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不同核酸提取方法对幽门螺杆菌23S rRNA基因检测结果的影响
1
作者 徐文莉 谢怡婷 +3 位作者 廖长征 王嘉宝 段媛玲 陈思祖 《检验医学》 2026年第2期193-195,共3页
目的 分析不同核酸提取方法对幽门螺杆菌23S rRNA基因检测结果的影响。方法 收集2022年12月—2023年2月深圳市龙岗中心医院20例行胃镜检查且幽门螺杆菌呼气试验结果已知患者术中采集的胃黏膜组织。分别采用基因突变检测试剂盒(手工法)... 目的 分析不同核酸提取方法对幽门螺杆菌23S rRNA基因检测结果的影响。方法 收集2022年12月—2023年2月深圳市龙岗中心医院20例行胃镜检查且幽门螺杆菌呼气试验结果已知患者术中采集的胃黏膜组织。分别采用基因突变检测试剂盒(手工法)和全自动核酸提取仪(仪器法)配套核酸提取试剂提取幽门螺杆菌核酸,比较2种方法提取核酸耗时差异。采用实时荧光定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测幽门螺杆菌23S rRNA基因,比较2种核酸提取方法幽门螺杆菌23S rRNA基因突变结果差异。比较呼气试验和2种核酸提取方法幽门螺杆菌阳性率差异。结果 2种核酸提取方法RT-qPCR检测幽门螺杆菌阳性例数均高于呼气试验,但3组差异无统计学意义(P=0.931)。2种核酸提取方法A2142G、A2142C基因检测结果均为阴性,A2143G阳性各6例,差异无统计学意义(P=1.000)。仪器法提取核酸耗时45 min,远低于手工法(150 min)。结论 仪器法提取核酸的质量、浓度均可以满足幽门螺杆菌23S rRNA基因检测要求,且耗时远低于手工法。 展开更多
关键词 幽门螺杆菌 核酸 23s rRNA基因 仪器法 手工法
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肺炎支原体23S rRNA V区基因突变对阿奇霉素临床疗效影响的量化研究
2
作者 朱春晖 况萍 《国外医药(抗生素分册)》 2026年第1期25-29,共5页
目的肺炎支原体(MP)23S rRNA V区基因突变与大环内酯类药物耐药的相关性已明确,但其对患儿各项临床症状及指标恢复进程的具体量化影响,尤其是本地区人群中的数据尚显不足。本研究旨在详细分析携带耐药突变肺炎支原体肺炎(MPP)患儿的临... 目的肺炎支原体(MP)23S rRNA V区基因突变与大环内酯类药物耐药的相关性已明确,但其对患儿各项临床症状及指标恢复进程的具体量化影响,尤其是本地区人群中的数据尚显不足。本研究旨在详细分析携带耐药突变肺炎支原体肺炎(MPP)患儿的临床病程特征,为本地化精准治疗和预后评估提供量化循证依据。方法选取2022年8月—2025年8月住院的60例MPP患儿,通过聚合酶链式反应(PCR)及DNA测序检测MP 23S rRNA V区基因突变,分为突变组(n=32)和野生型组(n=28)。所有患儿接受阿奇霉素序贯疗法,比较两组临床疗效指标。结果60例患儿中,MP基因突变检出率为53.3%(32/60),其中A2063G为主要突变类型(占90.6%)。与野生型组相比,突变组患儿的退热时间、咳嗽缓解时间、肺部啰音消失时间、影像学改善时间及C反应蛋白复常时间均显著延长(均为P<0.001),总治疗疗程更长(P<0.001)。突变组治疗总有效率显著低于野生型组(71.9%vs96.4%,P=0.011)。结论研究通过详细的时间轴分析,量化了耐药突变对MPP患儿临床恢复的延迟效应,强调MP 23S rRNA V区基因突变(主要为A2063G)导致患儿临床症状迁延,疗程延长。在高耐药流行区,早期基因检测对于避免治疗延迟、及时调整方案具有关键的临床决策价值。 展开更多
关键词 肺炎支原体 23s rRNA 基因突变 阿奇霉素 临床病程
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MP 23S rRNA突变、LDH交互影响肺炎支原体肺炎患儿阿奇霉素响应性的效能及其预测价值
3
作者 段永彬 梁娟 +2 位作者 张敬芳 胡湘萍 张俊霞 《河南医学研究》 2026年第5期888-893,共6页
目的探讨肺炎支原体(MP)肺炎患儿MP 23S rRNA突变、乳酸脱氢酶(LDH)交互作用对阿奇霉素响应性的影响及其对阿奇霉素响应性的预测价值。方法选取2023年3月至2025年2月濮阳市人民医院收治的196例MP肺炎患儿,依据阿奇霉素响应性分为不良组... 目的探讨肺炎支原体(MP)肺炎患儿MP 23S rRNA突变、乳酸脱氢酶(LDH)交互作用对阿奇霉素响应性的影响及其对阿奇霉素响应性的预测价值。方法选取2023年3月至2025年2月濮阳市人民医院收治的196例MP肺炎患儿,依据阿奇霉素响应性分为不良组、良好组。比较两组临床资料及MP 23S rRNA突变、LDH水平。多因素logistic回归分析MP 23S rRNA突变、LDH对阿奇霉素响应性的影响效应。交互作用分析MP 23S rRNA突变、LDH对阿奇霉素响应性的交互影响效应。