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基于毛细管电泳技术的克劳按蚊、迷糊按蚊和棋斑按蚊三重PCR方法鉴定
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作者 陶莉 聂国嫒 +6 位作者 张荣 苏小建 杨国平 耿合员 贺骥 谭伟龙 杨庆贵 《中国热带医学》 北大核心 2025年第8期1037-1041,共5页
目的建立一种能同时、准确、快速鉴定克劳按蚊、迷糊按蚊和棋斑按蚊3种按蚊的三重PCR鉴定方法。方法采用通用的DNA提取方法获取带足按蚊、雷氏按蚊、须喙按蚊、美彩按蚊、多斑按蚊、乌头按蚊、克劳按蚊、迷糊按蚊、棋斑按蚊的基因组DNA... 目的建立一种能同时、准确、快速鉴定克劳按蚊、迷糊按蚊和棋斑按蚊3种按蚊的三重PCR鉴定方法。方法采用通用的DNA提取方法获取带足按蚊、雷氏按蚊、须喙按蚊、美彩按蚊、多斑按蚊、乌头按蚊、克劳按蚊、迷糊按蚊、棋斑按蚊的基因组DNA,并测定其浓度。以克劳按蚊、迷糊按蚊和棋斑按蚊的线粒体COI基因为靶基因,其他6种蚊种作为对照,依据引物设计原则,设计出能特异性扩增3种按蚊的引物,并委托专业机构合成。以提取的按蚊DNA为模板,先进行单重PCR验证引物的特异性。在此基础上,对三重PCR反应体系中的引物浓度、dNTP浓度、Taq酶用量等进行优化,将优化后的PCR产物按照毛细管电泳实验流程上样,观察并记录检测结果。将克劳按蚊、迷糊按蚊和棋斑按蚊的模板DNA 10倍梯度稀释,稀释浓度从10 ng/μL~10^(-6) ng/μL。然后,进行三重PCR灵敏性检测。结果克劳按蚊、迷糊按蚊、棋斑按蚊的引物浓度相同,在退火温度58℃时特异性均很好,可分别扩增出118、187、307 bp的特异性条带,其他蚊种及空白对照无条带。克劳按蚊、迷糊按蚊、棋斑按蚊检测下限浓度均为10^(-4) ng/μL。结论该方法可同时、准确、快速地鉴定克劳按蚊、迷糊按蚊、棋斑按蚊样本,并适用于残缺、非成虫期等形态特征不完全的样本的鉴定,为蚊虫监测和疾病防控提供了一种可靠的技术手段。 展开更多
关键词 克劳按蚊 迷糊按蚊 棋斑按蚊 毛细管电泳 COI基因 三重pcr
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口蹄疫病毒O型、A型和AsiaⅠ型三重实时荧光定量RT-PCR检测方法的建立及初步应用
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作者 王翠 赵雪丽 +7 位作者 王东方 王淑娟 马震原 杨海波 刘影 柴茂 谢彩华 闫若潜 《中国动物传染病学报》 北大核心 2025年第2期61-69,共9页
为建立口蹄疫病毒(FMDV)O型、A型和AsiaⅠ型三重实时荧光定量RT-PCR检测方法,本研究在比对多条FMDV基因的基础上,根据2B基因的最优保守区,设计O型、A型和Asia I型FMDV通用的反转录引物;再根据VP1基因的比对结果,以变异区为扩增靶区域,设... 为建立口蹄疫病毒(FMDV)O型、A型和AsiaⅠ型三重实时荧光定量RT-PCR检测方法,本研究在比对多条FMDV基因的基础上,根据2B基因的最优保守区,设计O型、A型和Asia I型FMDV通用的反转录引物;再根据VP1基因的比对结果,以变异区为扩增靶区域,设计3对分别针对O型、A型和AsiaⅠ型FMDV的特异性引物和TaqMan MGB探针。经优化反应体系和扩增程序等反应条件,建立基于探针技术的FDMV三重实时荧光定量RT-PCR检测方法。验证该方法的特异性、敏感性和重复性,对15份临床疑似FMDV感染样品进行检测,并与基因测序方法及RT-PCR方法进行比较分析。结果显示:本研究成功建立了FMDV三重FQ-PCR方法,实现了一步法对FMDV O型、A型和AsiaⅠ型病原样品的鉴别检测。该方法可特异性扩增FMDV O型、A型和AsiaⅠ型标准株细胞培养物,但对猪水疱性口炎病毒(VSV)等7种病原及阴性对照未出现扩增,特异性较强;对FMDV O型、A型和AsiaⅠ型阳性重组质粒标准品的最低检出限均可达到10拷贝/μL,敏感性较高;批内/批间试验变异系数为0.48%~1.55%,重复性较好;利用建立的三重FQ-PCR方法对15份临床疑似FMDV感染样品进行检测,检测结果与基因测序结果完全一致,优于RT-PCR方法。本研究建立的三重FQ-PCR方法具有敏感性高、特异性强,在同一反应体系中能同时鉴别检测出FMDV O型、A型和AsiaⅠ型等优点,能满足临床鉴别检测的需求。 展开更多
关键词 口蹄疫病毒 三重实时荧光定量RT-pcr 应用
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猪非典型瘟病毒、经典猪瘟病毒、日本乙型脑炎病毒的三重荧光定量PCR检测方法的建立与应用 被引量:2
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作者 许浩文 陈军光 +6 位作者 马琼琼 潘杏明 郭美君 朱伟群 周莹珊 董婉玉 王晓杜 《中国预防兽医学报》 北大核心 2025年第2期144-151,共8页
