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高精度R454B变频压缩机半经验模型开发
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作者 廖健生 王龙炎 +3 位作者 曹昊敏 陈栋宇 丁国良 郑立宇 《暖通空调》 2025年第4期22-29,13,共9页
R454B具有比R32更低的全球变暖潜能值(GWP),在空调器中的应用得到快速增长。R454B空调器的优化设计需要精度高、外推性好的压缩机模型,已有的经验模型和半经验模型均无法同时满足要求。本文提出了一种新的预测压缩机流量和功率的半经验... R454B具有比R32更低的全球变暖潜能值(GWP),在空调器中的应用得到快速增长。R454B空调器的优化设计需要精度高、外推性好的压缩机模型,已有的经验模型和半经验模型均无法同时满足要求。本文提出了一种新的预测压缩机流量和功率的半经验模型,其中流量模型通过将容积效率表示为蒸发压力和冷凝压力的线性函数,采用局部线性化的方式推导得出;功率模型通过将整体效率表示为多项式函数推导得出。对3台压缩机进行了实验测试并验证了模型精度,模型对于流量和功率的平均预测误差均在2%以内,在外推工况计算中,压缩机的流量和功率变化平滑,且未出现流量或功率为负值的不符合物理规律的错误。本文提出的压缩机半经验模型能够满足系统优化的需要。 展开更多
关键词 R454B 变频压缩机 半经验模型 精度 外推性
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LINC00667调节miR-454-3p/MAP3K9轴对鼻咽癌细胞恶性生物学行为的影响
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作者 吴华 孙永明 +3 位作者 蔡佳伟 赖世佳 蔡雪花 郑建华 《中国细胞生物学学报》 2025年第4期793-802,共10页
该研究探讨LINC00667调节mi R-454-3p/MAP3K9轴对鼻咽癌细胞恶性生物学行为的影响。该研究将鼻咽癌细胞HNE1分为control组、si-NC组、si-LINC00667组、mimic NC组、miR-454-3pmimic组、si-LINC00667+inhibitorNC组、si-LINC00667+miR-45... 该研究探讨LINC00667调节mi R-454-3p/MAP3K9轴对鼻咽癌细胞恶性生物学行为的影响。该研究将鼻咽癌细胞HNE1分为control组、si-NC组、si-LINC00667组、mimic NC组、miR-454-3pmimic组、si-LINC00667+inhibitorNC组、si-LINC00667+miR-454-3pinhibitor组。利用qRT-PCR检测LINC00667、miR-454-3p、MAP3K9 mRNA表达水平;MTT法检测细胞增殖情况;划痕实验检测细胞迁移情况;Transwell检测细胞侵袭情况;TUNEL染色检测细胞凋亡情况;Western blot法检测MAP3K9蛋白表达水平;双荧光素酶报告基因实验检测LINC00667与miR-454-3p以及miR-454-3p与MAP3K9的相互作用。结果得出,HNE1与人正常鼻咽上皮细胞相比,LINC00667、MAP3K9 mRNA表达水平升高, miR-454-3p表达水平降低(P<0.05)。与control组和si-NC组比较, siLINC00667组HNE1细胞中LINC00667表达水平、MAP3K9表达水平以及细胞增殖、迁移和侵袭能力降低, miR-454-3p表达水平和细胞凋亡率升高(P<0.05)。转染miR-454-3p mimic对HNE1细胞的影响与转染si-LINC00667类似。与si-LINC00667+inhibitor NC组相比, si-LINC00667+miR-454-3p inhibitor组HNE1细胞的增殖、迁移和侵袭能力升高, MAP3K9表达水平升高, miR-454-3p表达水平、细胞凋亡率降低(P<0.05);双荧光素酶报告基因实验显示, LINC00667与miR-454-3p、miR-454-3p与MAP3K9存在靶向关系。总结可得,干扰LINC00667可能通过上调miR-454-3p表达,抑制MAP3K9表达,进而抑制鼻咽癌细胞恶性生物学行为。 展开更多
关键词 LINC00667 miR-454-3p MAP3K9 鼻咽癌 恶性生物学行为
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R454B与R410a在单元式空调系统的对比研究
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作者 靳文睿 《家电维修》 2025年第11期3-6,共4页
