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miR-574-3p、FAM3C在食管癌组织中的表达及其与患者临床病理特征的关系 被引量:1
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作者 杨志强 常国涛 +2 位作者 史文松 马晓斌 钱河 《现代肿瘤医学》 2025年第3期427-432,共6页
目的:探究微小RNA(miR)-574-3p、序列相似家族3成员C(family with sequence similarity 3 member C,FAM3C)在食管癌组织中的表达,并分析二者与患者临床病理特征的关系。方法:选取2018年5月至2020年5月于本院行手术治疗的90例食管癌患者... 目的:探究微小RNA(miR)-574-3p、序列相似家族3成员C(family with sequence similarity 3 member C,FAM3C)在食管癌组织中的表达,并分析二者与患者临床病理特征的关系。方法:选取2018年5月至2020年5月于本院行手术治疗的90例食管癌患者,收集术中留取的癌组织和癌旁组织标本。使用qRT-PCR法检测组织中miR-574-3p、FAM3C mRNA相对表达量;使用免疫组织化学法检测组织中FAM3C蛋白表达情况;采用Spearman等级相关分析食管癌组织中miR-574-3p、FAM3C的相关性;Kaplan-Meier法分析miR-574-3p、FAM3C与预后的关系。结果:食管癌患者癌组织中miR-574-3p低表达,FAM3C mRNA、FAM3C蛋白高表达(P<0.05)。食管癌组织中miR-574-3p、FAM3C蛋白表达水平具有负相关性(r=-0.420,P<0.05)。Pearson相关性分析显示,食管癌组织中miR-574-3p、FAM3C mRNA表达具有负相关性(r=-0.731,P<0.05)。miR-574-3p、FAM3C蛋白均与TNM分期、浸润程度、淋巴结转移有关(P<0.05)。miR-574-3p高表达组3年累积生存率为83.72%,显著高于miR-574-3p低表达组(53.19%);FAM3C高表达组3年累积生存率为56.86%,显著低于FAM3C低表达组(82.05%),差异均有统计学意义(log rankχ^(2)=10.175、7.290,P<0.05)。结论:食管癌组织中miR-574-3p表达水平较低,FAM3C表达水平较高,且二者具有负相关性,与临床病理特征中的TNM分期、浸润程度、淋巴结转移以及患者3年累积生存率有关。 展开更多
关键词 食管癌 微小RNA-574-3p 序列相似家族3成员c 临床病理特征
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C基因型牛副流感3型病毒分离株全基因组测序及分析 被引量:2
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作者 冉旭华 张峣 +5 位作者 卢元赫 曹思 张玲玲 刘阳阳 倪宏波 闻晓波 《中国生物制品学杂志》 CAS CSCD 2016年第6期595-599,共5页
目的对宁夏地区分离得到的1株C基因型牛副流感3型病毒(bovine parainfluenza 3 virus,BPIV3)进行全基因组测序,并进行同源性及进化树分析。方法参考Gen Bank上登录的BPIV3中国分离株SD0835基因组序列设计5对引物,覆盖病毒基因组全长,提... 目的对宁夏地区分离得到的1株C基因型牛副流感3型病毒(bovine parainfluenza 3 virus,BPIV3)进行全基因组测序,并进行同源性及进化树分析。方法参考Gen Bank上登录的BPIV3中国分离株SD0835基因组序列设计5对引物,覆盖病毒基因组全长,提取BPIV3总RNA,以其为模板,进行RT-PCR扩增,扩增产物与p MD誖18-T Vector连接,连接产物转化大肠埃希菌DH5α感受态细胞,将阳性克隆进行核苷酸测序,测序结果通过分子生物学软件进行拼接,并与Gen Bank上登录的参考序列进行比较,构建系统进化树。结果成功分离得到1株BPIV3,命名为NX49,NX49株全基因组核酸序列为15 474 nt,提交至Gen Bank的序列号为KT071671。NX49与中国山东C型分离株SD0835的同源性最高,为99.3%;与中国内蒙古A型分离株NM09的同源性为82.5%;与澳大利亚B型分离株Q5592的同源性为81.4%。结论 NX49与SD0835同属一个进化分枝,但由于地域及时间上的不同,可能造成它们之间在基因水平上存在差异。 展开更多
关键词 牛副流感3型病毒 全基因组 c基因型 测序
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磁性纳米Fe_(3)O_(4)@C对SBR脱氮除磷性能及其微生物种群组成的影响 被引量:6
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作者 刘琴 信欣 +4 位作者 周希 廖娟 段文瑶 解宗兰 叶恒 《环境科学学报》 CAS CSCD 北大核心 2021年第7期2664-2672,共9页
为探究磁性纳米Fe_(3)O_(4)@C对序批式活性污泥反应器(SBR)污水处理系统脱氮除磷性能的影响,建立了2个相同的SBR(编号分别为0号和1号),其中,0号反应器未投加任何磁性材料(对照组),1号反应器中投加0.5 g·L^(-1)的Fe_(3)O_(4)@C(实验... 为探究磁性纳米Fe_(3)O_(4)@C对序批式活性污泥反应器(SBR)污水处理系统脱氮除磷性能的影响,建立了2个相同的SBR(编号分别为0号和1号),其中,0号反应器未投加任何磁性材料(对照组),1号反应器中投加0.5 g·L^(-1)的Fe_(3)O_(4)@C(实验组),并采用高通量测序和实时定量PCR(qPCR)技术对2个反应器内生物种群结构及关键脱氮除磷功能菌群进行分析.结果表明:(1)Fe_(3)O_(4)@C对SBR除污性能有显著影响,其中,1号反应器化学需氧量(COD)的去除性能得到增强,24 d后去除率稳定在90%左右;0号和1号反应器总氮(TN)平均去除率分别为35.83%和52.18%;从第43 d起,1号反应器除磷性能明显高于0号反应器,运行70 d后,0号和1号反应器对总磷(TP)的平均去除率分别为47.52%和56.33%.(2)添加Fe_(3)O_(4)@C材料后,反应器内变形菌门(Proteobacteria)的相对丰度从23.91%增加至32.14%,优势脱氮菌门Planctomycetes、Nitrospirae的相对丰度分别从2.66%、0.46%增加至5.16%、2.23%.(3)添加Fe_(3)O_(4)@C后,SBR内细菌总数明显增多,16S基因拷贝数从1.77×10^(7) copies·g^(-1)增长到4.21×10^(7) copies·g^(-1);各功能菌数量也有大幅度增长,除磷功能基因PAO增加了3.4倍,脱氮功能基因nirS、Nitrospira、Nitrobacter、AOB分别增长了2.3、2.4、4.7和572倍.研究表明,磁性纳米Fe_(3)O_(4)@C能有效促进SBR脱氮除磷性能,可为SBR工艺的优化改进提供理论支撑. 展开更多