猪非典型瘟病毒(APPV)、经典猪瘟病毒(CSFV)、日本乙型脑炎病毒(JEV)均属于黄病毒科重要成员,从临床症状难以区分且三者的混合感染。为建立一种能快速鉴别检测APPV、CSFV、JEV的三重荧光定量PCR(qPCR)检测方法,本研究根据APPV 5'UT... 猪非典型瘟病毒(APPV)、经典猪瘟病毒(CSFV)、日本乙型脑炎病毒(JEV)均属于黄病毒科重要成员,从临床症状难以区分且三者的混合感染。为建立一种能快速鉴别检测APPV、CSFV、JEV的三重荧光定量PCR(qPCR)检测方法,本研究根据APPV 5'UTR基因、CSFV E2基因和JEV E基因分别设计引物与探针,将公司合成的重组质粒标准品pLKO.1-APPV-5'UTR、pLKO.1-CSFV-E2和pLKO.1-JEV-E按体积比1:1:1混合后均为(1×10^(8)拷贝/μL)作为模板,经反应条件优化,初步建立同时检测这3种病毒的三重q PCR方法。以本研究构建的APPV慢病毒、CSFV慢病毒、JEV慢病毒,以及猪流感病毒、猪Delta冠状病毒、猪流行性腹泻病毒、伪狂犬病病毒、猪圆环病毒2型、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪轮状病毒、猪传染性胃肠炎病毒、诺如病毒的基因组为模板,采用建立的该方法检测,评估其特异性,结果显示,该方法仅能检测到APPV、CSFV、JEV的慢病毒,而其他病原检测结果均为阴性。选取1×10^(1)拷贝/μL~1×10^(8)拷贝/μL的混合质粒标准品和1×10^(1)TU/m L~1×10^(6)TU/m L的三种混合慢病毒液分别作为模板,采用本研究建立的方法检测,评估该方法的敏感性,结果显示,该方法对重组质粒pLKO.1-APPV-5'UTR、pLKO.1-CSFV-E2和pLKO.1-JEV-E的检测限均为1×10^(2)拷贝/μL,对3种慢病毒的检测限均为1×10^(2)TU/mL。以1×10~7拷贝/μL、1×10^(5)拷贝/μL、1×10~3拷贝/μL的质粒标准品混合物作为模板,分别进行组内和组间的重复性试验,结果显示,组内和组间重复性试验的变异系数(CV)均低于4.5%。利用本研究建立的三重qPCR和已发表的3种病原的SYBR Green qPCR检测方法对111份临床样品(75份猪肛拭子样品和36份猪组织病料样品)分别检测,结果显示,该三重qPCR方法与已发表的APPV、CSFV、JEV SYBR Green qPCR方法的总符合率分别为99.10%、100%、100%。本研究首次建立的检测APPV、CSFV、JEV的三重TaqMan qPCR方法特异性强、敏感性高、重复性好,为三者临床样品的快速鉴别检测提供了技术支持。 展开更多
关键词 猪非典型瘟病毒 经典猪瘟病毒 日本乙型脑炎病毒 三重荧光定量pcr
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猪圆环病毒2型、3型、4型三重PCR检测方法的建立与初步应用 被引量:1
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作者 梁惠平 吴虹瑾 +10 位作者 肖艳 曾庆华 刘琪 黄曼孜 李昕宇 陈翰卓 文姝寓 喻富伟 尹经毅 张俊杰 吴欢生 《生物灾害科学》 2025年第3期354-362,共9页
【目的】为了建立成本低且能同时快速检测猪圆环病毒2型(PCV2)、猪圆环病毒3型(PCV3)、猪圆环病毒4型(PCV4)的方法。【方法】根据PCV2、PCV3、PCV4各自的Rep基因组序列设计3对特异性引物,通过优化反应条件,建立了一种能同时检测上述3种... 【目的】为了建立成本低且能同时快速检测猪圆环病毒2型(PCV2)、猪圆环病毒3型(PCV3)、猪圆环病毒4型(PCV4)的方法。【方法】根据PCV2、PCV3、PCV4各自的Rep基因组序列设计3对特异性引物,通过优化反应条件,建立了一种能同时检测上述3种圆环病毒的三重PCR方法。【结果】建立的三重PCR方法对PCV2、PCV3、PCV4的基因组DNA均能高效扩增,对猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪瘟病毒(CSFV)、猪伪狂犬病毒(PRV)、猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪德尔塔冠状病毒(PDCoV)、猪细小病毒(PPV)、猪传染性胃肠炎病毒(TEGV)及猪塞内卡病毒(SVA)的核酸均无特异性扩增,特异性较强;对PCV2、PCV3、PCV4的重组质粒最低检测限分别为3.5×10^(3)拷贝/μL、5.6×10^(3)拷贝/μL、4.7×10^(3)拷贝/μL,与试验建立的单一PCR检测结果一致,具有较高的检测灵敏度。采用三重PCR技术检测,结果确认其中PCV2阳性率为64%(16/25),PCV3阳性率为32%(8/25),PCV4阳性率为40%(10/25);其中双重感染(PCV2/3、PCV2/4、PCV3/4)发生率均为8%(2/25),而三重共感染率为4%(1/25)。应用本试验的单一PCR引物进行复检,二者结果一致。【结论】三重PCR方法可以有效地快速同时检测PCV2/3/4,为检测猪圆环病毒混合感染及该病的流行病学调查提供了技术支持。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 猪圆环病毒3型 猪圆环病毒4型 三重pcr
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牛MB、MH、PM三重PCR检测方法的建立与应用
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作者 沈思思 江波涛 +9 位作者 刘雪松 冯万宇 兰世捷 张蕾 苗艳 李丹 张国华 王欢 王岩 陈亮 《东北农业大学学报》 北大核心 2025年第2期72-79,共8页
