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中国东部平原湖区现代沉积植物DNA的保存及其与土地利用的关系
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作者 吴铠 李凯 +5 位作者 林琪 贾伟瀚 葛亚汶 Kathleen R.Stoof-Leichsenring Ulrike Herzschuh 倪健 《第四纪研究》 北大核心 2025年第1期213-226,共14页
东部平原湖区湖泊众多,但普遍面临富营养化和流域植被破坏问题,使其成为现代生态保护和探究人类活动对湖泊生态系统干扰研究的热点地区。湖泊沉积DNA技术近年来开始被用于湖泊水生植物调查以及流域植被重建等工作,但是该技术在我国东部... 东部平原湖区湖泊众多,但普遍面临富营养化和流域植被破坏问题,使其成为现代生态保护和探究人类活动对湖泊生态系统干扰研究的热点地区。湖泊沉积DNA技术近年来开始被用于湖泊水生植物调查以及流域植被重建等工作,但是该技术在我国东部平原湖区的适用性以及植物DNA信号与湖周及流域植被的关系,有待于进一步评估。本研究选择东部平原湖区的22个湖泊为研究对象,利用植物DNA宏条形码技术使用通用植物引物trnL g-h对湖泊表层沉积物中的植物DNA进行扩增并进行高通量测序,结合湖泊形态特征、水体及沉积物理化参数以及湖泊周边土地利用类型等,揭示不同湖泊沉积物中植物DNA保存丰富度的差异及其影响因素,探讨了陆生植物DNA对植被的代表性。结果表明,植物DNA宏条形码共记录230个类群,其中28%的序列可以鉴定至种水平,在分类学分辨率以及鉴定效率上沉积植物DNA相较于花粉分析具有一定优势。与花粉检测的区域性植被信号不同,湖泊沉积植物DNA反映的是局地或者湖泊周边植被组成,可对湖周森林、农田以及建筑用地中的优势植物信号进行区分,凸显了沉积植物DNA在东部平原湖区进行局地植被重建中的适用性。此外,年均降水量以及流域下垫面性质对陆生沉积植物DNA丰度具有重要影响,同时年均温也是影响沉积植物DNA保存的重要因素。综上,在东部平原湖区,湖泊沉积植物DNA技术可为揭示长期人类活动影响下的局地植被组成变化提供支持,但这同样依赖于对湖泊沉积植物DNA现代过程的进一步研究和理解。 展开更多
关键词 沉积物dna 植物dna 宏条形码 土地利用类型 东部平原湖区
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一种改良的植物DNA提取方法 被引量:191
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作者 李金璐 王硕 +2 位作者 于婧 王玲 周世良 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第1期72-78,共7页
植物组织中含有大量多糖、多酚、酯类等次生代谢产物,要从中提取高质量的DNA比较困难。针对这一情况,该文提出一种改良CTAB植物DNA提取方法(mCTAB),并以10种常见植物为实验材料,与4种常用的植物DNA提取试剂盒作对比。结果表明,mCTAB法... 植物组织中含有大量多糖、多酚、酯类等次生代谢产物,要从中提取高质量的DNA比较困难。针对这一情况,该文提出一种改良CTAB植物DNA提取方法(mCTAB),并以10种常见植物为实验材料,与4种常用的植物DNA提取试剂盒作对比。结果表明,mCTAB法提取的DNA产率高且质量好,PCR扩增成功率也较高,而提取成本显著低于DNA提取试剂盒,可有效用于植物DNA条形码等研究的植物DNA提取。 展开更多
关键词 dna条形码 改良CTAB法 植物dna提取 提取方法
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逆境胁迫下植物DNA损伤和DNA错配修复研究进展 被引量:8
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作者 钟鸣 陈琢 +2 位作者 刘宛 李培军 台培东 《生态学杂志》 CAS CSCD 北大核心 2012年第9期2404-2411,共8页