采用受试者工作特征(ROC)曲线及曲线下面积(AUC)分析MP 23S rRNA突变、LDH对阿奇霉素响应性的预测价值。结果196例MP肺炎患儿中阿奇霉素响应性不良47例(23.98%)、良好149例(76.02%);不良组MP 23S rRNA突变占比、LDH水平高于良好组,差异有统计学意义(P<0.05);多因素logistic回归分析显示,MP 23S rRNA突变、LDH均是阿奇霉素响应性的相关影响因素(P<0.05);根据MP 23S rRNA突变、LDH将全部对象分为MP 23S rRNA无突变+LDH正常水平(R_(00))、MP 23S rRNA无突变+LDH升高(R_(01))、MP 23S rRNA突变+LDH正常水平(R_(10))、MP 23S rRNA突变+LDH升高(R_(01))4个亚组,以R_(00)为参照,R_(01)、R_(10)、R_(01)可将阿奇霉素响应不良风险提高1.139倍、2.709倍、5.332倍(P<0.05);MP 23S rRNA突变联合LDH预测阿奇霉素响应性的AUC值为0.949,大于单独的MP 23S rRNA突变的0.872、LDH的0.776(P<0.05)。结论MP肺炎阿奇霉素响应性不良患儿MP 23S rRNA突变占比、LDH水平较良好患儿明显升高,且MP 23S rRNA突变、LDH对阿奇霉素响应性具有正向相加交互效应,联合检测其水平可用于早期预测阿奇霉素响应性,为临床个体化治疗提供决策依据。 展开更多
关键词 肺炎支原体 肺炎支原体肺炎 MP 23s rRNA 突变 乳酸脱氢酶 交互影响 预测
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肺炎支原体耐药性与23S rRNA耐药基因位点突变研究 被引量：6
4
作者 孙晓旭 董玉琼 +3 位作者 赵永旺 袁业红 吕晶晶 侯伦 《中国病原生物学杂志》 北大核心 2025年第1期52-56,共5页
目的探析肺炎支原体肺炎(Mycoplasma pneumoniae pneumonia,MPP)患儿肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,MP)耐药性及23S rRNA耐药基因位点突变情况,以期为临床治疗提供依据。方法对比分析本院2022年1月~2023年12月收治的MPP患儿临床资料... 目的探析肺炎支原体肺炎(Mycoplasma pneumoniae pneumonia,MPP)患儿肺炎支原体(Mycoplasma pneumoniae,MP)耐药性及23S rRNA耐药基因位点突变情况,以期为临床治疗提供依据。方法对比分析本院2022年1月~2023年12月收治的MPP患儿临床资料,采用PCR技术检测23S rRNA耐药基因位点突变情况,结合药敏试验结果,探讨耐药性与基因突变间的关联。结果共分离出78株MP菌株。这些菌株对乙酰螺旋霉素、红霉素、克拉霉素和罗红霉素的耐药性超过50%,耐药率分别为75.64%、73.08%、51.28%和76.92%;对左氧氟沙星、环丙沙星和莫西沙星的耐药率低于10%,分别为3.85%、3.85%和1.28%。对78株MP菌株进行测序分析显示,23S rRNA耐药基因位点突变率为76.92%(60/78)。其中,47株为A2063G位点发生突变(78.33%,47/60),9株为A2064G位点发生突变(15%,9/60),4株为A2063C位点发生突变(6.67%,4/60)。47株A2063G位点突变MP菌株对罗红霉素、乙酰螺旋霉素完全耐药,对红霉素、克拉霉素、阿奇霉素、交沙霉素、左氧氟沙星、环丙沙星和莫西沙星的耐药率分别为95.74%、63.83%、44.68%、17.02%、6.38%、6.38%和2.13%。9株A2064G位点突变MP菌株对罗红霉素完全耐药,对乙酰螺旋霉素、红霉素、克拉霉素、阿奇霉素、交沙霉素的耐药率分别为88.89%、88.89%、77.78%、33.33%和22.22%,未对左氧氟沙星、环丙沙星、莫西沙星产生耐药性。4株A2063C位点突变MP菌株对罗红霉素、乙酰螺旋霉素、红霉素完全耐药,对克拉霉素耐药率为75%,对阿奇霉素、交沙霉素耐药率为25%,未对左氧氟沙星、环丙沙星、莫西沙星产生耐药性。不同突变位点MP菌株对常用抗菌药物耐药率差异无统计学意义(P>0.05)。在基因突变组患者中,咳嗽、发热、气促、寒战、呼吸音减弱、肺外感染和重症肺炎的发生率分别为100%、88.33%、66.67%、31.67%、71.67%、40%和63.33%。而在基因未突变组中,这些症状的发生率分别为94.44%、77.78%、44.44%、22.22%、27.78%、5.56%和33.33%。两组患者在咳嗽、发热、气促、寒战方面的差异无统计学意义(P<0.05),但在呼吸音减弱、肺外感染、重症肺炎方面的差异有统计学意义(P>0.05)。在基因突变组中,14例合并混合感染,感染率为23.34%,其中4例合并细菌感染,包括铜绿假单胞菌2例,肺炎克雷伯菌1例,鲍曼不动杆菌1例;10例合并病毒感染,包括腺病毒5例,流感病毒4例,合胞病毒1例。基因未突变组中,6例合并混合感染,感染率为33.34%,其中3例合并细菌感染,包括铜绿假单胞菌1例,肺炎克雷伯菌1例,肺炎链球菌1例;3例合并病毒感染,包括腺病毒2例,呼吸道合胞病毒1例。两组混合感染率差异无统计学意义。结论本院MP菌株对大环内酯类抗生素的耐药率较高,而对氟喹诺酮类抗生素的耐药率较低。23S rRNA耐药基因位点突变与MP菌株的耐药性密切相关,其中A2063G位点突变与高耐药率显著相关。 展开更多