为建立可同时检测牛支原体(Mycoplasma bovis,MB)、溶血性曼氏杆菌(Mannheimia haemolytica,MH)和多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida,PM)的三重PCR检测方法,试验采用上述3种病原体对应的copD/F(MB)、lktc(MH)、kmt(PM)基因设计特异... 为建立可同时检测牛支原体(Mycoplasma bovis,MB)、溶血性曼氏杆菌(Mannheimia haemolytica,MH)和多杀性巴氏杆菌(Pasteurella multocida,PM)的三重PCR检测方法,试验采用上述3种病原体对应的copD/F(MB)、lktc(MH)、kmt(PM)基因设计特异性引物。通过筛选退火温度和引物质量浓度,验证方法特异性、敏感性和重复性,建立可同时检测MB、MH和PM的三重PCR检测方法,并初步应用于临床。结果表明:该方法特异性强,仅对MB、MH和PM有特异性扩增,方法最适退火温度为52.5℃,最适引物质量浓度为1.0 mg·L^(-1);对3种病原体最低检出限MB为1.75×10^(3)拷贝数·μL^(-1)、MH为1.34×10^(4)拷贝数·μL^(-1)、PM为1.96×10^(4)拷贝数·μL^(-1),利用该三重PCR和单项PCR分别检测黑龙江省268份临床样本,显示三重PCR阳性检出率MB为28.73%(77/268)、MH为13.43%(36/268)、PM为20.52%(55/268)。混合感染以MB和PM为主,感染率为8.96%(24/268);其次为MB和MH,感染率为6.72%(18/268);MH和PM感染率为3.36%(9/268);同时感染3种病原体的感染率为1.12%(3/268)。三重PCR扩增结果与单项PCR检测结果总符合率为92.84%。说明建立的三重PCR可为MB、MH和PM临床快速检测及流行病学调查提供技术支持。 展开更多
关键词 牛支原体 溶血性曼氏杆菌 多杀性巴氏杆菌 三重pcr
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带足按蚊、雷氏按蚊、须喙按蚊三重PCR鉴定方法的建立
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作者 聂国嫒 胡双双 +4 位作者 苏小建 张荣 乃吉麦·多里坤 黄培鑫 杨庆贵 《中国媒介生物学及控制杂志》 2025年第4期508-512,共5页
目的 针对带足按蚊、雷氏按蚊、须喙按蚊分布重叠样本鉴定难题,建立三重PCR快速分子鉴定方法。方法 以3种目标蚊种线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因为靶标,6种按蚊为对照。设计特异性引物,通过单重PCR筛选最优引物,优化三重PCR反... 目的 针对带足按蚊、雷氏按蚊、须喙按蚊分布重叠样本鉴定难题,建立三重PCR快速分子鉴定方法。方法 以3种目标蚊种线粒体细胞色素C氧化酶亚基Ⅰ(COⅠ)基因为靶标,6种按蚊为对照。设计特异性引物,通过单重PCR筛选最优引物,优化三重PCR反应体系(引物浓度、模板DNA含量、退火温度),并验证其特异性与敏感性。结果 筛选出3对特异性引物(带足按蚊F3/R3、雷氏按蚊F8/R8、须喙按蚊F17/R17),在50 pmol/μl引物各1μl、1 ng/μl模板DNA 2μl、退火温度58℃条件下,可分别扩增出55、132和250 bp的特异性目标条带,对照蚊种及空白对照均无扩增。敏感性试验显示检测下限为10^(-4) ng/μl。结论 该三重PCR方法可快速、特异性鉴别3种按蚊,突破传统形态学鉴定对完整样本的依赖,适用于口岸病媒生物监测中的复杂样本鉴定。 展开更多
关键词 带足按蚊 雷氏按蚊 须喙按蚊 三重pcr 分子鉴定
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猪圆环病毒2、3和4型三重荧光定量PCR鉴别检测方法的建立及初步应用
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作者 魏千禾 于浩然 +5 位作者 陈军光 董婉玉 周兴东 宋厚辉 周莹珊 王晓杜 《中国预防兽医学报》 北大核心 2025年第6期593-600,共8页
猪圆环病毒2型(PCV2)可引起仔猪的断奶后多系统衰竭综合征(PMWS)、猪皮炎肾病综合征(PDNS)等疾病,PCV基因型多且常以混合感染为主,给养殖场造成严重经济损失。为建立一种能同时检测PCV2、PCV3、PCV4的荧光定量PCR(q PCR)方法,本研究根据... 猪圆环病毒2型(PCV2)可引起仔猪的断奶后多系统衰竭综合征(PMWS)、猪皮炎肾病综合征(PDNS)等疾病,PCV基因型多且常以混合感染为主,给养殖场造成严重经济损失。为建立一种能同时检测PCV2、PCV3、PCV4的荧光定量PCR(q PCR)方法,本研究根据PCV2、PCV3和PCV4的rep基因序列,设计特异性引物和探针,利用三维响应面曲线优化扩增条件,建立了一种可同时检测3种PCV的三重Taq Man qPCR方法。通过将扩增的PCV2、PCV3、PCV4的rep基因片段克隆至pUC-57载体,构建重组质粒标准品,并经测序鉴定。特异性试验中,结果显示该方法仅对PCV2、PCV3、PCV4检测为阳性,对其他常见猪病毒及细菌检测结果均为阴性,特异性强;敏感性试验中,使用构建的3种重组质粒标准品等体积混合再10倍倍比稀后经该三重qPCR检测,结果显示该方法对PCV2、PCV3、PCV4重组质粒标准品的检测限分别为1×10^(1)拷贝/μL、1×10^(2)拷贝/μL、1×10^(0)拷贝/μL,敏感性较高;重复性试验中,采用本研究建立的三重qPCR方法分别对3种浓度PCV2、PCV3、PCV4重组质粒标准品进行组内和组间重复性检测,结果显示该方法组内和组间重复性试验的变异系数分别小于3.34%和2.77%,重复性较好。利用该方法检测浙江省送检的共120份仔猪组织病料及肛拭子样品,并利用已发表的检测PCV2、PCV3及PCV4的SYBR Green I qPCR方法同时检测,结果显示,本研究建立的方法对PCV2的检出率为60.8%(73/120),对PCV3的检出率为45.8%(55/120),对PCV4的检出率为25.8%(31/120);SYBR Green I qPCR法对PCV2的检出率为65%(78/120),对PCV3的检出率为45.8%(55/120),对PCV4的检出率为27.5%(33/120);两种检测方法的总符合率均为92.5%(111/120)。本研究首次建立了可用于鉴别检测临床样品中PCV2、PCV3、PCV4感染的q PCR鉴别检测方法,为猪场PCV感染的防控奠定基础。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 猪圆环病毒3型 猪圆环病毒4型 三重荧光定量pcr
