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基于网络药理学和分子对接技术分析二陈汤治疗肝癌作用机制
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作者 王业民 郑凯凯 +2 位作者 孙艳朝 张蔓莉 张志亮 《新中医》 2026年第3期143-151,共9页
目的:采用网络药理学和分子对接技术分析二陈汤治疗肝癌的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选二陈汤的活性成分,使用Swiss Target Prediction数据库获取活性成分相关靶点。在GeneCards、OMIM和DrugBank数据... 目的:采用网络药理学和分子对接技术分析二陈汤治疗肝癌的作用机制。方法:通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)筛选二陈汤的活性成分,使用Swiss Target Prediction数据库获取活性成分相关靶点。在GeneCards、OMIM和DrugBank数据库筛选肝癌的相关靶点。使用Venny 2.1.0获取二陈汤活性成分靶点与肝癌靶点的交集靶点。应用STRING数据库建立交集靶点蛋白质相互作用(PPI)网络图,采用Cytoscape 3.10.2软件建立核心靶点PPI网络图。采用Cytoscape 3.10.2软件构建“中药-活性成分-靶点”网络。对核心靶点进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。应用AutoDockTools 1.5.7软件进行活性成分和关键靶点的分子对接。结果:从二陈汤中获得130个活性成分及其潜在作用靶点966个。肝癌疾病筛选得到肝癌相关靶点1 020个。活性成分和疾病交集靶点225个,核心靶点53个。筛选得到二陈汤主要活性成分为槲皮素-3,3'-二甲醚、槲皮素、黄芩素、啤酒甾醇、5,7-二羟基-2-(3-羟基-4-甲氧基苯基)苯并二氢吡喃-4-酮(R-橙皮素)、6-甲基姜辣二醇双乙酸酯。筛选出核心靶点为信号传导和转录激活因子3(STAT3)、肉瘤病毒蛋白(SRC)、雌激素受体1(ESR1)、丝氨酸/苏氨酸激酶1(AKT1)、磷酸肌醇3-激酶调节亚基1(PIK3R1)、表皮生长因子受体(EGFR)、信号传导和转录激活因子1(STAT1)。GO富集分析显示核心靶点主要参与染色质重塑、凋亡过程负向调控等多个生物学过程。KEGG富集分析显示核心靶点主要参与癌症通路、EGFR酪氨酸激酶抑制剂耐药性等通路。分子对接结果显示关键靶点与二陈汤中主要活性成分结合稳定。结论:网络药理学分析结果显示,二陈汤可通过槲皮素-3,3'-二甲醚、槲皮素、黄芩素、啤酒甾醇、R-橙皮素、6-甲基姜辣二醇双乙酸酯等活性成分,作用于STAT3、SRC、ESR1、AKT1、PIK3R1、EGFR、STAT1等靶点,调控多种通路发挥治疗肝癌的作用。 展开更多
关键词 肝癌 二陈汤 网络药理学 分子对接 作用机制
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基于网络毒理学与分子对接技术探究黄曲霉毒素B1诱发肺癌的作用机制
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作者 李博 张轩斌 +4 位作者 金博 韩彬 王颖 崔勇俊 尹硕鑫 《医学理论与实践》 2026年第3期383-388,共6页
目的:通过网络毒理学的方法研究黄曲霉毒素B1(AFB1)诱发肺癌的作用机制。方法:通过ChEMBL、STITCH、SwissADME数据库获得AFB1的靶基因,GeneCards、OMIM和TTD数据库获得肺癌相关靶点;通过“VennDiagram”R包获得AFB1与肺癌的交集靶点并... 目的:通过网络毒理学的方法研究黄曲霉毒素B1(AFB1)诱发肺癌的作用机制。方法:通过ChEMBL、STITCH、SwissADME数据库获得AFB1的靶基因,GeneCards、OMIM和TTD数据库获得肺癌相关靶点;通过“VennDiagram”R包获得AFB1与肺癌的交集靶点并构建韦恩图。运用STRING数据库及Cytoscape构建蛋白互作网络图;R语言对交集基因进行GO和KEGG分析;最后利用CB-Dock2平台进行分子对接。结果:共筛选出AFB1相关靶点589个,疾病靶点4206个,通过韦恩图映射得到193个共同靶点,PPI结果显示SRC、AKT1、PIK3CA、PIK3CB、IL6可能是AFB1诱发肺癌的核心靶点。GO富集分析发现AFB1主要是通过参与腺体发育、转移酶活性的正向调控、细胞内受体信号通路等生物过程干预肺癌。KEGG信号通路排除广泛通路后主要富集于PI3K-AKT、MAPK、RAS等信号通路。分子对接结果显示AFB1与靶蛋白SRC、AKT1、PIK3CA、IL6均有较好的亲和力。结论:此研究不仅为理解AFB1诱发肺癌的分子机制提供了理论依据,还为进一步阐明相关作用机制奠定了基础。 展开更多
关键词 肺癌 黄曲霉毒素B1 网络毒理学 分子对接
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基于网络药理学、分子对接及动物实验验证探讨龟甲胶-鹿角胶药对治疗骨质疏松性骨折的作用机制
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作者 牛素生 杜梦凡 +4 位作者 刘俊宁 张燕 黄茂畅 胡斌涵 李润泽 《现代中西医结合杂志》 2026年第1期15-22,共8页
