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干扰素-γ诱导蛋白16调控天然免疫及病毒感染的研究进展
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作者 李向茸 董平安 +1 位作者 莫荣纤 冯若飞 《微生物学报》 北大核心 2026年第2期481-494,共14页
干扰素-γ诱导蛋白16(interferon gamma-inducible protein 16,IFI16)是含pyrin和造血表达、干扰素诱导特性和核定位(hematopoietic expression,interferon-inducible nature,and nuclear localization,HIN)结构域的蛋白质(pyrin and HI... 干扰素-γ诱导蛋白16(interferon gamma-inducible protein 16,IFI16)是含pyrin和造血表达、干扰素诱导特性和核定位(hematopoietic expression,interferon-inducible nature,and nuclear localization,HIN)结构域的蛋白质(pyrin and HIN domain-containing protein,PYHIN)家族的重要成员,其独特的分子结构使其能够识别细胞内的多种核酸分子。作为一种关键的免疫调节因子,IFI16可通过多种途径参与天然免疫信号转导,在宿主抗病毒防御中发挥重要作用。本文综述了IFI16的分子特征及其在天然免疫和病毒感染中的调控机制,为抗病毒感染的治疗靶点及药物开发提供理论依据。 展开更多
关键词 干扰素-γ诱导蛋白16 DNA传感器 天然免疫 病毒感染
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颅内动脉瘤术后肺部感染患者血清CC16、TSP-1、GDF15表达及其临床意义
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作者 杨国军 刘兵 +2 位作者 赵明珍 赵静 于淼 《中国病原生物学杂志》 北大核心 2026年第3期329-333,共5页
目的探讨Clara细胞分泌蛋白16(CC16)、血小板反应蛋白-1(TSP-1)、生长分化因子15(GDF15)在颅内动脉瘤(IA)术后肺部感染(PI)患者血清中的表达及临床意义。方法将本院2019年1月~2025年6月收治的100例术后PI的IA患者设为观察组,根据严重程... 目的探讨Clara细胞分泌蛋白16(CC16)、血小板反应蛋白-1(TSP-1)、生长分化因子15(GDF15)在颅内动脉瘤(IA)术后肺部感染(PI)患者血清中的表达及临床意义。方法将本院2019年1月~2025年6月收治的100例术后PI的IA患者设为观察组,根据严重程度分为轻度组(n=35)、中度组(n=42)和重度组(n=23),另根据预后情况分为好转组(n=68)和未好转组(n=32)。另将119例术后未发生PI的IA患者设为对照组。CC16、TSP-1、GDF15与白细胞介素-6(IL-6)、降钙素原(PCT)的相关性通过Pearson法分析;血清CC16、TSP-1、GDF15预测IA术后PI患者预后的效能及一致性分别通过ROC曲线及Hosmer-Lemeshow检验评估。结果相较对照组,观察组CC16水平较低(P<0.05),TSP-1、GDF15水平较高(P<0.05)。随着IA患者PI严重程度的升高,CC16水平呈下降趋势(P<0.05),TSP-1、GDF15水平呈上升趋势(P0.05)。未好转组、好转组患者治疗7d后的CC16水平均较确诊时升高(P<0.05),TSP-1、GDF15水平均较确诊时降低(P0.05);且相较好转组,未好转组确诊时及治疗7d后CC16水平较低(P<0.05),TSP-1、GDF15水平较高(P<0.05)。相关性分析显示,术后发生PI的IA患者血清CC16、TSP-1、GDF15水平与IL-6、PCT水平存在一定相关性(P0.05)。ROC分析显示,CC16、TSP-1、GDF15联合预测IA术后PI患者预后的敏感度为84.37%,AUC为0.918,较CC16(Z=2.536,P=0.011)、TSP-1(Z=2.358,P=0.018)GDF15(Z=2.565,P=0.010)单独预测显著升高。Hosmer-Lemeshow检验表明CC16、TSP-1、GDF15联合预测结果与实际预后一致性较高。结论CC16、TSP-1、GDF15在术后PI的IA患者血清中表达异常,且三者水平与患者感染程度和预后密切相关。 展开更多
关键词 颅内动脉瘤 术后肺部感染 Clara细胞分泌蛋白16 血小板反应蛋白-1 生长分化因子15
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突触融合蛋白16在肝细胞癌中的表达及与临床病理特征和预后的相关性
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作者 黄兴 栗源 +2 位作者 高杨 郑侠 曲文书 《临床肿瘤学杂志》 2026年第2期141-147,共7页
目的探讨突触融合蛋白16(STX16)在肝细胞癌(HCC)中的表达特征,并分析其与临床病理参数及患者预后的相关性。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析STX16在HCC组织与癌旁组织中的表达差异、诊断效能及预后关联;收集江苏省肿瘤医院132例... 目的探讨突触融合蛋白16(STX16)在肝细胞癌(HCC)中的表达特征,并分析其与临床病理参数及患者预后的相关性。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析STX16在HCC组织与癌旁组织中的表达差异、诊断效能及预后关联;收集江苏省肿瘤医院132例HCC患者的临床标本,采用免疫组织化学法检测STX16蛋白在癌组织和癌旁组织中的表达水平,分析其表达差异及其与患者临床病理特征及总生存期(OS)的关系。结果TCGA队列分析显示,STX16在HCC组织中的表达水平显著高于癌旁组织(5.31±0.60 vs.3.24±0.39,P<0.01)。