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辣椒MADS-box转录因子基因CaAGL61的耐热功能分析 被引量:1
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作者 王梦园 魏倩睿 +4 位作者 李海艳 杨巧敏 宇军 黄炜 逯明辉 《中国农业科学》 北大核心 2025年第8期1604-1616,共13页
【目的】MADS-box转录因子是植物最大的转录因子家族之一,在植物生长发育和胁迫响应中均发挥重要功能。前期通过转录组数据获得一个辣椒热响应基因,该基因编码MADS-box转录因子家族成员CaAGL61(Agamous-like MADS-box protein AGL61)。... 【目的】MADS-box转录因子是植物最大的转录因子家族之一,在植物生长发育和胁迫响应中均发挥重要功能。前期通过转录组数据获得一个辣椒热响应基因,该基因编码MADS-box转录因子家族成员CaAGL61(Agamous-like MADS-box protein AGL61)。在此基础上,进一步研究CaAGL61在辣椒耐热性调控中的功能,为深入了解辣椒耐热分子机制提供理论参考,为辣椒耐热性的遗传改良提供基因位点。【方法】通过SMART在线工具预测CaAGL61保守结构域,使用MEGA7构建辣椒和其他植物物种AGL61蛋白的系统发育树,利用实时荧光定量PCR技术探究CaAGL61在辣椒中的表达模式,运用烟草亚细胞定位技术和酵母双杂交自激活系统检测CaAGL61的转录因子特性,利用病毒诱导的基因沉默技术和基因瞬时过表达技术探究CaAGL61表达对辣椒耐热性的影响。【结果】CaAGL61编码179个氨基酸,包含一个MADS结构域,在系统进化方面高度保守。CaAGL61在辣椒花器官中的表达量最高、其次是茎和果实,根中的表达量最低;进一步分析发现CaAGL61的表达量随着花器官的成熟而增加,尤其在授粉坐果期的花药中表达量最高;45℃高温处理显著上调了CaAGL61的表达水平。亚细胞定位显示,CaAGL61定位于细胞核中;酵母转录激活分析表明,CaAGL61具有转录激活活性。CaAGL61沉默植株的耐热性显著增强,热胁迫处理后,与对照相比,CaAGL61沉默植株生长点萎蔫程度减轻,叶片相对电导率降低,丙二醛含量、死细胞和活性氧积累减少,而叶绿素含量升高。相反,CaAGL61瞬时过表达降低了辣椒的耐热性,与对照相比,表现为植株受热胁迫损伤程度更严重,叶片相对电导率升高,丙二醛含量、死细胞和活性氧积累增多,叶绿素含量下降。【结论】鉴定了一个辣椒热响应MADS-box转录因子基因CaAGL61,该基因通过加剧氧化胁迫而负调控辣椒耐热性。 展开更多
关键词 辣椒 耐热 MADS-box转录因子 CaAGL61 负调控
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藜麦MADS-box基因家族的全基因组鉴定和表达分析 被引量:1
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作者 何财林 卢晶 +2 位作者 郭会会 李小安 吴琪 《生物技术通报》 北大核心 2025年第1期157-172,共16页
【目的】开展藜麦CqMADS-box基因家族鉴定和表达分析,为藜麦产量品质的提高提供优异基因资源。【方法】基于拟南芥MADS-box蛋白序列,利用BLASTP和隐马尔可夫模型文件(Hidden Markov Model, HMM)鉴定CqMADS-box基因家族成员,采用最大似然... 【目的】开展藜麦CqMADS-box基因家族鉴定和表达分析,为藜麦产量品质的提高提供优异基因资源。【方法】基于拟南芥MADS-box蛋白序列,利用BLASTP和隐马尔可夫模型文件(Hidden Markov Model, HMM)鉴定CqMADS-box基因家族成员,采用最大似然法(maximum likelihood, ML)构建系统发育树,分析MADS-box基因在染色体的位置,利用MXSCan分析CqMADSbox基因家族成员在藜麦亚基因组A/B间,及其与甜菜二倍体近缘种C. pallidicaule(A)、C. suecicum(B),六倍体近缘种中国台湾红藜(Chenopodium formosanum)中MADS-box成员的共线性,利用WoLF PSORT、PlantCARE等在线网站分析CqMADS-box转录因子的理化性质、基因结构、启动子区顺式作用元件。基于前期发表的转录组数据,分析CqMADS-box在不同组织、6个花序发育时期、种子萌发的表达模式;利用转录组数据分析在长日照和短日照下,花期和花器官相关CqMADS-box的表达情况。【结果】鉴定得到117个藜麦MADS-box基因家族成员,分布在17条染色体上。Ⅰ型CqMADS-box包含Mα、Mγ两个进化分支,Ⅱ型包含CqPI(CqGLO)、CqAGL17等14个进化分支。不同分支CqMADS-box基因结构、蛋白Motif组成、转录因子结合位点类型和数量存在不同程度的差异。进化分析表明,串联复制是藜麦MADS-box家族扩张的主要途径,大部分复制的时间在四倍体化之前。表达模式结果表明,CqMADS-box基因在花序中表达量相对较高,而在花序发育前期(YP1或YP2),CqSEP3、CqAP1、CqGGM13类基因呈相对高表达;种子经过ABA处理后,CqSEP3类基因表达量显著上升;不同光周期下的表达模式表明,CqAP1、CqSOC1类基因在长日照和短日照下表达量均较高。【结论】CqMADS-box基因家族成员具有组织特异性表达模式,且CqSEP3类基因在藜麦花序发育和响应ABA激素处理的过程中发挥重要作用。 展开更多
