水芹4CL基因家族鉴定及高温干旱胁迫下的表达分析 被引量：1

1

作者 徐文娟 花立群 +4 位作者 付丹萍 章亮 薛静晗 白龙飞 甘德芳 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第7期143-156,共14页

【目的】了解水芹Oja4CLs基因家族成员的特性以及在高温、干旱胁迫下的表达情况,为水芹Oja4CLs基因家族成员的功能研究提供理论依据。【方法】以拟南芥4CL保守序列搜索溧阳白芹基因组数据库,并对水芹4CL家族成员编码蛋白的理化性质及家... 【目的】了解水芹Oja4CLs基因家族成员的特性以及在高温、干旱胁迫下的表达情况,为水芹Oja4CLs基因家族成员的功能研究提供理论依据。【方法】以拟南芥4CL保守序列搜索溧阳白芹基因组数据库,并对水芹4CL家族成员编码蛋白的理化性质及家族成员结构域和保守基序进行分析;同时研究高温、干旱胁迫对水芹Oja4CLs基因表达的影响。【结果】在溧阳白芹基因组数据库中共鉴定得到77个水芹4CL家族成员,命名为Oja4CL01~Oja4CL77,其氨基酸残基数在249~2318,分子质量为27.61~257.47 kD;等电点在5.17~8.82,二级结构α-螺旋占比26.54%~46.78%,β转角占比4.40%~10.61%,延伸链占比15.16%~25.33%,无规则卷曲占比29.53%~46.72%。亚细胞定位结果显示,25个Oja4CLs蛋白定位于细胞质,19个Oja4CLs蛋白定位于叶绿体,15个Oja4CLs蛋白定位于细胞质膜,12个Oja4CLs蛋白定位于原生质体,3个Oja4CLs蛋白定位于胞外,2个Oja4CLs蛋白定位于内质网,1个Oja4CLs蛋白定位于细胞核。水芹Oja4CLs基因对高温、干旱呈现不同的响应,定植后7 d(幼苗期),Oja4CL01、Oja4CL15、Oja4CL39、Oja4CL59在高温、干旱胁迫下大量表达;定植后28 d(成株期),Oja4CL59和Oja4CL70在高温、干旱胁迫下大量表达;定植后56 d(开花期),Oja4CL15和Oja4CL59在高温、干旱胁迫下大量表达。【结论】77个水芹4CL基因家族成员分为6个亚家族,大部分Oja4CLs都呈现较高表达,幼苗期水芹对高温、干旱比较敏感,高表达4CL基因以响应高温干旱。 展开更多

关键词 水芹(Oenanthe javanica) 4cl基因家族 生物信息学分析 高温干旱胁迫

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‘皇冠’李果实空腔褐变与木质素积累的关系及其4CL基因家族鉴定 被引量：1

2

作者 李建昆 彭超 +8 位作者 张子扬 梁茜 魏鸣康 杨强 李斌奇 Muhammad Moaaz Ali Viola Kayima 陈发兴 邓红红 《中国农业科学》 北大核心 2025年第4期759-778,共20页