目的 基于网络药理学、分子对接及动物实验验证探讨龟甲胶-鹿角胶药对治疗骨质疏松性骨折(OPF)的物质基础及作用机制。方法 (1)检索文献及BATMAN-TCM、DrugBank、ETCM、化学专业数据库获取鹿角胶、龟板胶活性成分及靶标,运用GeneCards... 目的 基于网络药理学、分子对接及动物实验验证探讨龟甲胶-鹿角胶药对治疗骨质疏松性骨折(OPF)的物质基础及作用机制。方法 (1)检索文献及BATMAN-TCM、DrugBank、ETCM、化学专业数据库获取鹿角胶、龟板胶活性成分及靶标,运用GeneCards数据库筛选活性成分及靶标,通过STRING数据库构建治疗靶标间互作网络图,运用Metascape数据库对所得数据进行基因本体论(GO)生物功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析,并使用PubChem、PDB、OpenBabel、AutoDock Tool、Pymol工具对药物有效活性成分和疾病关键靶标进行分子对接分析。(2)取15只SD雌性大鼠,随机取5只作为假手术组,剩余10只大鼠行双侧卵巢切除建立骨质疏松模型。将术后3个月证实造模成功大鼠随机分为骨质疏松骨折组和龟甲胶-鹿角胶药对组,将原假手术组大鼠作为单纯骨折组。对3组大鼠行股骨骨折内固定术,术后龟甲胶-鹿角胶药对组按照2.7 mL/(kg·d)的剂量给予龟甲胶和鹿角胶溶液灌胃,单纯骨折组和骨质疏松骨折组给予等量生理盐水灌胃,均1次/d。持续灌胃8周后,检测血清中骨碱性磷酸酶(BALP)、抗酒石酸酸性磷酸酶(TRACP)水平。结果 (1)筛选龟甲胶和鹿角胶共同有效活性物质17个、靶标93个,得到OPF靶标2867个,这些靶标主要涉及化学突触传递的调控以及离子跨膜转运等生物学过程,并主要富集在TNF以及多巴胺突触等信号通路上;分子对接验证显示,大部分靶标与活性成分的结合度好。(2)龟甲胶-鹿角胶药对组血清BALP水平明显高于骨质疏松骨折组(P<0.05),血清TRACP水平明显低于骨质疏松骨折组(P<0.05)。实验验证表示龟甲胶-鹿角胶药对干预可以提高BALP水平,降低TRACP水平。结论 龟甲胶-鹿角胶药对可能通过调控TNF等信号转导途径促进成骨指标的表达、抑制破骨指标代谢而发挥促进OPF愈合的作用。 展开更多
关键词 网络药理学 分子对接 骨质疏松性骨折 龟甲胶 鹿角胶 成骨 破骨
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分子对接技术在蛋白质基包装材料中的应用研究进展
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作者 陈景华 王昌胜 +2 位作者 付婉莹 罗燚 石梦涵 《包装学报》 2026年第1期1-12,共12页
传统的蛋白质基包装材料优化方法在应对可持续包装需求时存在效率低、成本高的局限性。为应对这一挑战,研究人员引入分子对接技术。其凭借高效模拟蛋白质与功能性分子相互作用的能力来改善材料性能,为实验设计提供科学的理论依据。此外... 传统的蛋白质基包装材料优化方法在应对可持续包装需求时存在效率低、成本高的局限性。为应对这一挑战,研究人员引入分子对接技术。其凭借高效模拟蛋白质与功能性分子相互作用的能力来改善材料性能,为实验设计提供科学的理论依据。此外,模拟与实验验证相结合的方式,在提升蛋白质基包装材料的抗菌性、阻隔性和力学性能方面展现出显著优势。因此,综述分子对接技术在蛋白质基包装材料中的应用框架,系统总结其在明胶、大豆蛋白、玉米醇溶蛋白、麦醇溶蛋白及酪蛋白/乳清蛋白中的模拟分析与实验验证研究成果。未来的研究重点是,开发更高精度的预测模型、实现多尺度模拟以及深化模拟与实验的融合,以进一步推动蛋白质基包装材料的智能化开发和工业化应用。 展开更多
关键词 分子对接技术 蛋白质基包装材料 可食用薄膜 可持续包装
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供需精准对接、促高质量就业——面向粤港澳大湾区的智能网联汽车新职业技能培训实践与研究
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作者 张红伟 张杨 +2 位作者 高宏超 张霞峰 柳畅 《汽车维修技师》 2026年第2期64-66,共3页
本文以粤港澳大湾区为研究背景,研究了智能网联汽车产业发展现状及趋势,分析大湾区的产业优势、人才需求以及培训资源,提出了实现供需精准对接、高质量就业的智能网联汽车新职业技能培训策略,通过打造紧密结合市场需求赋能“金专业”的... 本文以粤港澳大湾区为研究背景,研究了智能网联汽车产业发展现状及趋势,分析大湾区的产业优势、人才需求以及培训资源,提出了实现供需精准对接、高质量就业的智能网联汽车新职业技能培训策略,通过打造紧密结合市场需求赋能“金专业”的培训内容、打造领先型“双师型”“金教师”队伍建设体系、打造企业级项目案例融入“金课程”“金教材”、打造基于“金基地”的培训质量评估体系等进行智能网联汽车新职业技能培训,促进大湾区智能网联汽车产业的快速发展和人才的高质量就业。 展开更多
关键词 供需精准对接 促进高质量就业 粤港澳大湾区 智能网联汽车 新职业技能培训
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基于网络药理学和分子对接探讨壮骨止痛胶囊治疗骨质疏松症的作用机制及实验验证
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作者 刘娜 杨昭杰 +4 位作者 闫张若平 申瑞芳 吴莹 张慧君 滕军燕 《颈腰痛杂志》 2026年第1期19-29,共11页
目的 采用超高效液相色谱-高分辨质谱(UPLC-HRMS)分析、网络药理学、分子对接技术探究壮骨止痛胶囊(ZGZTC)治疗骨质疏松症的潜在作用机制。方法 制备大鼠含药血清,通过细胞计数试剂剂盒(CCK8)法评估其对MC3T3-E1成骨细胞和RAW264.7破骨... 目的 采用超高效液相色谱-高分辨质谱(UPLC-HRMS)分析、网络药理学、分子对接技术探究壮骨止痛胶囊(ZGZTC)治疗骨质疏松症的潜在作用机制。方法 制备大鼠含药血清,通过细胞计数试剂剂盒(CCK8)法评估其对MC3T3-E1成骨细胞和RAW264.7破骨细胞增殖的影响。采用UPLC-HRMS结合TCMSP数据库系统表征复方ZGZTC化学成分。基于SwissTargetPrediction平台预测化合物靶点,整合GeneCards、OMIM、TTD、PharmGKB数据库获取骨质疏松靶标。通过Venny 2.1分析获取交集靶点后,开展蛋白相互作用(PPI)网络拓扑分析及GO/KEGG功能富集,并通过Cytoscape 3.10.0软件构建“药物-成分-靶点-疾病-通路”多维互作网络图。