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DNASE1L3 Mediates Hepatocellular Carcinoma Tumor Growth and Organoid Models via the Wnt/β-Catenin Signaling Pathway
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作者 Shulong Zhang Yijun Zhao +5 位作者 Li Geng Feihong Song Li Feng Jun Jiang Qianqian Cai Fei Fan 《Oncology Research》 2026年第3期691-724,共34页
Background:Hepatocellular carcinoma(HCC)is a highly lethal malignancy driven by both intrinsic oncogenic pathways and immune microenvironmental regulation.Emerging evidence suggests that DNASE1L3 may influence tumor b... Background:Hepatocellular carcinoma(HCC)is a highly lethal malignancy driven by both intrinsic oncogenic pathways and immune microenvironmental regulation.Emerging evidence suggests that DNASE1L3 may influence tumor biology and immune responses;however,its specific roles in HCC progression and macrophage-mediated regulation remain unclear.This study aimed to elucidate the biological functions of DNASE1L3 in HCC and to determine how it modulates tumor behavior and immune interactions.Methods:Bioinformatics analyses of the GSE41804 and Cancer Genome Atlas-Liver Hepatocellular Carcinoma(TCGA-LIHC)datasets were used to identify hub genes.Functional assays assessed the impact of DNASE1L3 on HCC cell proliferation,migration,invasion,and cell cycle progression.The effects of DNASE1L3 on macrophage polarization and the Wnt/β-catenin signaling pathway were examined using a co-culture system.An HCC organoid model was established to further validate its regulatory function.Results:Eight prognostic signature genes were identified,with deoxyribonuclease I-like 3(DNase I-like 3)selected as the hub gene.DNASE1L3 overexpression suppressed HCC cell growth,inhibited migration and invasion,induced G1 arrest,and modulated epithelial-mesenchymal transition(EMT)markers.DNASE1L3 knockdown promoted M2-like macrophage polarization.Mechanistically,DNASE1L3 interacted withβ-catenin to enhance its ubiquitination and degradation,thereby inhibiting Wnt/β-catenin signaling and reducing PD-L1 expression.DNASE1L3 overexpression similarly restricted organoid growth and suppressed pathway activity.Conclusion:DNASE1L3 acts as a negative regulator of HCC progression by targeting the Wnt/β-catenin pathway and reducing PD-L1 expression,thereby influencing both tumor cell behavior and macrophage-mediated immune responses. 展开更多
关键词 Hepatocellular carcinoma DNASE1l3 Wnt/β-catenin signaling pathway organoid models tumor growth
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红花来源纳米囊泡通过调控SIPA1L2泛素化促进内皮细胞自噬 被引量:1
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作者 罗烨 杨灵 +2 位作者 陈俊羽 翁建新 柯晓 《中国病理生理杂志》 北大核心 2025年第2期303-310,共8页
目的:探讨红花来源纳米囊泡(Carthamus tinctorius L.-derived nanovesicles,CDNVs)在氧化型低密度脂蛋白(oxidized low-density lipoprotein,ox-LDL)介导的内皮细胞损伤中的保护作用及其调节机制。方法:体外培养人脐静脉内皮细胞(HUVEC... 目的:探讨红花来源纳米囊泡(Carthamus tinctorius L.-derived nanovesicles,CDNVs)在氧化型低密度脂蛋白(oxidized low-density lipoprotein,ox-LDL)介导的内皮细胞损伤中的保护作用及其调节机制。方法:体外培养人脐静脉内皮细胞(HUVECs),用ox-LDL诱导内皮细胞损伤模型;分为正常对照(normal control,NC)组、oxLDL组(HUVECs加入100 mg/L ox-LDL处理24 h构建内皮细胞损伤模型或内皮细胞炎症模型)和CDNVs+ox-LDL组(先加入40 mg/L CDNVs处理1 h后再加入100 mg/L ox-LDL共培养24 h。采用EdU增殖染色实验观察HUVECs增殖情况;采用细胞凋亡实验检测HUVECs的凋亡水平;RT-qPCR检测信号诱导增殖相关蛋白1样蛋白2(signal-induced proliferation-associated 1-like protein 2,SIPA1L2)mRNA的表达变化;Western blot实验检测自噬蛋白及SIPA1L2蛋白表达水平的变化;免疫共沉淀检测SIPA1L2的泛素化程度。结果:(1)成功分离提纯CDNVs,其鉴定为类圆形、具有双层膜结构的纳米级别囊泡;(2)CDNVs可促进ox-LDL干预下HUVECs的增殖水平(P<0.05),并抑制凋亡(P<0.05);(3)CDNVs可抑制ox-LDL干预下HUVECs的SIPA1L2蛋白表达水平(P<0.05),并促进其自噬(P<0.05);(4)CDNVs促进SIPA1L2蛋白泛素化,并通过泛素-蛋白酶体途径降低SIPA1L2的蛋白水平(P<0.05)。结论:CDNVs通过介导SIPA1L2泛素化促进内皮细胞自噬而发挥保护作用。 展开更多