【目的】明确柰李果实空腔褐变的发生规律,探索柰李果实空腔褐变与木质素积累的关系;并进行木质素生物合成途径的关键基因4CL基因家族鉴定与分析,为后续研究柰李果实空腔褐变的调控、防治和分子机制奠定基础。【方法】以‘皇冠’李盛花... 【目的】明确柰李果实空腔褐变的发生规律,探索柰李果实空腔褐变与木质素积累的关系;并进行木质素生物合成途径的关键基因4CL基因家族鉴定与分析,为后续研究柰李果实空腔褐变的调控、防治和分子机制奠定基础。【方法】以‘皇冠’李盛花后10、25、40、55、70和85 d的果实为试材,研究果实空腔褐变的发生规律。采用石蜡切片观察组织结构变化,气相色谱-质谱联用(gas chromatography-mass spectrometry)技术明确木质素单体类型,紫外分光光度计测定木质素含量和木质素生物合成相关酶活性,qRT-PCR技术分析基因表达。结合NCBI、TBtools、MEME、MEGA11、SOPMA、SWISS-MODEL和PlantCARE等软件进行4CL基因家族的鉴定与分析。【结果】‘皇冠’李果实空腔始于转色期,成熟期空腔褐变率达到37.73%,转色期和成熟期空腔褐变果的果形指数显著高于非空腔褐变果。石蜡切片结果显示,空腔褐变部位的果肉被番红溶液染成红色,空腔褐变面积随果实发育增大。果肉木质素总量随果实发育逐渐增加,空腔褐变果的木质素总量极显著高于非空腔褐变果(P<0.001)。空腔褐变果的木质素单体主要包括愈创木基丙烷(22.6%)和紫丁香基丙烷(10.8%)。果实发育期,空腔褐变果的4CL和PAL酶活性均显著高于非空腔褐变果。空腔褐变果的8个Ps4CL表达均高于非空腔褐变果,2个PsPAL在空腔和非空腔褐变果的表达趋势基本一致,转色期空腔褐变果的PsPAL表达略高于非空腔褐变果。Ps4CL1、Ps4CL2、Ps4CL7和Ps4CL8可能参与李果肉木质素生物合成,Ps4CL基因家族均含内源激素类响应元件。共线性分析显示,李与拟南芥存在2对4CL同源基因,与桃有8对4CL同源基因。通过构建互作网络,鉴定到核心枢纽基因Ps4CL5、Ps4CL7和Ps4CL8,都分别至少有30个共表达基因。qRT-PCR结果表明,Ps4CL基因表达呈现组织特异性和时空特异性。【结论】‘皇冠’李果实空腔褐变发生的关键时期为转色期,明确了木质素总含量和单体类型、木质素生物合成相关酶活性及关键基因表达的变化,WGCNA鉴定到关键基因参与木质素生物合成途径。 展开更多

关键词 柰李 果实空腔褐变 木质素生物合成 酶活性 4cl基因家族

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枸杞果实发育期4CL活性和基因表达

3

作者 张凯敏 耿贵工 乔枫 《分子植物育种》 北大核心 2025年第4期1295-1304,共10页

本研究旨在探究枸杞果实发育期4-香豆酸:辅酶A连接酶(4CL)的活性、4CL基因相对表达量及类黄酮含量之间的关系。采用试剂盒测定枸杞果实5个发育时期(青果期,绿果期,变色期,黄熟期,红熟期)(M1~M5)的4CL酶活性,利用RT-qPCR方法测定了4CL基... 本研究旨在探究枸杞果实发育期4-香豆酸:辅酶A连接酶(4CL)的活性、4CL基因相对表达量及类黄酮含量之间的关系。采用试剂盒测定枸杞果实5个发育时期(青果期,绿果期,变色期,黄熟期,红熟期)(M1~M5)的4CL酶活性,利用RT-qPCR方法测定了4CL基因的相对表达量,克隆了枸杞4CL基因(GenBank登录号:MW981504),并利用基因原核系统表达了该目的基因。结果显示:在枸杞果实发育期M1~M5,4CL酶活性和类黄酮含量都呈先下降后上升趋势,在变色期(M3)4CL酶活性和类黄酮含量最低。枸杞4CL基因的全长cDNA序列长度为2171 bp,ORF为1716 bp,编码571个氨基酸。通过BLAST对比分析,该基因编码的氨基酸与番茄等茄科植物亲缘关系最近。枸杞4CL酶活性、类黄酮含量、4CL基因表达之间呈显著性相关关系(P<0.05)。通过构建原核表达载体对枸杞4CL基因进行原核表达分析与优化,发现加入IPTG后均可诱导枸杞4CL蛋白的表达,且随着培养温度的升高,蛋白表达量逐渐增加。结果表明:可通过调节枸杞4CL活性及4CL基因表达量,进而调控类黄酮的积累。 展开更多

