目的基于基因芯片数据分析PHD锌指蛋白19(PHD finger protein 19,PHF19)在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达及预后价值。方法下载癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)肺癌患者数据并分析PHF19在肺癌...目的基于基因芯片数据分析PHD锌指蛋白19(PHD finger protein 19,PHF19)在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达及预后价值。方法下载癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)肺癌患者数据并分析PHF19在肺癌中表达,通过基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载数据集GSE30219,GSE50081筛选患者分别纳入训练集和验证集,并分析PHF19表达与肺癌患者性别、年龄、肿瘤临床分期、病理类型与无病生存率(disease free survival,DFS)、总生存率(overall survival,OS)的关系,通过在线数据库对肺癌患者PHF19及共表达相关基因进行基因本体论与京都基因和基因组百科全书(Gene Ontology and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,GO-KEGG)富集分析、免疫浸润分析。结果TCGA、GEO数据显示PHF19在肺癌中高表达(P<0.001),PHF19表达与肿瘤分期相关。PHF19低表达组的NSCLC患者较高表达组具有更长的DFS及OS(P均<0.05)。多因素COX回归分析显示PHF19为NSCLC患者独立预后影响因素(P<0.05)。绘制列线图预测肺癌患者的生存率并验证C指数表明模型准确度良好。基因富集分析显示PHF19高表达主要与细胞周期、细胞核、染色质等相关。免疫浸润分析显示PHF19与免疫细胞浸润密切相关。结论PHF19可作为预测NSCLC预后的指标,PHF19高表达是NSCLC不良预后的独立预测因子,可能是其治疗的新的靶点。展开更多
目的探讨PHF2在乳腺癌细胞和组织中的表达及其与乳腺癌临床病理特征、预后的关系。方法采用q RT-PCR法检测乳腺癌及正常乳腺上皮细胞株(n=7)及配对的癌旁组织(n=30)中PHF2 m RNA的表达水平;应用Western blot法检测乳腺癌细胞株中PHF2蛋...目的探讨PHF2在乳腺癌细胞和组织中的表达及其与乳腺癌临床病理特征、预后的关系。方法采用q RT-PCR法检测乳腺癌及正常乳腺上皮细胞株(n=7)及配对的癌旁组织(n=30)中PHF2 m RNA的表达水平;应用Western blot法检测乳腺癌细胞株中PHF2蛋白的表达水平,免疫组化法检测乳腺癌组织(n=50)和癌旁组织(n=15)中PHF2蛋白的表达,分析PHF2表达与乳腺癌临床病理特征的关系及预后的关系。结果与正常人乳腺上皮细胞相比,PHF2 m RNA和蛋白在乳腺癌细胞株中表达下调(P<0.01);与癌旁组织相比,PHF2 m RNA在90%(27/30)的乳腺癌组织中表达下调(P<0.05);免疫组化结果显示:在70%(35/50)的乳腺癌组织中PHF2蛋白表达下调(P<0.05);PHF2表达下调与乳腺癌患者的淋巴结转移、ER阴性及预后密切相关(P<0.05)。结论 PHF2在乳腺癌中表达下调,可以作为乳腺癌预后判断的指标之一,有望成为乳腺癌治疗的新靶点。展开更多
采用PHF-LSM(permeability-based hydraulic fracture-level set method)水力压裂计算模型,建立了含节理分布的岩石材料模型,将其计算结果与裂缝几何特征和诱发应力理论解对比验证模型正确性,在此基础上分析节理对水力裂缝应力阴影效应...采用PHF-LSM(permeability-based hydraulic fracture-level set method)水力压裂计算模型,建立了含节理分布的岩石材料模型,将其计算结果与裂缝几何特征和诱发应力理论解对比验证模型正确性,在此基础上分析节理对水力裂缝应力阴影效应的影响.计算结果表明:基于弥散裂缝模型的PHF模型应使用等效开裂区域最外侧结点位移差作为裂缝等效开度;节理的存在会影响裂缝注水过程中水压力变化,同时会引起裂缝等效开度的增大;较大的节理入射角度与距注水点较小的节理高度会产生更大诱发应力,同时会引起最小主应力方向的改变,导致更强应力阴影效应,裂缝偏转加强.展开更多
