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CMA-CPEPS和CMA-REPS集合预报系统对2023年中国汛期降水预报的对比评估
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作者 熊洁 李俊 +3 位作者 陈法敬 李红祺 王明欢 康兆萍 《气象》 北大核心 2025年第9期1046-1060,共15页
基于CMA对流尺度集合预报系统(CMA-CPEPS)和区域集合预报系统(CMA-REPS)对2023年中国汛期(6月15日至8月28日)降水预报性能进行评估,并检验“23·7”华北特大暴雨过程的预报,得到如下主要结论:CMA-REPS存在降水预报系统性偏强的问题,... 基于CMA对流尺度集合预报系统(CMA-CPEPS)和区域集合预报系统(CMA-REPS)对2023年中国汛期(6月15日至8月28日)降水预报性能进行评估,并检验“23·7”华北特大暴雨过程的预报,得到如下主要结论:CMA-REPS存在降水预报系统性偏强的问题,CMA-CPEPS显著改善了这一问题;相比于CMA-REPS,CMA-CPEPS对晴雨的预报及其随时间变化的预报能力明显更优,且对降水的概率预报和分辨能力更好;CMA-CPEPS和CMA-REPS离散度均偏小,两套系统离散度与均方根误差的比值及空间相关系数均相当;对于“23·7”华北特大暴雨过程的预报,CMA-CPEPS比CMA-REPS展现出更强的时空分布细节捕捉能力,且CMA-CPEPS在降水强度、降水强度随时间演变趋势以及强降水的时空分辨能力方面均更出色,尤其在短历时强降水的预报上具有明显优势。总体来说,CMA-CPEPS对2023年中国汛期降水的预报能力在CMA-REPS基础上提升明显。 展开更多
关键词 CMA对流尺度集合预报系统(CMA-CPEPS) CMA区域集合预报系统(CMA-repS) “23·7”华北特大暴雨 FSS评分
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基于CMA-REPS的台风“梅花”(2212)路径预报偏差成因分析
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作者 吴胜蓝 漆梁波 《海洋气象学报》 2025年第1期23-33,共11页
2022年第12号台风“梅花”环流形势复杂,集合路径发散度大,模式各时次预报调整较大,路径预报难度高。利用中国气象局区域集合预报系统(China Meteorological Administration-Regional Ensemble Prediction System,CMA-REPS),对比分析台... 2022年第12号台风“梅花”环流形势复杂,集合路径发散度大,模式各时次预报调整较大,路径预报难度高。利用中国气象局区域集合预报系统(China Meteorological Administration-Regional Ensemble Prediction System,CMA-REPS),对比分析台风“梅花”路径预报偏差较小成员(偏东组)和偏差较大成员(偏西组)的环境流场和台风环流特征。结果显示,偏东组对应副热带高压(以下简称“副高”)位置偏南,与南侧高压合并,偏南引导气流更有利于台风向北移动,路径偏东。副高形态和位置也是不同预报时次起报的集合平均路径摇摆调整的主要原因。另外,偏东组成员对应台风尺度更大,台风本身及周围环流由于β效应的作用会趋使路径向偏北方向移动。陆地低涡对台风路径的影响较为复杂,低涡系统靠近台风发展有利于“梅花”西移,对台风系统有“吸引”作用,而低涡远离台风是不利于台风向西偏移的,由于距离较远对台风路径没有太多影响。但台风尺度和切断低涡对“梅花”路径的贡献作用是相对偏小的,在实际业务预报中需注意不过分高估高空槽或低涡系统对台风路径的吸引作用。 展开更多
关键词 CMA-repS 台风“梅花” 路径预报偏差
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基于群机器人的V-REP觅食仿真
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作者 丁冠通 《中国高新科技》 2025年第11期15-17,共3页