关键词 枸杞果实 4cl 基因表达 基因克隆 类黄酮含量

原文传递

花生4CL基因家族鉴定及对干旱与盐胁迫响应分析

4

作者 张泽 杨秀丽 宁东贤 《生物技术通报》 北大核心 2025年第7期117-127,共11页

【目的】分析花生4-香豆酸:CoA连接酶(4-coumarate:CoA ligase,4CL)基因家族成员基本特性及其对干旱和盐胁迫的响应,为培育花生耐旱抗盐品种提供重要的目标基因。【方法】通过HMM文件及NCBI CDD和Pfam数据库在全基因组水平鉴定花生4CL... 【目的】分析花生4-香豆酸:CoA连接酶(4-coumarate:CoA ligase,4CL)基因家族成员基本特性及其对干旱和盐胁迫的响应,为培育花生耐旱抗盐品种提供重要的目标基因。【方法】通过HMM文件及NCBI CDD和Pfam数据库在全基因组水平鉴定花生4CL基因家族成员;利用ExPASy-ProtParam工具进行蛋白理化性质分析;通过MEGA7及itol工具进行系统进化分析;通过MEME及NCBI中的CD-search工具进行蛋白保守基序和保守结构域分析;通过PlantCARE及TBtools进行启动子元件分析及可视化;通过RNA-seq数据及RT-qPCR分析花生4CLs转录水平变化。【结果】借助花生Tifrunner基因组参考数据,鉴定到56个花生4CL基因,氨基酸长度介于239-1208之间,pI介于5.5-9.22之间,蛋白脂肪系数介于80.2-103.13之间,不稳定性指数在25.51-48.79之间,GRAVY值在-0.367-0.139之间;花生A与B基因组的20条染色体上,Ah4CLs基因不均匀地分布,5和15号染色体Ah4CLs基因密度最高;同一个聚类分支,Ah4CLs具有相似的保守基序组成及相似的内含子-外显子分布结构,外显子数量在1-18之间;Ah4CLs启动子区域富含光、非生物胁迫、激素及生长发育响应元件;Ah4CLs表达具有组织特异性,在根、花及种子中表达量较高;在ABA、盐与干旱胁迫处理下,部分Ah4CLs转录水平显著增加,特别是Ah4CL28在ABA、干旱及盐处理下均明显转录上调,这些基因在花生应对非生物胁迫中可能发挥着重要作用。【结论】鉴定到的56个花生4CL基因家族成员有不同结构与特性,在部分基序及结构域上具有保守型,Ah4CLs在影响花生生长发育的同时,还参与非生物胁迫响应。 展开更多

关键词 花生 4cl基因 基因家族 进化分析 共线性分析 启动子分析 干旱胁迫 盐胁迫

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慈竹4CL基因的克隆及其生物信息学分析 被引量：22

5

作者 胡尚连 曹颖 +3 位作者 黄胜雄 孙霞 卢学琴 蒋瑶 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2009年第8期204-210,共7页

【目的】克隆慈竹木质素生物合成酶4CL基因,研究其序列特征,为今后利用该基因调控慈竹木质素的生物合成研究奠定基础。【方法】参照其他物种4CL基因保守区,设计简并引物,以慈竹幼笋cDNA为模板,克隆到1条750 bp的4CL基因保守区片段。以... 【目的】克隆慈竹木质素生物合成酶4CL基因,研究其序列特征,为今后利用该基因调控慈竹木质素的生物合成研究奠定基础。【方法】参照其他物种4CL基因保守区,设计简并引物,以慈竹幼笋cDNA为模板,克隆到1条750 bp的4CL基因保守区片段。以这条保守区片段为模板,结合5′RACE和3′RACE克隆4CL基因全长序列,并对其进行了生物信息学分析。【结果】成功克隆了慈竹4CL基因全序列,该序列CDS区全长为1 674 bp,编码558个氨基酸;氨基酸序列中存在两大4CL氨基酸保守域(SSGTTGMPKGV和GEICIRG),其中前一个氨基酸保守域的第7个氨基酸位点变为M,与常见的L不同,表明慈竹的4CL基因发生了一定变异。系统进化分析表明,该基因(Na4CL)与水稻的Os4CL4和黑麦草的Lp4CL2具有很高的同源性。【结论】克隆了慈竹木质素合成酶4CL基因全长序列,在GenBank上注册为EU327341,可能与慈竹木质素生物合成有关。 展开更多

关键词 慈竹 4cl基因 克隆 生物信息学分析

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亚麻4CL基因克隆及RNAi遗传转化 被引量：9

6

作者 龙松华 李翔 +6 位作者 陈信波 乔瑞清 邓欣 邱财生 郭媛 郝冬梅 王玉富 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第12期2405-2411,共7页