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鲈鳜主要病毒性病原三重荧光定量PCR检测方法的建立及应用
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作者 谭红连 韦剑成 +5 位作者 李莉萍 童桂香 苏美珍 韦信贤 杨明伟 陈静 《南方农业学报》 北大核心 2025年第8期2651-2661,共11页
【目的】建立能同时检测鲈鳜虹彩病毒(RanaV)、传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)和鲈形目鱼类弹状病毒(PFRV)的三重荧光定量PCR,为鲈鳜养殖过程中的RanaV、ISKNV、PFRV检疫、监测及临床诊断等提供简便且高效的检测方法。【方法】分别根据RanaV... 【目的】建立能同时检测鲈鳜虹彩病毒(RanaV)、传染性脾肾坏死病毒(ISKNV)和鲈形目鱼类弹状病毒(PFRV)的三重荧光定量PCR,为鲈鳜养殖过程中的RanaV、ISKNV、PFRV检疫、监测及临床诊断等提供简便且高效的检测方法。【方法】分别根据RanaV-MCP基因、ISKNV-MCP基因、PFRV-G基因的保守序列设计特异性扩增引物和TaqMan-MGB探针,将目的基因片段克隆至pGM-T载体上构建重组质粒pGM-T-MCP^(RanaV)、pGM-T-MCP^(ISKNV)和pGM-T-G^(PFRV),其中,pGM-T-MCP^(RanaV)、pGM-T-MCP^(ISKNV)分别作为RanaV和ISKNV的标准品DNA,pGM-T-G^(PFRV)则以SalⅠ酶切后经体外转录获得PFRV标准品RNA;以标准品为模板进行三重荧光定量PCR反应条件优化及标准曲线制定,并分别进行敏感性、特异性、重复性及临床应用试验。【结果】优化后的三重荧光定量PCR反应体系30.0μL:2×Fast One Step Probe RT-qPCR Mix 15.0μL,引物RanaV-qF/RanaV-qR(10μmol/L)、ISKNV-qF/ISKNV-qR(10μmol/L)、PFRV-qF/PFRV-qR(10μmol/L)各0.6μL,探针RanaV-qP(5μmol/L)0.9μL,探针ISKNV-qP(5μmol/L)0.9μL,探针PFRV-qP(5μmol/L)1.2μL,核酸模板3.0μL,灭菌DEPC水补足至30.0μL。建立的三重荧光定量PCR对RanaV、ISKNV和PFRV标准品均具有较高的扩增效率(Eff.>95.0%),其标准曲线线性关系良好(RSq≥0.999),可实现对RanaV、ISKNV和PFRV的同步定量分析;对RanaV、ISKNV、PFRV标准品的检测灵敏度可达10 copies/反应,对鲈鳜组织样品的检测灵敏度为10 copies/mg;与草鱼呼肠孤病毒(GCRV)、罗非鱼湖病毒(TiLV)、鲤春病毒血症病毒(SVCV)等鱼类常见病原均无交叉反应;检测RanaV、ISKNV、PFRV的组内及组间重复试验的C_t值变异系数均低于2.00%。采用建立的三重荧光定量PCR对采自广西各地养殖场的鲈鳜样品(大口黑鲈95份,鳜68份)进行检测,结果发现,RanaV阳性检出率为19.0%,ISKNV阳性检出率为14.7%,PFRV阳性检出率为4.3%。【结论】基于TaqMan-MGB探针建立的三重荧光定量PCR能同时检测RanaV、ISKNV和PFRV,具有灵敏度高、特异性强、准确可靠、操作简单、快速高效的特点,可为鲈鳜的苗种检疫、疫情监测及临床诊断提供更简便、更高效的技术手段。RanaV、ISKNV和PFRV感染在广西鲈鳜养殖中已流行,大口黑鲈以RanaV感染为主,鳜则以ISKNV感染为主,且存在混合感染及无临床症状的潜伏感染。 展开更多
关键词 大口黑鲈 虹彩病毒(RanaV) 传染性脾肾坏死病毒(ISKNV) 鲈形目鱼类弹状病毒(PFRV) 三重荧光定量pcr
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牛诺如病毒和牛嵴病毒及牛环曲病毒三重RT-PCR检测方法的建立 被引量:2
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作者 孙睿雪 李玉铎 +5 位作者 吴国军 陈天杰 车瑞香 茹毅 韩欢胜 赵建军 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2024年第4期454-464,共11页
