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堆叠覆盖环境下的深度强化学习机械臂避障抓取方法
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作者 禹鑫燚 周晨 +2 位作者 俞俊鑫 曹铭洲 欧林林 《高技术通讯》 北大核心 2025年第3期284-296,共13页
堆叠覆盖环境下的机械臂避障抓取是一个重要且有挑战性的任务。针对机械臂在堆叠环境下的避障抓取任务,本文提出了一种基于图像编码器和深度强化学习(deep reinforcement learning,DRL)的机械臂避障抓取方法Ec-DSAC(encoder and crop fo... 堆叠覆盖环境下的机械臂避障抓取是一个重要且有挑战性的任务。针对机械臂在堆叠环境下的避障抓取任务,本文提出了一种基于图像编码器和深度强化学习(deep reinforcement learning,DRL)的机械臂避障抓取方法Ec-DSAC(encoder and crop for discrete SAC)。首先设计结合YOLO(you only look once)v5和对比学习网络编码的图像编码器,能够编码关键特征和全局特征,实现像素信息至向量信息的降维。其次结合图像编码器和离散软演员-评价家(soft actor-critic,SAC)算法,设计离散动作空间和密集奖励函数约束并引导策略输出的学习方向,同时使用随机图像裁剪增加强化学习的样本效率。最后,提出了一种应用于深度强化学习预训练的二次行为克隆方法,增强了强化学习网络的学习能力并提高了控制策略的成功率。仿真实验中Ec-DSAC的避障抓取成功率稳定高于80.0%,验证其具有比现有方法更好的避障抓取性能。现实实验中避障抓取成功率为73.3%,验证其在现实堆叠覆盖环境下避障抓取的有效性。 展开更多
关键词 堆叠覆盖环境 避障抓取 图像编码器 深度强化学习 二次行为克隆
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基于机器视觉的高通量微生物克隆挑选工作站研制及应用
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作者 张建康 王文君 +5 位作者 郭洪菊 白北辰 张亚飞 袁征 李彦辉 李航 《合成生物学》 北大核心 2025年第4期956-971,共16页
微生物克隆挑选是基因工程生物实验中的关键环节,需要从生长有大量菌落的培养皿中将符合质量要求的单克隆菌落准确、快速挑取出来并接种到培养基中,以便进一步扩大培养或检测。在高通量实验中,克隆挑选环节任务量大、记录繁复、容易交... 微生物克隆挑选是基因工程生物实验中的关键环节,需要从生长有大量菌落的培养皿中将符合质量要求的单克隆菌落准确、快速挑取出来并接种到培养基中,以便进一步扩大培养或检测。在高通量实验中,克隆挑选环节任务量大、记录繁复、容易交叉污染,依靠人工操作难以在短时间准确完成。针对这一难题,本项目成功研制出一种自动化克隆挑选工作站,通过菌落图像的深度学习实现克隆定位和筛选,并利用机器人技术完成挑取-接种-清洗-高温灭菌过程。在所研制的可视化工作界面中,工作站系统能够个性化编辑适用于多种微生物克隆的多项实验操作流程。通过样机验证实验结果,证明了所研制系统和方法的可行性和有效性,为高通量实验室自动化发展提供了有效工具和有益实践。 展开更多
关键词 自动化平台 深度学习 克隆挑选 机器视觉 合成生物学
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基于行为克隆的机械臂多智能体深度强化学习轨迹跟踪控制 被引量:1
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作者 易佳豪 王福杰 +3 位作者 胡锦涛 秦毅 郭芳 罗俊轩 《计算机应用研究》 北大核心 2025年第4期1025-1033,共9页
针对具有非线性干扰以及多变环境的机械臂轨迹跟踪问题,提出了一种结合行为克隆(behavior cloning,BC)的多智能体深度强化学习(multi-agent deep reinforcement learning,MDRL)控制方法。多智能体控制算法中包含了以孪生延迟深度确定性... 针对具有非线性干扰以及多变环境的机械臂轨迹跟踪问题,提出了一种结合行为克隆(behavior cloning,BC)的多智能体深度强化学习(multi-agent deep reinforcement learning,MDRL)控制方法。多智能体控制算法中包含了以孪生延迟深度确定性策略梯度算法(twin delayed deep deterministic policy gradient algorithm,TD3)为基底算法的比例积分微分智能体(proportional-integral-derivative agent,PID agent)和直接用深度强化学习策略输出扭矩的智能体(direct deep reinforcement learning agent,DDR agent),并采用两个奖励函数来优化两个agent的策略网络。PID agent用于输出PID控制器的参数,再由PID控制器输出力矩控制机械臂以增加控制器的跟踪泛性,DDR agent则直接输出扭矩增加控制器的抗干扰性。为了克服多智能体训练难度高的问题,在训练中引入行为克隆技术,利用PID控制器的专家经验对PID agent进行预训练,形成预策略在训练初期就可以输出较合适的PID参数,增加有效经验来加速训练过程的奖励收敛。为了验证方法的有效性,通过欧拉拉格朗日建模二自由度机械臂,并在具有干扰的多种环境下进行仿真实验对比。实验结果表明,所提算法在具有随机干扰环境以及与训练轨迹不同的跟踪轨迹中都具有最好的跟踪效果,验证了所提算法的有效性。 展开更多