该实验以前期克隆的亚麻4CL基因片段为靶序列,利用RACE方法克隆其全长cDNA序列(1 957bp),GenBank登录号为KC832864,该序列含有1 650bp完整的开放阅读框。系统进化树分析表明,亚麻4CL基因与盐芥4CL基因亲缘关系较近,而与禾本科的水稻(Ory... 该实验以前期克隆的亚麻4CL基因片段为靶序列,利用RACE方法克隆其全长cDNA序列(1 957bp),GenBank登录号为KC832864,该序列含有1 650bp完整的开放阅读框。系统进化树分析表明,亚麻4CL基因与盐芥4CL基因亲缘关系较近,而与禾本科的水稻(Oryza sativa)等亲缘关系最远。其编码蛋白预测分析结果显示,亚麻4CL基因由549个氨基酸组成,相对分子量为60kD,等电点为5.3,蛋白质二级结构以无规则卷曲比例最多,其次是α-螺旋。以亚麻4CL基因编码区413bp靶标序列作为干扰区段,扩增其正反向基因片段,构建植物干扰表达载体p1301M-4CL。通过农杆菌介导转入亚麻,DNA及RNA水平上分子检测发现,RNAi结构已经转入亚麻中,并显著降低了其4CL基因的表达量。 展开更多

关键词 亚麻 木质素 4cl基因 序列分析 RNAI载体 遗传转化

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木质素生物合成酶4CL基因的遗传进化分析 被引量：15

7

作者 黄胜雄 胡尚连 +3 位作者 孙霞 曹颖 卢学琴 蒋瑶 《西北农林科技大学学报（自然科学版）》 CSCD 北大核心 2008年第10期199-206,共8页

【目的】4CL是木质素生物合成途径中的关键合成酶,通过对4CL基因的遗传进化分析,为其研究和利用提供理论依据。【方法】利用生物信息学手段,对4CL基因完整cDNA和编码氨基酸序列进行数据挖掘,利用Mega软件、ExPASy的Prosite数据库、NCBI... 【目的】4CL是木质素生物合成途径中的关键合成酶,通过对4CL基因的遗传进化分析,为其研究和利用提供理论依据。【方法】利用生物信息学手段,对4CL基因完整cDNA和编码氨基酸序列进行数据挖掘,利用Mega软件、ExPASy的Prosite数据库、NCBI的Conserved Domains数据库,进行4CL基因核酸和蛋白质水平上的遗传进化分析。【结果】构建了4CL基因的系统发生树,揭示出植物中的4CL基因聚类与植物分类大体一致,主要以基因家族的形式存在,但基因家族中部分基因存在着结构和功能的分化,4CL基因中存在着GC含量偏高和偏低两大类基因。4CL基因编码的氨基酸序列保守区高度相似,但是在单、双子叶两大类植物之间,其氨基酸平均含量存在着较大差异。【结论】在植物的进化过程中,虽然4CL基因较保守,但部分4CL基因发生了分化,体现在基因的结构和功能方面,在4CL基因的研究中必须充分考虑到这种分化。 展开更多

关键词 木质素 4cl基因 遗传进化分析

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芒果4CL基因的克隆及其表达分析 被引量：11

8

作者 罗睿雄 赵志常 +2 位作者 高爱平 黄建峰 刘宽亮 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2016年第S1期57-62,共6页

4-香豆酸:辅酶A连接酶(4CL)是植物类黄酮类化合物和木质素等生物合成途径的一种关键酶,为了研究其在芒果果实中的作用机理,采用RACE方法,从芒果果实克隆得到了一个类黄酮合成相关的4CL基因。该基因全长c DNA序列为1 740 bp,开放阅读框为... 4-香豆酸:辅酶A连接酶(4CL)是植物类黄酮类化合物和木质素等生物合成途径的一种关键酶,为了研究其在芒果果实中的作用机理,采用RACE方法,从芒果果实克隆得到了一个类黄酮合成相关的4CL基因。该基因全长c DNA序列为1 740 bp,开放阅读框为1 653 bp,编码550个氨基酸,分子量为60.47 k Da,等电点为9.51。对基因组扩增得到了2 318 bp长度的片段分析发现,该基因含有5个内含子,分别在1 013~1 139 bp,1 330~1 415 bp,1 564~1 653 bp,1 722~1 802 bp,1 905~2 000 bp。通过在线软件对其二级结构和三级结构进行了预测,系统发育分析发现该基因编码的蛋白与水曲柳、菘蓝等植物具有较近的亲缘关系。对3种不同着色的芒果品种中的4CL基因的RTPCR进行分析发现:红色的贵妃品种中表达量较高,而绿色的桂七品种中表达量较低。研究表明4CL基因表达芒果果实着色具有密切的相关性。 展开更多