受试者工作特征(ROC)曲线分析表明,STX16对HCC具有较好的诊断价值,其曲线下面积(AUC)为0.940,灵敏度为87.0%,特异度为90.0%。生存分析显示,STX16高表达患者的无进展间隔期(PFI:13.1个月vs.29.2个月,P=0.005)与总生存期(OS:48.9个月vs.69.3个月,P=0.035)均显著缩短。多因素Cox回归分析证实,STX16高表达是PFI(HR=1.546,95%CI:1.047~2.282,P=0.028)和OS(HR=1.579,95%CI:1.019~2.448,P=0.041)的独立危险因素。在临床验证队列中,STX16在HCC组织中的表达水平显著高于癌旁组织(免疫组化评分:5.99 vs.1.75,P<0.01);STX16高表达患者的OS明显短于低表达患者(44.0个月vs.未达到,P<0.01);Cox回归分析显示STX16表达水平是影响OS的危险因素,但并非独立预后因素。结论STX16在HCC组织中呈显著高表达,与肿瘤的侵袭性及不良预后密切相关,可作为HCC潜在的独立预后生物标志物。 展开更多
关键词 肝细胞癌 突触融合蛋白16 生物标志物 预后 生存分析
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血清Gal-9和IFI16水平对子宫内膜异位症患者术后复发的预测价值
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作者 王爽 张晓玲 +2 位作者 周爱龙 李舒雅 黄国辉 《中国医科大学学报》 北大核心 2026年第1期89-93,共5页
探讨血清半乳糖凝集素9(Gal-9)和γ干扰素诱导蛋白16(IFI16)水平对子宫内膜异位症(简称内异症)患者术后复发的预测价值。将160例行腹腔镜手术的内异症患者根据术后是否复发分为复发组和未复发组,并将复发组患者根据痛经程度分为轻度组... 探讨血清半乳糖凝集素9(Gal-9)和γ干扰素诱导蛋白16(IFI16)水平对子宫内膜异位症(简称内异症)患者术后复发的预测价值。将160例行腹腔镜手术的内异症患者根据术后是否复发分为复发组和未复发组,并将复发组患者根据痛经程度分为轻度组和中重度组。另选取160例同期健康体检者作为对照。检测血清Gal-9和IFI16水平,分析内异症术后复发的影响因素。结果显示,内异症患者血清Gal-9和IFI16水平均异常升高,二者联合预测内异症术后复发的效能较高。 展开更多
关键词 子宫内膜异位症 半乳糖凝集素9 γ干扰素诱导蛋白16 术后复发 预测
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龟鹿二仙胶对膝骨关节炎大鼠肠道菌群的影响:机器学习与16S rDNA分析 被引量:2
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作者 顾富城 杨美鑫 +6 位作者 吴伟欣 蔡玮俊 钦洋溢 孙铭一 孙健 耿秋东 李楠 《中国组织工程研究》 北大核心 2026年第4期1058-1072,共15页
背景:龟鹿二仙胶由龟甲胶、鹿角胶、枸杞子和人参组成。在早期的临床观察中,发现使用龟鹿二仙胶治疗肝肾不足型膝骨关节炎患者能有效缓解膝关节疼痛、增加运动范围、提高行走能力。然而,口服龟鹿二仙胶能够对膝关节产生局部治疗作用的... 背景:龟鹿二仙胶由龟甲胶、鹿角胶、枸杞子和人参组成。在早期的临床观察中,发现使用龟鹿二仙胶治疗肝肾不足型膝骨关节炎患者能有效缓解膝关节疼痛、增加运动范围、提高行走能力。然而,口服龟鹿二仙胶能够对膝关节产生局部治疗作用的确切机制尚不清楚。目的:研究龟鹿二仙胶对膝骨关节炎大鼠肠道菌群的影响,并利用16SrDNA测序和机器学习分析评估其作用机制。方法:将18只雄性SD大鼠随机分为3组:空白组、模型组、龟鹿二仙胶组,每组6只。模型组和龟鹿二仙胶组采用内侧半月板失稳手术制备膝骨关节炎模型。造模成功后,龟鹿二仙胶组灌胃龟鹿二仙胶水煎剂,空白组和模型组则给予等量的蒸馏水。持续干预28 d后,使用高效液相色谱技术检测龟鹿二仙胶有效成分;MRI成像观察大鼠膝关节软骨情况采集各组大鼠粪便样本,使用试剂盒提取DNA,通过PCR扩增及纯化,构建Illumina测序文库,利用Illumina MiSeq平台进行高通量测序,生成原始序列数据。得到原始数据后,使用QIIME2软件对数据进行处理,使用线性判别分析效应值和随机森林算法对微生物数据进行差异性物种筛选,使用KEGG和MetaCyc功能通路分析探索关键菌群与实验组间的关联,使用线性判别分析效应值和随机森林算法筛选差异性物种,使用关联网络分析微生物群落间的相互作用,结合机器学习方法分析肠道菌群组成和变化。结果与结论:①龟鹿二仙胶中药复方进行LC-MS成分鉴定,共指出7种有效成分。②MRI成像显示,龟鹿二仙胶组大鼠高密度影的滑膜炎症范围减少,且股骨头内侧髁软骨较模型组退化较少。③16SrDNA测序显示模型组大鼠表现出明显的菌群失衡,在门水平上厚壁菌门和拟杆菌门的丰度显著降低,而变形菌门的比例显著增加(P<0.05)。龟鹿二仙胶组大鼠的肠道菌群结构有了显著改善,其厚壁菌门和拟杆菌门的比例回升,恢复了更为多样的菌群组成,接近空白组(P<0.05)。④KEGG和MetaCyc功能通路分析显示,龟鹿二仙胶组显著激活了多条代谢通路,包括氨基酸代谢、脂质代谢和生物素合成通路(P<0.05)。⑤上述结果提示,龟鹿二仙胶含有7种有效成分,并利用16SrDNA测序分析膝骨关节炎大鼠肠道菌群变化;龟鹿二仙胶能显著改善肠道菌群失衡,恢复有益菌丰度,对肠道菌群组成有显著影响,为龟鹿二仙胶的药效及机制提供了科学依据。 展开更多
关键词 龟鹿二仙胶 膝骨关节炎 肠道菌群 16SrDNA测序 机器学习 Α多样性 Β多样性 差异通路
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基于16S rRNA测序的抗生素治疗对反复种植失败合并慢性子宫内膜炎患者妊娠结局的影响
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作者 许美含 何陈佳 +1 位作者 吴娴 徐步芳 《上海交通大学学报(医学版)》 北大核心 2026年第2期172-180,共9页