关键词 CqMADS-box 藜麦 全基因组鉴定 进化分析 花序发育 光周期
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MADS-box转录因子家族基因对植物非生物胁迫的响应研究进展 被引量:1
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作者 田诗 金钏 +3 位作者 刘亚杰 王雪松 张军保 刘丽杰 《高师理科学刊》 2025年第3期80-85,共6页
植物生长发育过程中会遇到多种逆境因素的影响,包括生物胁迫和非生物胁迫.研究表明,MADS-box转录因子可参与调控植物的非生物胁迫反应,对植物的生长发育起到重要作用.综述了MADS-box转录因子响应干旱胁迫、温度胁迫、盐胁迫以及其它非... 植物生长发育过程中会遇到多种逆境因素的影响,包括生物胁迫和非生物胁迫.研究表明,MADS-box转录因子可参与调控植物的非生物胁迫反应,对植物的生长发育起到重要作用.综述了MADS-box转录因子响应干旱胁迫、温度胁迫、盐胁迫以及其它非生物胁迫的研究进展,进一步分析了MADS-box转录因子家族基因的研究前景,即MADS-box基因应对非生物胁迫的信号通路,对各种胁迫之间相关基因的关系进行深入分析,从而更好地阐释各基因的功能,为作物抗逆新品种的培育奠定基础. 展开更多
关键词 MADS-box转录因子 非生物胁迫 植物
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多花黄精MADS-box基因家族的鉴定及其在一个天然不育系中的表达分析
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作者 邵博闻 杨美森 +6 位作者 陈凯 邹辉 韩之刚 李聪 石艳 斯金平 陈东红 《中国中药杂志》 北大核心 2025年第21期6027-6038,共12页
黄精是中华传统药食同源植物,具补气养阴、润肺、健脾及益肾等诸多功效。MADS-box基因是在植物中广泛存在,参与多种生长发育过程的转录因子。该研究利用生物信息学方法在多花黄精中鉴定出74个MADS-box基因,分为14个亚类,同一亚类基因在... 黄精是中华传统药食同源植物,具补气养阴、润肺、健脾及益肾等诸多功效。MADS-box基因是在植物中广泛存在,参与多种生长发育过程的转录因子。该研究利用生物信息学方法在多花黄精中鉴定出74个MADS-box基因,分为14个亚类,同一亚类基因在系统进化树中聚集在同一分支上,具有相同的保守基序及结构域;它们不均匀分布于11条染色体上。另外,在一个多花黄精天然不育材料(QyS1)中,通过细胞学观察发现QyS1花器官同源转化为类似花丝或花被的结构导致不育,相应地,转录组分析发现3个AGAMOUS同源基因PcMADS46、56、68在不育系花苞时期表达量较野生型显著下调,可能是导致其不育的关键因素。通过加权共表达网络分析进一步提出导致QyS1花器官发育异常的调控模型:不育系中C类基因表达量降低,引起下游表观遗传抑制因子表达下调、生长素信号通路和转运蛋白基因上调,从而导致雌/雄蕊器官出现同源转化和不育。该研究基于MADS-box基因家族鉴定分析及多花黄精中的不育现象展开研究,为多花黄精的种质资源保存和育种提供理论依据和生产指导。 展开更多
关键词 多花黄精 MADS-box 天然不育系 细胞学观察 转录组
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DExH-box解旋酶9 O-GlcNAc修饰对HBV相关肝癌细胞增殖能力的影响
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作者 罗慧敏 皮雨博 +3 位作者 陈彦猛 汪凯 唐霓 黄爱龙 《重庆医科大学学报》 北大核心 2025年第6期799-807,共9页
目的:研究DExH-box解旋酶9(DExH-boxhelicase9,DHX9)的氧连接-N-乙酰葡萄糖胺(O-linkedNacetylglucosamine,O-GlcNAc)修饰对乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)相关肝癌细胞增殖能力的影响。方法:通过分子克隆构建pAdTrack-TO4-DHX9-3... 目的:研究DExH-box解旋酶9(DExH-boxhelicase9,DHX9)的氧连接-N-乙酰葡萄糖胺(O-linkedNacetylglucosamine,O-GlcNAc)修饰对乙型肝炎病毒(hepatitis B virus,HBV)相关肝癌细胞增殖能力的影响。方法:通过分子克隆构建pAdTrack-TO4-DHX9-3Flag重组腺病毒质粒,并将重组腺病毒质粒转染至HEK293细胞中,包装、扩增重组腺病毒AdDHX9。通过免疫共沉淀实验检测DHX9与O-GlcNAc转移酶(O-GlcNAc transferase,OGT)的相互作用,免疫荧光实验研究DHX9与OGT共定位情况。