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基于50K液相芯片的中国绵羊群体遗传结构与羊毛性状选择信号分析 被引量：3
1
作者 张嘉良 黄畅 +4 位作者 杨永林 杨华 白文林 马月辉 赵倩君 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第7期3164-3176,共13页
旨在揭示不同被毛类型绵羊群体的遗传结构特征,通过选择信号分析筛选与羊毛性状相关的候选基因。本研究选择8个绵羊群体(包括15只欧拉羊、13只塔什库尔干羊、15只阿勒泰羊、16只藏绵羊、12只青海毛肉兼用细毛羊、10只甘肃高山细毛羊、1... 旨在揭示不同被毛类型绵羊群体的遗传结构特征,通过选择信号分析筛选与羊毛性状相关的候选基因。本研究选择8个绵羊群体(包括15只欧拉羊、13只塔什库尔干羊、15只阿勒泰羊、16只藏绵羊、12只青海毛肉兼用细毛羊、10只甘肃高山细毛羊、15只中国美利奴羊和11只敖汉细毛羊)共计107只个体作为研究对象。将绵羊群体按照不同羊毛类型分为两组,包括59只细毛型绵羊和48只粗毛型绵羊。使用自主研发的绵羊SNP 50K液相芯片对所选绵羊群体进行基因分型,经质控后进行主成分分析、邻接连接树和群体遗传结构分析。基于群体遗传分化指数(FST)和核苷酸多样性比值(θπratio)两种选择信号方法筛选与羊毛性状相关的候选基因,通过KEGG通路分析确定候选基因的功能。主成分分析、邻接连接树和群体遗传结构分析的结果表明,两组绵羊群体之间存在遗传分化。基于FST和θπRatio的结合分析,前1%区域作为受选择区域,检测到165个受选择区域,包含456个受选择基因。基因注释发现,受选择基因与毛囊及毛发发育(JAK2、SELENBP1)、黑色素合成(IRF4)、真皮乳头细胞的间接调控(RAC2)以及皮肤分子生物学中关键管家基因(SDHA)密切相关。本研究探究了8个我国绵羊群体的遗传结构,细毛型和粗毛型绵羊群体间有明显的群体分化。基于两种选择信号检测方法筛选到与羊毛性状相关的候选基因(JAK2、IRF4、RAC2、IDUA、SDHA和SELENBP1)等。研究结果可为绵羊羊毛性状的分子遗传标记挖掘提供参考。 展开更多
关键词 绵羊 SNP芯片 群体遗传结构 选择信号
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基于芯片数据的长白猪繁殖性状基因组选择研究 被引量：2
2
作者 阳文攀 刘相杰 +8 位作者 罗冬香 陈梦会 谢瑛 方跃鑫 林婷燕 李爱民 李文静 邓政 丁能水 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第1期213-221,共9页
旨在比较不同基因组预测模型预测准确性与运行效率,以探究支持向量机(SVM)回归与随机森林(RandomForest)回归在基因组预测中的应用价值与应用前景。本研究使用博瑞迪猪50K液相芯片,采用GBLUP、BayesB、BayesLASSO、SVM回归和RandomFores... 旨在比较不同基因组预测模型预测准确性与运行效率,以探究支持向量机(SVM)回归与随机森林(RandomForest)回归在基因组预测中的应用价值与应用前景。本研究使用博瑞迪猪50K液相芯片,采用GBLUP、BayesB、BayesLASSO、SVM回归和RandomForest回归等基因组预测模型,对1 001头长白猪繁殖性状进行基因组预测评估。研究发现,在总产仔数、产活仔数、窝重等繁殖性状中,使用SVM回归径向基函数核的评估准确性均最高;产活仔数、窝重在参数C值为1时评估准确性达到最大值,总产仔数在参数C值为2时评估准确性达到最大值。在总产仔数、产活仔数、窝重等繁殖性状中,使用RandomForest回归评估ntree、mtry、nodesize等参数时发现,基因组预测准确性随着参数的变化展现一定的随机性。RandomForest回归模型在总产仔数、产活仔数、窝重中的评估准确性均最高,其次为SVM回归,GBLUP、BayesB、BayesLASSO等模型遗传评估准确性较差且保持一致。交叉验证相关性显示,不同模型遗传评估结果存在较强的相关性,为0.806~0.995。SVM回归与RandomForest回归等非参数机器学习模型在猪繁殖性状基因组选择中具有一定的优势,但运行时间在一定程度上限制了这些算法的使用。随着算法的研究优化,SVM回归与RandomForest回归等非参数机器学习模型将具有良好的应用前景。 展开更多
