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胃癌差异表达蛋白的蛋白质组学分析 被引量：3
1
作者 李素云 陈苏琼 +2 位作者 谢远杰 张志伟 贺修胜 《中南医学科学杂志》 CAS 2015年第1期14-20,共7页
目的筛选与鉴定胃癌差异表达蛋白质分子。方法采用定量蛋白组学方法,通过同位素i TRAQ标记胃癌与正常胃黏膜组织总蛋白,然后用强阳离子交换/反相液相色谱(SCX/nano HPLC)进行电喷雾串联质谱分析(ESI-MS/MS),获得两组样本的多肽及相对丰... 目的筛选与鉴定胃癌差异表达蛋白质分子。方法采用定量蛋白组学方法,通过同位素i TRAQ标记胃癌与正常胃黏膜组织总蛋白,然后用强阳离子交换/反相液相色谱(SCX/nano HPLC)进行电喷雾串联质谱分析(ESI-MS/MS),获得两组样本的多肽及相对丰度信息,通过数据库搜索与比对,鉴定差异表达蛋白质。结果共鉴定出319个蛋白质,其中表达差异在2倍以上的88个,在胃癌中呈高表达的12个、呈低表达的76个。按蛋白质功能分为七大类:细胞骨架蛋白、分子伴侣、信号传导、生物代谢、凋亡,蛋白质合成与代谢类及其他蛋白质。结论成功筛选了胃癌差异表达蛋白质分子,这些蛋白质的表达改变,可能参与了胃癌的发生和发展。 展开更多
关键词 胃癌 itraqtm同位素标记相对和绝对定量 多维液相色谱 串联质谱
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基于差异蛋白质组学解析紫色杆菌素抑制结肠癌细胞HT29的作用机制
2
作者 刘鹭 芦晶 +4 位作者 王莹 逄晓阳 许嫚 张书文 吕加平 《中国农业科学》 CAS CSCD 北大核心 2017年第9期1694-1704,共11页
【目的】对紫色杆菌素作用后的结肠癌细胞HT29进行差异蛋白质组学分析,探究其影响的代谢通路,揭示其抑制癌细胞生长的作用机制,为新型抗癌药物的开发提供一定的参考。【方法】以不同剂量的紫色杆菌素处理HT29 24、48、72 h,通过MTT试验... 【目的】对紫色杆菌素作用后的结肠癌细胞HT29进行差异蛋白质组学分析,探究其影响的代谢通路,揭示其抑制癌细胞生长的作用机制,为新型抗癌药物的开发提供一定的参考。【方法】以不同剂量的紫色杆菌素处理HT29 24、48、72 h,通过MTT试验以及透射电镜分析其对结肠癌细胞的有效抑制剂量及抑制情况。在此基础上,对提取的3个处理组的蛋白进行同位素标记,利用反相液相色谱(RP-LC)联用串联质谱(AB SCIEX Triple TOF5600)获得样品中的多肽及其相对丰度信息,通过数据库(NCBI.Human.protein database)搜索比对,鉴定差异表达蛋白。利用GO分析、KEGG信号通路分析,解析紫色杆菌素抑癌作用代谢途径。【结果】紫色杆菌素对HT29的抑制作用呈一定的时间、剂量依赖性。当紫色杆菌素对HT29的抑制率达50%时,仅为阳性药物5-Fu剂量的1/6,具有更明显的抑制效果。电镜下观察显示,随着紫色杆菌素剂量增大,细胞内部线粒体出现空泡结构,质膜出泡;当浓度达30 mg·L^(-1)时,细胞膜消失,染色质边集。通过差异蛋白质组学分析,共鉴定出4 258个蛋白,表达差异在2倍以上的蛋白共为757个。其中高剂量组处理差异蛋白数为492个,低剂量组处理的差异蛋白数为112个,阳性对照组差异蛋白数为336个。KEGG分析显示这些差异蛋白共参与50条信号通路。其中有10条信号通路具有显著性(P<0.05),主要参与核糖体循环途径、三羧酸循环途径和RNA降解途径等。【结论】紫色杆菌素主要通过影响HT29细胞生命活动中的蛋白转录和翻译水平进而发挥抑制作用。 展开更多
关键词 差异蛋白质组学 紫色杆菌素 HT29 iTRAQ同位素相对标记和绝对定量 透射电镜
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