关键词 红花 纳米囊泡 自噬 SIPA1l2蛋白 泛素化
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青鳉eef1a1l3基因的表达特征及抗体制备
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作者 黄岩 林淑婷 +2 位作者 邓菊 梁晶婕 陈天圣 《淡水渔业》 北大核心 2025年第1期60-68,共9页
青鳉(Oryzias latipes)是研究性别分化和生殖调控的重要模式鱼类,前期通过青鳉性腺转录组发现eef1a1l3 mRNA在卵巢中高表达,而在精巢几乎不表达,推测其参与性别分化和卵巢发育的调控。生物信息学分析显示,Eef1a1l3蛋白在硬骨鱼类中非常... 青鳉(Oryzias latipes)是研究性别分化和生殖调控的重要模式鱼类,前期通过青鳉性腺转录组发现eef1a1l3 mRNA在卵巢中高表达,而在精巢几乎不表达,推测其参与性别分化和卵巢发育的调控。生物信息学分析显示,Eef1a1l3蛋白在硬骨鱼类中非常保守。为探究eef1a1l3基因的功能,通过半定量PCR(SqRT-PCR)绘制了eef1a1l3基因在不同组织和早期不同发育时期的表达谱。通过抗原选取、原核表达、蛋白纯化以及动物免疫实验获取Eef1a1l3多克隆抗体,并对该抗体进行了特异性的检测以及效价的鉴定。结果显示,eef1a1l3 mRNA在成体组织中仅在卵巢特异表达,在早期胚胎发育阶段呈现母源性表达。制备的Eef1a1l3多克隆抗体与抗原结合的最大稀释倍数为1∶64000,显示出良好的免疫原性,并且Eef1a1l3蛋白在青鳉性腺中的卵巢而非精巢中有表达,这与mRNA表达模式一致。综上,eef1a1l3基因可能是早期胚胎发育和卵巢发育的重要调控因子,并且制备的Eef1a1l3多克隆抗体可以应用于青鳉及其他硬骨鱼类eef1a1l3基因功能的相关研究。 展开更多
关键词 青鳉(Oryzias latipes) eef1a1l3基因 多克隆抗体 表达模式 性别分化
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缺失F1L对重组复制缺陷痘苗病毒天坛株在小鼠中免疫原性与免疫保护效果的影响 被引量:1
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作者 刘士元 任皎 +7 位作者 赵莉 吴依依 刘冠雅 韩一泽 黄保英 王文玲 田厚文 谭文杰 《病毒学报》 北大核心 2025年第2期334-343,共10页
痘苗病毒(Vaccinia virus,VACV)广泛用于疫苗与重组病毒载体。国内拥有自主知识产权的复制缺陷型痘苗病毒天坛株(Non-replicating Tiantan strain Vaccinia virus,NTV)作为新型猴痘疫苗近期已获得临床试验批准。前期研究中,本课题组通... 痘苗病毒(Vaccinia virus,VACV)广泛用于疫苗与重组病毒载体。国内拥有自主知识产权的复制缺陷型痘苗病毒天坛株(Non-replicating Tiantan strain Vaccinia virus,NTV)作为新型猴痘疫苗近期已获得临床试验批准。前期研究中,本课题组通过回插基因C7L获得了重组病毒NTV-C7L(J),然而该重组病毒的免疫原性未得到明显改善,迫切需要进一步改进。本研究利用同源重组技术对NTV-C7L(J)进行了二次基因改造,构建了缺失F1L基因的重组病毒NTV-ΔF1L-C7L(J)。BALB/c小鼠免疫结果表明,105 PFU免疫剂量二次肌肉注射,NTV-ΔF1L-C7L(J)可诱导出较强体液免疫反应和CD8^(+)T细胞反应,其水平明显高于NTV与NTV-C7L(J)免疫组。与2×10^(5) PFU剂量复制型痘苗病毒天坛株(Vaccinia virus Tiantan strain,VTT)组尾部划痕单剂免疫组相比,NTV-ΔF1L-C7L(J)抗体应答低但细胞免疫反应强。初次免疫后第42d采用致死剂量(107 PFU)VACV WR株进行小鼠滴鼻攻毒,NTV-ΔF1L-C7L(J)加强免疫组与VTT单剂免疫组均可提供完全保护,且攻毒后前者小鼠体重保护明显优于后者;但NTV与NTV-C7L(J)免疫组仅呈现部分保护(分别为60%和90%)。研究结果表明∶F1L基因的缺失明显提高了NTV及NTV-C7L(J)的免疫原性与免疫保护效果,且安全性优于VTT。本研究为开发新型痘苗病毒载体及更加安全高效阻断猴痘的疫苗提供了新思路和实验依据。 展开更多
关键词 痘苗病毒 天坛株 复制缺陷 F1l 免疫原性 保护
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猪circYME1L1的鉴定及在脂质代谢中的功能预测 被引量:1
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作者 常乐彬 王冰洁 +9 位作者 王畅 刘贤 李新建 王腾飞 王春秀 李秀领 余彤 王克君 柏峻 韩雪蕾 《河南农业大学学报》 北大核心 2025年第6期1018-1027,共10页
