目的通过多数据库联合挖掘探索PTP4A3在肝细胞癌发生发展中的作用。方法基于Oncomine及癌症和肿瘤基因图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库联合数据分析PTP4A3在肝细胞癌组织和正常组织中的表达水平;通过Human Protein Atlas数据...目的通过多数据库联合挖掘探索PTP4A3在肝细胞癌发生发展中的作用。方法基于Oncomine及癌症和肿瘤基因图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库联合数据分析PTP4A3在肝细胞癌组织和正常组织中的表达水平;通过Human Protein Atlas数据库,进一步研究PTP4A3在肝细胞癌和正常组织中的表达;同时基于Kaplan-Meier Plotter数据库进一步分析PTP4A3表达水平与肝细胞癌预后的关系。结果基于Oncomine数据库分析PTP4A3在肝细胞癌中高表达的研究有1项,低表达的0项。涉及PTP4A3在肝细胞癌组织和正常组织中转录水平的5项研究中,共包括768个样本,与正常组织相比,PTP4A3在肝细胞癌组织中高表达(P=1.06×10^(-5))。基于TCGA数据库(正常组50例,肝细胞癌组371例),PTP4A3在肝细胞癌组织中显著高表达(P <0.0001)。在Human Protein Atlas数据库的免疫组织化学数据中,相对于正常肝组织,PTP4A3在肝细胞癌中显著高表达。Kaplan-Meier Plotter数据库(n=364)分析显示,PTP4A3的mRNA表达量与肝细胞癌患者总体生存率存在相关性,即高表达PTP4A3的患者总体生存率较低,预后较差(P=0.049)。结论数据库挖掘显示PTP4A3基因具有促进肝细胞癌发生发展的作用,是肝细胞癌的关键基因之一,为以PTP4A3作为肝细胞癌药物靶点研究和治疗提供基础。展开更多
1 PTP4A3基因的概述PTP4A3基因编码一种属于蛋白酪氨酸磷酸酶（protein tyrosine phosphatases,PTPs）家族的蛋白,其相对分子质量大约为22 k D[1]。目前发现编码促肝细胞再生磷酸酶（phosphatases of regenerating livers,PRL）家族的...1 PTP4A3基因的概述PTP4A3基因编码一种属于蛋白酪氨酸磷酸酶（protein tyrosine phosphatases,PTPs）家族的蛋白,其相对分子质量大约为22 k D[1]。目前发现编码促肝细胞再生磷酸酶（phosphatases of regenerating livers,PRL）家族的基因包括PTP4A1、PTP4A2和PTP4A3,它们分别位于染色体6q12、1q35.2和8q24.展开更多
Nr4a3(nuclear receptor subfamily 4 group a member 3)属于核受体亚家族成员,参与细胞增殖、细胞迁移和细胞凋亡的调控。据报道,Nr4a3在多种肿瘤组织中表达下调。为探索Nr4a3在乳腺癌发生、发展中的作用,本文利用公共数据库分析NR4A3...Nr4a3(nuclear receptor subfamily 4 group a member 3)属于核受体亚家族成员,参与细胞增殖、细胞迁移和细胞凋亡的调控。据报道,Nr4a3在多种肿瘤组织中表达下调。为探索Nr4a3在乳腺癌发生、发展中的作用,本文利用公共数据库分析NR4A3在乳腺癌组织中的表达以及与乳腺癌患者总生存率的关系。在4T1细胞系上敲除Nr4a3基因,通过流式细胞术等检测细胞凋亡、细胞周期;CCK-8与集落形成实验检测细胞活力;细胞划痕与侵袭检测细胞迁移与侵袭能力;通过q-PCR检测细胞周期和凋亡基因的表达水平。结果表明:Nr4a3在乳腺癌组织中表达水平显著下调;与乳腺癌患者的总生存率呈正相关关系;Nr4a3敲除后,细胞增殖增强,细胞凋亡减少及细胞迁移能力和侵袭能力增强。本研究揭示了Nr4a3在乳腺癌细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的潜在作用,可能成为乳腺癌潜在的治疗靶点。展开更多
文摘目的通过多数据库联合挖掘探索PTP4A3在肝细胞癌发生发展中的作用。方法基于Oncomine及癌症和肿瘤基因图谱(the Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库联合数据分析PTP4A3在肝细胞癌组织和正常组织中的表达水平;通过Human Protein Atlas数据库,进一步研究PTP4A3在肝细胞癌和正常组织中的表达;同时基于Kaplan-Meier Plotter数据库进一步分析PTP4A3表达水平与肝细胞癌预后的关系。结果基于Oncomine数据库分析PTP4A3在肝细胞癌中高表达的研究有1项,低表达的0项。涉及PTP4A3在肝细胞癌组织和正常组织中转录水平的5项研究中,共包括768个样本,与正常组织相比,PTP4A3在肝细胞癌组织中高表达(P=1.06×10^(-5))。基于TCGA数据库(正常组50例,肝细胞癌组371例),PTP4A3在肝细胞癌组织中显著高表达(P <0.0001)。在Human Protein Atlas数据库的免疫组织化学数据中,相对于正常肝组织,PTP4A3在肝细胞癌中显著高表达。Kaplan-Meier Plotter数据库(n=364)分析显示,PTP4A3的mRNA表达量与肝细胞癌患者总体生存率存在相关性,即高表达PTP4A3的患者总体生存率较低,预后较差(P=0.049)。结论数据库挖掘显示PTP4A3基因具有促进肝细胞癌发生发展的作用,是肝细胞癌的关键基因之一,为以PTP4A3作为肝细胞癌药物靶点研究和治疗提供基础。
文摘1 PTP4A3基因的概述PTP4A3基因编码一种属于蛋白酪氨酸磷酸酶（protein tyrosine phosphatases,PTPs）家族的蛋白,其相对分子质量大约为22 k D[1]。目前发现编码促肝细胞再生磷酸酶（phosphatases of regenerating livers,PRL）家族的基因包括PTP4A1、PTP4A2和PTP4A3,它们分别位于染色体6q12、1q35.2和8q24.
文摘Nr4a3(nuclear receptor subfamily 4 group a member 3)属于核受体亚家族成员,参与细胞增殖、细胞迁移和细胞凋亡的调控。据报道,Nr4a3在多种肿瘤组织中表达下调。为探索Nr4a3在乳腺癌发生、发展中的作用,本文利用公共数据库分析NR4A3在乳腺癌组织中的表达以及与乳腺癌患者总生存率的关系。在4T1细胞系上敲除Nr4a3基因,通过流式细胞术等检测细胞凋亡、细胞周期;CCK-8与集落形成实验检测细胞活力;细胞划痕与侵袭检测细胞迁移与侵袭能力;通过q-PCR检测细胞周期和凋亡基因的表达水平。结果表明:Nr4a3在乳腺癌组织中表达水平显著下调;与乳腺癌患者的总生存率呈正相关关系;Nr4a3敲除后,细胞增殖增强,细胞凋亡减少及细胞迁移能力和侵袭能力增强。本研究揭示了Nr4a3在乳腺癌细胞增殖、凋亡、迁移和侵袭的潜在作用,可能成为乳腺癌潜在的治疗靶点。