关键词 长白猪 繁殖性状 基因芯片 基因组选择 机器学习
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“太行云牛”群体遗传结构与基因组选择信号分析 被引量：4
3
作者 王坤 张元庆 +5 位作者 陈卓 刘彦杰 王泽昭 李博 程景 牛晓艳 《中国农业大学学报》 北大核心 2025年第8期96-106,共11页
为研究“太行云牛”群体遗传结构,筛选与“太行云牛”重要经济性状相关的基因组选择信号区域及候选基因,本研究利用“育芯1号”牛200 K液相芯片,分别对113头“太行云牛”和26头晋南牛进行了SNP检测、群体遗传结构分析、连锁不平衡衰减分... 为研究“太行云牛”群体遗传结构,筛选与“太行云牛”重要经济性状相关的基因组选择信号区域及候选基因,本研究利用“育芯1号”牛200 K液相芯片,分别对113头“太行云牛”和26头晋南牛进行了SNP检测、群体遗传结构分析、连锁不平衡衰减分析;应用FST和θπ方法筛选“太行云牛”中受选择的基因组信号区域,并通过GO和KEGG注释挖掘潜在的候选基因。结果显示:1)对芯片数据进行质控后共获得187988个SNP位点,主成分分析和邻接树结果均显示“太行云牛”和晋南牛可清楚的分为2支,且2个群体均表现出连锁不平衡随遗传距离增加逐渐衰减的规律,“太行云牛”的连锁不平衡程度高于晋南牛。2)采用ADMIXTURE进行祖先成分分析,当K=3时,结果最接近真实的品种祖先成分,交叉验证误差值最小。3)2种分析方法共筛选到618个在“太行云牛”中受选择的位点,涉及257个基因,其中包括2个与毛色相关基因(KIT和MITF),2个与脂肪沉积和肉嫩度相关基因(SOAT2和CYP2R1),4个与繁殖过程相关基因(EIF4B和MAP3K1和IFNAR2和TGFβ2),4个与抗病及应激相关的基因(PDGFRA和FGF6和KDR和RPS6KA6)。综上,本研究采用FST和θπ基因组选择信号分析在两群体基因组中筛选到618个受选择区域和257个受选择基因,这些选择信号涉及到毛色、脂肪代谢、繁殖、抗病、生长发育等生物学过程。本研究为“太行云牛”优良性状的分子机理提供了重要遗传信息,鉴定到的受选择位点和基因也为后续该品种分子育种和选种提供数据依据。 展开更多
关键词 “太行云牛” 基因芯片 遗传结构 选择信号 候选基因
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荷斯坦奶牛基因组选择技术研究与应用
4
作者 孙东晓 郑伟杰 +2 位作者 贺巾锋 张毅 宋建 《中国畜禽种业》 2025年第4期106-114,共9页
自2009年始,奶牛育种进入基因组选择时代并带来革命性变化,实现了青年公牛早期准确选择,大幅度缩短育种周期并降低育种成本。欧美奶业发达国家已有比较成熟的荷斯坦奶牛基因组选择育种技术体系,产奶性状的基因组评估准确性达80%以上。... 自2009年始,奶牛育种进入基因组选择时代并带来革命性变化,实现了青年公牛早期准确选择,大幅度缩短育种周期并降低育种成本。欧美奶业发达国家已有比较成熟的荷斯坦奶牛基因组选择育种技术体系,产奶性状的基因组评估准确性达80%以上。我国自2012年启动荷斯坦青年公牛基因组评估工作。目前,基因组选择技术不仅全面应用于青年公牛,越来越多后备母牛也开始参加基因组检测,用于组建育种核心群、筛选胚胎供体及精准选种选配。基因组最佳线性无偏预测是最通常的基因组遗传评估方法,随着高通量测序技术发展日新月异,研究人员开始探索基于测序数据及整合全基因组关联分析、转录组等多组学信息的基因组评估新方法,有望进一步提高评估准确性。该文综述了国内外荷斯坦奶牛基因组选择技术研究与应用现状,为中国荷斯坦牛基因组选择育种技术体系的完善与产业化应用提供参考。 展开更多
关键词 荷斯坦奶牛 基因组选择 遗传进展 基因组遗传评估 育种芯片
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不同芯片密度对华西牛重要经济性状基因组评估准确性的影响 被引量：2
5
作者 王元清 王泽昭 +7 位作者 朱波 陈燕 徐凌洋 张路培 高会江 李超 李俊雅 高雪 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第2期591-602,共12页