【目的】对猪circYME1L1的环状结构进行鉴定,并利用生物信息学对其功能进行预测和分析,为进一步探讨circYME1L1在脂质代谢中的作用提供参考依据。【方法】基于前期成年期大白猪和确山黑猪背最长肌的全转录组测序数据,以筛选到的环状RNA(... 【目的】对猪circYME1L1的环状结构进行鉴定,并利用生物信息学对其功能进行预测和分析,为进一步探讨circYME1L1在脂质代谢中的作用提供参考依据。【方法】基于前期成年期大白猪和确山黑猪背最长肌的全转录组测序数据,以筛选到的环状RNA(circYME1L1)作为研究对象,通过Sanger测序、RNase R消化试验和亚细胞定位试验,对其环状结构、稳定性和细胞内分布情况进行鉴定和分析,同时利用miRanda和TargetScan预测cir⁃cYME1L1可能互作的miRNA及其下游靶基因,并对其进行基因本体(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析。【结果】猪circYME1L1是由YME1L1基因的9~11外显子环化形成的环状RNA分子,具有抗RNase R酶降解的特性,且主要存在于细胞质中,并在器官或组织中广泛表达,其中,在脂肪、肺脏和肾脏中显著高于其他器官或组织。生物信息学分析结果显示,circYME1L1与AGO、CELF2和PTBP1等蛋白质存在多个结合位点;通过构建circYME1L1-miRNA-mRNA调控网络,鉴定出3个靶向miRNA(ssc-miR-31、ssc-miR-149和ssc-miR-532-3p)及其下游靶向的226个基因;GO功能富集分析显示,cir⁃cYME1L1的靶基因主要富集到能量代谢、生长因子活性和RNA聚合酶的正向调控等条目;KEGG通路富集分析显示,circYME1L1的靶基因显著富集到PI3K-Akt信号通路、MAPK信号通路和脂肪消化与吸收等与脂质代谢相关的通路。此外,circYME1L1可能作为竞争性内源RNA(competing endogenous RNAs,ceRNA)网络调控脂质代谢相关的基因表达。【结论】猪circYME1L1在体内稳定存在,且具有参与调控脂质代谢等潜在的生物学作用。 展开更多
关键词 亚细胞定位 circYME1l1 靶基因预测 脂质代谢
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DOT1L敲除的鸡胚成纤维细胞系构建及其对ALV-J复制和细胞信号通路的影响
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作者 余莫涵 王鑫妍 +4 位作者 蔡清清 王佳兴 高琦 常国斌 陈世豪 《中国家禽》 北大核心 2025年第8期1-10,共10页
研究旨在通过CRISPR-Cas9技术构建DOT1L基因敲除的鸡胚成纤维细胞系(DF-1),并分析DOT1L基因敲除对J亚群禽白血病病毒(ALV-J)复制及其细胞信号通路的影响,也为后续进一步研究DOT1L的生物学功能提供生物材料。研究首先利用CRISPR/Cas9基... 研究旨在通过CRISPR-Cas9技术构建DOT1L基因敲除的鸡胚成纤维细胞系(DF-1),并分析DOT1L基因敲除对J亚群禽白血病病毒(ALV-J)复制及其细胞信号通路的影响,也为后续进一步研究DOT1L的生物学功能提供生物材料。研究首先利用CRISPR/Cas9基因编辑技术构建DOT1L基因敲除的DF-1细胞系,分析野生型和敲除细胞对ALV-J复制的影响,再通过转录组测序技术对敲除细胞与野生型细胞的基因表达谱进行了差异分析。结果显示:设计的sgRNA均具有T7E1酶切割活性且sgRNA-1切割活性最高。DNA测序显示,筛选DOT1L敲除的阳性细胞外显子区域分别缺失2个和4个碱基,导致移码突变产生。Western blot验证DOT1L基因敲除的单克隆细胞的H3K79me2水平显著降低(P<0.05),并且DOT1L敲除显著抑制ALV-J复制。RNA-Seq结果显示,与野生细胞系相比DOT1L敲除细胞系的差异表达基因(DEGs)共有2821个,其中上调基因1384个,下调基因1437个。DEGs的GO功能注释主要与细胞成长代谢和生物过程的调节相关;KEGG通路富集分析主要集中在细胞黏附、ECM受体和Wnt途径等信号通路。综上,研究首次成功构建了DOT1L基因敲除的鸡胚成纤维细胞系,并通过转录组测序分析和筛选DOT1L基因敲除细胞系的差异基因表达谱,这有助于理解DOT1L基因在鸡胚成纤维细胞中的潜在作用,还为进一步探究鸡DOT1L的抗病毒天然免疫调控功能提供重要的生物材料。 展开更多
关键词 DOT1l基因 鸡胚成纤维细胞系 CRISPR-Cas9 ALV-J 转录组测序
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2021—2023年安徽省肉羊主产区羊口疮病毒感染情况调查及流行毒株B2L和F1L基因的遗传演化分析
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作者 张留君 陈佳乐 +7 位作者 冯星 陈威振 邓亚飞 王波 左国林 贺绍君 辛洪雷 刘德义 《中国人兽共患病学报》 北大核心 2025年第7期697-703,共7页
目的为明确安徽省肉羊主产区羊口疮病毒(ORFV)感染情况及流行毒株的遗传演变特征。方法使用荧光定量PCR(qPCR)对2021—2023年从安徽省主要肉羊养殖地市采集的303份临床样本进行ORFV检测;采用常规PCR扩增阳性样本中ORFV的全长B2L和F1L基... 目的为明确安徽省肉羊主产区羊口疮病毒(ORFV)感染情况及流行毒株的遗传演变特征。方法使用荧光定量PCR(qPCR)对2021—2023年从安徽省主要肉羊养殖地市采集的303份临床样本进行ORFV检测;采用常规PCR扩增阳性样本中ORFV的全长B2L和F1L基因,并通过测序后进行遗传演化分析。结果qPCR检测显示,本次临床样本ORFV总阳性率为48.8%(148/303)。序列多重比对分析显示,本次56株样本毒株B2L基因间DNA和氨基酸序列相似性分别为96.7%~100.0%和97.4%~100.0%。同时,本次56株样本毒株F1L基因间DNA和氨基酸序列相似性分别为95.1%~100.0%和95.0%~100.0%。根据B2L基因DNA序列构建的遗传进化树结果显示,山羊源样本毒株FY-TYA与甘肃人源参考毒株Gansu位于同一小分支,而山羊源样本毒株FY-XQC与国内疫苗参考毒株China Vaccine和国内山羊源参考毒株OV-HLJ-04位于同一小分支。同时,根据F1L基因DNA序列构建的遗传进化树显示,山羊源样本毒株FY-XQA和FY-XQC均与新疆绵羊源参考毒株Xinjiang位于同一小分支。结论安徽省主要肉羊养殖地区ORFV感染较为普遍,且当前流行毒株B2L和F1L基因DNA及氨基酸序列均存在不同程度的遗传变异,其中F1L基因变异程度较大。此外,部分山羊源样本毒株与人源、疫苗及绵羊源参考毒株亲缘关系较近。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 B2L基因 F1l基因 遗传演化分析
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谷子CrRLK1L基因家族鉴定及其在非生物胁迫下的表达模式分析
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作者 赵影 张凤洁 +3 位作者 付成成 王莹 段甜甜 李雪垠 《湖南农业大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第6期37-49,共13页
为了解谷子中Cr RLK1L基因家族成员组成及其生物学功能,基于谷子基因组信息对谷子Cr RLK1L家族成员进行鉴定与生物信息学分析,并对其在干旱、高温、低温等非生物胁迫下的表达模式进行分析。结果显示:谷子中共鉴定到29个Cr RLK1L基因家族... 为了解谷子中Cr RLK1L基因家族成员组成及其生物学功能,基于谷子基因组信息对谷子Cr RLK1L家族成员进行鉴定与生物信息学分析,并对其在干旱、高温、低温等非生物胁迫下的表达模式进行分析。结果显示:谷子中共鉴定到29个Cr RLK1L基因家族(SiCrRLK1L)成员,其序列均较保守,推测其可能具有相同的功能;与拟南芥相比,谷子CrRLK1L家族与水稻具有更近的亲缘关系;大部分SiCrRLK1L基因在植物根部的表达量较高,具有组织特异性,且一部分SiCrRLK1L基因表达水平受逆境胁迫影响较大;SiCrRLK1L家族基因中含有与干旱胁迫等逆境相关的响应元件;SiCrRLK1L7、SiCrRLK1L23、SiCrRLK1L25、SiCrRLK1L27在干旱、低温(4℃)和高温(37℃)胁迫下均有不同的表达模式。 展开更多