关键词 磁性纳米Fe_(3)O_(4)@c SBR工艺 脱氮除磷 定量PcR 微生物种群
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FAM3C介导TGF-β1诱导的人血管平滑肌细胞表型转换、活力增强及迁移 被引量:2
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作者 訾亚飞 王正力 +3 位作者 訾亚婉 李雅馨 刘杨东 赵渝 《中国病理生理杂志》 CAS CSCD 北大核心 2022年第12期2130-2138,共9页
目的:探讨序列相似家族3成员C(FAM3C)在转化生长因子β1(TGF-β1)诱导人血管平滑肌细胞(VSMCs)表型转换中的作用及机制。方法:检测不同浓度(0、1、2、5及10μg/L)的TGF-β1作用24 h和10μg/L的TGF-β1作用不同时间(0、6、12、24及48 h)... 目的:探讨序列相似家族3成员C(FAM3C)在转化生长因子β1(TGF-β1)诱导人血管平滑肌细胞(VSMCs)表型转换中的作用及机制。方法:检测不同浓度(0、1、2、5及10μg/L)的TGF-β1作用24 h和10μg/L的TGF-β1作用不同时间(0、6、12、24及48 h)对原代人VSMCs中FAM3C表达的影响;检测TGF-β1(10μg/L)作用不同时间(0、6、12和24 h)对VSMCs表型转换的影响;敲减FAM3C、过表达FAM3C及加入蛋白激酶B(PKB/Akt)抑制剂Ⅷ(Akti-Ⅷ)后,Western blot检测骨桥蛋白(OPN)、波形蛋白(vimentin)、α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)、增殖细胞核抗原(PCNA)、FAM3C、Akt及磷酸化Akt(p-Akt)蛋白水平,CCK-8检测细胞活力,Transwell检测细胞迁移,免疫荧光检测vimentin及α-SMA蛋白表达。结果:随着TGF-β1作用浓度(0、1、2、5及10μg/L)和时间(0、6、12、24及48 h)的增加,VSMCs中FAM3C蛋白表达上调。TGF-β1(10μg/L)呈时间依赖性(0、6、12和24 h)上调OPN及vimentin表达,下调α-SMA表达。与si-NC组相比,敲减FAM3C后,OPN、vimentin、PCNA及p-Akt蛋白水平下调(P<0.05),α-SMA表达上调(P<0.05),细胞活力及迁移能力减弱(P<0.05);此外,敲减FAM3C减弱了TGF-β1对VSMCs的作用。而与LV-GFP组相比,过表达FAM3C后,OPN、vimentin、PCNA及p-Akt蛋白水平升高(P<0.05),α-SMA蛋白表达减少(P<0.05),细胞活力及迁移能力增强;过表达FAM3C促进了TGF-β1对VSMCs表型转换、活力及迁移的作用,而Akti-Ⅷ抑制了过表达FAM3C及与TGF-β1共作用对VSMCs表型的调节。结论:FAM3C通过Akt介导TGF-β1诱导的人VSMCs表型转换、活力增强及迁移,可能是干预内膜增生的潜在靶点。 展开更多
关键词 序列相似家族3成员c 转化生长因子Β1 血管平滑肌细胞 表型转换
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Cloning and expression of NS3 cDNA fragment of HCV genome of Hebei isolate in E.coli 被引量:7
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作者 Zhu, FL Lu, HY +1 位作者 Li, Z Qi, ZT 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS CSCD 1998年第2期73-76,共4页
AIM To obtain greater antigenicity of HCV NS3 protein. METHODS The HCV NS3 cDNA fragment was amplified by reverse transcription polymerase chain reaction from the sera of the HCV infected patients. The DNA sequence... AIM To obtain greater antigenicity of HCV NS3 protein. METHODS The HCV NS3 cDNA fragment was amplified by reverse transcription polymerase chain reaction from the sera of the HCV infected patients. The DNA sequence was determined by dideoxy mediated chain termination method using T7 polymerase. HCV NS3 protein was expressed in E. coli . RESULTS Sequence analysis indicated that the HCV isolate of this study belongs to HCV Ⅱ; SDS PAGE demonstrated an M r 23800 and an M r 22000 recombinant protein band which amount to 14% and 11% of the total bacterial proteins separately. Western blotting and ELISA showed NS3 protein possessed greater antigenicity. CONCLUSION Recombinant HCV NS3 protein was expressed successfully, which provided the basis for developing HCV diagnostic reagents. 展开更多
关键词 hepatitis c virus NS3 GENE GENE EXPRESSION DNA VIRAL VIRAL proteins sequence analysis polymerase chain reaction enzyme linked IMMUNOSORBENT assay Escherichia coli
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RNA sequencing screening of differentially expressed genes after spinal cord injury 被引量:5