作为R410A(GWP=2088)的环保替代制冷剂,本文对R454B应用于单元式空调系统进行系统性研究。通过物性分析、理论计算、部件实验及整机测试,结果表明:R454B凭借其更高的单位质量流量的制冷量以及在蒸发器中的优异表现,系统能效提升2.5%;然... 作为R410A(GWP=2088)的环保替代制冷剂,本文对R454B应用于单元式空调系统进行系统性研究。通过物性分析、理论计算、部件实验及整机测试,结果表明:R454B凭借其更高的单位质量流量的制冷量以及在蒸发器中的优异表现,系统能效提升2.5%;然而,由于低密度的特性,制冷能力相较R410a下降3%。此外,通过分析换热器性能差异与换热温差的关系,发现R454B的温度滑移特性是导致换热性能差距随风量增加而显著增大的关键因素。 展开更多
关键词 R454B R410A 能力下降 能效上升 温度滑移
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Long-period Double-lined Eclipsing Binaries:The System V454 Aur with the Secondary Eclipse Caused by the Occultation of the Hotter Component
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作者 Alexei Y.Kniazev Oleg Malkov +2 位作者 Stanislav Gorda Leonid N.Berdnikov Ivan Y.Katkov 《Research in Astronomy and Astrophysics》 2025年第2期239-253,共15页
We present the results of our study of the long-period eclipsing binary star V454 Aur.The results are based on spectroscopic data obtained with the UFESéchelle spectrograph and photometric observations from Trans... We present the results of our study of the long-period eclipsing binary star V454 Aur.The results are based on spectroscopic data obtained with the UFESéchelle spectrograph and photometric observations from Transiting Exoplanet Survey Satellite(TESS).The derived radial velocity curve is based on 17 spectra obtained between 2021and 2023,covering all orbital phases of this binary system.The orbital period determined from TESS data,P=27.019803±0.000003 days,agrees within uncertainties with the period established in previous studies.The model constructed for the TESS photometric light curve achieves a precision of 0.01%.The effective temperatures of both components,as well as the system metallicity,were directly derived from the spectra and are Teff,A=6250±50 K,Teff,B=5855±50 K,and[Fe/H]=-0.10±0.08,respectively.Our analysis of the photometric and spectroscopic data allowed us to directly compute the luminosities of the components,LA=1.82 L☉and LB=1.07 L☉,their radii,RA=1.15 R☉and RB=1.00 R☉,and their masses,MA=1.137 M☉and MB=1.023 M☉,with uncertainties below 1%.Comparison with evolutionary tracks indicates that the system’s age is 1.18±0.10 Gyr,and both components are still on the main sequence.The V454 Aur system is particularly interesting due to the partial eclipse of the primary component,which results in the“inversion”of the primary and secondary minima in the photometric light curve. 展开更多
