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应用变性梯度凝胶电泳和16SrDNA序列分析对山羊瘤胃细菌多样性的研究 被引量:53
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作者 姚文 朱伟云 +3 位作者 韩正康 Antoon D L Akkermans Barbara Williams Seerp Tamminga 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2004年第9期1374-1378,共5页
以取自3头安装有永久性瘤胃瘘管的土种山羊的瘤胃内容物为材料,经过DNA抽提和PCR扩增,扩增产物利用变性梯度凝胶电泳技术(DGGE,一种DNA指纹技术)分析瘤胃细菌在两种日粮条件下的多样性.同时利用基因序列分析技术,分析了16个在DGGE胶上... 以取自3头安装有永久性瘤胃瘘管的土种山羊的瘤胃内容物为材料,经过DNA抽提和PCR扩增,扩增产物利用变性梯度凝胶电泳技术(DGGE,一种DNA指纹技术)分析瘤胃细菌在两种日粮条件下的多样性.同时利用基因序列分析技术,分析了16个在DGGE胶上有匹配带的克隆的16S rDNA序列,并与现有的数据库进行了比较.结果表明,饲喂基础日粮时3头山羊瘤胃内容物的DGGE图谱有一定的相似性(43%~55%);饲料中添加大豆黄酮一定程度上影响了瘤胃细菌的组成,DGGE 谱带变化程度分别为 1 号 36% 、2 号 46% 、3 号 30%。基因序列分析表明,DGGE图谱中优势条带的16S rDNA基因序列中有5个基因序列与基因数据库登录的相关序列的相似性大于97%,8个基因序列的相似性在90%~96%,余下的低于90%。相似性大于97%的5个克隆中,只有1个被鉴定为Prevotella sp .,其余 4 个都属于未被鉴定的瘤胃细菌。 展开更多
关键词 变性梯度凝胶电泳 16srdna序列分析 山羊 瘤胃细菌 多样性
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枣疯病植原体PCR检测方法的建立及16SrDNA序列分析 被引量:3
2
作者 张曼 张娅君 +2 位作者 李继东 张长征 张典濮 《河南科学》 2011年第9期1059-1062,共4页
以新郑灰枣枣疯病叶片为试验材料,先提取枣疯病病株叶片的DNA,经过巢式PCR扩增后对枣疯病植原体16SrDNA进行测序和分析.获得枣疯病植原体的16SrDNA基因片段为1 125bp,通过序列同源性比较,表明枣疯病样品中检测到的植原体与EY(AY197655)... 以新郑灰枣枣疯病叶片为试验材料,先提取枣疯病病株叶片的DNA,经过巢式PCR扩增后对枣疯病植原体16SrDNA进行测序和分析.获得枣疯病植原体的16SrDNA基因片段为1 125bp,通过序列同源性比较,表明枣疯病样品中检测到的植原体与EY(AY197655)同源性高达99%,应属于16SrV组,确定了枣疯病植原体的分类地位. 展开更多
关键词 枣疯病 植原体 16srdna序列 序列分析
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六斑月瓢虫模板DNA的制备及16SrDNA序列扩增 被引量:7
3
作者 庞虹 《昆虫天敌》 CSCD 2001年第2期55-59,共5页
本文对酒精浸泡的六斑月瓢虫Menochilus sexmaculata Fabricius)标本进行基因组DNA的提取,用线粒体16 SrDNA引物扩增出长度约为500bp的PCR产物,为进一步开展瓢虫的分子系统学研... 本文对酒精浸泡的六斑月瓢虫Menochilus sexmaculata Fabricius)标本进行基因组DNA的提取,用线粒体16 SrDNA引物扩增出长度约为500bp的PCR产物,为进一步开展瓢虫的分子系统学研究打下基础。 展开更多
关键词 瓢虫科 六斑月瓢虫 PCR RDNA 线粒体16srdna序列 扩增
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16SrDNA序列在细菌鉴定和检测分析中的应用价值 被引量:5
4
作者 刘新武 于艳妮 +1 位作者 滕海风 殷积芳 《医学检验与临床》 2017年第7期30-32,共3页