6
作者 Yi Li Ying Chen +5 位作者 Xiang Li Jian Wu Jing-Ying Pan Ri-Xin Cai Ri-Yun Yang Xiao-Dong Wang 《Neural Regeneration Research》 SCIE CAS CSCD 2019年第9期1583-1593,共11页
In the search for a therapeutic schedule for spinal cord injury,it is necessary to understand key genes and their corresponding regulatory networks involved in the spinal cord injury process.However,ad hoc selection a... In the search for a therapeutic schedule for spinal cord injury,it is necessary to understand key genes and their corresponding regulatory networks involved in the spinal cord injury process.However,ad hoc selection and analysis of one or two genes cannot fully reveal the complex molecular biological mechanisms of spinal cord injury.The emergence of second-generation sequencing technology(RNA sequencing)has provided a better method.In this study,RNA sequencing technology was used to analyze differentially expressed genes at different time points after spinal cord injury in rat models established by contusion of the eighth thoracic segment.The numbers of genes that changed significantly were 944,1362 and 1421 at 1,4 and 7 days after spinal cord injury respectively.After gene ontology analysis and temporal expression analysis of the differentially expressed genes,C5ar1,Socs3 and CCL6 genes were then selected and identified by real-time polymerase chain reaction and western blot assay.The mRNA expression trends of C5ar1,Socs3 and CCL6 genes were consistent with the RNA sequencing results.Further verification and analysis of C5ar1 indicate that the level of protein expression of C5ar1 was consistent with its nucleic acid level after spinal cord injury.C5ar1 was mainly expressed in neurons and astrocytes.Finally,the gene Itgb2,which may be related to C5ar1,was found by Chilibot database and literature search.Immunofluorescence histochemical results showed that the expression of Itgb2 was highly consistent with that of C5ar1.Itgb2 was expressed in astrocytes.RNA sequencing technology can screen differentially expressed genes at different time points after spinal cord injury.Through analysis and verification,genes strongly associated with spinal cord injury can be screened.This can provide experimental data for further determining the molecular mechanism of spinal cord injury,and also provide possible targets for the treatment of spinal cord injury.This study was approved ethically by the Laboratory Animal Ethics Committee of Jiangsu Province,China(approval No.2018-0306-001)on March 6,2018. 展开更多
关键词 NERVE REGENERATION spinal cORD injury RNA sequencing c5ar1 Itgb2 SOcS3 ccL6 ASTROcYTES rats neural REGENERATION
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猪核转录因子C/EBPβ基因3′末端部分序列的克隆
7
作者 吕利英 胡晟 苏玉虹 《安徽农业科学》 CAS 北大核心 2010年第23期12469-12470,12475,共3页
[目的]研究猪核转录因子C/EBPβ,扩增C/EBPβ3′非翻译区(3′UTR)部分序列。[方法]以报道的猪C/EBPβ基因片段(DQ450678.1)为模板设计引物,应用3′末端快速扩增技术(3′RACE技术)进行扩增。[结果]成功克隆猪核转录因子C/EBPβ的3′UTR,... [目的]研究猪核转录因子C/EBPβ,扩增C/EBPβ3′非翻译区(3′UTR)部分序列。[方法]以报道的猪C/EBPβ基因片段(DQ450678.1)为模板设计引物,应用3′末端快速扩增技术(3′RACE技术)进行扩增。[结果]成功克隆猪核转录因子C/EBPβ的3′UTR,并获得GenBank登录号:FJ869121。[结论]与GenBank中报道的其他哺乳动物相应序列进行比较分析,猪核转录因子C/EBPβ的3′UTR序列与人C/EBPβ基因核苷酸序列BLAST比对,同源性为93%,为克隆其基因组全长及分析其功能奠定了基础。 展开更多