在正常条件下植物体内的基因组是稳定的,但在逆境胁迫条件下(如化学诱变物、紫外线、电离辐射、细菌及真菌毒素、以及代谢过程中产生的活性氧自由基等),细胞DNA容易遭受伤害,其主要损伤形式为碱基改变、脱碱基位点、碱基错配、插入或缺... 在正常条件下植物体内的基因组是稳定的,但在逆境胁迫条件下(如化学诱变物、紫外线、电离辐射、细菌及真菌毒素、以及代谢过程中产生的活性氧自由基等),细胞DNA容易遭受伤害,其主要损伤形式为碱基改变、脱碱基位点、碱基错配、插入或缺失、嘧啶联合、DNA加合物、DNA链断裂、甲基化损伤、DNA链内和链间交联。这些受损伤的DNA对植物细胞产生遗传毒性或细胞毒性。对DNA损伤进行修复则是机体抵御各种伤害的基础。本文介绍了植物DNA损伤(甲基化损伤、DNA加合物等)和DNA错配修复(DNA mis-match repair,MMR)(原核生物MMR、植物的MMR、植物微卫星的不稳定性)的研究进展。认为植物DNA错配修复基因及MMR突变体在环境毒物生物修复和环境污染的早期诊断与评价方面具有较高的应用前景。 展开更多
关键词 逆境胁迫 植物dna损伤 dna错配修复 生物标记物
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三种快速提取植物DNA改良方法的比较 被引量:31
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作者 陈璋 朱秀英 卢勤 《遗传》 CAS CSCD 北大核心 1990年第2期10-12,共3页
DNA是生物遗传信息的载体,快速提取高分子量、纯净的DNA是进行核苷酸序列测定、基因文库构建和遗传转化等研究的重要步骤。研究以水稻、小麦、大麦、大豆、豌豆和紫云英等为材料,比较了三种改良法提取植物DNA的效果。结果表明,三种改良... DNA是生物遗传信息的载体,快速提取高分子量、纯净的DNA是进行核苷酸序列测定、基因文库构建和遗传转化等研究的重要步骤。研究以水稻、小麦、大麦、大豆、豌豆和紫云英等为材料,比较了三种改良法提取植物DNA的效果。结果表明,三种改良后的方法不仅保留了原法的许多优点,而且方法简单,不经CsCl_2密度梯度离心能较干净地去除蛋白质及RNA,获得较纯净的、大分子的双链DNA,在不同程度上满足了各种植物提取DNA的需要。 展开更多
关键词 植物dna 提取
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植物DNA条形码技术 被引量:163
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作者 任保青 陈之端 《植物学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期1-12,共12页
DNA条形码技术是利用标准的、具有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段在物种内的特异性和种间的多样性而创建的一种新的生物身份识别系统,从而实现对物种的快速自动鉴定。尽管这一技术在理论上和具体应用上仍存在很多争论,但DNA条... DNA条形码技术是利用标准的、具有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段在物种内的特异性和种间的多样性而创建的一种新的生物身份识别系统,从而实现对物种的快速自动鉴定。尽管这一技术在理论上和具体应用上仍存在很多争论,但DNA条形码概念自2003年由加拿大分类学家Paul Hebert首次提出后就在世界范围内受到了广泛关注。在植物类群中条形码的研究和应用尚处于探索阶段,稍落后于对动物类群的研究,这主要表现在:(1)DNA条形码的选择及其评价仍没有统一的标准;(2)对类群较全面的形态分类学修订和植物DNA条形码研究的结合十分缺乏;(3)以往研究在取样上尺度较大,而对具体类群的研究较少,一个科或一个属只用有限的种类作为代表,同一种内的取样个体数量也不足,这样虽然表面上看来利用选定的DNA条形码可以较容易地把代表物种区分开,但实际上目前建议的植物DNA条形码(例如由生命条形码咨询委员会植物工作组最近提出的rbcL和matK)由于其分子进化速率较慢,在种级水平上,特别是对于那些经历了适应辐射或快速进化的属来说,分辨率较低。而DNA条形码的应用主要集中在属内物种水平的鉴别,因此只有针对具体类群进行探索研究,发现进化速率较快、分辨率高且通用性好的条形码,才可能为建立完整的条形码数据库起到积极有效的作用。 展开更多
关键词 ITS.matK 形态分类学 植物dna条形码 RBCL TRNH-PSBA
