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黄芪根腐病菌锐顶镰刀菌的实时荧光定量PCR快速检测方法
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作者 祖未希 赵丽梅 +2 位作者 赵雪姣 王雪 高芬 《河南农业科学》 北大核心 2026年第3期107-117,共11页
锐顶镰刀菌(Fusarium acuminatum)是黄芪根腐病的重要病原菌之一。为实现锐顶镰刀菌的快速检测和准确定量,建立了一种实时荧光定量PCR(qPCR)检测方法,并对其在黄芪植株和土壤样本检测中的实用性进行验证。结果表明,基于锐顶镰刀菌EF-1... 锐顶镰刀菌(Fusarium acuminatum)是黄芪根腐病的重要病原菌之一。为实现锐顶镰刀菌的快速检测和准确定量,建立了一种实时荧光定量PCR(qPCR)检测方法,并对其在黄芪植株和土壤样本检测中的实用性进行验证。结果表明,基于锐顶镰刀菌EF-1α序列设计的引物Fae F4/Fae R4特异性强,所建方法对黄芪和土壤中锐顶镰刀菌的检测灵敏度分别为DNA质量浓度2.56×10^(-3)ng/μL和分生孢子1×10^(2)个/g,标准曲线的相关系数分别为0.9997和0.9838,扩增效率分别为1.07和0.87。重复性评价显示方法可靠、稳定。利用该方法检测发现,黄芪样本接种锐顶镰刀菌1 h后即可检测到病菌存在,且侵染量随时间逐渐上升;田间疑似根腐发病样本的锐顶镰刀菌阳性检出率为100%;田间发病和未发病土壤样本中,病菌阳性检出率也为100%,且相同种植年限的发病土带菌量显著高于未发病土。因此,所建qPCR检测方法可用于黄芪植株和土壤中锐顶镰刀菌的检测,为黄芪根腐病的精准监测和及时防控提供可靠的技术支撑。 展开更多
关键词 黄芪 根腐病 锐顶镰刀菌 实时荧光定量pcr 检测
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奶牛乳腺炎致病菌三重qPCR检测方法的建立
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作者 康新华 赵雯 牛琼 《中国牛业科学》 2026年第1期29-37,共9页
为建立奶牛乳腺炎主要致病菌的快速检测方法,选择大肠埃希氏菌(Escherichia coli)phoA基因、肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)mdh基因、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)femA基因以及内标基因ACtB的保守区序列设计合成特异性... 为建立奶牛乳腺炎主要致病菌的快速检测方法,选择大肠埃希氏菌(Escherichia coli)phoA基因、肺炎克雷伯菌(Klebsiella pneumoniae)mdh基因、金黄色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)femA基因以及内标基因ACtB的保守区序列设计合成特异性引物探针,建立了奶牛乳腺炎大肠埃希氏菌、金黄色葡萄球菌和肺炎克雷伯菌的三重荧光PCR检测方法。该方法可特异性检出3种常见的奶牛乳腺炎致病菌,与无乳链球菌、停乳链球菌、牛支原体、沙门氏菌等常见病原无交叉反应,特异性强;对phoA、mdh和femA的最低检出限分别为16.9、16.7和20.4拷贝/μL,且组内和组间变异系数均小于2%,具有良好的重复性。用该方法对90份奶牛乳腺炎生乳样本进行检测,检测结果与单一荧光PCR方法一致。表明所建立的奶牛乳腺炎大肠埃希氏菌、肺炎克雷伯菌和金黄色葡萄球菌三重荧光定量PCR检测方法具有特异性强、灵敏度高、操作简单的特点,适用于奶牛乳腺炎的临床诊断检测。 展开更多
关键词 奶牛乳腺炎 大肠埃希氏菌 肺炎克雷伯菌 金黄色葡萄球菌 三重荧光qpcr
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山茶花花香生物合成相关基因的实时荧光定量PCR内参基因的筛选及验证
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作者 陈艺荃 樊荣辉 +3 位作者 林兵 陈燕 吴建设 钟淮钦 《园艺学报》 北大核心 2026年第2期598-612,共15页
为研究山茶花花香生物合成相关基因的表达模式,筛选在山茶花中稳定表达的内参基因。利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测10个候选内参基因(α-TUB、CYP、PP2A、ACTIN1、ACTIN2、GAPDH、UBQ、AQP、UBC和HIS)在不同的组织、开花阶段、... 为研究山茶花花香生物合成相关基因的表达模式,筛选在山茶花中稳定表达的内参基因。利用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)技术检测10个候选内参基因(α-TUB、CYP、PP2A、ACTIN1、ACTIN2、GAPDH、UBQ、AQP、UBC和HIS)在不同的组织、开花阶段、品种和混合样品中的表达水平,geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder 4种算法综合评估和鉴定内参基因的表达稳定性。结果显示,10个候选内参基因的引物特异性好,均具有作为内参基因的性能;分析山茶花不同开花阶段基因表达时可选用PP2A和UBC,分析不同组织和不同香型品种基因表达时最理想的内参基因为PP2A和ACTIN1,其中PP2A在山茶花不同的组织、开花阶段、香型品种和混合样品中均能稳定表达。通过qRT-PCR扩增了花香相关的9个靶基因,验证PP2A是山茶花花香相关基因表达研究的最佳内参基因,而以传统管家基因GAPDH为内参时,山茶花芳樟醇/橙花叔醇合酶基因CaLIS/NES1和苯乙醛还原酶基因CaPAR的表达模式出现较大偏差。 展开更多