关键词 谷子 CrRLK1l基因家族 抗逆 非生物胁迫
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羊口疮病毒的F1L和B2L基因研究现状
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作者 杨毅 阿安拉木 朵红 《动物医学进展》 北大核心 2025年第10期115-118,共4页
羊传染性脓疱(CE)是由羊传染性脓疱病毒(CEV)或学名羊口疮病毒(ORFV)引起的一种急性接触性人兽共患病。其基因组长约140 kb,编码130多个基因,其中,F1L和B2L基因保守程度高,蛋白免疫原性较好。论文介绍了F1L和B2L基因的研究现状,以期为O... 羊传染性脓疱(CE)是由羊传染性脓疱病毒(CEV)或学名羊口疮病毒(ORFV)引起的一种急性接触性人兽共患病。其基因组长约140 kb,编码130多个基因,其中,F1L和B2L基因保守程度高,蛋白免疫原性较好。论文介绍了F1L和B2L基因的研究现状,以期为ORFV的检测和新型疫苗的研制提供新的思路。 展开更多
关键词 羊传染性脓疱病毒 F1l基因 B2L基因
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CHD1L调节PI3K通路影响皮肤鳞状细胞癌A431细胞增殖、凋亡
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作者 董海平 吕超 +1 位作者 李梓琰 刘梅 《生物技术》 2025年第6期744-748,共5页
[目的]研究CHD1L调节PI3K通路对皮肤鳞状细胞癌(Cutaneous Squamous Cell Carcinoma,CSCC)A431细胞增殖、凋亡的影响。[方法]将A431细胞吹打均匀。将A431细胞分为3组(2×10^(6)个细胞/组):阴性对照组(转染0.1μmol/L siRNA NC)、siC... [目的]研究CHD1L调节PI3K通路对皮肤鳞状细胞癌(Cutaneous Squamous Cell Carcinoma,CSCC)A431细胞增殖、凋亡的影响。[方法]将A431细胞吹打均匀。将A431细胞分为3组(2×10^(6)个细胞/组):阴性对照组(转染0.1μmol/L siRNA NC)、siCHD1L组(转染0.1μmol/L siRNA CHD1L)、LY294002组(加入5μmol/L PI3K通路抑制剂)。以蛋白免疫印迹实验分析CSCC细胞(A431、SCC13、HSC-5)、正常皮肤细胞(HaCaT)中CHD1L的表达。采用MTT实验、细胞集落形成实验分析A431细胞增殖活性;原位末端标记法分析A431细胞凋亡率;蛋白免疫印迹实验检测A431细胞中CHD1L、PI3K与AKT蛋白的表达水平。[结果]与正常皮肤细胞相比,CSCC细胞中的CHD1L表达水平增加(P<0.05)。与阴性对照组相比,siCHD1L组、LY294002组的A431细胞的增殖能力降低(P<0.05)、凋亡率增加(P<0.05)。与阴性对照组相比,siCHD1L组的CHD1L、PI3K和AKT表达降低(P<0.05),LY294002组的PI3K与AKT表达降低,而LY294002组的CHD1L表达水平无明显变化。[结论]CSCC细胞中CHD1L表达量高于正常皮肤细胞,并且抑制CSCC A431细胞中的CHD1L后,PI3K通路同时受到抑制。通过抑制CHD1L或PI3K通路能够降低CSCC A431细胞的增殖活性,并促其凋亡。 展开更多
关键词 CHD1l LY294002 皮肤鳞状细胞癌 凋亡 A431 增殖 PI3K AKT
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口腔扁平苔藓患者血清ASH1L、Ang-2水平及临床意义
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作者 肖强 何浩 +2 位作者 杨淼 尹莉 邓宇恬 《检验医学与临床》 2025年第9期1216-1220,共5页
目的探讨口腔扁平苔藓(OLP)患者血清缺失、小、同源异形蛋白1(ASH1L),血管生成素-2(Ang-2)水平及与临床体征、病损程度、疾病活动性的相关性。方法选择2020年5月至2023年5月该院收治的120例OLP患者作为OLP组,选择同期在该院体检的119例... 目的探讨口腔扁平苔藓(OLP)患者血清缺失、小、同源异形蛋白1(ASH1L),血管生成素-2(Ang-2)水平及与临床体征、病损程度、疾病活动性的相关性。方法选择2020年5月至2023年5月该院收治的120例OLP患者作为OLP组,选择同期在该院体检的119例健康志愿者作为对照组。OLP患者中网纹型39例(网纹型组),萎缩型48例(萎缩型组),糜烂型33例(糜烂型组)。检测所有研究对象血清ASH1L、Ang-2、白细胞介素(IL)-6和肿瘤坏死因子-α(TNF-α)水平,分析OLP患者血清ASH1L、Ang-2水平与临床体征评分、RAE病损评分、REU疾病活动评分、IL-6水平、TNF-α水平的相关性。结果OLP组血清Ang-2、IL-6和TNF-α水平均高于对照组(P<0.05),血清ASH1L水平低于对照组(P<0.05)。糜烂型组血清Ang-2、IL-6和TNF-α水平及临床体征评分、RAE病损评分、REU疾病活动评分均高于萎缩型组、网纹型组(P<0.05),血清ASH1L水平均低于萎缩型组、网纹型组(P<0.05);萎缩型组血清Ang-2、IL-6和TNF-α水平及临床体征评分、RAE病损评分、REU疾病活动评分均高于网纹型组(P<0.05),血清ASH1L水平低于网纹型组(P<0.05)。OLP患者血清ASH1L水平与临床体征评分、RAE病损评分、REU疾病活动评分及IL-6、TNF-α水平均呈负相关(P<0.05),Ang-2水平与临床体征评分、RAE病损评分、REU疾病活动评分及IL-6、TNF-α水平均呈正相关(P<0.05)。结论OLP患者血清ASH1L水平降低,Ang-2水平升高,ASH1L、Ang-2水平与OLP患者临床体征、病损程度和疾病活动性有关。 展开更多
关键词 口腔扁平苔藓 ASH1l 血管生成素-2 白细胞介素-6 肿瘤坏死因子-Α
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Loss-of-function mutations of microRNA-142-3p promote ASH1L expression to induce immune evasion and hepatocellular carcinoma progression