关键词 多智能体 孪生延迟深度确定性策略梯度 深度强化学习 轨迹跟踪 行为克隆
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考虑行为克隆的深度强化学习股票交易策略 被引量:3
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作者 杨兴雨 陈亮威 +1 位作者 郑萧腾 张永 《系统管理学报》 CSSCI CSCD 北大核心 2024年第1期150-161,共12页
为提高股票投资的收益并降低风险,将模仿学习中的行为克隆思想引入深度强化学习框架中设计股票交易策略。在策略设计过程中,将对决DQN深度强化学习算法和行为克隆进行结合,使智能体在自主探索的同时模仿事先构造的投资专家的决策。选择... 为提高股票投资的收益并降低风险,将模仿学习中的行为克隆思想引入深度强化学习框架中设计股票交易策略。在策略设计过程中,将对决DQN深度强化学习算法和行为克隆进行结合,使智能体在自主探索的同时模仿事先构造的投资专家的决策。选择不同行业的股票进行数值实验,说明了所设计的交易策略在年化收益率、夏普比率和卡玛比率等收益与风险指标上优于对比策略。研究结果表明:将模仿学习与深度强化学习相结合可以使智能体同时具有探索和模仿能力,从而提高模型的泛化能力和策略的适用性。 展开更多
关键词 股票交易策略 深度强化学习 模仿学习 行为克隆 对决深度Q学习网络
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基于深度强化学习的无信号灯路口决策研究 被引量:3
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作者 傅明建 郭福强 《计算机工程》 CAS CSCD 北大核心 2024年第5期91-99,共9页
无信号灯左转路口是自动驾驶场景中最为危险的场景之一,如何实现高效安全的左转决策是自动驾驶领域的重大难题。深度强化学习(DRL)算法在自动驾驶决策领域具有广阔应用前景。但是,深度强化学习在自动驾驶场景中存在样本效率低、奖励函... 无信号灯左转路口是自动驾驶场景中最为危险的场景之一,如何实现高效安全的左转决策是自动驾驶领域的重大难题。深度强化学习(DRL)算法在自动驾驶决策领域具有广阔应用前景。但是,深度强化学习在自动驾驶场景中存在样本效率低、奖励函数设计困难等问题。提出一种基于专家先验的深度强化学习算法(CBAMBC SAC)来解决上述问题。首先,利用SMARTS仿真平台获得专家先验知识;然后,使用通道-空间注意力机制(CBAM)改进行为克隆(BC)方法,在专家先验知识的基础上预训练模仿专家策略;最后,使用模仿专家策略指导深度强化学习算法的学习过程,并在无信号灯路口左转决策中进行验证。实验结果表明,基于专家先验的DRL算法比传统的DRL算法更具优势,不仅可以免去人为设置奖励函数的工作量,而且可以显著提高样本效率从而获得更优性能。在无信号灯路口左转场景下,CBAM-BC SAC算法与传统DRL算法(SAC)、基于传统行为克隆的DRL算法(BC SAC)相比,平均通行成功率分别提高了14.2和2.2个百分点。 展开更多
关键词 深度强化学习 自动驾驶 模仿学习 行为克隆 驾驶决策
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代码相似性检测技术综述 被引量:3
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作者 孙祥杰 魏强 +1 位作者 王奕森 杜江 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2024年第4期1248-1258,共11页
代码复用为软件开发带来便利的同时也引入了安全风险,如加速漏洞传播、代码恶意抄袭等,代码相似性检测技术通过分析代码间词法、语法、语义等信息计算代码相似程度,是判断代码复用最有效的技术之一,也是近年发展较快的程序安全分析技术... 代码复用为软件开发带来便利的同时也引入了安全风险,如加速漏洞传播、代码恶意抄袭等,代码相似性检测技术通过分析代码间词法、语法、语义等信息计算代码相似程度,是判断代码复用最有效的技术之一,也是近年发展较快的程序安全分析技术。首先,系统梳理代码相似性检测的近期技术进展,根据目标代码是否开源,将代码相似性检测技术分为源码相似性检测和二进制代码相似性检测,又根据编程语言、指令集的不同进行二次细分;其次,总结每一种技术的思路和研究成果,分析机器学习技术在代码相似性检测领域成功的案例,并讨论现有技术的优势与不足;最后,给出代码相似性检测技术的发展趋势,为相关研究人员提供参考。 展开更多