目的·比较宫腔镜检查后给予广谱抗生素与16S rRNA基因测序并针对性给予抗生素联合补充乳杆菌对于反复种植失败(recurrent implantation failure,RIF)合并慢性子宫内膜炎(chronic endometritis,CE)患者妊娠结局的影响。方法·... 目的·比较宫腔镜检查后给予广谱抗生素与16S rRNA基因测序并针对性给予抗生素联合补充乳杆菌对于反复种植失败(recurrent implantation failure,RIF)合并慢性子宫内膜炎(chronic endometritis,CE)患者妊娠结局的影响。方法·回顾性分析2023年1月至2025年5月在上海交通大学医学院附属瑞金医院妇产科生殖医学中心就诊的676名排除已知因素(未行胚胎植入前非整倍体遗传学检测)的RIF患者(接受分泌中期16S rRNA测序或增殖期宫腔镜检查)的妊娠结局。27名患者16S rRNA检查结果提示乳杆菌占比<90%且单一病原体占比≥10%,纳入16S rRNA诊断CE组(16S rRNA组);根据致病菌给予针对性抗生素治疗7~10 d后阴道给药补充乳杆菌10 d。65名患者经宫腔镜检查及CD138免疫组织化学染色确诊CE,纳入宫腔镜诊断CE组(宫腔镜组);接受左氧氟沙星联合甲硝唑治疗14 d。所有患者于治疗后下一个月经周期开始接受冻融胚胎移植(frozen embryo transfer,FET)。使用13项影响妊娠结局的协变量将2组FET周期进行1∶4倾向性评分匹配。主要研究终点为活产率,次要研究终点包括临床妊娠率、人绒毛膜促性腺激素(human chorionic gonadotropin,HCG)阳性率、流产率、妊娠并发症及新生儿不良结局发生率。进行多因素Logistic回归分析评估与活产相关的潜在风险因素。结果·宫腔镜组65名患者共接受127个FET周期,16S rRNA组27名患者共接受33个FET周期;宫腔镜组47名患者(74个FET周期)与16S rRNA组22名患者(26个FET周期)完成匹配。匹配后,16S rRNA组活产率(61.5%vs 23.0%,P=0.001)、临床妊娠率(65.4%vs 33.8%,P=0.011)、HCG阳性率(73.1%vs 46.7%,P=0.038)均显著高于宫腔镜组;2组流产率、异位妊娠率、妊娠并发症及新生儿不良结局发生率差异均无统计学意义(均P>0.05)。多因素Logistic回归分析结果显示,宫腔镜组与更低的活产率相关(OR=0.230,95%CI 0.087~0.607,P=0.003)。此外,女方高龄、体质量指数(body mass index,BMI)增加、仅移植1个胚胎以及移植卵裂胚均与更低的活产率相关(均P<0.05)。结论·与宫腔镜诊断联合广谱抗生素治疗相比,基于16S rRNA测序的菌群检测及针对性抗生素治疗联合补充乳杆菌可更有效改善RIF合并CE患者的妊娠结局,并且未发现对于母胎安全的不良影响。 展开更多
关键词 慢性子宫内膜炎 体外受精-胚胎移植 反复种植失败 16S rRNA测序 宫腔镜 乳杆菌补充治疗
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基于16S rRNA测序对小鼠坐骨神经损伤后的肠道菌群分析
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作者 顾希 顾丹丹 +3 位作者 夏一鸣 蒋陶然 姚登兵 蒋茂荣 《中国实验动物学报》 北大核心 2026年第1期23-33,共11页
目的通过构建小鼠坐骨神经横断模型,利用16S rRNA测序研究坐骨神经损伤对肠道菌群的影响。方法将18只C57BL/6小鼠随机分组,分别为假手术组、实验组(D1组、D4组、D7组、D14组、D28组)。造模时,假手术组仅开皮暴露神经取肠道内容物,其余... 目的通过构建小鼠坐骨神经横断模型,利用16S rRNA测序研究坐骨神经损伤对肠道菌群的影响。方法将18只C57BL/6小鼠随机分组,分别为假手术组、实验组(D1组、D4组、D7组、D14组、D28组)。造模时,假手术组仅开皮暴露神经取肠道内容物,其余在造模后第1、4、7、14、28天收集小鼠结肠内容物进行16S rRNA测序,分析肠道菌群的物种丰度变化和菌群基因功能预测。结果术后第4天开始,肠道内微生物群落的物种丰富度及多样性明显下降,第7天时物种水平开始回升。厚壁菌门(Firmicutes)、疣微菌门(Verrucomicrobiota)、变形菌门(Proteobacteria)的变化趋势明显,其中且以阿克曼氏菌属(Akkermansia)、库特氏菌属(Kurthia)、杜博西氏菌属(Dubosiella)等细菌表现最为显著。与假手术组相比,实验组Akkermansia水平逐渐下降;Kurthia、Dubosiella等水平于第4天开始上升,且第7天达到峰值。另外,根据菌群基因功能预测结果推断:多种代谢通路(如脂质代谢、氨基酸代谢等)在小鼠神经横断后可能受影响。结论坐骨神经横断引发小鼠肠道微生物菌群发生显著变化且通过基因功能预测观察到代谢相关通路的变化,提示微生物潜在功能可能受到影响。该结果需通过代谢组学进行验证,以期将来为探索肠道菌群在周围神经损伤修复中的潜在作用提供研究线索。 展开更多
关键词 坐骨神经横断 肠道菌群 16S rRNA测序 小鼠
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基于16S rRNA测序与随机森林模型的上海市公共浴池水细菌群落特征及其与嗜肺军团菌污染的关联
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作者 石丽莎 陈健 +2 位作者 李晓静 郑毅鸣 张莉君 《环境与职业医学》 北大核心 2026年第1期82-88,107,共8页
