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Cytb和12S rRNA基因在法医学野生动物种属鉴定中的应用
1
作者 姜德志 张雅欣 +9 位作者 臧钰 安茂蕾 张赞 邱程程 姜曜恒 宋伟 赵宏 解坤 陈佳艺 乌日嘎 《中国法医学杂志》 2025年第3期308-311,322,共5页
目的分析比较DNA条形码细胞色素b(Cytochrome b,Cytb)与12S rRNA(ribosomal RNA,rRNA)基因序列用于野生动物种属鉴定的效能。方法对10份野生动物检材进行DNA提取、定量、Cytb与12S rRNA基因序列扩增、Sanger测序以及序列比对分析。结果... 目的分析比较DNA条形码细胞色素b(Cytochrome b,Cytb)与12S rRNA(ribosomal RNA,rRNA)基因序列用于野生动物种属鉴定的效能。方法对10份野生动物检材进行DNA提取、定量、Cytb与12S rRNA基因序列扩增、Sanger测序以及序列比对分析。结果6份检材的两个基因片段均扩增成功,1份检材仅Cytb扩增成功,3份检材仅12S rRNA扩增成功。DNA序列分析显示,单独采用Cytb时,6份检材可鉴定至物种水平(黑水鸡、山斑鸠、雉鸡、黄爪隼、和尚鹦鹉、猞猁),1份检材仅能鉴定至属水平(兔属);单独采用12S rRNA时,8份检材可鉴定至物种水平(黑水鸡、华南兔、雉鸡、和尚鹦鹉、小麂、猕猴、猞猁),隶属于七个物种,而1份检材仅能鉴定至属水平(隼属);而联合采用Cytb和12S rRNA时,所有检材均可鉴定至物种水平。结论在应用DNA条形码技术鉴定野生动物时,本研究选取的Cytb与12S rRNA基因区域可鉴定黑水鸡、山斑鸠等常见物种,但难以区分同属近缘物种。故在野生动物种属鉴定实践中,对疑为此类者推荐选用2个或更多的DNA条形码标记。 展开更多
关键词 种属鉴定 DNA条形码 CYTB 12s rRNA 野生动物
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基于线粒体12S rRNA的南极鱼亚目鱼类物种鉴定研究
2
作者 王晓谕 彭祖焜 +3 位作者 朱久阳 黄开 朱国平 王丛丛 《海洋渔业》 北大核心 2025年第4期543-555,共13页
南极鱼亚目鱼类种类繁多,且同科鱼类在外形特征上相似,为对其进行准确的物种鉴定,于2021-2023年在CCLAMR48.1亚区和48.2亚区收集了101尾南极鱼类,利用DNA条形码技术,从分子水平分析南极鱼亚目鱼类间的系统进化关系,并验证了12SrRNA基因... 南极鱼亚目鱼类种类繁多,且同科鱼类在外形特征上相似,为对其进行准确的物种鉴定,于2021-2023年在CCLAMR48.1亚区和48.2亚区收集了101尾南极鱼类,利用DNA条形码技术,从分子水平分析南极鱼亚目鱼类间的系统进化关系,并验证了12SrRNA基因作为DNA条形码对南极鱼亚目鱼类物种鉴定的适用性。结果表明,采集的101尾鱼类包括3科13属13种,13种南极鱼类的种间平均遗传距离为0.039 1,是种内平均遗传距离的11.7倍,符合作为DNA条形码的基本要求。NJ进化树拓扑结构显示,除了头带冰鱼(Chaenocephalus aceratus)和眼斑雪冰鱼(Chionodraco rastrospinosus),其余序列均能形成独立的单支,同科物种聚类在一支上,具有较高的节点支持率。综上所述,基于线粒体12SrRNA基因的DNA条形码能够对南极鱼亚目鱼类进行准确的物种鉴定,在科的水平上展现出清晰的系统进化关系。 展开更多
关键词 南极鱼亚目 12s rRNA DNA条形码 物种鉴定
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华南地区耳聋人群线粒体基因12S rRNA的突变频谱筛查
3
作者 黄露莎 岑晓晴 +5 位作者 梁悦 王月莹 王娟 方淑斌 姜鸿彦 陈垲钿 《中华耳科学杂志》 北大核心 2025年第3期431-437,共7页