许多人类科学技术的许多发明都是受自然界某些现象的启发。作为一群生物,觅食场景包含了许多特性。这些特性应用于群体机器人的研究和仿真具有重要意义。文章利用V-REP/CoppeliaSim机器人模拟器、群机器人对蚂蚁觅食场景进行模拟和研究... 许多人类科学技术的许多发明都是受自然界某些现象的启发。作为一群生物,觅食场景包含了许多特性。这些特性应用于群体机器人的研究和仿真具有重要意义。文章利用V-REP/CoppeliaSim机器人模拟器、群机器人对蚂蚁觅食场景进行模拟和研究。实验模拟采用了多种传感器、信标、无线信号等检测方法,以实现了群体机器人在觅食过程中的多种行为。通过实验仿真结果和数据分析,改变一些条件来提高群体机器人的有效性。 展开更多
关键词 V-rep 聚集 柱头 模拟 蚂蚁 觅食行为
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回顾Rep与Cap的结构及其对研究CRESS DNA 病毒的启发
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作者 王栓群 刘献辉 +2 位作者 王琳 张衡 谢相科 《微生物学杂志》 北大核心 2025年第2期120-129,共10页
编码复制相关蛋白(Replication-associated protein,Rep)的单链环状DNA病毒(Circular Rep Encoding Single-Stranded DNA (CRESS DNA) Viruses)感染真核生物,具有病毒基因组小、宿主范围多样化、流行率高、滚环复制以及亲和性强等特点。... 编码复制相关蛋白(Replication-associated protein,Rep)的单链环状DNA病毒(Circular Rep Encoding Single-Stranded DNA (CRESS DNA) Viruses)感染真核生物,具有病毒基因组小、宿主范围多样化、流行率高、滚环复制以及亲和性强等特点。CRESS DNA病毒广泛感染且潜伏于多种真核生物,包括植物、动物、人类和真菌等,在病毒学领域影响深远且具有重要意义。CRESS DNA病毒是一种小型非囊膜DNA病毒,直径15~25 nm。病毒具有单链环状的基因组,主要编码两种蛋白质包括衣壳相关蛋白(Capsid protein,Cap)以及复制相关蛋白。Cap是组成病毒衣壳的唯一蛋白质组分,且在整个病毒复制周期中起着至关重要的作用,其参与病毒附着、细胞进入、基因组脱壳和成熟病毒粒子的组装。Rep则介导病毒基因组复制起始位点的识别,并利用其核酸内切酶活性使环状DNA断裂以进行滚环复制(Rolling cycle replication,RCR)。CRESS DNA病毒能够利用碱基长度有限的基因组在多种真核生物中进行复制并引起许多重要疾病,是病毒自然进化过程中产生的一种优秀的研究模型,该病毒进行复制的分子机制以及感染宿主的免疫机制值得深入探究。本文回顾了目前对CRESS DNA病毒编码蛋白的结构研究,通过了解蛋白在复制周期中的作用及其相互关系,为进一步阐明CRESS DNA病毒相关疾病的发病机制提供参考。 展开更多
关键词 CRESS DNA病毒 衣壳蛋白 复制酶相关蛋白 蛋白质结构 致病机制
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甜菜严重曲顶病毒Rep蛋白N端结构域介导基因沉默抑制并诱导VIM5表达
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作者 徐静钰 陆建新 +4 位作者 余振宇 胡媚杰 郭承楷 邱钟琪 陈中祺 《生物工程学报》 北大核心 2025年第10期3956-3968,共13页
双生病毒严重危害农作物产量。双生病毒编码的复制起始蛋白(replication initiator protein,Rep)是病毒复制的必需蛋白。甜菜严重曲顶病毒(beet severe curly top virus,BSCTV)属于双生病毒科曲顶病毒属,其Rep蛋白可以诱导拟南芥E3泛素... 双生病毒严重危害农作物产量。双生病毒编码的复制起始蛋白(replication initiator protein,Rep)是病毒复制的必需蛋白。甜菜严重曲顶病毒(beet severe curly top virus,BSCTV)属于双生病毒科曲顶病毒属,其Rep蛋白可以诱导拟南芥E3泛素化连接酶VIM5在叶片中表达,VIM5介导甲基转移酶通过泛素化途径降解,进而降低了BSCTV基因组C2-3启动子区域的甲基化水平,然而Rep蛋白中负责诱导VIM5的具体结构域并不清楚。一些双生病毒的Rep蛋白具有抑制基因沉默的功能,然而BSCTV编码的Rep蛋白是否具有沉默抑制活性尚不明确。本研究利用烟草瞬时表达系统,研究Rep蛋白的不同结构域在抑制基因沉默和诱导VIM5表达方面的功能。发现Rep蛋白N端结构域(第1-180个氨基酸)可以抑制外源GFP在16c-GFP转基因烟草注射叶片上的降解;进一步研究发现,Rep蛋白N端的第1-104个氨基酸可以显著诱导VIM5的表达,而Rep蛋白C端的结构则不能诱导VIM5的表达。本研究表明BSCTV编码的Rep蛋白的N端结构域能够抑制基因沉默同时诱导VIM5表达,有助于更加深入地理解双生病毒复制起始蛋白Rep和宿主植物的互作机制。 展开更多