为了解牛诺如病毒(BNo V)、牛嵴病毒(BKV)和牛环曲病毒(BTo V)在国内的流行情况,本研究参考Gen Bank中登录的BNo V Rd Rp基因、BKV 3D基因和BTo V N基因保守区域,设计3对特异性引物,成功建立了能够同时快速检测BNo V、BKV、BTo V的三重R... 为了解牛诺如病毒(BNo V)、牛嵴病毒(BKV)和牛环曲病毒(BTo V)在国内的流行情况,本研究参考Gen Bank中登录的BNo V Rd Rp基因、BKV 3D基因和BTo V N基因保守区域,设计3对特异性引物,成功建立了能够同时快速检测BNo V、BKV、BTo V的三重RT-PCR方法。该方法特异性较强,仅对BNo V、BKV、BTo V扩增出特异性条带,对其他5种常见引发犊牛腹泻的病毒均未扩增出条带;敏感性较高,针对p MD18-T-BNo V、p MD18-T-BKV和p MD18-T-BTo V质粒标准品的最低检测限分别为2.73×10^(4)copies/μL、2.87×10^(4)copies/μL、3.18×10^(3)copies/μL;重复性好,同批次样品的3次检测结果均一致。使用该方法对153份临床样品进行检测,结果显示,BNo V、BKV、BToV的阳性率分别为11.11%、25.49%、38.56%,3种病毒混合感染率为7.18%。与其他学者建立的单一RT-PCR检测方法相比,符合率分别为94.77%、93.46%、91.50%。上述结果表明,本试验建立的三重RT-PCR方法为犊牛上述国内新发病毒快速检测及流行病学调查提供了技术支撑。 展开更多
关键词 牛诺如病毒 牛嵴病毒 牛环曲病毒 三重RT-pcr
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犬和猫皮肤癣菌三重荧光定量PCR检测方法的建立及应用
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作者 徐博 郭思宇 +5 位作者 纪佳豪 李梓豪 刘文扬 勾永志 白二钢 李睿文 《动物医学进展》 北大核心 2024年第9期56-60,共5页
建立鉴别犬小孢子菌(Microsporum canis,MC)、须癣毛癣菌(Trichophyton mentagrophytes,TM)和秕糠马拉色菌(Malassezia furfur,MF)的三重荧光PCR检测方法,根据MC、TM和MF 3种真菌的ITS基因保守序列设计引物和探针,建立三重荧光PCR检测... 建立鉴别犬小孢子菌(Microsporum canis,MC)、须癣毛癣菌(Trichophyton mentagrophytes,TM)和秕糠马拉色菌(Malassezia furfur,MF)的三重荧光PCR检测方法,根据MC、TM和MF 3种真菌的ITS基因保守序列设计引物和探针,建立三重荧光PCR检测方法。所建立的三重荧光PCR方法仅对MC、TM和MF出现阳性扩增,与大肠埃希氏菌、产色葡萄球菌和铜绿假单胞菌等犬、猫皮肤病常见病原无交叉反应,对MC、TM和MF的最低检出限分别为1.36×10^(1)、1.35×10^(1)、1.33×10^(1)拷贝;组内和组间变异系数均小于2%,重复性好。应用建立三重荧光PCR方法对88份犬、猫临床样品进行检测,结果检出1份MC阳性、21份TM阳性、20份MF阳性,检测结果与单一荧光PCR方法一致。该方法可对MC、TM和MF同时快速检测,可用于犬、猫真菌性皮肤病的快速诊断。 展开更多
关键词 犬和猫皮肤病 犬小孢子菌 须癣毛癣菌 秕糠马拉色菌 三重荧光pcr
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三重PCR检测鱼类致病性嗜水气单胞菌 被引量:34
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作者 王远微 汤承 +2 位作者 于学辉 王英 岳华 《微生物学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第7期947-951,共5页
【目的】建立一种能够快速准确地检测致病性嗜水气单胞菌的PCR方法。【方法】根据嗜水气单胞菌的16S rRNA、气溶素基因(aer)和丝氨酸蛋白酶基因(ahp)的保守序列设计了3对引物,然后进行了PCR反应条件的优化、特异性和敏感性的检测并与普... 【目的】建立一种能够快速准确地检测致病性嗜水气单胞菌的PCR方法。【方法】根据嗜水气单胞菌的16S rRNA、气溶素基因(aer)和丝氨酸蛋白酶基因(ahp)的保守序列设计了3对引物,然后进行了PCR反应条件的优化、特异性和敏感性的检测并与普通的细菌分离鉴定进行了临床样本和人工攻毒样本检出率的比较。【结果】该方法特异性好,只对致病性嗜水气单胞菌呈阳性扩增;敏感性高,最低可检测100fg的细菌DNA模版。对临床疑似黄鳝(Monopterus albus)样本的检出率为81.8%,高于细菌分离的40.9%;对人工攻毒鲫鱼(Carassius auratus)样本的检出率为87.5%,高于细菌分离的67.5%。【结论】本方法的成功建立,实现在同一反应管中同时对16SrRNA、aer和ahp的检测,避免了只针对aer或ahp单个毒力基因的PCR检测方法可能存在的漏检和误检,为致病性嗜水气单胞菌的诊断、大规模检疫、流行病学调查等提供了一种快速、准确而有效的检测方法。 展开更多
关键词 嗜水气单胞菌 AER AHP 16S RRNA 三重pcr
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牛支原体、无乳支原体和丝状支原体丝状亚种小克隆三重PCR检测方法的建立及初步应用 被引量:30
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作者 李大伟 黄灿平 +4 位作者 张彦明 谢建华 冉智光 熊仲良 范伟兴 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第2期306-310,共5页