传统的微生物鉴定及分类方法是对细菌进行分离培养, 根据其形态特征和生化反应进行鉴定. 当该菌种不具有特征的形态及生化反应时, 传统鉴定方法便难以奏效, 并且传统方法耗时长、 操作繁琐,无法满足临床快速检测的需要, 无法对临床用药... 传统的微生物鉴定及分类方法是对细菌进行分离培养, 根据其形态特征和生化反应进行鉴定. 当该菌种不具有特征的形态及生化反应时, 传统鉴定方法便难以奏效, 并且传统方法耗时长、 操作繁琐,无法满足临床快速检测的需要, 无法对临床用药及治疗提供可靠依据. 随着分子生物学技术不断发展,诸多新技术手段逐渐应用于微生物的鉴定及分类,其中16SrDNA (编码核糖体16SrRNA基因) 序列测序分析法已经广泛应用于菌种鉴定和系统发生学研究. 本文就16SrDNA序列在细菌鉴定和检测分析中的应用研究进行如下综述. 展开更多
关键词 16srdna序列 细菌鉴定 检测分析
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耐热脂肪酶产生菌FS1403的分离筛选和16SrDNA基因序列的分析 被引量:7
5
作者 吴伟斌 施碧红 +3 位作者 温建新 罗秀珍 施巧琴 吴松刚 《药物生物技术》 CAS CSCD 2008年第1期6-10,共5页
从菲律宾火山口土样中分离、筛选获得一株产脂肪酶的耐热菌FS1403,对该菌脂肪酶的酶学性质初步研究表明:酶的最适作用温度为55℃,60℃处理1h保持70%酶活性,为中度耐热脂肪酶。酶的最适pH值为8.0,在pH7~pH10的条件下酶活都比较... 从菲律宾火山口土样中分离、筛选获得一株产脂肪酶的耐热菌FS1403,对该菌脂肪酶的酶学性质初步研究表明:酶的最适作用温度为55℃,60℃处理1h保持70%酶活性,为中度耐热脂肪酶。酶的最适pH值为8.0,在pH7~pH10的条件下酶活都比较稳定。采用细菌16SrDNA通用引物,PCR扩增、克隆并分析了该菌的16SrDNA基因序列,同源性和系统发育学分析表明菌株FS1403与Bacillus subtilis具有最紧密亲缘关系。 展开更多
关键词 脂肪酶 耐热菌 16srdna序列分析
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不同症状矮牵牛植株植原体16SrDNA片段的克隆及序列分析* 被引量:4
6
作者 蔡红 李小林 +1 位作者 孔宝华 陈海如 《华中农业大学学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期1-4,共4页
 应用植原体 16SrRNA基因通用引物,分别对表现矮化和扁茎症状的矮牵牛植株进行巢式PCR检测,均得到约 1. 2kb的特异片段。将此特异片段与pGEM -TEasy载体连接并转化到大肠杆菌JM109感受态细胞中,通过PCR鉴定,序列测定及同源性比较分析,...  应用植原体 16SrRNA基因通用引物,分别对表现矮化和扁茎症状的矮牵牛植株进行巢式PCR检测,均得到约 1. 2kb的特异片段。将此特异片段与pGEM -TEasy载体连接并转化到大肠杆菌JM109感受态细胞中,通过PCR鉴定,序列测定及同源性比较分析,结果表明:这 2个植原体株系 16SrDNA片段G+C含量分别为47. 1%和 47. 0%,具有其他柔膜菌纲原核生物 16SrRNA基因碱基组成特征;与 16Sr组中的代表株系 (西方翠菊黄化,SAY)同源率达到最高,分别为 99. 1和 98. 6%,故认为这 2个株系为该组成员之一。 展开更多
关键词 矮牵牛 矮化 扁茎 16srdna序列 植原体病害
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沙坡头地区根瘤菌DNA同源性及16SrDNA全序列 被引量:6
7
作者 李颖 白雨 陈文新 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第2期95-99,共5页
数值分类和多位点酶电泳分析表明,分离自宁夏沙坡头地区的12株根瘤菌构成一个独立的表观群。对这一菌群进行了DNA同源性和群内中心菌株16SrDNA全序列分析。12个菌株的G+Cmol%在564~622范围内;群内D... 数值分类和多位点酶电泳分析表明,分离自宁夏沙坡头地区的12株根瘤菌构成一个独立的表观群。对这一菌群进行了DNA同源性和群内中心菌株16SrDNA全序列分析。12个菌株的G+Cmol%在564~622范围内;群内DNA同源性为723%~935%,大于70%,属种内水平;中心株N220的16SrDNA全序列与参比菌株的序列比较,从模拟系统发育树看出,它与三株土壤杆菌、三株根瘤菌的16SrDNA序列同源性在948%~992%的相似性水平上构成一个分支,看来沙坡头地区这群根瘤菌是一个独立的新种群。 展开更多
关键词 根瘤菌 DNA同源性 16srdna序列
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椰毒假单胞菌酵米面亚种16S rDNA序列测定与分析 被引量:16
8