关键词 山茶花 花香 内参基因 实时荧光定量pcr 表达分析 PP2A
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槲树不同器官及盐胁迫下qRT-PCR的内参基因筛选及验证
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作者 蒋萌 白晓宁 +4 位作者 王文波 赵亚洲 胡增辉 苏淑钗 冷平生 《中南林业科技大学学报》 北大核心 2026年第1期211-220,234,共11页
[目的]筛选在不同器官及盐胁迫下表达稳定的槲树内参基因,验证所选内参基因在qRT-PCR中的适用性和稳定性,为精准评价槲树目标基因表达量提供理论依据。[方法]从槲树盐胁迫转录组中筛选出10个高表达传统管家基因作为候选内参基因(TUBA、T... [目的]筛选在不同器官及盐胁迫下表达稳定的槲树内参基因,验证所选内参基因在qRT-PCR中的适用性和稳定性,为精准评价槲树目标基因表达量提供理论依据。[方法]从槲树盐胁迫转录组中筛选出10个高表达传统管家基因作为候选内参基因(TUBA、TUBA、GAPDH、Actin、EIF2B5、UBE2W、ADCK、EEF1B、UBE2J1和EIF5A),采用geNorm、NormFinder、BestKeeper和RefFinder软件和ΔCt程序对候选基因在槲树中的表达稳定性进行分析。以槲树6个器官(根、茎、叶、叶芽、花序、种子)及盐胁迫下4个不同处理时期(CK、3 h、24 h、96 h)的叶片为样品,通过qRT-PCR技术,结合候选内参基因,验证过氧化氢酶基因QdCAT2在槲树不同器官及盐胁迫下的表达模式以及候选内参基因的表达稳定性。[结果]10个候选内参基因中,EIF5A和UBE2W的表达稳定性最高,综合排名位居前列,EIF2B5为最不稳定内参基因。QdCAT2基因在槲树叶片中表达量最高,且随着盐胁迫时间的延长,表达量呈先升高后降低的趋势,在处理3 h后达到高峰,使用EIF5A、UBE2W及EIF5A+UBE2W组合作为内参基因得到的相对表达结果基本一致,表明EIF5A和UBE2W为槲树各器官及盐胁迫最适合的内参基因。[结论]成功筛选出了2个稳定内参基因,并验证了EIF5A、UBE2W及EIF5A+UBE2W组合均适合作为槲树不同器官及盐胁迫下qRT-PCR的内参基因,为槲树不同器官及盐胁迫下基因表达分析提供了参考,并为后续槲树分子生物学研究奠定理论基础。 展开更多
关键词 槲树 实时荧光定量pcr 内参基因筛选 盐胁迫 表达分析
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弓形虫和钩端螺旋体双重荧光定量PCR方法的建立
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作者 栾扬 张亚 +5 位作者 李志敏 王蕾 毕振威 钱晶 熊富强 谭业平 《中国动物检疫》 2026年第1期118-123,130,共7页
为建立快速准确的弓形虫和钩端螺旋体检测方法,以弓形虫529 bp重复序列和钩端螺旋体LigB基因保守区域为靶标分别设计特异性引物和TaqMan MGB探针,进行双重荧光定量PCR反应体系和条件优化以及敏感性、特异性、重复性试验和临床样品检测... 为建立快速准确的弓形虫和钩端螺旋体检测方法,以弓形虫529 bp重复序列和钩端螺旋体LigB基因保守区域为靶标分别设计特异性引物和TaqMan MGB探针,进行双重荧光定量PCR反应体系和条件优化以及敏感性、特异性、重复性试验和临床样品检测。结果显示,该方法对弓形虫核酸检测限为1 copy/μL,钩端螺旋体核酸检测限为10 copies/μL;可特异性检测弓形虫和钩端螺旋体,与犬细小病毒、犬腺病毒II型、猫疱疹病毒、隐孢子虫、猫细小病毒等病原核酸无交叉反应;组内变异系数小于3.16%,组间的变异系数小于2.23%;临床样品检测验证该方法阳性检出率高于普通PCR方法,两种方法具有良好一致性。结果表明,所建立的双重荧光定量PCR方法具有敏感、特异、稳定等特性,可用于弓形虫和钩端螺旋体临床检测。 展开更多
关键词 弓形虫 钩端螺旋体 荧光定量pcr
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苹果软枝病毒2实时荧光定量PCR检测技术的建立及应用
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作者 刘成龙 李凯杰 +5 位作者 范旭东 任芳 崔亚伟 张凤娟 董雅凤 胡国君 《中国果树》 2026年第3期97-104,共8页
苹果软枝病毒2(apple rubbery wood virus 2,ARWV-2)隶属Phenuiviridae科Rubodvirus属,与苹果软枝病的发生有关。根据ARWV-2的L、Ma和Sa链基因组序列分别设计了2对引物,验证后3条链各保留1对用于荧光定量PCR(qPCR)扩增,即AR-2L-F2/R2、A... 苹果软枝病毒2(apple rubbery wood virus 2,ARWV-2)隶属Phenuiviridae科Rubodvirus属,与苹果软枝病的发生有关。根据ARWV-2的L、Ma和Sa链基因组序列分别设计了2对引物,验证后3条链各保留1对用于荧光定量PCR(qPCR)扩增,即AR-2L-F2/R2、AR-2Ma-F2/R2和AR-2Sa-F1/R1。体系优化及灵敏度测定结果显示:3对引物的最佳退火温度均为59.0℃;用量为0.4μL;扩增效率分别为92.1%、92.6%和92.1%;相关系数分别为0.996、0.996和0.998;检测灵敏度分别为10^(4)、10^(4)和10^(5),是普通PCR的100倍,且AR-2Sa-F1/R1为最优引物。随机选取150株田间苹果样品进行检测,结果显示,普通PCR对ARWV-2的检出率为12.67%,而qPCR为22.00%。建立的ARWV-2 TB Green染料法qPCR检测技术特异性强、灵敏度高,可用于田间样品的检测。 展开更多
