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盐酸菜细菌菌群多样性及其与风味特征的关联分析
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作者 张振东 罗习云 +4 位作者 罗春露 马秀秀 郭壮 杨勇 王玉荣 《中国酿造》 北大核心 2025年第1期119-123,共5页
该研究采用高通量测序技术,电子鼻及电子舌分别对盐酸菜细菌菌群多样性及风味特征进行分析,并采用皮尔森相关系数对两者之间的相关性进行分析。结果表明,从盐酸菜中共注释到10个细菌门和335个细菌属,优势细菌门(平均相对丰度≥1%)为厚... 该研究采用高通量测序技术,电子鼻及电子舌分别对盐酸菜细菌菌群多样性及风味特征进行分析,并采用皮尔森相关系数对两者之间的相关性进行分析。结果表明,从盐酸菜中共注释到10个细菌门和335个细菌属,优势细菌门(平均相对丰度≥1%)为厚壁菌门(Firmicutes)(70.05%)、变形菌门(Proteobacteria)(25.16%)和放线菌门(Actinoacteria)(3.22%),优势细菌属为乳酸杆菌属(Lactobacillus)(15.72%)、促生乳杆菌属(Levilactobacillus)(12.70%)、泛菌属(Pantoea)(7.36%)等21个菌属。在气味指标上,不同来源盐酸菜的氮氧化合物、有机硫化物和萜类化合物、烷类和醇类化合物的差异较大;在滋味品质上,酸味和咸味的差异较大。相关性分析发现,促生乳杆菌属可能对盐酸菜的气味品质影响较大,而沙雷氏菌属(Serratia)可能起到增加盐酸菜鲜味的回味的作用。该研究为盐酸菜的发酵工艺改进以及品质控制提供了数据支撑。 展开更多
关键词 盐酸菜 菌群多样性 电子鼻 电子舌 风味品质 相关性
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新型敷料结合珠香散对慢性伤口愈合时间和伤口菌群多样性的影响
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作者 鄢婧 王意菊 +2 位作者 李金月 齐艳霞 贾汝福 《中国微生态学杂志》 北大核心 2025年第5期541-549,共9页
目的探讨新型敷料结合珠香散对慢性伤口的愈合时间和伤口菌群多样性的影响,为该类患者的治疗提供参考。方法采用单中心、随机对照临床试验,将120例慢性伤口患者随机分为新型敷料联合珠香散组(NJ组,n=30)、新型敷料联合安慰剂组(NA组,n=... 目的探讨新型敷料结合珠香散对慢性伤口的愈合时间和伤口菌群多样性的影响,为该类患者的治疗提供参考。方法采用单中心、随机对照临床试验,将120例慢性伤口患者随机分为新型敷料联合珠香散组(NJ组,n=30)、新型敷料联合安慰剂组(NA组,n=30)、传统敷料联合珠香散组(TJ组,n=30)和传统敷料联合安慰剂组(TA组,n=30)。记录伤口愈合时间,测量伤口面积,评估伤口外观并通过16S rRNA基因高通量测序技术分析伤口菌群的alpha多样性和beta多样性。结果NJ组患者的伤口愈合时间显著短于其他三组(均P<0.001);治疗第7天时的伤口面积显著小于其他三组(均P<0.05);伤口外观评分显著高于其他三组(均P<0.001)。NJ组患者伤口菌群alpha多样性指标(Shannon指数、Chao1指数)水平显著高于其他三组(均P<0.001);beta多样性分析显示NJ组患者伤口菌群结构与其他三组存在显著差异(均P<0.05)。相关性分析显示,伤口菌群多样性与伤口愈合时间和面积缩小率具有显著相关性(均P<0.001)。结论新型敷料结合珠香散可显著促进慢性伤口愈合,改善伤口菌群多样性,增加有益菌相对丰度,抑制致病菌。 展开更多
关键词 慢性伤口 新型敷料 珠香散 菌群多样性 伤口愈合
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新疆地区酸驼乳可代谢低聚糖乳酸菌分离鉴定及细菌菌群多样性分析
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作者 武亚婷 陈贺 +4 位作者 张红艳 郑楠 王富兰 王帅 赵艳坤 《食品工业科技》 北大核心 2025年第18期212-222,共11页
新疆酸驼乳是乳酸菌的优质培养基,为明确新疆地区酸驼乳中乳酸菌多样性和细菌群落多样性,该研究以采集自新疆3个地区的9份酸驼乳为研究对象,分别采用单分子实时测序(single molecule real time sequencing,SMRT)与微生物纯培养技术进行... 新疆酸驼乳是乳酸菌的优质培养基,为明确新疆地区酸驼乳中乳酸菌多样性和细菌群落多样性,该研究以采集自新疆3个地区的9份酸驼乳为研究对象,分别采用单分子实时测序(single molecule real time sequencing,SMRT)与微生物纯培养技术进行分析。SMRT结果表明:不同地区酸驼乳中的细菌群落组成丰富且多样,9份酸驼乳样品共鉴定出899个属和158个种。达坂城地区样品中最丰富的细菌属是乳杆菌属(60.44%)、乳球菌属(14.66%)和拉恩氏菌属(12.06%)。哈密地区样品中最丰富的细菌属是乳杆菌属(32.27%)、乳球菌属(28.86%)和假单胞菌属(12.56%)。柯坪地区样品中最丰富的细菌属是乳球菌属(43.80%)和沙雷氏菌属(16.01%)。达坂城地区样品中最丰富的细菌种是水生拉恩氏菌(12.06%),哈密地区样品中最丰富的细菌种是莓实假单胞菌(7.50%),柯坪地区样品中最丰富的细菌种是产酸克雷伯氏菌(6.67%)。利用微生物纯培养方法,研究了15株乳酸菌对低聚木糖、低聚果糖、菊粉以及低聚异麦芽糖的代谢能力。通过筛选得到7株可代谢这四种低聚糖的乳酸菌,菌株A-1、菌株B-3、菌株C-1、菌株C-2和菌株C-5被鉴定为乳酸乳球菌,菌株A-2被鉴定为肠系膜明串珠菌,菌株B-1被鉴定为副干酪乳杆菌。由此可见,新疆不同地区酸驼乳之间细菌群落结构存在差异,该研究为酸驼乳发酵剂的开发提供了一定的理论依据与菌种资源。 展开更多
