原山地动物遗传育种与繁殖教育部重点实验室贵州省动物遗传育种与繁殖重点实验室
出处
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2013年第7期127-132,共6页
基金
贵州省科学技术基金项目“AMPD1基因与小香羊肉质风味的关联研究”(黔科合J字[2011]2225号)
贵州省畜禽健康养殖技术创新能力建设项目(黔科合院所创能[2010]4004号)
留学回国人员科研启动项目《贵州小香羊优质肉质风味关键影响因子研究》
文摘
为筛选腺苷单磷酸脱氨酶1(adenosine monophosphate deaminase 1,AMPD1)基因启动子区单核苷酸多态性(SNP)及研究其对启动子功能元件的影响,试验选择小香羊、黔北麻羊、努比山羊构建不同DNA池,直接测序结合BLAST筛选SNP位点。结果表明,AMPD1基因启动子区存在5个SNPs位点,分别为:T-614A、G-326A、G-309A、T-287C和T-165C。生物信息学软件预测得到AMPD1基因核心启动子区和转录因子结合位点,SNPs位点导致9个转录因子结合位点消失,而产生7个新的转录因子结合位点。AMPD1基因RNA二级结构在突变后显著改变,但未检测到CpG岛区域。
关键词
腺苷单磷酸脱氨酶1
单核苷酸多态性
启动子
小香羊
黔北麻羊
努比山羊
Keywords
ampd1 snp
promoter Small-xiang goat
Qianbei ma goat ~ Nubian goat
分类号
S816.79 [农业科学—饲料科学]
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职称材料
题名
作者
出处
发文年
被引量
操作
1
A-FABP和AMPD1基因SNP位点对北京油鸡部分肉质性状的组合效应分析
刘琛
文杰
赵桂苹
郑麦青
陈继兰
《畜牧兽医学报》
CAS
CSCD
北大核心
2009
16
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职称材料
2
山羊腺苷单磷酸脱氨酶1基因启动子区单核苷酸多态性研究
王德凤
杨永强
韩勇
《中国畜牧兽医》
CAS
北大核心
2013
1
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