关键词 甜菜严重曲顶病毒 复制起始蛋白 沉默抑制子 双生病毒
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猪圆环病毒3型Rep蛋白的原核表达及酶活性分析 被引量:1
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作者 韩阳 关帅印 +3 位作者 李振 周赛赛 袁红根 宋云峰 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期2061-2071,共11页
Rep蛋白对猪圆环病毒(porcine circovirus, PCV)的复制具有重要作用。为分析PCV3 Rep蛋白的核酸内切酶活性、ATPase活性和解旋酶活性,作者使用镍亲和层析法纯化相应的重组蛋白,通过优化反应条件,建立Rep蛋白酶活性的测定方法,并探究Rep... Rep蛋白对猪圆环病毒(porcine circovirus, PCV)的复制具有重要作用。为分析PCV3 Rep蛋白的核酸内切酶活性、ATPase活性和解旋酶活性,作者使用镍亲和层析法纯化相应的重组蛋白,通过优化反应条件,建立Rep蛋白酶活性的测定方法,并探究Rep蛋白关键活性位点。结果表明,Rep蛋白在体外具有核酸内切酶活性、ATPase活性和解旋酶活性。当蛋白浓度为1.6μmol·L^(-1),Mg^(2+)浓度为1.0 mmol·L^(-1),37℃反应75 min时其ATPase活性达到最佳。当蛋白浓度为7μmol·L^(-1),Mg^(2+)浓度为12.5 mmol·L^(-1),37℃反应60 min时其解旋酶活性达到最佳。Y89为Rep蛋白核酸内切酶活性的关键位点,K173、D210、N250为ATPase活性和解旋酶活性的关键位点。本研究建立了PCV3 Rep蛋白酶活性分析的方法,初步揭示了该蛋白的主要功能位点,为Rep蛋白的功能研究以及基于Rep蛋白活性的抗病毒药物研究奠定了基础。 展开更多
关键词 猪圆环病毒3 rep蛋白 核酸内切酶活性 ATPASE活性 解旋酶活性
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Rep-PCR技术及其应用现状 被引量:1
7
作者 赵燕梅 张吉明 许庆方 《上海畜牧兽医通讯》 2014年第3期24-26,共3页
本文着重介绍Rep-PCR技术原理、特点及其在细菌、真菌、环境微生物遗传多样性研究方面的应用。Rep-PCR目前发展迅速并被广泛应用于多种细菌基因分类,此方法操作方便,可以大样本进行,且分辨效果好,可重复性强。现在Rep-PCR可自动化分型,... 本文着重介绍Rep-PCR技术原理、特点及其在细菌、真菌、环境微生物遗传多样性研究方面的应用。Rep-PCR目前发展迅速并被广泛应用于多种细菌基因分类,此方法操作方便,可以大样本进行,且分辨效果好,可重复性强。现在Rep-PCR可自动化分型,并可建立各种细菌REP、ERIC-PCR分型标准数据库。但Rep-PCR也存在一定问题,不同来源或不同批次的引物和酶,对Rep-PCR结果都有一定的影响。 展开更多
关键词 rep—PCR rep—PCR技术特点 rep^PCR应用现状
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广西地区鸽圆环病毒Cap和Rep基因的克隆及遗传进化分析 被引量:1
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作者 黄运福 颜国庆 +5 位作者 唐林生 韦建兴 银慧慧 赵武 姜源明 刘伟 《现代畜牧兽医》 2024年第4期1-5,共5页
研究旨在了解广西某肉鸽场鸽圆环病毒(PiCV) Cap和Rep基因的遗传变异情况,通过PCR技术对感染PiCV的鸽组织样品克隆Cap和Rep基因并进行测序及序列分析。结果显示,克隆的Cap和Rep基因大小分别为816 bp和954 bp。核苷酸序列同源性比对分析... 研究旨在了解广西某肉鸽场鸽圆环病毒(PiCV) Cap和Rep基因的遗传变异情况,通过PCR技术对感染PiCV的鸽组织样品克隆Cap和Rep基因并进行测序及序列分析。结果显示,克隆的Cap和Rep基因大小分别为816 bp和954 bp。核苷酸序列同源性比对分析结果显示,克隆的Cap和Rep基因与XJ1毒株核苷酸同源性最高,分别为95.5%和97.6%。遗传进化分析结果显示,Cap和Rep基因与XJ1毒株亲缘关系较近。研究表明,广西鸽群中存在PiCV流行,其Cap和Rep基因与XJ1毒株核苷酸同源性最高,亲缘关系较近,这为广西地区PiCV的诊断及防控提供了重要参考。 展开更多