关键词 苹果 苹果软枝病毒2 实时荧光定量pcr 检测
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血清学检测指标及实时荧光定量PCR检测在侵袭性念珠菌病患者中的诊断价值
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作者 MD ALI HOSSAIN 彭亮 +2 位作者 袁余 周晓涵 马莹 《四川大学学报(医学版)》 北大核心 2026年第1期170-176,共7页
目的评估血清学检测指标1,3-β-D-葡聚糖试验(G试验)、念珠菌甘露聚糖(Mn)抗原、念珠菌甘露聚糖IgG抗体(Mn-IgG)和实时荧光定量PCR(qPCR)检测在侵袭性念珠菌病(IC)患者中的临床诊断价值。方法收集四川大学华西医院2022年12月-2024年12... 目的评估血清学检测指标1,3-β-D-葡聚糖试验(G试验)、念珠菌甘露聚糖(Mn)抗原、念珠菌甘露聚糖IgG抗体(Mn-IgG)和实时荧光定量PCR(qPCR)检测在侵袭性念珠菌病(IC)患者中的临床诊断价值。方法收集四川大学华西医院2022年12月-2024年12月期间通过血培养及无菌体液培养确诊为IC患者的血清样本79例作为IC组,排除IC感染患者的血清样本83例作为非IC组,进行G试验(磁微粒化学发光法)、Mn抗原(ELISA法)、Mn-IgG抗体(化学发光法)和qPCR检测。比较分析G试验、Mn抗原、Mn-IgG抗体和qPCR检测及联合检测对IC诊断的敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值,绘制受试者工作特征(ROC)曲线并计算ROC曲线下面积(AUC)。结果3种血清学检测指标单独检测对IC诊断的敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值分别为:G试验62.03%、94.87%、92.45%、71.15%;Mn抗原65.63%、86.59%、79.25%、76.34%;Mn-IgG抗体31.65%、87.95%、71.43%、57.48%。G试验、Mn抗原、Mn-IgG三项联合检测敏感性提高至73.44%。基于ROC曲线分析,各血清学检测指标诊断IC的AUC分别为:G试验0.862(95%CI:0.803-0.922)、Mn试验0.853(95%CI:0.790-0.915)、Mn-IgG 0.603(95%CI:0.514-0.692)。G试验+Mn试验两项联合检测、G试验+Mn-IgG两项联合检测、G试验+Mn试验+Mn-IgG三项联合检测的AUC分别为0.875(95%CI:0.809-0.925)、0.869(95%CI:0.805-0.917)和0.875(95%CI:0.809-0.924),优于单独检测。qPCR对IC诊断的敏感性、特异性、阳性预测值、阴性预测值分别为100.00%、98.80%、98.75%、100.00%。以培养菌株基质辅助激光解吸电离飞行时间质谱仪(MALDI-TOF MS)鉴定结果为金标准,qPCR检测对白念珠菌、热带念珠菌、光滑念珠菌、近平滑念珠菌的诊断一致性分别为100.00%、100.00%、94.44%和90.00%。结论G试验、Mn抗原和Mn-IgG抗体联合检测可提高诊断敏感性,有助于IC的早期诊断。qPCR对IC具有优异的诊断性能,可将IC常见念珠菌鉴定至种水平,并可覆盖其他念珠菌种,与临床培养方法结果一致性好。 展开更多
关键词 1 3-β-D葡聚糖 念珠菌甘露聚糖抗原 念珠菌甘露聚糖IgG抗体 实时荧光定量pcr 侵袭性念珠菌病
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GPV,GPMV,GoCV多重实时荧光定量PCR检测方法研究
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作者 刘久源 辛鹏 +2 位作者 刘贤琳 王艺威 董浩 《吉林农业大学学报》 北大核心 2026年第1期165-172,共8页
为快速精准判断吉林省内鹅细小病毒(GPV)、鹅副黏病毒(GPMV)和鹅圆环病毒(GoCV)的流行情况,以Taqman荧光定量PCR检测技术为基础,分别以VP3、F和Rep复制区为靶基因,设计3组不同的特异性引物和探针,建立能够同时检测3种常见雏鹅易感病毒... 为快速精准判断吉林省内鹅细小病毒(GPV)、鹅副黏病毒(GPMV)和鹅圆环病毒(GoCV)的流行情况,以Taqman荧光定量PCR检测技术为基础,分别以VP3、F和Rep复制区为靶基因,设计3组不同的特异性引物和探针,建立能够同时检测3种常见雏鹅易感病毒的检测方法。结果表明:建立的多重荧光定量检测方法仅对鹅细小病毒、鹅圆环病毒和鹅副黏病毒存在特异性扩增,与其他鹅类病毒或常见病原不存在交叉反应;最低检测限分别为6.59×10^(1),5.57×10^(1),4.89×10^(1)copies/μL,相较常规PCR灵敏性分别高10^(3)倍,10^(2)倍和10^(2)倍,且重复性较好,组间和组内变异系数均<2%。对50份样本进行检测,多重荧光定量PCR分别检测出4份GPV,2份GPMV,12份GoCV,GPV与GoCV混合感染1份,结果与常规PCR检测一致。建立的检测方法能够同时检测GPV,GPMV和GoCV 3种鹅类病毒,且检测效率较高,能够为3种鹅类易感病毒疫情的早期防控提供可靠技术支持。 展开更多
关键词 鹅细小病毒 鹅副黏病毒 鹅圆环病毒 荧光定量pcr 探针法
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荧光定量PCR法与液体培养法检测解脲脲原体结果比较及阳性标本的药敏分析
