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Genome-wide analysis of the B3 transcription factors reveals that RcABI3/VP1 subfamily plays important roles in seed development and oil storage in castor bean(Ricinus communis) 被引量:4
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作者 Wen-Bo Wang Tao Ao +4 位作者 Yan-Yu Zhang Di Wu Wei Xu Bing Han Ai-Zhong Liu 《Plant Diversity》 SCIE CAS CSCD 2022年第2期201-212,共12页
The B3 transcription factors(TFs)in plants play vital roles in numerous biological processes.Although B3 genes have been broadly identified in many plants,little is known about their potential functions in mediating s... The B3 transcription factors(TFs)in plants play vital roles in numerous biological processes.Although B3 genes have been broadly identified in many plants,little is known about their potential functions in mediating seed development and material accumulation.Castor bean(Ricinus communis)is a non-edible oilseed crop considered an ideal model system for seed biology research.Here,we identified a total of 61 B3 genes in the castor bean genome,which can be classified into five subfamilies,including ABI3/VP1,HSI,ARF,RAV and REM.The expression profiles revealed that RcABI3/VP1 subfamily genes are significantly up-regulated in the middle and later stages of seed development,indicating that these genes may be associated with the accumulation of storage oils.Furthermore,through yeast one-hybrid and tobacco transient expression assays,we detected that ABI3/VP1 subfamily member RcLEC2 directly regulates the transcription of RcOleosin2,which encodes an oil-body structural protein.This finding suggests that RcLEC2,as a seed-specific TF,may be involved in the regulation of storage materials accumulation.This study provides novel insights into the potential roles and molecular basis of B3 family proteins in seed development and material accumulation. 展开更多
关键词 B3 transcription factor Castor bean gene expression ABI3/vp1 subfamily Seed development Seed oil
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猪O型口蹄疫病毒强弱毒株VP_1基因的克隆与序列分析 被引量:5
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作者 娄高明 杜伟贤 +5 位作者 魏平华 宋长绪 杨傲冰 周秀蓉 张春红 谢明权 《中国预防兽医学报》 CAS CSCD 北大核心 2001年第5期377-381,共5页
本研究根据口蹄疫病毒 (FMDV)VP1基因的序列 ,设计并合成了 1对用于扩增整个VP1基因的引物 (5P、P6 )。从细胞培养液或组织中提取总RNA ,通过PT_PCR扩增 ,从F2 9株、O3I3株和T5 0 9株中均获得了 1条约 740bp的DNA电泳带。将PCR产物双酶... 本研究根据口蹄疫病毒 (FMDV)VP1基因的序列 ,设计并合成了 1对用于扩增整个VP1基因的引物 (5P、P6 )。从细胞培养液或组织中提取总RNA ,通过PT_PCR扩增 ,从F2 9株、O3I3株和T5 0 9株中均获得了 1条约 740bp的DNA电泳带。将PCR产物双酶切后电泳回收 ,插入到相应双酶切的pUC18质粒中 ,获得了重组质粒。通过PCR鉴定 ,证明重组质粒pUCVP1/F2 9、pUCVP1/O313、pUCVP1/T5 0 9均插入了VP1基因。对上述 3个重组质粒进行测序后分析 ,F2 9强毒株与O3I3、T5 0 9弱毒株相比 ,其核苷酸序列同源性分别为 98.75 %和 99.0 6 % ;因F2 9株核苷酸发生 3个碱基缺失与 1个碱基替换 ,故推导的氨基酸序列同源性分别仅为 44 .13%和 41.32 % ;而T5 0 9株与O3I3株相比 ,其核苷酸、氨基酸序列同源性分别为 99.37%和 95 .31%。通过序列分析发现 ,本研究的 3个毒株与国内大多数毒株 (包括 1997年台湾暴发FMDV所分离的毒株 ,除O/A/ 5 8株外 )均属于同一基因型 ,核苷酸序列同源性为 85 %~ 94% ;而与国外毒株相比 ,属不同的基因型 ,核苷酸序列同源性仅为 81%~ 82 %。其推导的氨基酸序列 ,除F2 9株与O/HK/ 93株及 1997年台湾暴发FMDV分离的少数毒株的氨基酸序列同源性仅为 45 %~ 6 3%外 ,本研究的 展开更多
关键词 O型口蹄疫病毒 vp1基因 基因克隆 序列测定 强毒株 弱毒株
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鸭甲肝病毒VP1基因克隆及序列分析 被引量:1
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作者 藏玉婷 王彬 +1 位作者 宋扬 丁国杰 《中国兽药杂志》 北大核心 2015年第2期18-21,共4页
通过PCR技术,从自行分离的鸭甲肝病毒JS株基因组中扩增出病毒衣壳蛋白VP1完整基因片段,并对该片段进行序列测定及分析。结果显示JS-VP1与DHAV-A的VP1基因序列酸核苷酸同源性在62.0%-64.4%之间,与DHAV-B的VP1基因序列酸核苷酸同源性在63.... 通过PCR技术,从自行分离的鸭甲肝病毒JS株基因组中扩增出病毒衣壳蛋白VP1完整基因片段,并对该片段进行序列测定及分析。结果显示JS-VP1与DHAV-A的VP1基因序列酸核苷酸同源性在62.0%-64.4%之间,与DHAV-B的VP1基因序列酸核苷酸同源性在63.6%-63.8%之间,与DHAV-C的VP1基因序列酸核苷酸同源性在92.3%-98.5%之间,分析表明JS株为鸭甲肝病毒基因C型,血清型分型为韩国新型。进化树表明JS株与SD02株的亲缘关系较进,进一步说明VP1基因的核苷酸序列是DHAV基因组中的高度可变区,可作为DHAV基因型研究的标记,分离毒株为DHAV的防治及疫苗的设计奠定了基础。 展开更多
关键词 鸭甲肝病毒 vp1基因 序列分析
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