通过琥珀酰化小麦胚芽凝集素(succinylated wheat germ agglutinin,sWGA)和糖基化免疫沉淀实验(immunoprecipitation,IP)检测DHX9 O-GlcNAc修饰水平。通过克隆形成实验和细胞生长曲线探索DHX9 O-GlcNAc修饰对HBV相关肝癌细胞增殖能力的影响。结果:成功获得了重组腺病毒AdDHX9,经Western blot鉴定了DHX9的表达。DHX9与OGT相互作用,2者共定位于细胞核。sWGA和糖基化IP实验证实了DHX9能够发生O-GlcNAc修饰,并且HBV感染促进了DHX9 O-GlcNAc修饰水平。克隆形成实验显示,与AdGFP对照组(142.667±7.572)相比,AdDHX9组(386.667±15.630)的细胞克隆数量增加(P<0.001)。细胞生长曲线结果显示,AdDHX9组(22.860±0.770)比AdGFP对照组(13.670±0.517)的细胞整体生长速率增加(P<0.001)。结论:HBV感染促进DHX9 O-GlcNAc修饰;DHX9 O-GlcNAc修饰增强HBV相关肝癌细胞的增殖能力。 展开更多
关键词 DExH-box解旋酶9 氧连接-N-乙酰葡萄糖胺 肝细胞癌 细胞增殖
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水稻MADS-box家族基因研究进展
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作者 王晓清 王航 +3 位作者 张泽霖 胡霞菲 贺浩华 胡丽芳 《福建农业学报》 北大核心 2025年第7期743-750,共8页
MADS-box家族是序列较为保守的一类蛋白家族,其可通过结合CarG[CC(A/T)_(6)GG]元件调控下游基因的表达来参与一系列植物发育过程。水稻中共存在76个MADS-box基因,本文对参与调控水稻花器官发育、开花时间、营养生长和胁迫响应的相关MADS... MADS-box家族是序列较为保守的一类蛋白家族,其可通过结合CarG[CC(A/T)_(6)GG]元件调控下游基因的表达来参与一系列植物发育过程。水稻中共存在76个MADS-box基因,本文对参与调控水稻花器官发育、开花时间、营养生长和胁迫响应的相关MADS-box基因的功能及作用机理进行了综述,将有助于加深对水稻MADS-box家族基因的认知,为后续研究其分子调控网络并为其它物种MADS-box基因家族的研究提供理论参考。 展开更多
关键词 水稻 MADS-box基因 功能
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Ⅰ型MADS-box基因SlMADS79调控番茄株型的功能研究
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作者 郭绪虎 李灵芝 +2 位作者 李凤 马博岩 贾晓宇 《作物学报》 北大核心 2025年第4期982-991,共10页
MADS-box基因在植物生长发育全过程中具有重要调控功能。目前,关于番茄Ⅱ型MADS-box基因的功能研究较多,而Ⅰ型MADS-box基因却鲜有报道。本研究克隆了Ⅰ型MADS-box基因SlMADS79,该基因在番茄根、叶和侧芽中表达水平相对较高,推测其可能... MADS-box基因在植物生长发育全过程中具有重要调控功能。目前,关于番茄Ⅱ型MADS-box基因的功能研究较多,而Ⅰ型MADS-box基因却鲜有报道。本研究克隆了Ⅰ型MADS-box基因SlMADS79,该基因在番茄根、叶和侧芽中表达水平相对较高,推测其可能参与番茄营养器官生长调控。本研究以经典番茄栽培品种Ailsa Craig(AC^(++))为背景材料,采用RNA干扰技术沉默SlMADS79基因。与野生型相比,SlMADS79基因沉默株系顶端优势度降低、植株矮小;叶片的长度、宽度、周长以及面积均小于野生型植株;根系总长度、总表面积、总投影面积、根系体积、分叉数、根尖数均显著减少。解剖学研究表明,沉默植株茎秆的纵切面细胞较小,然而其平均数量明显增加。在激素水平上,SlMADS79沉默株系中IAA(吲哚-3-乙酸)、TZR(转玉米素核糖苷)以及CS(栗木甾酮)含量降低。在分子水平上,生长素应答基因IAA3和赤霉素合成基因GA3ox1在SlMADS79沉默株系中显著下调,而细胞周期基因CyCA3;1在沉默株系中显著上调。本研究从形态、解剖、激素和分子水平上进一步解析了SlMADS79基因的生物学功能,丰富了番茄Ⅰ型MADS-box基因家族的研究,为番茄株型调控研究提供了可靠的理论依据。 展开更多
关键词 番茄 MADS-box SlMADS79 株高 叶片形态 根系
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绿豆MADS-box基因家族鉴定及表达分析
8
作者 姚晓琳 张晓芳 +4 位作者 李昆洛 郝俊莹 隋梦宇 张沿政 李帅 《山东农业科学》 北大核心 2025年第5期11-28,共18页