关键词 酸驼乳 代谢低聚糖 乳酸 高通量测序 菌群多样性
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慕萨莱思发酵过程中真菌菌群多样性分析及优良酿酒酵母的筛选与鉴定
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作者 唐睿 吴涛 +4 位作者 王贵芳 张雨 程玉成 江晓 布海丽且姆·阿卜杜热合曼 《中国酿造》 北大核心 2025年第4期120-126,共7页
采用高通量测序技术分析慕萨莱思发酵过程中的真菌菌群多样性,采用传统培养分离法结合形态学观察从中分离、筛选酵母菌,进一步通过生理生化试验、产乙醇、产酯能力及酸耐受性分析筛选优良酿酒酵母,并通过分子生物学技术对其进行菌种鉴... 采用高通量测序技术分析慕萨莱思发酵过程中的真菌菌群多样性,采用传统培养分离法结合形态学观察从中分离、筛选酵母菌,进一步通过生理生化试验、产乙醇、产酯能力及酸耐受性分析筛选优良酿酒酵母,并通过分子生物学技术对其进行菌种鉴定。结果表明,慕萨莱思发酵过程中,真菌菌群的丰富度、均匀度及多样性呈先升高后下降的趋势,从中共注释到25个真菌属,主要真菌属为酵母属(Saccharomyces)、曲霉属(Aspergillus)、篮状菌属(Talaromyces)、短梗霉属(Aureobasidium)、红酵母属(Rhodotorula)、线黑粉菌属(Filobasidium)、羊肚菌属(Morchella)、镰刀菌属(Fusarium)等。发酵初期优势真菌属(相对丰度>1%)为红酵母属、羊肚菌属、镰刀菌属、线黑粉菌属;发酵中期为酵母属、短梗霉属、革孔菌属(Coriolopsis)、篮状菌属、青霉属(Penicillium)、曲霉属;发酵后期为酵母属、曲霉属、篮状菌属、线黑粉菌属、青霉属。慕萨莱思发酵过程中共分离筛选出2株优势酵母菌菌株(编号为J-1、J-6),经鉴定,均为酿酒酵母(Saccharomyces cerevisiae),其耐酸性及生长性能均优于商业酿酒酵母SY。 展开更多
关键词 慕萨莱思 发酵过程 菌群多样性 筛选 耐受性分析 鉴定
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慢性牙周炎患者龈沟液菌群多样性及其与炎症因子水平的相关性
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作者 李垚 刘帅 刘志芳 《口腔医学研究》 北大核心 2025年第9期788-794,共7页
目的:探讨慢性牙周炎患者龈沟液菌群多样性及其与炎症因子水平的相关性。方法:纳入2024年1~10月在我院就诊的40例慢性牙周炎患者,按照疾病分期分为轻度组(Ⅰ期、Ⅱ期)和重度组(Ⅲ期、Ⅳ期),每组20例,另选取20例健康受试者作为健康对照... 目的:探讨慢性牙周炎患者龈沟液菌群多样性及其与炎症因子水平的相关性。方法:纳入2024年1~10月在我院就诊的40例慢性牙周炎患者,按照疾病分期分为轻度组(Ⅰ期、Ⅱ期)和重度组(Ⅲ期、Ⅳ期),每组20例,另选取20例健康受试者作为健康对照组。采用16S核糖体脱氧核糖核酸(16S ribosomal deoxyribonucleic acid,16S rDNA)高通量测序技术分析龈沟液和唾液菌群多样性,测定血清炎症因子水平,分析其与菌群多样性的相关性。结果:在轻度与重度龈沟液样本中共有1450个操作分类单元(operational taxonomic units,OTUs),分别有379个和381个独有OTUs;唾液样本中共有1403个OTUs,分别有365个和379个独有。轻度与重度组龈沟液、唾液标本多个菌群菌门、菌种的相对丰度存在显著差异(P<0.05),但Chao1指数、Shannon指数两组间无显著差异(P>0.05);菌群的主要成分分析显示,轻度组与重度组在Bray-Curtis距离上的差异具有统计学意义(P<0.05)。慢性牙周炎患者龈沟液、唾液标本隐藏真杆菌属水平、马氏棒杆菌属水平相对丰度与白细胞介素(interleukin,IL)-6、IL-1分别呈正负相关(P<0.05),且龈沟液标本相关系数高于唾液。结论:慢性牙周炎疾病严重程度与菌群群落结构组成变化有关,而与群落物种丰富度和均匀度变化无关;且慢性牙周炎患者龈沟液隐藏真杆菌属、马氏棒杆菌属水平相对丰度与血清炎症因子水平均密切相关。 展开更多
关键词 慢性牙周炎 龈沟液 菌群多样性 炎症因子
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过敏性哮喘患儿肠道菌群多样性与IgE水平和CD4^(+)T细胞表达的相关性
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作者 周杏珠 卓欣欣 曾霞 《临床肺科杂志》 2025年第5期738-743,共6页
