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基于生物信息学研究Duffy血型ACKR1基因在肺腺癌中表达及临床意义
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作者 袁咏梅 周仁龙 +1 位作者 闫岩 王革非 《生物化工》 2025年第3期28-33,39,共7页
目的:基于生物信息学方法,研究Duffy血型非典型趋化因子受体1(Atypical Chemokine Receptor 1,ACKR1)基因在肺腺癌(Lung Adenocarcinoma,LUAD)中的表达及其临床意义。方法:利用GEPIA数据库分析ACKR1基因在LUAD中的表达水平及其与肿瘤分... 目的:基于生物信息学方法,研究Duffy血型非典型趋化因子受体1(Atypical Chemokine Receptor 1,ACKR1)基因在肺腺癌(Lung Adenocarcinoma,LUAD)中的表达及其临床意义。方法:利用GEPIA数据库分析ACKR1基因在LUAD中的表达水平及其与肿瘤分级等临床特征的相关性;通过Sangerbox数据库分析ACKR1表达水平与免疫细胞浸润水平的关系及其对患者预后的影响;利用STRING数据库构建ACKR1蛋白的相互作用网络,并进行GO功能富集分析。结果:与正常组织相比,ACKR1基因在多数LUAD患者中显著低表达(p<0.05)。ACKR1表达水平随LUAD临床分期的增加而逐渐降低,且与6种免疫细胞的浸润水平呈正相关。蛋白相互作用网络分析显示,ACKR1与趋化因子配体、黏附蛋白等存在相互作用。GO富集分析表明,ACKR1主要参与免疫细胞迁移、趋化作用及相关信号通路的调控。生存分析结果表明,ACKR1低表达的LUAD患者预后显著较差,其生存期明显短于ACKR1高表达组。ROC曲线分析显示,ACKR1基因在LUAD中的曲线下面积为0.922,对LUAD具有较高的诊断效能。结论:ACKR1基因在LUAD组织中普遍呈现低表达状态,且其低表达与患者不良预后显著相关,提示ACKR1可能作为LUAD患者潜在的新型肿瘤标志物。 展开更多
关键词 DUFFY血型 非典型趋化因子受体1(ackr1) 肺腺癌 生物信息学
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丙肝患者ACKR1多态性与肝纤维化及肝损伤的相关性研究 被引量:3
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作者 邵林楠 周世航 +3 位作者 王霓 张树婷 段莹 刘铭 《中国输血杂志》 CAS 2019年第10期996-999,共4页
目的研究ACKR1多态性与HCV患者肝纤维化及肝损伤的相关性。方法招募245名患有慢性HCV感染的患者参与研究,使用TaqMan探针方法进行ACKR1多态性分析,同时收集患者肝纤维化和肝功能指标。通过对比不同ACKR1基因型患者肝纤维化和肝功能指标... 目的研究ACKR1多态性与HCV患者肝纤维化及肝损伤的相关性。方法招募245名患有慢性HCV感染的患者参与研究,使用TaqMan探针方法进行ACKR1多态性分析,同时收集患者肝纤维化和肝功能指标。通过对比不同ACKR1基因型患者肝纤维化和肝功能指标来分析ACKR1多态性与HCV患者肝纤维化及肝损伤的相关性。结果通过比较FY^*A/FY^*A与FY^*A/FY^*B基因型患者血常规及血液生化指标发现,除了ALT及AST/ALT外,其余指标2组间均无统计学差异(P>0.05);比较不同基因型患者肝纤维化指标及Fibroscan检测结果发现2组间各指标均无统计学差异(P>0.05)。结论HCV患者肝纤维化进程不受ACKR1多态性影响,但肝损伤程度可以被ACKR1调控,携带有FY^*A等位基因对肝损伤有一定保护作用。 展开更多
关键词 HCV ackr1 多态性 肝纤维化 肝损伤
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ACKR1在尿路上皮膀胱癌组织中的表达及其与预后的相关性 被引量:1
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作者 李如鹏 罗蓉 +1 位作者 赵建 高宏飞 《现代肿瘤医学》 CAS 2024年第20期3942-3947,共6页
