目的:基于网络药理学方法探讨活血药治疗IgA肾病的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台,筛选并获取活血药的有效成分及其作用靶点。通过人类孟德尔遗传数据库、GeneCards数据库查找筛选IgA肾病相关靶点,运用Venn图,得到...目的:基于网络药理学方法探讨活血药治疗IgA肾病的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台,筛选并获取活血药的有效成分及其作用靶点。通过人类孟德尔遗传数据库、GeneCards数据库查找筛选IgA肾病相关靶点,运用Venn图,得到药物靶点及疾病靶点的共同靶点。运用STRING平台构建蛋白质-蛋白质互相作用(protein-protein interaction,PPI)网络,利用Metascape平台对其进行基因本体论(gene ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)功能富集分析。而后采用Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶点-通路关系网络。结果:共筛选出活血药有效活性成分85个,预测其潜在靶点239个,筛选出IgA肾病疾病靶点667个。其中,活血药有效活性成分参与IgA肾病的靶点共82个。PPI网络模型中共包含82个节点,312条边,其中关键靶点有信号转导与转录激活因子3、肿瘤坏死因子、白细胞介素6、白细胞介素10、丝裂原活化蛋白激酶1、蛋白激酶B抗体和丝裂原活化蛋白激酶14。GO富集分析涉及生长因子受体结合通路、细胞因子受体结合通路、DNA-转录因子结合通路等。KEGG富集分析显示关键信号通路涉及糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、MAPK信号通路、白细胞介素17信号通路。结论:活血药可能通过多成分、多靶点、多通路对IgA肾病协同发挥作用。展开更多
文摘目的:基于网络药理学方法探讨活血药治疗IgA肾病的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台,筛选并获取活血药的有效成分及其作用靶点。通过人类孟德尔遗传数据库、GeneCards数据库查找筛选IgA肾病相关靶点,运用Venn图,得到药物靶点及疾病靶点的共同靶点。运用STRING平台构建蛋白质-蛋白质互相作用(protein-protein interaction,PPI)网络,利用Metascape平台对其进行基因本体论(gene ontology,GO)、京都基因与基因组百科全书(Kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)功能富集分析。而后采用Cytoscape软件构建药物-活性成分-靶点-通路关系网络。结果:共筛选出活血药有效活性成分85个,预测其潜在靶点239个,筛选出IgA肾病疾病靶点667个。其中,活血药有效活性成分参与IgA肾病的靶点共82个。PPI网络模型中共包含82个节点,312条边,其中关键靶点有信号转导与转录激活因子3、肿瘤坏死因子、白细胞介素6、白细胞介素10、丝裂原活化蛋白激酶1、蛋白激酶B抗体和丝裂原活化蛋白激酶14。GO富集分析涉及生长因子受体结合通路、细胞因子受体结合通路、DNA-转录因子结合通路等。KEGG富集分析显示关键信号通路涉及糖尿病并发症中的AGE-RAGE信号通路、TNF信号通路、MAPK信号通路、白细胞介素17信号通路。结论:活血药可能通过多成分、多靶点、多通路对IgA肾病协同发挥作用。