旨在基于Illumina BovineHD 770K与Cattle 110K芯片在华西牛中的实际应用情况,系统比较在不同标记密度下基因组选择预测准确性的差异,探索两款芯片在华西牛遗传评估中结合使用方法。本试验以课题组前期构建的华西牛基因组选择参考群体... 旨在基于Illumina BovineHD 770K与Cattle 110K芯片在华西牛中的实际应用情况,系统比较在不同标记密度下基因组选择预测准确性的差异,探索两款芯片在华西牛遗传评估中结合使用方法。本试验以课题组前期构建的华西牛基因组选择参考群体为研究对象,利用重测序数据将3948头华西牛770K芯片填充至790K后,分别取90K(两款芯片交集)、110K、770K、790K(两款芯片并集)4种标记密度,对华西牛遗传评估所涉及的5个性状(断奶重、育肥期平均日增重、产犊难易度、胴体重、屠宰率)进行遗传力估计,并通过GBLUP模型利用五折交叉验证对基因组评估准确性进行比较,筛选并确定华西牛遗传评估中最适标记密度。结果显示:1)4种标记密度下,估计的华西牛5个性状遗传力差异不显著,断奶重和平均日增重的遗传力为0.47~0.50,属于高遗传力;胴体重为0.37~0.39,属于中等遗传力;产犊难易度和屠宰率性状为0.14~0.21,属于中低遗传力。2)在GBLUP评估模型中,Cattle 110K在各个性状上的预测准确性均表现良好,并较Illumina BovineHD 770K芯片有显著提升(P<0.05),其中胴体重、产犊难易度和屠宰率3个性状提升较为明显,分别提升了14.9%、13.8%和8.4%;断奶重和育肥期平均日增重分别提升2.8%和4.5%。3)各性状预测准确性随着遗传力的升高而增加,不同标记密度的回归系数分别为0.4392(90K)、0.3741(110K)、0.4136(770K)、0.4593(790K)。因此,在华西牛实际遗传评估中,可直接使用Cattle 110K芯片进行评估,在获得较好评估准确性的同时降低成本。 展开更多
关键词 华西牛 基因组选择 标记密度 育种芯片 中国肉牛基因组选择指数
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猪全基因组低密度SNP芯片的设计与效果评价
6
作者 武建亮 苏洋 +4 位作者 毛瑞涵 周磊 闫田田 李智 刘剑锋 《畜牧兽医学报》 北大核心 2025年第6期2733-2740,共8页
旨在探究低密度SNP芯片在猪育种中的应用效果,尤其是在基因型填充和育种值估计准确性方面的表现。本研究在中高密度SNP芯片“中芯一号”的基础上设计了一款密度为5K的低密度SNP芯片,可用于检测种猪遗传标记分型,并填充至质控后的“中芯... 旨在探究低密度SNP芯片在猪育种中的应用效果,尤其是在基因型填充和育种值估计准确性方面的表现。本研究在中高密度SNP芯片“中芯一号”的基础上设计了一款密度为5K的低密度SNP芯片,可用于检测种猪遗传标记分型,并填充至质控后的“中芯一号”的面板上,最终应用于基因组选择。随后本研究使用来自某种猪育种场的3239头纯种大白猪数据,通过五折交叉验证方法探究该低密度芯片的基因型填充准确性和填充后数据的基因组育种值估计准确性。结果表明,基因型填充的等位基因正确率达到了99.46%,达100 kg校正日龄和达100 kg背膘厚的遗传评估准确性均值分别达到了0.3742和0.4021,与原始基因型数据相比,准确性损失仅为0.0015和0.0012。结果提示,低密度SNP芯片在降低检测成本的同时,保留了绝大部分原始信息。本研究为畜禽全基因组低密度芯片的设计提供了依据和参考,这种策略大幅降低了基因型检测的成本,促进了我国猪全基因选择的普及。 展开更多
关键词 猪 基因组选择 低密度SNP芯片 芯片设计 基因型填充
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棉花60K功能位点基因芯片的制备及应用
7
作者 王亚雯 戚正阳 +6 位作者 尤佳琦 聂新辉 曹娟 杨细燕 涂礼莉 张献龙 王茂军 《作物学报》 北大核心 2025年第5期1178-1188,共11页