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作者 Xing-Hui Yu Yan Xie +8 位作者 Jian Yu Kun-Ning Zhang Zhou-Bo Guo Di Wang Zhao-Xian Li Wei-Qi Zhang Yu-Ying Tan Li Zhang Wen-Tao Jiang 《World Journal of Gastroenterology》 SCIE CAS 2025年第1期126-145,共20页
BACKGROUND Hepatocellular carcinoma(HCC)has been a pervasive malignancy throughout the world with elevated mortality.Efficient therapeutic targets are beneficial to treat and predict the disease.Currently,the exact mo... BACKGROUND Hepatocellular carcinoma(HCC)has been a pervasive malignancy throughout the world with elevated mortality.Efficient therapeutic targets are beneficial to treat and predict the disease.Currently,the exact molecular mechanisms leading to the progression of HCC are still unclear.Research has shown that the microRNA-142-3p level decreases in HCC,whereas bioinformatics analysis of the cancer genome atlas database shows the ASH1L expression increased among liver tumor tissues.In this paper,we will explore the effects and mechanisms of microRNA-142-3p and ASH1L affect the prognosis of HCC patients and HCC cell bioactivity,and the association between them.AIM To investigate the effects and mechanisms of microRNA-142-3p and ASH1L on the HCC cell bioactivity and prognosis of HCC patients.METHODS In this study,we grouped HCC patients according to their immunohistochemistry results of ASH1L with pathological tissues,and retrospectively analyzed the prognosis of HCC patients.Furthermore,explored the roles and mechanisms of microRNA-142-3p and ASH1L by cellular and animal experiments,which involved the following experimental methods:Immunohistochemical staining,western blot,quantitative real-time-polymerase chain reaction,flow cytometric analysis,tumor xenografts in nude mice,etc.The statistical methods involved in this study contained t-test,one-way analysis of variance,theχ^(2)test,the Kaplan-Meier approach and the log-rank test.RESULTS In this study,we found that HCC patients with high expression of ASH1L possess a more recurrence rate as well as a decreased overall survival rate.ASH1L promotes the tumorigenicity of HCC and microRNA-142-3p exhibits reduced expression in HCC tissues and interacts with ASH1L through targeting the ASH1L 3′untranslated region.Furthermore,microRNA-142-3p promotes apoptosis and inhibits proliferation,invasion,and migration of HCC cell lines in vitro via ASH1L.For the exploration mechanism,we found ASH1L may promote an immunosuppressive microenvironment in HCC and ASH1L affects the expression of the cell junction protein zonula occludens-1,which is potentially relevant to the immune system.CONCLUSION Loss function of microRNA-142-3p induces cancer progression and immune evasion through upregulation of ASH1L in HCC.Both microRNA-142-3p and ASH1L can feature as new biomarker for HCC in the future. 展开更多
关键词 Hepatocellular carcinoma MicroRNA-142-3p ASH1l Immune evasion Tumor immune microenvironment Apoptosis
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大白菜CrRLK1L基因家族鉴定及表达模式
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作者 赵玉梅 吴晓宇 +2 位作者 杨柳 黄家保 段巧红 《分子植物育种》 北大核心 2025年第12期3897-3906,共10页