关键词 c/EBPΒ 3′RAcE 测序
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八字地老虎和粘虫蜕皮激素接受子3(HR3)基因cDNA序列的克隆与序列分析
8
作者 吴丽梅 韩岚岚 +1 位作者 刘健 樊东 《昆虫知识》 CSCD 北大核心 2010年第4期665-672,共8页
蜕皮激素接受子3(hormone receptor 3,HR3),是一种蜕皮调节转录因子,调控蜕皮过程中相关基因的表达,是蜕皮级联反应中的关键因子。本文以八字地老虎Agrotisc-nigrumL.和粘虫Mythimna separata Walker预蛹期幼虫为材料,分别提取总RNA,利... 蜕皮激素接受子3(hormone receptor 3,HR3),是一种蜕皮调节转录因子,调控蜕皮过程中相关基因的表达,是蜕皮级联反应中的关键因子。本文以八字地老虎Agrotisc-nigrumL.和粘虫Mythimna separata Walker预蛹期幼虫为材料,分别提取总RNA,利用RT-PCR和cDNA末端快速扩增技术(RACE),分别扩增得到2种昆虫蜕皮激素接受子3(HR3)的5′非编码区和完整开放读码框在内的cDNA序列,其中八字地老虎的HR3 cDNA序列含有1729个碱基,包括一个1533个碱基的开放阅读框,编码一个含510个氨基酸的蛋白,分子量约为57.5ku。粘虫的HR3cDNA序列含有1743个碱基,包括一个1536个碱基的开放阅读框,编码一个含511个氨基酸的蛋白,分子量约为57.9ku。这2种昆虫HR3 cDNA序列推导的氨基酸序列均具有昆虫核受体超家族特征性结构域,与其他昆虫,尤其是鳞翅目昆虫的蜕皮激素接受子3的氨基酸序列高度同源。获得的基因cDNA序列已经登录GenBank并获得登录号,八字地老虎HR3登录号为GU188853,粘虫HR3登录号为GU188854。 展开更多
关键词 八字地老虎 粘虫 蜕皮激素接受子3 分子克隆 序列分析
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LncRNA SNHG16调节miR-212-3p/FAM3C轴对食管癌细胞增殖迁移和侵袭的影响 被引量:1
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作者 侯英利 冯晓娜 +3 位作者 李春晖 张萌 董海平 殷星 《河北医学》 CAS 2024年第8期1238-1244,共7页
目的:探讨长链非编码小核仁RNA宿主基因16(LncRNA SNHG16)靶向微小RNA-212-3p(miR-212-3p)/序列相似家族3成员C(FAM3C)轴对食管癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响。方法:体外培养人食管癌细胞KYSE-510作为研究对象,将其分为对照组、si-NC组... 目的:探讨长链非编码小核仁RNA宿主基因16(LncRNA SNHG16)靶向微小RNA-212-3p(miR-212-3p)/序列相似家族3成员C(FAM3C)轴对食管癌细胞增殖、迁移和侵袭的影响。方法:体外培养人食管癌细胞KYSE-510作为研究对象,将其分为对照组、si-NC组、si-SNHG16组、si-SNHG16+inhibitor NC组、si-SNHG16+miR-212-3p inhibitor组。各组细胞LncRNA SNHG16,miR-212-3p、FAM3C mRNA表达的检测用RT-qPCR法;用CCK-8试剂盒检测KYSE-510细胞增殖,用流式细胞术检测KYSE-510细胞凋亡,用划痕实验检测KYSE-510细胞迁移,用Transwell法检测KYSE-510细胞侵袭,双荧光素酶报告实验验证LncRNA SNHG16与miR-212-3p及miR-212-3p与FAM3C之间的靶向关系。结果:与对照组和si-NC组相比,si-SNHG16组中LncRNA SNHG16、FAM3C mRNA水平、OD值、划痕愈合率、细胞侵袭数降低,miR-212-3p水平、细胞凋亡率升高(P<0.05);与si-SNHG16+inhibitor NC组相比,si-SNHG16+miR-212-3p inhibitor组中miR-212-3p水平、细胞凋亡率降低、FAM3C mRNA水平、OD值、划痕愈合率、细胞侵袭数升高(P<0.05),而LncRNA SNHG16水平无差异(P>0.05);生物学信息网站预测miR-212-3p与LncRNA SNHG16和FAM3C均存在靶向结合位,且双荧光素酶报告基因实验验证了LncRNA SNHG16与miR-212-3p、miR-212-3p与FAM3C之间均存在靶向关系(P<0.05)。结论:在食管癌中LncRNA SNHG16表达上调,敲低LncRNA SNHG16的表达可靶向上调miR-212-3p,抑制FAM3C的表达,进而抑制食管癌细胞增殖、迁移和侵袭,促进食管癌细胞的凋亡。 展开更多
关键词 长链非编码小核仁RNA宿主基因16 微小RNA-212-3p/序列相似家族3成员c 食管癌 增殖 迁移 侵袭
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二代基因测序技术检测急性髓系白血病患者CRLF2、FLT3及C-KIT突变的价值 被引量:1
10
作者 常渊媛 杨亚锋 《临床医学研究与实践》 2023年第7期97-100,共4页
目的探讨二代基因测序技术检测急性髓系白血病患者细胞因子受体样因子2(CRLF2)、FMS样酪氨酸激酶3(FLT3)及C-KIT突变的价值。方法选择2017年1月至2020年1月在我院接受治疗的78例急性髓系白血病患者为研究对象,采用二代基因测序技术检测C... 目的探讨二代基因测序技术检测急性髓系白血病患者细胞因子受体样因子2(CRLF2)、FMS样酪氨酸激酶3(FLT3)及C-KIT突变的价值。方法选择2017年1月至2020年1月在我院接受治疗的78例急性髓系白血病患者为研究对象,采用二代基因测序技术检测CRLF2、FLT3及C-KIT突变情况。比较CRLF2、FLT3及C-KIT不同突变类型患者的临床参数;比较CRLF2、FLT3及C-KIT不同突变类型患者治疗≤2个疗程的完全缓解率和复发率。结果78例患者中CRLF2突变11例,突变率为14.10%,正常核型突变率高于异常核型,差异具有统计学意义(P<0.05);FLT3突变9例,突变率为11.54%,正常核型突变率高于异常核型,差异具有统计学意义(P<0.05);C-KIT突变6例,突变率为7.69%,正常核型突变率低于异常核型,差异具有统计学意义(P<0.05)。CRLF2不同突变类型患者的年龄、白细胞计数、血小板计数比较,差异具有统计学意义(P<0.05);FLT3不同突变类型患者的白细胞计数比较,差异具有统计学意义(P<0.05);C-KIT不同突变类型患者的血红蛋白水平比较,差异具有统计学意义(P<0.05)。开展随访跟踪共计76例患者可评价干预效果,CRLF2不同突变类型患者治疗≤2个疗程的完全缓解率和复发率比较,差异无统计学意义(P>0.05);FLT3突变阳性患者治疗≤2个疗程的完全缓解率低于突变阴性患者,复发率高于突变阴性患者,差异具有统计学意义(P<0.05);C-KIT不同突变类型患者治疗≤2个疗程的完全缓解率比较,差异无统计学意义(P>0.05);C-KIT突变阳性患者复发率高于突变阴性患者,差异具有统计学意义(P<0.05)。结论急性髓系白血病患者CRLF2、FLT3及C-KIT突变较为常见,利用二代基因测序技术开展上述基因突变检测有助于指导临床治疗及预后评估。 展开更多