关键词 二进制代码相似性 源代码相似性 跨语言代码相似性 深度学习 代码克隆
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基于行为克隆的高通量卫星通信频谱资源分配 被引量:4
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作者 秦浩 李双益 +2 位作者 赵迪 孟昊炜 宋彬 《通信学报》 EI CSCD 北大核心 2024年第5期101-114,共14页
为应对在高通量多波束卫星系统中,随着波束数量和用户规模的扩大,频谱资源分配问题的维度急剧增加和求解复杂度呈指数级上升这一挑战,提出了一种结合行为克隆与深度强化学习的两阶段算法。第一阶段基于行为克隆,利用已有卫星资源分配决... 为应对在高通量多波束卫星系统中,随着波束数量和用户规模的扩大,频谱资源分配问题的维度急剧增加和求解复杂度呈指数级上升这一挑战,提出了一种结合行为克隆与深度强化学习的两阶段算法。第一阶段基于行为克隆,利用已有卫星资源分配决策数据对策略网络进行预训练,通过模仿专家行为减少盲目探索,加快算法收敛。第二阶段基于近端策略优化,进一步优化策略网络,并通过引入卷积注意力模块有效地提取用户业务状态特征,以提升算法整体性能。仿真结果表明,所提算法在收敛速度和算法稳定性方面均优于其他基准算法,并在系统时延、系统平均满意度和频谱效率等性能指标上表现更佳。 展开更多
关键词 高通量卫星 行为克隆 深度强化学习 近端策略优化 卷积注意力模块
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基于依赖增强的分层抽象语法树的代码克隆检测 被引量:2
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作者 万泽轩 谢春丽 +1 位作者 吕泉润 梁瑶 《计算机应用》 CSCD 北大核心 2024年第4期1259-1268,共10页
在软件工程领域,基于语义相似的代码克隆检测方法可以降低软件维护的成本并预防系统漏洞,抽象语法树(AST)作为典型的代码抽象表征形式,已成功应用于多种程序语言的代码克隆检测任务,然而现有工作主要利用原始AST提取代码的语义,没有深... 在软件工程领域,基于语义相似的代码克隆检测方法可以降低软件维护的成本并预防系统漏洞,抽象语法树(AST)作为典型的代码抽象表征形式,已成功应用于多种程序语言的代码克隆检测任务,然而现有工作主要利用原始AST提取代码的语义,没有深入挖掘AST中的深层语义和结构信息。针对上述问题,提出一种基于依赖增强的分层抽象语法树(DEHAST)的代码克隆检测方法。首先,对AST进行分层处理,将AST划分得到不同的语义层次;其次,为AST的不同层次添加相应的依赖增强边构建DEHAST,将简单的AST变成具有更丰富程序语义的异构图;最后,使用图匹配网络(GMN)模型检测异构图的相似性,实现代码克隆检测。在BigCloneBench和Google Code Jam两个数据集上的实验结果显示,DEHAST能够检测100%的Type-1和Type-2代码克隆、99%的Type-3代码克隆和97%的Type-4代码克隆;与基于树的方法ASTNN(AST-based Neural Network)相比,F1分数均提高了4个百分点,验证了DEHAST可以较好地完成代码语义克隆检测。 展开更多
关键词 代码克隆检测 语义克隆 抽象语法树 深度学习 图匹配网络
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基于词汇的源代码克隆检测技术综述
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作者 刘春玲 戚旭衍 +3 位作者 唐永鹤 孙雪凯 李晴浩 张雨 《计算机科学》 CSCD 北大核心 2024年第6期12-22,共11页
代码克隆指在软件开发过程中对源代码复用、修改、重构产生的文本相似或结构相似的代码。代码克隆对提升软件开发效率、节约开发成本有积极作用,但也会引起Bug传播,并对软件的稳定性、可维护性产生负面影响。代码克隆检测在剽窃检测、... 代码克隆指在软件开发过程中对源代码复用、修改、重构产生的文本相似或结构相似的代码。代码克隆对提升软件开发效率、节约开发成本有积极作用,但也会引起Bug传播,并对软件的稳定性、可维护性产生负面影响。代码克隆检测在剽窃检测、漏洞检测、版权侵权等领域具有重要的研究意义和应用价值。基于词汇的克隆检测技术能快速检测1-3型克隆,能扩展到其他编程语言,已被广泛应用于大规模克隆检测任务中。文中对近5年基于词汇的克隆检测技术的研究现状进行了梳理,根据相似性算法中的基本计算粒度将其分为4类,并对10余个技术特征进行了分析和总结,讨论其局限性及面临的挑战,最后结合新技术的发展提出了基于词汇的克隆检测技术未来可能的研究方向。 展开更多