关键词 stars:luminosity function mass function (stars:)binaries:spectroscopic stars:individual(V454 Aur)
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基于高通量测序454 GS FLX的丹参转录组学研究 被引量:91
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作者 李滢 孙超 +3 位作者 罗红梅 李西文 牛云云 陈士林 《药学学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期524-529,共6页
本研究应用新一代高通量测序技术454GS FLX Titanium对2年生丹参根的转录组进行测序,研究其基因表达谱,挖掘其功能基因。获得46722表达序列标签(express sequence tags,EST),序列平均长度414bp,与Sanger测序的长度相当。所得序列与GenB... 本研究应用新一代高通量测序技术454GS FLX Titanium对2年生丹参根的转录组进行测序,研究其基因表达谱,挖掘其功能基因。获得46722表达序列标签(express sequence tags,EST),序列平均长度414bp,与Sanger测序的长度相当。所得序列与GenBank丹参EST合并拼接,获得18235条unigene,其中,454高通量测序发现了13980条新的unigene。数据库中的序列同源性比较表明,其中73.0%(13308条)与其他生物的已知基因具有不同程度的同源性。通过BLAST与Gene Ontology分析获得了可能参与丹参酮合成的序列27条(编码15个关键酶),参与丹酚酸合成的序列29条(编码11个关键酶),细胞色素P450序列70条,转录因子序列577条。454高通量测序技术作为药用植物功能基因组研究的重要手段可在丹参功能基因的发现中发挥重要作用,这些基因的发现为丹参酮和丹酚酸类化合物生物合成研究奠定了基础,同时也为丹参的转录组研究提供了基础数据。 展开更多
关键词 丹参 454GSFLX 表达序列标签 转录组
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基于454测序的油茶DNA序列微卫星观察与分析 被引量:23
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作者 温强 徐林初 +4 位作者 江香梅 李江 顾胤聪 徐立安 黄敏仁 《林业科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2013年第8期43-50,共8页
采用MISA软件挖掘比较各1/4个454高通量测序反应获得的普通油茶、浙江红山茶和短柱茶EST序列及普通油茶基因组序列中的微卫星信息。结果显示:3个种的EST序列微卫星出现频率大小相近,普通油茶EST序列的微卫星出现频率高于其基因组序列的... 采用MISA软件挖掘比较各1/4个454高通量测序反应获得的普通油茶、浙江红山茶和短柱茶EST序列及普通油茶基因组序列中的微卫星信息。结果显示:3个种的EST序列微卫星出现频率大小相近,普通油茶EST序列的微卫星出现频率高于其基因组序列的;在所有被检索序列的二至六碱基微卫星中,均以二碱基微卫星最多(>55%),并以(AG)n类型为主,但三碱基微卫星在所有EST序列中以(AAG)n类型最多,而在普通油茶基因组序列中则以(AAT)n最多;除六碱基微卫星外,二至五碱基微卫星均表现为不同微卫星重复单元的丰度随着微卫星碱基长度增加而减少。在转录组序列中,除六碱基微卫星之外,不同微卫星单元重复数的变异与重复单元长度呈负相关,推测二碱基微卫星理论多态性最高,而五碱基微卫星理论多态性最低;对在无冗余独立基因各区域中的微卫星进行统计,显示分布比例依次为3'UTR>CDS>5'UTR,在相同区域内比较,UTR区域中二碱基微卫星占总数量比例最大,CDS区域内三碱基微卫星的比例最高,此外5'UTR区域的三碱基微卫星的分布比例均高于3'UTR,初步推断5'UTR区域的微卫星相对3'UTR要保守些。 展开更多
关键词 山茶属 454高通量测序 微卫星
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应用454测序技术分析种植制度对黑垆土微生物多样性的影响 被引量:13
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作者 蔡艳 郝明德 +2 位作者 张丽琼 臧逸飞 何晓雁 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2015年第2期339-346,共8页