关键词 二代基因测序技术 急性髓系白血病 细胞因子受体样因子2 FMS样酪氨酸激酶3 c-KIT
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接骨草HMGR基因cDNA克隆、不同器官中的差异表达及生物信息学分析 被引量:2
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作者 姚元枝 黎晓英 +2 位作者 郭文博 刘宇 魏麟 《中草药》 CAS CSCD 北大核心 2015年第16期2449-2453,共5页
目的克隆接骨草Sambucus chinensis 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因并分析其差异表达。方法采用RT-PCR方法获得HMGR基因c DNA序列,并对HMGR蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三级结构预测分析,并预测该蛋白功能;利用实时荧... 目的克隆接骨草Sambucus chinensis 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶(HMGR)基因并分析其差异表达。方法采用RT-PCR方法获得HMGR基因c DNA序列,并对HMGR蛋白进行理化性质、蛋白二级结构及三级结构预测分析,并预测该蛋白功能;利用实时荧光定量PCR方法检测HMGR基因在接骨草的根状茎、地上茎、叶、花中的表达情况。结果克隆获得的HMGR基因c DNA全长为1 626 bp,编码593个氨基酸。生物信息学预测HMGR蛋白含2个跨膜区,不含信号肽。HMGR基因主要在接骨草的花和地上茎中表达较高,其他器官表达相对较低。结论首次从接骨草中克隆了HMGR基因,为进一步阐明该基因在接骨草萜类化合物代谢途径中的重要作用奠定基础。 展开更多
关键词 接骨草 3-羟基-3-甲基戊二酰辅酶A还原酶 实时荧光定量PcR c DNA序列 萜类化合物
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人白介素-3基因表达调节的研究 被引量:2
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作者 陈鸿书 陈嵩 +1 位作者 曹廷兵 甘立霞 《生物化学杂志》 CSCD 1995年第1期6-10,共5页
报导了h-IL-3基因表达调节研究的结果:(1)人静止的外周血淋巴细胞几乎不表达IL-3mRNA,但受丝裂原PHA的刺激后则诱导IL-3mRNA表达,TPA与PHA联合处理,使IL-3mRNA的蓄积进一步增加,但TP... 报导了h-IL-3基因表达调节研究的结果:(1)人静止的外周血淋巴细胞几乎不表达IL-3mRNA,但受丝裂原PHA的刺激后则诱导IL-3mRNA表达,TPA与PHA联合处理,使IL-3mRNA的蓄积进一步增加,但TPA单独不足以诱导IL-3mRNA蓄积;(2)A23187/TPA能代替PHA/TPA的刺激,并直接诱导IL-3mRNA表达;(3)TREODN处理则显著抑制PHA/TPA诱导的IL-3mRNA表达。这些结果揭示:h-IL-3基因的表达在转录及转录后水平被调节,而且是可诱导的,诱导h-IL-3基因表达、需要Ca2+依赖及PKC依赖的两个信息转导系统,Fos蛋白是反式激活IL-3基因表达的转录因子,PKC依赖的转导系统,可能与IL-3mRNA的稳定性有关。 展开更多
关键词 白细胞介素3 基因表达 调节
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鸽微RNA病毒实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立
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作者 张靖鹏 陈翠腾 +5 位作者 林琳 付环茹 李兆龙 江斌 黄瑜 万春和 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第2期860-866,共7页
旨在建立鸽微RNA病毒(pigeon megrivirus,PiMeV)实时荧光定量RT-PCR检测方法。本研究根据GenBank中PiMeVs序列特征设计特异性检测引物,从信鸽粪便中检测到PiMeV阳性(命名为PiMeV-CHN001株),并对其3 C基因进行核苷酸同源性比较和遗传进... 旨在建立鸽微RNA病毒(pigeon megrivirus,PiMeV)实时荧光定量RT-PCR检测方法。本研究根据GenBank中PiMeVs序列特征设计特异性检测引物,从信鸽粪便中检测到PiMeV阳性(命名为PiMeV-CHN001株),并对其3 C基因进行核苷酸同源性比较和遗传进化分析,明确其基因特征后,设计特异性实时荧光定量RT-PCR检测(RT-qPCR)引物组,建立检测PiMeV的RT-qPCR方法。结果显示:PiMeV-CHN001株3 C基因全长为591 bp,编码197个氨基酸,和其他2株野鸽源PiMeV(MeV-B1株和MeV-B2株)核苷酸相似性分别为89.5%和92.0%。建立的检测PiMeV的RT-qPCR方法的标准曲线Y轴截距为37.93,斜率为-3.335,相关系数为1.00,扩增效率为99.4%。特异性强,仅PiMeV出现特异性扩增信号和特异性峰值[Tm值为(81.69±0.22)℃],对鸽源禽流感病毒(avian influenza virus,AIV)、鸽源禽I型副黏病毒(pigeon paramyxovirus type I,PPMV-1)、鸽输血传播病毒(pigeon torque teno virus,PTTV)、鸽腺病毒(pigeon adenovirus,PiAd)及鸽圆环病毒(pigeon circovirus,PiCV)检测均未见特异性扩增信号;敏感性优,最低检测限为54.0拷贝·μL^(-1);重复性好,批内和批间变异系数均低于1.5%。用建立的检测方法对42份信鸽粪便样品进行检测,发现2份阳性样品(阳性率为4.76%)。本研究首次证实我国大陆地区信鸽中存在PiMeV,丰富了PiMeV宿主谱信息;建立的RT-qPCR方法为后续开展PiMeV流行病学研究提供支撑。 展开更多
关键词 信鸽 鸽微RNA病毒 3 c基因 序列分析 实时荧光定量RT-PcR方法