目的 研究华南地区耳聋人群线粒体12S rRNA基因在非综合征型耳聋和药物性耳聋中的突变谱特点,对发现的候选突变位点进行初步功能探讨。方法 选取2010年5月至2020年11月中山大学附属第一医院收治的来自广东、广西、海南、福建、江西等省... 目的 研究华南地区耳聋人群线粒体12S rRNA基因在非综合征型耳聋和药物性耳聋中的突变谱特点,对发现的候选突变位点进行初步功能探讨。方法 选取2010年5月至2020年11月中山大学附属第一医院收治的来自广东、广西、海南、福建、江西等省份的散发性或家族性听力障碍患者312例,另选取同期年龄匹配的听力正常者180例。对312例非综合征型耳聋和药物性耳聋患者进行病史、临床表型分析,采用Sanger测序对患者线粒体12S rRNA基因进行检测,采用焦磷酸测序方法对TRMU基因m.7445A>G,m.7444G>A和线粒体突变阈值进行定量。采用线粒体结构比较和系统发育分析方法对潜在的致病位点进行功能分析。结果 线粒体12S rRNA基因检测共发现28个突变,包括5种已知和可能的致病突变(m.827A>G、m.961insC、m.1005T>C、m.1027A>G和m.1555A>G)和1个新的替换突变m.1236C>T。可能的致病突变比例为5.77%(18/312)。未发现TRMU基因m.7445A>G和m.7444G>A突变。线粒体突变阈值对表型的修饰作用不明确。线粒体结构比较和系统发育分析支持m.1555A>G,m.827A>G和m.1005T>C为药物性耳聋的致病性突变,m.1027A>G,m.961insC和新发现的m.1236C>T可能与耳聋相关。此外,m.750A>G,m.1438A>G的致病性有待研究。结论 线粒体12S rRNA突变在非综合征型耳聋和药物性耳聋中突变率较高,m.1555A>G,m.827A>G和m.1005T>C为药物性耳聋的致病性突变可能性大。 展开更多
关键词 线粒体12s rRNA GJB2 TRMU 非综合征型耳聋 药物性耳聋
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基于线粒体12S rRNA基因鉴别混合牛肉及制品的牛种来源 被引量：23
4
作者 陈冬 柏凡 +2 位作者 周明亮 张翔宇 吴登俊 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2008年第8期1008-1014,共7页
线粒体基因组具有种内高度保守性。它的12SrRNA基因同时具有抗腐蚀、耐高温的特点,而被用于饲料、鲜肉及肉制品的来源追踪和物种成分鉴别等研究。利用牦牛、普通牛、水牛作为研究材料,在牛线粒体12SrRNA基因通用引物扩增片段区域发现3... 线粒体基因组具有种内高度保守性。它的12SrRNA基因同时具有抗腐蚀、耐高温的特点,而被用于饲料、鲜肉及肉制品的来源追踪和物种成分鉴别等研究。利用牦牛、普通牛、水牛作为研究材料,在牛线粒体12SrRNA基因通用引物扩增片段区域发现3种特异的酶切位点,可用于混合鲜牛肉及制品的牛种来源的鉴别。结果显示:牦牛12SrRNA扩增片段被酶切为203bp和250bp,普通牛为134bp和318bp,水牛为86bp和367bp,通过测序验证了特异性位点和酶切的正确性;对样品经过不同温度(100℃、120℃、140℃、160℃和180℃)处理均能扩增到目的条带,但条带从120℃开始变淡。该方法在鲜牛肉及制品的牛种来源鉴别上具有简单、快速、廉价等优点。 展开更多
关键词 12s RRNA 酶切 牛线粒体基因 内源参照基因
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3种青蟹线粒体12S rRNA基因序列分析 被引量：20
5
作者 高天翔 王玉江 +2 位作者 刘进贤 渡边精一 伏屋玲子 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期313-317,共5页
对采自泰国、马达加斯加和日本各地的青蟹属的3种青蟹Scyllaserrata(Forskl)、S.oceanica(Dana)和S.tranquebarica(Fabricius)的线粒体12SrRNA基因片段序列进行了测定,分析研究了其种间遗传差异及系统发育关系。研究结果显示:S.serrata... 对采自泰国、马达加斯加和日本各地的青蟹属的3种青蟹Scyllaserrata(Forskl)、S.oceanica(Dana)和S.tranquebarica(Fabricius)的线粒体12SrRNA基因片段序列进行了测定,分析研究了其种间遗传差异及系统发育关系。研究结果显示:S.serrata、S.oceanica及S.tranquebarica在12SrRNA基因片段上存在长度差异,3种青蟹的序列长度分别为422bp、426bp、425bp;种内个体间无序列差异或差异极小,种间序列差异远大于种内差异。以日本虫寻和底栖短桨蟹为外群,采用距离法和最大简约法重新构建了3种青蟹的分子系统树,得到的三个明显的分枝分别对应于上述3种青蟹,S.oceanica与S.tranquebarica两种间的亲缘关系较近。研究结果支持3种青蟹为不同物种的观点,建议对其进行分别的渔业管理。 展开更多