研究典型种植制度对旱地黑垆土微生物多样性的影响,对优化旱地作物种植制度、发挥土壤潜在肥力、实现土壤资源可持续利用有着重要的意义。通过27年长期定位试验,采用454测序技术分析了黄土高原旱作地区不同种植制度下黑垆土细菌、真菌... 研究典型种植制度对旱地黑垆土微生物多样性的影响,对优化旱地作物种植制度、发挥土壤潜在肥力、实现土壤资源可持续利用有着重要的意义。通过27年长期定位试验,采用454测序技术分析了黄土高原旱作地区不同种植制度下黑垆土细菌、真菌多样性的变化情况。结果表明,不施肥低营养胁迫下,细菌多样性表现为粮豆轮作>小麦连作>裸地>苜蓿连作,真菌多样性表现为小麦连作≈苜蓿连作>裸地>粮豆轮作。施氮、磷肥条件下,粮草长周期轮作(苜蓿→苜蓿→苜蓿→苜蓿→马铃薯→小麦→小麦→小麦+苜蓿)中土壤微生物多样性大致表现出先降低后增加的趋势,第4年苜蓿或苜蓿茬后第1年小麦微生物Chao指数和Shannon指数最低,苜蓿茬后第2年小麦微生物多样性最高,细菌Chao指数和真菌Shannon指数比连作小麦高22.0%和79.2%;粮草短周期轮作(红豆草→小麦→小麦+红豆草)中土壤微生物多样性大致呈现增加趋势,至红豆草茬后第2年小麦土壤微生物多样性达到最高,真菌Chao指数和Shannon指数均分别比连作小麦高50.8%和51.0%。黄土高原旱地区黑垆土采取粮食作物与豆科作物轮作可提高土壤微生物多样性。 展开更多
关键词 454测序 高通量测序 旱地土壤 微生物多样性 种植制度
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454测序技术开发微卫星标记的研究进展 被引量:18
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作者 程晓凤 黄福江 +1 位作者 刘明典 汪登强 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第8期82-90,共9页
第二代测序技术(454测序为例)已成为测定基因组序列的一种成熟技术。454测序亦可应用于目标DNA区域分析,因此可用作微卫星标记的开发。较传统方法而言,具有便捷、高效等特点。目前,运用454技术进行基因组测序或转录组测序开发微卫星标记... 第二代测序技术(454测序为例)已成为测定基因组序列的一种成熟技术。454测序亦可应用于目标DNA区域分析,因此可用作微卫星标记的开发。较传统方法而言,具有便捷、高效等特点。目前,运用454技术进行基因组测序或转录组测序开发微卫星标记,用以研究种群生态学、构建遗传图谱等得到越来越多的重视和应用。综述了454测序技术在开发微卫星标记上的应用,并根据其优缺点对其应用前景进行了展望,旨在为应用454测序开发微卫星提供参考。 展开更多
关键词 454测序 微卫星 基因组 转录组
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454测序技术在微生物生态学研究中的应用 被引量:23
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作者 段曌 肖炜 +2 位作者 王永霞 赖泳红 崔晓龙 《微生物学杂志》 CAS CSCD 2011年第5期76-81,共6页
以Sanger法(双脱氧核苷酸末端终止法)为代表的第1代测序技术由于其成本高、速度慢、通量低等不足,满足不了大规模测序的要求。进入21世纪后,以Roche 454为代表的第2代测序技术诞生了,454测序法作为一种高通量的测序方法,近年来已被广泛... 以Sanger法(双脱氧核苷酸末端终止法)为代表的第1代测序技术由于其成本高、速度慢、通量低等不足,满足不了大规模测序的要求。进入21世纪后,以Roche 454为代表的第2代测序技术诞生了,454测序法作为一种高通量的测序方法,近年来已被广泛应用于微生物生态学研究中。介绍了该测序技术的原理和操作步骤,结合本实验室的研究成果,对近年来运用454测序技术在微生物生态学研究中的进展进行综述,并对其研究前景进行介绍。 展开更多
关键词 454测序 高通量测序 微生物多样性 宏基因组
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运用454焦磷酸测序技术对断奶前后仔猪肠道菌群的分析 被引量:13
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作者 王一冰 张小平 +1 位作者 黄怡 李卫芬 《动物营养学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第10期2440-2446,共7页
本研究旨在运用454焦磷酸测序技术分析断奶前后仔猪肠道菌群的变化。随机选取胎次和出生时间相近的、体重差异不显著的健康"杜×长×大"外三元新生仔猪12头用于试验。整个试验期间由母猪按常规哺乳直到断奶(25日龄),... 本研究旨在运用454焦磷酸测序技术分析断奶前后仔猪肠道菌群的变化。随机选取胎次和出生时间相近的、体重差异不显著的健康"杜×长×大"外三元新生仔猪12头用于试验。整个试验期间由母猪按常规哺乳直到断奶(25日龄),母猪饲粮不含有抗生素,仔猪于12日龄开始饲喂教槽料。于25日龄(断奶前)和32日龄(断奶后)分别随机挑选3头仔猪进行心脏放血屠宰,无菌采集盲肠内容物,运用454焦磷酸测序技术分析断奶前后仔猪盲肠内容物中菌群结构的变化。结果表明:与断奶前仔猪相比,断奶后仔猪腹泻率显著增加(P<0.05);肠道中菌群多样性增加;肠道中拟杆菌门(Bacteroidetes)含量变化不显著(P>0.05),厚壁菌门(Firmicutes)含量显著增加了63.95%(P<0.05),梭杆菌门(Fusobacteria)和变形菌门(Proteobacteria)含量分别显著减少了100.00%和70.54%(P<0.05)。