关键词 鸽圆环病毒 Cap基因 rep基因 遗传进化分析
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猪圆环病毒2型Rep/Rep'和Cap蛋白亚单位疫苗免疫保护性试验 被引量:6
9
作者 刘丹 王一平 +5 位作者 吴洪丽 危艳武 刘建波 李胜斌 魏萍 刘长明 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第11期916-919,共4页
猪圆环病毒2型(PCV2)ORF1基因编码的Rep/Rep'蛋白与病毒复制酶相关,ORF2编码的Cap蛋白为病毒核衣壳,是病毒保护性抗原。为比较这3种蛋白作为亚单位疫苗的免疫保护性,本研究以重组杆状病毒表达的PCV2-rRep、-rRep'和-rCap蛋白制... 猪圆环病毒2型(PCV2)ORF1基因编码的Rep/Rep'蛋白与病毒复制酶相关,ORF2编码的Cap蛋白为病毒核衣壳,是病毒保护性抗原。为比较这3种蛋白作为亚单位疫苗的免疫保护性,本研究以重组杆状病毒表达的PCV2-rRep、-rRep'和-rCap蛋白制备亚单位疫苗及PCV2灭活苗,分组免疫BALB/c鼠进行攻毒,以评价疫苗的免疫保护力。对PCV2-rRep和-rRep'亚单位疫苗免疫鼠血清ELISA抗体检测表明,于免疫后第14 d抗体全部转阳,第35 d抗体效价分别达到1∶42 667和1∶51 200。PCV2-rCap亚单位疫苗和PCV2灭活苗免疫组于第21 d抗体转阳,第35 d抗体效价分别达1∶2 133和1∶333。攻毒试验表明,PCV2-rCap亚单位疫苗和PCV2灭活苗免疫鼠获得完全保护;而PCV2-rRep和-rRep'蛋白亚单位疫苗免疫组无保护作用。血清中和试验表明,PCV2-rCap蛋白亚单位疫苗和PCV2灭活苗免疫鼠血清中和抗体效价达1∶1 600和1∶800;而PCV2-rRep和-rRep'蛋白亚单位疫苗免疫鼠血清无中和病毒能力。该研究表明,PCV2-Cap蛋白亚单位疫苗具有良好的免疫保护力,可以与PCV2自然感染猪产生的抗Rep蛋白抗体相鉴别,具有良好的开发前景。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 rep rep’和Cap蛋白 亚单位疫苗 免疫保护性
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思科城域网REP技术在宁夏广播电视网络有限公司的应用
10
作者 朱跃峰 李建宁 《广播电视信息》 2009年第6期58-60,共3页
REP技术是思科公司专门为城域网所开发的具有低收敛的弹性以太网协议,与生成树相比,它可以在链路中断后50ms内完成新的二层拓扑构建。此技术在宁夏广播电视网络有限公司全区数据平台上的应用,标志着宁夏广播电视网络有限公司数据平台向... REP技术是思科公司专门为城域网所开发的具有低收敛的弹性以太网协议,与生成树相比,它可以在链路中断后50ms内完成新的二层拓扑构建。此技术在宁夏广播电视网络有限公司全区数据平台上的应用,标志着宁夏广播电视网络有限公司数据平台向电信级平台的靠近。 展开更多
关键词 城域网rep技术 SEGMENT rep环的收敛 rep环的保护
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鸡舍环境金黄色葡萄球菌气溶胶产生及其传播的REP-PCR鉴定 被引量:17
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作者 钟召兵 柴同杰 +3 位作者 段会勇 苗增民 姚美玲 袁文 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2008年第10期1395-1401,共7页