CrRLK1L(Catharanthus roseus RLK1-like)蛋白在调控植物胁迫响应和生长发育等过程中起着重要作用。本研究利用生物信息学方法在大白菜基因组中筛选获得33个CrRLK1L家族成员,其不均匀地分布在大白菜10条染色体上,编码蛋白长度范围在117~... CrRLK1L(Catharanthus roseus RLK1-like)蛋白在调控植物胁迫响应和生长发育等过程中起着重要作用。本研究利用生物信息学方法在大白菜基因组中筛选获得33个CrRLK1L家族成员,其不均匀地分布在大白菜10条染色体上,编码蛋白长度范围在117~885 aa之间,等电点的范围为5.41~8.69。序列分析表明,BraCrRLK1Ls可以分为4个分支且同一分支内的基因结构和保守基序相对保守。染色体定位及共线性分析表明,片段复制事件对BraCrRLK1L基因家族的进化和扩张起着重要作用。大白菜与拟南芥共线性分析表明,拟南芥与大白菜有较近的亲缘关系,可为大白菜CrRLK1L的研究提供借鉴。启动子作用元件分析预测BraCrRLK1L家族在盐胁迫、低温、干旱及其他胁迫环境中可能发挥着重要作用。对其中Bra012850的组织特异性表达分析表明,Bra012850在种子中表达量最高;盐胁迫下Bra012850表达呈下调趋势,推测其在盐胁迫中起负调节作用。此外,对Bra012850进行基因克隆、亚细胞定位和蛋白表达。本研究为大白菜CrRLK1L基因家族进一步的功能研究提供理论依据。 展开更多
关键词 大白菜 CrRLK1l 基因家族 FERONIA 盐胁迫
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斑马鱼apcdd1l基因启动子功能鉴定及其在心脏发育中的调控作用研究
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作者 吕文超 芮宇梦 祖尧 《基因组学与应用生物学》 北大核心 2025年第8期836-845,共10页
本研究旨在揭示腺瘤性息肉调节样蛋白1(adenomatous polyposis coli down-regulated 1 like,apcdd1l)基因在斑马鱼(Danio rerio)心脏发育中的调控功能及其与心脏发育关键基因的互作关系.采用生物信息学预测结合实验验证的方法,成功克隆... 本研究旨在揭示腺瘤性息肉调节样蛋白1(adenomatous polyposis coli down-regulated 1 like,apcdd1l)基因在斑马鱼(Danio rerio)心脏发育中的调控功能及其与心脏发育关键基因的互作关系.采用生物信息学预测结合实验验证的方法,成功克隆了apcdd1l基因启动子区域,发现该区域未检测到典型的甲基化CpG岛,但富含多个潜在的转录因子结合位点.双萤光素酶报告实验证实,该启动子具有显著转录活性,以100 ng/孔pGL3-apcdd1l-luc转染HEK 293T细胞后,其萤光素酶活性较空载体对照组提升5.3倍(P<0.01).进一步通过转录因子共转染实验发现,心脏核心调控因子gata5对apcdd1l启动子具有显著抑制作用(转录活性降低61.29%±17.10%,P<0.0001),且存在剂量依赖效应.此外,利用Tol2转座子系统成功构建了apcdd1l启动子驱动EGFP表达的转基因斑马鱼系,荧光显微系统观察发现,胚胎心室、心房部分区域与房室间隔在60~72 hpf(hours post fertilization)时出现特异性荧光表达.综上所述,本研究揭示了apcdd1l在心脏发育中的调控作用,发现其可能作为gata5的下游效应因子参与心脏发育负反馈调控,为深入解析脊椎动物心脏发育的分子机制提供了重要实验证据,同时所建立的转基因斑马鱼模型也为后续开展apcdd1l基因的时空表达谱分析及功能研究奠定了可视化研究基础. 展开更多
关键词 apcdd1l 启动子 心脏发育 Tol2转座子 斑马鱼
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羊口疮病毒榆林株B2L和F1L串联基因在昆虫杆状病毒系统的表达 被引量:4
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作者 冯平 李云章 +2 位作者 孙丰廷 屈雷 闫海龙 《西北农林科技大学学报(自然科学版)》 CSCD 北大核心 2018年第6期1-8,共8页
【目的】克隆分析羊口疮病毒(ORFV)榆林株(ORFV-Yulin)的F1L基因序列,通过昆虫杆状病毒表达B2L和F1L串联基因。【方法】采用PCR方法扩增ORFV-Yulin株F1L全长基因,测序后对其进行序列分析和遗传进化分析。扩增ORFV-Yulin株B2L融合基因(r ... 【目的】克隆分析羊口疮病毒(ORFV)榆林株(ORFV-Yulin)的F1L基因序列,通过昆虫杆状病毒表达B2L和F1L串联基因。【方法】采用PCR方法扩增ORFV-Yulin株F1L全长基因,测序后对其进行序列分析和遗传进化分析。扩增ORFV-Yulin株B2L融合基因(r B2L)和F1L融合基因(c F1L),利用碱基linker连接,通过重叠PCR方法扩增获得ORFV r B2L-linker-c F1L重组基因(r B2Lc F1L),将其与昆虫杆状病毒表达载体pBac5连接构建表达载体pBac-rB2LcF1L。将pBac-rB2LcF1L包装出杆状病毒,侵染sf9细胞,通过SDS-PAGE、Western-blotting以及质谱鉴定等方法验证目的基因r B2Lc F1L的表达。【结果】克隆获得了1 029bp的F1L全长基因,该基因高度保守,与FJ-MH2015株的序列相似性最高,核苷酸和氨基酸的相似性分别为99.0%和99.4%。系统进化分析表明,ORFV-Yulin株与XP(KU199840.1)、FJ-MH2015(KM675409.1)以及Shanxi(HQ221964.1)株同处于一个分支。PCR扩增获得了855bp的c F1L基因、1 180bp的r B2L基因及1 983bp的r B2Lc F1L基因,成功构建了pBacrB2LcF1L载体,并包装出相应的杆状病毒。B2L和F1L串联基因通过昆虫杆状病毒表达系统获得成功表达,表达产物的分子质量为80ku,且有部分重组蛋白能分泌到细胞培养基中。【结论】ORFV-Yulin株的B2L和F1L串联基因在昆虫杆状病毒系统表达成功。 展开更多
关键词 羊口疮病毒 F1l基因 F1l+B2L串联表达 昆虫杆状病毒 基因表达
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表达ORFV F1L基因的重组山羊痘病毒的构建及初步鉴定 被引量:3
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作者 张倩 王震 +4 位作者 倪伟 付强 李瑞芳 张辉 陈创夫 《生物技术》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期68-72,共5页