目的探讨过敏性哮喘(AA)患儿肠道菌群多样性与免疫球蛋白E(IgE)水平和CD4^(+)T细胞表达的相关性。方法选择2022年1月至2023年5月期间在我院门诊或住院治疗的AA患儿70例作为AA组(n=70),选择同期于我院体检的健康儿童70例作为对照组(n=70... 目的探讨过敏性哮喘(AA)患儿肠道菌群多样性与免疫球蛋白E(IgE)水平和CD4^(+)T细胞表达的相关性。方法选择2022年1月至2023年5月期间在我院门诊或住院治疗的AA患儿70例作为AA组(n=70),选择同期于我院体检的健康儿童70例作为对照组(n=70)。收集所有患儿临床资料并对其进行肠道菌群分析,并收集实验室检查结果(包括IgE水平和CD4^(+)CD25^(+)Foxp3^(+)T占比)相关资料。对比两组患儿上述资料之间的差异,并分析肠道菌群多样性与IgE水平和CD4^(+)CD25^(+)Foxp3^(+)T占比之间的关系。结果AA组患儿EOS、IgE显著高于对照组,而FEV 1/FVC、Treg占比显著低于对照组(P<0.05)。AA组颤杆菌克属(Oscillibacter)、多尔氏菌属(Dorea)、嗜胆菌属(Bilophila)、链球菌属(Streptococcus)、普雷沃氏菌(Prevotella)、韦荣氏球菌属(Veillonella)为优势菌群,而对照组双歧杆菌属(Bifidobacterium)、另枝菌属(Alistipes)、毛螺旋菌属(Parasutterella)、纺锤链杆属(Fusicatenibacter)、巨球型菌属(Megasphaera)、瘤胃球菌科(Ruminococcaceae)为优势菌群(LDA>4log10)。AA组Chao1指数、ACE指数及Shannon指数低于对照组,而Simpson指数高于对照组,差异具有统计学意义(P<0.05)。Oscillibacter、Dorea、Bilophila、Streptococcus、Prevotella、Veillonella与IgE表达量呈正相关,与Treg占比呈负相关;Bifidobacterium、Alistipes、Parasutterella、Fusicatenibacter、Megasphaera、Ruminococcaceae与IgE表达量呈负相关,与Treg占比呈正相关(P<0.05)。结论AA患儿肠道菌群多样性情况与IgE及Treg占比显著相关。 展开更多
关键词 过敏性哮喘 儿童 肠道菌群多样性 IgE 淋巴细胞
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枸杞发酵过程中菌群多样性及其对产品品质影响的研究进展
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作者 刘霞 吴燕 +3 位作者 杨静 牛艳 张锋锋 王晓菁 《农产品加工》 2025年第18期92-94,共3页
以枸杞为原料发酵生产枸杞酒等精深加工产品是目前枸杞研究领域的热点。对枸杞发酵原理、菌种作用机制及菌群多样性对产品品质的影响等进行阐述,以期全面且深入地了解枸杞发酵过程及菌群机制,为今后调整发酵制作流程、控制枸杞发酵过程... 以枸杞为原料发酵生产枸杞酒等精深加工产品是目前枸杞研究领域的热点。对枸杞发酵原理、菌种作用机制及菌群多样性对产品品质的影响等进行阐述,以期全面且深入地了解枸杞发酵过程及菌群机制,为今后调整发酵制作流程、控制枸杞发酵过程、开发高品质与高营养价值的枸杞发酵产品提供理论依据。 展开更多
关键词 枸杞发酵 菌群多样性 产品品质
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阴道菌群多样性对宫颈病变的影响
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作者 张心愿 屈海蓉 +3 位作者 许华瑞 陈莉 张洪炜 赵福英 《生殖医学杂志》 2025年第6期790-796,共7页
目的采用16S rDNA高通量测序技术分析不同宫颈病变患者的阴道菌群变化特征,探讨阴道菌群多样性对宫颈病变的影响。方法选取2022年12月至2024年3月因宫颈疾病就诊银川市妇幼保健院的168例女性作为研究对象,根据宫颈病变的级别分为宫颈高... 目的采用16S rDNA高通量测序技术分析不同宫颈病变患者的阴道菌群变化特征,探讨阴道菌群多样性对宫颈病变的影响。方法选取2022年12月至2024年3月因宫颈疾病就诊银川市妇幼保健院的168例女性作为研究对象,根据宫颈病变的级别分为宫颈高级别鳞状上皮内病变组(HSIL组,n=46)、宫颈低级别鳞状上皮内病变组(LSIL组,n=76)、正常宫颈对照组(CONTROL组,n=46)。三组患者均通过16S rDNA高通量测序技术分析其阴道菌群的构成。结果HSIL组的HPV16和HPV18感染率最高,LSIL组次之,CONTROL组最低,组间比较均有显著性差异(P<0.05)。各组患者阴道微生物构成分析结果显示,门水平中,HSIL组变形杆菌门丰度较LSIL组、CONTROL组显著增加(P<0.05);纲水平中,HSIL组变形菌纲的占比较LSIL组、CONTROL组显著增加(P<0.05);目水平中,HSIL组棒状杆菌目及伯克霍尔德菌目的占比较LSIL组、CONTROL组均显著增加(P<0.05);科水平中,HSIL组分枝杆菌科及伯克氏菌科的占比较LSIL组、CONTROL组均显著增加(P<0.05);属水平中,与CONTROL组和LSIL组比较,HSIL组乳杆菌属显著下降(P<0.05),但加德纳氏菌属显著增加(P<0.05)。Shannon、chao1及Simpson指数显示,HSIL组患者阴道微生物群落的丰富度与多样性是最高的,均显著高于LSIL组(P<0.05)。结论宫颈病变的严重程度与阴道微生态紊乱相关,宫颈高级别鳞状上皮内病变女性阴道微生物构成的特点为乳杆菌减少、致病菌加德纳氏菌增多。改善HSIL患者阴道微生态,增加阴道乳杆菌可能对宫颈病变转归产生积极作用。 展开更多
