为了探讨牛磺鹅去氧胆酸(taurochenodeoxycholic acid,TCDCA)的抗炎作用机制,通过PubChem查找TCDCA的分子结构并下载SDF格式文件,经PharmMapper服务器、GeneCards数据库预测并筛选TCDCA抗炎靶点。将靶点导入STRING数据库得到蛋白互作关...为了探讨牛磺鹅去氧胆酸(taurochenodeoxycholic acid,TCDCA)的抗炎作用机制,通过PubChem查找TCDCA的分子结构并下载SDF格式文件,经PharmMapper服务器、GeneCards数据库预测并筛选TCDCA抗炎靶点。将靶点导入STRING数据库得到蛋白互作关系并通过Cytoscape进行可视化处理,然后将靶点导入STRING数据库进行GO及KEGG通路分析,通过分子对接对TCDCA与主要靶点结合活性进行验证,并通过DisGeNET数据库获取靶点类型信息。筛选得到TCDCA涉及抗炎作用的靶点89个,网络分析结果表明, TCDCA主要涉及刺激反应(response to stimulus)、多细胞生物过程(multicellular organismal process)、单细胞生物过程(single-multicellular organism process)、对化学刺激反应(response to chemical)及有机物反应(response to organic substance)等68个生物过程,通过调节癌症相关通路(pathways in cancer)、孕酮介导的卵母细胞成熟(progesterone-mediated oocyte maturation)、MAPK信号通路(MAPK signaling pathway)、蛋白多糖在癌症中的作用(proteoglycans in cancer)等51条信号通路来发挥抗炎作用。本研究反映出TCDCA经多靶点、多途径发挥抗炎作用的特点,为后续开展其抗炎作用机制的研究指明了方向。展开更多
文摘为了探讨牛磺鹅去氧胆酸(taurochenodeoxycholic acid,TCDCA)的抗炎作用机制,通过PubChem查找TCDCA的分子结构并下载SDF格式文件,经PharmMapper服务器、GeneCards数据库预测并筛选TCDCA抗炎靶点。将靶点导入STRING数据库得到蛋白互作关系并通过Cytoscape进行可视化处理,然后将靶点导入STRING数据库进行GO及KEGG通路分析,通过分子对接对TCDCA与主要靶点结合活性进行验证,并通过DisGeNET数据库获取靶点类型信息。筛选得到TCDCA涉及抗炎作用的靶点89个,网络分析结果表明, TCDCA主要涉及刺激反应(response to stimulus)、多细胞生物过程(multicellular organismal process)、单细胞生物过程(single-multicellular organism process)、对化学刺激反应(response to chemical)及有机物反应(response to organic substance)等68个生物过程,通过调节癌症相关通路(pathways in cancer)、孕酮介导的卵母细胞成熟(progesterone-mediated oocyte maturation)、MAPK信号通路(MAPK signaling pathway)、蛋白多糖在癌症中的作用(proteoglycans in cancer)等51条信号通路来发挥抗炎作用。本研究反映出TCDCA经多靶点、多途径发挥抗炎作用的特点,为后续开展其抗炎作用机制的研究指明了方向。