[背景]公共浴池嗜肺军团菌污染问题是近年来受关注的公共卫生问题之一,其与水样细菌群落特征的关联性研究有限,16S rRNA测序技术与随机森林模型为解析该关联性及公共浴池水细菌群落特征提供了新途径。[目的]掌握上海市公共浴池水细菌群... [背景]公共浴池嗜肺军团菌污染问题是近年来受关注的公共卫生问题之一,其与水样细菌群落特征的关联性研究有限,16S rRNA测序技术与随机森林模型为解析该关联性及公共浴池水细菌群落特征提供了新途径。[目的]掌握上海市公共浴池水细菌群落结构及多样性,探究嗜肺军团菌污染与细菌群落特征的关联性,并筛选关联性关键菌属,为制定公共浴池水卫生管理规范提供科学依据。[方法]于2023年2—3月期间,依据公共沐浴场所经营规模、区域分布、不同功能情况,选取上海市10家公共浴池水为研究对象,检测其水质卫生状况。根据嗜肺军团菌检测结果,将样本分为军团菌检出组和未检出组,采用16S rRNA测序分析水样的细菌群落结构、α-多样性和β-多样性,利用冗余分析(RDA)探究理化指标与细菌群落多样性的关联性,并通过随机森林模型筛选区分两组的关键菌属,以平均精度下降值(MDA)评估菌属重要性。[结果]军团菌检出组耗氧量小于军团菌未检出组(均值分别为1.85 mg·L^(-1)vs.6.81 mg·L^(-1),P<0.05),其余理化指标两组无明显差异。测序分析结果表明,共检测到27个细菌门和454个细菌属,其中变形菌门(平均相对丰度为63.00%)为公共浴池水主要优势菌门,泥单胞菌属(8.50%)、食酸菌属(8.13%)、分枝杆菌属(7.93%)和不动杆菌属(6.59%)为优势菌属。α-多样性分析发现军团菌检出组水样中的细菌群落丰富度(Chao1和ACE指数)高于未检出组(P<0.01),β-多样性分析发现两组细菌群落结构相似(P>0.05)。RDA分析表明,细菌群落多样性与水质pH呈正相关,与耗氧量和游离性余氯呈负相关,其中RDA1和RDA2对细菌群落多样性的解释率分别为23.92%和21.30%。利用随机森林模型筛选出对军团菌检出组和未检出组水样中微生物群落分布差异有较大影响的有慢生根瘤菌科未分类属(MDA=2.42)、亚栖热菌属(MDA=2.37)、黄杆菌属(MDA=2.26)等20种关键菌属。[结论]公共浴池水细菌群落多样性受到pH值、耗氧量和游离性余氯影响,嗜肺军团菌污染水样细菌群落更丰富,且存在引起群落差异的特征性关键细菌属,机器学习随机森林技术有助于探索特征性关键细菌属,研究结果为开展该类场所风险预警提供了依据。 展开更多
关键词 公共浴池水 16S rRNA测序 随机森林模型 群落结构 多样性 嗜肺军团菌
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非小细胞肺癌患者癌组织TRIM16、TGFBR2表达及与临床病理特征、预后的关系分析
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作者 迟玮 张连勇 +4 位作者 李静静 王雪 李飞 田亮 张荣菊 《诊断病理学杂志》 2026年第2期164-169,共6页
目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)患者癌组织三结构域蛋白16(TRIM16)、转化生长因子β受体2(TGFBR2)表达及与临床病理特征、预后的关系。方法收集河北省沧州市中心医院2020年1月至2021年12月行手术治疗的84例NSCLC患者癌组织及癌旁组织,采... 目的探讨非小细胞肺癌(NSCLC)患者癌组织三结构域蛋白16(TRIM16)、转化生长因子β受体2(TGFBR2)表达及与临床病理特征、预后的关系。方法收集河北省沧州市中心医院2020年1月至2021年12月行手术治疗的84例NSCLC患者癌组织及癌旁组织,采用免疫组织化学法检测TRIM16、TGFBR2蛋白表达,同时收集整理病理类型、淋巴结转移、肿瘤分期等临床资料;采用Spearman法分析相关性;采用Kaplan-Meier法分析TRIM16、TGFBR2与患者预后的关系;采用COX回归分析患者预后的影响因素。结果与癌旁正常组织相比,NSCLC组织中TRIM16、TGFBR2阳性率明显较低(P<0.05);TRIM16、TGFBR2表达与TNM分期、淋巴结转移、细胞分化程度有关(P<0.05)。肿瘤直径>3 cm的NSCLC患者TRIM16阳性表达比例显著低于肿瘤直径≤3 cm的NSCLC患者(P<0.05)。浸润深度为深层的NSCLC患者TGFBR2阳性表达比例显著低于浸润深度为浅层的NSCLC患者(P<0.05);NSCLC组织TRIM16与TGFBR2表达呈正相关(r=0.440,P<0.05);TRIM16、TGFBR2阳性表达患者3年生存率高于TRIM16、TGFBR2阴性表达患者(Log rank χ^(2)=16.476、8.862,P<0.05)。TNM分期、淋巴结转移是NSCLC患者死亡的危险因素,TRIM16、TGFBR2是保护因素(P<0.05)。结论NSCLC组织TRIM16、TGFBR2表达与患者临床病理特征及预后有密切联系。 展开更多
关键词 三结构域蛋白16 转化生长因子β受体2 临床病理特征 预后
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基于16S核糖体RNA测序技术探讨隐匿性胰胆反流对胆囊结石患者胆汁菌群的影响
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作者 侯念宗 张诚 +7 位作者 达选博 项雨凯 张红雷 邱晨邵文涛 刘兆娜 胡海 蒋兆彦 杨玉龙 《上海医学》 2026年第1期49-58,共10页
目的通过16S核糖体RNA(16S rRNA)测序技术探究隐匿性胰胆反流(OPBR)对胆囊结石患者胆汁菌群结构和功能的影响。方法选取2024年7月1-12日于同济大学附属东方医院胆石中心就诊,拟行腹腔镜胆囊切除术或保胆手术的胆囊结石患者37例,其中男2... 目的通过16S核糖体RNA(16S rRNA)测序技术探究隐匿性胰胆反流(OPBR)对胆囊结石患者胆汁菌群结构和功能的影响。方法选取2024年7月1-12日于同济大学附属东方医院胆石中心就诊,拟行腹腔镜胆囊切除术或保胆手术的胆囊结石患者37例,其中男21例、女16例;根据患者是否合并OPBR,将患者分为对照组和OPBR组。采集患者的胆囊胆汁,测定胆汁淀粉酶水平,胆汁淀粉酶≤110 U/L的患者为未合并OPBR纳入对照组,>110 U/L的患者为合并OPBR纳入OPBR组。对胆汁样本进行16S核糖体RNA(16S rRNA)测序,并行胆汁菌群生物信息学分析:胆汁菌群测序质量评估(稀释曲线和丰度等级曲线),胆汁菌群测序物种组成分析[花瓣图分析扩增子序列变异(ASV)数量,Circos图呈现样本与物种之间的丰度],胆汁菌群α多样性分析(指标包括Shannon指数、Simpson指数、Chao1指数、ACE指数及Observed species指数)和β多样性分析[主成分分析(PCA)及非度量多维尺度(NMDS)分析],胆汁菌群差异物种线性判别分析(LEfSe)、胆汁菌群差异物种随机森林分析,以及胆汁菌群差异物种代谢KEGG通路预测分析。