关键词 阴道菌群多样性 宫颈病变 16Sr DNA高通量测序
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急性颅脑外伤患者肠道菌群多样性差异对继发性全身炎症反应综合征的临床预测价值 被引量:2
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作者 董玉萍 贺彬 +5 位作者 祁锁霞 潘淑凤 杨静 郭敬明 倪万成 张晓 《中国现代医学杂志》 CAS 2024年第20期74-79,共6页
目的探讨急性颅脑外伤患者肠道菌群多样性差异对继发性全身炎症反应综合征(SIRS)的临床预测价值。方法回顾性分析2022年1月—2023年12月固原市人民医院急诊重症监护病房和神经外科重症监护病房收治的急性颅脑外伤患者60例。按SIRS诊断... 目的探讨急性颅脑外伤患者肠道菌群多样性差异对继发性全身炎症反应综合征(SIRS)的临床预测价值。方法回顾性分析2022年1月—2023年12月固原市人民医院急诊重症监护病房和神经外科重症监护病房收治的急性颅脑外伤患者60例。按SIRS诊断标准分为单纯急性颅脑外伤组(非SIRS组)与急性颅脑外伤后继发性SIRS组(SIRS组);收集患者一般资料并进行临床指标检测,通过16S rRNA基因测序比较两组肠道菌群多样性与菌属相对丰度,采用Pearson相关性分析肠道菌群与临床指标的关系,采用受试者工作特征(ROC)曲线分析肠道菌群对SIRS的预测价值。结果两组患者性别构成、年龄、红细胞计数、血小板计数比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。SIRS组体温较非SIRS组高、心率较非SIRS组快、白细胞计数较非SIRS组多、C反应蛋白水平较非SIRS组高(P<0.05)。两组患者Chao1和Shannon指数比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。两组患者拟杆菌属、瘤胃球菌属、阿克曼菌属、粪肠球菌属相对丰度比较,差异均无统计学意义(P>0.05)。SIRS组普雷沃菌属相对丰度低于非SIRS组(P<0.05),埃希菌-志贺菌属、棒状杆菌属相对丰度均高于非SIRS组(P<0.05)。Pearson相关性分析结果表明,体温、心率、白细胞计数及C反应蛋白与普雷沃菌属相对丰度均呈负相关(r=-0.574、-0.539、-0.554和-0.572,均P<0.05);体温、心率、白细胞计数及C反应蛋白与埃希菌-志贺菌属相对丰度呈正相关(r=0.751、0.743、0.657和0.770,均P<0.05),与棒状杆菌属相对丰度均呈正相关(r=0.782、0.762、0.707和0.799,均P<0.05)。ROC曲线分析结果表明,联合诊断的预测效能最高,曲线下面积为0.946(95%CI:0.871,1.000),敏感性为96.7%(95%CI:0.902,0.100),特异性为93.3%(95%CI:0.844,0.100)。结论肠道菌群组成的变化与颅脑损伤后SIRS的发展密切相关,特定菌属的丰度变化可作为SIRS发展的早期生物预警信号。 展开更多
关键词 急性颅脑外伤 肠道菌群多样性 全身炎症反应综合征 16SrRNA基因测序 预测价值
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基于高通量测序的营养不良儿童肠道菌群多样性研究 被引量:1
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作者 吴慧丹 黄峥 +3 位作者 阳丽君 江美花 李扬帆 梅桂斌 《中国现代药物应用》 2024年第1期175-180,共6页
目的 使用高通量测序模式和方法 ,对比分析营养不良儿童和正常儿童中肠道菌群物种存在的多样性和实际组成特点存在的差异。方法 选取20例营养不良患儿作为A组,选择20例身体正常的儿童作为B组,采集分析粪便样本,提取细菌中的核糖体DNA(RD... 目的 使用高通量测序模式和方法 ,对比分析营养不良儿童和正常儿童中肠道菌群物种存在的多样性和实际组成特点存在的差异。方法 选取20例营养不良患儿作为A组,选择20例身体正常的儿童作为B组,采集分析粪便样本,提取细菌中的核糖体DNA(RDNA),通过两组聚合酶链式反应(PCR)模式和方法 ,增加V4~V5区域实现高通量的测序设计,并进行生物信息学的分析研究;构建相应的稀释曲线,使用MOTHUR软件实现APLHA的多样化的计算分析,通过R语言实现热图(HEAT MAP)分析研究,实现典型关联分析(CCA),之后分别在样本的门和属两个列表中实现数据的整合和归纳,进行统计分析。结果 两组年龄、性别、分娩方式等一般资料比较,差异无统计学意义(P>0.05)。两组生物多样性比较差异无统计学意义(P>0.05)。两组生物多样性比较差异无统计学意义(P>0.05)。两组样本中共发现微生物154种。A组肠道菌群的操作性分类单元(OTU)为320, B组大肠产甲烷菌群的OTU为348,以及其共同OTU为290,两组肠细菌群门的细菌中共检出14个。为更好地展现检测结果 ,本研究依托柱状图优势,将各个样品进行分类学层面的比较和研究。A组硬壁菌门及未分级菌(乳酸菌)的OTU少于B组,拟杆菌(多形状杆菌、罗斯菌)的OTU多于B组,差异有统计学意义(P<0.05)。除A组含有的菌群外, B组还独有厌氧弧菌属、厌氧螺菌属等19种,远超A组体内的菌群种类和丰度。两组体内多形杆状菌、隐秘杆菌属等5种菌群丰度相同,差异无统计学意义(P>0.05),其他菌群丰度比较差异有统计学意义(P<0.05)。结论 营养不良儿童肠道菌群中硬壁菌的数量较少,其中多形杆状菌和罗斯菌的浓度较高,为保持菌群的稳定性与均衡,必须利用不同菌属的实际特性做好菌落的调节,确保儿童有良好的消化吸收与身体生长发育。 展开更多