关键词 肺炎支原体 耐药性 23s rRNA 耐药基因位点突变
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纤维支气管镜肺泡灌洗治疗23S rRNA基因阳性重症肺炎支原体肺炎患儿的疗效分析 被引量：2
5
作者 冯燕华 庞夏玲 +7 位作者 张一莉 刘广兵 黄惠萍 杨晓祥 谭杰 黄丽莲 莫荣浩 陈洁琳 《浙江医学》 2025年第14期1520-1523,共4页
目的探讨纤维支气管镜(下称纤支镜)肺泡灌洗治疗23S核糖体RNA(23S rRNA)基因阳性重症肺炎支原体肺炎(SMPP)患儿的疗效。方法回顾性选取2023年1至12月广西壮族自治区妇幼保健院收治的23S rRNA基因阳性SMPP患儿328例,根据治疗方式不同分... 目的探讨纤维支气管镜(下称纤支镜)肺泡灌洗治疗23S核糖体RNA(23S rRNA)基因阳性重症肺炎支原体肺炎(SMPP)患儿的疗效。方法回顾性选取2023年1至12月广西壮族自治区妇幼保健院收治的23S rRNA基因阳性SMPP患儿328例,根据治疗方式不同分为非纤支镜组(<8岁者使用阿奇霉素+甲泼尼龙琥珀酸钠治疗,≥8岁者使用多西环素+甲泼尼龙琥珀酸钠治疗)和纤支镜组(在非纤支镜组的基础上进行纤支镜检查及肺泡灌洗治疗),比较两组患儿肺功能指标[用力肺活量(FVC)、第1秒用力呼气容积(FEV_(1))]及炎症指标[C反应蛋白(CRP)、降钙素原(PCT)]水平,临床症状(肺部啰音、咳嗽、发热)持续时间,肺部CT检查结果,临床疗效。结果治疗后,纤支镜组患儿FVC、FEV_(1)均高于非纤支镜组,CRP和PCT水平均低于非纤支镜组,肺部啰音、咳嗽及发热持续时间均短于非纤支镜组,肺部CT检查结果提示的总有效率及治疗总有效率均高于非纤支镜组,差异均有统计学意义(均P<0.01)。结论纤支镜检查及肺泡灌洗治疗能够显著改善23S rRNA基因阳性SMPP患儿的肺功能、炎症指标、临床症状和肺部CT表现,且提高总体疗效,是耐药性SMPP治疗的有效方案。 展开更多
关键词 重症肺炎支原体肺炎 23s核糖体RNA基因 肺泡灌洗治疗 纤维支气管镜
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23S rRNA基因检测在儿童肺炎支原体肺炎大环内酯类耐药中的应用关联研究 被引量：5
6
作者 李文博 张帆 +1 位作者 程云 张子轩 《儿科药学杂志》 2025年第2期32-36,共5页
目的:探究23S rRNA基因检测在儿童肺炎支原体肺炎(MPP)大环内酯类药物耐药中的作用。方法:回顾性分析2022年10月至2023年11月于六安市人民医院住院治疗的104例肺炎支原体(MP)感染患儿,采集所有患儿的咽拭子样本,应用药敏试验检测常用抗... 目的:探究23S rRNA基因检测在儿童肺炎支原体肺炎(MPP)大环内酯类药物耐药中的作用。方法:回顾性分析2022年10月至2023年11月于六安市人民医院住院治疗的104例肺炎支原体(MP)感染患儿,采集所有患儿的咽拭子样本,应用药敏试验检测常用抗菌药物对MP的敏感性,观察并分析MPP患儿的耐药情况,根据药敏试验结果将患儿分为耐药组与非耐药组,同时采用实时荧光定量PCR法(RT-qPCR)检测MP-DNA载量,并对其与抗菌药物耐药性的关系进行分析,应用PCR基因测序对23S rRNAⅤ区2063位点基因进行检测,并对2063位点基因型与抗菌药物耐药性的关系进行分析,同时对23S rRNAⅤ区2063位点基因型与MP-DNA载量的关系进行对比分析。结果:检测结果显示,MP在大环内酯类抗菌药物中的耐药性较高,其中在红霉素与罗红霉素药物中的耐药性最高,分别为71.15%、73.08%,阿奇霉素、克拉霉素、乙酰螺旋霉素、克林霉素、耐药率分别为25.00%、34.62%、52.88%、55.77%,在喹诺酮类抗菌药物中的耐药性较低,分别为3.85%、2.88%、0.00%;阿奇霉素、红霉素、克拉霉素以及克林霉素耐药组患儿MP-DNA载量指数明显较该抗菌药物非耐药组患儿更低(P<0.05);通过分析得出,23S rRNA基因2063位点基因突变对大环内酯类抗菌药物耐药产生了显著影响,通过对大环内酯类抗菌药物耐药的病例分析得出,2063位点基因G型突变率>60%;突变型基因组患儿MP-DNA的载量指数较野生型基因组更低(P<0.05)。结论:大环内酯类抗菌药物在治疗MP感染患儿中表现出较高的耐药性,其中23S rRNAⅤ区2063基因位点突变与MP耐药具有密切关联,因此,MP 23S rRNA基因测序能够作为临床治疗MPP患儿时进行耐药检测的有效手段,并为其合理使用抗菌药物提供参考。 展开更多
关键词 23s rRNA基因 儿童 肺炎支原体 大环内酯类 抗菌药物 耐药性