采用ANDERSEN-6级空气微生物样品收集器和RCS离心式采样器在山东泰安4个鸡场舍内空气、舍外环境上风向10、50m和下风向10、50、100、200、400m不同距离处收集金黄色葡萄球菌,计算每个采样点的金黄色葡萄球菌浓度;与此同时,收集鸡的... 采用ANDERSEN-6级空气微生物样品收集器和RCS离心式采样器在山东泰安4个鸡场舍内空气、舍外环境上风向10、50m和下风向10、50、100、200、400m不同距离处收集金黄色葡萄球菌,计算每个采样点的金黄色葡萄球菌浓度;与此同时,收集鸡的粪便,分离金黄色葡萄球菌。利用金黄色葡萄球菌DNA基因外重复一致回文序列聚合酶链式反应(Repetitive extragenic palindromic elements PCR,REP—PCR)鉴定技术,扩增不同测量点和粪便分离的金黄色葡萄球菌的DNA图谱。通过每个采样点的金黄色葡萄球菌的浓度变化以及金黄色葡萄球菌遗传相似性分析确认动物舍微生物气溶胶向舍外环境的传播。结果显示:4个鸡场舍内空气中金黄色葡萄球菌的浓度远远高于舍外上风和下风向的金黄色葡萄球菌浓度(P〈0.05或P〈0.01),但是舍外下风不同距离间的金黄色葡萄球菌浓度差异并不显著(P〉0.05)。REP-PCR结果表明,从鸡的粪便中分离的金黄色葡萄球菌与从舍内空气中分离的部分金黄色葡萄球菌(38.7%)相似性可达100%,从鸡场舍外下风方向分离到的多数金黄色葡萄球菌(55.9%)与舍内空气或粪便中分离的金黄色葡萄球菌相似性可达100%。可见,它们分别是由粪便中遗传基因完全相同的菌株繁殖而来。而从鸡舍上风分离到的金黄色葡萄球菌与舍内空气或粪便中分离的金黄色葡萄球菌相似性仅在60%~87%。结果显示,鸡粪便中的金黄色葡萄球菌能够形成气溶胶,进入气悬状态,不仅能在舍内传播,而且还能够借助舍内外气体交换,传播到舍外下风一定的距离。从而说明,来自动物体的金黄色葡萄球菌既能污染舍内空气,对本舍鸡群构成传染威胁,又能传播一定的距离,对周边社区环境空气造成生物污染。 展开更多
关键词 鸡舍 气载金黄色葡萄球菌 rep—PCR 病原菌传播
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猪圆环病毒2型Rep和Rep’蛋白免疫原性及其抗体中和活性的测定 被引量:7
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作者 刘丹 王一平 +6 位作者 危艳武 唐青海 吴洪丽 刘建波 李胜斌 魏萍 刘长明 《中国兽医科学》 CAS CSCD 北大核心 2012年第12期1216-1223,共8页
为了构建表达PCV2Rep和Rep’蛋白的重组杆状病毒,采用高保真PCR法从病毒感染细胞中扩增Rep和Rep’蛋白基因,并克隆到杆状病毒转移载体(pBlueBac4.5/V5-His-TOPO)。将重组质粒与线性化杆状病毒DNA共转染昆虫细胞(Sf21),经同源重组和蚀斑... 为了构建表达PCV2Rep和Rep’蛋白的重组杆状病毒,采用高保真PCR法从病毒感染细胞中扩增Rep和Rep’蛋白基因,并克隆到杆状病毒转移载体(pBlueBac4.5/V5-His-TOPO)。将重组质粒与线性化杆状病毒DNA共转染昆虫细胞(Sf21),经同源重组和蚀斑筛选,获得2株高效表达PCV2Rep和Rep’蛋白的重组杆状病毒。经3次克隆的重组毒株的毒价达3.0×107 PFU/mL和7.0×107 PFU/mL。蛋白表达产物分析表明,PCV2Rep和Rep’蛋白分子质量为36.0ku和20.4ku,分别占总蛋白含量的6.2%和10.1%。免疫活性分析表明,这2种重组蛋白均可与PCV2特异性抗体产生反应,具有良好的反应原性。用Ni-NTA亲和层析法纯化这2种重组蛋白,纯度分别为92.5%和93.6%。用纯化的2种蛋白免疫小鼠,经间接ELISA检测,血清抗体效价高达1∶51 200。以抗这2种蛋白的抗体进行的IPMA试验表明,它们均能特异性识别PCV2感染细胞中的Rep和Rep’蛋白抗原。病毒血清中和试验证实,抗Rep和Rep’蛋白抗体均无中和病毒活性。本研究表达的重组PCV2Rep和Rep’蛋白,为探讨该病毒复制机制奠定了基础,也为PCV2Cap亚单位疫苗与自然野毒感染间的鉴别诊断开辟了新途径。 展开更多
关键词 猪圆环病毒2型 reprep’蛋白 杆状病毒表达 免疫原性 中和活性
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Rep-PCR应用于快速鉴定啤酒污染菌的研究 被引量:10
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作者 朱林江 郑飞云 +3 位作者 赵亚洲 邢香楠 李崎 顾国贤 《生物工程学报》 CAS CSCD 北大核心 2006年第6期1013-1020,共8页