关键词 高通量测序 营养不良 儿童肠道 菌群多样性
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抹茶菌群多样性分析
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作者 蒋玉兰 朱跃进 +4 位作者 吕杨俊 潘俊娴 叶丽伟 王霈菲 张士康 《茶叶通讯》 2024年第2期210-219,242,共11页
为了解抹茶菌群多样性,以不同企业不同等级的抹茶为试验材料,采用CTAB法提取样品总DNA,分别测定样品中微生物的16SrDNA基因V3、V4区序列。测序数据经质量控制、嵌合体过滤、高质量数据统计后,利用QIIME2软件获得扩增子序列变体ASVs特征... 为了解抹茶菌群多样性,以不同企业不同等级的抹茶为试验材料,采用CTAB法提取样品总DNA,分别测定样品中微生物的16SrDNA基因V3、V4区序列。测序数据经质量控制、嵌合体过滤、高质量数据统计后,利用QIIME2软件获得扩增子序列变体ASVs特征表和特征序列,进行ASVs分布、α多样性、β多样性、物种和物种关系分析。结果表明,45个抹茶样本中有9个样本的菌群丰度极低,集中在高等级产品中。Z企业和Y企业的抹茶菌群ASVs数目、Chao1和Observed-species指数均与抹茶等级呈负相关性,而J企业抹茶的上述指标与抹茶等级不成相关性。Shannon指数表明影响各抹茶中菌群多样性的因素基本一致。抹茶组内样本间群落结构相近,企业内部样本间群落结构相近,同一企业不同批次但等级相同的样本菌群结构相近,产品微生态稳定性较好。36个抹茶样中共检测到物种29门、71纲、176目、345科、902属、1577种,其中变形菌门(Proteobacteria)和厚壁菌门(Firmicutes)为各组样本的绝对优势菌门,二者在ZA、ZB、ZC、YA、YB、JA、JB和JC中的丰度之和分别为96.34%、95.85%、96.06%、95.53%、95.31%、95.91%、96.06%和95.27%。鞘氨醇单胞菌属(Sphingomonas)、甲基杆菌属(Methylobacterium)和假单胞杆菌属(Pseudomonas)为各组的共有优势菌属(丰度≥2.00%),优势菌属在上述各组中的丰度之和分别为64.71%、65.61%、60.04%、70.65%、69.20%、72.98%、75.92%和76.57%。各组的共有优势菌属均属于变形菌门(Proteobacteria),ZB的第一优势菌属链球菌属(Streptococcus)属于厚壁菌门(Firmicutes)。本试验结果为阐明抹茶菌群多样性提供理论参考。 展开更多
关键词 抹茶 茶粉 粉茶 菌群多样性 16SrDNA序列分析
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芦台春酱香型白酒酿造过程中真菌菌群多样性及代谢分析 被引量:3
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作者 王佳丽 胥强 +3 位作者 路程顺 赵淑先 张同存 罗学刚 《中国酿造》 CAS 北大核心 2024年第4期45-52,共8页
该研究采用高通量测序技术对天津芦台春酱香型白酒发酵过程中不同轮次出窖酒醅的真菌群落结构进行研究,并对其与理化因子、挥发性风味成分相关性分别进行典范对应分析(CCA)及偏最小二乘判别分析(PLS-DA)。结果表明,随着轮次的增加,真菌... 该研究采用高通量测序技术对天津芦台春酱香型白酒发酵过程中不同轮次出窖酒醅的真菌群落结构进行研究,并对其与理化因子、挥发性风味成分相关性分别进行典范对应分析(CCA)及偏最小二乘判别分析(PLS-DA)。结果表明,随着轮次的增加,真菌菌群的多样性升高,而丰度先升高后降低;酵母菌是白酒发酵过程中的主要真菌,但相对丰度逐步降低,在属水平上以伊萨酵母属(Issatchenkia)为主,其相对丰度由第一轮次的97.48%逐渐下降至第七轮次的3.53%。相关性分析结果表明,总酸、还原糖和酒精度是窖池发酵微生物演替的重要理化因子;伊萨酵母属(Issatchenkia)与乙酸乙酯、乙酸异戊酯、异戊醇等相关性较大;哈萨克斯坦酵母属(Kazachstania)、丝衣霉属(Byssochlamys)、罗萨氏菌属(Rasamsonia)、复膜孢酵母属(Saccharomycopsis)等与正己酸乙酯、庚酸乙酯、3-羟基丁酸乙酯、丁二酸二乙酯、苯乙酸乙酯、油酸乙酯、乙醇等相关性较大;而Leiothecium、未分类的酵母目(unclassified_o__Saccharomycetales)、Apiotrichum、Cutaneotrichosporon等则对壬酸乙酯、乙酸苯乙酯、正己醇、2,3-丁二醇、糠醇、糠醛等的形成起到重要作用。 展开更多
关键词 酱香型白酒 酒醅 菌群多样性 理化因子 挥发性风味物质 相关性分析