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植物DNA甲基化及其表观遗传作用 被引量:16
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作者 陈小强 王春国 +2 位作者 李秀兰 宋文芹 陈瑞阳 《细胞生物学杂志》 CAS CSCD 2007年第4期519-524,共6页
表观遗传学(epigenetics)是研究没有DNA序列变化的、可遗传的基因表达的改变。目前研究表明,表观遗传学在植物生长发育过程中起着极其重要的作用,主要通过包括DNA甲基化、RNA干涉、基因组印记、转基因沉默等多个方面来调控植物的生长发... 表观遗传学(epigenetics)是研究没有DNA序列变化的、可遗传的基因表达的改变。目前研究表明,表观遗传学在植物生长发育过程中起着极其重要的作用,主要通过包括DNA甲基化、RNA干涉、基因组印记、转基因沉默等多个方面来调控植物的生长发育。其中,DNA甲基化是表观遗传学的最重要研究内容之一,是调节基因组功能的重要手段。现对植物DNA甲基化的特征、维持机制、调控机制、表观遗传作用及其研究方法进行简要论述。 展开更多
关键词 表观遗传学 植物dna甲基化 甲基化研究方法
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植物DNA条形码研究展望 被引量:18
7
作者 李德铢 曾春霞 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期297-298,共2页
物种的鉴定是生物多样性研究的基石之一。在DNA双螺旋结构发现50年之际,加拿大学者提出了通过DNA条形码,即标准化的、较短的DNA序列对物种进行快速、准确鉴定的动议(Hebert et al.,2003)。经过12年的发展,DNA条形码已成为生物多样性... 物种的鉴定是生物多样性研究的基石之一。在DNA双螺旋结构发现50年之际,加拿大学者提出了通过DNA条形码,即标准化的、较短的DNA序列对物种进行快速、准确鉴定的动议(Hebert et al.,2003)。经过12年的发展,DNA条形码已成为生物多样性研究领域发展最迅速的方向之一。一方面,DNA条形码和分子系统发育的研究使分类学、生态学、进化生物学等传统领域焕发出新的活力, 展开更多
关键词 植物dna 条形码 dna双螺旋结构 生物多样性 展望 分子系统发育 进化生物学 加拿大
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植物DNA条形码与生物多样性数据共享平台构建 被引量:4
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作者 曾春霞 王亚楠 +1 位作者 王雨华 王红 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2014年第3期285-292,共8页
DNA条形码基于较短的DNA序列实现物种的快速、准确鉴定,不仅加快了全球生物物种的鉴定和分类步伐,也为生物多样性的管理、保护和可持续利用提供了新思路和研究方法。植物DNA条形码标准数据库的不断完善,将使植物多样性信息的快速获取成... DNA条形码基于较短的DNA序列实现物种的快速、准确鉴定,不仅加快了全球生物物种的鉴定和分类步伐,也为生物多样性的管理、保护和可持续利用提供了新思路和研究方法。植物DNA条形码标准数据库的不断完善,将使植物多样性信息的快速获取成为可能;将不同类型数据资源整合、共享和利用,构建植物DNA条形码数据共享平台,是满足公众对物种准确鉴定和快速认知的重要支撑。本文介绍了近年来植物DNA条形码的研究进展;植物DNA条形码参考数据库的研发现状和存在的问题。结合上述问题,围绕"大数据"时代背景,对如何管理和使用好海量的植物信息,如何构建数据共享平台提出了一些设想:(1)数据共享平台的元数据应尽可能翔实、丰富、准确和多关联;(2)数据标准应统一规范;(3)查询入口方便、迅速、多样,易于管理,便于实现更大程度的数据共享和全球化的合作交流。 展开更多
关键词 植物dna条形码 iFlora 生物多样性 共享平台
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植物DNA条形码研究现状及应用前景 被引量:14
9
作者 唐建阳 周先治 《中国农学通报》 CSCD 北大核心 2009年第24期35-43,共9页