作者 焦振泉 刘秀梅 +1 位作者 杨瑞馥 孟昭赫 《卫生研究》 CAS CSCD 北大核心 1999年第4期232-235,共4页
本文对3种不同来源样品的4株椰酵假单胞菌的16SrDNA的序列进行了测定,以确定其系统发育位置及与其它菌种的遗传进化关系。实验中设计了7条引物,利用聚合酶链式反应(PolymaseChainRe-action,PCR... 本文对3种不同来源样品的4株椰酵假单胞菌的16SrDNA的序列进行了测定,以确定其系统发育位置及与其它菌种的遗传进化关系。实验中设计了7条引物,利用聚合酶链式反应(PolymaseChainRe-action,PCR)扩增4株细菌的16SrDNA,通过扩增产物的克隆测序或直接测序,获得了它们的16SrDNA序列,将测得的序列与伯克霍尔德氏菌属中其它菌种的16SrDNA序列进行了聚类分析,得到了系统发育进化树状图。树状图及不同菌种之间的同源性比值:椰酵假单胞菌(P.cocovenenanssubsp.farinofermentans)与唐菖蒲伯克霍尔德氏菌(Burkholderiagladioli)、椰毒伯克霍尔德氏菌(Burkholderiacocovenenans)的亲缘关系非常近,与其它菌种的亲缘关系相对较远,椰酵假单胞菌、唐菖蒲伯克霍尔德氏菌和椰毒伯克霍尔德氏菌可归属于一个独立的系统发育系。 展开更多
关键词 椰酵假单胞菌 16srdna序列 食物中毒 序列测定
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中国大陆绒螯蟹线粒体16S rDNA序列变异与分子鉴定标记 被引量:28
9
作者 孙红英 周开亚 +1 位作者 陆健健 杨光 《自然科学进展》 北大核心 2002年第5期485-490,共6页
选取了中国大陆东部6个水系合计110个绒螯蟹个体,通过DNA序列测定和PCR/RFLP分析,对线粒体16S rDNA部分片段的序列变异进行研究.结果表明,在401 bp的16S rDNA片段中,合浦绒螯蟹(Eriocheir japonica hepuensis)与中华绒螯蟹(E.j.sinensis... 选取了中国大陆东部6个水系合计110个绒螯蟹个体,通过DNA序列测定和PCR/RFLP分析,对线粒体16S rDNA部分片段的序列变异进行研究.结果表明,在401 bp的16S rDNA片段中,合浦绒螯蟹(Eriocheir japonica hepuensis)与中华绒螯蟹(E.j.sinensis)之间存在3~4个固定的碱基替代;合浦绒螯蟹的闽江、九龙江和南流江种群之间未发现碱基变异,表现为1种单元型(C型);中华绒螯蟹长江和辽河的种群中,有1个固定的碱基替代,表现为A,B两种单元型.单元型之间的碱基变异反映了绒螯蟹地理种群之间的遗传歧异.经DraⅠ酶切形成的16S rDNA酶切片段差异,为2个亚种的鉴定提供了一种准确、简捷的DNA分子标记.对长江水系部分水域绒螯蟹的分子鉴定提示,长江下游至长江口以中华绒螯蟹的2个单元型为主,但已混有合浦绒螯蟹的单元型.在江苏、安徽渔场中的饲养种群分别属于单元型A型和B型.16S rDNA的PCR/RFLP差异可作为正确鉴定中华绒螯蟹和合浦绒螯蟹的分子鉴定标记;16S rDNA片段中1个固定位点的碱基替代可作为区分中华绒螯蟹两种单元型的分子鉴定标记. 展开更多
关键词 中华绒鳌蟹 合浦绒鳌蟹 16srdna序列变异 PCR/RFLP 分子鉴定标记
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利用16S rDNA序列分析宜宾芽菜中细菌菌群
10
作者 李东 左勇 +3 位作者 任忠侨 孙琴 张晶 曾林 《中国调味品》 CAS 北大核心 2014年第10期81-84,共4页
使用ClustalX 2.0和MEGA 4.1软件对从宜宾芽菜中分离出的9株细菌(AY,AZ,AH,AI,AJ,AK,AL,AG,AO)的16SrDNA序列进行比对、分析,并绘制系统发育树。经鉴定,该9个菌株可分为3个种群,其中AY,AZ,AH,AL,AK,AJ这6个菌为第一种群;AO,AI为第二种群... 使用ClustalX 2.0和MEGA 4.1软件对从宜宾芽菜中分离出的9株细菌(AY,AZ,AH,AI,AJ,AK,AL,AG,AO)的16SrDNA序列进行比对、分析,并绘制系统发育树。经鉴定,该9个菌株可分为3个种群,其中AY,AZ,AH,AL,AK,AJ这6个菌为第一种群;AO,AI为第二种群;AG为第三种群。结果表明:利用16SrDNA序列的分子生物学方法可以实现细菌菌群的快速分类鉴定,与传统方法相比具有简便、快速等优点。 展开更多
关键词 细菌 16srdna序列分析法 发育树
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兔巴氏杆菌的分离鉴定及其16S rDNA序列分析 被引量:5