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肺炎支原体感染患儿23S rRNA基因位点突变情况及其与咽拭子MP-DNA载量、临床症状的相关性
7
作者 吴秀娟 菅辉玲 +2 位作者 金桂荣 韩娜 潘君瑶 《中外医药研究》 2025年第27期154-156,共3页
目的:分析肺炎支原体(MP)感染患儿23S rRNA基因位点突变情况及其与咽拭子MP-DNA载量、临床症状的相关性。方法:回顾性分析2024年3月1日—2025年6月1日克拉玛依市中心医院收治的150例MP感染患儿的临床资料。根据23S rRNA基因位点突变情... 目的:分析肺炎支原体(MP)感染患儿23S rRNA基因位点突变情况及其与咽拭子MP-DNA载量、临床症状的相关性。方法:回顾性分析2024年3月1日—2025年6月1日克拉玛依市中心医院收治的150例MP感染患儿的临床资料。根据23S rRNA基因位点突变情况将患儿分为突变组(n=88)和未突变组(n=62),比较两组患儿临床资料,分析23S rRNA基因位点突变与咽拭子MP-DNA载量及临床症状的相关性。结果:150例MP感染患儿中,88例患儿发生23S rRNA基因位点突变,其中85例为2063位点突变,3例为2064位点突变。两组白细胞计数、C反应蛋白(CRP)、乳酸脱氢酶、降钙素原、MP-DNA载量、肺实变、重症肺炎支原体肺炎(MPP)情况与发热及住院时间比较,差异有统计学意义(P<0.05)。Spearman相关性分析结果显示,23S rRNA基因位点突变与CRP水平、MP-DNA载量、重症MPP、发热时间及住院时间呈正相关(P<0.001)。结论:MP感染患儿易发生23S rRNA基因位点突变,以2063位点突变居多,23S rRNA基因位点突变与患儿CRP水平、MPDNA载量、重症MPP、发热时间及住院时间相关。 展开更多
关键词 肺炎支原体 23s rRNA基因位点突变 DNA载量 相关性
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肺炎支原体23S rRNA耐药基因与肺炎支原体肺炎患儿肺功能的相关性 被引量：1
8
作者 王培文 魏红艳 《新乡医学院学报》 2025年第2期128-132,共5页
目的探讨23S rRNA耐药基因与肺炎支原体肺炎(MPP)患儿肺功能、临床特征的相关性。方法选择2022年1月至2023年10月沧州市人民医院儿科收治的85例MPP患儿为研究对象。根据23S rRNA耐药基因检测结果将患儿分为阳性组(n=43)和阴性组(n=42)... 目的探讨23S rRNA耐药基因与肺炎支原体肺炎(MPP)患儿肺功能、临床特征的相关性。方法选择2022年1月至2023年10月沧州市人民医院儿科收治的85例MPP患儿为研究对象。根据23S rRNA耐药基因检测结果将患儿分为阳性组(n=43)和阴性组(n=42)。比较2组患儿的临床症状、体征、住院时间、并发症、影像学特征及肺功能指标,并分析患儿肺功能指标与23S rRNA耐药基因的相关性。结果85例MPP患儿肺炎支原体23S rRNA耐药基因阳性者43例,阳性率为50.59%。2组患儿咳嗽、发热、气促及寒战发生情况比较差异无统计学意义(χ^(2)=1.036、0.903、0.567、0.171,P>0.05);阳性组患儿呼吸音减弱占比显著高于阴性组(χ^(2)=11.318,P<0.05)。阳性组患儿的住院时间显著长于阴性组(P<0.05)。阳性组患儿神经系统、消化系统并发症发生率显著高于阴性组(χ^(2)=4.814、4.9300x09,P<0.05);2组患儿心血管系统、血液系统及泌尿系统并发症发生率比较差异无统计学意义(χ^(2)=0.668、1.325、0.188,P>0.05)。阳性组患儿肺部病变的影像学特征肺不张、胸腔积液及肺实变率显著高于阴性组(χ^(2)=10.577、7.043、15.568,P<0.05);2组患儿肺坏死率比较差异无统计学意义(χ^(2)=1.001,P>0.05)。阳性组患儿肺功能指标潮气量(VT)、呼气峰流速时间占呼气时间比值(tPTEF/TE)及呼出75%潮气量时的瞬间流速与潮气呼气峰流速比(TEF25/PTEF)显著低于阴性组(P<0.05)。相关性分析结果显示,23S rRNA耐药基因阳性与MPP患儿肺功能指标VT、tPTEF/TE及TEF25/PTEF呈负相关(r=-0.571、-0.592、-0.520,P<0.05)。结论23S rRNA耐药基因阳性与MPP患儿肺功能呈负相关,耐药基因阳性可能会加重MPP患儿的肺功能损害,延长病程。 展开更多
关键词 肺炎支原体肺炎 肺功能 23s rRNA耐药基因 大环内酯类抗生素 耐药性
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23S rRNA基因突变对儿童肺炎支原体肺炎病情程度及大环内酯类抗生素耐药的影响
9
作者 高佳英 侯欢 何月贤 《妇儿健康导刊》 2025年第23期76-79,共4页