为了解绿豆MADS-box基因的进化过程,本研究通过全基因组分析鉴定出77个VrMADS-box基因,分布在11条染色体上,其中7号染色体上最多,共有18个。VrMADS-box基因主要分为Ⅰ型和Ⅱ型,Ⅰ型VrMADS-box基因又划分为Mα(15)、Mβ(4)和Mγ(11)三个... 为了解绿豆MADS-box基因的进化过程,本研究通过全基因组分析鉴定出77个VrMADS-box基因,分布在11条染色体上,其中7号染色体上最多,共有18个。VrMADS-box基因主要分为Ⅰ型和Ⅱ型,Ⅰ型VrMADS-box基因又划分为Mα(15)、Mβ(4)和Mγ(11)三个亚支;Ⅱ型VrMADS-box基因则划分为MIKCc(44)和MIKC∗(3)两个亚支。MIKCc可划分为12个亚家族,绿豆缺少开花位点C(FLC)亚家族。绿豆MADS-box基因种内存在18个重复基因对,种间共线性分析表明绿豆和拟南芥(Arabidopsis thaliana)、大豆(Glycine max)MADS-box基因间分别存在39个和171个同源基因对。不同亚家族VrMADS-box基因在结构和表达模式等方面存在显著差异,表明它们在绿豆生长发育过程中可能发挥不同作用。本研究揭示了VrMADS-box基因家族的信息和表达模式,有助于进一步研究绿豆VrMADS-box家族基因的功能及分子机制。 展开更多
关键词 MADS-box 绿豆 基因家族分析 基因表达
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珙桐MADS-box基因家族的鉴定、表达及调控分析
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作者 刘晋芸 胡小盼 +3 位作者 朱大海 叶天意 李培瑶 魏炜 《四川大学学报(自然科学版)》 北大核心 2025年第1期215-227,共13页
为了对珙桐MADS-box基因家族进行全面系统的研究,了解其对珙桐花器官特性和苞片发育的影响,本研究在珙桐全基因组范围内对MADS-box基因家族进行鉴定和分类,并与近缘物种进行同源性分析.通过物种内共线性基因计算珙桐MADS-box基因家族的... 为了对珙桐MADS-box基因家族进行全面系统的研究,了解其对珙桐花器官特性和苞片发育的影响,本研究在珙桐全基因组范围内对MADS-box基因家族进行鉴定和分类,并与近缘物种进行同源性分析.通过物种内共线性基因计算珙桐MADS-box基因家族的选择压力.成功鉴定了103个珙桐MADS-box基因家族成员,其中MIKCC类基因受到更为强烈的纯化选择.通过与近缘物种的MADS-box基因家族的同源性分析发现珙桐AGL2/SEP亚家族和SQUA亚家族的MADS-box基因数目存在明显的扩张.利用转录组测序技术以及qRTPCR检测了MADS-box基因家族在3个发育阶段的苞片和叶片中的表达模式,并利用转录因子结合位点对部分关键差异表达基因所编码的转录因子进行了靶基因的初步预测,发现珙桐花瓣状苞片的形成可能是花器官特征决定基因AP1-like、AP3-like和SEP-like的同源基因在苞片中的异位表达所导致. 展开更多
关键词 珙桐 MADS-box基因家族 花瓣状苞片 基因异位表达
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紫玉兰‘红元宝’MIKC型MADS-box家族鉴定及其在多季成花中的作用探析
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作者 陈小珺 朱森宇 +4 位作者 田丰 王晶晶 吴超 申亚梅 马晶晶 《热带亚热带植物学报》 北大核心 2025年第3期269-281,共13页
为了解紫玉兰(Yulania liliiflora) MADS-box基因家族成员的功能和表达模式,基于‘红元宝’(‘Hongyuanbao’)转录组数据,对其MIKC型MADS-box基因家族成员进行鉴定、理化性质、系统进化和保守结构域分析。结果表明,共鉴定出19个MIKC型MA... 为了解紫玉兰(Yulania liliiflora) MADS-box基因家族成员的功能和表达模式,基于‘红元宝’(‘Hongyuanbao’)转录组数据,对其MIKC型MADS-box基因家族成员进行鉴定、理化性质、系统进化和保守结构域分析。结果表明,共鉴定出19个MIKC型MADS-box基因家族成员,均定位于细胞核中且拥有共同的MADS或K-box保守结构域。大部分MlMADSs在花器官建成中发挥功能,且MlAGL6和MlAGL12-c作为蛋白质互作网络的中心节点可能发挥关键作用。Ml MADS-box成员在雄蕊、花芽和茎等组织中均有较高的表达水平,在花器官形成和花发育过程中发挥重要作用,并筛选到调控紫玉兰‘红元宝’2次成花的候选关键基因Ml AGL6。这为探索MIKC型MADS-box基因在紫玉兰‘红元宝’生殖发育过程的功能提供数据支持。 展开更多
关键词 紫玉兰 MIKC型MADS-box基因家族 花发育 基因表达
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Y-box结合蛋白1对胆管癌细胞增殖和侵袭的影响及其作用机制研究
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作者 乔月新 赵乾威 +6 位作者 孙光源 郭迎雪 范爽 赵亚丽 李照 孙中帅 崔大鹏 《实用临床医药杂志》 2025年第22期28-33,共6页