关键词 青蟹属 线粒体DNA 12s RRNA基因 遗传变异 系统发育
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基于线粒体12S rRNA序列探讨4种青蟹系统发育关系及中国沿海青蟹的分类地位 被引量：21
6
作者 高天翔 王玉江 +2 位作者 刘进贤 马凌波 今井秀行 《中国海洋大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期57-60,32,共5页
研究青蟹属4种青蟹的系统发育关系,阐明分布于中国沿海青蟹的分类地位,本研究采集了青蟹属4种青蟹以及中国沿海的青蟹样品,测定分析了其线粒体12S rRNA部分片段序列。结果表明4种青蟹的12S rRNA基因片段长度存在差异,每一种的个体都单... 研究青蟹属4种青蟹的系统发育关系,阐明分布于中国沿海青蟹的分类地位,本研究采集了青蟹属4种青蟹以及中国沿海的青蟹样品,测定分析了其线粒体12S rRNA部分片段序列。结果表明4种青蟹的12S rRNA基因片段长度存在差异,每一种的个体都单独聚为1支,中国沿海的青蟹样品全部与Scylla paramamosain聚为1支,结果提示分布于中国沿海的青蟹主要是S.paramamosain。S.serrata,S.paramamosain和S.tranquebarica3个种间的亲缘关系较近,这3个种形成1个单系群并且具有很高的自展置信值。S.olivacea与其他3个种互为单系,与以上3种青蟹的亲缘关系较远。 展开更多
关键词 青蟹 12s RRNA 系统发育 分类
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基于线粒体DNA 12S rRNA和COⅢ基因序列研究中国沿海7个长蛸(Octopus variabilis)野生群体的遗传多样性 被引量：13
7
作者 徐梅英 李继姬 +3 位作者 郭宝英 吕振明 周超 吴常文 《海洋与湖沼》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期387-396,共10页
基于线粒体DNA的12S rRNA和COⅢ基因序列对我国沿海重要经济头足类长蛸不同群体(大连、烟台、青岛、连云港、舟山、温州、厦门)进行了遗传多样性和遗传结构的分析。由PCR扩增获得80个个体的12SrRNA基因416bp、COⅢ基因512bp的部分序列,... 基于线粒体DNA的12S rRNA和COⅢ基因序列对我国沿海重要经济头足类长蛸不同群体(大连、烟台、青岛、连云港、舟山、温州、厦门)进行了遗传多样性和遗传结构的分析。由PCR扩增获得80个个体的12SrRNA基因416bp、COⅢ基因512bp的部分序列,两者多态性遗传参数统计显示,80个个体分别检出64(12S)和27(COⅢ)个单倍型,总群体单倍型多样性指数(Hd)分别为0.984(12S)和0.909(COⅢ),核苷酸多样性指数(Pi)分别为0.028(12S)和0.034(COⅢ),平均核苷酸差异数(K)分别为9.403(12S)和17.265(COⅢ),显示出较丰富的遗传多样性。两种基因遗传分析结果均显示厦门群体与其它群体的显著分化。初步分析长蛸各群体遗传分化的原因之一可能是洋流格局的形成阻隔了群体间的基因交流。 展开更多
关键词 长蛸 12s rRNA COⅢ 遗传多样性 分子标记技术
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用12S rRNA基因序列研究斑腿蝗科二属六种的进化关系 被引量：13
8
作者 曾维铭 蒋国芳 +1 位作者 张大羽 洪芳 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2004年第2期248-252,共5页