基于PHF(permeability-based hydraulic fracture)模型,采用水平集方法(level set method,LSM)描述材料边界分布,并用多尺度方法MT模型,对材料有效参数进行均匀化,建立适用于考虑非均质岩石材料细观界面特征分布与水力裂缝动态发展过程...基于PHF(permeability-based hydraulic fracture)模型,采用水平集方法(level set method,LSM)描述材料边界分布,并用多尺度方法MT模型,对材料有效参数进行均匀化,建立适用于考虑非均质岩石材料细观界面特征分布与水力裂缝动态发展过程的PHF-LSM-MT数值计算模型.该模型解决了已有PHF-LSM模型无法精确描述积分点作用范围内细观尺度材料分布特征的问题.通过比较包裹体几何分布和体积分数影响下的有效弹性参数,验证了采用MT模型均匀化细观特征的可行性;在此基础上,对非均质岩石水力裂缝发展过程进行研究,得到了考虑细观界面特征情况下的裂缝发展过程,探讨了等效开裂区域影响范围内关键位置的水压力变化特征和应力路径发展过程.展开更多
基于渗透率修正和水平集法的水力压裂数值计算模型(permeability-based hydraulic fracture-level set method,PHF-LSM)是以Biot固结理论为基础建立一种弥散裂缝模型.模型是通过弱化开裂及损伤区域岩石材料性质来模拟裂缝的发展过程,因...基于渗透率修正和水平集法的水力压裂数值计算模型(permeability-based hydraulic fracture-level set method,PHF-LSM)是以Biot固结理论为基础建立一种弥散裂缝模型.模型是通过弱化开裂及损伤区域岩石材料性质来模拟裂缝的发展过程,因此求解过程中无法给出水力裂缝的几何特征.依据水力裂缝传播过程中的平均有效应力场分布建立PHF-LSM方法的水力裂缝的等效路径和等效高度;依据等效传播路径周围位移场计算水力裂缝的等效开度,并通过与KGD理论模型对比进行验证所提方法的有效性.计算了均质和非均质岩石材料中裂缝等效几何特征的动态发展特性.结果表明,所提出的等效计算方法弥补了PHF-LSM无法得到水力裂缝几何特征的不足.展开更多
采用PHF-LSM(permeability-based hydraulic fracture-level set method)水力压裂数值计算模型,模拟并分析了均质与分层岩石材料中分段压裂过程引起的应力阴影效应.通过与单一裂缝诱发应力理论解的对比,验证了PHF-LSM考虑应力阴影效应...采用PHF-LSM(permeability-based hydraulic fracture-level set method)水力压裂数值计算模型,模拟并分析了均质与分层岩石材料中分段压裂过程引起的应力阴影效应.通过与单一裂缝诱发应力理论解的对比,验证了PHF-LSM考虑应力阴影效应的可行性.以此模型为基础分析了单一裂缝发展过程中,岩石材料参数与初始应力条件对诱发应力场的影响,以及均质与分层岩石材料的多裂缝起裂过程中不同压裂间距与压裂顺序产生的应力阴影效应.数值计算结果表明:泊松比、抗拉强度与孔隙率的增加会增大裂缝引起的诱发应力与净压力比值的峰值,而弹性模量和水平主应力差的增大会减小该峰值;裂缝间距的扩大可以减弱裂缝间应力阴影效应;两步压裂与顺序压裂的裂缝总面积均大于同时压裂时的面积,但顺序压裂与两步压裂会带来更高的起裂压力;产层厚度与压裂间距的减小会增大应力阴影效应.展开更多
文摘目的基于基因芯片数据分析PHD锌指蛋白19(PHD finger protein 19,PHF19)在非小细胞肺癌(non-small cell lung cancer,NSCLC)中的表达及预后价值。方法下载癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)肺癌患者数据并分析PHF19在肺癌中表达,通过基因表达数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载数据集GSE30219,GSE50081筛选患者分别纳入训练集和验证集,并分析PHF19表达与肺癌患者性别、年龄、肿瘤临床分期、病理类型与无病生存率(disease free survival,DFS)、总生存率(overall survival,OS)的关系,通过在线数据库对肺癌患者PHF19及共表达相关基因进行基因本体论与京都基因和基因组百科全书(Gene Ontology and Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,GO-KEGG)富集分析、免疫浸润分析。结果TCGA、GEO数据显示PHF19在肺癌中高表达(P<0.001),PHF19表达与肿瘤分期相关。PHF19低表达组的NSCLC患者较高表达组具有更长的DFS及OS(P均<0.05)。多因素COX回归分析显示PHF19为NSCLC患者独立预后影响因素(P<0.05)。绘制列线图预测肺癌患者的生存率并验证C指数表明模型准确度良好。基因富集分析显示PHF19高表达主要与细胞周期、细胞核、染色质等相关。免疫浸润分析显示PHF19与免疫细胞浸润密切相关。结论PHF19可作为预测NSCLC预后的指标,PHF19高表达是NSCLC不良预后的独立预测因子,可能是其治疗的新的靶点。