棉花是最重要的天然纺织纤维来源,同时是重要的油料来源。功能位点基因芯片作为一种可以提高育种值评估准确性和育种效率的工具,在棉花中应用较少。本研究制备了一款棉花60K功能位点基因芯片。该芯片制备基于已获得的棉花不同品种的Assa... 棉花是最重要的天然纺织纤维来源,同时是重要的油料来源。功能位点基因芯片作为一种可以提高育种值评估准确性和育种效率的工具,在棉花中应用较少。本研究制备了一款棉花60K功能位点基因芯片。该芯片制备基于已获得的棉花不同品种的Assay for Transposase Accessible Chromatin with high-throughput sequencing (ATAC-seq)、Chromatin Immunoprecipitation sequencing (ChIP-seq)、High-throughput Chromosome Conformation Capture (Hi-C)等组学数据,相较棉花领域已有的基因芯片,包含了更多经过多维组学数据注释的功能遗传变异的位点,所携带的有效功能信息更多。本研究将该芯片应用于棉花群体的全基因组关联分析中,鉴定到40个与棉花纤维品质性状相关的显著SNP位点,其中与纤维伸长率(FE)相关的显著位点共25个,与马克隆值(FM)相关的显著位点共5个,与纤维强度(FS)相关的显著位点共2个,与纤维长度(FL)相关的显著位点共4个,与纤维整齐度(FU)相关的显著位点共4个。本研究中棉花60K功能位点基因芯片可应用于棉花种质资源评价、遗传定位及全基因组选择育种等方面,助力棉花基因组育种。 展开更多
关键词 棉花育种 基因芯片 棉花60K功能位点基因芯片 全基因组关联分析 驯化选择
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3D-NoC的测试端口选择优化 被引量：4
8
作者 许川佩 姚永兴 《计算机应用研究》 CSCD 北大核心 2015年第3期810-813,820,共5页
提出一种功耗限制下测试端口选择优化的方法,从而缩短测试时间。以系统功耗确定测试端口对数,以内核测试占用网络资源最少和测试时间最短为目标,为被测核选择端口位置。利用云进化算法对不同端口位置组合寻优,快速收敛到适应值最佳的测... 提出一种功耗限制下测试端口选择优化的方法,从而缩短测试时间。以系统功耗确定测试端口对数,以内核测试占用网络资源最少和测试时间最短为目标,为被测核选择端口位置。利用云进化算法对不同端口位置组合寻优,快速收敛到适应值最佳的测试端口组合,完成测试方法研究。以ITC’02基准电路作为实验对象,针对不同规模No C,实验结果表明,这种方法提高了测试效率,缩短了测试时间,降低了测试代价。 展开更多
关键词 片上网络 选择优化 云进化算法
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全基因组选择在猪育种中的应用 被引量：25
9
作者 王晨 秦珂 +3 位作者 薛明 莫德林 陈瑶生 刘小红 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2016年第1期1-9,共9页
全基因组选择(Genomic selection,GS)是一种全基因组范围内的标记辅助选择方法。利用全基因组遗传标记信息对个体进行遗传评估,能够更加准确地早期预测估计育种值,降低近交系数,大大提高猪育种的遗传进展。随着猪全基因组测序的完成和猪... 全基因组选择(Genomic selection,GS)是一种全基因组范围内的标记辅助选择方法。利用全基因组遗传标记信息对个体进行遗传评估,能够更加准确地早期预测估计育种值,降低近交系数,大大提高猪育种的遗传进展。随着猪全基因组测序的完成和猪60kSNP芯片的商业化,全基因组选择已经成为猪育种研究领域的新热点。本文综述了全基因组选择的分析方法、计算方法和影响因素,并阐述了全基因组选择在猪育种中的应用情况和发展趋势。 展开更多
关键词 全基因组选择 猪 育种 SNP芯片
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嵌入式系统电源芯片选型与应用 被引量：21
10
作者 孟海斌 张红雨 《单片机与嵌入式系统应用》 2010年第12期7-10,共4页
对嵌入式系统可使用的4类电源芯片——普通线性稳压器、低压差线性稳压器、电容式DC—DC转换器(即电荷泵)、电感式DC—DC转换器——进行了原理介绍和特点分析,提出了电源芯片选型的原则,最后给出了一个电源设计实例。