本研究旨在建立一种可一次性区分牛支原体、丝状支原体丝状亚种小克隆和无乳支原体的三重PCR诊断方法,为临床诊断和流行病学调查提供可靠检测技术。根据GenBank发表的上述3种病原的基因组序列保守区域设计3对特异性引物建立三重PCR方法... 本研究旨在建立一种可一次性区分牛支原体、丝状支原体丝状亚种小克隆和无乳支原体的三重PCR诊断方法,为临床诊断和流行病学调查提供可靠检测技术。根据GenBank发表的上述3种病原的基因组序列保守区域设计3对特异性引物建立三重PCR方法;确定其检测敏感性,以猪支原体、鸡支原体、无乳支原体和丝状支原体丝状亚种小克隆基因作模板检验其特异性;同时和病原分离鉴定结果对比其准确性。结果表明在优化体系和条件下能够同时得到扩增长度为448、549、375 bp 3条特异性片段,未扩增出猪、鸡支原体模板特异性片段;其敏感性(可检测到的最小模板DNA含量)为0.8 ng.μL-1;36份临床样品检测结果显示,三重PCR检测结果与分离培养鉴定方法一致,均能鉴定出牛支原体阳性病料。本研究建立的三重PCR诊断方法能够一次性鉴别3种支原体,具有高敏感性、特异性和准确性,可用于临床诊断和流行病学调查。 展开更多
关键词 牛支原体 丝状支原体丝状亚种小克隆 无乳支原体 三重pcr
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微卫星三重PCR基因扫描技术在中国明对虾家系标识中的应用 被引量:16
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作者 孔杰 高焕 +5 位作者 于飞 罗坤 王伟继 孟宪红 刘萍 张天时 《中国水产科学》 CAS CSCD 北大核心 2007年第1期59-66,共8页
在开发中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)微卫星引物的基础上,利用3对微卫星引物,克隆编号分别为H081、RS0683和RS1101,构建中国明对虾的三重PCR稳定扩增体系。在此基础上,进一步利用荧光标记引物的基因扫描技术(Genescan)对利用精... 在开发中国明对虾(Fenneropenaeus chinensis)微卫星引物的基础上,利用3对微卫星引物,克隆编号分别为H081、RS0683和RS1101,构建中国明对虾的三重PCR稳定扩增体系。在此基础上,进一步利用荧光标记引物的基因扫描技术(Genescan)对利用精荚移植技术建立的中国明对虾7个半同胞家系和16个全同胞家系进行识别研究。结果表明,该项技术可以准确地把7个半同胞家系的子代个体间、16个全同胞家系的子代个体间以及总的31个全同胞家系的子代个体间区别开,且能准确把这些家系产生的任意子代个体定位到各个家系。该技术可以满足大批量家系材料样本的分析,具有较好的应用价值。[中国水产科学,2007,14(1):59-66] 展开更多
关键词 微卫星 三重pcr 基因扫描 中国明对虾 家系识别
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三重PCR检测草莓灰霉病菌、炭疽病菌和黄萎病菌 被引量:20
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作者 王楠 王剑 +2 位作者 尹丹韩 高观朋 王伟 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2010年第21期4392-4400,共9页
【目的】探索和优化检测条件,建立同时检测草莓灰霉病菌Botrytiscinerea,炭疽病菌Colletotrichum gloeosporioides和黄萎病菌Verticillium dahliae的三重PCR检测体系,为3种病害的早期快速诊断和鉴定提供技术和方法。【方法】选择可以组... 【目的】探索和优化检测条件,建立同时检测草莓灰霉病菌Botrytiscinerea,炭疽病菌Colletotrichum gloeosporioides和黄萎病菌Verticillium dahliae的三重PCR检测体系,为3种病害的早期快速诊断和鉴定提供技术和方法。【方法】选择可以组合的3种病原菌特异引物,研究多重PCR的影响因素,优化PCR退火温度,采用正交试验方法,以3个引物组、TaqDNA聚合酶、dNTP和Mg2+六因素三水平优化多重PCR体系。【结果】建立并验证适合上述草莓主要病原菌的三重PCR最佳检测体系,可分别扩增出729、539和450bp的特异条带,最适退火温度为50℃,25μL的反应体系中含有0.32μmol·L-1C729+/-、0.032μmol·L-1DB19/DB22、0.32μmol·L-1CgInt/ITS4、1.5UTaq聚合酶、0.15mmol·L-1dNTP、1.6mmol·L-1MgCl2。【结论】利用上述引物组合和反应体系进行三重PCR检测,能够快速从田间发病植株和土壤中将草莓灰霉病菌、草莓炭疽病菌和草莓黄萎病菌检测出来,灵敏度可以达到10pg菌丝DNA。 展开更多
关键词 草莓 灰霉病菌 炭疽病菌 黄萎病菌 分子检测 三重pcr
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肉鸡源弯曲菌的分离、多重PCR鉴定及其耐药性分析 被引量:8
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作者 朱冬梅 刘书亮 +2 位作者 彭珍 赖海梅 韩新锋 《中国人兽共患病学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期390-396,共7页