目的分析23S rRNA基因突变对儿童肺炎支原体肺炎(MPP)病情程度及大环内酯类抗生素(MA)耐药的影响。方法选取合肥医科大学第五附属(珠海)医院2023年4月至2025年4月收治的278例MPP患儿,根据肺炎支原体(MP)是否发生23S rRNA突变分为突变型... 目的分析23S rRNA基因突变对儿童肺炎支原体肺炎(MPP)病情程度及大环内酯类抗生素(MA)耐药的影响。方法选取合肥医科大学第五附属(珠海)医院2023年4月至2025年4月收治的278例MPP患儿,根据肺炎支原体(MP)是否发生23S rRNA突变分为突变型组和野生型组,比较两组的一般资料、病情程度和MA耐药情况。结果23S rRNA突变型占45.32%(126/278),野生型占54.68%(152/278)。与野生型组比较,突变型组的发热、咳嗽、住院时间较长,MP-DNA载量、白细胞计数、中性粒细胞与淋巴细胞比值、C反应蛋白、白细胞介素-6、降钙素原、乳酸脱氢酶水平较高,差异有统计学意义(P<0.05)。突变型组的MA耐药率高于野生型组,且G型突变对红霉素、吉他霉素的耐药率高于C型和T型突变,差异有统计学意义(P<0.05)。结论23S rRNA基因突变可引起MA耐药,影响儿童MPP的病情程度。 展开更多
关键词 儿童肺炎支原体肺炎 大环内酯类抗生素 肺炎支原体 23s rRNA基因突变 耐药性
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16S rRNA、23S rRNA及16S～23S rRNA基因在细菌分离与鉴定中的应用 被引量：30
10
作者 李鹏 马艳娇 赵云 《现代畜牧兽医》 2008年第7期49-52,共4页
在细菌的进化过程中,rRNA结构既具保守性又具高变性。保守性反映生物物种的亲缘关系,高变性则揭示生物物种的特征核酸序列,rRNA是属种鉴定的分子基础。因此,可以利用保守区设计通用引物扩增细菌的相应靶序列,再利用可变区的差异鉴别菌... 在细菌的进化过程中,rRNA结构既具保守性又具高变性。保守性反映生物物种的亲缘关系,高变性则揭示生物物种的特征核酸序列,rRNA是属种鉴定的分子基础。因此,可以利用保守区设计通用引物扩增细菌的相应靶序列,再利用可变区的差异鉴别菌种。文章就16S rRNA、23S rRNA和16S～23S rRNA基因在细菌分离与鉴定中的应用做以下综述。 展开更多
关键词 16S RRNA基因 23s RRNA基因 16S^23s RRNA基因 细菌
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不同动物种源肺炎克雷伯氏菌分离株23S rRNA序列分析 被引量：12
11
作者 钟世勋 王迪 +5 位作者 曲亭合 潘德琴 黄璇 李奕芙 邵明旭 朱瑞良 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期937-939,共3页
为分析动物种源肺炎克雷伯氏菌分离株（K．p妇）的进化特点，本研究通过PCR扩增不同动物种源K．pn的23SrRNA基因片段，克隆测序，进行BLAST比对；构建K-pm菌株的系统进化树。结果显示，本实验室保存的12株K．p力核苷酸序列与GenBank收录... 为分析动物种源肺炎克雷伯氏菌分离株（K．p妇）的进化特点，本研究通过PCR扩增不同动物种源K．pn的23SrRNA基因片段，克隆测序，进行BLAST比对；构建K-pm菌株的系统进化树。结果显示，本实验室保存的12株K．p力核苷酸序列与GenBank收录的X87284株K-pm核苷酸序列同源性为96．8％～99．0％，而与沙门氏菌和奇异变形杆菌同源性只有90．0％～92．7％；8株毛皮动物K．加核苷酸序列同源性为98．1％～99．9％，与猪源、鸡源K．p力的核苷酸序列同源性分别为95．5％～98．1％、96．7％～97．9％；猪源与鸡源K．pn的核苷酸序列同源性为95．9％～97．4％。结果表明，不同动物种源K-pn23SrRNA基因序列同源性差异明显，具有种属的特异性，23SrRNA基因序列可以作为鉴定K-pm的一种快速、简便的方法。 展开更多
关键词 肺炎克雷伯氏菌 23s RRNA 同源性 进化 基因分析
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山羊奇异变形杆菌分离鉴定及其16S-23SrRNAISR序列RFLP分析 被引量：7
12
作者 崔国林 钟世勋 +2 位作者 杨世发 左雪梅 朱瑞良 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第6期919-924,共6页