关键词 芒果 4cl 基因克隆

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东方山羊豆4香豆酸:辅酶A连接酶(4CL)基因的克隆和荧光定量表达分析 被引量：9

9

作者 杨冬梅 王学敏 +5 位作者 高洪文 Dzyubenko Nikolay Chapurin Vladimir 韩永增 宋清晓 董洁 《草地学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期533-538,共6页

东方山羊豆(Galega orientalisL.)是20世纪末引种到我国的牧草品种,为发掘其基因资源,本实验克隆出东方山羊豆4 CL基因,并深入研究4 CL基因对东方山羊豆抗逆性的影响,为今后东方山羊豆在我国的种植和应用奠定基础。结果表明:采用RACE技... 东方山羊豆(Galega orientalisL.)是20世纪末引种到我国的牧草品种,为发掘其基因资源,本实验克隆出东方山羊豆4 CL基因,并深入研究4 CL基因对东方山羊豆抗逆性的影响,为今后东方山羊豆在我国的种植和应用奠定基础。结果表明:采用RACE技术结合RT-PCR方法从东方山羊豆中获得一个编码4 CL基因的cDNA全长序列,命名为Go4 CL。该序列全长1916 bp,开放阅读框1653 bp,编码510个氨基酸。利用Real-Time PCR方法检测发现,Go4 CL基因在东方山羊豆的根中表达量最高,叶中表达量最少。在PEG、ABA、MeJA、SA胁迫处理下Go4 CL基因的表达量均有不同程度的上调,说明此基因在植物抵御干旱、病菌侵袭和机械损伤等胁迫过程中能够起到调控作用。 展开更多

关键词 东方山羊豆 4香豆:酸辅酸A连接酶 基因克隆 荧光定量PCR

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华南象草Pp4CL基因的克隆及其转基因烟草木质素含量分析 被引量：7

10

作者 钟天秀 李有涵 +4 位作者 李菲 彭小群 柯善文 陈曙 解新明 《西北植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第12期2355-2364,共10页

为探究华南象草(Pennisetum purpureumcv.Huanan)木质素合成关键酶基因的调控机制,通过同源克隆得到华南象草4-香豆酸:CoA连接酶基因(Pp4CL)的cDNA序列,长度为1 943bp,其中编码区序列1 662bp。Pp4CL蛋白由553个氨基酸组成,分子量为59.57... 为探究华南象草(Pennisetum purpureumcv.Huanan)木质素合成关键酶基因的调控机制,通过同源克隆得到华南象草4-香豆酸:CoA连接酶基因(Pp4CL)的cDNA序列,长度为1 943bp,其中编码区序列1 662bp。Pp4CL蛋白由553个氨基酸组成,分子量为59.57kD,等电点为5.2,属于疏水性蛋白。该蛋白含有AMP结合结构域,属于AFD ClassⅠ超家族。在系统进化分析中,Pp4CL与At4CL1、Os4CL1遗传距离最近,聚为一支。Pp4CL氨基酸序列具有SSGTGLPKGV和GEICIRG等2个保守基序,是典型的植物4CL。构建原核表达载体pGEX-4CL,得到约88kD的Pp4CL-GST融合蛋白,为Pp4CL酶活性测定及Western免疫印迹分析奠定了基础。同时构建植物表达载体pBA-4CL,并通过叶盘法对烟草进行了遗传转化,得到3个转基因阳性株系(OX-9、OX-7、OX-4),它们中叶柄木质素总含量分别比非转基因植株(对照)提高了10.0%、16.2%和94.6%,茎秆基部节木质素总含量分别比对照提高了0.9%、4.0%和13.5%。研究结果表明,Pp4CL蛋白与木质素合成有关,过表达Pp4CL基因能够显著提高植株木质素含量。该研究结果为华南象草木质素改良工作打下了基础,同时也为深入开展牧草分子育种提供了依据。 展开更多

关键词 华南象草 木质素 4cl基因 转基因烟草

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象草4CL基因片段的克隆及RNAi表达载体构建 被引量：10