目的:探讨非典型趋化因子1(ACKR1)在尿路上皮膀胱癌(UBC)组织中的表达情况,并探讨其与预后的相关性。方法:收集428例UBC样本转录组基因表达数据进行差异基因分析并用ESTIMATE法进行肿瘤免疫微环境分析。随后,回顾性分析2019年1月至2021... 目的:探讨非典型趋化因子1(ACKR1)在尿路上皮膀胱癌(UBC)组织中的表达情况,并探讨其与预后的相关性。方法:收集428例UBC样本转录组基因表达数据进行差异基因分析并用ESTIMATE法进行肿瘤免疫微环境分析。随后,回顾性分析2019年1月至2021年12月我院泌尿外科收治的81例膀胱癌患者的临床资料,根据患者预后分为复发组(n=42)和未复发组(n=39),比较两组各临床特征的差异。采用免疫组织化学法检测组织中ACKR1表达情况,比较膀胱壁各层瘤内组织与瘤周组织ACKR1表达差异,并分析其与UBC患者临床病理特征的关系;采用乘积极限法(Kaplan-Meier)分析UBC患者预后状况,并采用Log-Rank检验进行显著性比较;采用Cox模型分析UBC患者不良预后的影响因素。结果:428例样本数据的差异表达基因分析发现ACKR1在肿瘤组织内表达下降并且与较低的免疫评分相关。81例UBC患者样本的IHC结果结合临床资料发现在未复发组中固有层瘤周组织的ACKR1表达量要高于复发组。另外,存在肿瘤细胞血管浸润者较不存在者的ACKR1表达量更低,且差异具有统计学意义。与ACKR1低表达组相比,ACKR1高表达组患者具有更长无复发生存期且P<0.001。单因素Cox回归分析表明分化级别、浸润深度、肿瘤大小、脉管浸润及ACKR1表达与患者复发相关;多因素Cox回归分析表明ACKR1表达为膀胱癌复发的独立影响因素(P<0.05),即与ACKR1低表达的患者相比,ACKR1高表达的患者复发风险较低(OR=0.032,95%CI:0.0041~0.24,P<0.05)。结论:固有层瘤周组织内毛细血管内皮细胞表面的ACKR1低表达的患者可能倾向于较短的无复发生存期。 展开更多
关键词 膀胱癌 ackr1 趋化因子 血管浸润 肿瘤免疫微环境
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贮存时间对红细胞非典型趋化因子受体1清除及储存趋化因子的影响 被引量:3
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作者 周世航 王霓 +1 位作者 刘铭 梁晓华 《中国输血杂志》 CAS 2022年第11期1113-1116,共4页
目的 探讨贮存时间对红细胞非典型趋化因子受体1(atypical chemokine receptor 1,ACKR1)的趋化因子清除功能及储存的影响。方法 6袋去白细胞悬浮红细胞制剂,每袋通过无菌热合机分出2小袋(10 mL/袋),置于血液贮存冰箱储存,分别于贮存d5、... 目的 探讨贮存时间对红细胞非典型趋化因子受体1(atypical chemokine receptor 1,ACKR1)的趋化因子清除功能及储存的影响。方法 6袋去白细胞悬浮红细胞制剂,每袋通过无菌热合机分出2小袋(10 mL/袋),置于血液贮存冰箱储存,分别于贮存d5、d25取出,进行红细胞CCL5、CXCL8以及CCL11含量以及ACKR1趋化因子清除功能测定。同时采集贮存期在d5~25的42份(1 mL/份)去白细胞悬浮红细胞制剂标本,进行红细胞膜上ACKR1表达及趋化因子CCL5、CXCL8以及CCL11含量的检测。结果 贮存期d 25和d 5相比,红细胞裂解液CCL5(pg/mL)(467.7±250.2 vs 586.9±209.5,P>0.05)及CCL11(pg/mL)(122.2±30.3 vs 125.5±32.7,P>0.05)浓度无差异,而CXCL8的浓度降低(pg/mL)(42.4±5.3 vs 24.3±5.9,P<0.05),红细胞ACKR1对趋化因子CCL5(pg/mL)(2 634.0±730.2 vs 453.8±257.4,P<0.05)、CXCL8(pg/mL)(1 117.0±236.6 vs 306.2±28.3,P<0.05)以及CCL11(pg/mL)的清除能力下降(1 278.0±164.5 vs 467.2±50.9,P<0.05)。在红细胞膜表面未检出趋化因子CCL5、CXCL8以及CCL11。红细胞表面ACKR1表达在d 5~25期间,无明显变化(P>0.05)。结论 红细胞内是贮存ACKR1结合趋化因子主要场所,在红细胞贮存期会发生红细胞ACKR1趋化因子清除功能的降低以及红细胞内部储存的某些ACKR1结合趋化因子的降低。 展开更多
关键词 非典型趋化因子受体1 趋化因子 红细胞
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