关键词 软件安全 源代码克隆检测 代码表征 深度学习
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基于深度神经网络模型的无铁心永磁同步直线电机结构优化研究 被引量:22
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作者 杨阳 赵吉文 +3 位作者 宋俊材 董菲 何中燕 宗开放 《中国电机工程学报》 EI CSCD 北大核心 2019年第20期6085-6094,共10页
针对无铁心永磁同步直线电机(permanent magnet synchronous linear motor,PMSLM)存在推力波动问题,该文从电机结构优化着手,引入深度学习算法建立PMSLM快速计算模型,并进行全局优化以实现推力波动抑制。首先,通过有限元模型获取PMSLM... 针对无铁心永磁同步直线电机(permanent magnet synchronous linear motor,PMSLM)存在推力波动问题,该文从电机结构优化着手,引入深度学习算法建立PMSLM快速计算模型,并进行全局优化以实现推力波动抑制。首先,通过有限元模型获取PMSLM结构参数与推力及推力波动的样本数据,采用深度神经网络(deep neural network,DNN)建立其非参数快速计算模型,并与K近邻域算法和支持向量机建模方法对比,验证DNN优越性;其次,以"推力密度不削弱,推力波动最小"为目标,采用免疫克隆算法对电机结构参数进行多工况优化;最后,仿真分析和样机测试验证该方法的正确性和有效性。 展开更多
关键词 永磁同步直线电机 推力波动 深度神经网络 免疫克隆算法
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南极深海沉积物宏基因组DNA中低温脂肪酶基因的克隆、表达及性质分析 被引量:14
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作者 张金伟 曾润颖 《生物化学与生物物理进展》 SCIE CAS CSCD 北大核心 2006年第12期1207-1214,共8页
从南极普利兹湾深海900米深的沉积物中提取获得宏基因组DNA,并通过设计引物,从中克隆到全长为948bp的低温脂肪酶(lip3)开放阅读框完整序列,该基因编码一个由315个氨基酸残基组成、预计分子质量为34.557ku酶蛋白(Lip3);氨基酸序列上的GFG... 从南极普利兹湾深海900米深的沉积物中提取获得宏基因组DNA,并通过设计引物,从中克隆到全长为948bp的低温脂肪酶(lip3)开放阅读框完整序列,该基因编码一个由315个氨基酸残基组成、预计分子质量为34.557ku酶蛋白(Lip3);氨基酸序列上的GFGNS(GXGXS)和G-N-S-M-G(GXSXG)在许多脂肪酶中有很高的保守性,它们是水解机制所必需的序列,也是丝氨酸水解酶中最保守的序列.构建了lip3基因重组表达载体,并在大肠杆菌中获得表达,采用镍离子亲和层析柱对表达的酶蛋白Lip3进行纯化,得到约35ku蛋白条带,酶学性质的分析表明,该酶的最适作用温度为25℃,在0℃时表现为最高活力的22%,最适pH值为8.0,对热敏感,35℃热处理60min剩余酶活为10%,以硝基苯棕榈酸酯为底物,Lip3的酶促反应常数Km值随着反应温度的升高而升高,是典型的低温酶. 展开更多
关键词 南极深海沉积物 宏基因组 低温脂肪酶 克隆与表达
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热球菌HJ21高温α-淀粉酶基因克隆、表达及性质研究 被引量:3
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作者 王淑军 吕明生 +5 位作者 秦松 陆兆新 房耀维 邓祥元 林谦 刘红飞 《海洋学报》 CAS CSCD 北大核心 2011年第3期158-164,共7页
通过简并引物扩增热球菌(Thermococcus siculi)HJ21高温α-淀粉酶保守区域之间的序列,再利用Site-finding技术获得两端未知序列。构建了在N端添加了His6标签的表达载体pEt-28a-His6-THJA后转化E.coli,在IPTG诱导下表达。进一步纯化后SDS... 通过简并引物扩增热球菌(Thermococcus siculi)HJ21高温α-淀粉酶保守区域之间的序列,再利用Site-finding技术获得两端未知序列。构建了在N端添加了His6标签的表达载体pEt-28a-His6-THJA后转化E.coli,在IPTG诱导下表达。进一步纯化后SDS-PAGE电泳检测达到电泳纯,重组酶分子量为50 KDa。重组酶最适作用温度和pH值分别为90℃,pH5.0。重组酶在pH为5.5时最稳定;K+,Sr2+,Mg2+,Na+对α-淀粉酶活力的促进作用不显著,Cu2+,Pb2+,Hg2+,Zn2+,N-溴代丁酰亚胺和三氯乙酸对该酶有显著抑制作用。 展开更多
关键词 深海古菌 高温酸性α-淀粉酶 基因克隆 表达 酶学性质