2012年初,山东菏泽某羊场的羊群发病,从发病羊器官分离到2株病原细菌。对病原细菌进行鉴定,并对其与已知同种异源菌株相似性差异进行分析。从患病山羊内脏器官分离细菌,经形态特征、培养特性、生化试验、血清学试验及致病性试验进行鉴定... 2012年初,山东菏泽某羊场的羊群发病,从发病羊器官分离到2株病原细菌。对病原细菌进行鉴定,并对其与已知同种异源菌株相似性差异进行分析。从患病山羊内脏器官分离细菌,经形态特征、培养特性、生化试验、血清学试验及致病性试验进行鉴定;再通过设计通用引物扩增16S-23SrRNA ISR(intergenic spacer region)序列,将PCR产物经HinfⅠ单酶切获得3条可视条带,同时对扩增条带中的主带测序并进行系统发育分析。结果表明,分离菌株为奇异变形杆菌;分离菌株同本实验室保存的兔源与鸡源奇异变形杆菌PCR-RFLP结果一致;分离菌株PCR产物同GenBank收录的HI4320株奇异变形杆菌及本实验室保存的兔源与鸡源奇异变形杆菌进行序列比较,分离羊源菌株与兔源菌株相似性为94.8%、与鸡源菌株相似性为96.0%～98.2%,与人源HI4320株相似性为96.9%。研究证实发病羊致病病原为奇异变形杆菌,其与鸡源、兔源和人源奇异变形杆菌的亲缘关系较近。 展开更多
关键词 山羊 奇异变形杆菌 16S-23s rRNA ISR PCR-RFLP 系统发育分析
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3种水产病原弧菌(Vibrio)的16S—23S rDNA间区(IGSs)的克隆、测序与分析 被引量：9
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作者 邓先余 王智学 +1 位作者 孙成波 何建国 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2006年第2期162-170,共9页
根据细菌16S rDNA3端和23S rDNA5端的高度保守区设计引物,PCR扩增了5株溶藻弧菌、2株河流弧菌和2株创伤弧菌的16S—23S rDNA间区,克隆到pGEM-T载体上,测序;采用BLAST和DNAstar软件对16S—23S rDNA间区序列及其内的tRNA基因进行比较分析... 根据细菌16S rDNA3端和23S rDNA5端的高度保守区设计引物,PCR扩增了5株溶藻弧菌、2株河流弧菌和2株创伤弧菌的16S—23S rDNA间区,克隆到pGEM-T载体上,测序;采用BLAST和DNAstar软件对16S—23S rDNA间区序列及其内的tRNA基因进行比较分析研究。结果表明,3种弧菌共测出的16S—23S rDNA间区有33条,类型有6种:IGSGLAV、IGSGLV、IGSIA、IGSG、IGSA和IGS0,其中IGSIA和IGSG最为常见,9株弧菌均包含有此两类IGS;在3种弧菌中,大部分IGS序列tRNA基因两端的非编码区具有较高的种内同源性,可以成为设计种特异性引物和探针的靶区。16S—23S rDNA间区结构的差异为建立一类新的弧菌检测方法奠定了基础。溶藻弧菌的16S—23S rDNA间区序列为首次报道。 展开更多
关键词 溶藻弧菌 河流弧菌 创伤弧菌 16S-23s RDNA间区 TRNA基因
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利用16S-23S rDNA RFLP及16S rRNA基因序列分析方法对湖北省饭豆(Vigna umbellata L.)根瘤菌系统发育的研究 被引量：7
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作者 潘峰 王平 +2 位作者 胡正嘉 何绍江 冯新梅 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期78-82,共5页
采用16S-23S rDNA间隔区段(IGS)PCR-RFLP与16S rRNA基因部分序列分析的方法对饭豆根瘤菌进行了遗传多样性及系统发育分析.由16S-23S rDNA IGS PCR-RFLP分析可知,所有菌株在52%的相似性水平上聚在一起,形成了慢生型菌群与快生型菌群这两... 采用16S-23S rDNA间隔区段(IGS)PCR-RFLP与16S rRNA基因部分序列分析的方法对饭豆根瘤菌进行了遗传多样性及系统发育分析.由16S-23S rDNA IGS PCR-RFLP分析可知,所有菌株在52%的相似性水平上聚在一起,形成了慢生型菌群与快生型菌群这两大菌群.群Ⅰ中,在79%相似性的水平上分为ⅠA与ⅠB两个分支.群Ⅱ中,在62%相似性的水平上分为ⅡA与ⅡB两个分支,分支ⅡA在72%的相似性水平上进一步分为ⅡA1、ⅡA2和ⅡA3三簇;分支ⅡB中的饭豆根瘤菌与标准菌株USDA205T聚在一起,表现的差异并不大.由16SrRNA基因部分序列分析结果可知,供试的4个代表菌株分别位于不同的系统发育分支中.CYR4243与Sinorhizobium fredii的模式菌株USDA205T的序列相似性达到了99.87%.HCY1101与Rhizobium leguminosarum中的三叶草生物型(bv.trifolii)和豌豆生物型(bv.viceae)这两个生物型的参比菌株亲缘关系最近,序列相似性为100%.HCY5202与R.galegae亲缘关系最近,序列相似性为99.86%.CYY3302与Bradyrhizobium elkanii的参比菌株USDA86有最近的亲缘关系,序列相似性近似于100%. 展开更多
关键词 根瘤菌 16S-23s RDNA IGS PCR—RFLP 16S rRNA基因 系统发育 饭豆