生物DNA条形码已成为近年来生物学研究的热点,该技术在动物研究中已得到广泛应用,在植物中研究进展缓慢,植物DNA条形码筛选区域主要集中在叶绿体和核糖体内转录间隔区(ITS),目前还未获得广泛认同的植物DNA条形码。主要综述了不同单片段... 生物DNA条形码已成为近年来生物学研究的热点,该技术在动物研究中已得到广泛应用,在植物中研究进展缓慢,植物DNA条形码筛选区域主要集中在叶绿体和核糖体内转录间隔区(ITS),目前还未获得广泛认同的植物DNA条形码。主要综述了不同单片段条形码及组合条形码的研究及应用现状,并展望了植物DNA条形码应用前景。 展开更多
关键词 植物dna条形码 研究现状 应用前景
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植物DNA条形码技术用于交通命案的调查 被引量:7
10
作者 雷湘华 周倩 高必达 《中国司法鉴定》 2013年第5期48-50,共3页
目的以rDNA-ITS序列片段为植物DNA条形码,对涉及一例交通命案的植物检材进行种属鉴定,判断三轮车左侧车体上提取的树皮样物质与农用车所运的树木是否为同一树种。方法采用改良CTAB法提取植物DNA,先将DNA纯化,再进行rDNA-ITS的PCR扩增,... 目的以rDNA-ITS序列片段为植物DNA条形码,对涉及一例交通命案的植物检材进行种属鉴定,判断三轮车左侧车体上提取的树皮样物质与农用车所运的树木是否为同一树种。方法采用改良CTAB法提取植物DNA,先将DNA纯化,再进行rDNA-ITS的PCR扩增,然后对PCR产物切胶、回收,克隆、测序,对测序结果进行BLAST分析,并构建系统发育树。结果三轮车上粘附的树皮来源于柑橘(Citrus sunki),农用车所运的树木为界山三角槭(Acer buergerianum),两者非同一种属。结论用rDNA-ITS序列片段用作植物DNA条形码对植物种属进行鉴定,可获得可靠的鉴定意见。 展开更多
关键词 物种鉴定 Rdna-ITS 植物dna条形码 交通命案
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植物DNA条形码在系统发育研究中的应用 被引量:4
11
作者 向小果 王伟 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期281-282,共2页
1常用植物DNA条形码物种的准确鉴定是开展科学研究和生物多样性保护的先决条件,但根据形态学特征进行物种鉴定对非专业人员而言比较困难。即使是专业人员,面对纷繁复杂的物种,要想逐一鉴定也难以实现。DNA条形码技术(DNA barcoding)... 1常用植物DNA条形码物种的准确鉴定是开展科学研究和生物多样性保护的先决条件,但根据形态学特征进行物种鉴定对非专业人员而言比较困难。即使是专业人员,面对纷繁复杂的物种,要想逐一鉴定也难以实现。DNA条形码技术(DNA barcoding)为物种的快速、准确鉴定提供了可能(Hebert et al.,2003)。线粒体COI基因作为动物的DNA条形码已得到广泛应用。 展开更多
关键词 植物dna 条形码技术 系统发育 应用 物种鉴定 生物多样性保护 形态学特征 COI基因
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植物DNA甲基化与表观遗传 被引量:4
12
作者 李新玲 徐香玲 《中国农学通报》 CSCD 2008年第1期123-126,共4页
非DNA序列遗传信息的传递称为表观遗传,它不涉及基因序列的改变,不符合孟德尔式的遗传方式。其中DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰方式,是调节基因组功能的重要手段。简要论述了植物DNA甲基转移酶、甲基化方式、发生位置及DNA甲基化... 非DNA序列遗传信息的传递称为表观遗传,它不涉及基因序列的改变,不符合孟德尔式的遗传方式。其中DNA甲基化是一种重要的表观遗传修饰方式,是调节基因组功能的重要手段。简要论述了植物DNA甲基转移酶、甲基化方式、发生位置及DNA甲基化所引起的表观遗传现象。 展开更多
关键词 植物dna甲基化 表观遗传 甲基转移酶
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绿盲蝽体内寄主植物DNA提取方法的优化 被引量:1
13