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作者 代红丹 李红林 王希 《皮肤性病诊疗学杂志》 2026年第1期16-20,共5页
目的比较荧光定量PCR法与液体培养法检测解脲脲原体(Uu)的阳性率,并对单纯Uu阳性标本进行药敏分析,为临床上Uu感染的诊断和治疗提供依据。方法回顾性分析重庆市中医院2022年1月—2024年12月368例采用荧光定量PCR法和液体培养法进行Uu检... 目的比较荧光定量PCR法与液体培养法检测解脲脲原体(Uu)的阳性率,并对单纯Uu阳性标本进行药敏分析,为临床上Uu感染的诊断和治疗提供依据。方法回顾性分析重庆市中医院2022年1月—2024年12月368例采用荧光定量PCR法和液体培养法进行Uu检测患者的结果,比较两种方法检测的阳性率,分析两种方法检测均阳性的样本资料,并对单纯Uu阳性标本进行药敏分析。结果荧光定量PCR法与液体培养法对Uu检测的阳性率差异有统计学意义(P=0.004),两种方法检测Uu均为阳性的患者71例,阳性率为19.29%,其中女32例(35.56%),男39例(14.03%),女性比例明显高于男性(χ^(2)=20.23,P<0.001)。仅液体培养法阳性的98例,阳性率为26.63%;仅PCR法阳性的80例,阳性率为21.74%。两种方法检测结果一致性为中等(Kappa=0.734)。两种方法检测Uu均阳性的患者年龄主要集中在20~39岁。单纯Uu阳性58例,对美满霉素和交沙霉素的敏感率均为100%,对强力霉素和克拉霉素的敏感率均在90%以上。结论荧光定量PCR法和液体培养法对Uu检测的阳性率有差异,必要时考虑两种方法联合检测以提高检测的准确性。临床上对Uu阳性患者进行治疗时可将敏感性较高的美满霉素、交沙霉素、强力霉素和克拉霉素作为首选。 展开更多
关键词 解脲脲原体 荧光定量pcr 液体培养法
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Expression of O<sup>6</sup>-Methylguanine-DNA Methyltransferase Examined by Alkyl-Transfer Assays, Methylation-Specific PCR and Western Blots in Tumors and Matched Normal Tissue 被引量:1
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作者 Kimiko Ishiguro Krishnamurthy Shyam +4 位作者 Philip G. Penketh Raymond P. Baumann Alan C. Sartorelli Thomas J. Rutherford Elena S. Ratner 《Journal of Cancer Therapy》 2013年第4期919-931,共13页
The tumor selectivity of alkylating agents that produce guanine O6-chloroethyl (laromustine and carmustine) and O6-methyl (temozolomide) lesions depends upon O6-methylguanine-DNA methyltransferase (MGMT) activity bein... The tumor selectivity of alkylating agents that produce guanine O6-chloroethyl (laromustine and carmustine) and O6-methyl (temozolomide) lesions depends upon O6-methylguanine-DNA methyltransferase (MGMT) activity being lower in tumor than in host tissue. Despite the established role of MGMT as a tumor resistance factor, consensus on how to assess MGMT expression in clinical samples is unsettled. The aim of this study is to examine the relationship between the values derived from distinctive MGMT measurements in 13, 12, 6 and 2 pairs of human tumors and matched normal adjacent tissue from the colon, kidney, lung and liver, respectively, and in human cell lines. The MGMT measurements included 1) alkyl-transfer assays using [benzene-3H]O6-benzylguanine as a substrate to assess functional MGMT activity, 2) methylation-specific PCR (MSP) to probe MGMT gene promoter CpG methylations as a measure of gene silencing, and 3) western immunoblots to analyze the MGMT protein. In human cell lines, a strict