目的:研制安全有效的预防羊口疮的重组山羊痘病毒活载体疫苗。方法:采用PCR技术扩增ORFV的F1L基因,将其与载体pUC-TK12连接,同时酶切插入LacZ报告基因和Pb56双向启动子,构建重组转移载体pUC-TK12-LacZ-F1L,将其转染至已感染山羊痘病毒... 目的:研制安全有效的预防羊口疮的重组山羊痘病毒活载体疫苗。方法:采用PCR技术扩增ORFV的F1L基因,将其与载体pUC-TK12连接,同时酶切插入LacZ报告基因和Pb56双向启动子,构建重组转移载体pUC-TK12-LacZ-F1L,将其转染至已感染山羊痘病毒疫苗株的BHK-21细胞,进行同源重组。通过蓝白斑筛选,收获重组病毒并进行PCR初步鉴定。结果:获得了全长为1 023bp的F1L基因,测序结果与GenBank公布的标准序列同源性为99.9%。构建了重组转移载体pTL-F1L,转染BHK-21细胞后,获得了重组山羊痘病毒蓝色蚀斑。结论:该研究成功获得了含有羊传染性脓疱病毒F1L基因的重组山羊痘病毒疫苗候选株rGPV-F1L,为羊传染性脓疱病基因工程活载体疫苗的研制奠定基础。 展开更多
关键词 羊传染性脓疱病毒(ORFV) F1l基因 山羊痘病毒 rGPV—F1l
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水稻BC1L基因家族成员全基因组鉴定与组织表达特征
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作者 刘盛钦 何天翔 +5 位作者 赵静雅 吕亮亮 樊怀麟 李梦雅 冯婷婷 黄先忠 《安徽科技学院学报》 2025年第5期26-35,共10页
水稻(Oryza sativa)的BRITTLE CULM1(BC1)基因属于COBRA-like(COBL)基因家族,在水稻细胞壁的生物合成中发挥重要作用。本研究通过全基因组分析从水稻基因组中共鉴定出11个BC1L成员,非均匀分布于6条染色体上。系统进化分析表明,11个OsBC1... 水稻(Oryza sativa)的BRITTLE CULM1(BC1)基因属于COBRA-like(COBL)基因家族,在水稻细胞壁的生物合成中发挥重要作用。本研究通过全基因组分析从水稻基因组中共鉴定出11个BC1L成员,非均匀分布于6条染色体上。系统进化分析表明,11个OsBC1L蛋白进化上与二穗短柄草(Brachypodium distachyon)及玉米(Zea mays)亲缘关系较近,而与拟南芥(Arabidopsis thaliana)、陆地棉(Gossypium hirsutum)以及番茄(Solanum lycopersicum)等双子叶植物的进化距离相对较远。共线性分析表明,水稻与二穗短柄草的共线性基因对数量最多(9个),而与拟南芥之间的数量最少(4个),但水稻物种内只有2个共线性基因对。进化分析表明OsBC1L基因进化中以纯化选择为主。启动子顺式作用元件分析发现,所有OsBC1L基因均富含激素响应元件及非生物胁迫相关元件,其中部分成员的启动子区域还显著富集光响应元件。基因表达分析表明11个OsBC1L在根、茎秆、叶片、节、叶鞘和幼穗等6个组织中明显差异表达。本研究系统分析了水稻COBL基因家族成员的结构与表达特征,为后续深入解析OsBC1L基因在水稻细胞壁合成分子机制及抗逆遗传改良奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 BC1l 基因家族 系统进化 表达特征
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Case report of a novel GREB1L gene mutation in a patient with branchio-oto-renal syndrome
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作者 Sijing Chen Zixuan Yang +1 位作者 Maoxin Wang Cuiping Zhong 《Journal of Otology》 2025年第2期67-71,共5页
Branchio-oto-renal(BOR)syndrome is an uncommon disorder inherited in an autosomal dominant manner.Its main clinical manifestations include branchial cleft cysts,anterior auricular fistula,hearing impairment,and kidney... Branchio-oto-renal(BOR)syndrome is an uncommon disorder inherited in an autosomal dominant manner.Its main clinical manifestations include branchial cleft cysts,anterior auricular fistula,hearing impairment,and kidney malformations.BOR syndrome is associated with heterozygous pathogenic variants including EYA1,SIX1,and SIX5.The study focused on a 13-year-old Chinese boy who presented with hearing impairment,renal malformations,and bony atresia of the right external auditory canal with microtia.The boy's clinical manifestations met the diagnostic criteria for BOR syndrome.Two of the boy's family members underwent clinical examination.However,neither displayed a phenotype associated with BOR syndrome.The boy and his two relatives provided blood samples for genomic DNA extraction,followed by Sanger sequencing.A novel mutation in the GREB1L gene was identified in the boy,but neither of his family members exhibited the same variant.Identifying a novel mutation in GREB1L offers valuable insights into the genotype-phenotype correlation of BOR syndrome,improving the precision of early diagnosis and promoting the advancement of personalized treatment strategies. 展开更多
关键词 Branchio-oto-renal syndrome GREB1l Hearing loss Kidney agenesis
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ASH1L对三阴性乳腺癌细胞增殖、细胞周期和凋亡的影响
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作者 韩肖肖 张金保 +1 位作者 田慧珍 吴雯雯 《中国医药导报》 2025年第22期13-18,共6页