目的探讨Y-box结合蛋白1(YBX1)对胆管癌细胞增殖和侵袭的影响及其作用机制。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析胆管癌中YBX1表达及其与患者预后的关系,并结合免疫组织化学染色法在胆管癌患者癌组织与癌旁组织中进行验证。采用蛋... 目的探讨Y-box结合蛋白1(YBX1)对胆管癌细胞增殖和侵袭的影响及其作用机制。方法基于癌症基因组图谱(TCGA)数据库分析胆管癌中YBX1表达及其与患者预后的关系,并结合免疫组织化学染色法在胆管癌患者癌组织与癌旁组织中进行验证。采用蛋白质印迹法检测人正常胆管HIBEC细胞和胆管癌细胞系(KMBC、CC-LP-1、QBC939细胞)中YBX1蛋白表达水平;构建过表达YBX1和敲减YBX1的KMBC细胞系,通过CCK-8实验、克隆形成实验、划痕愈合实验和Transwell侵袭实验观察YBX1对KMBC细胞增殖、迁移和侵袭的影响;采用蛋白质印迹法检测YBX1对KMBC细胞中Wnt/β-catenin通路活性及其信号分子[细胞周期蛋白A1(cyclinA1)、周期蛋白依赖性激酶1(CDK1)、基质金属蛋白酶(MMP)-2和MMP-9]表达的影响。结果TCGA数据库分析显示,YBX1在不同病理分期、不同淋巴结转移情况胆管癌组织中的表达均高于正常胆管组织,差异有统计学意义(P<0.01或P<0.001);YBX1高表达与胆管癌患者的总生存期和无复发生存期呈显著负相关(P<0.05)。免疫组织化学染色结果显示,胆管癌患者癌组织中YBX1阳性表达量高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.001)。胆管癌细胞系(KMBC、CC-LP-1、QBC939细胞)中YBX1蛋白表达水平均高于人正常胆管HIBEC细胞,差异有统计学意义(P<0.01或P<0.001)。成功构建YBX1稳定过表达和YBX1敲减的KMBC细胞系后,细胞实验结果显示,过表达YBX1可促进KMBC细胞增殖、迁移和侵袭,上调 β-catenin、cyclinA1、CDK1、MMP-2和MMP-9表达水平,敲减YBX1则可显著抑制KMBC细胞增殖、迁移和侵袭,下调 β-catenin、cyclinA1、CDK1、MMP-2和MMP-9表达水平,差异均有统计学意义(P<0.05或P<0.01或P<0.001)。结论YBX1通过激活Wnt/β-catenin信号通路,上调cyclinA1、CDK1、MMP-2和MMP-9蛋白表达,促进胆管癌细胞增殖、迁移和侵袭。 展开更多
关键词 Y-box结合蛋白1 WNT/Β-CATENIN信号通路 胆管癌 细胞增殖 细胞侵袭 细胞迁移 预后 细胞实验
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F-box蛋白21在肾透明细胞癌中的表达及其与预后和免疫浸润的关系
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作者 蔡扬科 江惠明 +1 位作者 彭栋 何强 《临床肿瘤学杂志》 2025年第11期1114-1121,共8页
目的探讨F-box蛋白21(FBXO21)在肾透明细胞癌(KIRC)中的表达变化及其临床预后价值,并初步分析其潜在机制。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)和国际癌症基因组联盟(ICGC)数据库分析FBXO21在KIRC中的表达水平及其与临床特征和预后的关系。采... 目的探讨F-box蛋白21(FBXO21)在肾透明细胞癌(KIRC)中的表达变化及其临床预后价值,并初步分析其潜在机制。方法利用癌症基因组图谱(TCGA)和国际癌症基因组联盟(ICGC)数据库分析FBXO21在KIRC中的表达水平及其与临床特征和预后的关系。采用实时荧光定量PCR(RT-q PCR)和免疫组织化学法(IHC)对梅州市人民医院收集的KIRC临床样本进行验证。采用Kaplan-Meier生存分析和Cox比例风险回归模型评估其预后价值,并构建列线图预测模型。结合基因富集分析(GSEA)、基因本体论(GO)与京都基因和基因组百科全书(KEGG)进行功能富集分析,利用ESTIMATE和TIMER算法评估其与肿瘤免疫微环境的关系。结果FBXO21在KIRC组织中显著下调,且其低表达与T分期、临床分期及组织学分级显著相关(P<0.05)。RT-q PCR和IHC结果验证了FBXO21在KIRC中低表达的趋势(P<0.001)。生存分析显示,FBXO21低表达患者的总生存期(OS)和无病生存期(DFS)均显著缩短(P<0.001)。Cox回归分析表明FBXO21为KIRC的显著预后因素(P<0.05)。列线图模型具有良好的生存预测效能。功能富集分析显示FBXO21相关基因富集于转化生长因子-β(TGF-β)、KRAS、白介素6-Janus激酶-信号转导和转录激活蛋白3(IL6-JAK-STAT3)及叉头框O类转录因子(Fox O)等关键通路。免疫浸润分析显示,FBXO21与免疫评分及多种免疫细胞浸润水平密切相关。结论FBXO21在KIRC中低表达,具有良好的预后评估价值,有望成为潜在的生物标志物和治疗靶点。 展开更多
关键词 肾透明细胞癌 F-box蛋白21 免疫浸润 预后标志物
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宿主和病毒的F-Box蛋白在病毒感染过程中作用的研究进展