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作者 奎玲 黄仆 +2 位作者 刘孟良 代洪波 朱玲 《黑龙江畜牧兽医》 CAS 北大核心 2011年第10期102-104,共3页
兔巴氏杆菌病是由多杀性巴氏杆菌(Pm)引起的一种急性、传染性疾病,以败血症和出血性炎症为主要特征,因此又被称为“兔出血性败血症”。
关键词 多杀性巴氏杆菌 兔巴氏杆菌病 16srdna序列分析 分离鉴定 出血性败血症 传染性疾病
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自溶高温放线菌的生物学特性及16S rDNA序列分析研究 被引量:4
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作者 田勇强 张云峰 +3 位作者 李文军 崔晓龙 徐丽华 姜成林 《微生物学通报》 CAS CSCD 北大核心 1999年第4期268-271,共4页
从云南各地土样及温泉水样中分离到多株高温放线菌。对其中的自溶高温放线菌的形态,生理生化特性、细胞化学组分、同功酶谱及16S rDNA序列进行了研究,结果表明它们与非自溶放线菌在上述各方面存在着明显差异分别属于高温放线菌属(The... 从云南各地土样及温泉水样中分离到多株高温放线菌。对其中的自溶高温放线菌的形态,生理生化特性、细胞化学组分、同功酶谱及16S rDNA序列进行了研究,结果表明它们与非自溶放线菌在上述各方面存在着明显差异分别属于高温放线菌属(Thermoactinomyces)和链霉菌属(Streptomyces)。同时发现培养基成分、温度、空气湿度对菌体自溶均有显著影响,特别是水分对链霉菌的自溶起着关键作用。 展开更多
关键词 自溶高温放线菌 16srdna序列
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鸡眼草根瘤菌的16S rDNA全序列分析 被引量:5
13
作者 韦革宏 朱铭莪 陈文新 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第1期113-116,共4页
Based on the previous studies on numerical taxonomy, SDS\|PAGE of whole\|cell protein and DNA hybridization, the rhizobial strains isolated from \%Kummerowia\% sp. in semi\|arid area of North\|west constituted a new s... Based on the previous studies on numerical taxonomy, SDS\|PAGE of whole\|cell protein and DNA hybridization, the rhizobial strains isolated from \%Kummerowia\% sp. in semi\|arid area of North\|west constituted a new subgroup, the 16S rDNA sequence of representative strain SH714 were tested. The unrooted phylogenetic tree was produced. In this tree, the strain SH714 with \%Sinorhizobium xinjiangensis, S. fredii, S. meliloti, S. medicae, S. saheli\% and \%S. teranga\% constituted a branch of \%Sinorhizobium.\% Within this branch, the similarity valuse of 16S rDNA sequence between strain SH714 and \%S. xinjiangesis, S. fredii, S. meliloti, S. medicae, S. saheli\% and \%S. teranga\% were 97.4%, 97.5%, 96.8%, 96.7%, 97.2% and 95.6% respectively, the values were more than 95%, this indicated that these known species should belong to the same genus. The values of DNA homology between type strains of these species were less than 70%. Thus, the strain SH714 represented a new rhizobial species, and there were some diversity between SH714 and known rhizobial species in phenotypic feature and composition of protien. 展开更多