最后,进行分子对接和分子动力学模拟验证其结合的可能性并进行逆转录实时定量聚合酶链反应逆转录实时定量聚合酶链反应(RT-qPCR)检测。结果 ZGZTC含药血清对MC3T3-E1成骨前体细胞增殖有作用。ZGZTC中共鉴定出198个化合物,435个作用靶点;获得疾病相关靶点1 889个,成分与疾病交集靶点133个,其中核心靶点为肿瘤坏死因子(TNF)、原癌基因蛋白c-Src(SRC)、表皮生长因子受体(EGFR)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶AKT1和雌激素受体1,核心成分为黄芩素、山柰酚、矢车菊素、地奥司明和鞣花酸。富集分析表明,ZGZTC影响骨质疏松症主要通过血管内皮生长因子(VEGF)、缺氧诱导因子1(HIF-1)、Ras相关蛋白-1(Rap1)信号通路以及癌症通路。分子对接和分子动力学模拟结果表明结合良好。RT-qPCR检测结果显示基因TNF和SRC相对表达上调。结论 ZGZTC可能主要通过黄芩素、山柰酚、矢车菊素、地奥司明和鞣花酸等成分作用于靶基因TNF,介导VEGF/HIF-1/Rap1等信号通路发挥对骨质疏松症的治疗作用。 展开更多
关键词 壮骨止痛胶囊 骨质疏松症 超高效液相色谱-高分辨质谱分析 网络药理学 分子对接 分子动力学模拟
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基于网络药理学和分子对接技术探究鱼腥草防治肠炎的作用机制
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作者 陶文静 徐浩华 +6 位作者 樊启文 赵娜 黄静 陈芳 杜恩存 郭万正 魏金涛 《动物营养学报》 北大核心 2026年第1期693-705,共13页
本研究旨在利用网络药理学和分子对接技术探究鱼腥草防治肠炎的作用机制。通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和文献检索获得鱼腥草的活性成分,通过Swiss Target Prediction和GeneCards数据库获得鱼腥草活性成分靶点和肠炎靶点... 本研究旨在利用网络药理学和分子对接技术探究鱼腥草防治肠炎的作用机制。通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)和文献检索获得鱼腥草的活性成分,通过Swiss Target Prediction和GeneCards数据库获得鱼腥草活性成分靶点和肠炎靶点,并获取交集靶点。通过基因、蛋白质相互作用关系检索工具(STRING)数据库对交集靶点进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析,使用注释、可视化和综合发现数据库(DAVID)进行基因本体(GO)功能和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。利用Cytoscape 3.7.1软件构建鱼腥草活性成分-肠炎靶点-信号通路网络图,利用分子对接技术对活性成分和关键靶点进行对接验证。结果表明:鱼腥草的主要活性成分有异热马酮、山奈酚和槲皮素等9种,防治肠炎的作用靶点共90个,其中核心靶点为白细胞介素6(IL6)、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶1(AKT1)、肿瘤坏死因子(TNF)和表皮生长因子受体(EGFR)。GO功能富集条目473条,其中生物过程347条,细胞组分55条,分子功能71条;KEGG通路富集条目146条,主要涉及磷脂酰肌醇3-激酶(PI3K)-蛋白激酶B(AKT)和TNF信号通路等。分子对接结果显示,鱼腥草活性成分与核心靶点均能稳定结合,其中异热马酮与EGFR、山奈酚与TNF、槲皮素与TNF的结合能力较强。综上可知,鱼腥草含有的异热马酮、山奈酚和槲皮素等活性成分通过结合IL6、AKT1、TNF和EGFR等核心靶点,调控PI3K-AKT和TNF信号通路来防治肠炎,这为鱼腥草在畜禽生产中的应用提供了理论依据。 展开更多
关键词 鱼腥草 肠炎 网络药理学 分子对接
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基于广泛靶向代谢组学、网络药理学和分子对接研究牡蛎抗疲劳作用机制
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作者 王佳 任青兮 +2 位作者 刘双平 李美英 毛健 《食品工业科技》 北大核心 2026年第1期149-158,共10页
本研究综合运用广泛靶向代谢组学、网络药理学以及分子对接技术,探究牡蛎在抗疲劳方面的潜在作用机制,为牡蛎的科学应用提供坚实的理论基础和实验依据。采用超高效液相色谱-电喷雾-串联三重四级杆/线性离子阱质谱(UPLC-ESI-QTRAP-MS/MS... 本研究综合运用广泛靶向代谢组学、网络药理学以及分子对接技术,探究牡蛎在抗疲劳方面的潜在作用机制,为牡蛎的科学应用提供坚实的理论基础和实验依据。采用超高效液相色谱-电喷雾-串联三重四级杆/线性离子阱质谱(UPLC-ESI-QTRAP-MS/MS)系统,并结合数据库对牡蛎体外模拟消化产物进行广泛靶向代谢组学分析,获取牡蛎在消化过程中的成分转化信息。利用PubChem、Siwss Target Prediction、GeneCards等数据库及Cytoscape等软件对牡蛎活性成分进行抗疲劳的网络药理学分析,构建牡蛎“活性成分-作用靶点”网络。随后基于分子对接技术对核心靶点进行验证。共鉴定出牡蛎中17类1231种活性成分,识别出具有潜在抗疲劳的活性成分181个、交集靶点106个,主要包括1,5-戊二胺、色胺、4-叔辛基苯酚等,核心靶点包括雌激素受体1(Estrogen receptor 1,ESR1)、表皮生长因子受体(Epidermal growth factor receptor,EGFR)、过氧化物酶体增殖物激活受体-γ(Peroxisome proliferatoractivated receptor gamma,PPARG)等。信号通路富集分析显示,钙信号通路、神经活性配体-受体相互作用、PI3K/Akt信号通路等为牡蛎抗疲劳的关键信号通路。分子对接结果进一步验证了牡蛎关键活性成分与核心靶点的良好结合。牡蛎可能通过多成分、多靶点、多通路协同作用发挥抗疲劳效果。本研究为深入探讨牡蛎的有效成分及其分子作用机制提供了理论支撑,为牡蛎的进一步研究和应用奠定了坚实基础。 展开更多
