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Analysis of QTLs for Flag Leaf Shape and Its Response to Elevated CO_2 in Rice(Oryza sativa)
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作者 FAN Gui-zhi DONG Yan-jun +5 位作者 WANG Chun-ming WAN Jian-min XIE Hui XU Chang-liang ZHU Jian-guo CAI Qing-sheng 《Rice science》 SCIE 2007年第1期7-12,共6页
To understand the responses of flag leaf shape in rice to elevated CO2 environment and their genetic characteristics, quantitative trait loci (QTLs) for flag leaf shape in rice were mapped onto the molecular marker ... To understand the responses of flag leaf shape in rice to elevated CO2 environment and their genetic characteristics, quantitative trait loci (QTLs) for flag leaf shape in rice were mapped onto the molecular marker linkage map of chromosome segment substitution lines (CSSLs) derived from a cross between a japonica variety Asominori and an indica variety IR24 under free air carbon dioxide enrichment (FACE, 200 μmol/mol above current levels) and current CO2 concentration (Ambient, about 370 μmol/mol). Three flag-leaf traits, flag-leaf length (LL), width (LW) and the ratio of LL to LW (RLW), were estimated for each CSSL and their parental varieties. The differences in LL, LW and RLW between parents and in LL and LW within IR24 between FACE and Ambient were significant at 1% level. The continuous distributions and transgressive segregations of LL, LW and RLW were also observed in CSSL population, showing that the three traits were quantitatively inherited under both FACE and Ambient. A total of 16 QTLs for the three traits were detected on chromosomes 1, 2, 3, 4, 6, 8 and 11 with LOD (Log10-1ikelihood ratio) scores ranging from 3.0 to 6.7. Among them, four QTLs (qLL-6*, qLL-8* qLW-4* and qRLW-6*) were commonly detected under both FACE and Ambient. Therefore, based on the different responses to elevated CO2 in comparison with current CO2 level, it can be suggested that the expressions of several QTLs associated with flag-leaf shape in rice could be induced by the high CO2 level. 展开更多
关键词 rice (Oryza sativa) flag leaf leaf shape character quantitative trait locus chromosome segment substitution lines carbon dioxide enrichment
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利用重测序的水稻染色体片段代换系群体定位剑叶形态QTL 被引量:9
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作者 徐建军 赵强 +5 位作者 赵元凤 朱磊 徐辰武 顾铭洪 韩斌 梁国华 《中国水稻科学》 CAS CSCD 北大核心 2011年第5期483-487,共5页
剑叶形态性状(剑叶长、剑叶宽和剑叶面积)是水稻理想株型育种的重要目标性状之一。发掘新的控制水稻剑叶形态性状的基因资源,准确鉴定和定位水稻剑叶形态性状QTL,对开展水稻剑叶形态性状分子生物学研究和理想株型分子育种都具有重要意... 剑叶形态性状(剑叶长、剑叶宽和剑叶面积)是水稻理想株型育种的重要目标性状之一。发掘新的控制水稻剑叶形态性状的基因资源,准确鉴定和定位水稻剑叶形态性状QTL,对开展水稻剑叶形态性状分子生物学研究和理想株型分子育种都具有重要意义。以通过高通量测序而准确获知代换片段位置及长度的一套用籼稻品种9311为受体、粳稻品种日本晴为供体构建的,包括128个染色体片段代换系群体为材料,对剑叶形态性状及其与主穗颖花之间的相关性进行分析,结果表明剑叶面积与剑叶长、宽呈极显著正相关,主穗颖花数与剑叶长、剑叶面积呈极显著正相关。利用多元回归分析方法,结合Bin-map,共鉴定出与水稻剑叶长、宽和面积相关的QTL分别为4、4和6个,贡献率介于4.08%~60.40%。上述QTL的准确定位,为进一步精细定位及克隆相应QTL以及开展水稻剑叶形态性状分子育种奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 剑叶形态 染色体片段代换系 QTL定位
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控制水稻剑叶形态相关性状的数量基因位点(QTL)的定位 被引量:20