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SCSC-S/Fe复合系统脱氮除磷途径及微生物群落特性 被引量:11
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作者 范军辉 郝瑞霞 +3 位作者 LIU Lei 朱晓霞 王卫东 万京京 《中国环境科学》 EI CAS CSSCI CSCD 北大核心 2017年第4期1358-1365,共8页
为提升再生水品质,以玉米芯耦合硫铁填料构造出固相纤维素碳源+硫铁填料复合脱氮除磷系统(简称SCSC-S/Fe复合系统),基于填料生物膜Miseq高通量测序构建了16S rRNA基因克隆文库,结合系统沉积物的X射线衍射(XRD)分析,探讨了该系统对模拟... 为提升再生水品质,以玉米芯耦合硫铁填料构造出固相纤维素碳源+硫铁填料复合脱氮除磷系统(简称SCSC-S/Fe复合系统),基于填料生物膜Miseq高通量测序构建了16S rRNA基因克隆文库,结合系统沉积物的X射线衍射(XRD)分析,探讨了该系统对模拟城市污水处理厂低C/N比尾水深度脱氮同步除磷特性及作用途径.结果表明,随温度升高,TN去除率逐渐增大,TP去除率增加不明显,在温度为30℃和水力停留时间HRT=9h时,NO_3^--N、TN、TP平均去除率分别为99.86%、92.70%和89.15%.固相纤维素碳源反硝化脱氮单元内具有降解纤维素类和反硝化作用类细菌分别占细菌总数的41.37%和54.02%,硫铁复合填料脱氮除磷单元内异养反硝化、硫自养反硝化和氬自养反硝化的细菌占细菌总数的91.53%;XRD结果表明,水中的PO_4^(3-)主要以FeP0_4、Fe_3(P0_4)_2·χH_20和Fe_3(P0_4)_3(0H)_2等物质形式去除.因此,复合系统脱氮以异养反硝化作用为主,协同硫自养反硝化和氢自养反硝化作用;复合系统具有"化学+生物"双重除磷作用,以化学除磷作用为主.SCSC-S/Fe复合系统实现了低C/N比城市污水处理厂尾水深度脱氮同步除磷的目的. 展开更多
关键词 固相纤维素碳源 硫铁复合填料 深度脱氮除磷 16SrRNA克隆文库
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利用ObjectARX2000显示打开的图形数据库 被引量:1
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作者 袁宁 李西琴 《工程图学学报》 CSCD 2002年第2期29-34,共6页
论述了基于AutoCAD2000环境下用ObjectARX2000开发工具显示图形数据文件的方法。介绍了ObjectARX2000深层克隆功能(deep-clone),给出了完整的程序结构和伪代码。 该方法突破了ObjectARX2000不能调用AutoCAD2000中“打开”(Open)命令的限... 论述了基于AutoCAD2000环境下用ObjectARX2000开发工具显示图形数据文件的方法。介绍了ObjectARX2000深层克隆功能(deep-clone),给出了完整的程序结构和伪代码。 该方法突破了ObjectARX2000不能调用AutoCAD2000中“打开”(Open)命令的限制,为已读入的图形数据的显示提供一种可行方法。 展开更多
关键词 OBJECTARX2000 图形数据库 图形显示 深层克隆 AUTOCAD2000 视窗
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一种基于深度学习的恶意代码克隆检测技术 被引量:7
15
作者 沈元 严寒冰 +1 位作者 夏春和 韩志辉 《北京航空航天大学学报》 EI CAS CSCD 北大核心 2022年第2期282-290,共9页
恶意代码克隆检测已经成为恶意代码同源分析及高级持续性威胁(APT)攻击溯源的有效方式。从公共威胁情报中收集了不同APT组织的样本,并提出了一种基于深度学习的恶意代码克隆检测框架,目的是检测新发现的恶意代码中的函数与已知APT组织... 恶意代码克隆检测已经成为恶意代码同源分析及高级持续性威胁(APT)攻击溯源的有效方式。从公共威胁情报中收集了不同APT组织的样本,并提出了一种基于深度学习的恶意代码克隆检测框架,目的是检测新发现的恶意代码中的函数与已知APT组织资源库中的恶意代码的相似性,以此高效地对恶意软件进行分析,进而快速判别APT攻击来源。通过反汇编技术对恶意代码进行静态分析,并利用其关键系统函数调用图及反汇编代码作为该恶意代码的特征。根据神经网络模型对APT组织资源库中的恶意代码进行分类。通过广泛评估和与MCrab模型的对比可知,改进模型优于MCrab模型,可以有效地进行恶意代码克隆检测与分类,且获得了较高的检测率。 展开更多
关键词 深度学习 高级持续性威胁(APT)组织 克隆检测 控制流图(CFG) 系统函数调用图
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利用深井海水进行海带配子体克隆育苗试验 被引量:2
16
作者 罗世菊 曲霞 +5 位作者 李晓捷 张壮志 王青岩 李言 梁广津 武瑞娜 《水产科学》 CAS 北大核心 2013年第3期142-145,共4页