关键词 电源芯片 普通线性稳压器 低压差线性稳压器 电容式DC—DC转换器 电感式DC--DC转换器 选型
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微电脑控制的心电数据床边采集系统 被引量：6
11
作者 陈蕴 宁新宝 《南京大学学报（自然科学版）》 CAS CSCD 北大核心 2002年第1期14-19,共6页
介绍的微电脑控制的心电数据床边采集系统 ,具有心电数据的采集、存储和向计算机传送数据的功能 .它与传统的心电数据采集系统相比 ,着重解决以下关键技术 :以 5 1系列单片机为核心的软、硬件结构 ;具有 12位分辨率的多通道A/D采样、多... 介绍的微电脑控制的心电数据床边采集系统 ,具有心电数据的采集、存储和向计算机传送数据的功能 .它与传统的心电数据采集系统相比 ,着重解决以下关键技术 :以 5 1系列单片机为核心的软、硬件结构 ;具有 12位分辨率的多通道A/D采样、多路选择功能的高性能前置放大电路 ;实时高效的数据压缩算法等 .系统性能稳定、使用方便 。 展开更多
关键词 放大器 多路选择 单片机 ECG信号压缩 微电脑控制 心电数据 床边采集系统 心电诊断
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基于H.264的视频会议芯片选型 被引量：1
12
作者 史凯 雒江涛 《电视技术》 北大核心 2008年第3期95-96,共2页
简要介绍了基于H.264的视频会议的硬件结构,比较了不同厂家的多媒体处理芯片和MCU模块芯片的特点。总结了视频会议系统在发展中遇到的问题,并以柯达公司的KDV800视频会议产品为例阐述了该系统在实际工程中的应用。
关键词 H.264 芯片选型 H.323 视频会议
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煤矿井下6～10kV电网选择性速断过流保护系统设计 被引量：13
13
作者 杜生华 王拓 +1 位作者 邹有明 陈淑红 《煤矿安全》 CAS 北大核心 2005年第4期1-3,共3页
文章在分析典型煤矿井下6～1 0 k V供电系统的基础上,设计出一种基于单片机和串行通信的新型过流保护系统。该系统能够在电网发生短路故障后0 .2 s内实现有选择性的快速断电,从而避免井下电网因越级跳闸而造成的大面积停电。仿真表明,... 文章在分析典型煤矿井下6～1 0 k V供电系统的基础上,设计出一种基于单片机和串行通信的新型过流保护系统。该系统能够在电网发生短路故障后0 .2 s内实现有选择性的快速断电,从而避免井下电网因越级跳闸而造成的大面积停电。仿真表明,该保护系统性能稳定,满足设计要求。 展开更多
关键词 单片机 串行通信 选择性 过流保护 越级跳闸
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马铃薯炸片品种筛选研究 被引量：9
14
作者 张永成 阮建平 《青海农林科技》 2005年第1期53-54,61,共3页
对32个马铃薯品种的薯块性状、炸片品质、口味等综合性状,按照炸片的具体要求,与国外引进的炸片品种"大西洋"作对照,进行试炸、观察与比较,从中筛选适于炸片的优良品种,为食品加工提供可靠的理论依据。
关键词 品种筛选 马铃薯品种 薯块 综合性状 “大西洋” 优良品种 品质 对照 观察 研究
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昆明犬群体遗传结构及受选择基因分析 被引量：3
15
作者 李静 程鲁光 +5 位作者 万九生 陈超 邓卫东 张正红 张志 黎立光 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2022年第5期1455-1464,共10页