结果本研究最终纳入20例患者的有效胆汁样本,对照组、OPBR组各10例。测序质量评估显示,物种稀释曲线与丰度等级曲线表明数据质量可靠;所有样本测序深度及Q30碱基识别准确率均满足后续分析要求。对照组、OPBR组分别有2005、1834个ASV,两组共同存在3个ASV,对照组、OPBR组分别有2002、1831个独有的ASV。Circos图分析结果显示,两组胆汁菌群的微生物组成主要有5个核心菌门,分别为变形菌门、厚壁菌门、拟杆菌门、放线菌门和脱硫杆菌门,变形菌门相对丰度在两组中均占据绝对优势地位,厚壁菌门次之。α多样性分析结果显示,在物种多样性方面,OPBR组的Shannon指数显著低于对照组(P<0.05),Simpson指数显著高于对照组(P<0.05);在物种数量方面,OPBR组的Chao1指数、ACE指数和Observed species指数均显著低于对照组(P值均<0.05)。PCA与NMDS分析结果显示,PCA第一主成分(PC1)解释65.21%的变异,能够清晰分离两组样本(组间距离>组内离散度);NMDS应力值为0.038(<0.05),进一步验证组间菌群结构差异显著。LEfSe分析结果显示,OPBR组瘤胃球菌属显著富集,对照组芽单胞菌门、鞘氨醇单胞菌目、双歧杆菌目、水杆菌属、普雷沃菌科NK3B31组、粪杆菌属等显著富集。随机森林模型显示,粪杆菌属为鉴别两组的关键生物标志物,其次为瘤胃球菌属。KEGG通路功能预测分析结果显示,OPBR组菌群的脂类、糖类、氨基酸的代谢功能降低,微生物的活性和毒性增加。结论合并OPBR的胆囊结石患者胆汁菌群结构紊乱(粪杆菌属丰度下降而瘤胃球菌属丰度上升)及功能异常(代谢减弱、毒性增强),可能是OPBR诱发胆囊病变的微生物学机制,为防治OPBR提供了潜在靶点。 展开更多
关键词 隐匿性胰胆反流 胆囊结石 胆汁菌群 16S核糖体RNA测序
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GT1株弓形虫ROP16蛋白不同功能片段对三阴性乳腺癌细胞表型的影响
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作者 周月 赵志军 《中国兽医科学》 北大核心 2026年第2期175-183,共9页
为了探究Ⅰ型GT1株弓形虫ROP16蛋白不同功能截短体(激酶域与N端保守基序)对三阴性乳腺癌MDA-MB-231细胞周期、增殖、凋亡及迁移的影响,解析其抗肿瘤活性的分子结构关键功能域。首先基于NCBI-CDD预测ROP16功能域,构建ROP16激酶域截短体(3... 为了探究Ⅰ型GT1株弓形虫ROP16蛋白不同功能截短体(激酶域与N端保守基序)对三阴性乳腺癌MDA-MB-231细胞周期、增殖、凋亡及迁移的影响,解析其抗肿瘤活性的分子结构关键功能域。首先基于NCBI-CDD预测ROP16功能域,构建ROP16激酶域截短体(357~707aa)及N端截短体(1~356aa)慢病毒载体;建立MDA-MB-231稳转细胞系,通过CCK8、流式凋亡/周期检测、划痕/Transwell试验评估功能域对细胞表型的影响;结合RT-qPCR、Western-blot分析凋亡相关基因(BAX/BCL2/CASP3)的m RNA及蛋白表达。结果显示,ROP161~356截短体可显著抑制MDA-MB-231细胞增殖(P<0.05),促进细胞凋亡(P<0.05),引起G2/M期阻滞,同时上调促凋亡因子BAX、Caspase3表达;而ROP16357~707截短体非但不具抗肿瘤活性,反而促进细胞增殖(P<0.05),加速有丝分裂进程,并显著增强细胞的转移(P<0.01)及侵袭能力(P<0.05)。本研究首次证实ROP16 N端保守基序(1~356aa)在抗肿瘤作用中起核心作用,揭示了ROP16不同功能截短体对肿瘤细胞的差异性调控,为基于ROP16蛋白开发新型抗肿瘤生物制剂提供了关键理论依据与研究方向。 展开更多
关键词 弓形虫 ROP16蛋白 截短体 MDA-MB-231细胞 表型
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基于16S rDNA基因测序探究痛泻要方对肝郁脾虚型IBS-D患者肠道菌群的影响
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作者 周坤城 姚承佼 +8 位作者 李奕霖 罗利红 谢凤娇 熊钦 杨洋 唐俊玲 周世文 程相熊 冯培民 《时珍国医国药》 北大核心 2026年第4期781-789,共9页
目的探讨中国西南部人群中健康对照组与肝郁脾虚型IBS-D患者之间的肠道菌群及代谢物差异,初步评估痛泻要方对肝郁脾虚型IBS-D患者肠道菌群的影响。方法课题纳入了60例健康对照组与120例肝郁脾虚型IBS-D患者,并将IBS-D患者随机分为空白... 目的探讨中国西南部人群中健康对照组与肝郁脾虚型IBS-D患者之间的肠道菌群及代谢物差异,初步评估痛泻要方对肝郁脾虚型IBS-D患者肠道菌群的影响。方法课题纳入了60例健康对照组与120例肝郁脾虚型IBS-D患者,并将IBS-D患者随机分为空白对照组、痛泻要方治疗组(n=60)。收集患者就诊前及就诊14天后的粪便样本以及健康志愿者体检当日的粪便样本,并通过16S rDNA基因测序技术检测健康对照组、痛泻要方治疗前后患者肠道菌群的变化。结果IBSD和健康对照组的拟杆菌门/厚壁菌门(F/B)比率差异明显。经过痛泻要方治疗后,IBS-D的罗氏菌属(Roseburia)、罗姆布茨菌属(Roseburia spp.,Romboutsia timonensis)以及唾液链球菌(Streptococcus_salivarius)的丰度增高。KEGG富集结果显示:在IBS-D患者中,MAPK信号通路、自噬和T细胞受体信号通路的活性显著增强。结论健康对照组,肝郁脾虚型IBS-D患者和痛泻要方治疗后的IBS-D患者肠道菌群结构与功能均存在显著差异。痛泻要方可能通过增加罗氏菌属、罗姆布茨菌属、唾液链球菌等菌属的丰度,调节肠道菌群并对肝郁脾虚型IBS-D患者产生疗效。 展开更多
关键词 腹泻型肠易激综合征 肝郁脾虚型 痛泻要方 肠道菌群 16S rRNA基因测序
