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我国研制出首款鸡55KSNP芯片
1
《现代畜牧兽医》 2017年第4期63-63,共1页
近日，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所鸡遗传育种团队，在对中外鸡种全基因组重测序的基础上，整合对重要经济性状功能基因的显著位点，开展了自主芯片设计，研制出我国首款鸡55KSNP芯片。
关键词 鸡 55ksnp芯片 中国 饲养业
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基于小麦55K SNP芯片检测小麦穗长和株高性状QTL 被引量：21
2
作者 李聪 马建 +5 位作者 刘航 丁浦洋 杨聪聪 张涵 秦娜娜 兰秀锦 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期1284-1292,共9页
为了进一步挖掘小麦穗长和株高的QTL位点,将小麦品系‘20828’和国审小麦品种川农16杂交后得到的重组自交系群体(RIL)于2016-2018年种植在四川崇州、温江和雅安以及孟加拉国库尔纳市,进行穗长和株高的遗传分析。结果表明,在RIL群体内,... 为了进一步挖掘小麦穗长和株高的QTL位点,将小麦品系‘20828’和国审小麦品种川农16杂交后得到的重组自交系群体(RIL)于2016-2018年种植在四川崇州、温江和雅安以及孟加拉国库尔纳市,进行穗长和株高的遗传分析。结果表明,在RIL群体内,穗长和株高均呈正态分布,符合数量性状遗传特点。在3年8个环境中共检测出44个控制穗长和株高的QTL,其中稳定的穗长QTL有5个,分布于2D、4B和5B染色体上,贡献率为2.90%~26.26%;控制株高的稳定QTL有3个,分布于2D、4B和4D染色体上,贡献率为1.96%~21.22%。在2D染色体AX-86171316~AX-109422526标记区间和4B染色体AX-109526283~AX-110549715标记区间均同时检测到了控制穗长和株高的QTL,推测为一因多效位点。QSl.sau.2D.1、QSl.sau.2D.2、QSl.sau.4B.1、QSl.sau.4B.2、QSl.sau.5B、QPh.sau.2D和QPh.sau.4B可能为新的稳定QTL。本研究鉴定的这些位点对增加穗长、降低株高以及提高小麦的产量具有重要作用。 展开更多
关键词 普通小麦 穗长 株高 QTL 小麦55ksnp芯片
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青海省小麦品种基于55K SNP芯片的遗传多样性分析 被引量：7
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作者 谢静敏 侯万伟 张小娟 《麦类作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第11期1343-1350,共8页
为研究青海省小麦品种之间的遗传关系和遗传多样性,选取93个青海小麦品种,基于55K SNP芯片对其进行全基因组扫描,并进行遗传多样性分析。结果共扫描到53063个SNP位点,选择分型成功率(call rate,CR)≥0.90、缺失率<10%、MAF>0.05的... 为研究青海省小麦品种之间的遗传关系和遗传多样性,选取93个青海小麦品种,基于55K SNP芯片对其进行全基因组扫描,并进行遗传多样性分析。结果共扫描到53063个SNP位点,选择分型成功率(call rate,CR)≥0.90、缺失率<10%、MAF>0.05的SNP位点,获得多态性SNP位点50243个,多态性比率为94.68%。其中多态性位点在第2同源群中分布最多,在第4同源群中分布最少,在基因组中分布呈现B>A>D,特别是4D染色体上的多态性SNP分布最少。93个小麦品种的多态性信息含量(PIC)为0.00~0.59,平均值为0.33,为中度多态性位点;两两品种间的遗传距离为0.00~0.67,平均值为0.41。通过聚类分析表明,根据遗传距离可将93个小麦品种划分为8个类群。综上,青海省现有小麦品种的遗传关系较近,需要引进外来品种来丰富青海省小麦品种的遗传多样性,推动小麦品种的选育及研究工作。 展开更多
关键词 青海省 小麦 55ksnp 遗传多样性
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我国研制出新款猪55K SNP芯片
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《现代畜牧兽医》 2017年第6期63-63,共1页
由中国农业大学动物科技学院刘剑锋教授团队设计研制的新款猪55KSNP芯片已于4月底投入生产。该款芯片是在中外猪种全基因组重测序、多组织转录组和蛋白组图谱构建的基础上,整合现有重要经济功能基因的公开报道的候选位点,并加入72个我... 由中国农业大学动物科技学院刘剑锋教授团队设计研制的新款猪55KSNP芯片已于4月底投入生产。该款芯片是在中外猪种全基因组重测序、多组织转录组和蛋白组图谱构建的基础上,整合现有重要经济功能基因的公开报道的候选位点,并加入72个我国部分地方猪种特有SNP,综合优化研制而成（命名为55KCAU-Porcine）。 展开更多
关键词 新闻通讯 期刊 编辑工作 畜牧 兽医 猪55ksnp芯片
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