对厚壁菌门含量进行深入分析发现,在纲的水平,与断奶前仔猪相比,断奶后仔猪肠道中梭菌纲(Clostridia)和芽孢杆菌纲(Bacilli)含量有减少的趋势(P>0.05),而Negativicutes纲、Erysipelotrichia纲和未知厚壁菌纲含量有增加的趋势(P>0.05)。从门到属的水平,断奶前后仔猪肠道菌群相对丰度不同,有些菌是断奶前仔猪肠道特有的,如嗜胆菌属(Bilophila)、具核梭杆菌属(Fusobacterium nucleatum)、黄杆菌属(Flavobacteriaceae)等,有些菌是断奶后仔猪肠道特有的,如费克蓝姆菌属(Facklamia)、八叠球菌属(Sarcina)等。由此可见,断奶后仔猪肠道菌群多样性和菌群结构发生了改变。 展开更多
关键词 断奶仔猪 肠道菌群 454焦磷酸测序
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不同施氮水平对固氮甘蔗品种RB_(72-454)的肥效响应 被引量:9
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作者 周正邦 龚德勇 +2 位作者 易代勇 刘凡值 谢惠珏 《贵州农业科学》 CAS 2006年第1期52-55,共4页
用RB72-454和F134(CK)2个甘蔗品种在坝地和坡地设置尿素施用量为每667m240 kg、20 kg、10 kg和不施尿素4种处理,经新植和宿根各1年试验,结果表明:3种施氮处理RB72-454产量构成因素比不施氮肥明显增加,但对施氮水平响应不敏感。20 kg/66... 用RB72-454和F134(CK)2个甘蔗品种在坝地和坡地设置尿素施用量为每667m240 kg、20 kg、10 kg和不施尿素4种处理,经新植和宿根各1年试验,结果表明:3种施氮处理RB72-454产量构成因素比不施氮肥明显增加,但对施氮水平响应不敏感。20 kg/667m2尿素处理RB72-454的产量、含糖量、产糖量坝地达8 686 kg/667m2、15.72%和1159 kg/667m2,比F134分别增长50.1%、1.49%(绝对值)和65.6%;坡地达6 982 kg/667m2、15.53%和927 kg/667m2,比F134分别增长71.7%、1.06%(绝对值)和85.4%,增产增糖效果极显著。 展开更多
关键词 甘蔗 RB72-454 固氮 氮肥敏感性 肥效响应 施氮水平 甘蔗品种 平响应 产量构成因素 肥效
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CVTree在454高通量测序分析菌群结构中的应用 被引量:10
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作者 华蔚颖 徐昭 +3 位作者 张梦晖 李旻 张晨虹 赵立平 《中国微生态学杂志》 CAS CSCD 2010年第4期312-316,共5页
目的探究将基于短串频度的CVTree方法用于反映菌群结构的16S rRNA基因的454高通量测序数据分析的可行性,为快速分析高通量菌群结构数据提供新的方法。方法对一个四世同堂的中国家庭7名成员肠道菌群和不同基因型及饮食类型的小鼠肠道菌群... 目的探究将基于短串频度的CVTree方法用于反映菌群结构的16S rRNA基因的454高通量测序数据分析的可行性,为快速分析高通量菌群结构数据提供新的方法。方法对一个四世同堂的中国家庭7名成员肠道菌群和不同基因型及饮食类型的小鼠肠道菌群用454高通量方法获得16S rRNA基因的V3区的测序数据,用CVTree的方法进行菌群结构的比较分析。结果通过选取合适的短串长度,CVTree的方法能准确检测到各样本间的聚类关系,其结果与之前文献报道的基于Unifrac算法的结果相一致。结论CVTree能快速、有效地处理16S rRNA基因的454高通量测序数据,实现对不同菌群结构相似性的比较分析。 展开更多
关键词 CVTree 454高通量测序 菌群结构
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基于454焦磷酸测序法的典型草原土壤真核生物多样性 被引量:10
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作者 井赵斌 程积民 +1 位作者 张宝泉 李红红 《草业科学》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期1690-1697,共8页