采用DNA测序技术测定了中国斑腿蝗科昆虫 6种和斑翅蝗科的红胫小车蝗线粒体 12SrRNA基因长约 345bp片段的序列。在获得的 345bp的序列中 ,A +T约占 71 8% ,其中 135个核苷酸位点存在变异 (约占 39 1% )。PAUP4 0b数据分析软件构建该 6... 采用DNA测序技术测定了中国斑腿蝗科昆虫 6种和斑翅蝗科的红胫小车蝗线粒体 12SrRNA基因长约 345bp片段的序列。在获得的 345bp的序列中 ,A +T约占 71 8% ,其中 135个核苷酸位点存在变异 (约占 39 1% )。PAUP4 0b数据分析软件构建该 6种蝗虫的MP和NJ分子系统树显示 ,稻蝗属和蔗蝗属各为独立的一支。在稻蝗属一支中 ,中华稻蝗与山稻蝗关系很近 ,而与小稻蝗关系较远 ,这与形态学结果相吻合 ;在蔗蝗属一支中 ,异歧蔗蝗与斑角蔗蝗亲缘关系较近 ,而与等歧蔗蝗关系较远 ,这与形态学研究结果并不吻合 。 展开更多
关键词 斑腿蝗科 mtDNA 12s RRNA基因 系统进化
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10个牛品种线粒体12S rRNA基因多态性分析 被引量：7
9
作者 孟彦 许尚忠 +4 位作者 昝林森 高雪 陈金宝 任红艳 王兴平 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2006年第4期422-426,共5页
以鲁西牛、渤海黑牛、大别山牛、南阳牛、晋南牛、秦川牛、中国西门塔尔牛、日本和牛、海福特牛和安格斯牛10个牛品种共计353头牛为研究对象，利用单链构象多态性（SSOP）分子标记方法对其线粒体DNA 12S rRNA基因进行了多态性分析，结... 以鲁西牛、渤海黑牛、大别山牛、南阳牛、晋南牛、秦川牛、中国西门塔尔牛、日本和牛、海福特牛和安格斯牛10个牛品种共计353头牛为研究对象，利用单链构象多态性（SSOP）分子标记方法对其线粒体DNA 12S rRNA基因进行了多态性分析，结果发现该基因出现分布频率不同的3种单倍型（Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ），其中单倍型Ⅰ出现的频率最低，仅在晋南牛1个个体中发现；单倍型Ⅱ在中国本地黄牛中都存在。在中国西门塔尔牛中的分布频率很低，但在3个国外品种海福特牛、安格斯牛和日本和牛中不存在；单倍型Ⅲ在这10个牛品种中均有分布．但以国外品种最丰富。计算平均多态信息含量，发现我国地方品种在0．232～0．423之间，基本属于中度多态，说明我国地方黄牛品种在12SrRNA上多态性比较丰富，国外品种较为贫乏；但是单倍型Ⅰ频率很低有丢失的趋势，需要对其进行保护。 展开更多
关键词 牛 线粒体DNA 12s RRNA基因 SSCP 多态性
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基于线粒体12S rRNA和ND5基因序列的中国飞蝗属3亚种系统发育关系研究 被引量：12
10
作者 叶维萍 叶海燕 +1 位作者 卢慧甍 黄原 《Entomotaxonomia》 CSCD 北大核心 2005年第1期5-13,共9页
对分布于中国的飞蝗Locusta migratoria Linnaeus 3亚种的线粒体12S rDNA 487 (bp)和 ND5 (451 bp) 基因的部分序列进行测定,与已知全线粒体基因组全序列的非洲飞蝗亚种进行序列比较,... 对分布于中国的飞蝗Locusta migratoria Linnaeus 3亚种的线粒体12S rDNA 487 (bp)和 ND5 (451 bp) 基因的部分序列进行测定,与已知全线粒体基因组全序列的非洲飞蝗亚种进行序列比较,并在此基础上对ND5基因,以斑腿蝗科瘤喉蝗Parapodismamikado 为外群,重建 MP 树。基于序列长度的限制,将两基因联合分析重建了 1 棵最简约无根树。在对准的 4 个亚种共有的 481 bp 的 12S rDNA 和 451 bp 的 ND5 片断序列比较中,AT 含量明显高于 GC 含量。由序列差异来看,亚洲飞蝗和东亚飞蝗序列相似度高,非洲飞蝗和西藏飞蝗相似度高,ND5 基因的 MP 树和联合树也支持这个结论。由于大陆漂移和青藏高原隆起的特殊地质事件,正好解释了非洲飞蝗和西藏飞蝗的相似性,支持西藏飞蝗为单独 1 亚种,与非洲飞蝗为同一起源地,与其它 2 亚种相区别。 展开更多