关键词 根瘤菌 鸡眼草根瘤菌 16srdna序列
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中国马铃薯疮痂病病原菌16S rDNA的遗传多样性分析 被引量:40
14
作者 张萌 赵伟全 +3 位作者 于秀梅 杨文香 张汀 刘大群 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2009年第2期499-504,共6页
【目的】利用16S rDNA序列对来自中国8个省(区)的34株马铃薯疮痂病菌和15株参比菌株进行系统发育分析。【方法】采用链霉菌通用引物对34株测试菌株的基因组进行16S rDNA序列扩增,测序后在GenBank中进行BLASTn比对,选取同源性较高的菌株... 【目的】利用16S rDNA序列对来自中国8个省(区)的34株马铃薯疮痂病菌和15株参比菌株进行系统发育分析。【方法】采用链霉菌通用引物对34株测试菌株的基因组进行16S rDNA序列扩增,测序后在GenBank中进行BLASTn比对,选取同源性较高的菌株构建系统发育树。【结果】34个测试菌株均为链霉菌属,其中Streptomyces scabies12株、S.galilaeus8株、S.bobili6株、S.turgidiscabies1株、S.acidiscabies1株、S.diastatochromogenes2株、S.setonii1株、S.enissocaesilis3株。其中S.galilaeus、S.bobili和S.enissocaesilis等种均为新发现的疮痂病病原。对各菌株的分布分析发现,山东省的疮痂病菌有4种,内蒙古自治区和陕西省有3种,四川省、河北省和山西省均有2种,黑龙江省为1种。【结论】中国马铃薯疮痂病菌存在明显的遗传多样性,且分布较为复杂。 展开更多
关键词 马铃薯疮痂病 链霉菌 16srdna序列 遗传多样性
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快生型大豆根瘤菌(Rhizobium fredii)15067与褐球固氮菌(Azotobacter chroococcum)10006的16S rDNA分析 被引量:1
15
作者 李海英 刘金玲 +3 位作者 张喜波 康妮 于海鹏 李鹏 《黑龙江大学自然科学学报》 CAS 北大核心 2008年第6期769-773,共5页
分别对快生型大豆根瘤菌(Rhizobium fredii)15067和褐球固氮菌(Azotobacter chroococ-cum)10006两个菌株进行了16S rDNA的全序列测定,将此全序列与已知相关的16S rDNA进行了比较及聚类分析,得到系统发育树状图。在系统发育树中,根瘤菌15... 分别对快生型大豆根瘤菌(Rhizobium fredii)15067和褐球固氮菌(Azotobacter chroococ-cum)10006两个菌株进行了16S rDNA的全序列测定,将此全序列与已知相关的16S rDNA进行了比较及聚类分析,得到系统发育树状图。在系统发育树中,根瘤菌15067隶属于中华根瘤菌属,与Sinorhizobium xinjiangenseIAM 14142,SinoRhizobium frediiSjzZ 4构成一个分支,其中与S.frediiSjzZ4的相似性最高,达99.72%;固氮菌10006处于固氮菌属分支中,其中和Azotobacter chroococcumAM12A,Azotobacter chroococcum的相似性均高达99.93%。为确定两株菌株的分类地位、进一步发掘和利用菌株的优良性状提供了参考依据。 展开更多
关键词 快生型大豆根瘤菌 褐球固氮菌 16srdna的全序列 系统发育分析
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应用PCR-DGGE技术分析黄海冷水团海域的细菌群落组成 被引量:29
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作者 刘敏 朱开玲 +2 位作者 李洪波 张涛 肖天 《环境科学》 CAS CSCD 北大核心 2008年第4期1082-1091,共10页