negative correlation existed between MGMT activity and the extent of promoter methylation. In tissue specimens, by contrast, the correlation between these two variables was low. Moreover, alkyl-transfer assays identified 3 pairs of tumors and normal tissue with tumor-selective reduction in MGMT activity in the absence of promoter methylation. Cell line MGMT migrated as a single band in western analyses, whereas tissue MGMT was heterogeneous around its molecular size and at much higher molecular masses, indicative of multi-layered post-translational modifications. Malignancy is occasionally associated with a mobility shift in MGMT. Contrary to the prevalent expectation that MGMT expression is governed at the level of gene silencing, these data suggest that other mechanisms that can lead to tumorselective reduction in MGMT activity exist in human tissue. 展开更多
关键词 O6-Methylguanine-DNA METHYLTRANSFERASE (MGMT O6-Alkylguanine-DNA ALKYLTRANSFERASE AGT) [Benzene-3H]O6-Benzylguanine methylation-specific pcr (MSP) Laromustine (Onrigin Cloretazine VNP40101M 101M) TEMOZOLOMIDE
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实时荧光定量PCR与传统方法诊断HIV感染者合并耶氏肺孢子菌肺炎的效能比较
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作者 许少莉 王梦琦 +1 位作者 马丹丹 侯淑芬 《临床研究》 2026年第1期121-123,128,共4页
目的探讨实时荧光定量PCR(qPCR)与传统染色技术在艾滋病(HIV)感染者合并耶氏肺孢子菌肺炎中的诊断效能。方法选取2023年12月至2025年4月郑州市第六人民医院接收的130例疑似耶氏肺孢子菌肺炎的HIV感染者,共收集130份呼吸道标本(BALF或痰... 目的探讨实时荧光定量PCR(qPCR)与传统染色技术在艾滋病(HIV)感染者合并耶氏肺孢子菌肺炎中的诊断效能。方法选取2023年12月至2025年4月郑州市第六人民医院接收的130例疑似耶氏肺孢子菌肺炎的HIV感染者,共收集130份呼吸道标本(BALF或痰液)。所有患者于入院48 h内采集支气管肺泡灌洗液(BALF)或痰液,同期开展qPCR与传统染色[六胺银(GMS)染色]检测,比较两种方法的耶氏肺孢子菌肺炎诊断效能。结果所有130例均完成GMS染色检测,以临床最终裁决诊断为参照。GMS染色检出耶氏肺孢子菌肺炎19例(真阳19例,假阳0例),非耶氏肺孢子菌肺炎111例(真阴48例,假阴63例),其敏感度为23.17%(19/82),特异度为100.00%(48/48)。qPCR检出耶氏肺孢子菌肺炎84例(真阳78例,假阳6例),非耶氏肺孢子菌肺炎46例(真阴42例,假阴4例),其敏感度为95.12%(78/82),特异度为87.50%(42/48)。与GMS染色相比,qPCR法表现出明显更高的敏感度与总体准确度。两种方法均具有较高的特异度,GMS染色法特异度高于qPCR法。配对McNemar检验提示两法敏感度、特异度、准确率均存在统计学差异(P<0.05)。结论在HIV感染者疑似耶氏肺孢子菌肺炎的诊断中,qPCR相较于传统GMS染色,其敏感度与准确度较高。建议以qPCR作为首选检测手段,结合GMS染色及临床综合证据进行分层判定,以减少漏诊、提升诊断效率并优化治疗决策。 展开更多
关键词 艾滋病感染者 耶氏肺孢子菌肺炎 实时荧光定量pcr 六胺银染色 诊断效能 支气管肺泡灌洗液
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重组人肝细胞生长因子裸质粒注射液外源性DNA残留量实时荧光定量PCR检测方法的建立及验证
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作者 张波 王艺诺 +4 位作者 马杉姗 张彦兴 马素永 李尚儒 侯慧丽 《中国生物制品学杂志》 2026年第2期195-200,共6页