目的 研究ASH1L对三阴性乳腺癌(TNBC)恶性表型的影响和功能。方法 RT-q PCR和Western blot法检测ASH1L在人正常乳腺上皮细胞和乳腺癌细胞中的表达情况。慢病毒感染TNBC细胞系MDA-MB-231构建对照组细胞和稳定敲降ASH1L的实验组细胞。CCK... 目的 研究ASH1L对三阴性乳腺癌(TNBC)恶性表型的影响和功能。方法 RT-q PCR和Western blot法检测ASH1L在人正常乳腺上皮细胞和乳腺癌细胞中的表达情况。慢病毒感染TNBC细胞系MDA-MB-231构建对照组细胞和稳定敲降ASH1L的实验组细胞。CCK8法检测ASH1L对TNBC细胞增殖的影响。流式细胞术检测ASH1L对TNBC细胞周期和凋亡的影响。将MDA-MB-231细胞和敲降ASH1L的MDA-MB-231细胞分别接种至裸鼠对照组和裸鼠实验组皮下构建乳腺癌移植瘤模型;在细胞接种后第21天,剥离移植瘤并称重。结果 与正常乳腺上皮细胞比较,ASH1L m RNA及蛋白在TNBC细胞中高表达(P<0.01),其中在MDA-MB-231细胞中的表达最高。短发夹RNA介导的基因沉默可以在MDA-MB-231细胞中有效地降低ASH1L m RNA和蛋白水平的表达(P<0.01)。CCK8实验结果显示,与对照组比较,实验组TNBC细胞的增殖能力降低(P<0.05)。流式细胞术实验结果显示,与对照组比较,实验组TNBC细胞周期阻滞于G_(0)/G_(1)期,细胞凋亡增加(P<0.05)。裸鼠皮下荷瘤实验结果显示,与裸鼠对照组比较,裸鼠实验组移植瘤重量减少(P<0.05)。结论 ASH1L在三阴性乳腺癌细胞中高表达,并且能够促进三阴性乳腺癌细胞的生长,作为一个重要的表观遗传分子在TNBC中发挥促癌的功能。 展开更多
关键词 ASH1l 三阴性乳腺癌 增殖 细胞周期 凋亡 表观遗传
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CircSHOC2 regulates steroid hormone synthesis in ovarian granulosa cells through the mir-130b-5p/ASH1L pathway
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作者 Lu-Tong Zhang Teng Zhang +5 位作者 Xiang-Rong Song Madaniyati Mie-Lie Yi-Hao Li Lei Gao Gong-She Yang Gui-Yan Chu 《Zoological Research》 2025年第5期1108-1120,共13页
Estrus represents a critical phase in the porcine reproductive cycle and relies on functional ovarian development and coordinated steroidogenesis.Granulosa cells(GCs)mediate these processes by secreting estradiol(E_(2... Estrus represents a critical phase in the porcine reproductive cycle and relies on functional ovarian development and coordinated steroidogenesis.Granulosa cells(GCs)mediate these processes by secreting estradiol(E_(2))and progesterone(P_(4)),which are essential for follicular maturation and ovulatory competence.While circular RNAs(circRNAs)have been implicated in steroid hormone synthesis,their involvement in the regulation of gilt estrous remains unclear.In this study,circRNA sequencing was performed on ovarian tissues of estrus(ES)and non-estrus(NES)gilts,resulting in the identification of a novel circRNA,termed circular SHOC2 leucine rich repeat scaffold protein(circSHOC2),which exhibited marked up-regulation in ES ovaries.Functional assays demonstrated that circSHOC2 overexpression enhanced E_(2)and P_(4)synthesis and increased the protein levels of key steroidogenic enzymes.Mechanistic investigation revealed that circSHOC2 sponges miR-130b-5p.Silencing miR-130b-5p significantly enhanced E_(2)and P_(4)production,along with the up-regulation of steroidogenic proteins.Additionally,miR-130b-5p targeted ASH1-like histone lysine methyltransferase(ASH1L),while its overexpression significantly inhibited ASH1L.Cotransfection experiments revealed that ASH1L mitigated the inhibitory effects of miR-130b-5p on E_(2)and P_(4)synthesis in GCs.These findings establish a regulatory axis in which circSHOC2 modulates steroidogenic capacity in porcine GCs via the miR-130b-5p/ASH1L pathway,offering mechanistic insight into the molecular basis of gilt estrus and providing potential targets to enhance reproductive efficiency. 展开更多
关键词 Gilt estrus CircRNA miR-130b-5p ASH1l Steroid hormone
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