关键词 直翅目 斑翅蝗科 飞蝗 线粒体 12s RDNA ND5
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异源四倍体鲫鲤、三倍体湘云鲫和它们父母本线粒体DNA12SrRNA基因遗传变异的分析 被引量：12
11
作者 郭新红 刘少军 +1 位作者 颜金鹏 刘筠 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 2004年第6期875-880,共6页
采用质粒克隆测序方法 ,获得了异源四倍体鲫鲤 5个个体、异源四倍体鲫鲤雌核发育二倍体后代 2个个体、三倍体湘云鲫 2个个体及红鲫、湘江野鲤和日本白鲫各 1个个体的线粒体DNA 12SrRNA基因的全序列。经对比发现 ,异源四倍体 5个个体共... 采用质粒克隆测序方法 ,获得了异源四倍体鲫鲤 5个个体、异源四倍体鲫鲤雌核发育二倍体后代 2个个体、三倍体湘云鲫 2个个体及红鲫、湘江野鲤和日本白鲫各 1个个体的线粒体DNA 12SrRNA基因的全序列。经对比发现 ,异源四倍体 5个个体共享 2种单元型 ,异源四倍体鲫鲤雌核发育二倍体后代 2个个体、三倍体湘云鲫 2个个体以及红鲫、湘江野鲤和日本白鲫各 1个个体分别共享 1种单元型。用MEGA 1 0软件分析了它们的碱基组成和核苷酸序列差异 ,用邻接法构建系统进化树。它们间的序列同源性在 95 %～ 99%之间 ,异源四倍体鲫鲤、三倍体湘云鲫和它们母本 (分别为红鲫和日本白鲫 )之间的序列同源性大于异源四倍体鲫鲤、三倍体湘云鲫和它们父本(分别为湘江野鲤和异源四倍体鲫鲤 )之间的序列同源性 ,结果表明 :异源四倍体鲫鲤和三倍体湘云鲫在线粒体DNA 12SrRNA基因上具有母性遗传特征。另一值得注意的地方是异源四倍体鲫鲤经过 9代 (F3 F11)繁殖后 ,在 5个个体中发现了 2种单元型 ,说明在四倍体基因库中存在遗传多样性 ,为四倍体基因库的繁殖。 展开更多
关键词 12s RRNA基因 DNA序列 遗传变异 异源四倍体鲫鲤 三倍体湘云鲫
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D6S1043和D12S391基因座在亲权鉴定中的应用 被引量：14
12
作者 郭宏 林源 +5 位作者 柳燕 阙庭志 严品华 赵珍敏 李成涛 李莉 《法医学杂志》 CAS CSCD 2007年第5期345-346,共2页
目的研究D6S1043和D12S391基因座在亲权关系鉴定案件中的应用价值。方法应用荧光标记复合扩增系统对日常检案中所收集的192名汉族无关个体血样DNA进行PCR扩增,用ABI3100-Avant遗传分析仪对扩增产物进行毛细管电泳,用GeneMapperv3.2软件... 目的研究D6S1043和D12S391基因座在亲权关系鉴定案件中的应用价值。方法应用荧光标记复合扩增系统对日常检案中所收集的192名汉族无关个体血样DNA进行PCR扩增,用ABI3100-Avant遗传分析仪对扩增产物进行毛细管电泳,用GeneMapperv3.2软件进行基因分型,统计分析D6S1043和D12S391基因座的多态信息。结果在D6S1043和D12S391基因座分别发现12个等位基因,它们在中国汉族人群中的个体识别能力分别为0.9656和0.9510,二联体非父排除率分别为0.573和0.510,三联体非父排除率分别为0.731和0.679。结论D6S1043和D12S391基因座具有高度多态性,在亲权鉴定中具有重要应用价值。 展开更多
关键词 D6S1043 D12s391 亲权鉴定 短串联重复序列
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基于12S和16S rRNA序列的湍蛙属部分物种的系统发育关系 被引量：10
13
作者 金义文 江建平 +2 位作者 谢锋 郑中华 徐俊晓 《Zoological Research》 CAS CSCD 北大核心 2005年第1期61-68,共8页