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miRNA与其靶mRNA 3′UTR序列的匹配特征分析 被引量:1
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作者 孙佩智 李宏 +4 位作者 赵小庆 薄素玲 张泽峰 张强 路战远 《内蒙古大学学报(自然科学版)》 CAS 北大核心 2021年第2期150-161,共12页
MicroRNA是调控基因表达的重要功能片段,它们在动植物的生长发育、疾病发生过程中发挥着重要的作用。基于miRecords数据库,以人类、小鼠和大鼠实验验证的miRNA和它们的靶mRNA 3′UTR序列为研究对象,分析了miRNA和其匹配片段在3′UTR序... MicroRNA是调控基因表达的重要功能片段,它们在动植物的生长发育、疾病发生过程中发挥着重要的作用。基于miRecords数据库,以人类、小鼠和大鼠实验验证的miRNA和它们的靶mRNA 3′UTR序列为研究对象,分析了miRNA和其匹配片段在3′UTR序列上的位置偏好性。研究发现,miRNA与3′UTR序列相互作用的位置存在区域偏好。低G+C含量的miRNA主要作用在3′UTR序列的5′端和3′端,高G+C含量的miRNA主要作用在3′UTR序列的5′端。低G+C含量的匹配片段在3′UTR序列上没有明显的位置偏好,而高G+C含量的匹配片段集中分布在3′UTR序列的5′端。低配对率的匹配片段主要分布在3′UTR序列的两端,中等配对率的匹配片段主要分布在3′UTR序列的5′端。此外,还分析了miRNA与匹配片段的4种相互作用方式中配对率的差异。研究对于揭示miRNA对基因表达调控的多样性提供了新的思路。 展开更多
关键词 MIRNA 3′UTR序列 匹配片段 作用区域偏好 G+c含量 配对率
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Cyanidin-3-rutinoside(C3R) attenuates free fatty acid-induced hepatic lipid accumulation in HepG2 cells
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作者 Jingxu Duan Wancong Yu +2 位作者 Yujia Niu Jiao Li Zhaohui Xue 《Food Bioscience》 2026年第4期826-838,共13页
Non-alcoholic fatty liver disease(NAFLD)is characterized by pathological lipid accumulation in hepatocytes.Cyanidin-3-rutinoside(C3R),a natural anthocyanin,attenuated lipid accumulation in a free fatty acid(FFA)-induc... Non-alcoholic fatty liver disease(NAFLD)is characterized by pathological lipid accumulation in hepatocytes.Cyanidin-3-rutinoside(C3R),a natural anthocyanin,attenuated lipid accumulation in a free fatty acid(FFA)-induced HepG2 steatosis model.It significantly reduced intracellular triglyceride(TG),total cholesterol(TC),and low-density lipoprotein cholesterol(LDL-C)levels,suppressed lipid droplet formation,and alleviated oxidative stress by enhancing superoxide dismutase(SOD)/catalase(CAT)activities,as well as increasing glutathione(GSH)content,while lowering malondialdehyde(MDA)and reactive oxygen species(ROS).RNA sequencing analysis revealed that C3R reversed FFA-induced transcriptomic alterations.Mechanistically,C3R inhibited sterol regulatory element-binding protein 2(SREBP2)-mediated cholesterol synthesis,activated the proprotein convertase subtilisin/kexin type 9(PCSK9)/low-density lipoprotein receptor(LDLR)pathway to promote cholesterol clearance,and upregulated peroxisome proliferator-activated receptor gamma(PPARγ)-dependent cytochrome p450 family 7 subfamily a member 1(CYP7A1)expression to stimulate bile acid synthesis from cholesterol.C3R also enhanced autophagic flux,thereby facilitating the degradation of lipid droplets.Molecular docking confirmed the high-affinity binding of C3R to insulin-induced gene 1(INSIG1),PCSK9,and PPARγ,with hydroxyl groups forming specific hydrogen bonds at the active sites,supporting direct target engagement.These findings establish a multi-targeted mechanism for C3R in ameliorating hepatic steatosis,providing a molecular basis for anthocyanin-mediated regulation of lipid metabolism. 展开更多
关键词 c3R Lipid metabolism RNA sequencing cholesterol metabolism