以海带配子体克隆为试验对象,研究了深井海水对海带配子体克隆生长、发育的影响,并利用深井海水进行了克隆育苗试验。试验结果表明,利用深井海水培养海带配子体克隆,配子体生长速度较自然海水稍慢,但深井海水可促进配子体发育,加快孢子... 以海带配子体克隆为试验对象,研究了深井海水对海带配子体克隆生长、发育的影响,并利用深井海水进行了克隆育苗试验。试验结果表明,利用深井海水培养海带配子体克隆,配子体生长速度较自然海水稍慢,但深井海水可促进配子体发育,加快孢子体的形成,缩短育苗时间,而且利用深井海水进行克隆育苗可取得较好效果。综合考虑克隆培养效果及降低育苗成本,克隆育苗可采取自然海水与深井海水交替使用的模式进行。 展开更多
关键词 海带 配子体克隆 生长 发育 克隆育苗 深井海水
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深海放线菌生淀粉酶基因的克隆表达及酶学特性研究 被引量:2
17
作者 李丽珍 杨键 +4 位作者 田新朋 麦志茂 苏宏飞 龙丽娟 张偲 《生物加工过程》 CAS 2015年第2期35-40,共6页
从深海放线菌Streptomyces sp.SCSIO03032基因组中扩增到1条含淀粉结合域的水解糖苷13家族基因amy032,该基因编码氨基酸与已知蛋白一致性最高为67%。将amy032插入表达载体pET32a启动子下游,构建重组载体pET-amy。重组质粒导入大肠杆菌Ro... 从深海放线菌Streptomyces sp.SCSIO03032基因组中扩增到1条含淀粉结合域的水解糖苷13家族基因amy032,该基因编码氨基酸与已知蛋白一致性最高为67%。将amy032插入表达载体pET32a启动子下游,构建重组载体pET-amy。重组质粒导入大肠杆菌Rosseta(DE3)菌株中,SDS-PAGE分析结果显示目的基因成功实现异源表达。Ni-NTA对重组酶进行纯化,并对其酶学性质进行表征。结果表明:重组淀粉酶AMY032的最适作用温度为50℃,最适pH为8.0,以可溶性淀粉为底物时的比酶活为(276±57)U/mg,Km为0.02g/L,Vmax为70mg/(L·min)。Ca2+能提高该酶的催化活性,Ni2+、Cu2+、Zn2+和Mn2+对该酶有抑制作用。AMY032对生玉米淀粉和生大米淀粉具有水解活性,其比酶活分别为(49±12)U/mg和(39±11)U/mg;扫描电镜结果显示AMY032使生玉米淀粉的表面产生明显凹陷。 展开更多
关键词 深海放线菌 基因组挖掘 有机物降解 淀粉结合域 克隆表达
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Microbial community structure and diversity in deep-sea hydrothermal vent sediments along the Eastern Lau Spreading Centre 被引量:6
18
作者 WEI Manman ZHANG Rubing +4 位作者 WANG Yuguang JI Houguo ZHENG Jia CHEN Xinhua ZHOU Hongbo 《Acta Oceanologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2013年第2期42-51,共10页
The aim of this study is to investigate microbial structures and diversities in five active hydrothermal fields' sediments along the Eastern Lau Spreading Centre (ELSC) in the Lau Basin (southwest Pacific). Micro... The aim of this study is to investigate microbial structures and diversities in five active hydrothermal fields' sediments along the Eastern Lau Spreading Centre (ELSC) in the Lau Basin (southwest Pacific). Microbial communities were surveyed by denatured gradient gel electrophoresis (DGGE) and clone library analysis of 16S rRNA genes. The differences in microbial community structures among sediment samples from the five deep-sea hydrothermal sites were revealed by DGGE profiles. Cluster analysis of DGGE profiles sepa- rated the five