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作者 许明秀 桓晨 《吉林大学学报(医学版)》 北大核心 2025年第1期245-254,共10页
F-Box蛋白家族是一类含有F-Box结构域的蛋白,与细胞S期激酶相关蛋白1(SKP1)、Cullin1和环框蛋白1(RBX1)共同形成SKP1-CUL1-F-Box(SCF)E3泛素连接酶复合物,该复合物介导底物发生泛素化修饰并经蛋白酶体途径降解。宿主F-Box蛋白在整个病... F-Box蛋白家族是一类含有F-Box结构域的蛋白,与细胞S期激酶相关蛋白1(SKP1)、Cullin1和环框蛋白1(RBX1)共同形成SKP1-CUL1-F-Box(SCF)E3泛素连接酶复合物,该复合物介导底物发生泛素化修饰并经蛋白酶体途径降解。宿主F-Box蛋白在整个病毒感染周期中发挥关键作用。F-Box蛋白能够调控人类免疫缺陷病毒(HIV)-1和EB病毒(EBV)等多种RNA病毒及DNA病毒的复制,且调控机制均不同。在病毒进入宿主细胞后,宿主F-Box蛋白可以调控病毒复制过程中关键蛋白质的稳定性和降解,也可增强病毒感染后宿主细胞的免疫应答,抑制病毒复制。部分F-Box蛋白能通过降解宿主限制因子、抑制病毒激活和干扰素信号通路等方式协助病毒完成复制周期。病毒也可通过编码含F-Box结构域的蛋白与宿主SKP1、Cullin1和RBX1蛋白结合,降解宿主因子促进自身复制。F-Box蛋白调控在病毒感染过程中发挥的作用差异较大,一种F-Box蛋白能够调控多种病毒的复制,一种病毒也能被多种F-Box蛋白所调控,现从宿主F-Box蛋白和病毒F-Box蛋白角度,对F-Box蛋白在病毒感染过程中的作用机制进行综述,探讨以F-Box蛋白作为靶点,开发新型抗病毒药物的意义及潜在价值。 展开更多
关键词 F-box蛋白 病毒 泛素蛋白酶体途径 S期激酶相关蛋白1 环框蛋白1
暂未订购
F-box蛋白在植物生长发育中的功能研究进展 被引量:21
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作者 吴丹 唐冬英 +3 位作者 李新梅 李丽 赵小英 刘选明 《生命科学研究》 CAS CSCD 2015年第4期362-367,共6页
在真核生物中,由泛素介导的蛋白降解途径与植物生长发育密切相关。F-box蛋白家族是一类含有Fbox基序(motif),在泛素介导的蛋白质水解过程中具有底物识别特性的蛋白质家族。目前,从各种植物中已鉴定出大量的F-box蛋白质,这类蛋白质在植... 在真核生物中,由泛素介导的蛋白降解途径与植物生长发育密切相关。F-box蛋白家族是一类含有Fbox基序(motif),在泛素介导的蛋白质水解过程中具有底物识别特性的蛋白质家族。目前,从各种植物中已鉴定出大量的F-box蛋白质,这类蛋白质在植物激素的信号转导、光信号转导、自交不亲和以及花器官发育等许多生理过程中都具有重要功能。研究发现F-box蛋白在调控植物生长发育过程中所发挥的功能与其结构及泛素蛋白酶体途径密切相关。 展开更多
关键词 F-box蛋白 SKP1-CUL1-F-box(SCF)复合体 泛素蛋白酶体途径(UPS)
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胃癌组织中微小RNA-152-3p和性别决定区Y-box蛋白5的表达水平及临床意义
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作者 郭书丽 杨晨 +3 位作者 逯丹 郭晓敏 郭书华 韩新峰 《实用临床医药杂志》 2025年第17期33-37,共5页
目的探讨胃癌(GC)组织中微小RNA-152-3p(miR-152-3p)和性别决定区Y-box蛋白5(SOX5)的表达水平及其临床意义。方法选取120例GC患者作为研究对象,采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测miR-152-3p、SOX5表达水平,分析其与GC患者临床... 目的探讨胃癌(GC)组织中微小RNA-152-3p(miR-152-3p)和性别决定区Y-box蛋白5(SOX5)的表达水平及其临床意义。方法选取120例GC患者作为研究对象,采用实时荧光定量聚合酶链反应(qRT-PCR)检测miR-152-3p、SOX5表达水平,分析其与GC患者临床病理特征的关系。应用Kaplan-Meier法绘制生存曲线;采用Cox回归模型筛选GC患者预后的影响因素。结果GC组织中miR-152-3p表达水平低于癌旁组织,SOX5表达水平高于癌旁组织,差异有统计学意义(P<0.05)。GC组织中miR-152-3p、SOX5表达均与淋巴结转移、分化程度、TNM分期有关(P<0.05)。miR-152-3p表达水平与SOX5表达水平呈负相关(r=-0.512,P<0.05),且miR-152-3p与SOX5存在靶向结合位点。miR-152-3p低表达组的5年特异性生存率为60.53%,低于miR-152-3p高表达组的84.09%,差异有统计学意义(χ^(2)=7.256,P<0.05);SOX5高表达组的5年特异性生存率为63.10%,低于SOX5低表达组的83.33%,差异有统计学意义(χ^(2)=4.840,P<0.05)。多因素Cox回归分析显示,miR-152-3p表达水平、SOX5表达水平、TNM分期均为GC患者预后的独立影响因素(P<0.05)。结论GC组织中miR-152-3p低表达、SOX5高表达,且两者表达水平与TNM分期等临床病理特征及患者预后密切相关。 展开更多