为评价rep-PCR在快速鉴定啤酒污染菌中的应用,首先比较了DNA提取方法,确定CTAB法作为制备rep-PCR的DNA模板的方法。并通过PCR产物直接测序的方法,从分离菌中鉴定得到11种常见的啤酒污染菌。用BOXA1R和(GTG)_5引物扩增分离菌,采用Gel Com... 为评价rep-PCR在快速鉴定啤酒污染菌中的应用,首先比较了DNA提取方法,确定CTAB法作为制备rep-PCR的DNA模板的方法。并通过PCR产物直接测序的方法,从分离菌中鉴定得到11种常见的啤酒污染菌。用BOXA1R和(GTG)_5引物扩增分离菌,采用Gel ComparⅡ软件处理电泳图,构建污染菌的标准指纹图库。经过聚类分析表明,BOXA1R和(GTG)5对Lactobacillusbrevis、L.buchneri、L.casei/paracasei、L.plantarum和L.fermentum的聚类效果具有互补性,并首次提出指纹比对快速鉴定的相似系数阈值的概念。对来自三个不同来源的9株乳酸菌的快速鉴定结果表明,rep-PCR鉴定技术简单、快速、可靠,在快速鉴定方面将具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 rep—PCR BOXAIR (GTG) 相似系数阈值 啤酒腐败菌
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猪圆环病毒Ⅱ型Rep基因在PK15细胞中的表达及特性 被引量:7
14
作者 申会刚 周继勇 +4 位作者 陈庆新 郭军庆 陈婷飞 商绍彬 李增魁 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2005年第3期244-246,329,共4页
为研究猪圆环病毒型(PCV2)Rep基因在PK15细胞中的表达特性,通过PCR方法克隆了PCV2杭州株(HZ0201)Rep基因全长945bp片段,与真核表达载体pCI-neo构建为重组质粒pCI-PCV2-Rep。pCI-PCV2-Rep质粒转染PK15细胞后48h,通过RT-PCR可检测到PCV2Re... 为研究猪圆环病毒型(PCV2)Rep基因在PK15细胞中的表达特性,通过PCR方法克隆了PCV2杭州株(HZ0201)Rep基因全长945bp片段,与真核表达载体pCI-neo构建为重组质粒pCI-PCV2-Rep。pCI-PCV2-Rep质粒转染PK15细胞后48h,通过RT-PCR可检测到PCV2RepmRNA的转录;用猪PCV2多抗血清作间接免疫荧光试验,可检测到Rep基因表达产物。在表达量低的细胞中,PCV2Rep蛋白主要位于PK15的细胞浆,在表达量高的细胞中,细胞浆和细胞核中均含有大量的Rep蛋白,表明Rep对PK15细胞的细胞浆和细胞核的亲嗜性没有明显差别。 展开更多
关键词 PK15细胞 猪圆环病毒Ⅱ型 rep 间接免疫荧光试验 PCV2 RT-PCR 基因表达产物 PCR方法 表达特性 重组质粒 真核表达 质粒转染 mRNA 表达量 细胞核 neo pCI 抗血清 胞浆 检测 蛋白 全长
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腺相关病毒Rep78/68蛋白功能的研究进展 被引量:1
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作者 占申标 吕颖慧 李招发 《生物技术通报》 CAS CSCD 北大核心 2014年第2期24-29,共6页
Rep78/68是腺相关病毒(AAV)基因组编码的具有多种调控功能的非结构蛋白。主要参与了AAV DNA定点整合到人类19号染色体,抑制病毒的生物活性,如腺病毒、类猿病毒SV40等,调节AAV DNA的复制和转录等。重点阐述了定点整合的作用机制,Rep78/AA... Rep78/68是腺相关病毒(AAV)基因组编码的具有多种调控功能的非结构蛋白。主要参与了AAV DNA定点整合到人类19号染色体,抑制病毒的生物活性,如腺病毒、类猿病毒SV40等,调节AAV DNA的复制和转录等。重点阐述了定点整合的作用机制,Rep78/AAV ITR/ICP8复合物的形成机制以及Rep68蛋白的寡聚化特性,Rep78蛋白对p53核输出的限制,AAV Rep78蛋白与人乳头瘤病毒(HPV)E1蛋白相互作用从而促使Rep78和ITR DNA的结合,Rep78对乙型肝炎病毒(HBV)的抑制。这些作用的详细机制仍需完善和充实,对Rep78/68蛋白的相关作用机制的深入研究有助于rAAV基因药物的研发。 展开更多
关键词 AAV rep78 rep68 P53 机制
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香蕉束顶病毒海口分离物Rep基因的克隆、原核表达、抗血清制备及检测 被引量:8