hydrothermal samples into two groups. Four different 16S rRNA gene clone libraries, repre- senting two selected hydrothermal samples (19-4TVG8 and 19-4TVG11), were constructed. Twenty-three and 32 phylotypes were identified from 166 and 160 bacterial clones respectively, including Proteobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes, Nitrospirae and Planctomycetes. The phylum Proteobacteria is dominant in both bacterial libraries with a predominance of Gamma-Proteobacteria. A total of 31 and 25 phylotypes were obtained from 160 and 130 archaeal clones respectively, including Miscellaneous Crenarchaeotic Group, Marine Group Ⅰ and Ⅲ, Marine Benthic Group E, Terrestrial Hot Spring Crenarchaeota and Deep-sea Hy- drothermal Vent Euryarchaeota. These results show a variety of clones related to those involved in sulfur cycling, suggesting that the cycling and utilization of sulfur compounds may extensively occur in the Lau Basin deep-sea hydrothermal ecosystem. 展开更多
关键词 microbial diversity deep-sea hydrothermal vent DGGE 16S rRNA gene clone libraries
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Gene cloning and sequence analysis of the cold-adapted chaperones DnaK and DnaJ from deep-sea psychrotrophic bacterium Pseudoalteromonas sp. SM9913 被引量:1
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作者 ZHAO Dianli CHEN Xiulan HE Hailun SHI Mei ZHANG Yuzhong 《Acta Oceanologica Sinica》 SCIE CAS CSCD 2007年第6期91-100,共10页
Pseudoalteromonas sp. SM9913 is a phychrotmphic bacterium isolated from the deep-sea sediment. The genes encoding chaperones DnaJ and DnaK of P. sp. SM9913 were cloned by normal PCR and TAIL - PCR (GenBank accession ... Pseudoalteromonas sp. SM9913 is a phychrotmphic bacterium isolated from the deep-sea sediment. The genes encoding chaperones DnaJ and DnaK of P. sp. SM9913 were cloned by normal PCR and TAIL - PCR (GenBank accession Nos DQ640312, DQ504163 ). The chaperones DnaJ and DnaK from the strain SM9913 contain such conserved domains as those of many other bacteria, and show some cold-adapted characteristics in their structures when compared with those from psychro-, meso-and themophilic bacteria. It is indicated that chaperones DnaJ and DnaK of P. sp. SM9913 may be adapted to low temperature in deep-sea and function well in assisting folding, assembling and translocation of proteins at low temperature. This research lays a foundation for the further study on the cold-adapted mechanism of chaperones DnaJ and DnaK of cold-adapted microorganisms. 展开更多