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Fully Decoupled Branch Energy Balancing Control Method for Modular Multilevel Matrix Converter Based on Sequence Circulating Components 被引量:1
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作者 Zexin Zhao Weijiang Chen +5 位作者 Zhichang Yang Guoliang Zhao Bin Han Yunfei Xu Nianwen Xiang Shulai Wang 《CSEE Journal of Power and Energy Systems》 SCIE EI CSCD 2024年第1期235-247,共13页
The modular multilevel matrix converter(M3C)is a potential frequency converter for low-frequency AC transmission.However,capacitor voltage control of high-voltage and largecapacity M3C is more difficult,especially for... The modular multilevel matrix converter(M3C)is a potential frequency converter for low-frequency AC transmission.However,capacitor voltage control of high-voltage and largecapacity M3C is more difficult,especially for voltage balancing between branches.To solve this problem,this paper defines sequence circulating components and theoretically analyzes the influence mechanism of different sequence circulating components on branch capacitor voltage.A fully decoupled branch energy balancing control method based on four groups of sequence circulating components is proposed.This method can control capacitor voltages of nine branches in horizontal,vertical and diagonal directions.Considering influences of both circulating current and voltage,a cross decoupled control is designed to improve control precision.Simulation results are taken from a low-frequency transmission system based on PSCAD/EMTDC,and effectiveness and precision of the proposed branch energy balancing control method are verified in the case of nonuniform parameters and an unbalanced power system. 展开更多
关键词 Branch energy balancing control decoupled control low-frequency Ac transmission modular multilevel matrix converter(M3c) sequence circulating components
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FAM3C表达对胰腺癌细胞增殖、迁移、侵袭的影响和调控机制
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作者 王雷生 陶月 +5 位作者 张硕 陈恩洪 杨东杰 何友钊 茆勇 胡浩 《中华肝胆外科杂志》 CAS CSCD 北大核心 2024年第7期531-536,共6页
目的分析序列相似家族3成员C(FAM3C)在胰腺癌中的表达以及对胰腺癌细胞增殖、迁移、侵袭等影响和相关机制。方法收集2022年7月至2023年6月在江南大学附属医院手术切除的4例胰腺癌患者的癌组织和癌旁组织。聚合酶链反应和Western印迹检... 目的分析序列相似家族3成员C(FAM3C)在胰腺癌中的表达以及对胰腺癌细胞增殖、迁移、侵袭等影响和相关机制。方法收集2022年7月至2023年6月在江南大学附属医院手术切除的4例胰腺癌患者的癌组织和癌旁组织。聚合酶链反应和Western印迹检测组织和胰腺癌细胞PANC-1、MIA PaCa-2中FAM3C的表达。选取PANC-1、MIA PaCa-2细胞(FAM3C高表达)设置FAM3C-siRNA干扰组和甲基转移酶样蛋白3(METTL3)-siRNA干扰组,予以相应干扰小RNA处理,同时设置阴性对照组。细胞计数检测增殖能力,Transwell检测细胞迁移及侵袭。免疫共沉淀甲基化抗体检测FAM3C是否发生甲基化以及METTL3是否介导此甲基化。结果4例胰腺癌患者癌组织中FAM3C的mRNA相对表达为(1.29±0.19),高于癌旁组织(0.47±0.17),差异有统计学意义(t=-6.48,P=0.001)。与阴性对照A组相比,FAM3C-siRNA干扰组增殖能力下降,迁移和侵袭细胞数减少,差异均有统计学意义(均P<0.05)。在PANC-1细胞阴性对照B组中,IgG处理的细胞FAM3C mRNA相对表达为(1.05±0.53),低于甲基化抗体处理组的(30.57±1.09),差异有统计学意义(t=-42.04,P=0.001)。PANC-1细胞经甲基化抗体处理后,阴性对照B组FAM3C mRNA相对表达高于METTL3-siRNA干扰组(30.57±1.09)比(18.17±0.50),差异有统计学意义(t=17.89,P=0.001)。与阴性对照B组相比,METTL3-siRNA干扰组PANC-1细胞增殖能力、迁移和侵袭细胞数降低,差异均有统计学意义(均P<0.05)。MIA PaCa-2与PANC-1细胞检测结果一致。结论FAM3C在胰腺癌中高表达,且促进胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭,METTL3通过甲基化修饰FAM3C影响其表达,进一步影响胰腺癌细胞增殖、迁移和侵袭。 展开更多
