研究前期鉴定一个嵌合子标签——BCL2L2CR,含有B细胞淋巴瘤/白血病-2样蛋白2(B-cell CLL/lymphoma 2 like protein 2,BCL2L2)重复序列,为分析BCL2L2CR作用,利用RT-PCR方法克隆其cDNA序列,采用流式细胞术、过表达、CCK-8和细胞划痕试验...研究前期鉴定一个嵌合子标签——BCL2L2CR,含有B细胞淋巴瘤/白血病-2样蛋白2(B-cell CLL/lymphoma 2 like protein 2,BCL2L2)重复序列,为分析BCL2L2CR作用,利用RT-PCR方法克隆其cDNA序列,采用流式细胞术、过表达、CCK-8和细胞划痕试验等分子生物学技术分析其对细胞凋亡、增殖和迁移的影响。发现BCL2L2CR是BCL2L2外显子3部分序列发生顺式重复形成,前141个氨基酸与BCL2L2完全相同,含有BCL2同源结构域4、3和1,缺少同源结构域2;BCL2L2CR促进PK-15和3T3L细胞增殖和迁移。研究结果确定嵌合RNA BCL2L2CR具有一定功能,将为深入揭示BCL2L2CR功能提供基础,有助于进一步认识嵌合RNAs及其在正常生理活动中的作用。展开更多
嵌合RNAs是指由两个或两个以上独立基因(即亲本基因)融合产生的新RNAs。传统观点认为,嵌合RNAs都是染色体重排的结果。近年来研究发现,相邻基因间的顺式剪接(cis-splicing of adjacent genes,cis-SAGe)也是产生嵌合RNAs的重要机制之一。...嵌合RNAs是指由两个或两个以上独立基因(即亲本基因)融合产生的新RNAs。传统观点认为,嵌合RNAs都是染色体重排的结果。近年来研究发现,相邻基因间的顺式剪接(cis-splicing of adjacent genes,cis-SAGe)也是产生嵌合RNAs的重要机制之一。cis-SAGe是同一条染色体上位置相邻、转录方向相同的基因间发生转录通读,由此产生的初始转录本经过加工,形成了含有两个或多个亲本基因序列的嵌合RNAs。cis-SAGe最初是在肿瘤细胞中被鉴定出来,其在肿瘤发生中的潜在功能引起了研究者的广泛兴趣。随着研究的深入,人们发现cis-SAGe也广泛存在于正常组织中,可能是哺乳动物进化过程中产生新基因的一种重要机制。本文就cis-SAGe的剪接和表达特性、产生机制及其产物的功能等方面进行了综述,以期为人们全面了解cis-SAGe的研究概况及发展趋势提供参考。展开更多
文摘目的:前列腺癌(prostate cancer, PCa)是男性最常见的恶性肿瘤且具有明显的种族差异,亚洲人口的病死率最高。嵌合RNA是PCa转录组的重要组成部分,可通过多种分子机制参与肿瘤的发生与发展。本研究旨在系统解析中国人群PCa中嵌合RNA的表达模式并评估其诊疗价值。方法:在中国前列腺癌基因组与表观基因组图谱(Chinese Prostate Cancer Genome and Epigenome Atlas, CPGEA)中,我们共鉴定出101个癌与癌旁差异表达的嵌合RNA。通过计算癌组织与配对癌旁组织中嵌合RNA表达数量的差值(Δ嵌合RNA),分析其与患者预后的相关性。随后在流式分选分离的特定细胞亚群中,探究Δ嵌合RNA的细胞类型特异性。结合FOXA1基因突变状态及通路富集分析,深入探讨其潜在的生物学机制。结果:Δ嵌合RNA(癌组织嵌合体数量减去癌旁组织嵌合体数量)较高的患者预后较好,癌组织中Read-Through型嵌合RNA的Δ值显著高于非Read-Through型,提示肿瘤细胞可能更倾向于保留或产生Read-Through事件。此外,PSMA+上皮细胞相关Δ嵌合RNA与较低N分期及M1型巨噬细胞浸润呈正相关;CD14+巨噬细胞相关Δ嵌合RNA则与骨转移及M2型巨噬细胞浸润呈负相关。在FOXA1野生型(WT)患者中,高Δ嵌合RNA提示更好的预后及较低的PSA水平,而在FOXA1突变型(Mut)患者中该关联消失。通路富集分析表明,Δ嵌合RNA相关基因主要富集于神经形成、神经内分泌分化及类固醇激素合成等相关通路。结论:本研究揭示了Δ嵌合RNA是PCa组织中跨细胞类型的预后保护因素,其高值(尤其以Read-Through型)可能反映了肿瘤基因组稳定性。其抑癌作用可能依赖于完整的FOXA1功能,并通过抑制肿瘤转移、重塑免疫微环境及阻断神经内分泌分化等机制实现。该发现为中国人群PCa的预后评估及精准治疗提供了新的理论依据。
文摘研究前期鉴定一个嵌合子标签——BCL2L2CR,含有B细胞淋巴瘤/白血病-2样蛋白2(B-cell CLL/lymphoma 2 like protein 2,BCL2L2)重复序列,为分析BCL2L2CR作用,利用RT-PCR方法克隆其cDNA序列,采用流式细胞术、过表达、CCK-8和细胞划痕试验等分子生物学技术分析其对细胞凋亡、增殖和迁移的影响。发现BCL2L2CR是BCL2L2外显子3部分序列发生顺式重复形成,前141个氨基酸与BCL2L2完全相同,含有BCL2同源结构域4、3和1,缺少同源结构域2;BCL2L2CR促进PK-15和3T3L细胞增殖和迁移。研究结果确定嵌合RNA BCL2L2CR具有一定功能,将为深入揭示BCL2L2CR功能提供基础,有助于进一步认识嵌合RNAs及其在正常生理活动中的作用。
文摘嵌合RNAs是指由两个或两个以上独立基因(即亲本基因)融合产生的新RNAs。传统观点认为,嵌合RNAs都是染色体重排的结果。近年来研究发现,相邻基因间的顺式剪接(cis-splicing of adjacent genes,cis-SAGe)也是产生嵌合RNAs的重要机制之一。cis-SAGe是同一条染色体上位置相邻、转录方向相同的基因间发生转录通读,由此产生的初始转录本经过加工,形成了含有两个或多个亲本基因序列的嵌合RNAs。cis-SAGe最初是在肿瘤细胞中被鉴定出来,其在肿瘤发生中的潜在功能引起了研究者的广泛兴趣。随着研究的深入,人们发现cis-SAGe也广泛存在于正常组织中,可能是哺乳动物进化过程中产生新基因的一种重要机制。本文就cis-SAGe的剪接和表达特性、产生机制及其产物的功能等方面进行了综述,以期为人们全面了解cis-SAGe的研究概况及发展趋势提供参考。