作者 王倩 包伟方 +2 位作者 吴月坤 杨益众 陆宴辉 《应用昆虫学报》 CAS CSCD 北大核心 2017年第4期683-689,共7页
【目的】优化绿盲蝽Apolygus lucorum体内植物DNA提取方法,为绿盲蝽寄主利用习性研究发展DNA分子追踪技术。【方法】首先分别利用CTAB法、两种试剂盒法提取绿盲蝽中肠内DNA样本,比较分析其中的棉花DNA检出率。其次,利用1%~1.5%的次氯酸... 【目的】优化绿盲蝽Apolygus lucorum体内植物DNA提取方法,为绿盲蝽寄主利用习性研究发展DNA分子追踪技术。【方法】首先分别利用CTAB法、两种试剂盒法提取绿盲蝽中肠内DNA样本,比较分析其中的棉花DNA检出率。其次,利用1%~1.5%的次氯酸钠溶液漂洗绿盲蝽成虫,比较不同漂洗处理对绿盲蝽体表植物DNA的清除效率以及对体内棉花DNA检出率。【结果】不同提取方法对绿盲蝽中肠内棉花DNA检出率存在显著影响,其中CTAB法提取的中肠样本中棉花DNA的检出率最高。将绿盲蝽成虫在1%~1.5%次氯酸钠中漂洗5 s,可清除成虫体表的植物DNA污染,且不破坏体内的棉花DNA;漂洗30 s后,体内棉花DNA检出率明显降低。【结论】本研究证实了利用整头绿盲蝽成虫代替其中肠提取的绿盲蝽DNA样本的可行性,并明确了成虫体内植物DNA高效提取的方法,为进一步利用DNA分子追踪技术研究绿盲蝽田间寄主选择与取食行为奠定了重要基础。 展开更多
关键词 绿盲蝽 植物dna提取 CTAB法 体表dna污染
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植物DNA条形码、物种形成和分类学 被引量:8
14
作者 刘建全 《生物多样性》 CAS CSCD 北大核心 2015年第3期283-285,共3页
DNA条形码最大的特点是用一段标准DNA序列就可以鉴定生物材料(特别是不具有分类特征的残缺或来自幼小个体的材料)和生物产品的物种来源(Hebert et al.,2003)。已有研究发现,动物中线粒体基因组的COI基因序列能鉴定多个动物类群的物... DNA条形码最大的特点是用一段标准DNA序列就可以鉴定生物材料(特别是不具有分类特征的残缺或来自幼小个体的材料)和生物产品的物种来源(Hebert et al.,2003)。已有研究发现,动物中线粒体基因组的COI基因序列能鉴定多个动物类群的物种,被认为是理想的DNA条形码片段(Ward et al.,2005;Tavares&Baker,2008)。而植物DNA条形码序列的确定还存在争议, 展开更多
关键词 植物dna 物种形成 条形码 分类学 线粒体基因组 生物材料 动物类群 dna序列
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出入境检验检疫领域中植物DNA条形码技术的应用探究 被引量:2
15
作者 于璇 何瑞芳 彭梅 《中国新技术新产品》 2017年第8期14-15,共2页
DNA生物技术的发展为DNA条形码技术的应用创造了条件,作为一项新技术,应用DNA片段来检查不同物种的类别,从而为出入境的植物检疫检验提供科学的支持。本文首先分析了DNA条形码技术的特征,在检疫中的应用以及实际发展中存在的问题,并提... DNA生物技术的发展为DNA条形码技术的应用创造了条件,作为一项新技术,应用DNA片段来检查不同物种的类别,从而为出入境的植物检疫检验提供科学的支持。本文首先分析了DNA条形码技术的特征,在检疫中的应用以及实际发展中存在的问题,并提出了科学解决对策。 展开更多
关键词 出入境检疫 植物dna条形码技术 特征 应用 问题 对策
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植物DNA分子标记技术的研究和应用 被引量:14
16
作者 唐巍 欧阳藩 《大自然探索》 1998年第1期16-21,共6页
植物DNA分子标记技术的研究和应用中国科学院化工冶金研究所生化工程国家重点实验室博士后唐巍研究员欧阳藩当代生物学研究的一个重要领域是基因组分析,但是它的进展在很大程度上取决于DNA分子标记技术的进步和发展。自从Bos... 植物DNA分子标记技术的研究和应用中国科学院化工冶金研究所生化工程国家重点实验室博士后唐巍研究员欧阳藩当代生物学研究的一个重要领域是基因组分析,但是它的进展在很大程度上取决于DNA分子标记技术的进步和发展。自从Bostein和White等于1980年... 展开更多
关键词 植物dna 分子标记 dna分子标记 RFLP RAPD AFLP