利用454焦磷酸测序法对黄土区不同封育时期典型草地土壤真核生物多样性进行了研究。结果表明,选择的V4区引物可以扩增出土壤真核生物中的微生物、动物和植物,其中真菌群落主要由子囊菌门(Ascomycota)、壶菌门(Chytridiomycota)、担子菌... 利用454焦磷酸测序法对黄土区不同封育时期典型草地土壤真核生物多样性进行了研究。结果表明,选择的V4区引物可以扩增出土壤真核生物中的微生物、动物和植物,其中真菌群落主要由子囊菌门(Ascomycota)、壶菌门(Chytridiomycota)、担子菌门(Basidiomycota)、绿藻门(Chlorophyta)、球囊菌门(Glomeromycota)和变形菌门(Proteobacteria)组成;动物群落区系主要包括脊椎动物门(Craniata)、节足动物门(Arthropoda)、线虫门(Nematoda)和环节动物门(Annelida);植物群落包括陆生植物(Embryophyta)和单子叶植物纲(百合纲)(Liliopsida)。在不同分类学水平,不同封育时期草地真菌群落组成具有各自的优势菌群;动物群落组成仅在种水平存在差异。草地管理实践中可以结合土壤微生物和土壤养分恢复时间的阈值对封育草地进行合理利用。454焦磷酸测序法可以用于土壤中未知动物、植物和微生物区系的研究。 展开更多
关键词 454焦磷酸测序 18SrRNA 真核生物 微生物 封育草地
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利用DGGE和454测序研究不同浙贝母种源对根际土壤真菌群落的影响 被引量:9
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作者 袁小凤 彭三妹 +1 位作者 王博林 丁志山 《中国中药杂志》 CAS CSCD 北大核心 2014年第22期4304-4310,共7页
探讨不同种源浙贝母根际真菌群落多样性差异,以了解浙贝母的土壤微生态机制。利用变性凝胶梯度电泳(DGGE)和454焦磷酸测序技术检测不同种源浙贝在同一块地种植其根际真菌的多样性及组成。DGGE结果表明,本地种源(宁波种)根际真菌Shannon... 探讨不同种源浙贝母根际真菌群落多样性差异,以了解浙贝母的土壤微生态机制。利用变性凝胶梯度电泳(DGGE)和454焦磷酸测序技术检测不同种源浙贝在同一块地种植其根际真菌的多样性及组成。DGGE结果表明,本地种源(宁波种)根际真菌Shannon指数高于南通和磐安种源。测序结果显示宁波产地的浙贝根际真菌主要由子囊菌、半知菌、接合菌以及一些未知真菌组成。其中,3个种源根际大部分真菌种类相同,但每个种源均有特异性真菌。454测序结果发现磐安本地种真菌多样性高于宁波和南通等外地种,与DGGE结果相同,这可能是本地种进化适应的结果。磐安实验地的根际土真菌包括Fungi_incertae_sedis,Ascomycota,Mucoromycotina,Basidiomycota,Chytridiomycota等10个门,其中前5门几乎占据了整个群落的90%,其真菌的种类和数量均超过宁波实验地,充分显示出产地的差异以及宏基因组测序的优越性。磐安种根际真菌隶属于10门29科28属159种,宁波种6门20科19属136种,南通种8门37科47属289种,非根际土则隶属于7门25科24属102种。其中Dothidea,Capnobotryella,Conidiobolus等属仅存在南通种,而Pyrenochaeta,Glomus,Pseudonectria等则只存于磐安种,暗示这些真菌的存在与浙贝母相关。种源和产地实验发现本地种的真菌多样性高于外地种,每个种源根际均有特异性真菌,说明根际真菌多样性及组成是由浙贝母种源和产区的土壤类型共同决定,而这些真菌等微生物通过与土壤-根际微生态系统的互作,反过来会进一步影响浙贝母的生长。 展开更多
关键词 种源 浙贝母 根际 真菌 变性凝胶梯度电泳 454焦磷酸测序
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基于454测序技术的青藏高原黄绿蜜环菌微卫星引物的开发 被引量:6
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作者 邢睿 高庆波 +5 位作者 张发起 李印虎 付鹏程 张金华 王久利 陈世龙 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第9期1045-1052,共8页
【目的】本研究利用454焦磷酸测序技术,对青藏高原黄绿蜜环菌(Armillaria luteo-virens)转录组进行测序,从获得的Expressed sequence tags(EST)序列中开发EST-SSR引物。【方法】利用高通量测序获得的EST序列设计微卫星引物,通过PCR扩增... 【目的】本研究利用454焦磷酸测序技术,对青藏高原黄绿蜜环菌(Armillaria luteo-virens)转录组进行测序,从获得的Expressed sequence tags(EST)序列中开发EST-SSR引物。【方法】利用高通量测序获得的EST序列设计微卫星引物,通过PCR扩增、琼脂糖凝胶电泳和毛细管电泳检测筛选出合格的微卫星引物。【结果】共得到了1997121条reads,总数据量超过80Mb,序列平均长度为449bp。对于所获得的reads进行拼接后得到了22236条非冗余的EST序列,其中含有2024条contigs(平均读长974bp)和20212条singletons(平均读长404bp)。在所有序列中共找到321条符合条件的含有SSR的序列,从中随机选择98对,成功开发出27对具有多态性条带的微卫星引物。利用采集自3个不同居群的66个个体对上述27对引物进行验证,有17对引物符合Hardy-Weinberg平衡且没有连锁不平衡现象。【结论】首次成功利用高通量测序技术开发的EST-SSR引物将会对今后黄绿蜜环菌遗传多样性的研究以及种质资源鉴定、遗传图谱构建等打下了坚实基础。 展开更多
