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LINC01980在宫颈癌中的表达及调控LIN28B表达促进宫颈癌生长的作用机制 被引量：1
1
作者 王春梅 吴德慧 +2 位作者 康燕 魏顺英 马登云 《中国免疫学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2023年第2期369-374,共6页
目的:探讨长链非编码RNA01980(LINC01980)在宫颈癌中的表达及其调控LIN28B促进宫颈癌生长的作用机制。方法:生物信息学工具iBio Tools V5.0(http://www.chrisapp.xyz:3838/R/AnnoE2/)预测宫颈癌差异表达基因,catRAPID数据库(http://serv... 目的:探讨长链非编码RNA01980(LINC01980)在宫颈癌中的表达及其调控LIN28B促进宫颈癌生长的作用机制。方法:生物信息学工具iBio Tools V5.0(http://www.chrisapp.xyz:3838/R/AnnoE2/)预测宫颈癌差异表达基因,catRAPID数据库(http://service.tartaglialab.com/page/catrapid_group)在线预测相关RNA结合蛋白。选取2020年1月至2021年5月青海红十字医院收治的病理学诊断为宫颈癌的患者60例作为宫颈癌组,选取同期健康体检者(宫颈未发生病变)60例作为健康组,qRTPCR检测两组研究对象血清LINC01980水平;体外培养宫颈癌细胞Hela,转染并分为Lnc-NC组、si-LINC01980组、si-LINC01980+LIN28B-NC组和si-LINC01980+LIN28B组,对照组仅添加新鲜培养液。RNA pull-down和RNA免疫共沉淀试验检测LINC01980与LIN28B相互作用;qRT-PCR检测Hela细胞LINC01980、LIN28B mRNA表达;CCK-8检测细胞活力;流式细胞术检测细胞周期和凋亡;Western blot检测细胞周期蛋白D1(CyclinD1)、周期蛋白依赖性激酶4(CDK4)、半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3(caspase-3)表达。结果:生物信息学工具iBio Tools V5.0预测结果表明,LINC01980在宫颈癌组织中表达上调;与健康组比较,宫颈癌组血清LINC01980 mRNA表达显著升高(P<0.05);生物信息学网站(http://service.tartaglialab.com/page/catrapid_group)预测结果表明,LINC 01980 RNA序列与LIN28存在结合位点,LINC01980与LIN28B存在相互作用;与对照组比较,si-LINC01980组Hela细胞LINC01980、LIN28B mRNA表达、细胞活力、S期、G2/M期细胞百分比、蛋白CyclinD1、CDK4、LIN28B表达显著降低,细胞凋亡率、G0/G1期细胞百分比、蛋白caspase-3表达显著升高(P<0.05);与si-LINC01980组比较,si-LINC01980+LIN28B组Hela细胞活力、S期、G2/M期期细胞百分比、蛋白CyclinD1、CDK4、LIN28B表达显著升高,细胞凋亡率、G0/G1期细胞百分比、caspase-3蛋白表达显著降低(P<0.05)。结论:LINC01980可能通过调控LIN28B影响宫颈癌细胞增殖和凋亡,参与宫颈癌发生发展,可能是宫颈癌治疗的潜在靶点。 展开更多
关键词 长链非编码RNA 01980 LIN28B 宫颈癌 表达 生长
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口腔鳞状细胞癌预后相关的长链非编码RNA筛选及验证
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作者 刘絮影 李锦存 +3 位作者 翟堃 胡晨 董文 马坚 《口腔医学研究》 北大核心 2025年第2期109-117,共9页
目的:基于口腔癌在线数据库鉴定与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和mRNA,构建ceRNA网络,分析其在OSCC发生发展中的作用。方法:从癌症基因组图谱(the cancer ge... 目的:基于口腔癌在线数据库鉴定与口腔鳞状细胞癌(oral squamous cell carcinoma,OSCC)预后相关的长链非编码RNA(long non-coding RNA,lncRNA)和mRNA,构建ceRNA网络,分析其在OSCC发生发展中的作用。方法:从癌症基因组图谱(the cancer genome atlas program,TCGA)和基因表达综合数据库(gene expression omnibus database,GEO)中筛选出TCGA-OSCC、GSE23558和GSE30784数据集,进行表达谱分析,筛选出差异表达lncRNA和mRNA,并进行生存分析、基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因和基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)富集分析,确定其与OSCC预后的相关性。利用starBase、miRTarBase数据库预测关键lncRNA及mRNA的共同靶标miRNA,以此构建竞争性内源性RNA(competing endogenous RNA,ceRNA)网络。通过实时荧光定量聚合酶链反应(real-time quantitative PCR,qRT-PCR)检测这些关键lncRNA在OSCC细胞系和肿瘤组织中表达水平。结果:表达谱分析鉴定出23个差异表达lncRNA,其中有6个lncRNA与OSCC患者预后相关;mRNA的表达分析鉴定出282个差异表达mRNA,主要富集在三磷酸鸟苷(guanosine triphosphate,GTP)酶激活剂活性、核苷酸结合寡聚化域(nucletide-binding oligomerization domain,NOD)样受体等信号通路,其中10个差异表达的mRNA与OSCC预后相关。ceRNA网络构建了包括6个lncRNA、10个mRNA和靶向预测的26个miRNA分子网络。qRT-PCR结果显示包含LINC01980在内的5个lncRNA在OSCC细胞中高表达,而MIR99AHG低表达。在OSCC组织中,LINC01980表达水平明显升高,而MIR99AHG表达水平降低。结论:本研究筛选的LINC01980和MIR99AHG与OSCC进展和预后相关,可作为OSCC的生物学标志物进一步探讨。 展开更多
关键词 口腔鳞状细胞癌 长链非编码RNA 预后 LINC01980 MIR99AHG
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