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奇异变形杆菌分离株23S rRNA序列分析 被引量：5
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作者 王慧 朱瑞良 +5 位作者 朱明华 谭燕玲 孙振红 魏凯 盛鹏程 王新建 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期476-479,共4页
通过PCR反应扩增7株鸡奇异变形杆菌和1株兔奇异变形杆菌的23SrRNA基因片段(1045bp),经克隆测序,用DNA Star分析软件将所获得的序列与GenBank中收录的奇异变形杆菌、普通变形杆菌以及其他相近属的23S rRNA基因序列进行同源性比较,并由此... 通过PCR反应扩增7株鸡奇异变形杆菌和1株兔奇异变形杆菌的23SrRNA基因片段(1045bp),经克隆测序,用DNA Star分析软件将所获得的序列与GenBank中收录的奇异变形杆菌、普通变形杆菌以及其他相近属的23S rRNA基因序列进行同源性比较,并由此构建奇异变形杆菌系统进化发生树。结果表示,本实验室保存的7株鸡奇异变形杆菌核苷酸序列与GenBank中收录的奇异变形杆菌核苷酸序列同源性为99.4%～99.8%,与兔奇异变形杆菌核苷酸序列同源性为98.8%～99.3%,与普通变形杆菌的核苷酸序列同源性为95.4%～96.2%,而与其他相近属同源性只有92.9%～93.4%。结果表明,23S rRNA基因序列分析可以作为鉴定奇异变形杆菌的一种快速、简便的方法。 展开更多
关键词 奇异变形杆菌 23s RRNA PCR 同源性 进化 分析
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3株杂色鲍致病菌——副溶血弧菌的16S-23S rDNA间区序列的分析 被引量：14
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作者 邓先余 王智学 何建国 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第3期304-308,共5页
以细菌的 1 6SrDNA 3′端和 2 3SrDNA 5′端的高度保守区为引物 ,扩增了 3株杂色鲍致病菌—副溶血弧菌(Vibrioparahaemolyticus)的 1 6S 2 3SrDNA间区 ,克隆到pGEM T载体上 ,测序。用BLAST和DNAstar软件对 1 6S 2 3SrDNA间区序列及其内... 以细菌的 1 6SrDNA 3′端和 2 3SrDNA 5′端的高度保守区为引物 ,扩增了 3株杂色鲍致病菌—副溶血弧菌(Vibrioparahaemolyticus)的 1 6S 2 3SrDNA间区 ,克隆到pGEM T载体上 ,测序。用BLAST和DNAstar软件对 1 6S 2 3SrDNA间区序列及其内的tRNA基因进行比较分析。结果表明副溶血弧菌ZSU0 0 8和ZSU0 0 9测出的 1 6S 2 3SrDNA间区均有 6条 ,间区类型也相同 ,分别为IGSGLAV 、IGSGLV、IGSAG、IGSIA、IGSG 和IGS0 。其中IGSGLAV最大 ,包含tRNAGlu、tR NALys、tRNAAla和tRNAVal基因 ;IGSGLV包含tRNAGlu、tRNALys和tRNAVal基因 ;IGSAG包含tRNAAla和tRNAGlu基因 ;IGSIA,则为tRNAIle和tRNAAla基因 ;IGSG 仅包含tRNAGlu基因 ;而IGS0 最小 ,未包含任何tRNA。菌株ZSU0 1 0测出的 1 6S 2 3SrDNAIGS序列有 5条 ,除缺少IGSAG 外 ,其余的IGS类型均与ZSU0 0 8和ZSU0 0 9相同。与GenBank内的副溶血弧菌IGS序列比较 ,发现副溶血弧菌所有类型的IGS的tRNA基因两端的非编码区具有较高的种内同源性。 1 6S 2 3SrDNA间区结构的差异为建立一种新的副溶血弧菌检测方法奠定了基础。 展开更多
关键词 副溶血弧菌 16S-23s RDNA间区 TRNA基因
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利奈唑胺体外诱导粪肠球菌耐药株23S rRNA V区基因突变位点分析 被引量：10
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作者 李多云 余治健 +6 位作者 徐俊 刘晓军 邓名贵 潘伟光 郑金鑫 陈重 邓启文 《中国病原生物学杂志》 CSCD 北大核心 2014年第4期316-317,375,共3页