关键词 胃癌 微小RNA-152-3p 性别决定区Y-box蛋白5 临床病理特征 预后 淋巴结转移 上皮-间充质转化 Kaplan-Meier生存曲线
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谷子泛素连接酶U-box E3基因家族的鉴定及响应非生物胁迫分析
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作者 何卫 李俊怡 +5 位作者 李新妮 马雪华 邢媛 曹晓宁 乔治军 刘思辰 《生物技术通报》 北大核心 2025年第5期104-118,共15页
【目的】基于全基因组水平对谷子(Setaria italica)泛素连接酶U-box(plant U-box protein,PUB)基因家族(SiPUB)进行系统鉴定,为谷子泛素连接酶U-box基因家族的生物学功能研究提供理论支撑。【方法】利用U-box保守Pfam序列全基因组鉴定谷... 【目的】基于全基因组水平对谷子(Setaria italica)泛素连接酶U-box(plant U-box protein,PUB)基因家族(SiPUB)进行系统鉴定,为谷子泛素连接酶U-box基因家族的生物学功能研究提供理论支撑。【方法】利用U-box保守Pfam序列全基因组鉴定谷子U-box基因家族成员,采用系统进化树构建、亚细胞定位预测、预测蛋白的相对分子质量与等电点等理化性质、绘制家族成员Scaffold定位图等分析,利用实时荧光定量PCR技术(RT-qPCR)对不同胁迫处理下的谷子U-box基因家族成员表达情况进行研究。【结果】谷子基因组中有71个PUB基因家族成员,不均匀地分布在8条染色体上。系统进化分析表明,SiPUB基因分布在Ⅰ-Ⅸ亚家族中。启动子顺式作用元件分析显示,U-box基因与植物生长发育、胁迫和激素调控相关。荧光定量PCR结果表明,SiPUBs在谷子的各个部位差异表达,对谷子U-box基因家族不同结构域在胁迫下的表达模式分析,含U-box结构域基因在低温和干旱下表达量变化显著、茉莉酸下特定时段表达,含U-box+HEAT_2结构域基因在3种胁迫下变化不显著,含U-box+Pkinase等结构域基因在不同胁迫下表达量有升有降,表明各结构域在植物环境应答及基因调控中有不同作用,植株可通过调控SiPUBs表达响应非生物胁迫。【结论】鉴定出71个SiPUBs基因,不同亚家族在非生物胁迫下的表达模式存在差异,表明SiPUBs对谷子响应非生物胁迫起重要的调控作用。 展开更多
关键词 谷子 E3泛素连接酶 U-box基因家族 低温胁迫 干旱胁迫 茉莉酸胁迫
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植物MADS-box基因研究进展 被引量:11
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作者 马辉 张智俊 罗淑萍 《生物技术通报》 CAS CSCD 2006年第6期14-18,共5页
植物中的MADS-box基因是一个序列特异的调节基因家族,其编码的MADS-box蛋白转录因子以二聚体化的形式通过保守的MADS结构域与特定的DNA序列结合来调控基因的表达,从而调节植物的生长发育.对植物MADS-box基因的分布、分类、结构、功能和... 植物中的MADS-box基因是一个序列特异的调节基因家族,其编码的MADS-box蛋白转录因子以二聚体化的形式通过保守的MADS结构域与特定的DNA序列结合来调控基因的表达,从而调节植物的生长发育.对植物MADS-box基因的分布、分类、结构、功能和前景作了简要的综述。 展开更多
关键词 MADS-box基因 MADS-box蛋白转录因子 植物
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实现AES算法中S-BOX和INV-S-BOX的高效方法 被引量:5
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作者 韩少男 李晓江 《微电子学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期103-107,共5页
介绍了AES中的S-BOX和INV-S-BOX的算法原理,分析目前广泛使用的实现S-BOX和INV-S-BOX的三种方法:直接查表法,扩展欧几里德算法和基于复合域GF((22)2)2)的算法。对直接查表法和基于复合域GF((22)2)2)的算法进行改进,提出了两种改进电路... 介绍了AES中的S-BOX和INV-S-BOX的算法原理,分析目前广泛使用的实现S-BOX和INV-S-BOX的三种方法:直接查表法,扩展欧几里德算法和基于复合域GF((22)2)2)的算法。对直接查表法和基于复合域GF((22)2)2)的算法进行改进,提出了两种改进电路结构。通过综合仿真,给出了按照上述方法实现的硬件电路的面积和关键路径上的时间延迟。结果表明,提出的两种新实现方法与传统实现方法相比,电路面积分别有28%和22%的优化。 展开更多