11

作者 霍松 陈慧 +1 位作者 朱琼华 解新明 《草业学报》 CSCD 北大核心 2012年第1期296-301,共6页

象草是热带和亚热带地区广泛栽培的多年生资源植物。为探讨华南象草4-香豆酸:CoA连接酶(4CL)基因下调表达对木质素合成的影响,本研究设计1对特异引物,PCR扩增获得一段长为374bp的干扰片段。通过TO-PO克隆,将该片段克隆到载体pCR/GW/T... 象草是热带和亚热带地区广泛栽培的多年生资源植物。为探讨华南象草4-香豆酸:CoA连接酶(4CL)基因下调表达对木质素合成的影响,本研究设计1对特异引物,PCR扩增获得一段长为374bp的干扰片段。通过TO-PO克隆,将该片段克隆到载体pCR/GW/TOPO,构建了入门克隆载体pENTR-4CL;再经过LR反应使pE-NTR-4CL上的干扰片段进入目的载体pCB2004B上,形成表达载体pCB2004B-4CL,最后通过冻融法将其转入到根癌农杆菌EHA105中。菌液PCR结果表明RNAi质粒已成功转入农杆菌,为进一步利用RNAi技术研究4CL基因的功能奠定了基础。 展开更多

关键词 象草 GATEWAY技术 4cl基因 RNAI 载体构建

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毛白杨4CL基因启动子的克隆及初步功能分析 被引量：6

12

作者 邢智峰 张安世 +1 位作者 徐存栓 魏建华 《河南师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2007年第2期142-145,共4页

4CL(4-coumarate:CoA ligase,4-香豆酸:辅酶A连接酶)在植物木质素合成途径中催化羟基香豆酸生成羟基肉桂酰CoA,主要在木质部中表达,对植物木质素生物合成具重要调控作用.为研究4CL基因启动子在转基因植物中的表达特性,探索其在植物基因... 4CL(4-coumarate:CoA ligase,4-香豆酸:辅酶A连接酶)在植物木质素合成途径中催化羟基香豆酸生成羟基肉桂酰CoA,主要在木质部中表达,对植物木质素生物合成具重要调控作用.为研究4CL基因启动子在转基因植物中的表达特性,探索其在植物基因工程研究中的潜在应用价值,利用PCR方法从毛白杨基因组DNA中扩增得到了4CL启动子片段.序列分析表明与美洲山杨(P.tremuloids)的4CL启动子同源性为95%.采用生物信息学方法对该序列进行分析.与GUS基因融合构建双元表达载体,转化烟草的瞬时表达检测可见明显GUS活性. 展开更多

关键词 毛白杨 4cl基因启动子 GUS基因

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长白落叶松4CL基因单核苷酸多态性及其与木材材性的关联分析 被引量：3

13

作者 王艳红 贾庆斌 +1 位作者 张磊 张含国 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2016年第2期242-251,共10页

为探讨长白落叶松4CL基因多态性与木材材性及生长性状的关系,本研究以10个种源的长白落叶松为实验材料,采用直接测序方法开展4CL基因多态性检测,共检测到64个SNPs,SNP频率为1/31 bp,多样性指数πT值为0.015 77,θW值为0.008 78。同义突... 为探讨长白落叶松4CL基因多态性与木材材性及生长性状的关系,本研究以10个种源的长白落叶松为实验材料,采用直接测序方法开展4CL基因多态性检测,共检测到64个SNPs,SNP频率为1/31 bp,多样性指数πT值为0.015 77,θW值为0.008 78。同义突变核苷酸多样性（πsyn=0.022 56）是非同义突变核苷酸多样性（πnonsyn=0.015 75）的1.4倍,推测长白落叶松4CL基因编码区在长白落叶松物种演化过程中受到纯化选择压力的作用。对频率大于10%的27个常见SNP的单位点和单倍型分别于长白落叶松木材材性和生长性状进行关联分析,检测到7个SNPs和6个单倍型的与木材材性和生长性状显著关联,表型贡献率为0.09%2.08%。研究结果为基于分子标记的长白落叶松优良木材品质及生长性状定向辅助育种提供理论依据。 展开更多