测定了湍蛙属 6个种共 10个种群 ,以及 4个外群种的线粒体 12S和 16SrRNA基因片段 ,比对后有94 0bp序列 ,发现 35 2个变异位点、 186个简约性位点。运用NJ法、MP法、ML法构建了系统关系树 ,各系统树一致表明内群为一单系群 ,分为两组 :... 测定了湍蛙属 6个种共 10个种群 ,以及 4个外群种的线粒体 12S和 16SrRNA基因片段 ,比对后有94 0bp序列 ,发现 35 2个变异位点、 186个简约性位点。运用NJ法、MP法、ML法构建了系统关系树 ,各系统树一致表明内群为一单系群 ,分为两组 :第一组中 ,四川湍蛙两种群先聚合 ,再和棕点湍蛙聚为一支 ;第二组中 ,香港湍蛙和戴云湍蛙聚为一支 ,而香港大屿山离岛湍蛙种群首先与华南湍蛙相聚 ,再与武夷湍蛙构成姐妹支。研究结果表明 :香港地区增加 1种湍蛙分布 ;戴云湍蛙是一有效种 ;四川湍蛙的石棉和洪雅种群间遗传差异达到或超过其他种间的分歧水平。 展开更多
关键词 湍蛙属 12s RRNA基因 16S RRNA基因 系统发育 无尾目
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中华鳖与砂鳖线粒体DNA 12S rRNA基因序列的比较分析和分子鉴定标记 被引量：16
14
作者 陈合格 刘文彬 张轩杰 《水产学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期318-322,共5页
对中华鳖和砂鳖线粒体DNA12SrRNA基因进行了引物设计、PCR扩增、序列测定和PCRRFLP分析。研究结果表明:中华鳖、砂鳖线粒体DNA12SrRNA基因片段的碱基序列长度相同,均为562bp,其A、T、C、G含量相似,分别为209个(37.2%)、121个(21.5%)、14... 对中华鳖和砂鳖线粒体DNA12SrRNA基因进行了引物设计、PCR扩增、序列测定和PCRRFLP分析。研究结果表明:中华鳖、砂鳖线粒体DNA12SrRNA基因片段的碱基序列长度相同,均为562bp,其A、T、C、G含量相似,分别为209个(37.2%)、121个(21.5%)、145个(25.8%)、87个(15.5%)和207个(36.8%)、120个(21.4%)、145个(25.8%)、90个(16%)。两序列间共有13处碱基不同,序列差异率为2.31%,中华鳖与砂鳖各自个体间的平均核苷酸序列差异率分别为0.53%和0.36%,种间差异显著;用内切酶MspI酶切两种鳖的12SrRNA基因片段,在砂鳖中可得到大小为519bp和43bp两个片段,而中华鳖无此酶切位点,这可作为准确鉴别中华鳖和砂鳖的分子鉴定标记。从两种鳖线粒体DNA12SrRNA基因片段碱基的显著差异和MspI酶切位点的变化,可以进一步证明砂鳖是不同于中华鳖的鳖属一新种。 展开更多
关键词 中华鳖 砂鳖 12s RRNA基因 PCR-RFLP分析 分子鉴定标记
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基于线粒体12S rRNA基因序列鉴别牛肉的种源 被引量：10
15
作者 王兰萍 耿荣庆 +3 位作者 王伟 邓乔文 徐永新 陈钥 《家畜生态学报》 北大核心 2013年第2期19-21,共3页
在提取黄牛肉、牦牛肉和水牛肉总DNA的基础上,设计通用引物进行PCR扩增,电泳回收PCR产物后双向测序,再通过构建系统进化树鉴别牛肉的物种来源。PCR扩增获得的牦牛、水牛12SrDNA基因片段大小都为440bp,黄牛12SrDNA基因片段大小都为439bp... 在提取黄牛肉、牦牛肉和水牛肉总DNA的基础上,设计通用引物进行PCR扩增,电泳回收PCR产物后双向测序,再通过构建系统进化树鉴别牛肉的物种来源。PCR扩增获得的牦牛、水牛12SrDNA基因片段大小都为440bp,黄牛12SrDNA基因片段大小都为439bp。参照引用的不同牛种12SrDNA基因序列,构建的系统进化树能够清晰地鉴别测序样品的牛种来源。因此,结合运用PCR扩增和DNA测序技术是一种精确可靠的方法,能够有效地运用于牛肉的种源鉴别。 展开更多
关键词 12s RRNA 牛肉 鉴别
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九种绢丝昆虫线粒体12S rRNA基因的序列特征和系统发育分析 被引量：10
16
作者 刘彦群 靳向东 +2 位作者 秦利 鲁成 向仲怀 《昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第3期307-314,共8页