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柯萨奇病毒A16小鼠适应过程中VP1位点突变与复制动力学的相关性研究
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作者 李慧洁 王蕊 +4 位作者 李冀琛 段伟 梁钰材 孙强 张勇 《病毒学报》 北大核心 2026年第1期23-36,共14页
目的阐明柯萨奇病毒A16(Coxsackievirus A16,CVA16)在跨宿主适应过程中毒力增强的分子基础,并构建从母株(P0株)到小鼠适应株(P5株)的表型与遗传演化框架,为解析其宿主适应性机制提供理论依据。方法以临床分离的CVA16母株(P0株)为起始毒... 目的阐明柯萨奇病毒A16(Coxsackievirus A16,CVA16)在跨宿主适应过程中毒力增强的分子基础,并构建从母株(P0株)到小鼠适应株(P5株)的表型与遗传演化框架,为解析其宿主适应性机制提供理论依据。方法以临床分离的CVA16母株(P0株)为起始毒株,通过在ICR乳鼠体内连续传代构建小鼠适应性毒株,建立P0株至P5株的完整演化谱系。利用全基因组测序技术比较P0株与P5株的遗传变异差异,结合RD细胞感染实验与乳鼠攻毒实验,系统评估不同代次毒株的体外复制能力、体内致病性及靶器官组织病理学改变。通过病毒结合试验与内化试验,解析CVA16毒力增强的可能分子机制。结果基因组比对分析明确了P0株与P5株间的变异特征,其中VP1的关键突变定位于病毒入侵相关功能区域。体内外表型验证显示,P5株相较于P0母株呈现显著增强的复制能力与致病性:在RD细胞中可诱导更高水平的病毒颗粒产生及病毒RNA复制;对乳鼠攻毒后,能引发快速体重下降、后肢麻痹等典型症状,且致死率达100%;在乳鼠骨骼肌、肺和脊髓中,病毒滴度显著升高,并造成更严重的组织炎性浸润与结构损伤。机制研究证实,P5株毒力升高主要与病毒内化效率及后续胞内复制能力的提升有关,而病毒与宿主细胞的初始结合能力无显著差异。结论本研究揭示CVA16在小鼠适应过程中,其毒力增强是由多层次遗传变异驱动的结果,其中病毒进入效率和胞内复制能力的提升是关键调控因素。本研究为理解CVA16跨宿主适应机制及神经系统致病机理提供了试验证据,也为靶向病毒结构功能域的抗病毒药物研发及疫苗设计奠定了基础。 展开更多
关键词 柯萨奇病毒A16 小鼠适应株 VP1突变 病毒内化 致病性
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高盐上调TMEM16A致小鼠冠状动脉重构的机制
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作者 满志 秦小江 +8 位作者 郑志发 方梦薇 孟欣 郭苏 张学凤 杨灵波 施熠炜 张明升 侯晓敏 《中国动脉硬化杂志》 2026年第2期103-110,共8页
[目的]探讨高盐摄入上调跨膜蛋白16A(TMEM16A)致小鼠冠状动脉重构的机制。[方法]36只8周龄雄性C57BL/6J小鼠随机分为3组:对照组(饮食中未额外添加NaCl)、10 g/L NaCl组(1 L纯水中含10 g NaCl)和20 g/L NaCl组(1 L纯水中含20 g NaCl),喂... [目的]探讨高盐摄入上调跨膜蛋白16A(TMEM16A)致小鼠冠状动脉重构的机制。[方法]36只8周龄雄性C57BL/6J小鼠随机分为3组:对照组(饮食中未额外添加NaCl)、10 g/L NaCl组(1 L纯水中含10 g NaCl)和20 g/L NaCl组(1 L纯水中含20 g NaCl),喂养8周。每周测量小鼠体重和收缩压(SBP);8周后,收集血清测量小鼠血清Na+浓度;测量小鼠左心室质量指数(LVMI)以评估高盐对小鼠心脏的影响;Langendorff逆行恒压灌流法测定小鼠冠状动脉流量(CF);HE染色评估小鼠冠状动脉形态学改变,并计算管壁厚度百分比及管壁面积百分比;微血管张力记录仪检测小鼠离体冠状动脉收缩性变化,以冠状动脉血管环面积标化其张力;Western blot检测小鼠冠状动脉中TMEM16A蛋白表达;免疫荧光双染检测小鼠冠状动脉中TMEM16A和α-平滑肌肌动蛋白(α-SMA)表达。[结果]8周后,10 g/L NaCl组和20 g/L NaCl组小鼠体重变化率均低于对照组,SBP均显著高于对照组(P<0.05或P<0.01)。与对照组相比,10 g/L NaCl组和20 g/L NaCl组小鼠血清Na+浓度均增加(P<0.05或P<0.01);高盐摄入可增加小鼠LVMI,降低小鼠CF,且均以20 g/L NaCl组小鼠最显著(P<0.01);10 g/L NaCl组和20 g/L NaCl组小鼠冠状动脉的管壁厚度百分比和管壁面积百分比均显著增加(均P<0.01);10 g/L NaCl组和20g/L NaCl组小鼠冠状动脉对60 mmol/L KCl和0.03μmol/L内皮素1的收缩反应均显著增强(P<0.01);20 g/L NaCl组小鼠冠状动脉中TMEM16A蛋白表达显著增加(P<0.01),10 g/L NaCl组和20 g/L NaCl组小鼠冠状动脉中TMEM16A和α-SMA荧光表达均显著增加(均P<0.01),且TMEM16A与α-SMA在冠状动脉中存在显著共定位。[结论]高盐摄入可致小鼠冠状动脉重构,其机制可能与上调冠状动脉TMEM16A的表达有关。 展开更多
关键词 高盐摄入 跨膜蛋白16A 冠状动脉 血管重构
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血清IL-16、IL-17、IL-23与寻常型银屑病患者并发心血管事件的关联性分析
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作者 程露 徐继鹏 陈盼 《淮海医药》 2026年第1期21-25,共5页