16
作者 余乃通 冯团诚 +2 位作者 王健华 张雨良 刘志昕 《植物保护》 CAS CSCD 北大核心 2011年第4期38-43,共6页
[目的]对香蕉束顶病毒(Banana bunchy top virus,BBTV)海口分离物起始蛋白(replication initiation pro-teins,Rep)基因进行克隆、原核表达、抗血清制备,为BBTV有效的检测及分子流行病学等研究奠定基础。[方法]以海口地区染病香蕉幼嫩... [目的]对香蕉束顶病毒(Banana bunchy top virus,BBTV)海口分离物起始蛋白(replication initiation pro-teins,Rep)基因进行克隆、原核表达、抗血清制备,为BBTV有效的检测及分子流行病学等研究奠定基础。[方法]以海口地区染病香蕉幼嫩假茎和叶片的总DNA为模板,通过PCR技术克隆BBTV海口分离物的起始蛋白基因,连接到表达载体并进行大肠杆菌原核表达,制备高效价特异性抗血清。[结果]应用PCR方法从染毒香蕉幼嫩假茎和叶片总DNA中扩增复制rep基因,回收目的片段后经酶切,获得了含BBTV Rep基因的重组质粒pET32b-Rep。将重组质粒转化E.coliBL21(DE3),经不同的时间、温度及IPTG浓度优化,12%SDS-PAGE电泳分析,在20℃、0.1 mmol/L IPTG条件诱导4h,最终获得大量的可溶性融合蛋白。将可溶性蛋白上清液经Ni2+-NTA亲和层析柱纯化,得到高纯度的融合蛋白。用纯化后的融合蛋白免疫家兔,获得了BBTV Rep蛋白抗血清。以融合蛋白做抗原,间接ELISA法测定抗血清效价大于125 000。以田间样品做抗原时,结果表明抗血清最佳工作浓度为1∶1 000。Western blot鉴定结果表明抗血清能与融合蛋白特异性结合。[结论]利用Rep基因制备的特异性抗血清在BBTV病毒粒体的组装机制研究及病毒病诊断上具有重要的应用价值。 展开更多
关键词 香蕉束顶病毒 rep基因 原核表达 抗血清制备
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鸭圆环病毒FJ0601株Rep蛋白的原核表达及其抗血清制备 被引量:5
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作者 刘少宁 杨金保 +5 位作者 张兴晓 陈智 高继明 孔义波 朱岩丽 姜世金 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2010年第1期10-12,18,共4页
通过PCR方法扩增鸭圆环病毒(Duck circorirus,DuCV)FJ0601株Rep基因的完整ORF,按正确的阅读框架将其克隆入原核表达载体pGEX-6P-1中,重组质粒转化BL21宿主菌后,经IPTG诱导表达。诱导菌体裂解物经SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)后,将... 通过PCR方法扩增鸭圆环病毒(Duck circorirus,DuCV)FJ0601株Rep基因的完整ORF,按正确的阅读框架将其克隆入原核表达载体pGEX-6P-1中,重组质粒转化BL21宿主菌后,经IPTG诱导表达。诱导菌体裂解物经SDS-聚丙烯酰胺凝胶电泳(SDS-PAGE)后,将表达产物从凝胶中回收,免疫4周龄小鼠,3次免疫后,采血分离血清。所得抗GST-Rep多克隆抗血清分别与经PCR检验为阳性的病鸭脾脏、胸腺、法氏囊组织的冰冻切片进行间接免疫荧光试验(IFA),结果在感染DuCV的发病鸭3种免疫器官中均可检测到由阳性细胞组成的局部病灶,表明大肠杆菌表达的Rep融合蛋白至少保留了部分天然Rep蛋白的抗原性。 展开更多
关键词 鸭圆环病毒 rep 原核表达 IFA
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猪圆环病毒2型Rep蛋白基因的原核表达及间接ELISA抗体检测方法的建立 被引量:4
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作者 李文良 毛立 +4 位作者 张纹纹 王小敏 茅爱华 甘源 江杰元 《中国兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2013年第8期1154-1158,共5页