旨在以昆明犬为主要研究对象探究昆明犬-国内唯一培育并广泛使用的工作犬品种的遗传多样性和群体遗传结构。本试验共采集16头昆明犬(3个品系)、4头马里努阿犬、4头德国牧羊犬血样并提取基因组DNA,用Illumina CanineHD Beadchip芯片对24... 旨在以昆明犬为主要研究对象探究昆明犬-国内唯一培育并广泛使用的工作犬品种的遗传多样性和群体遗传结构。本试验共采集16头昆明犬(3个品系)、4头马里努阿犬、4头德国牧羊犬血样并提取基因组DNA,用Illumina CanineHD Beadchip芯片对24头3个品种犬进行主成分分析(PCA)、STRUCTURE和邻接(NJ)树分析,检测3个品种警犬的遗传群体结构,并分析昆明犬选育中可能受到选择的候选基因。结果显示,芯片数据根据质控标准最终有86270个SNPs被筛选出来用于分析。STRUCTURE群体结构分析表明,K=2时德国牧羊犬(DM)和其他品种犬完全区分开来,K=3时马里努阿犬(ML)可以和其他两个品种区分出来,昆明犬中存在部分德国牧羊犬的杂合。PCA和NJ树分析均能将3个品种犬清楚地分开。通过在常染色体上设置500 kb的滑动窗口和将这些区域注释后得到22个在昆明犬品种形成过程中可能受到正选择的基因,主要是参与腺苷酸环化酶活化g蛋白偶联受体信号通路的基因及蛋白和在神经元轴突的生长锥中影响轴突和前导突起生长的基因。本研究探讨了中国昆明犬与其他品种犬的遗传关系,为昆明犬受到强烈的人工选择而产生调节学习、记忆、应激刺激等适应的遗传机制提供了重要的参考。 展开更多
关键词 家犬 昆明犬 SNP芯片 群体结构 选择信号
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基于LabVIEW数字量输出功能的扩展 被引量：1
16
作者 祁昌禹 韩根亮 +2 位作者 李工农 陈小通 马宏伟 《甘肃科学学报》 2012年第1期116-118,共3页
在测控技术应用中,常受到普通数据采集卡数字量输出的限制,通过采用"复用+片选+锁存"硬件电路设计理念,实现数字量输出口的扩展;结合LabVIEW软件在硬件控制中的优势,实现直观、可靠的软面板操作.
关键词 数字量输出 LABVIEW 复用+片选+锁存 软面板
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高密度SNP芯片及其对肉牛育种影响的研究进展 被引量：5
17
作者 张清峰 秦巧梅 《中国畜牧兽医》 CAS 北大核心 2011年第10期122-124,共3页
近年来先进的测序和基因分型技术促进了肉牛育种方法的革新。从过去低通量、耗时的限制性片段多态标记(RFLP)到如今高通量、高密度的单核苷酸多态性(SNP)标记,基因检测效率大幅提高。随着肉牛基因组序列图谱及SNP图谱的完成,基于高密度... 近年来先进的测序和基因分型技术促进了肉牛育种方法的革新。从过去低通量、耗时的限制性片段多态标记(RFLP)到如今高通量、高密度的单核苷酸多态性(SNP)标记,基因检测效率大幅提高。随着肉牛基因组序列图谱及SNP图谱的完成,基于高密度SNP标记的牛全基因组选择成了牛育种的新热点。作者立足高密度SNP芯片对肉牛育种的影响,综述高密度SNP芯片及和下一代测定技术及肉牛全基因组选择的研究进展,阐明高密度SNP芯片对多品种全基因组选择的模型的建立及准确的预测基因组育种值极其重要。 展开更多
关键词 高密度SNP芯片 肉牛 全基因组选择
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合川黑猪保种群遗传结构及选择信号分析 被引量：7
18
作者 龙熙 陈力 +6 位作者 吴平先 张廷焕 潘红梅 张亮 王金勇 郭宗义 柴捷 《畜牧兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2023年第5期1854-1867,共14页
旨在研究合川黑猪保种群体的遗传多样性、亲缘关系、近交系数、家系结构和选择信号,以期更好地保护和利用合川黑猪这一遗传资源。本研究利用猪50K SNP芯片,对合川黑猪保种群内所含的58头健康成年种猪进行SNP检测;计算群体的有效含量、... 旨在研究合川黑猪保种群体的遗传多样性、亲缘关系、近交系数、家系结构和选择信号,以期更好地保护和利用合川黑猪这一遗传资源。本研究利用猪50K SNP芯片,对合川黑猪保种群内所含的58头健康成年种猪进行SNP检测;计算群体的有效含量、多态信息含量、多态标记比例、期望杂合度、观测杂合度、有效等位基因数以及最小等位基因频率,分析保种群体的遗传多样性;利用Plink软件构建状态同源(identity by state,IBS)矩阵和分析每个样本的连续性纯合片段(runs of homozygosity,ROH),Gamatrix(V2)软件构建基因组关系G矩阵,分析合川黑猪保种群的亲缘关系;利用Mega X(V10.0)软件进行群体聚类分析,研究合川黑猪保种群的家系结构;运用Tajima’s D和iHS方法分析合川黑猪群体基因组上受选择的信号区域,挖掘潜在的候选基因。