利用PCR-DGGE技术对2个季节(2006-04和2006-10)的黄海冷水团海域的细菌群落组成和优势菌群进行了分析.通过软件Glyko Bandscan分析DGGE图谱,4月份所有站位的条带数相近(约17条),多样性丰富;10月份,在冷水团范围以内站位的条带约16条... 利用PCR-DGGE技术对2个季节(2006-04和2006-10)的黄海冷水团海域的细菌群落组成和优势菌群进行了分析.通过软件Glyko Bandscan分析DGGE图谱,4月份所有站位的条带数相近(约17条),多样性丰富;10月份,在冷水团范围以内站位的条带约16条,其多样性也较丰富;而在冷水团范围以外站位的条带少(约12条),其多样性较低.细菌16S rDNA V3区特征片段经DGGE分离、条带切割,共得到24条条带,克隆、测序后,进行系统进化分析,结果显示这24条带分别归属于2个细菌类群:变形细菌门(Proteobacteria)和拟杆菌门(Bacteroides).在24条序列中有16条分别与变形细菌亚群的γ-和δ-Proteobacteria相似,有5条与拟杆菌门相似.时空分析发现,4月份所有站位水体(海水温度为7-12℃)的细菌群落组成和10月份(冷水团存在期)冷水团内部水体(海水温度低于10℃)的细菌群落组成相同(都包括γ-Proteobacteria、δ-Proteobacteria和Bacteroides),与10月份冷水团外部水体(海水温度大于19℃)的(包括γ-Proteobacteria和Bacteroides)不同.优势菌群也存在同样的分布特点,4月份所有站位水体的优势菌群与10月份冷水团内部水体的优势菌群也相同(都是γ-Proteobacteria),而10月份冷水团外部水体不同的站位优势菌群不同.该海域细菌群落组成和优势菌群的分布特点,可能与冷水团的形成有一定的相关性. 展开更多
关键词 细菌群落组成 16srdna序列分析 PCR-DGGE 黄海冷水团
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微生物絮凝剂产生菌的筛选、鉴定及其培养条件的优化研究 被引量:35
17
作者 陶然 杨朝晖 +2 位作者 曾光明 邓恩建 李晨 《中国生物工程杂志》 CAS CSCD 北大核心 2005年第8期76-81,86,共7页
采用常规细菌分离方法从土壤中筛选出一株高效絮凝剂产生菌,编号为B6。经过形态学特征、生理生化反应及16S rDNA序列(GenBank accession No.DQ115363)同源性比较鉴定该菌株为恶臭假单胞菌,命名为Pseudomonas putidaB6。对其培养基进行研... 采用常规细菌分离方法从土壤中筛选出一株高效絮凝剂产生菌,编号为B6。经过形态学特征、生理生化反应及16S rDNA序列(GenBank accession No.DQ115363)同源性比较鉴定该菌株为恶臭假单胞菌,命名为Pseudomonas putidaB6。对其培养基进行研究,确定其最佳的碳源和氮源,并通过正交试验确定其最佳的培养基成分配比(ρ/gL-1)为葡萄糖15、果糖3、KH2PO41.0、K2HPO43.0、MgSO40.1、NH4NO30.8、(NH4)2SO41.5、酵母汁0.2、NaCl0.1。同时对其培养条件进行研究,确定最佳的培养基初始pH值为8.0、培养温度为30℃、摇床速度为160r/min,以及产絮凝剂的周期变化过程。用高岭土悬浮液对其絮凝条件进行研究,确定培养液最佳的絮凝条件。 展开更多
关键词 微生物絮凝剂 絮凝微生物 16srdna序列 培养条件 正交试验 微生物絮凝剂产生菌 比较鉴定 优化研究 PSEUDOMONAS 筛选
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红树内生细菌RS261菌株防治辣椒疫病的初步研究 被引量:19
18
作者 柳凤 欧雄常 +2 位作者 何红 胡汉桥 张小媛 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2009年第3期333-336,共4页