目的阐明体外诱导利奈唑胺耐药粪肠球菌的核糖体23SrRNA V区基因位点变异特征。方法收集1株血流感染的粪肠球菌和1株粪肠球菌质控菌ATCC29212(编号分别为F3和F4菌株,均为利奈唑胺敏感株),通过体外浓度倍增法诱导利奈唑胺耐药;挑取单克隆... 目的阐明体外诱导利奈唑胺耐药粪肠球菌的核糖体23SrRNA V区基因位点变异特征。方法收集1株血流感染的粪肠球菌和1株粪肠球菌质控菌ATCC29212(编号分别为F3和F4菌株,均为利奈唑胺敏感株),通过体外浓度倍增法诱导利奈唑胺耐药;挑取单克隆,经E-test条测定MIC值,获得各菌株的耐药浓度梯度;提取耐药菌株基因组DNA,PCR扩增23SrRNA V区基因,扩增产物经测序后与野生株比较,获得V区的突变位点。结果经体外多步法诱导利奈唑胺耐药的不同MIC值粪肠球菌共13株。PCR测序分析2株母株均无变异位点,23SrRNA V区的突变位点主要是G2576U,此外还有T2504A、G2505A、C2610A、C2424U。结论体外多步法可诱导粪肠球菌利奈唑胺耐药,耐药机制与23SrRNA V区位点突变密切相关,突变位点随着MIC值的增高而增多。 展开更多
关键词 粪肠球菌 利奈唑胺耐药 23s核糖体RNA基因
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奇异变形杆菌、洛菲氏不动杆菌16s rRNA3’-23s rRNA 5’间序列的克隆及测序 被引量：5
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作者 石磊 沈宜 +2 位作者 顾大勇 王华 周元国 《重庆医科大学学报》 CAS CSCD 2006年第6期783-786,835,共5页
目的:对奇异变形杆菌、洛菲氏不动杆菌16s rRNA 3’~23s rRNA 5’间序列(16S^23S rRNA intergenic spacer region,ISR)进行克隆测序,为分子探针技术鉴定两菌奠定基础。方法:针对临床常见致病菌16s rRNA 3’~23s rRNA 5’间序列两端的16S... 目的:对奇异变形杆菌、洛菲氏不动杆菌16s rRNA 3’~23s rRNA 5’间序列(16S^23S rRNA intergenic spacer region,ISR)进行克隆测序,为分子探针技术鉴定两菌奠定基础。方法:针对临床常见致病菌16s rRNA 3’~23s rRNA 5’间序列两端的16S及23S rRNA保守序列设计PCR扩增的通用引物,对两菌进行扩增,利用PMD-18TVector质粒对两菌的PCR产物进行T载体克隆构建,测序后申报Genbank。结果:两菌的通用引物扩增产物构建的T载体克隆,测序结果经Blast分析,确定为两菌的ISR序列,申报Genbank获得接收。结论:成功的对奇异变形杆菌、洛菲氏不动杆菌ISR序列进行了克隆测序,该序列可以用于两种菌的通用引物PCR扩增技术鉴定。 展开更多
关键词 奇异变形杆菌 洛菲氏不动杆菌 16s^23s rRNA间区 T载体
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一株嗜水气单胞菌Aeromonas hydrophila的16S-23S rDNA间区序列分析及应用 被引量：4
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作者 邓先余 王智学 +1 位作者 叶巧真 何建国 《中山大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2004年第4期74-78,共5页
根据细菌的16SrDNA3′端和23SrDNA5′端的高度保守区设计引物,扩增了一株中华鳖Trionyxsinensis"红板病"病原菌嗜水气单胞菌的16S-23SrDNA间区,克隆到pGEM＿T载体上,测序。用BLAST和DNAstar软件对16S-23SrDNA间区序列以及其内... 根据细菌的16SrDNA3′端和23SrDNA5′端的高度保守区设计引物,扩增了一株中华鳖Trionyxsinensis"红板病"病原菌嗜水气单胞菌的16S-23SrDNA间区,克隆到pGEM＿T载体上,测序。用BLAST和DNAstar软件对16S-23SrDNA间区序列以及其内tRNA基因与已发表的嗜水气单胞菌和近缘种的IGSG序列进行比较分析,设计出对嗜水气单胞菌特异的PCR引物,建立了检测嗜水气单胞菌的PCR方法,进行了特异性、灵敏性检测,并用此方法检测了不同的水样。 展开更多
关键词 嗜水气单胞菌 16S-23s RDNA间区 tRNA^Clu基因 特异性 灵敏性
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16S-23S rDNA间隔区在奶牛乳房炎诊断中的应用 被引量：13
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作者 曹随忠 杜立新 赵兴绪 《中国畜牧兽医》 CAS 2005年第2期26-27,共2页
以 16 S- 2 3S r DNA间隔区为扩增靶序列的 PCR技术是近年来发展的细菌分类和鉴定新方法 ,具有快速、敏感和特异性高的优点。作者综述了细菌 16 S- 2 3S r DNA间隔区序列的特性及其在奶牛乳房炎病原诊断中的应用等研究进展。
关键词 16S-23s rDNA间隔区 乳房炎 奶牛 PCR
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