关键词 长白落叶松 木质素 4cl基因 SNPS 单倍型

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长白落叶松群体4CL基因单核苷酸多态性分析 被引量：3

14

作者 徐悦丽 张含国 +4 位作者 施天元 姚宇 张磊 王艳红 刘灵 《植物研究》 CAS CSCD 北大核心 2013年第2期208-213,共6页

以黑龙江省林口县青山林场21年生长白落叶松(Larix olgensis Henry)异地保存种为材料,利用SNP标记方法和DNAMAN软件分析白刀山种源子代林的单核甘酸多态性情况。从分子水平证明长白落叶松具有丰富的遗传多样性,用4CL-A引物检测到178个SN... 以黑龙江省林口县青山林场21年生长白落叶松(Larix olgensis Henry)异地保存种为材料,利用SNP标记方法和DNAMAN软件分析白刀山种源子代林的单核甘酸多态性情况。从分子水平证明长白落叶松具有丰富的遗传多样性,用4CL-A引物检测到178个SNP多态位点。共测序240条EST序列,测序成功193条,测序成功率为80.42%。本研究178个SNP变异中,有126个属于转换类型,占总变异的70.79%;有52个属于颠换类型,占总变异的29.21%,变异类型符合,转换∶颠换=7∶3。在转换类型中,A/G和C/T转换分别占37.08%和33.71%;颠换类型中G/C、A/C、A/T、和G/T分别在占7.87%、8.99%、7.87%和4.99%。但每个家系内的转换和颠换的比例相差较大,没有规律。转换和颠换的比例最大的是554号家系,其比值为7∶1,最小的家系是855号家系,其比值为3∶4。 展开更多

关键词 长白落叶松 家系 单核甘酸多态性 4cl基因

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无核小枣木质素合成基因Zj4CL的克隆和表达分析 被引量：6

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作者 裴艳梅 王金鑫 彭建营 《植物遗传资源学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期147-152,161,共7页

为研究无核小枣果实无核形成机理,应用RT-PCR扩增技术首次从无核小枣果实中克隆得到4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL,4-Coumarate:Coenzyme A Ligase)基因,该序列长度1819 bp,包含1776 bp的完整开放阅读框,编码591个氨基酸,命名为Zj4CL(登陆号K... 为研究无核小枣果实无核形成机理,应用RT-PCR扩增技术首次从无核小枣果实中克隆得到4-香豆酸辅酶A连接酶(4CL,4-Coumarate:Coenzyme A Ligase)基因,该序列长度1819 bp,包含1776 bp的完整开放阅读框,编码591个氨基酸,命名为Zj4CL(登陆号KP279930)。Zj4CL与基因组序列比对发现,该基因组含有5个外显子,4个内含子。序列比对和结构域分析表明,Zj4CL包含4CL基因家族的Box I和Box II保守区。进化树分析显示,Zj4CL与苹果(XP_008362825)的亲缘关系最近。实时荧光定量PCR分析表明,无核小枣在花后30 d左右基因表达量达到最大值,到花后40 d以后表达量明显下降。 展开更多

关键词 无核小枣 木质素 4cl基因 基因克隆 实时荧光定量PCR

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尾叶桉U6 4CL基因cDNA克隆及反义表达载体的构建 被引量：3

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作者 孔华 郭安平 +2 位作者 郭运玲 刘恩平 贺立卡 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2008年第20期8466-8469,共4页

[目的]为了获得桉树4-香豆酸:辅酶A连接酶(4CL)基因,构建植物反义表达载体,研究4CL基因对木质素的调控机理。[方法]从尾叶桉U6幼茎组织中提取总RNA,经RT-PCR扩增得到1.4 kb cDNA片段,将其克隆到质粒载体pGEM-T Easy。[结果]测序结果表明... [目的]为了获得桉树4-香豆酸:辅酶A连接酶(4CL)基因,构建植物反义表达载体,研究4CL基因对木质素的调控机理。[方法]从尾叶桉U6幼茎组织中提取总RNA,经RT-PCR扩增得到1.4 kb cDNA片段,将其克隆到质粒载体pGEM-T Easy。[结果]测序结果表明,该基因1413 bp,编码471个氨基酸。克隆片段经双酶切消化,反向插入到植物表达载体pBI121上,构建成4CL反义基因表达载体。通过冻融法将携带反义cDNA的植物表达载体质粒导转入根癌农杆菌EHA105,得到完整的Ti质粒表达载体系统。[结论]为该基因转化桉树的主栽品种尾叶桉U6以降低其木质素含量奠定了基础。 展开更多

关键词 尾叶桉 4cl基因 反义表达载体

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毛白杨4CL-like基因的克隆与原核表达分析 被引量：2