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蜀本草多糖对植物DNA损伤的修复 被引量:1
17
作者 唐红枫 马自骋 +4 位作者 田梦婷 徐晨月 熊琦捷 程芬 孙茜 《科学技术与工程》 北大核心 2017年第21期212-216,共5页
研究蜀本草多糖对植物DNA损伤的修复作用,以蜀本草为原料,通过热水提法提取蜀本草多糖。经过浓缩、脱色、脱蛋白获得蜀本草多糖粗品。用不同浓度重金属溶液处理生长中的蚕豆幼苗,72 h后通过单细胞凝胶电泳检测蚕豆幼苗DNA损伤情况;采用... 研究蜀本草多糖对植物DNA损伤的修复作用,以蜀本草为原料,通过热水提法提取蜀本草多糖。经过浓缩、脱色、脱蛋白获得蜀本草多糖粗品。用不同浓度重金属溶液处理生长中的蚕豆幼苗,72 h后通过单细胞凝胶电泳检测蚕豆幼苗DNA损伤情况;采用不同浓度的蜀本草粗多糖溶液培养受损的蚕豆幼苗,检测其对蚕豆幼苗DNA损伤的修复作用。结果:20μmol CuSO_4对蚕豆幼苗叶片细胞诱导出了明显的DNA迁移。用蜀本草多糖溶液培养此浓度CuSO_4胁迫受损的蚕豆幼苗,其DNA受损情况得到一定改善,当蜀本草多糖浓度为200μmol时,彗星图像尾部明显缩短,修复效果明显。蜀本草多糖对植物DNA损伤修复存在一定的作用,但其作用的具体机制需要更进一步研究。 展开更多
关键词 蜀本草多糖 植物dna损伤 单细胞凝胶电泳 dna修复
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植物DNA条形码研究进展 被引量:4
18
作者 鲁松 《四川林业科技》 2012年第5期24-28,共5页
DNA条形码技术是利用标准的、具有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段在物种内的特异性和种间的多样性而创建的一种新的生物身份识别系统,从而实现对物种的快速自动鉴定。本文从植物DNA条形码的开发、应用、国内研究现状、植物DNA... DNA条形码技术是利用标准的、具有足够变异的、易扩增且相对较短的DNA片段在物种内的特异性和种间的多样性而创建的一种新的生物身份识别系统,从而实现对物种的快速自动鉴定。本文从植物DNA条形码的开发、应用、国内研究现状、植物DNA条形码面临的挑战以及发展前景等进行了综合分析,以期推动我国植物DNA条形码和分类学研究的发展。 展开更多
关键词 植物dna条形码 物种鉴定 研究现状
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一氧化氮诱导植物DNA反应机理的初步研究
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作者 罗进 叶能胜 +1 位作者 夏敏 谷学新 《分析化学》 SCIE EI CAS CSCD 北大核心 2009年第A03期324-324,共1页
一氧化氮(NO)在生物体内能对各种生物或非生物胁迫产生应答,能够调节植物生长发育,在植物抗病反应中起重要作用,NO与超氧离子(O2^-)迅速生成过氧亚硝酸根(ONOO^-),损伤机体组织,影响植物的生长。NO在植物体内所形成的ONOO^-... 一氧化氮(NO)在生物体内能对各种生物或非生物胁迫产生应答,能够调节植物生长发育,在植物抗病反应中起重要作用,NO与超氧离子(O2^-)迅速生成过氧亚硝酸根(ONOO^-),损伤机体组织,影响植物的生长。NO在植物体内所形成的ONOO^-能否与植物DNA反应,作用机理尚未明确。本实验选取植物细胞分裂素(6-异戊烯-腺嘌呤,植物DNA)与ONOO^-进行体外的化学模拟实验,旨为研究NO调控植物的生长发育作用提供科学的理论基础。 展开更多
关键词 植物dna 反应机理 一氧化氮 ONOO^- 植物生长发育 植物细胞分裂素 非生物胁迫 诱导
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一种快速、无毒的植物DNA微量抽提方法
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作者 朱作为 曹文广 陆维忠 《江苏农业学报》 CSCD 2002年第1期22-22,共1页
关键词 植物dna 微量dna 抽提方法
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