目的了解肉鸡屠宰加工过程中弯曲菌的污染及其耐药情况。方法根据GB 4789.9-2008,采用增菌培养、选择性平板分离、生化鉴定从肉鸡屠宰过程中分离疑似弯曲菌,并以弯曲菌属的16SrRNA、空肠弯曲菌的Hip O和结肠弯曲菌的Ceu E为靶基因,采用... 目的了解肉鸡屠宰加工过程中弯曲菌的污染及其耐药情况。方法根据GB 4789.9-2008,采用增菌培养、选择性平板分离、生化鉴定从肉鸡屠宰过程中分离疑似弯曲菌,并以弯曲菌属的16SrRNA、空肠弯曲菌的Hip O和结肠弯曲菌的Ceu E为靶基因,采用三重PCR方法对疑似菌株进行鉴定。采用琼脂稀释法对弯曲菌阳性菌株进行8种常用抗生素的药敏试验,参考CLSI标准(2010)判定药敏结果。结果根据形态特征、生化指标及PCR鉴定结果,从651份样品中,鉴定出空肠弯曲菌160株、结肠弯曲菌130株,其他弯曲菌11株,弯曲菌总分离率为46.24%;其中屠宰前、屠宰过程中及屠宰后鸡肉中弯曲菌的污染率分别为56.10%、31.00%、17.00%,可能存在由屠宰前向屠宰后传播趋势。药敏试验表明,弯曲菌对环丙沙星、左氧氟沙星、四环素和林可霉素的耐药率较高,分别为93.02%、87.71%、87.71%、80.07%,对庆大霉素、红霉素、链霉素、氟苯尼考的耐药率分别为67.11%、49.50%、31.89%、13.29%。结论肉鸡屠宰过程中弯曲菌的污染及其耐药情况较为严重,应该加强卫生和抗生素使用监督。 展开更多
关键词 空肠弯曲菌 结肠弯曲菌 三重pcr 耐药性 肉鸡
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鸡新城疫病毒、鸡细小病毒和禽流感病毒三重PCR检测方法的建立及应用 被引量:8
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作者 奉彬 谢芝勋 +7 位作者 邓显文 张艳芳 谢丽基 谢志勤 范晴 曾婷婷 罗思思 黄娇玲 《南方农业学报》 CAS CSCD 北大核心 2019年第11期2576-2582,共7页
【目的】建立能同时检测鸡新城疫病毒(NDV)、鸡细小病毒(ChPV)和禽流感病毒(AIV)的三重PCR检测方法,为临床上快速诊断及有效防控NDV、ChPV和AIV的单一或混合感染提供技术支持。【方法】参考NCBI中已公布NDV的F基因(登录号DQ195265.1)、C... 【目的】建立能同时检测鸡新城疫病毒(NDV)、鸡细小病毒(ChPV)和禽流感病毒(AIV)的三重PCR检测方法,为临床上快速诊断及有效防控NDV、ChPV和AIV的单一或混合感染提供技术支持。【方法】参考NCBI中已公布NDV的F基因(登录号DQ195265.1)、ChPV的NS1基因(登录号GU214704.1)和AIV的M基因保守区(登录号DQ485211.1),设计合成针对NDV、ChPV和AIV的特异性引物,应用这3对引物建立三重PCR检测方法,对反应体系及扩增程序进行优化,并通过特异性试验、敏感性试验、重复性试验和临床样品检测等评估其实用性。【结果】优化后的三重PCR反应体系为ChPV和AIV的上、下游引物各0.5μL,NDV的上、下游引物各1.0μL,NDV、ChPV和AIV的核酸模板各1.0μL,Premix TaqTM 12.5μL,无RNase水补足至25.0μL。最佳扩增程序:95.0℃预变性5 min;94.0℃1 min,58.5℃1 min,72.0℃1 min,进行35个循环;72.0℃延伸10 min,12.0℃结束反应。建立的三重PCR能同时扩增出NDV(453 bp)、ChPV(687 bp)和AIV(239 bp)的特异性条带,对应的最低检测下限分别为2.5 pg NDV、6.4 pg ChPV和2.0 pg AIV,但扩增传染性支气管炎病毒(IBV)、禽呼肠孤病毒(ARV)、马立克病毒(MDV)、传染性喉气管炎病毒(AILTV)和禽肺炎病毒(APV)等病原体均呈阴性。应用建立的三重PCR对50份鸡喉头或泄殖腔棉拭子样品进行检测,结果显示有1份NDV阳性、9份ChPV阳性和2份AIV阳性样品,其中包含2份ChPV和AIV均呈阳性的样品,1份ChPV和NDV均呈阳性的样品,与常规PCR的检测结果一致。【结论】建立的三重PCR能同时对NDV、ChPV和AIV 3种病原进行特异性诊断,在混合感染病例鉴别诊断方面具有广阔的应用前景。 展开更多
关键词 鸡新城疫病毒 鸡细小病毒 禽流感病毒 三重pcr 特异性 敏感性
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牛支原体、牛病毒性腹泻病毒和牛传染性鼻气管炎病毒三重二温式PCR检测方法的建立及应用 被引量:10
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作者 范晴 谢芝勋 +10 位作者 谢志勤 谢丽基 黄莉 黄娇玲 张艳芳 曾婷婷 王盛 罗思思 邓显文 刘加波 庞耀珊 《动物医学进展》 北大核心 2018年第2期43-48,共6页
为建立一种可同时检测牛支原体(MB)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)和牛传染性支气管炎病毒(IBRV)的三重二温式PCR检测方法。根据GenBank中MB、BVDV和IBRV的保守基因Uvrc基因、5′端非编码区(5′-UTR)和GB基因,分别设计了3对特异引物,将三温式... 为建立一种可同时检测牛支原体(MB)、牛病毒性腹泻病毒(BVDV)和牛传染性支气管炎病毒(IBRV)的三重二温式PCR检测方法。根据GenBank中MB、BVDV和IBRV的保守基因Uvrc基因、5′端非编码区(5′-UTR)和GB基因,分别设计了3对特异引物,将三温式PCR扩增程序简化为两个温度梯度,优化反应条件建立了用于同时检测MB、BVDV以及IBRV 3种常见牛呼吸道传染病病原的三重二温式PCR。结果显示,该方法特异性好,只对MB、BVDV和IBRV模板进行扩增,扩增的目的片段长度分别为412、170、727bp,对其他牛病原体无特异性扩增;灵敏度高,最低能同时检测到10 000拷贝的目的核酸;干扰性小,能同时检测3个不同浓度的模板。研究所建立的MB、BVDV和IBRV三重二温式PCR检测方法,具有特异性好、灵敏度高、方便快速等优点,可用于临床鉴别诊断和流行病学调查,具有很高的临床应用价值。 展开更多