为探讨鳞翅目中绢丝昆虫之间的系统发育关系和分子进化特征,本研究测定了中国柞蚕Antheraea pernyi野生型和放养型的线粒体12SrRNA基因的部分序列,结合来自GenBank数据库的17条序列,对总共9种绢丝昆虫(2科3属)的12SrRNA基因序列进行了... 为探讨鳞翅目中绢丝昆虫之间的系统发育关系和分子进化特征,本研究测定了中国柞蚕Antheraea pernyi野生型和放养型的线粒体12SrRNA基因的部分序列,结合来自GenBank数据库的17条序列,对总共9种绢丝昆虫(2科3属)的12SrRNA基因序列进行了分析。利用软件MEGA3.1进行碱基组成、变异位点的统计和分子进化分析,分别用类平均聚类法((UPGMA)、邻接法(NJ)、最小进化法(ME)、最大简约法(MP)重建系统发生树。测定的中国柞蚕野生型的12SrRNA基因序列(427bp)与放养型"豫早1号"的序列完全一致。序列对齐后共鉴定80个变异位点,50个简约信息位点。碱基组成分析显示在科属间具有明显差异,AT含量蚕蛾科高于大蚕蛾科;在A和T碱基的使用上,大蚕蛾科偏好使用T,而蚕蛾科则偏好使用A。与动物中常见的以转换为主的碱基替换模式不同,所分析的9种昆虫中除桑蚕属内部为转换与颠换基本一致外,其余物种间均是颠换多于转换。进化分析支持柞蚕属、樗蚕属和桑蚕属的单系。基于UPGMA法的进化树支持琥珀蚕是柞蚕属的较原始类型,而NJ、ME和MP法则支持印度柞蚕是较原始的类型,因此,柞蚕属种间的进化关系尚需进一步研究。 展开更多
关键词 绢丝昆虫 蚕蛾科 大蚕蛾科 12s RRNA基因 碱基组成 替换模式 系统发生关系
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用12S rRNA基因序列研究潮龟科(BATAGURIDAE)闭壳龟类的进化 被引量：15
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作者 吴平 周开亚 杨群 《应用与环境生物学报》 CAS CSCD 1998年第4期374-378,共5页
测定了潮龟科（Ｂａｔａｇｕｒｉｄａｅ）具闭壳结构的齿缘摄龟属（Ｃｙｃｌｅｍｙｓ）、锯缘摄龟属（Ｐｙｘｉｄｅａ）、闭壳龟属（Ｃｕｏｒａ）共６种线粒体１２ＳｒＲＮＡ基因片段的序列，结合潮龟科其它一些属的序列数据，探讨了具... 测定了潮龟科（Ｂａｔａｇｕｒｉｄａｅ）具闭壳结构的齿缘摄龟属（Ｃｙｃｌｅｍｙｓ）、锯缘摄龟属（Ｐｙｘｉｄｅａ）、闭壳龟属（Ｃｕｏｒａ）共６种线粒体１２ＳｒＲＮＡ基因片段的序列，结合潮龟科其它一些属的序列数据，探讨了具闭壳结构龟类的起源与进化以及闭壳龟属的分类学问题．认为闭壳龟属与锯缘摄龟属为姐妹群，两者与齿缘摄龟属的亲缘关系较远，提示这些具闭壳结构的龟类可能不是由一个共同祖先分化而来． 展开更多
关键词 潮龟科 闭壳的龟类 起源和进化 12s RRNA基因
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利用12S rRNA基因的限制性酶切末端片段长度多态性鉴定动物种类 被引量：9
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作者 汪琦 张昕 +3 位作者 赵大贺 马海萍 陈广全 张惠媛 《食品科学》 EI CAS CSCD 北大核心 2010年第2期214-219,共6页
目的:建立一种精确可靠的鉴定常见的10种动物(猪、狗、牛、山羊、绵羊、马、鸡、鼠、三文鱼和鹿)的方法。方法:利用12SrRNA基因的限制性酶切末端片段长度多态性(terminal restriction fragment length polymorphism,T-RFLP)鉴别动物种... 目的:建立一种精确可靠的鉴定常见的10种动物(猪、狗、牛、山羊、绵羊、马、鸡、鼠、三文鱼和鹿)的方法。方法:利用12SrRNA基因的限制性酶切末端片段长度多态性(terminal restriction fragment length polymorphism,T-RFLP)鉴别动物种类。将线粒体12S rRNA基因通过引物的5'端用FAM荧光标记,从基因组DNA中扩增450bp的目的片段。引物对1(下游引物FAM标记,上游引物不标记)扩增的PCR产物用限制性内切酶AluⅠ酶切。