关键词 454焦磷酸测序 黄绿蜜环菌 微卫星 遗传多样性 青藏高原
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基于454高通量测序的黄土高原不同乔木林土壤细菌群落特征 被引量:26
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作者 刘洋 曾全超 黄懿梅 《中国环境科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2016年第11期3487-3494,共8页
选取黄土高原不同乔木林(辽东栎,LDL;侧柏,CB;刺槐,CH;油松,YS)表层土壤为研究对象,利用第二代高通量测序技术罗氏454平台对其进行16SrRNA基因V1~V3可变区测序,通过分析其Alpha多样性、物种组成和丰度、群落结构,结合土壤的理化性质研... 选取黄土高原不同乔木林(辽东栎,LDL;侧柏,CB;刺槐,CH;油松,YS)表层土壤为研究对象,利用第二代高通量测序技术罗氏454平台对其进行16SrRNA基因V1~V3可变区测序,通过分析其Alpha多样性、物种组成和丰度、群落结构,结合土壤的理化性质研究其对细菌群落结构的影响.结果表明:所有土壤样品共检测到36个门,84个纲,187个目.不同乔木林土壤中优势菌来自变形菌门(Proteobacteria)、放线菌门(Actinobacteria)、酸杆菌门(Acidobacteria)、绿弯菌(Chloroflexi)和浮霉菌门(Planctomycetes),主要的优势菌纲为放线杆菌纲(Actinobacteria)、α-变形菌纲(Alphaproteobacteria)、酸杆菌(Acidobacteria)、β-变形菌纲(Betaproteobacteria)、浮霉菌纲(Planctomycetacia).不同乔木林土壤中绿弯菌门(Chloroflexi)与pH值呈极显著的正相关,总磷和蓝细菌(Cyanobacteria)呈极显著的正相关,微生物生物量碳与芽单胞菌门(Gemmatimonadetes)呈极显著的负相关,土壤总磷含量可能为CB样地区别于其他土样群落组成的主要因素.LDL样地细菌群落受环境影响较小. 展开更多
关键词 454高通量测序 子午岭 不同乔木林 土壤细菌 环境因子
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固氮甘蔗新品种RB72-454吨糖田土配套技术应用 被引量:4
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作者 周正邦 龚德勇 +2 位作者 易代勇 刘凡值 谢惠珏 《贵州农业科学》 CAS 2006年第6期84-85,88,共3页
用RB72-454和F134(CK)2个甘蔗品种,于2003~2005年在坝地和缓坡地进行吨糖田土试验示范,经新植和宿根研究结果表明:在用种量8 000芽/667m2、深沟双行种植、合理施肥和优化管理技术规范下,RB72-454坝地蔗糖分含量15.47%,产量8 616 kg/667... 用RB72-454和F134(CK)2个甘蔗品种,于2003~2005年在坝地和缓坡地进行吨糖田土试验示范,经新植和宿根研究结果表明:在用种量8 000芽/667m2、深沟双行种植、合理施肥和优化管理技术规范下,RB72-454坝地蔗糖分含量15.47%,产量8 616 kg/667m2,产糖量1 130 kg/667m2,比对照蔗糖分含量增长1.16个百分点,产量增加38.0%,单位面积产糖量增加49.1%;坡地蔗糖分含量15.56%,产量7 808 kg/667m2,产糖量1 030 kg/667m2,比对照蔗糖分含量增长1.16个百分点,产量增加37.5%,单位面积产糖量增加48.3%。RB72-454在坝地和坡地含糖量均达到1 t/667m2以上。 展开更多
关键词 甘蔗 RB72-454 栽培技术
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应用454测序技术评价非酒精性脂肪性肝病患者肠道菌群结构差异 被引量:8
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作者 沈峰 陈建能 +6 位作者 郑瑞丹 王晓颖 潘勤 陈光榆 章瑞南 徐雷鸣 范建高 《实用肝脏病杂志》 CAS 2015年第2期145-149,共5页