The endophytic Bacillus amyloliquefaciens strain RS261 is a biological agent isolated from the leaf of Rhizophora stylosa.The efficacy of RS261 strain on control of capsicum phytophthora blight caused by Phytophthora ... The endophytic Bacillus amyloliquefaciens strain RS261 is a biological agent isolated from the leaf of Rhizophora stylosa.The efficacy of RS261 strain on control of capsicum phytophthora blight caused by Phytophthora capsici was studied by seed socking,root drenching and fruit spraying.The results showed that good biocontrol efficacy was achieved.It indicated that biocontrol with endophytic bacteria was an atternative and potential methed to control the capsicum seedlings and fruits phytophthora blight. 展开更多
关键词 突变菌株 辣椒疫病 内生细菌 防治效果 16srdna序列分析 红树 解淀粉芽孢杆菌 辣椒疫霉
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产甾体皂甙华重楼内生菌的筛选与鉴定 被引量:31
19
作者 赵明 贺声蓉 +2 位作者 陈小静 黄春萍 王一丁 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第5期776-779,共4页
从华重楼(Paris polyphyllavar.chinensisFranch)的地下块茎中分离筛选得到2株可能产生甾体皂甙的内生菌(SS01和SS02),薄层层析检测菌株SS01、SS02的发酵产物分别有3条和2条层析带与重楼总皂甙的层析带迁移率相当。形态和生理生化特征... 从华重楼(Paris polyphyllavar.chinensisFranch)的地下块茎中分离筛选得到2株可能产生甾体皂甙的内生菌(SS01和SS02),薄层层析检测菌株SS01、SS02的发酵产物分别有3条和2条层析带与重楼总皂甙的层析带迁移率相当。形态和生理生化特征初步表明SS01和SS02分属于肠杆菌科(Enterobacteriaceae)和芽孢杆菌属(Bacillussp.)细菌。扩增、测序得到SS01和SS02的部分16S rDNA序列,GenBank接收号分别为AY842143和AY842144。用Blastn调出与菌株16SrDNA同源的序列,用Clustal W进行多重序列对比,用软件Phylip按Neighbor-Joining方法构建16SrDNA系统发育树。菌株SS01和SS02分别与Cedecea davisae DSM4568、Paenibacillus daejeonensis处于同一分支,相似性分别为98.9%和97.7%,将它们鉴定为Cedecea davisae SS01和Paenibacillus daejeonensis SS02。 展开更多
关键词 华重楼 内生菌 甾体皂甙 16srdna序列分析
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一株异养硝化细菌的分离及系统发育分析 被引量:55
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作者 张光亚 陈美慈 +1 位作者 韩如旸 闵航 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2003年第2期156-161,共6页
从大棚土壤中分离到一株异养型硝化细菌 ,命名为菌株HN ,分离菌株为革兰氏染色阳性 ,球状或杆状。菌落颜色为橙红色。该菌株能以乙酰胺为唯一碳源和氮源进行氨化作用和硝化作用并产生亚硝酸。以硝酸钠为氮源时能进行反硝化作用。部分长... 从大棚土壤中分离到一株异养型硝化细菌 ,命名为菌株HN ,分离菌株为革兰氏染色阳性 ,球状或杆状。菌落颜色为橙红色。该菌株能以乙酰胺为唯一碳源和氮源进行氨化作用和硝化作用并产生亚硝酸。以硝酸钠为氮源时能进行反硝化作用。部分长度的 1 6SrDNA序列分析表明 ,分离菌株HN与Rhodococcusruber具有 99%相似性。并用PHYLIPS程序将该菌株与报道的相关硝化细菌进行系统发育进化分析。本文首次报道Rhodococcussp . 展开更多
关键词 异养硝化细菌 16srdna序列 系统发育
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