关键词 牡蛎 抗疲劳 广泛靶向代谢组学 网路药理学 分子对接
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基于网络药理学、分子对接和细胞试验探究麻杏石甘汤对牛支原体感染的治疗机制
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作者 于斋卓 张亮 +4 位作者 陈九 乌志勇 朱阳东 闫滨 杨宏军 《中国畜牧兽医》 北大核心 2026年第2期995-1008,共14页
【目的】借助网络药理学、分子对接及细胞试验深入探究麻杏石甘汤对牛支原体感染的治疗机制,为传统中药的现代化提供科学依据,也为治疗牛支原体感染提供新的策略。【方法】以TCMSP、PubChem、SwissTargetPrediction等生物信息学平台为依... 【目的】借助网络药理学、分子对接及细胞试验深入探究麻杏石甘汤对牛支原体感染的治疗机制,为传统中药的现代化提供科学依据,也为治疗牛支原体感染提供新的策略。【方法】以TCMSP、PubChem、SwissTargetPrediction等生物信息学平台为依托,筛选出麻杏石甘汤各味药物活性成分及相关靶点;通过GeneCards、OMIM数据库获取牛支原体相关疾病的靶点;用STRING数据库构建蛋白-蛋白互作网络,借助Cytoscape 3.9.1软件进行网络拓扑分析,同时用DAVID平台进行GO功能与KEGG通路富集分析;运用PyMOL2.4.0和AutoDockTool 1.5.6软件完成分子对接与可视化。将MDBK细胞分为空白对照组、模型组及低、中、高剂量(2.5、5和10 mg/mL)麻杏石甘汤组,除空白对照组外,其余各组以感染复数为1000的牛支原体PG45感染4 h,清洗后分别更换为含药培养基或完全培养基,继续培养24 h,采用实时荧光定量PCR法检测各组细胞中的Ct值及相关炎症因子mRNA表达水平。【结果】网络药理学研究发现,麻杏石甘汤含有134个活性成分,牛支原体相关疾病靶点93个,二者的交集靶点共20个,其中白细胞介素-6(IL-6)、肿瘤坏死因子-α(TNF-α)、基质金属蛋白酶9(MMP9)、半胱天冬酶3(CASP3)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)等为关键核心靶点。GO功能富集分析主要涉及RNA聚合酶Ⅱ对转录的正向调控、细胞外空间、细胞质、细胞核、细胞因子活性等;KEGG通路富集分析主要涵盖IL-17、TNF、丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)等相关信号通路。分子对接结果表明,麻杏石甘汤的活性成分与关键核心靶点的结合能均<-17.8 kJ/mol,具有良好的结合能力。其中,槲皮素与CASP3结合能最小,为-28.87 kJ/mol。细胞试验结果显示,与模型组相比,各剂量麻杏石甘汤组Ct值均显著升高(P<0.05),显著升高了IL-2、IL-10基因表达量(P<0.05),降低了IL-6、IL-8、TNF-α、IL-17A、CASP3、MMP9、PTGS2基因表达量(P<0.05)。【结论】本研究通过网络药理学预测及细胞试验验证揭示了麻杏石甘汤通过作用于IL-6、TNF、MMP9等靶点,调控炎症因子的分泌,抑制炎症反应,从而发挥抗牛支原体感染作用。 展开更多
关键词 麻杏石甘汤 牛支原体 网络药理学 分子对接
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基于网络药理学与分子对接探究北柴胡叶提取物抗APAP肝损伤作用
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作者 李亮 王萌 +5 位作者 王卉 张思怡 张建辉 刘慧敏 张志勇 王桂荣 《核农学报》 北大核心 2026年第2期290-302,共13页
为探究北柴胡叶提取物(BCLE)抗对乙酰氨基酚(APAP)肝损伤的作用,采用液相-质谱法(LC-MS)、网络药理学、分子对接,并建立小鼠模型研究BCLE治疗效果及抗APAP肝损伤作用机制。网络药理学结果表明,BCLE活性成分有19种,BCLE与DILI公共靶点244... 为探究北柴胡叶提取物(BCLE)抗对乙酰氨基酚(APAP)肝损伤的作用,采用液相-质谱法(LC-MS)、网络药理学、分子对接,并建立小鼠模型研究BCLE治疗效果及抗APAP肝损伤作用机制。网络药理学结果表明,BCLE活性成分有19种,BCLE与DILI公共靶点244个,核心靶点44个,且活性成分与脂酰肌醇3-激酶(PI3K)、蛋白激酶B(AKT)信号通路相关性较高,分子对接显示活性成分与通路之间亦有良好的亲和力。动物试验结果表明,BCLE对APAP肝损伤有良好的治疗效果,可显著降低APAP模型组小鼠血清中谷丙转氨酶(ALT)和谷草转氨酶(AST)活力,缓解肝细胞损伤,减轻N-乙酰基-P-苯醌亚胺(NAPQI)的聚积,升高还原型谷胱甘肽(GSH)含量和超氧化物歧化酶(SOD)活性,降低丙二醛(MDA)和过氧化氢(H_(2)O_(2))含量,并显著上调APAP肝损伤小鼠磷酸化脂酰肌醇3-激酶(p-PI3K)、磷酸化蛋白激酶B(p-AKT)蛋白表达。综上,网络药理学与分子对接预测BCLE通过PI3K-AKT通路作用于APAP肝损伤,体内试验表明,BCLE可通过保护肝细胞,缓解氧化应激,上调PI3K-AKT通路抗APAP肝损伤。研究结果可为进一步提升北柴胡的药用价值,研发抗APAP肝损伤新型药物提供理论思路和试验依据。 展开更多
关键词 北柴胡叶提取物 对乙酰氨基酚肝损伤 网络药理学 分子对接
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基于嗅觉受体互作和分子对接探究佛手增香作用机制