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中草药和活性干酵母制剂对延边黄牛哺乳犊牛腹泻率及直肠菌群多样性的影响 被引量:1
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作者 李炯奎 金锡九 +4 位作者 耿凯 任凤龙 王鑫鸿 耿春银 金英海 《中国畜牧兽医》 CAS CSCD 北大核心 2024年第12期5317-5324,共8页
【目的】研究补饲中草药、活性干酵母制剂对哺乳犊牛腹泻率及肠道菌群多样性的影响,为探究中草药和活性干酵母制剂在哺乳犊牛肠道健康的作用机理提供理论依据。【方法】选取体重、月龄相近且体况良好的延边黄牛哺乳犊牛24头,采用完全随... 【目的】研究补饲中草药、活性干酵母制剂对哺乳犊牛腹泻率及肠道菌群多样性的影响,为探究中草药和活性干酵母制剂在哺乳犊牛肠道健康的作用机理提供理论依据。【方法】选取体重、月龄相近且体况良好的延边黄牛哺乳犊牛24头,采用完全随机设计方法随机分成3组,每组8头犊牛(公5头、母3头),对照组(Ⅰ组)饲喂基础饲粮,中草药组(Ⅱ组)在基础饲粮中添加0.5%的中草药制剂,酵母组(Ⅲ组)在基础饲粮中添加1 g/d的拉曼活性干酵母。饲养试验为期31 d,其中预试期10 d,正式试验期为21 d。在饲养试验结束当天晨饲前,采用棉拭子无菌采集该牧场犊牛直肠中新鲜粪便样品,于―80℃保存待测,采集的犊牛直肠中的粪便进行测序,比较Ⅱ、Ⅲ组与Ⅰ组在菌群多样性方面存在的差异。【结果】①与Ⅰ组相比,Ⅱ和Ⅲ组犊牛的平均日增重(ADG)显著提高(P<0.05),料重比(F/G)、腹泻率和粪便评分显著降低(P<0.05);②在瘤胃菌群多样性方面,与Ⅰ组相比,2个处理组的Alpha多样性指数(ACE、Chao1、Coverage、Shannon和Simpson)均无显著差异(P>0.05);③瘤胃菌群分布方面,在门水平上,两个处理组中优势菌门均为厚壁菌门(Firmicutes)和拟杆菌门(Bacteroidetes);在属水平上,两个处理组中优势菌属为瘤胃球菌科UCG-005(Ruminococcaceae_UCG-005)、理研菌科RC9肠群(Rikenellaceae_RC9_gut_group)、产粪甾醇真细菌群([Eubacterium]_coprostanoligenes_group)。其中,与Ⅰ组相比,Ⅱ和Ⅲ组理研菌科RC9肠群的相对丰度显著升高(P<0.05),其他菌群在门水平和属水平上的相对丰度差异不显著(P>0.05)。【结论】补饲0.5%中草药饲料添加剂或1 g/d活性干酵母制剂均可在不同程度上减少哺乳犊牛腹泻症状,而且改善肠道菌群多样性,促进其肠道健康发育。 展开更多
关键词 哺乳犊牛 中草药 活性干酵母 腹泻率 菌群多样性
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基于高通量测序的黄羽肉鸡屠宰过程中菌群多样性分析 被引量:1
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作者 肖亚培 王在天 +2 位作者 孙芝兰 刘芳 王道营 《肉类研究》 北大核心 2024年第3期1-9,共9页
利用传统培养和高通量测序技术分析黄羽肉鸡打毛、净膛、预冷和包装屠宰过程中鸡胴体表面和预冷水的微生物污染情况。结果表明:经打毛、净膛和预冷后的鸡胴体菌落总数分别为4.82、5.03、4.68(lg(CFU/g)),说明该屠宰工艺未起到较好的减... 利用传统培养和高通量测序技术分析黄羽肉鸡打毛、净膛、预冷和包装屠宰过程中鸡胴体表面和预冷水的微生物污染情况。结果表明:经打毛、净膛和预冷后的鸡胴体菌落总数分别为4.82、5.03、4.68(lg(CFU/g)),说明该屠宰工艺未起到较好的减菌效果,宰后胴体微生物污染严重;高通量测序技术分析发现,肉鸡屠宰加工过程中的胴体表面和预冷水的优势腐败菌在属水平上为莫拉氏菌属、假单胞菌属、葡萄球菌属、乳杆菌属、巨大球菌属、嗜冷杆菌属和不动杆菌属等。主成分分析表明,一阶、二阶预冷水、预冷后鸡胴体及包装后鸡胴体相距较近,差异性不大,但与打毛鸡胴体和净膛后鸡胴体2组样品有较大差异,说明预冷水中的污染菌组成决定了宰后胴体的污染菌种类。本研究说明不同屠宰流程后的黄羽肉鸡胴体污染菌的组成与丰度存在差异,需针对不同屠宰流程特性采取对应的控制手段保障黄羽肉鸡制品的质量与安全。 展开更多
关键词 高通量测序 黄羽肉鸡屠宰 落总数 菌群多样性 优势
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基于Illumina MiSeq高通量测序技术分析丹阳黄酒酒曲中微生物菌群多样性 被引量:4
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作者 陈磊 戴亦军 《中国酿造》 CAS 北大核心 2024年第6期141-145,共5页