关键词 三重二温式pcr 牛支原体 牛病毒性腹泻病毒 传染性鼻气管炎病毒 检测
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烟草青枯病、黑胫病和猝倒病的多重PCR检测 被引量:9
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作者 张丽芳 陈海如 +1 位作者 方敦煌 赵兴能 《华北农学报》 CSCD 北大核心 2013年第S1期22-26,共5页
烟草青枯病、黑胫病和猝倒病是烟草生产中的重要病害,常发生复合侵染。以3种重要烟草病原菌基因组DNA作为目的基因,分别设计3对特异性引物,通过优化引物和模板浓度,摸索扩增参数,建立了能同时检测3种病害的多重聚合酶链式反应(Multiplex... 烟草青枯病、黑胫病和猝倒病是烟草生产中的重要病害,常发生复合侵染。以3种重要烟草病原菌基因组DNA作为目的基因,分别设计3对特异性引物,通过优化引物和模板浓度,摸索扩增参数,建立了能同时检测3种病害的多重聚合酶链式反应(Multiplex polymerase chain reaction,mPCR)体系。结果表明,多重PCR能分别扩增出长度为461,364,265 bp的特异性目的条带,能同时检测3种病原菌DNA的最低检出限为1.01 ng/μL,该多重PCR检测体系反应准确、快速、高效,为同时检测以上3种烟草病害提供了新的方法,对烟草复合侵染病害的诊断和防治提供了重要的指导作用。 展开更多
关键词 烟草青枯病 烟草黑胫病 烟草猝倒病 多重pcr检测
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瓜黑星病菌、枯萎病菌和蔓枯病菌的三重PCR检测 被引量:9
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作者 高永洋 王楠 +1 位作者 高观朋 王伟 《植物病理学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第4期343-350,共8页
通过测定黄瓜黑星病菌(Cladosporium cucumerinum)rDNA的ITS序列,比对近缘种及瓜类几种重要病原菌的ITS序列,设计出特异性引物HX-1/HX-2,经过对引物HX-1/HX-2PCR条件的优化,可以扩增出1条190bp的黄瓜黑星病菌特异性DNA条带,灵敏度达到1... 通过测定黄瓜黑星病菌(Cladosporium cucumerinum)rDNA的ITS序列,比对近缘种及瓜类几种重要病原菌的ITS序列,设计出特异性引物HX-1/HX-2,经过对引物HX-1/HX-2PCR条件的优化,可以扩增出1条190bp的黄瓜黑星病菌特异性DNA条带,灵敏度达到1pg/μL。进一步将引物HX-1/HX-2和瓜类枯萎病菌、瓜类蔓枯病菌特异检测引物Fn-1/Fn-2、Mn-1/Mn-2组合,建立三重PCR体系,可一次检测出瓜类黑星病菌、瓜类枯萎病菌、瓜类蔓枯病菌3种瓜类植物重要的病原菌。建立了可以应用于田间瓜类黑星病菌PCR检测技术和瓜类主要病害三重PCR检测技术,对瓜类病害的诊断和防治具有重要的指导作用。 展开更多
关键词 瓜黑星病菌 瓜枯萎病菌 瓜蔓枯病菌 分子检测 三重pcr
原文传递
猪流行性腹泻病毒、猪肠道病毒9型及猪嵴病毒三重RT-PCR检测方法建立及初步应用 被引量:9
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作者 任玉鹏 张斌 +1 位作者 岳华 刘燕 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第4期603-608,共6页
旨在建立一种同时检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪肠道病毒9型(PEV-9)、猪嵴病毒(PKV)的三重RT-PCR法,并初步应用于临床样品检测。根据GenBank中PEDV和PKV基因序列保守区设计2对引物,参照文献合成1对PEV-9引物,在同一体系进行RT-PCR扩增... 旨在建立一种同时检测猪流行性腹泻病毒(PEDV)、猪肠道病毒9型(PEV-9)、猪嵴病毒(PKV)的三重RT-PCR法,并初步应用于临床样品检测。根据GenBank中PEDV和PKV基因序列保守区设计2对引物,参照文献合成1对PEV-9引物,在同一体系进行RT-PCR扩增,对引物浓度、退火温度、灵敏度、特异性等进行优化,应用该法对采自四川省6个猪场46份样品进行检测。结果表明引物量分别为PEDV 0.5μL、PEV-9 0.25μL、PKV0.25μL,退火温度为55℃时扩增效果最理想;本方法最低检测量分别为PEDV 5.97pg、PEV-9 0.11pg、PKV0.74pg;用该方法对猪瘟病毒、猪繁殖与呼吸综合征病毒、猪圆环病毒、猪萨佩罗病毒、猪博卡病毒、猪环曲病毒、猪源大肠杆菌、猪源沙门菌、副猪嗜血杆菌、猪链球菌和空肠弯曲杆菌等病原进行RT-PCR扩增时,均无非特异性扩增条带出现。对46份腹泻样品的检测结果显示,PEDV感染率为76.1%、PEV-9为73.9%、PKV为39.1%,3种病原在同一样本检出率达29.1%,表明存在混合感染或协同致病的可能;与单项RT-PCR法相比,阳性样本的检出符合率均在91%以上,表明该方法具较高可信度。建立的方法可快速、准确地检测3种猪腹泻病毒性病原,为病原学诊断和分子流行病学调查提供了有效技术支持。 展开更多
关键词 多重RT-pcr PEDV PEV-9 PKV 检测
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