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作者 侯梦 曹凡 +3 位作者 秦宇 周建成 廖惠云 李乃旭 《食品科学》 北大核心 2026年第2期58-65,共8页
为探究天然提取物增香的作用机制,采用气相色谱-质谱(gas chromatography-mass spectrometry,GCMS)技术分别对佛手3种提取物(精油、醇提浸膏和水提浸膏)进行非靶向鉴定分析,结合网络互作分析与分子对接验证,考察其关键香味组分与嗅觉受... 为探究天然提取物增香的作用机制,采用气相色谱-质谱(gas chromatography-mass spectrometry,GCMS)技术分别对佛手3种提取物(精油、醇提浸膏和水提浸膏)进行非靶向鉴定分析,结合网络互作分析与分子对接验证,考察其关键香味组分与嗅觉受体相互作用影响。结果表明:精油、醇提浸膏和水提浸膏分别鉴定出94、85种和86种化合物,其中精油与醇提浸膏、精油与水提浸膏和醇提浸膏与水提浸膏之间分别共有15、13种和40种化合物,3种提取物之间共有9种化合物;通过ODORactor、M2OR等数据库获取香气物质与嗅觉受体的交集靶点202个,经蛋白互作网络拓扑分析筛选出OR2C1、OR2L13、OR11H4等9个核心靶点,构建了“成分-交集靶点-嗅觉受体”网络,筛选出乙酸香叶酯、百里香酚等10个核心香味活性成分;分子对接结果显示乙酸香叶酯、百里香酚等成分与嗅觉受体呈现自发结合特性,并通过氢键和疏水作用形成稳定的构象。本研究从分子层面探究佛手增香的作用机制,可为天然香料开发提供理论依据和技术支持。 展开更多
关键词 佛手 提取物 香味成分 嗅觉受体 网络互作 分子对接
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Q460高强钢管环形对接焊缝残余应力分析
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作者 王世杰 郭琪 +2 位作者 闫月勤 张凤仙 李海旺 《太原理工大学学报》 北大核心 2026年第1期143-150,共8页
【目的】焊接残余应力会降低结构的疲劳强度、稳定性和刚度,其大小和分布直接影响结构的服役状态;高强钢屈强比大、强度储备低,在焊接残余应力的影响下,面临更加严峻的安全挑战。【方法】本文基于试验验证了双椭球热源方法分析Q460高强... 【目的】焊接残余应力会降低结构的疲劳强度、稳定性和刚度,其大小和分布直接影响结构的服役状态;高强钢屈强比大、强度储备低,在焊接残余应力的影响下,面临更加严峻的安全挑战。【方法】本文基于试验验证了双椭球热源方法分析Q460高强钢对接焊缝残余应力的可行性和准确性,在此基础上,参数化分析了曲率(k)、壁厚(t)以及径厚比(d/t)等设计参数对Q460弯曲钢管焊接残余应力峰值和分布的影响规律。【结果】结果表明,在环向应力方面,残余拉应力峰值随曲率、径厚比和壁厚线性增大;在轴向应力方面,残余拉应力峰值随壁厚和曲率增大,随径厚比减小。钢管曲率k还引起了轴向残余拉应力次峰值的出现,次峰值的出现扩大了残余应力的影响范围,导致焊接热影响区范围扩大了约50%。建议大直径管件应用时曲率控制在1/20000以内,壁厚宜小于25 mm。 展开更多
关键词 Q460高强钢 环形对接焊缝 残余应力 曲率
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基于网络药理学、转录组学及分子对接探讨四君子汤抗动脉粥样硬化的作用机制
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作者 隋玥含 何会 +2 位作者 罗涛红 战丽彬 王莹 《世界科学技术-中医药现代化》 北大核心 2026年第2期348-363,共16页
目的 基于网络药理学、转录组学及分子对接探讨四君子汤抗动脉粥样硬化(Atherosclerosis,AS)的作用靶点及分子机制。方法 借助TCMSP等数据库挖掘四君子汤活性成分及动脉粥样硬化靶点。构建“药物-成分-靶点-疾病”网络和蛋白质–蛋白质... 目的 基于网络药理学、转录组学及分子对接探讨四君子汤抗动脉粥样硬化(Atherosclerosis,AS)的作用靶点及分子机制。方法 借助TCMSP等数据库挖掘四君子汤活性成分及动脉粥样硬化靶点。构建“药物-成分-靶点-疾病”网络和蛋白质–蛋白质相互作用(Proteinprotein interaction,PPI)网络,进行基因本体(Gene ontology,GO)功能及京都基因和基因组数据库(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路富集分析。对小鼠主动脉进行转录组学测序,筛选差异表达基因(Differential gene expression,DEG);与网络药理学进行联合分析并进行分子对接。采用全自动生物化学分析仪检测甘油三酯(Triglyceride,TG)、总胆固醇(Total cholesterol,TC)、高密度脂蛋白胆固醇(High-density lipoprotein cholesterol,HDL-C)、低密度脂蛋白胆固醇(Low-density lipoprotein cholesterol,LDL-C)含量;苏木精-伊红(Hematoxylin and eosin,HE)染色和油红O染色观察主动脉病理变化情况;采用实时定量逆转录聚合酶链反应(Quantitative reverse transcription polymerase chain reaction,qRT-PCR)、蛋白质印迹法(Western blotting)法验证表皮生长因子(Epidermal growth factor,EGF)、OLR1、分泌型磷蛋白1(Secretory phosphoprotein 1,SPP1)的基因及蛋白表达水平;采用酶联免疫吸附测定(Enzyme-linked immunosorbent assaynzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)检测血清丙二醛(Malondiadehyde,MDA)、超氧化物歧化酶(Superoxide dismutase,SOD)含量。