该研究以江苏丹阳某黄酒酒曲为原料,利用Illumina Miseq高通量测序技术对其微生物菌群多样性进行研究。结果表明,该酒曲中真菌菌群的多样性高于细菌,而丰富度低于细菌。从样品中共注释到7个细菌门,10个细菌属;6个真菌门,14个真菌属。优... 该研究以江苏丹阳某黄酒酒曲为原料,利用Illumina Miseq高通量测序技术对其微生物菌群多样性进行研究。结果表明,该酒曲中真菌菌群的多样性高于细菌,而丰富度低于细菌。从样品中共注释到7个细菌门,10个细菌属;6个真菌门,14个真菌属。优势细菌属(相对丰度≥1%)为乳杆菌属(Lactobacillus)、魏斯氏菌属(Weissella)、肠杆菌属(Enterobacter)、葡萄球菌属(Staphylococcus)、不动杆菌属(Acinetobacter)、泛菌属(Pantoea);优势真菌属(相对丰度≥1%)为曲霉属(Aspergillus)、短梗霉属(Aureobasidium)、芽枝霉属(Cladosporium)、威克汉姆酵母属(Wickerhamomyces)、青霉属(Penicillium)、木拉克酵母属(Mrakia)、根霉属(Rhizopus)、镰刀菌属(Fusarium)、帚枝霉属(Sarocladium)、篮状菌属(Talaromyces)。其中,短梗霉属(Aureobasidium)、篮状菌属(Talaromyces)均为酒曲微生物中报道较少的属,其特性和功能尚不清晰,有待进一步深入的研究。该研究结果为丹阳黄酒的发酵工艺改进和品质提升提供了理论依据。 展开更多
关键词 黄酒酒曲 微生物菌群多样性 高通量测序 落结构
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自然发酵酸面团发酵过程中微生物菌群多样性分析及细菌功能预测 被引量:2
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作者 杨文馨 安飞宇 +1 位作者 曹恺欣 乌日娜 《中国酿造》 CAS 北大核心 2024年第2期43-47,共5页
该研究通过高通量测序技术研究不同发酵时期自然发酵酸面团的微生物菌群多样性,并利用PICRUSt对细菌群落进行基因功能预测分析。结果表明,对于细菌,共检测到5个细菌门,不同发酵时期绝对优势菌门不同,发酵前期(D1)为蓝藻细菌门(Cyanobact... 该研究通过高通量测序技术研究不同发酵时期自然发酵酸面团的微生物菌群多样性,并利用PICRUSt对细菌群落进行基因功能预测分析。结果表明,对于细菌,共检测到5个细菌门,不同发酵时期绝对优势菌门不同,发酵前期(D1)为蓝藻细菌门(Cyanobacteria),中期(D2~D3)为厚壁菌门(Firmicutes),后期(D4)为变形菌门(Proteobacteria);共检测到34个细菌属,发酵前期绝对优势菌属为未分类的蓝藻门(norank_c__Cyanobacteria),中期为乳球菌属(Lactococcus),后期为未分类的γ-变形菌纲(unclassified_c_Gammaproteobacteria)。对于真菌,共检测到13个真菌门,发酵过程中子囊菌门(Ascomycota)为绝对优势菌门;共检测到12个真菌属,未分类的酵母目(Saccharomycetales_unclassified)为绝对优势菌属,后期汉逊酵母属(Hanseniaspora)也被大量检出。通过PICRUSt进行分析预测,细菌群落在整个发酵过程中的基因功能主要有能量产生和转化、转录、无机离子转运和代谢等,该研究结果可为筛选酸面团内优良发酵功能菌种提供数据参考。 展开更多
关键词 自然发酵酸面团 微生物菌群多样性 高通量测序 功能预测
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哮喘患儿呼气冷凝物菌群多样性及其与病情的相关性
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作者 樊青曼 张冬婕 +2 位作者 刘士霞 穆艳顺 李向红 《临床肺科杂志》 2024年第12期1827-1831,共5页
目的探讨哮喘患儿呼气冷凝物菌群的多样性,分析其多样性与病情的相关性。方法前瞻性选取2020年12月至2024年1月来我院接受治疗的98例哮喘患儿作为研究对象纳入研究组,选取同期于我院接受健康检查的50例健康儿童作为观察对象,纳入对照组... 目的探讨哮喘患儿呼气冷凝物菌群的多样性,分析其多样性与病情的相关性。方法前瞻性选取2020年12月至2024年1月来我院接受治疗的98例哮喘患儿作为研究对象纳入研究组,选取同期于我院接受健康检查的50例健康儿童作为观察对象,纳入对照组。采用微生物评估方法对比研究组患儿和对照组儿童呼吸道中的呼气冷凝物的物种多样性,同时根据研究组患儿的临床表现将其分为轻中度组、重度组,采用Spearman分析其呼气冷凝物菌群多样性与病情的相关性。结果研究组的呼吸道菌群主要为变形菌门、厚壁菌门以及拟杆菌门,其中以变形菌门占比最高;研究组的丰富度指数Chao1、ACE以及多样性指数Evenness均低于对照组,多样性指数Shannon、Simpson均高于对照组(P<0.05);根据研究组患儿的临床表现进行亚分组后发现,重度组的丰富度指数Chao1、ACE以及多样性指数Evenness均低于轻中度组,多样性指数Shannon、Simpson均高于轻中度组(P<0.05);Spearman分析显示,哮喘的病情与ACE(r_( s)=-0.734,P<0.05)、Chao(r_( s)=-0.618,P<0.05)以及Evenness指数(r_( s)=-0.384,P<0.05)呈负相关,与Shannon(r_( s)=0.724,P<0.05)、simpson指数(r_( s)=0.642,P<0.05)呈正相关。结论在哮喘患儿的呼气冷凝物菌群中存在较高的菌群多样性,同时菌群多样性越高,患者的病情越严重。 展开更多
关键词 哮喘 患儿 呼气冷凝物 微生物菌群多样性 丰度
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阴道菌群多样性和代谢产物分析及与HPV感染的相关性 被引量:4