目的建立特异的重组人肝细胞生长因子(hepatocyte growth factor,HGF)裸质粒注射液产品中大肠埃希菌宿主DNA残留量的实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)检测方法,并进行验证及初步应用,为该药物的质量控制提供可靠依据,... 目的建立特异的重组人肝细胞生长因子(hepatocyte growth factor,HGF)裸质粒注射液产品中大肠埃希菌宿主DNA残留量的实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qPCR)检测方法,并进行验证及初步应用,为该药物的质量控制提供可靠依据,同时为同类基因治疗产品的安全性评价提供参考.方法以大肠埃希菌16SrRNA基因为靶序列,设计特异性引物及探针,通过qPCR法检测DNA残留量.对建立的方法进行专属性、线性与范围、定量下限、准确度、重复性及中间精密度验证,并对3批重组人HGF裸质粒注射液原液的外源性DNA残留量进行检测.结果该方法DNA浓度在0.01~100 pg/μL范围内时,线性关系良好,R^(2)为0.999,定量下限为0.01 pg/μL;该方法对CHO细胞的DNA无特异性扩增曲线;高、中、低浓度DNA加标量样品的回收率分别为104.0%、105.1%和100.0%;重复性和中间精密度检测值的RSD均小于30%.该方法检测3批原液的外源性DNA残留量均低于2μg/mg质粒.结论建立的qPCR法灵敏度高,特异性强,准确度和中间精密度良好,适用于重组人HGF裸质粒注射液及其他大肠埃希菌表达产品的外源性DNA残留量检测. 展开更多
关键词 肝细胞生长因子 重组裸质粒 外源性DNA残留量 实时荧光定量pcr 质量控制
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转基因大豆DBN8205转化体特异性定量PCR方法的研发和验证
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作者 吴琼 谢香庭 +2 位作者 王磊 牟勇 李进伟 《中国农业科学》 北大核心 2026年第1期29-40,共12页
【目的】转基因大豆DBN8205转化体已获批转基因生物安全证书(生产应用),转育品种即将产业化应用,建立DBN8205转化体特异性定性定量检测方法,为转基因生物安全监管和定量标识制度的实施提供依据。【方法】根据DBN8205转化体的分子特征序... 【目的】转基因大豆DBN8205转化体已获批转基因生物安全证书(生产应用),转育品种即将产业化应用,建立DBN8205转化体特异性定性定量检测方法,为转基因生物安全监管和定量标识制度的实施提供依据。【方法】根据DBN8205转化体的分子特征序列,设计转化体特异性引物和探针。通过比较多个引物探针组合的扩增曲线及Ct值,筛选出最佳引物探针组合。分别在实时荧光定量PCR和微滴数字PCR平台上考察DBN8205转化体特异性PCR方法的特异性、检测限、定量限、动力学范围和定量准确性等技术参数。制定标准方法联合验证方案,邀请多家实验室对实时荧光定量PCR方法进行联合验证,对联合验证数据进行统计分析,考察方法的重复性和重现性。【结果】筛选出最佳引物探针组合DBN8205-QF/QR/QP,扩增产物长120 bp,仅特异性识别DBN8205转化体成分,具有良好的扩增特异性。在实时荧光定量PCR平台上,检测限为10 copies,定量限为40 copies,标准曲线的各项技术参数符合标准要求,在40—8.2×10^(4)copies动力学范围内,模板拷贝数和Ct值间具有良好的线性关系,能够对含量低至0.1%的样品进行准确定量。8家实验室联合验证结果表明,DBN8205转化体特异性实时荧光定量PCR方法具有良好的重复性和重现性。在微滴数字PCR平台上,检测限和定量限与实时荧光定量PCR方法相同,分别为10和40 copies,动力学范围为40—8.0×10^(4)copies,能够对低至0.1%的样品进行准确定量,定量结果比qPCR具有更高的精密度。t检验表明,实时荧光定量PCR和二重微滴数字PCR的定量结果具有良好的一致性。【结论】建立的DBN8205转化体特异性定量PCR方法能够对DBN8205转化体进行身份鉴定,可在实时荧光定量PCR和微滴数字PCR平台上对产品中的DBN8205转化体成分进行精准定量分析。 展开更多
关键词 转基因大豆 DBN8205转化体 实时荧光定量pcr 二重微滴数字pcr 定量
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禽痘病毒微滴数字PCR检测方法的建立及应用
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作者 张熠帆 韩笑 +5 位作者 张叶娜 孔朋莉 宋厚辉 张晓峰 王晓杜 帅江冰 《畜牧兽医学报》 北大核心 2026年第1期337-348,共12页
旨在建立一种禽痘病毒(fowlpox virus,FWPV)微滴式数字聚合酶链式反应(digital droplet PCR,ddPCR)检测方法。本研究通过对反应体系优化,包括引物和探针浓度的优化、退火温度的优化等步骤,进行重复性、敏感性、特异性试验,建立了较为完... 旨在建立一种禽痘病毒(fowlpox virus,FWPV)微滴式数字聚合酶链式反应(digital droplet PCR,ddPCR)检测方法。本研究通过对反应体系优化,包括引物和探针浓度的优化、退火温度的优化等步骤,进行重复性、敏感性、特异性试验,建立了较为完整的ddPCR反应体系。本方法确定FWPV ddPCR反应体系最佳引物浓度为900 nmol·L^(-1),最佳探针浓度为200 nmol·L^(-1),且在55℃反应条件下,ddPCR检测结果最优;本方法与其他常见禽类病毒无交叉反应,特异性强;本方法重复性好,批间与批内变异系数均小于10%。本ddPCR方法最低检测限为2.37拷贝·反应-1。采用建立的ddPCR检测方法和行业标准(SN/T 1226—2015)检测方法对80份模拟样本进行检测,其中8份作为阴性,其余72份样品作为模拟感染样品,符合率为100%,比行业标准套式PCR方法符合率高出75%。在25份人工攻毒样本中,ddPCR对阳性样本的检出率达100%,行业标准套式PCR方法对阳性样本的检出率为33.3%。本方法的建立为检测禽及其肉制品中禽痘病毒提供了痕量精准检测方法,为降低禽痘对禽类养殖产业风险带来保障。 展开更多