结果 网络药理学筛选出四君子汤核心活性成分(槲皮素、山柰酚等)和核心靶点(AKT1、IL-6等),作用机制可能与PI3K-Akt、MAPK等信号通路相关。转录组学分析发现动脉粥样硬化模型组存在339个DEGs,四君子汤干预能有效逆转其基因的表达。联合分析确定核心靶点为EGF、OLR1和SPP1。分子对接表明,山柰酚、槲皮素等与上述靶点具有良好亲和力。动物实验证实,与正常组相比,动脉粥样硬化模型组小鼠血清TC、TG和LDL-C水平升高(P<0.01),HDL-C水平降低(P<0.01),主动脉斑块面积和脂质沉积显著增加,氧化应激MDA水平升高,SOD水平显著降低(P<0.01),且EGF、OLR1、SPP1的mRNA和蛋白表达均显著上调(P<0.01)。经四君子汤治疗后,上述指标均得到显著改善。结论 四君子汤可能通过山柰酚、槲皮素和柚皮素等活性成分作用于OLR1、SPP1和EGF等核心靶点,调节脂质代谢,抑制氧化应激,从而发挥抗动脉粥样硬化作用。 展开更多
关键词 网络药理学 转录组学 分子对接 四君子汤 动脉粥样硬化
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基于网络药理学和分子对接技术探讨从“少阳主枢”论治偏头痛的机制
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作者 陈琛 任毅 +5 位作者 杨杨 袁海宁 王娣 陈沛 郭雨萌 邹忆怀 《西部中医药》 2026年第2期49-55,共7页
目的:从“少阳主枢”理论出发,通过网络药理学和分子对接技术探讨小柴胡汤治疗偏头痛的作用机制。方法:通过(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)数据库获取小柴胡汤有效药物成... 目的:从“少阳主枢”理论出发,通过网络药理学和分子对接技术探讨小柴胡汤治疗偏头痛的作用机制。方法:通过(traditional Chinese medicine systems pharmacology database and analysis platform,TCMSP)数据库获取小柴胡汤有效药物成分及相关靶点;利用在线人类孟德尔遗传数据库(online mendelian inheritance in man,OMIM)、人类基因数据库(the human gene database,GeneCards)获取偏头痛疾病的相关靶点;绘制韦恩图得到小柴胡汤治疗偏头痛的潜在作用靶点;采用STRING数据库、Cytoscape 3.9.1软件构建“药物-成分-疾病-靶点”网络、蛋白-蛋白互作(protein-protein interactions,PPI)网络;使用核心靶基因导入基因功能注释数据库(the database for annotation visualization and integrated discovery,DAVID)对潜在作用靶点进行基因本体论(gene ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(kyoto encyclopedia of genes and genomes,KEGG)富集分析;运用Autodock软件进行分子对接并用Py-Mol软件进行绘图展示。结果:共获得小柴胡汤有效药物成分214个;小柴胡汤治疗偏头痛的潜在作用靶点148个;使用Cytoscape 3.9.1拓扑分析得到槲皮素、豆甾醇、β-谷甾醇等10个关键成分,PPI网络得到TNF、JUN、AKT1等5个核心靶点;GO功能富集分析得到条目810条,包括生物过程604条,细胞组分73条,分子功能133条;KEGG通路富集分析得到172条信号通路,主要包括脂质与动脉粥样硬化、IL-17、TNF等信号通路;分子对接结果显示关键成分与核心靶点有较好的结合能力。结论:小柴胡汤通过调节IL-17、TNF等信号通路,作用于TNF、JUN、AKT1等核心靶点,以调节大脑炎症反应为核心,对偏头痛发挥治疗作用。 展开更多
关键词 偏头痛 少阳主枢 网络药理学 分子对接 作用机制
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基于网络药理学与分子对接探讨金芪清疏颗粒治疗慢性阻塞性肺疾病稳定期的作用机制
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作者 陆曦 许玲 +4 位作者 马明华 张尔 季思勤 年华 王振伟 《河南中医》 2026年第1期93-100,共8页
目的:探讨金芪清疏颗粒治疗慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)稳定期的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台筛选金芪清疏颗粒组方中药的活性成分。利用SwissTargetPrediction数据库获取活... 目的:探讨金芪清疏颗粒治疗慢性阻塞性肺疾病(chronic obstructive pulmonary disease,COPD)稳定期的作用机制。方法:利用中药系统药理学数据库与分析平台筛选金芪清疏颗粒组方中药的活性成分。利用SwissTargetPrediction数据库获取活性成分相关靶点。从在线人类孟德尔遗传数据库与GeneCards数据库检索COPD稳定期的相关靶点。将金芪清疏颗粒活性成分的预测靶点与COPD稳定期相关靶点取交集,获得金芪清疏颗粒治疗COPD稳定期的潜在靶点。利用String平台构建潜在靶点的蛋白质-蛋白质相互作用(protein-protein interaction,PPI)网络,拓扑分析筛选关键靶点,并进行可视化分析。将关键靶点导入DAVID平台进行基因本体论(Gene Ontology,GO)和京都基因与基因组百科全书(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)信号通路富集分析。采用AutoDock Vina进行分子对接。