关键词 COLD-ADAPTED chaperone DNAJ DNAK DEEP-SEA Pseudoalteromonas sp. SM9913 gene cloning sequence analysis
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A Deep Adaptive Learning Method for Rolling Bearing Fault Diagnosis Using Immunity 被引量:24
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作者 Yuling Tian Xiangyu Liu 《Tsinghua Science and Technology》 SCIE EI CAS CSCD 2019年第6期750-762,共13页
The extraction of rolling bearing fault features using traditional diagnostic methods is not sufficiently comprehensive and the features are often chosen subjectively and depend on human experience. In this paper, an ... The extraction of rolling bearing fault features using traditional diagnostic methods is not sufficiently comprehensive and the features are often chosen subjectively and depend on human experience. In this paper, an improved deep convolutional process is used to extract a set of features adaptively. The hidden multi-layer feature of deep convolutional neural networks is also exploited to improve the extraction features. A deterministic detection of low-confidence samples is performed to ensure the reliability of the recognition results and to decrease the rate of false positives by evaluating the diagnosis of the deep convolutional neural network. To improve the efficiency of the continuous learning elements of the rolling bearing fault diagnosis, a clone learning strategy based on cloning and mutation operations is proposed. The experimental results show that the proposed deep convolutional neural network model can extract multiple rolling bearing fault features, improve classification and detection accuracy by reducing the false positive rate when diagnosing rolling bearing faults, and accelerate learning efficiency when using low-confidence rolling bearing fault samples. 展开更多
关键词 DEEP learning FAULT diagnosis FEATURE extraction CLONE selection strategy
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