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作者 马嘉嘉 李紫薇 +1 位作者 热汗古力·王苏甫 湛文博 《河北医药》 CAS 2024年第21期3333-3336,共4页
目的探讨人乳头瘤病毒(HPV)感染患者阴道菌群多样性和代谢产物并分析其相关性。方法选取2022年1月至2023年1月体检科或妇产科就诊的女性100例,采集患者宫颈分泌物检测其HPV感染情况,根据患者有无感染HPV,取阴道分泌物检测其阴道菌群及... 目的探讨人乳头瘤病毒(HPV)感染患者阴道菌群多样性和代谢产物并分析其相关性。方法选取2022年1月至2023年1月体检科或妇产科就诊的女性100例,采集患者宫颈分泌物检测其HPV感染情况,根据患者有无感染HPV,取阴道分泌物检测其阴道菌群及其代谢产物,明确其相关性。多因素Logistic回归分析影响HPV感染发生的因素。结果100例患者HPV检测显示,HPV阳性46例。HPV感染组细菌、菌群感染阳性占比、唾液酸苷酶、菌群多样性Ⅰ级占比及H_(2)O_(2)阳性占比均明显高于无HPV感染组(P<0.05),乳酸杆菌阳性占比、菌群多样性、密集性Ⅱ~Ⅲ级占比明显低于无HPV感染组(P<0.05),2组间霉菌、支原体、滴虫、混合菌阳性占比、菌群多样性、密集性Ⅳ级占比、白细胞脂酶、乙酰氨基葡萄糖苷酶阳性占比比较差异无统计学意义(P>0.05);多因素Logistic回归分析显示,菌群多样性、菌群密集性及H_(2)O_(2)为影响HPV感染的因素(P<0.05)。结论阴道菌群多样性、密集性、H_(2)O_(2)与HPV感染有关,可增加HPV感染风险。 展开更多
关键词 HPV感染 代谢产物 阴道菌群多样性
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丙型肝炎患者肠道菌群多样性变化及其致肝损伤作用机制研究进展 被引量:1
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作者 王美玲 李德伟 +3 位作者 吴旭 郭朝阳 赵圣强 王京 《山东医药》 CAS 2024年第15期98-102,共5页
肠道菌群在维持肠上皮通透性、调节代谢、诱导先天免疫等方面发挥重要作用,正常情况下肠道菌群维持着动态平衡。丙型肝炎患者的肠道菌群出现失调,主要表现为肠道菌群的α和β多样性发生改变。丙型肝炎病毒不仅能够通过调节胆汁酸代谢影... 肠道菌群在维持肠上皮通透性、调节代谢、诱导先天免疫等方面发挥重要作用,正常情况下肠道菌群维持着动态平衡。丙型肝炎患者的肠道菌群出现失调,主要表现为肠道菌群的α和β多样性发生改变。丙型肝炎病毒不仅能够通过调节胆汁酸代谢影响肠道菌群,还能破坏肠道的免疫防线,使得参与形成肠道黏膜免疫屏障的抗菌肽、IgA和免疫细胞、短链脂肪酸减少,引起肠道通透性增加,导致细菌易位。肠道菌群的这种失调启动炎症和代谢紊乱的循环,直接和间接通过肠—肝轴促进丙型肝炎患者肝脏的损伤。 展开更多
关键词 肠道菌群多样性 胆汁酸代谢 免疫屏障 肝损伤 肠道炎症 内毒素血症 丙型肝炎 病毒性肝炎
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固齿散对慢性牙周炎患者的效果及对龈沟液菌群多样性的影响 被引量:1
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作者 刘志芳 李垚 +1 位作者 刘帅 宋新燕 《湖南中医药大学学报》 CAS 2024年第10期1810-1815,共6页
目的探讨固齿散对慢性牙周炎患者的效果及对龈沟液菌群多样性的影响。方法选择邯郸市口腔医院2022年1月至2023年8月收治的112例慢性牙周炎患者为研究对象。按照随机数字表法将其分成观察组和对照组,各56例。对照组予以常规治疗,观察组... 目的探讨固齿散对慢性牙周炎患者的效果及对龈沟液菌群多样性的影响。方法选择邯郸市口腔医院2022年1月至2023年8月收治的112例慢性牙周炎患者为研究对象。按照随机数字表法将其分成观察组和对照组,各56例。对照组予以常规治疗,观察组在对照组基础上予以固齿散(0.5 g/次,2次/d)治疗,两组共治疗3个月。对比两组临床疗效,中医证候积分,牙周探诊相关指标情况[龈沟出血指数(sulcus bleeding index,SBI)、菌斑指数(plague index,PLI)及牙龈指数(gingival index,GI)],龈沟炎症因子[白细胞介素(interleukin,IL)-6、IL-1β],龈沟液菌群α多样性(Shannon指数、Simpson指数、Chao1指数、ACE指数)及β多样性。结果治疗后,观察组(92.86%)临床总有效率高于对照组(78.57%)(P<0.05);与对照组相比,观察组中医证候积分、SBI、PLI、GI、IL-6、IL-1β、Shannon指数降低(P<0.05,P<0.01),Simpson指数升高(P<0.05)。PC1对于样本差异的贡献值为70.90%,PC2对于样本差异的贡献值为24.10%。治疗后观察组与对照组整体距离存在一定分离趋势(P<0.05)。结论固齿散可调节慢性牙周炎患者龈沟液菌群多样性,改善牙周状况,减轻龈沟液炎症水平,效果显著。 展开更多
关键词 慢性牙周炎 固齿散 菌群多样性 龈沟液炎症 牙周状况 牙龈指数 斑指数
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