文摘目的探讨PHF2在乳腺癌细胞和组织中的表达及其与乳腺癌临床病理特征、预后的关系。方法采用q RT-PCR法检测乳腺癌及正常乳腺上皮细胞株(n=7)及配对的癌旁组织(n=30)中PHF2 m RNA的表达水平;应用Western blot法检测乳腺癌细胞株中PHF2蛋白的表达水平,免疫组化法检测乳腺癌组织(n=50)和癌旁组织(n=15)中PHF2蛋白的表达,分析PHF2表达与乳腺癌临床病理特征的关系及预后的关系。结果与正常人乳腺上皮细胞相比,PHF2 m RNA和蛋白在乳腺癌细胞株中表达下调(P<0.01);与癌旁组织相比,PHF2 m RNA在90%(27/30)的乳腺癌组织中表达下调(P<0.05);免疫组化结果显示:在70%(35/50)的乳腺癌组织中PHF2蛋白表达下调(P<0.05);PHF2表达下调与乳腺癌患者的淋巴结转移、ER阴性及预后密切相关(P<0.05)。结论 PHF2在乳腺癌中表达下调,可以作为乳腺癌预后判断的指标之一,有望成为乳腺癌治疗的新靶点。
文摘采用PHF-LSM(permeability-based hydraulic fracture-level set method)水力压裂计算模型,建立了含节理分布的岩石材料模型,将其计算结果与裂缝几何特征和诱发应力理论解对比验证模型正确性,在此基础上分析节理对水力裂缝应力阴影效应的影响.计算结果表明:基于弥散裂缝模型的PHF模型应使用等效开裂区域最外侧结点位移差作为裂缝等效开度;节理的存在会影响裂缝注水过程中水压力变化,同时会引起裂缝等效开度的增大;较大的节理入射角度与距注水点较小的节理高度会产生更大诱发应力,同时会引起最小主应力方向的改变,导致更强应力阴影效应,裂缝偏转加强.
文摘基于PHF(permeability-based hydraulic fracture)模型,采用水平集方法(level set method,LSM)描述材料边界分布,并用多尺度方法MT模型,对材料有效参数进行均匀化,建立适用于考虑非均质岩石材料细观界面特征分布与水力裂缝动态发展过程的PHF-LSM-MT数值计算模型.该模型解决了已有PHF-LSM模型无法精确描述积分点作用范围内细观尺度材料分布特征的问题.通过比较包裹体几何分布和体积分数影响下的有效弹性参数,验证了采用MT模型均匀化细观特征的可行性;在此基础上,对非均质岩石水力裂缝发展过程进行研究,得到了考虑细观界面特征情况下的裂缝发展过程,探讨了等效开裂区域影响范围内关键位置的水压力变化特征和应力路径发展过程.
文摘基于渗透率修正和水平集法的水力压裂数值计算模型(permeability-based hydraulic fracture-level set method,PHF-LSM)是以Biot固结理论为基础建立一种弥散裂缝模型.模型是通过弱化开裂及损伤区域岩石材料性质来模拟裂缝的发展过程,因此求解过程中无法给出水力裂缝的几何特征.依据水力裂缝传播过程中的平均有效应力场分布建立PHF-LSM方法的水力裂缝的等效路径和等效高度;依据等效传播路径周围位移场计算水力裂缝的等效开度,并通过与KGD理论模型对比进行验证所提方法的有效性.计算了均质和非均质岩石材料中裂缝等效几何特征的动态发展特性.结果表明,所提出的等效计算方法弥补了PHF-LSM无法得到水力裂缝几何特征的不足.
文摘采用PHF-LSM(permeability-based hydraulic fracture-level set method)水力压裂数值计算模型,模拟并分析了均质与分层岩石材料中分段压裂过程引起的应力阴影效应.通过与单一裂缝诱发应力理论解的对比,验证了PHF-LSM考虑应力阴影效应的可行性.以此模型为基础分析了单一裂缝发展过程中,岩石材料参数与初始应力条件对诱发应力场的影响,以及均质与分层岩石材料的多裂缝起裂过程中不同压裂间距与压裂顺序产生的应力阴影效应.数值计算结果表明:泊松比、抗拉强度与孔隙率的增加会增大裂缝引起的诱发应力与净压力比值的峰值,而弹性模量和水平主应力差的增大会减小该峰值;裂缝间距的扩大可以减弱裂缝间应力阴影效应;两步压裂与顺序压裂的裂缝总面积均大于同时压裂时的面积,但顺序压裂与两步压裂会带来更高的起裂压力;产层厚度与压裂间距的减小会增大应力阴影效应.