结果:获得金芪清疏颗粒211个活性成分,相关靶点1077个。“药物-活性成分-靶点”网络分析表明,金芪清疏颗粒度值排名前3位的活性成分为槲皮素、山柰酚、木犀草素。COPD稳定期相关靶点914个,与金芪清疏颗粒的1077个活性成分作用靶点取交集,得到230个潜在靶点。PPI网络分析得出前3位靶点依次为甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)、白细胞介素-6(interleukin-6,IL-6)、蛋白激酶B1(protein kinase B1,PKB1,又称AKT1)。GO分析得到生物过程339个,细胞组分31个,分子功能44个。KEGG富集分析得到136条信号通路,主要涉及癌症通路、脂质与动脉粥样硬化、糖尿病并发症AGE-RAGE信号通路等。分子对接表明:活性成分与核心靶点之间具有较好的结合能力。结论:金芪清疏颗粒主要通过槲皮素、山柰酚、木犀草素等活性成分,作用于GAPDH、IL-6等关键潜在靶点,调控脂质与动脉粥样硬化通路、癌症通路等发挥对COPD稳定期的治疗作用。 展开更多
关键词 慢性阻塞性肺疾病 金芪清疏颗粒 网络药理学 分子对接
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基于网络药理学和分子对接预测槲皮素缓解肉鸡氧化应激的作用机制
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作者 孔令联 宋志刚 《中国家禽》 北大核心 2026年第1期45-52,共8页
研究旨在利用网络药理学和分子对接技术,探究槲皮素调控肉鸡氧化应激的作用机制。研究通过在中药系统药理学(TCMSP)、SwissTargetPrediction、GeneCards和在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库中分别检索槲皮素和氧化应激相关靶点,对两者交... 研究旨在利用网络药理学和分子对接技术,探究槲皮素调控肉鸡氧化应激的作用机制。研究通过在中药系统药理学(TCMSP)、SwissTargetPrediction、GeneCards和在线人类孟德尔遗传(OMIM)数据库中分别检索槲皮素和氧化应激相关靶点,对两者交集靶点进行蛋白质互作分析、基因本体(GO)和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析。结果显示:共获得槲皮素作用靶点57个,氧化应激相关靶点3 865个,经交集分析得到交集靶点50个,其中B淋巴细胞瘤-2(BCL-2)、非受体酪氨酸激酶(SRC)、细胞周期蛋白D1(CCND1)、缺氧诱导因子1α(HIF1A)、转化生长因子β1(TGFB1)、表皮生长因子受体(EGFR)、血红素加氧酶1(HMOX1)、白细胞介素-6(IL-6)、骨髓细胞瘤癌基因(MYC)和BCL2样1(BCL2L1)是槲皮素缓解肉鸡氧化应激的核心靶点,槲皮素与上述核心靶点均可稳定结合;槲皮素主要影响内负向调节内在凋亡信号通路、细胞因子活性和对氧化应激的反应等过程,涉及24条信号通路,包括丝裂原活化蛋白激酶(MAPK)、C型凝集素受体、叉头盒转录因子O(FoxO)、细胞凋亡和核苷酸寡聚化结构域(NOD)样受体等。研究提示:槲皮素可能通过影响BCL-2、SRC、CCND1、HIF1A、TGFB1、EGFR、HMOX1、IL-6、MYC和BCL2L1等靶点,调控MAPK、C型凝集素受体、FoxO、细胞凋亡和NOD样受体等信号通路,进而缓解肉鸡氧化应激。 展开更多
关键词 氧化应激 槲皮素 网络药理学 分子对接 肉鸡
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基于分子对接技术筛选大菱鲆ACE抑制肽的研究
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作者 简恒源 赵彦钦 +10 位作者 陆佳伟 李燕苹 张瑶 张斌成 孔菲 王晓彤 代姣南 卢航 田元勇 鲁雪峰 赵慧 《农产品加工》 2026年第4期19-24,共6页
选择性筛选大菱鲆ACE抑制肽,利用生物信息学方法,以大菱鲆肌肉蛋白(ID:A0A8D3A461)为研究对象,在碱性蛋白酶(Subtilisin,EC 3.4.21.62)最适条件下对大菱鲆肌肉蛋白进行虚拟酶解,筛选具有ACE抑制活性的肽,并对其水溶性、毒性、等电点、... 选择性筛选大菱鲆ACE抑制肽,利用生物信息学方法,以大菱鲆肌肉蛋白(ID:A0A8D3A461)为研究对象,在碱性蛋白酶(Subtilisin,EC 3.4.21.62)最适条件下对大菱鲆肌肉蛋白进行虚拟酶解,筛选具有ACE抑制活性的肽,并对其水溶性、毒性、等电点、分子量及三维结构进行预测分析。虚拟酶解得到的肽段与ACE分子进行半柔性对接,筛选ACE抑制肽,选取其中3条潜在高活性ACE抑制肽(Arg-Phe,Arg-Phe,Gly-Trp),通过分子对接分析发现,上述活性肽与关键氨基酸(ARG522、GLU411)之间能够形成范德华力、电荷相互作用力、Pi-Pi键、盐桥等作用力,并可通过作用于Zn2+,改变ACE分子结构,进而通过竞争性ACE抑制作用达到降低血压的效果。虚拟筛选出的Arg-Phe和Arg-Phe能够显著降低SHR的收缩压,说明ACE抑制肽Arg-Phe和Arg-Phe具有降血压活性。研究结果证明了计算机模拟技术应用于活性肽研发的可行性,为研发具有ACE抑制活性的食源性降血压活性成分提供了新思路。 展开更多
关键词 食源性ACE抑制肽 大菱鲆 分子对接 活性肽 降血压
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基于网络药理学与分子对接研究导痰汤治疗高血压的作用机制
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作者 龙远雄 房赤 +1 位作者 李苏 雍苏南 《中国临床新医学》 2026年第2期190-195,共6页