关键词 禽痘病毒 微滴数字pcr 定量检测
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基于TaqMan探针实时荧光定量PCR的白蜡鞘孢菌分子鉴定技术
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作者 杨春光 李辉 +2 位作者 刘亚乔 薛腾 李鑫 《中国森林病虫》 北大核心 2026年第1期60-64,共5页
为快速准确检测白蜡枯梢病病原菌白蜡鞘孢菌Hymenoscyphus fraxineus,选择ITS和翻译延长因子1α(TEF1)基因为靶标,设计特异性引物与探针,构建目标菌株的TaqMan探针qPCR检测体系,并通过优化退火温度和引物与探针浓度完善该检测体系。结... 为快速准确检测白蜡枯梢病病原菌白蜡鞘孢菌Hymenoscyphus fraxineus,选择ITS和翻译延长因子1α(TEF1)基因为靶标,设计特异性引物与探针,构建目标菌株的TaqMan探针qPCR检测体系,并通过优化退火温度和引物与探针浓度完善该检测体系。结果表明,TaqMan探针qPCR体系可特异性扩增目标菌株靶标基因,最低DNA检测浓度为1.0 pg/μL;利用该检测体系可实现对白蜡鞘孢菌的高效率鉴定和疫情监控,为口岸外来有害生物防控、生态安全保护提供技术服务与支持。 展开更多
关键词 TAQMAN探针 实时荧光定量pcr 白蜡鞘孢菌 灵敏度
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菜豆细菌性萎蔫病菌探针法实时荧光定量PCR检测技术的建立
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作者 牟桂萍 闫晓东 +4 位作者 许然 胡加谊 曾杨森 黎玮琪 易建平 《植物病理学报》 北大核心 2026年第1期132-141,共10页
为快速准确检测菜豆细菌性萎蔫病菌(Curtobacterium flaccumfaciens pv.flaccumfaciens,Cff),根据GenBank中Cff的序列设计特异性探针Cff-P,并首次建立了Cff探针法实时荧光定量PCR(TaqMan quantitative real-time PCR,qPCR)检测方法。经... 为快速准确检测菜豆细菌性萎蔫病菌(Curtobacterium flaccumfaciens pv.flaccumfaciens,Cff),根据GenBank中Cff的序列设计特异性探针Cff-P,并首次建立了Cff探针法实时荧光定量PCR(TaqMan quantitative real-time PCR,qPCR)检测方法。经验证,探针Cff-P能扩增供试的34株Cff菌株,其他66株供试的非Cff菌株以及空白对照均为阴性,不同稀释度菌体DNA的扩增结果显示,该方法的检测灵敏度为50 fg·μL^(-1)菌体DNA。140个豆类种子样品的检测结果表明该检测方法可用于豆类种子样品中Cff的快速检测。本研究建立的TaqMan探针法实时荧光定量PCR检测方法,为我国农业部门和进境口岸Cff快速筛查提供了技术支持。 展开更多
关键词 菜豆细菌性萎蔫病菌 检测 TaqMan探针法实时荧光定量pcr
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猪圆环病毒2型和3型Taq Man双重荧光定量PCR方法的建立及应用
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作者 韩峰 张军 +6 位作者 李铎 吴承月 闫才杰 王紫荷 王秀锦 刘吉英 张振东 《动物医学进展》 北大核心 2026年第2期21-28,共8页
通过比对GenBank中猪圆环病毒2型(PCV2)和猪圆环病毒3型(PCV3)基因组序列,选取PCV2和PCV3 Cap基因片段的保守区间,各设计1对特异性引物和1条Taq Man MGB探针,优化各反应条件后,进行特异性、敏感性和重复性试验,建立鉴别PCV2与PCV3的Taq ... 通过比对GenBank中猪圆环病毒2型(PCV2)和猪圆环病毒3型(PCV3)基因组序列,选取PCV2和PCV3 Cap基因片段的保守区间,各设计1对特异性引物和1条Taq Man MGB探针,优化各反应条件后,进行特异性、敏感性和重复性试验,建立鉴别PCV2与PCV3的Taq Man双重qPCR检测方法。结果显示,PCV2、PCV3阳性质粒标准品的最低检出浓度分别为10^(2)copies/μL、10^(0)copies/μL,敏感性较高;该方法可特异性扩增PCV2、PCV3的核酸,检测伪狂犬病病毒(PRV)、猪繁殖与呼吸综合征病毒(PRRSV)、猪传染性胃肠炎病毒(TGEV)等其他6种病原核酸以及阴性对照均无交叉反应;组内与组间平行试验的变异系数(CV)值均在1%以下,R^(2)值分别为0.983、0.996,表明稳定性、重复性较好;利用本研究建立的方法对母猪血、断奶仔猪血、睾丸液等431份临床样品进行检测,结果显示,PCV2和PCV3的阳性率分别为9.3%和37.1%,共感染的阳性率为8.4%。对获得的阳性序列进行测序分析,其中9条PCV2序列均属于2d型,19条PCV3序列中有18条序列属于3a型,2条序列属于3b型。研究成功建立了PCV2与PCV3 Taq Man双重qPCR方法,为两种疾病的临床鉴别及流行病学调查提供了技术支持。 展开更多
关键词 PCV2 PCV3 双重Taq Man荧光定量pcr 混合感染
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禽白血病病毒A/J和B/K亚群双重TaqMan荧光定量PCR检测方法的建立