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作者 曹山 饶国栋 +2 位作者 魏弘宜 蒋湘宁 陆海 《广东农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第9期140-142,145,共4页

为得到毛白杨4CL-like基因并对其原核表达特性进行分析,利用毛白杨叶片的总RNA反转录得到的总cDNA为模板,利用PCR技术克隆得到毛白杨4CL-like基因(登录号:XP_002315339.1)。利用MEGA软件对4CL-like基因及其他9个来自不同物种的4CL基因... 为得到毛白杨4CL-like基因并对其原核表达特性进行分析,利用毛白杨叶片的总RNA反转录得到的总cDNA为模板,利用PCR技术克隆得到毛白杨4CL-like基因(登录号:XP_002315339.1)。利用MEGA软件对4CL-like基因及其他9个来自不同物种的4CL基因进行进化树分析。最后通过构建pET30-4CL-like原核表达载体对该基因进行原核表达分析。结果显示,克隆得到的4CL-like基因CDS区全长为1 758 bp,编码585个氨基酸。系统进化分析表明,该基因与葡萄中的4CL-like5有很高的同源性。另外,SDS-PAGE分析表明,4CL-like基因在大肠杆菌BL21中成功表达,所表达融合蛋白的分子量约为60 ku。 展开更多

关键词 毛白杨 4cl-like基因 克隆 原核表达

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香鳞毛蕨4CL基因密码子使用特性及表达预测分析 被引量：2

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作者 李珊珊 陈玲玲 +2 位作者 王鹤萌 胡宝忠 常缨 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2016年第10期1753-1761,共9页

目的研究蕨类植物中4CL基因的表达与分析,为蕨类植物次级代谢产物的积累和调控奠定理论基础。方法运用CHIPS、CUSP和Codon W在线程序对自主克隆的香鳞毛蕨4CL基因(Df4CL)序列进行分析,并与大肠杆菌、酵母菌、拟南芥、烟草等基因进行比较... 目的研究蕨类植物中4CL基因的表达与分析,为蕨类植物次级代谢产物的积累和调控奠定理论基础。方法运用CHIPS、CUSP和Codon W在线程序对自主克隆的香鳞毛蕨4CL基因(Df4CL)序列进行分析,并与大肠杆菌、酵母菌、拟南芥、烟草等基因进行比较,对了解Df4CL基因密码子使用特性,为其选择合适的表达系统具有重要意义。结果 Df4CL基因对ATGC选择没有偏向性,并且与小立碗藓的密码子使用偏好性相一致。在密码子使用频率上,Df4CL基因与拟南芥的差异小于与烟草、大肠杆菌、酵母的差异;基于4CL基因的密码子使用偏性的系统聚类分析表明,香鳞毛蕨与小立碗藓、拟南芥聚为一类。结论预示Df4CL基因更适合在拟南芥中外源表达。 展开更多

关键词 香鳞毛蕨 4-香豆酸辅酶A连接酶 密码子使用特性 基因表达

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营养胁迫对拟南芥4CL基因表达的影响研究

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作者 向静 林建中 +2 位作者 赵小英 唐冬英 刘选明 《湖南大学学报（自然科学版）》 EI CAS CSCD 北大核心 2011年第3期73-76,共4页

将拟南芥分别播种在N,P,K,Ca,Mg,Fe和Sucrose营养元素缺乏的培养基上,在长日照(16 h光照/8 h黑暗)22℃条件下培养10 d,不同营养元素缺乏的培养基中的拟南芥幼苗表现出相应的的表型.通过GUS的组织化学染色和采用Q-PCR检测分析4CL1,4CL2,4... 将拟南芥分别播种在N,P,K,Ca,Mg,Fe和Sucrose营养元素缺乏的培养基上,在长日照(16 h光照/8 h黑暗)22℃条件下培养10 d,不同营养元素缺乏的培养基中的拟南芥幼苗表现出相应的的表型.通过GUS的组织化学染色和采用Q-PCR检测分析4CL1,4CL2,4CL3基因在不同营养元素缺乏植株中的表达差异,研究4CL对不同营养元素胁迫的响应.研究结果表明钾元素的缺乏对参与木质素和黄酮类合成相关的4CL基因有诱导作用. 展开更多

关键词 营养 胁迫 拟南芥 4cl基因

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