关键词 AES算法 S-box INV-S-box GALOIS FIELD 复合Galois FIELD 乘法逆运算
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Y-box结合蛋白-1在胃癌组织中的表达及其生物学功能
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作者 笪晨星 顾勇 岳晨莉 《临床肿瘤学杂志》 2025年第5期426-431,共6页
目的探讨Y-box结合蛋白-1(YB-1)对胃癌细胞生物学行为的影响。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库,比较YB-1在384例胃癌及35例癌旁正常组织标本中的表达情况,并分析其表达对预后的影响。选取敲减YB-1效率较高的siRNA序列(siYB-1#2),并... 目的探讨Y-box结合蛋白-1(YB-1)对胃癌细胞生物学行为的影响。方法通过癌症基因组图谱(TCGA)数据库,比较YB-1在384例胃癌及35例癌旁正常组织标本中的表达情况,并分析其表达对预后的影响。选取敲减YB-1效率较高的siRNA序列(siYB-1#2),并以siNC作为阴性对照,分别转染胃癌AGS、SGC-7901细胞系,靶向敲减YB-1基因,同时在胃癌细胞中过表达YB-1基因进行反向验证。采用MTT法和克隆细胞形成实验检测胃癌细胞的增殖能力;流式细胞术检测细胞凋亡情况;Transwell法检测细胞侵袭、迁移能力。结果TCGA数据库显示,与癌旁正常组织比较,YB-1在胃癌组织中的表达显著升高(P<0.001);Kaplan-Meier生存曲线显示,YB-1高表达患者的生存时间较YB-1低表达患者短。MTT法和克隆细胞形成实验结果显示,与siNC组细胞相比,siYB-1#2组细胞增殖能力显著降低、细胞克隆数目显著减少,差异均有统计学意义(P<0.05);流式细胞术检测结果显示,敲减YB-1后的SGC-7901胃癌细胞凋亡率为(15.27±0.75)%,显著高于对照组的(8.43±0.51)%,差异有统计学意义(P<0.05);Transwell实验结果显示,与siNC组细胞相比,siYB-1#2组穿过Transwell小室的细胞数目减少,敲减YB-1可显著抑制AGS、SGC-7901细胞的迁移和侵袭能力(P<0.05)。反之,过表达YB-1可促进胃癌细胞AGS、SGC-7901的增殖并提高克隆形成能力(P<0.05),同时过表达YB-1后肿瘤细胞侵袭、迁移能力增强(P<0.05)。结论YB-1可能与胃癌的发生发展及侵袭转移有关。 展开更多
关键词 胃癌 Y-box结合蛋白-1 增殖 凋亡 迁移 侵袭
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甜瓜DEAD-box基因家族鉴定及其在果实发育过程中的表达分析
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作者 高明刚 李金玲 +8 位作者 陈永波 李栋 黄向丽 梁友忠 纪超 王志英 信国滨 李明 梁增文 《蔬菜》 2025年第7期36-45,共10页
DEAD-box基因家族是RNA解旋酶中最大的亚家族,在生物体遗传过程的复制、修复、重组、转录、RNA转运、细胞器基因表达和翻译等各方面都发挥着重要作用。根据甜瓜(Cucumis melo L.)基因组数据,本研究采用生物信息学手段对DEAD-box家族成... DEAD-box基因家族是RNA解旋酶中最大的亚家族,在生物体遗传过程的复制、修复、重组、转录、RNA转运、细胞器基因表达和翻译等各方面都发挥着重要作用。根据甜瓜(Cucumis melo L.)基因组数据,本研究采用生物信息学手段对DEAD-box家族成员进行筛选鉴定,并对其理化性质、染色体定位、系统进化、基因结构、保守基序和在果实发育不同阶段的差异表达进行分析。结果表明:在甜瓜中鉴定到29个CmDEADs基因,分布在12条染色体上;蛋白序列长度在409~1172 aa,等电点(PI)分布范围为5.29~9.95;分子量范围在46430.54~129660.04 Da。系统发育分析将29个CmDEADs分为4个亚群,亚群I~IV分别包含10、8、6、5个基因;物种间共线性分析检测到11个甜瓜CmDEADs与拟南芥的中的16个基因存在共线性关系,24个CmDEADs与26个黄瓜基因存在共线性关系。基因结构分析表明,29个CmDEADs的平均外显子数目为10.38,外显子数目4~15个;保守基序分析表明29个基因均检测到DEAD-box基因家族的9个核心基序。转录组数据分析表明,CmDEAD04、CmDEAD08、CmDEAD12、CmDEAD13、CmDEAD19和CmDEAD25在各发育阶段均维持在高表达水平,其中,CmDEAD04在GSE178084和PRJNA286120两个数据集上均表现为开花后10~20 d的表达量呈上升趋势,开花30 d后表达量开始显著下降,说明CmDEAD04可能在甜瓜果实发育中起了重要作用。本研究能够为甜瓜基因组和DEAD-box家族的遗传研究提供一定的理论参考。 展开更多
关键词 甜瓜 DEAD-box基因家族 表达分析 鉴定 果实发育 基因组 生物信息学
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