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作者 肖珂 左海龙 +3 位作者 巩迎军 张俊芝 张永娟 董彦君 《上海师范大学学报(自然科学版)》 2007年第2期66-70,共5页
水稻籽粒中一半以上的碳水化合物来自剑叶的光合作用,剑叶形态改良一直是水稻株型育种的一个重要目标.利用一个日本主要种植的粳稻品种越光(轮回亲本)和一个印度的籼稻品种Kasalath杂交产生的回交重组自交系群体(backcross recombi... 水稻籽粒中一半以上的碳水化合物来自剑叶的光合作用,剑叶形态改良一直是水稻株型育种的一个重要目标.利用一个日本主要种植的粳稻品种越光(轮回亲本)和一个印度的籼稻品种Kasalath杂交产生的回交重组自交系群体(backcross recombinant inbred lines,BILs)对剑叶形态中的3个主要性状(剑叶长、叶宽以及其叶面积)进行了相关分析及其数量基因位点(quantitative trait loci,QTL)的定位.研究表明,控制剑叶形态的3个主要性状间存在极显著的正相关,并检测到影响3个性状的8个QTL,分布在第1,3,4,6条染色体上,贡献率介于4.94%~22.07%,其中第4染色体上C1016标记和第6染色体上C556标记附近的共有6个QTL,其两侧的紧密分子标记在水稻株型分子育种上具有一定应用价值. 展开更多
关键词 水稻 相关 剑叶形态 数量性状位点(QTL)
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水稻品种魔王谷粒形、剑叶性状和株高QTL定位 被引量:12
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作者 彭伟业 孙平勇 +2 位作者 潘素君 李魏 戴良英 《作物学报》 CAS CSCD 北大核心 2018年第11期1673-1680,共8页
以粳稻魔王谷和籼稻CO39配组衍生的280个重组自交系为材料, 2015年和2016年对其粒形、剑叶形态、株高性状进行了相关性分析和QTL检测。剑叶长分别与粒厚和株高存在极显著负相关和正相关,剑叶宽与粒宽存在极显著正相关。检测到17个粒形Q... 以粳稻魔王谷和籼稻CO39配组衍生的280个重组自交系为材料, 2015年和2016年对其粒形、剑叶形态、株高性状进行了相关性分析和QTL检测。剑叶长分别与粒厚和株高存在极显著负相关和正相关,剑叶宽与粒宽存在极显著正相关。检测到17个粒形QTL,分布于第1、第2、第3、第4、第5、第6、第7、第9和第10染色体上,贡献率为3.51%~48.65%;其中,第3染色体RM6080-RM6283区间对粒长和千粒重兼具显著作用,第5染色体RM8211-RM3381区间同时影响粒宽和粒厚。检测到12个控制剑叶形态性状的QTL,分布于第1、第3、第4、第6、第7和第9染色体上,贡献率为4.26%~38.40%;有5个多效QTL区间,其中,第4染色体RM252-SFP4_6区间同时控制剑叶长、剑叶宽、剑叶面积和粒长,第9染色体RM257-RM3909区间同时影响剑叶面积和粒长。只检测到一个控制株高的QTL,位于第1染色体的RM6333-RM5536区间,是一个主效QTL,贡献率为28.76%。这些结果为进一步开展粒形、剑叶形态、株高基因的精细定位、克隆和分子辅助育种奠定了基础。 展开更多
关键词 水稻 粒形 剑叶 株高 QTL定位
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非洲栽培稻基因渗入系粒形和剑叶形态性状的QTL定位 被引量:3
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作者 杨莹莹 李若思 +5 位作者 王一平 袁筱萍 章孟臣 杨窑龙 魏兴华 冯跃 《核农学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第3期509-516,共8页
非洲栽培稻作为重要的水稻种质资源,其基因渗入系可以为普通栽培稻的遗传背景提供新的有利基因,如果能将这些优良基因引入普通栽培稻中,可为水稻分子设计育种提供新的基因资源。本研究以非洲栽培稻基因渗入系YIL60与轮回亲本中9B(Z9B)... 非洲栽培稻作为重要的水稻种质资源,其基因渗入系可以为普通栽培稻的遗传背景提供新的有利基因,如果能将这些优良基因引入普通栽培稻中,可为水稻分子设计育种提供新的基因资源。本研究以非洲栽培稻基因渗入系YIL60与轮回亲本中9B(Z9B)杂交衍生的包含188个株系的F_(2)和F_(2:3)群体为材料,对粒形性状包括粒长、粒宽、籽粒长宽比、千粒重,剑叶形态性状包括剑叶长、剑叶宽进行数量性状点位(QTL)检测。结果共检测到16个QTL,包括2个粒长QTL、3个粒宽QTL、2个籽粒长宽比QTL、2个千粒重QTL、1个剑叶长QTL、6个剑叶宽QTL,分布于第1、第6、第7、第10和第11号染色体上,贡献率为2.25%~25.64%;有4个多效性QTL区间,有4个QTL qGW7-1、qFLL10、qFLW10、qTGW7在F;和F;群体中被重复检测到,其中在第7号染色体RM3859-RM3394区间检测到同时控制粒长、粒宽、籽粒长宽比和千粒重的QTL,贡献率最高达17.10%,是一个来源于非洲栽培稻的新粒形QTL。本研究为进一步开展粒形、剑叶形态性状基因的精细定位、克隆和分子标记辅助育种工作奠定了一定的理论基础。 展开更多
关键词 非洲栽培稻 基因渗入系 粒形 剑叶 QTL定位
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基于关联分析的水稻剑叶宽基因定位与分析 被引量:1
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作者 王江旭 《黑龙江农业科学》 2023年第2期1-5,10,共6页
叶形是影响粳稻光合作用和碳水化合物积累的重要因素之一,而叶宽是决定水稻叶形的核心性状之一。挖掘和利用新的叶宽相关基因/QTL可以进一步丰富分子育种理论,提升叶宽性状遗传改良的效率。本研究利用295份粳稻品种的自然群体,于2020年... 叶形是影响粳稻光合作用和碳水化合物积累的重要因素之一,而叶宽是决定水稻叶形的核心性状之一。挖掘和利用新的叶宽相关基因/QTL可以进一步丰富分子育种理论,提升叶宽性状遗传改良的效率。本研究利用295份粳稻品种的自然群体,于2020年和2021年对各品种的剑叶宽进行考察。结合高通量重测序获得的788 396个高质量多态性SNP,对粳稻剑叶宽相关性状进行全基因组关联分析(GWAS),共检测到45个关联SNPs,分布在水稻的12条染色体上,表型贡献率范围为8.61%~15.76%。其中,qFL10在两年间被重复检测到,定位区间在10.11 Mb~10.23 Mb,此区段内包含15个基因。 展开更多
关键词 水稻 叶形 剑叶宽 关联分析 主效QTL
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