目的 基于网络药理学与分子对接研究导痰汤治疗高血压的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)数据库和Gene Cards数据库,获取导痰汤的活性成分、潜在作用靶点以及高血压靶点,取导痰汤潜在作用靶点与高血压靶点的交... 目的 基于网络药理学与分子对接研究导痰汤治疗高血压的作用机制。方法 通过中药系统药理学数据库分析平台(TCMSP)数据库和Gene Cards数据库,获取导痰汤的活性成分、潜在作用靶点以及高血压靶点,取导痰汤潜在作用靶点与高血压靶点的交集进行分析。构建导痰汤活性成分-高血压靶点相互作用网络和蛋白互作(PPI)网络,筛选主要活性成分和核心作用靶点。通过基因本体(GO)功能分析和京都基因与基因组百科全书(KEGG)通路富集分析探讨导痰汤治疗高血压的潜在作用机制。通过分子对接方法分析主要活性成分与核心靶点的结合能力。结果 导痰汤作用靶点与高血压靶点的交集靶点共110个。导痰汤活性成分-高血压靶点的相互作用网络提取到度值(degree)≥20的活性成分共15个。110个交集靶点中参与PPI有109个,度值、介数、中心度均超过平均值的作用靶点有26个,推测为导痰汤治疗高血压的核心靶点。GO功能分析结果显示,从110个交集靶点获得146个富集结果(P<0.05),其中包括89个生物过程(BP)、42个分子功能(MF)和15个细胞组分(CC)。KEGG通路富集分析共鉴定出95条相关信号通路(P<0.05)。分子对接结果显示,β-谷甾醇、卡维丁、豆甾醇、木犀草素与肿瘤坏死因子(TNF)、白细胞介素-6(IL-6)、前列腺素内过氧化物合酶2(PTGS2)、雌激素受体1(ESR1)的结合能均低于0 kcal/mol。结论 导痰汤治疗高血压具有多成分、多靶点、多通路协同作用的特点。 展开更多
关键词 网络药理学 分子对接 导痰汤 高血压
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整合网络药理学与分子对接筛选丹参-黄芪-金银花复方抗牛乳腺炎的活性成分及潜在作用靶点分析
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作者 王云杰 冯永娥 《中国农业大学学报》 北大核心 2026年第1期127-135,共9页
为探索牛乳腺炎防治新策略,本研究整合网络药理学与分子对接技术,系统解析了丹参-黄芪-金银花中药复方抗牛乳腺炎的活性成分及潜在作用靶点。结果表明:1)通过TCMSP数据库筛选丹参、黄芪和金银花三味中药的活性成分,设定类药性(DL≥0.18... 为探索牛乳腺炎防治新策略,本研究整合网络药理学与分子对接技术,系统解析了丹参-黄芪-金银花中药复方抗牛乳腺炎的活性成分及潜在作用靶点。结果表明:1)通过TCMSP数据库筛选丹参、黄芪和金银花三味中药的活性成分,设定类药性(DL≥0.18)和口服生物利用度(OB≥30%)为筛选标准,共获得88个活性成分及其222个作用靶点,结合GeneCards数据库获取的177个参与乳腺炎疾病相关宿主靶基因,经Venny 2.1平台进行靶点交集筛选,获得24个共同作用靶点。2)基于STRING数据库构建的蛋白互作网络揭示TNF、IL-6和IL-1β等关键核心靶点,并通过Cytoscape软件构建多维度“药物-成分-靶点”网络。GO和KEGG功能富集分析表明,这些靶点显著参与炎症反应调控、免疫应答激活等过程;结合GSE15020数据集差异表达分析,筛选出7个具有显著表达差异的核心靶点。3)分子对接验证显示木犀草素、槲皮素等活性成分与ICAM1、EGFR等靶点具有稳定的自发结合特性(结合能<−7 kcal/mol)。本研究从系统生物学角度揭示该复方通过多成分-多靶点-多通路协同作用调控牛乳腺炎症的分子机制,为开发新型抗牛乳腺炎中药制剂提供了理论依据和创新策略,有望通过多靶点干预减少抗生素依赖,推动牛养殖业的可持续发展。 展开更多
关键词 网络药理学 中药复方 牛乳腺炎 分子对接 靶基因
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基于网络药理学和分子对接技术分析马齿苋对奶牛乳腺炎的抗炎机制
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作者 丁涛 苗宇航 +4 位作者 辛杰 马文妍 浮怀琳 胡菊梅 杜军 《畜牧兽医学报》 北大核心 2026年第1期500-512,共13页
基于网络药理学、分子对接技术挖掘马齿苋主要活性成分抑制奶牛乳腺炎的关键靶点,体外细胞试验验证其可能的作用机制。利用TCMSP数据库检索马齿苋的活性成分及对应靶点,使用GeneCards数据库和OMIM数据库检索奶牛乳房炎的疾病靶点,并于... 基于网络药理学、分子对接技术挖掘马齿苋主要活性成分抑制奶牛乳腺炎的关键靶点,体外细胞试验验证其可能的作用机制。利用TCMSP数据库检索马齿苋的活性成分及对应靶点,使用GeneCards数据库和OMIM数据库检索奶牛乳房炎的疾病靶点,并于马齿苋活性成分靶点进行交集整合,并构建PPI网络。DAVID数据库进行GO功能富集分析和KEGG通路富集分析,AutoDock软件进行分子对接验证。最后,CCK-8法测定马齿苋提取物对奶牛乳腺上皮细胞的影响,LPS诱导MAC-T构建体外炎症模型,RT-qPCR检测关键靶点、IL-17信号通路以及炎症相关因子表达情况。结果显示:共筛选到马齿苋10种活性成分及188个对应靶点,从GeneCards和OMIM数据库中筛选出2495个奶牛乳腺炎的相关靶点,通过Venn平台共找到40个共表达靶点。通过PPI网络得到ALB、TNF、IL6、IL1B、MMP9等10个关键靶点,涉及AGE-RAGE、脂质和动脉粥样硬化、癌症、IL-17、PI3K-AKT等信号通路。体外细胞试验表明,马齿苋能够增加MAC-T中ALB的含量,并提供IL-17信号通路下调炎症因子MMP9、TNF-α、IL-6、IL-1β、IL-8、IFN-γ基因的转录,上调抑炎因子IL-10基因的转录。本研究揭示了马齿苋中能够通过抑制IL-17信号通路来抑制炎症因子的释放,从而抑制奶牛乳腺炎症反应。 展开更多
关键词 网络药理学 马齿苋 分子对接 奶牛乳腺炎
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