结果表明,合川黑猪保种群体的群体有效含量、平均多态信息含量、多态标记比例、平均有效等位基因数、最小等位基因频率分别为4.2、0.156、0.534、1.38、0.141,说明合川黑猪保种群体的遗传多样性较丰富;群体的平均期望杂合度为0.255,平均观测杂合度为0.271,观测杂合度稍高于期望杂合度,说明该保种群体出现了分化;平均IBS遗传距离为0.1992±0.0429,其中公猪的为0.1767±0.0484,IBS遗传距离和基于G矩阵的亲缘关系分析结果均表明,部分个体之间呈现较近的亲缘关系;合川黑猪保种群体内共发现2246个ROH片段,长度在1~10 Mb之间的ROH数量占比最多,为79.12%,含40~50个ROH的个体数量占比最多,为48.28%,群体平均近交系数为0.175;现有合川黑猪群体包含7个含公猪的家系和1个不含公猪的家系,各家系个体的数量差异较大;利用Tajima’s D方法检测到显著选择信号区域192个,涉及193个候选基因,iHS方法检测到显著选择信号区域303个,涉及331个候选基因。两种方法同时检测到的候选基因有5个,其中HVCN 1与精子的活力和低温耐受相关,TRAF 3IP1和PER 2与机体免疫功能相关。综上所述,合川黑猪保种群体遗传多样性较丰富,但部分个体间存在较大的近交风险,各家系中个体数量的差异明显,个别家系内公猪个体数量少,存在血统流失风险。此外,在适应性进化过程中,合川黑猪繁殖和免疫性状相关的基因受到了一定程度的选择作用。 展开更多
关键词 合川黑猪 50K SNP芯片 遗传多样性 遗传结构 选择信号
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实用微机多功能自动电子秤系统 被引量：2
19
作者 陈瑞林 吴子英 《自动化仪表》 CAS 北大核心 2000年第9期15-16,29,共3页
介绍一种采用单片机控制的实用多功能电子秤系统。它可用于橡胶行业，对生产线上的产品或半成品重量进行计量，判别产品重量是否合格。详细介绍了该电子秤系统的结构、工作原理、功能、关键技术及软件流程。
关键词 电子秤 单片机 选通输入 自动称重秤 微机
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籼型杂交水稻恢复系粒长及粒重的分子改良 被引量：3
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作者 苏相文 高方远 +3 位作者 任鄄胜 吕建群 陆贤军 任光俊 《西南农业学报》 CSCD 北大核心 2019年第10期2273-2278,共6页
【目的】通过分子标记辅助选择培育长粒型新恢复系,为杂交水稻长粒型育种提供新的种质资源。【方法】利用常规回交育种、分子标记辅助选择和抗病鉴定,结合粒型和低垩白等形态性状选择,将长粒型基因gs3导入短粒型优良恢复系中间材料R3394... 【目的】通过分子标记辅助选择培育长粒型新恢复系,为杂交水稻长粒型育种提供新的种质资源。【方法】利用常规回交育种、分子标记辅助选择和抗病鉴定,结合粒型和低垩白等形态性状选择,将长粒型基因gs3导入短粒型优良恢复系中间材料R33947中。【结果】培育出了4个新的长粒、低垩白和产量较高的改良系。他们的基因位点没有差异,但粒形和产量性状有明显不同。其中,RGL3株系配合力较好,后定名为成恢637。利用该恢复系与优质香稻不育系川康606A配制的杂交水稻新组合"川康优637"在长江上游区域试验中比对照F优498增产4.7%,米质优良。【结论】通过常规的回交选育、分子标记辅助选择和抗病鉴定,结合优良形态选择的方法,筛选获得4份gs3纯合的优质抗病改良系,为选育新的优质水稻恢复系提供种质资源。育成优良恢复系成恢637,其与优质香稻不育系川康606A配制的新组合"川康优637"具有品质优良、丰产性好、抗病性强等特点。 展开更多
关键词 水稻(Oryza SATIVA L.) 长粒型 gs3基因 分子标记辅助选择 基因芯片分析
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