目的:探讨血清白细胞介素-16(IL-16)、IL-17、IL-23与寻常型银屑病患者并发心血管事件的关联性。方法:选取2019年5月—2022年12月某院就诊的165例寻常型银屑病患者为研究对象,实施常规治疗,随访并统计心血管事件发生情况;根据患者是否... 目的:探讨血清白细胞介素-16(IL-16)、IL-17、IL-23与寻常型银屑病患者并发心血管事件的关联性。方法:选取2019年5月—2022年12月某院就诊的165例寻常型银屑病患者为研究对象,实施常规治疗,随访并统计心血管事件发生情况;根据患者是否发生心血管事件分为发生组和未发生组。采用多因素Logistic回归模型分析寻常型银屑病患者并发心血管事件的影响因素;绘制受试者工作特征(ROC)曲线分析血清IL-16、IL-17、IL-23水平对寻常型银屑病患者并发心血管事件的预测价值。结果:随访时间10~52个月,中位数为35个月,失访16例,失访率为9.70%(16/165);149例患者完成随访,共计21例发生心血管事件,发生率为14.09%(21/149)。多因素Logistic回归分析显示,年龄(OR=1.053)、BMI(OR=1.055)、吸烟史(OR=1.057)、病程(OR=1.132)、高血压(OR=1.053)、糖尿病(OR=1.066)、高脂血症(OR=1.055)、高尿酸血症(OR=1.092)、抑郁(OR=1.044)、睡眠障碍(OR=1.048)、血清IL-16(OR=1.063)、IL-17(OR=1.067)、IL-23(OR=1.103)、使用生物制剂治疗(OR=0.935)均为寻常型银屑病患者并发心血管事件的影响因素(P<0.05)。ROC分析显示,血清IL-16、IL-17、IL-23预测寻常型银屑病患者并发心血管事件的AUC分别为0.733、0.755、0.661,联合预测的AUC为0.886,特异度为95.31%,灵敏度为76.19%。结论:血清IL-16、IL-17、IL-23水平以及年龄、BMI、吸烟史、病程、高血压、糖尿病、高脂血症、高尿酸血症、抑郁、睡眠障碍、使用生物制剂治疗均为寻常型银屑病患者并发心血管事件的影响因素,血清IL-16、IL-17、IL-23联合检测有较高的预测价值。 展开更多
关键词 寻常型银屑病 白细胞介素-16 白细胞介素-17 白细胞介素-23 心血管事件 影响因素
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血清自噬相关蛋白16样蛋白1及半乳糖凝集素-9与活动性肺结核患者临床预后的相关性
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作者 赵新鸽 杨晶 《医药论坛杂志》 2026年第2期182-186,192,共6页
目的 观察活动性肺炎患者血清自噬相关蛋白16样蛋白1(autophagy related protein 16 like protein 1,ATG16L1)与半乳糖凝集素-9(galectin-9,GAL-9)表达,分析二者与患者预后的相关性。方法 回顾性研究,收集2022年6月—2024年2月于河南省... 目的 观察活动性肺炎患者血清自噬相关蛋白16样蛋白1(autophagy related protein 16 like protein 1,ATG16L1)与半乳糖凝集素-9(galectin-9,GAL-9)表达,分析二者与患者预后的相关性。方法 回顾性研究,收集2022年6月—2024年2月于河南省胸科医院确诊并完成6个月标准化(2HRZE/4HR)治疗的134例活动性肺结核患者资料,患者均为初治活动性肺结核患者,临床资料均保存完整,依据疗效将入选患者分为预后良好组(n=92)与预后不良组(n=42)。比较两组患者接受治疗前血清ATG16L1、GAL-9表达及其他资料,通过限制性立方样条法分析血清ATG16L1、GAL-9表达与患者临床预后的关系,并通过交互作用检验血清ATG16L1、GAL-9对活动性肺结核患者临床预后的交互作用。结果 预后不良组患者确诊时血清ATG16L1[(14.09±3.24)ng/L vs (9.74±2.06)ng/L]、GAL-9[(6.13±1.84)ng/mL vs (4.83±1.75)ng/mL]水平高于预后良好组(t=7.982、3.921,P均<0.001)。Logistic回归分析显示,活动性肺结核患者ATG16L1、GAL9高表达是其临床预后不良危险因素(OR>1,P<0.05)。限制性立方样条法分析显示,活动性肺结核患者确诊时血清ATG16L1、GAL-9水平与临床预后不良风险呈线性剂量反应关系(P<0.05),当确诊时血清ATG16L1≥10.45 ng/L,GAL-9≥5.22 ng/mL,患者临床预后不良风险随二者水平的增加而升高。交互作用分析显示,血清ATG16L1、GAL-9对活动性肺结核患者临床预后不良存在正向交互作用,二者同时高表达(ATG16L1>11.10 ng/L,GAL-9>5.23 ng/mL)时患者临床预后不良风险是二者同时低表达(ATG16L1≤11.10 ng/L,GAL-9≤5.23 ng/mL)时的35.833倍。结论 活动性肺结核患者临床预后与确诊时血清ATG16L1、GAL-9水平异常有关,确诊时血清ATG16L1、GAL-9水平异常升高可能提示临床预后不良风险。 展开更多
关键词 活动性肺结核 自噬相关蛋白16样蛋白1 半乳糖凝集素-9 预后
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16S rRNA测序法及其在动物肠道微生物研究中的应用
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作者 张金宝 马春芳 +1 位作者 杨奇 郭许峰 《动物医学进展》 北大核心 2026年第1期109-114,共6页
动物肠道微生物的物种丰度大、群落结构和生长习性复杂,对动物机体免疫功能具有很好的调节作用,使得动物肠道微生物的研究成为难点和热点。传统的形态学和生化学鉴定方法已无法满足细菌鉴定的需求,核苷酸测序法逐步被科研学者所接受,在... 动物肠道微生物的物种丰度大、群落结构和生长习性复杂,对动物机体免疫功能具有很好的调节作用,使得动物肠道微生物的研究成为难点和热点。传统的形态学和生化学鉴定方法已无法满足细菌鉴定的需求,核苷酸测序法逐步被科研学者所接受,在初步形态鉴定的基础上,借助16S rRNA高通量测序法进一步进行细菌基因鉴定,可精准测定分析细菌种类。论文就16S rRNA高通量测序法在动物肠道微生物研究中的应用进展进行综述,旨在为动物肠道微生物相关进一步研究提供理论依据。 展开更多
关键词 16S Rrna 动物肠道 微生物
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探究16S rDNA不同区间对药品生产环境常见细菌的种水平鉴定能力