关键词 胰腺肿瘤 甲基转移酶样蛋白3 序列相似家族3成员c 迁移 侵袭 增殖
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急性溃疡性结肠炎小鼠结肠组织中SHP2的表达及其作用探讨 被引量:1
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作者 谭婉燕 杨旭辉 《山东医药》 CAS 2018年第38期35-38,共4页
目的观察急性溃疡性结肠炎(UC)小鼠结肠组织中含C-Src同源序列的蛋白质酪氨酸磷酸酶2(SHP2)的表达,探讨SHP2在UC病程中的作用。方法将30只小鼠随机分成正常组、模型组、SHP2组各10只。模型组和SHP2组饮用4%DSS制作急性UC模型,正常组饮... 目的观察急性溃疡性结肠炎(UC)小鼠结肠组织中含C-Src同源序列的蛋白质酪氨酸磷酸酶2(SHP2)的表达,探讨SHP2在UC病程中的作用。方法将30只小鼠随机分成正常组、模型组、SHP2组各10只。模型组和SHP2组饮用4%DSS制作急性UC模型,正常组饮用高压过的饮用水。造模第1天,正常组、模型组、SHP2组分别注射腺病毒稀释液、腺病毒空载体、腺病毒SHP2突变载体。每天记录小鼠体质量、腹泻及便血情况,使用疾病活动指数(DAI)评分量表评价肠道临床炎症严重程度。饲养至20 d处死小鼠,取结肠组织,采用HE染色观察组织形态学变化,进行组织学评分,采用阿尔新蓝染色法检测杯状细胞数量。收集小鼠心脏血,ELISA法检测血清炎性因子COX-2、IL-6、TNF-α水平。取结肠组织,Western blotting法检测结肠组织中SHP2、p-P65、p-STAT3表达水平,免疫组化染色法检测Ki67表达水平。结果与正常组比较,模型组DAI评分、结肠组织病理学评分均升高,杯状细胞数量减少,血清COX-2、IL-6、TNF-α水平及结肠组织中p-P65、p-STAT3、Ki67表达水平均升高(P均<0. 05或<0. 01);与模型组比较,SHP2组DAI评分、结肠组织病理学评分均降低,杯状细胞数量增加,血清COX-2、IL-6、TNF-α水平及结肠组织中p-P65、p-STAT3、Ki67表达水平均降低(P <0. 05或<0. 01)。结论急性UC小鼠结肠组织中SHP2表达升高; SHP2可能是通过介导NF-κB/STAT3信号通路的激活,调节炎性因子COX-2、IL-6、TNF-α释放,导致黏膜损伤,促进UC的发生。 展开更多
关键词 溃疡性结肠炎 c-Src同源序列的蛋白质酪氨酸磷酸酶2 P65蛋白 信号传导与转录活化因子3 小鼠
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3C-based methods to detect long-range chromatin interactions
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作者 Gang WEI Keji ZHAO 《Frontiers in Biology》 CSCD 2011年第1期76-81,共6页
Transcriptional regulatory regions are often located several thousand bases from the gene that they control.To function, the chromatin strand forms loops to juxtapose distal regions with the promoter. These long-range... Transcriptional regulatory regions are often located several thousand bases from the gene that they control.To function, the chromatin strand forms loops to juxtapose distal regions with the promoter. These long-rangechromatin interactions have profound influences on the regulation of gene expression and mapping these interactions iscurrently a subject of intensive investigation. Chromosome conformation capture (3C) technology and its derivativeshave been widely used to detect chromatin interactions and greatly contributed to understanding of the relationshipbetween genome organization and genome function. Here we review these 3C-based methods for the study of long-rangechromatin interactions and recent exciting findings obtained by using these technologies. 展开更多
关键词 chromatin interactions 3c gene regulation next-generation sequencing
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β2肾上腺素能受体基因多态性和支气管哮喘关系的最新研究进展 被引量:8
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作者 陈慧芬 张德平 邱玉英 《国际呼吸杂志》 2013年第19期1481-1485,共5页
过去有关β2肾上腺素能受体基因(ADRB2)多态性的研究重点集中在编码区的多态性,这些多态性可能与哮喘的发生、表型及治疗反应相关,但是研究结果不完全一致。近年来大量研究发现,不仅仅是编码区,5’和3’非翻译区的多态性同样能改... 过去有关β2肾上腺素能受体基因(ADRB2)多态性的研究重点集中在编码区的多态性,这些多态性可能与哮喘的发生、表型及治疗反应相关,但是研究结果不完全一致。近年来大量研究发现,不仅仅是编码区,5’和3’非翻译区的多态性同样能改变β2肾上腺素能受体(β2AR)的功能并影响着哮喘的治疗反应等,应同时对β2—AR基因中所有的变异即完整的单倍型进行识别和分析。现综述近来对ADRB2基因编码区、5’和3'非翻译区多态性的研究新进展,特别是3’非翻译区poly-C重复序列的长度的变异可能对哮喘患者的肺功能和对0:AR激动剂的治疗反应具有重要作用。 展开更多
关键词 哮喘 Β2肾上腺素能受体 多态性 单倍型 3’非翻译区poly—c重复序列
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