采用PCR方法扩增猪圆环病毒2型(PCV-2)Rep蛋白基因,克隆入原核表达载体pET-32a(+),转化大肠杆菌BL21构建重组表达菌,经SDS-PAGE检测目的蛋白得到成功表达,采用His标签单抗和PCV-2阳性猪血清进行Western blot鉴定表明重组蛋白具有良好的... 采用PCR方法扩增猪圆环病毒2型(PCV-2)Rep蛋白基因,克隆入原核表达载体pET-32a(+),转化大肠杆菌BL21构建重组表达菌,经SDS-PAGE检测目的蛋白得到成功表达,采用His标签单抗和PCV-2阳性猪血清进行Western blot鉴定表明重组蛋白具有良好的抗原性。利用纯化的重组蛋白rRep作为包被抗原,通过反应条件优化,建立了间接ELISA抗体检测方法。抗原最适包被质量浓度为1mg/L(0.1μg/孔),待检血清最适稀释度为1∶100,作用时间为1h,酶标抗体最适稀释度为1∶3 000。用该方法检测猪瘟病毒(CSFV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、伪狂犬病病毒(PRV)阳性血清,结果均为阴性;批内和批间重复试验变异系数分别为<5%和<10%,表明本方法具有较好的特异性和重复性。应用rRep-ELISA对113份血清样品进行检测,与rCap-ELISA结果比较,rRep-ELISA检测阳性率为50.44%(57/113),略低于后者的54.87%(62/113),2种方法检测符合率为88.5%(100/113),具有较好的一致性。这为PCV-2感染的流行病学调查和新型ELISA诊断试剂盒的研制奠定基础。 展开更多
关键词 PCV-2 rep蛋白 原核表达 ELISA
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猪圆环病毒2型Rep蛋白ELISA抗体检测方法的建立 被引量:4
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作者 李杰 葛猛 +6 位作者 罗维 舒晓亮 蒋大良 李润成 李波 刘国华 余兴龙 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2012年第11期894-897,共4页
为建立一种快速检测猪圆环病毒2型(PCV2)抗体的方法,本研究通过基因合成PCV2的Rep编码序列,将其克隆至pET-28a(+)并在E.coli中表达,表达的重组Rep蛋白经Ni2+亲和纯化。采用纯化的目的蛋白作为包被抗原,建立检测PCV2 Rep蛋白抗体的间接EL... 为建立一种快速检测猪圆环病毒2型(PCV2)抗体的方法,本研究通过基因合成PCV2的Rep编码序列,将其克隆至pET-28a(+)并在E.coli中表达,表达的重组Rep蛋白经Ni2+亲和纯化。采用纯化的目的蛋白作为包被抗原,建立检测PCV2 Rep蛋白抗体的间接ELISA方法。结果表明最佳抗原包被浓度为200 ng/孔,血清和二抗最佳反应时间分别为1 h和30 min。该方法具有良好的特异性和敏感性,与韩国金诺公司试剂盒的符合率为81.4%,表明建立的ELISA方法可以用于PCV2的流行病学检测。 展开更多
关键词 猪圆环病毒 rep蛋白 原核表达 间接ELISA
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rep-PCR指纹图谱技术在乳酸菌鉴定中的应用 被引量:6
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作者 满朝新 迟涛 +6 位作者 胡博韬 房玉国 王旻 周艳秋 韩琳琳 胡惠秩 姜毓君 《中国乳品工业》 CAS 北大核心 2010年第5期4-6,共3页
采用了rep-PCR指纹图谱技术,对分离自内蒙古通辽地区的传统发酵乳中的乳酸菌进行了鉴定和多样性分析。应用rep-PCR指纹图谱技术能够对实验菌株达到非常好的分辨能力。结果表明,该地区的乳酸菌呈现出非常高的多样性,其中Lactobacillus pl... 采用了rep-PCR指纹图谱技术,对分离自内蒙古通辽地区的传统发酵乳中的乳酸菌进行了鉴定和多样性分析。应用rep-PCR指纹图谱技术能够对实验菌株达到非常好的分辨能力。结果表明,该地区的乳酸菌呈现出非常高的多样性,其中Lactobacillus plantarum和Lactobacillus helveticus等6种菌种是这些传统发酵乳中常见的种,而植物乳杆菌Lactobacillus plantarum为优势种;而且还发现同一乳酸菌种群指纹图谱存在一些特征性的条带,这将为我们快速鉴定乳酸菌提供了理论依据。 展开更多
关键词 乳酸菌 rep—PCR 传统发酵乳制品
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