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作者 郗俊杰 孙玲莉 +5 位作者 娄永锋 陈周伟 刘程智 沈泓 李珏 陈欢 《中国现代应用药学》 北大核心 2026年第1期94-101,共8页
目的 探究16S rDNA不同区间对药品生产环境常见细菌的种水平鉴定能力。方法 计算德国细菌古菌分类学数据库(List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature,LPSN)收录的所有模式菌株序列以及洁净室中常见分离细菌对应的模式... 目的 探究16S rDNA不同区间对药品生产环境常见细菌的种水平鉴定能力。方法 计算德国细菌古菌分类学数据库(List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature,LPSN)收录的所有模式菌株序列以及洁净室中常见分离细菌对应的模式菌株在16S rDNA不同区间香农熵,分析16S rDNA不同区间的物种水平鉴定能力;对所有LPSN收录的模式菌株进行相似度差值的比较,同时收集403个具有代表性的药品生产环境分离菌株样品,进行16S rDNA测序后完成相似度差值的比较,基于相似度差值探究16S rDNA不同区间的鉴定结果区分度;考虑到不同区间对不同种属可能存在区分能力的差异,对各区间测序区分度不显著的物种进行了相关性分析。结果 16S rDNA的27F~533R区间相比其他区间(533F~1100R区间、1100F~1492R区间)具有最高的种间分辨率,同时该区间的鉴定结果中,第一顺位与第二顺位的序列相似度差值最大,扩展比对区间对提升物种间的区分度没有显著效果。结论 优先应用16S rDNA的27F~533R区间开展细菌的种水平鉴定是高效、可靠的做法。 展开更多
关键词 16S rDNA测序 细菌 药品 种水平 鉴定
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考虑温度和几何尺寸影响的16MnD5钢断裂行为研究
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作者 祁爽 黄平 +5 位作者 包陈 崔光顺 安英辉 范敏郁 方奎元 钱王洁 《核动力工程》 北大核心 2026年第1期107-117,共11页
反应堆压力容器通常采用16MnD5低合金钢制造,但在高温、高压及中子辐照环境下,该材料易出现断裂韧性降低及韧脆转变温度T0升高的现象,从而对服役安全构成潜在威胁。为研究温度与几何尺寸对断裂韧性的影响,本文采用0.5T、0.4T和0.16T三... 反应堆压力容器通常采用16MnD5低合金钢制造,但在高温、高压及中子辐照环境下,该材料易出现断裂韧性降低及韧脆转变温度T0升高的现象,从而对服役安全构成潜在威胁。为研究温度与几何尺寸对断裂韧性的影响,本文采用0.5T、0.4T和0.16T三种紧凑拉伸(CT)试样,在温度为-80~350℃内开展断裂韧性试验,并结合主曲线法、多温度法和应变能密度断裂失效(SDFF)模型对试验数据进行系统分析。结果表明,随着温度升高,16MnD5钢的断裂韧性逐渐增加,并在200℃以上趋于稳定;在低温条件下,材料由延性断裂转变为脆性断裂,其韧脆转变区间约为-40~-60℃。此外,试样尺寸对断裂韧性影响显著:随着尺寸增大,裂尖约束效应增强,导致断裂韧性降低;而小尺寸试样因平面应力占主导而表现出更高的韧性。本研究揭示了温度与几何尺寸对16MnD5钢断裂韧性的耦合影响规律,并提出了适用于小试样与大试样断裂性能转换的评价方法,为反应堆压力容器材料的安全评估与寿命管理提供了理论依据。 展开更多
关键词 16MnD5 断裂韧性 温度 几何尺寸 主曲线法 应变能密度断裂失效(SDFF)模型
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卵巢癌组织miR-143、miR-145表达与患者HPV16/18感染及预后的关系
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作者 刘隆苹 吴辉云 +3 位作者 谢超 陈蓉 赵建华 程子院 《中国妇产科临床杂志》 北大核心 2026年第1期30-33,共4页
目的探讨卵巢癌组织miR-143、miR-145表达与患者人乳头瘤病毒(HPV)16/18感染及预后的关系。方法选取2020年2月至2023年7月于景德镇市第一人民医院接受治疗的卵巢癌患者120例作为研究对象。检测患者癌组织及癌旁组织miR-143、miR-145表... 目的探讨卵巢癌组织miR-143、miR-145表达与患者人乳头瘤病毒(HPV)16/18感染及预后的关系。方法选取2020年2月至2023年7月于景德镇市第一人民医院接受治疗的卵巢癌患者120例作为研究对象。检测患者癌组织及癌旁组织miR-143、miR-145表达水平并进行比较;比较不同年龄、临床分期、有无感染HPV16/18等临床特征患者癌组织miR-143、miR-145表达水平;随访6个月,依据预后情况分为预后不良组(n=36)和预后良好组(n=84),比较两组患者的癌组织miR-143、miR-145表达水平;绘制ROC曲线评价癌组织miR-143、miR-145表达对卵巢癌患者短期预后的评估价值。结果癌组织miR-143、miR-145表达水平均显著低于癌旁组织(P<0.05);肿瘤>2 cm、FIGO分期Ⅲ~Ⅳ期、有淋巴结转移、远处转移与HPV16/18感染患者癌组织miR-143、miR-145表达水平均降低(P<0.05);预后不良组患者癌组织miR-143、miR-145表达水平显著低于预后良好组患者(P<0.05);ROC结果显示,癌组织miR-143、miR-145与联合评估曲线下面积(AUC)分别为0.767、0.797、0.838,检测灵敏度分别为0.738、0.786、0.869,特异性分别为0.750、0.667、0.750,联合评估效能显著优于各指标单独评估(P<0.05)。结论癌组织miR-143、miR-145表达与卵巢癌患者HPV16/18感染有关,与患者短期预后具有良好的预测价值。 展开更多
关键词 卵巢癌 MIR-143 MIR-145 人乳头瘤病毒16/18 预后
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