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作者 檀子卿 蒋艳妹 +5 位作者 张亚婷 张瑞函 李梦婷 熊树德 刘永相 范春艳 《中国家禽》 北大核心 2026年第2期71-78,共8页
研究旨在建立一种同时检测禽白血病病毒(Avian leukosis virus,ALV)A、J亚群和B、K亚群的双重TaqMan荧光定量PCR检测方法。试验通过比对GenBank中ALV各亚群全基因组序列,设计针对A/J(LTR区)与B/K(env基因区)亚群的特异性引物和探针,构... 研究旨在建立一种同时检测禽白血病病毒(Avian leukosis virus,ALV)A、J亚群和B、K亚群的双重TaqMan荧光定量PCR检测方法。试验通过比对GenBank中ALV各亚群全基因组序列,设计针对A/J(LTR区)与B/K(env基因区)亚群的特异性引物和探针,构建重组质粒标准品建立双重TaqMan荧光定量PCR检测方法,并与常规PCR比较临床样本的检测效果。结果显示:建立的方法对A/J和B/K亚群的检测限分别为10 copies/μL和10^(2) copies/μL,灵敏度分别比常规PCR提高10倍和100倍;标准曲线相关性良好(R^(2)≥0.998),扩增效率为93.6%与96.2%;该方法仅对A、B、J、K亚群ALV产生扩增信号,不与其他常见禽类病原发生交叉反应;批内和批间变异系数(CV)均低于1%,表明建立的方法重复性良好;该方法检测100份临床样本共检出A/J阳性样本20份、B/K阳性样本2份,阳性检出率高于常规PCR,且与ELSIA检测结果符合率达100%。综上所述,研究建立的方法具有高灵敏度、高特异性和良好的稳定性,适用于临床样本的快速、精准检测,可为ALV的种群净化和流行病学监测提供可靠的技术支持。 展开更多
关键词 禽白血病病毒 双重荧光定量pcr TAQMAN探针 AJ/BK亚群
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防风混淆品水防风的DNA条形码及荧光定量PCR快速检查方法建立
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作者 卢文森 胥爱丽 +7 位作者 李养学 李素梅 刘权 陈婉纯 邬旻珊 刘焰嫦 韦兴沁 陈伟韬 《中药新药与临床药理》 北大核心 2026年第3期537-542,共6页
目的基于DNA条形码及荧光定量PCR(qPCR)检查法建立防风药材混淆品水防风的快速检查方法。方法建立基于ITS2序列防风、水防风DNA条形码,寻找防风和水防风的特异性位点,以邻接法构建防风及其伪品水防风的系统发育树;根据水防风特异性位点... 目的基于DNA条形码及荧光定量PCR(qPCR)检查法建立防风药材混淆品水防风的快速检查方法。方法建立基于ITS2序列防风、水防风DNA条形码,寻找防风和水防风的特异性位点,以邻接法构建防风及其伪品水防风的系统发育树;根据水防风特异性位点设计特异性引物(SFF、SFR),建立水防风荧光定量PCR方法;考察水防风qPCR检查法的掺伪检出限及灵敏度,并对市场收集的多批防风及其混淆品水防风样品进行快速检测。结果防风及其伪品水防风DNA条形码系统发育树中31批防风样品与6批水防风样品呈现不同分支。qPCR结果显示,水防风Ct值明显小于防风,其中水防风检出限为0.655 ng·mL^(-1);在防风DNA中掺杂1%水防风DNA时仍可检出。37批药材样品中,6批Ct值均<26为水防风,30批Ct值均>33为防风,1批Ct值为30.68,为防风掺水防风,qPCR检查结果与DNA条形码、电泳检测结果一致。结论本研究建立的防风混淆品水防风qPCR检测方法准确、灵敏度高,操作简便快捷,可应用于防风混淆品水防风的快速鉴别。 展开更多
关键词 防风 水防风 荧光定量pcr DNA条形码 中药材鉴别 快速鉴别
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针对禽致病性大肠埃希菌ISS及ompT基因的TaqMan双重荧光定量PCR方法的建立及应用
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作者 林蔚 武景琦 +3 位作者 杨佳美 郭影成 李立恒 赵丽丽 《实验动物科学》 2026年第1期22-27,共6页
目的建立一种检测禽致病性大肠埃希菌(APEC)的双重TaqMan qPCR方法。方法以APEC保守基因ISS(血清抗性基因)及ompT(保护蛋白基因)为靶标设计特异性引物,以Blunt-ISS及Blunt-ompT质粒标准品为模板,建立双重qPCR检测方法。结果ISS建立的qPC... 目的建立一种检测禽致病性大肠埃希菌(APEC)的双重TaqMan qPCR方法。方法以APEC保守基因ISS(血清抗性基因)及ompT(保护蛋白基因)为靶标设计特异性引物,以Blunt-ISS及Blunt-ompT质粒标准品为模板,建立双重qPCR检测方法。结果ISS建立的qPCR方法标准曲线为Y=-3.367+38.518,R^(2)=0.99,拷贝数10^(2)~10^(9)范围内与Ct值有很好的线性关系;ompT建立的qPCR方法标准曲线为Y=-3.314+36.817,R^(2)=0.997,拷贝数10^(2)~10^(9)范围内与Ct值有很好的线性关系。特异性试验显示两种方法与其他鸭病无交叉反应;敏感性实验表明,两种方法对Blunt-ISS及Blunt-ompT的最低检测限均为10^(2)拷贝数;重复性实验表明,相同条件下建立的两种方法重复性良好;60份临床组织样品检测结果与普通PCR符合率为100%。结论本研究建立的TaqMan qPCR方法特异性强,灵敏性高,重复性好,适用于临床检测。 展开更多
关键词 禽致病性大肠埃希菌 ISS OMPT 双重荧光定量pcr TAQMAN
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