目的阐明非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)患者肠道菌群结构特征。方法采用454焦磷酸测序技术,对47例经"肝活检"确诊的NAFLD患者和34例健康人新鲜粪便样品16S DNA V3-V5可变区进行测序,通过序列比较及操作分类单元(OTU)划分评价肠道菌... 目的阐明非酒精性脂肪性肝病(NAFLD)患者肠道菌群结构特征。方法采用454焦磷酸测序技术,对47例经"肝活检"确诊的NAFLD患者和34例健康人新鲜粪便样品16S DNA V3-V5可变区进行测序,通过序列比较及操作分类单元(OTU)划分评价肠道菌群结构差异。结果 NAFLD患者OTUs为(88.32±28.27),显著低于健康人[(109.65±30.65),P〈0.01];在"门"水平,NAFLD患者厚壁菌门所占比例为(51.2±17.8)%,显著高于健康人的[(46.4±12.8)%,P=0.048],而拟杆菌门为(31.6±18.9)%,显著低于健康人的[(43.3±14.4)%,P〈0.001];在"纲"水平上,NAFLD组Erysipelotrichi纲占(3.2±5.1)%,显著高于健康人的[(1.0±1.2)%,P=0.009],而Bacteroidia纲占(31.0±18.8)%,显著低于对照组的[(42.3±14.0)%,P=0.004];在"属"水平上,NAFLD组乳球菌占(0.0038±0.0001)%,低于健康组的[(0.0145±0.001)%,P=0.003],普氏菌属也同样显著减少(P=0.022),而链球菌(Streptococcus)在NAFLD占(1.50±0.03)%,显著高于对照组的[(0.21±0.24)%,P=0.004]。结论 NAFLD患者肠道菌群多样性减少,存在构成显著异常,是致病因素抑或其后果仍有待于进一步研究。 展开更多
关键词 非酒精性脂肪性肝病 肠道菌群 454焦磷酸测序
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运用454焦磷酸测序技术对病原菌16S-rDNA的分析 被引量:5
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作者 林萍 周与华 +1 位作者 李擎天 郭晓奎 《检验医学》 CAS 北大核心 2011年第6期364-367,共4页
目的探讨运用测序技术鉴定临床感染标本中病原菌的应用价值。方法运用聚合酶链反应(PCR)扩增及454焦磷酸测序技术,对标本中病原菌16S-rDNA V3区进行多样性分析;并与细菌培养结果相比较。结果测序能检测出临床不宜培养的菌属,如支原体属... 目的探讨运用测序技术鉴定临床感染标本中病原菌的应用价值。方法运用聚合酶链反应(PCR)扩增及454焦磷酸测序技术,对标本中病原菌16S-rDNA V3区进行多样性分析;并与细菌培养结果相比较。结果测序能检测出临床不宜培养的菌属,如支原体属、嗜血杆菌属、莫拉菌属等;9种菌属为2种方法共同检测所得,7种菌属的P值均<0.05。结论 2种方法的检测敏感性差异有统计学意义;与细菌培养相结合是临床实践中的一种新的偿试。 展开更多
关键词 病原菌 16S—rDNA基因 454焦磷酸测序技术
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miR-454-3p靶向TCF-4对人肾癌细胞GRC-1增殖、凋亡和迁移的影响 被引量:3
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作者 肖飞 辛世永 +4 位作者 任小强 邵长帅 高中伟 张建国 郑伟 《临床与实验病理学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2019年第12期1437-1442,共6页
目的探讨miR-454-3p与TCF-4的靶向关系,以及对人肾癌细胞GRC-1增殖、凋亡和迁移的影响。方法miR-454-3p mimic和(或)pLV-TCF-4转染GRC-1细胞后,采用qRT-PCR法检测miR-454-3p和TCF-4 mRNA水平;Western blot法检测TCF-4蛋白的表达;双荧光... 目的探讨miR-454-3p与TCF-4的靶向关系,以及对人肾癌细胞GRC-1增殖、凋亡和迁移的影响。方法miR-454-3p mimic和(或)pLV-TCF-4转染GRC-1细胞后,采用qRT-PCR法检测miR-454-3p和TCF-4 mRNA水平;Western blot法检测TCF-4蛋白的表达;双荧光素酶报告实验验证miR-454-3p与TCF-4的靶向关系;MTT法检测细胞增殖情况;Hoechst染色检测细胞凋亡;划痕实验检测细胞迁移能力;体外侵袭实验检测细胞侵袭能力。结果miR-454-3p mimic抑制TCF-4 mRNA和蛋白的表达;pLV-TCF-4缓解miR-454-3p对TCF-4蛋白表达的抑制作用。miR-454-3p mimic与TCF-4野生型报告载体共转,荧光素酶活性降低;与TCF-4突变型报告载体共转后,荧光素酶活性无明显变化。与GRC-1组相比,miR-454-3p mimic转染到GRC-1细胞后,细胞增殖倍数明显降低(P<0.01),细胞凋亡率由(5.08±1.21)%增加到(23.12±1.82)%,伤口愈合率由(58.43±6.32)%降低到(32.15±5.16)%,侵袭细胞数目由113.54±9.27减少至51.21±6.03;共转染miR-454-3p mimic和pLV-TCF-4后,能够逆转上述改变。结论miR-454-3p可通过靶向TCF-4抑制人肾癌细胞GRC-1的增殖和迁移,诱导细胞凋亡。 展开更多
关键词 肾肿瘤 TCF-4 miR-454-3p 增殖 凋亡 迁移
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