引物对2(上游引物FAM标记,下游引物不标记)扩增的PCR产物用限制性内切酶Tru9Ⅰ酶切。得到的酶切产物分别在遗传分析仪ABI3100上进行毛细管电泳,片段大小用Peak Scanner 1.0软件分析。结果:根据AluⅠ酶切图谱能够区分鸡、马、猪和三文鱼,而鹿和牛、山羊和绵羊、鼠和狗因酶切图谱相同无法分开。根据Tru9Ⅰ酶切图谱,能够进一步将鹿和牛、山羊和绵羊、鼠和狗分开。同一种动物不同个体的酶切图谱完全相同,结果具有可重复性。没有出现物种内多态的现象。大多数情况下,实际得到的末端片段长度与理论值非常接近,只存在2～5bp的差异。结论:该方法操作简单、结果精确,适用于鉴定动物种类。 展开更多
关键词 限制性酶切末端片段长度多态性T—RFLP 种类鉴定 12s RRNA
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四川黑熊线粒体12S和16S rRNA基因的克隆及序列分析 被引量：6
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作者 吴夏 陈瑜 +2 位作者 彭正松 杨军 侯万儒 《四川师范大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2007年第3期402-405,共4页
利用哺乳动物线粒体基因的保守序列设计引物,采用PCR方法,首次从亚洲黑熊四川亚种(Ursusthibetanus mupinensis)的肌肉组织总DNA中扩增出了线粒体12S rRNA和16S rRNA基因并进行了序列测定及分析.结果表明,四川黑熊12S rRNA基因长965 bp;... 利用哺乳动物线粒体基因的保守序列设计引物,采用PCR方法,首次从亚洲黑熊四川亚种(Ursusthibetanus mupinensis)的肌肉组织总DNA中扩增出了线粒体12S rRNA和16S rRNA基因并进行了序列测定及分析.结果表明,四川黑熊12S rRNA基因长965 bp;16S rRNA基因长1 580 bp.通过进一步的序列分析表明,四川黑熊的12S rRNA和16S rRNA基因有较高的进化速率,与美洲黑熊、棕熊、北极熊、眼镜熊及大熊猫的相应基因相比较有较大差异,其中与美洲黑熊的同源性相对较高. 展开更多
关键词 亚洲黑熊四川亚种(Ursus thibetanus mupinensis) 线粒体 12s RRNA 16S RRNA 序列分析
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淡水豚类线粒体DNA12S rRNA基因的序列变异及其分子系统学研究 被引量：7
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作者 杨光 刘珊 +3 位作者 季国庆 周开亚 Ricardo Bastida Laura Rivero 《Zoological Research》 CAS CSCD 2000年第6期425-431,共7页
淡水豚类 4个代表属 [白暨豚 (Lipotes)、恒河豚 (Platanista)、弗西豚 (Pontoporia)和亚河豚(Inia) ]mtDNA 12SrRNA基因的序列差异水平 ,高于其他齿鲸类科间的差异 ,特别是远远高于海豚总科内的科间差异。研究结果支持它们应归属于不... 淡水豚类 4个代表属 [白暨豚 (Lipotes)、恒河豚 (Platanista)、弗西豚 (Pontoporia)和亚河豚(Inia) ]mtDNA 12SrRNA基因的序列差异水平 ,高于其他齿鲸类科间的差异 ,特别是远远高于海豚总科内的科间差异。研究结果支持它们应归属于不同的科 ,即白暨豚科 (Lipotiidae)、恒河豚科 (Platanistidae)、弗西豚科 (Pontoporidae)和亚河豚科 (Iniidae)。恒河豚科是鲸类中最早分化出来的独立支系 ,而其余 3个淡水豚科组成一个单系 ,作为海豚总科的姊妹群。淡水豚类的发生是多系的。白暨豚科、亚河豚科和弗西豚科是否隶属于同一个总科尚需进一步研究。 展开更多
关键词 淡水豚类 12s RRNA 分子系统学
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